seq1 = pF1KE3709.tfa, 636 bp seq2 = pF1KE3709/gi568815595f_125872055.tfa (gi568815595f:125872055_126083317), 211263 bp >pF1KE3709 636 >gi568815595f:125872055_126083317 (Chr3) 1-116 (100001-100116) 100% -> 117-234 (103509-103626) 100% -> 235-396 (104950-105111) 100% -> 397-572 (110216-110391) 100% -> 573-636 (111200-111263) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGCTCAGACAGATAAGCCAACATGCATCCCGCCGGAGCTGCCGAAAAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGGCTCAGACAGATAAGCCAACATGCATCCCGCCGGAGCTGCCGAAAAT 50 . : . : . : . : . : 51 GCTGAAGGAGTTTGCCAAAGCCGCCATTCGGGCGCAGCCGCAGGACCTCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 GCTGAAGGAGTTTGCCAAAGCCGCCATTCGGGCGCAGCCGCAGGACCTCA 100 . : . : . : . : . : 101 TCCAGTGGGGGGCCGA TTATTTTGAGGCCCTGTCCCGTGGA ||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||| 100101 TCCAGTGGGGGGCCGAGTA...TAGTTATTTTGAGGCCCTGTCCCGTGGA 150 . : . : . : . : . : 142 GAGACGCCTCCGGTGAGAGAGCGGTCTGAGCGAGTCGCTTTGTGTAACTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103534 GAGACGCCTCCGGTGAGAGAGCGGTCTGAGCGAGTCGCTTTGTGTAACTG 200 . : . : . : . : . : 192 GGCAGAGCTAACACCTGAGCTGTTAAAGATCCTGCATTCTCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...> 103584 GGCAGAGCTAACACCTGAGCTGTTAAAGATCCTGCATTCTCAGGTA...C 250 . : . : . : . : . : 235 GTTGCTGGCAGACTGATCATCCGTGCAGAGGAGCTGGCCCAGATGTGG >>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104948 AGGTTGCTGGCAGACTGATCATCCGTGCAGAGGAGCTGGCCCAGATGTGG 300 . : . : . : . : . : 283 AAAGTGGTGAATCTCCCAACAGATCTGTTTAATAGTGTGATGAATGTGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104998 AAAGTGGTGAATCTCCCAACAGATCTGTTTAATAGTGTGATGAATGTGGG 350 . : . : . : . : . : 333 TCGCTTCACGGAGGAGATCGAGTGGCTGAAGTTTTTAGCCCTTGCTTGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105048 TCGCTTCACGGAGGAGATCGAGTGGCTGAAGTTTTTAGCCCTTGCTTGCA 400 . : . : . : . : . : 383 GCGCTCTGGGAGTT ACTATTACCAAAACTCTCAAGATAGTG ||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||| 105098 GCGCTCTGGGAGTTGTA...TAGACTATTACCAAAACTCTCAAGATAGTG 450 . : . : . : . : . : 424 TGTGAGGTCTTATCATGTGACCACAATGGTGGGTTGCCCCGAATCCCATT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 110243 TGTGAGGTCTTATCATGTGACCACAATGGTGGGTTGCCCCGAATCCCATT 500 . : . : . : . : . : 474 CAGCACCTTCCAGTTTCTCTACACGTATATTGCCGAAGTGGATGGGGAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 110293 CAGCACCTTCCAGTTTCTCTACACGTATATTGCCGAAGTGGATGGGGAGA 550 . : . : . : . : . : 524 TCTGTGCATCACATGTCAGCAGGATGCTAAACTACATTGAACAGGAAGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||> 110343 TCTGTGCATCACATGTCAGCAGGATGCTAAACTACATTGAACAGGAAGTG 600 . : . : . : . : . : 573 AATTGGTCCTGATGGTTTAATCACGGTGAATGACTTTACCCA >>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 110393 TA...CAGAATTGGTCCTGATGGTTTAATCACGGTGAATGACTTTACCCA 650 . : . : 615 AAACCCCAGGGTTTGGCTGGAG |||||||||||||||||||||| 111242 AAACCCCAGGGTTTGGCTGGAG