Result of SIM4 for pF1KE1705

seq1 = pF1KE1705.tfa, 627 bp
seq2 = pF1KE1705/gi568815596r_169712455.tfa (gi568815596r:169712455_169924597), 212143 bp

>pF1KE1705 627
>gi568815596r:169712455_169924597 (Chr2)

(complement)

1-109  (100001-100109)   100% ->
110-224  (102541-102655)   100% ->
225-406  (103325-103506)   100% ->
407-489  (104955-105037)   100% ->
490-541  (109070-109121)   100% ->
542-591  (112092-112141)   100% ->
592-627  (112740-112775)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGAAAGTAAGGCTTAAGGAACTAGAGAGTCGCCTGCAACAAGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGAAAGTAAGGCTTAAGGAACTAGAGAGTCGCCTGCAACAAGTGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGATTTGAAAAGCCCAAGCTACTTCTGGAACAGTATCCTACCAGGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGGATTTGAAAAGCCCAAGCTACTTCTGGAACAGTATCCTACCAGGCCGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACATTGCAG         CATGTATGCTCTATACAATCCATAACACTTAT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACATTGCAGGTA...TAGCATGTATGCTCTATACAATCCATAACACTTAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GATGACATTGAAAATAAAGTCGTTGCAGATCTAGGATGTGGTTGTGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102573 GATGACATTGAAAATAAAGTCGTTGCAGATCTAGGATGTGGTTGTGGAGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ACTTAGCATCGGAACTGCAATGTTAGGAGCAGG         GTTGTGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 102623 ACTTAGCATCGGAACTGCAATGTTAGGAGCAGGGTA...TAGGTTGTGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTGGATTTGACATAGATGAAGACGCATTGGAAATATTTAATAGGAATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103333 TTGGATTTGACATAGATGAAGACGCATTGGAAATATTTAATAGGAATGCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAAGAGTTTGAGTTAACAAATATTGACATGGTTCAATGTGATGTGTGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103383 GAAGAGTTTGAGTTAACAAATATTGACATGGTTCAATGTGATGTGTGCTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 ATTATCTAACAGAATGTCCAAGTCATTCGATACAGTAATTATGAATCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103433 ATTATCTAACAGAATGTCCAAGTCATTCGATACAGTAATTATGAATCCTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCTTTGGGACCAAAAATAATAAAG         GGACAGATATGGCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 103483 CCTTTGGGACCAAAAATAATAAAGGTT...CAGGGACAGATATGGCTTTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CTAAAGACTGCTTTGGAAATGGCAAGAACAGCAGTATATTCCTTACACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104972 CTAAAGACTGCTTTGGAAATGGCAAGAACAGCAGTATATTCCTTACACAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 ATCCTCAACTAGAGAA         CATGTTCAAAAGAAAGCTGCAGAAT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 105022 ATCCTCAACTAGAGAAGTA...CAGCATGTTCAAAAGAAAGCTGCAGAAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GGAAAATCAAGATAGATATTATAGCAG         AACTTCGATATGAC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 109095 GGAAAATCAAGATAGATATTATAGCAGGTA...CAGAACTTCGATATGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CTGCCAGCATCATACAAGTTTCACAAAAAGAAATCA         GTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 112106 CTGCCAGCATCATACAAGTTTCACAAAAAGAAATCAGTA...CAGGTGGA

    650     .    :    .    :    .    :
    597 CATTGAAGTGGACCTAATTCGGTTTTCCTTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 112745 CATTGAAGTGGACCTAATTCGGTTTTCCTTT

Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com