seq1 = pF1KE5534.tfa, 1311 bp seq2 = pF1KE5534/gi568815587f_117994816.tfa (gi568815587f:117994816_118217455), 222640 bp >pF1KE5534 1311 >gi568815587f:117994816_118217455 (Chr11) 1-43 (99999-100040) 95% -> 44-157 (104170-104283) 100% -> 158-310 (108286-108438) 100% -> 311-440 (109876-110005) 100% -> 441-542 (112959-113060) 100% -> 543-583 (114041-114081) 100% -> 584-743 (116926-117085) 99% -> 744-910 (118454-118620) 100% -> 911-1009 (120014-120112) 100% -> 1010-1152 (120323-120465) 100% -> 1153-1311 (122490-122645) 96% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGTTACAGGATCCTGACAGTGATCAACCTCTGAACAGCCTCG | -||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...> 99999 AA TTACAGGATCCTGACAGTGATCAACCTCTGAACAGCCTCGGTA...C 50 . : . : . : . : . : 44 ATGTCAAACCCCTGCGCAAACCCCGTATCCCCATGGAGACCTTCAGAA >>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104168 AGATGTCAAACCCCTGCGCAAACCCCGTATCCCCATGGAGACCTTCAGAA 100 . : . : . : . : . : 92 AGGTGGGGATCCCCATCATCATAGCACTACTGAGCCTGGCGAGTATCATC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104218 AGGTGGGGATCCCCATCATCATAGCACTACTGAGCCTGGCGAGTATCATC 150 . : . : . : . : . : 142 ATTGTGGTTGTCCTCA TCAAGGTGATTCTGGATAAATACTA ||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||| 104268 ATTGTGGTTGTCCTCAGTA...CAGTCAAGGTGATTCTGGATAAATACTA 200 . : . : . : . : . : 183 CTTCCTCTGCGGGCAGCCTCTCCACTTCATCCCGAGGAAGCAGCTGTGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 108311 CTTCCTCTGCGGGCAGCCTCTCCACTTCATCCCGAGGAAGCAGCTGTGTG 250 . : . : . : . : . : 233 ACGGAGAGCTGGACTGTCCCTTGGGGGAGGACGAGGAGCACTGTGTCAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 108361 ACGGAGAGCTGGACTGTCCCTTGGGGGAGGACGAGGAGCACTGTGTCAAG 300 . : . : . : . : . : 283 AGCTTCCCCGAAGGGCCTGCAGTGGCAG TCCGCCTCTCCAA ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||| 108411 AGCTTCCCCGAAGGGCCTGCAGTGGCAGGTG...CAGTCCGCCTCTCCAA 350 . : . : . : . : . : 324 GGACCGATCCACACTGCAGGTGCTGGACTCGGCCACAGGGAACTGGTTCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 109889 GGACCGATCCACACTGCAGGTGCTGGACTCGGCCACAGGGAACTGGTTCT 400 . : . : . : . : . : 374 CTGCCTGTTTCGACAACTTCACAGAAGCTCTCGCTGAGACAGCCTGTAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 109939 CTGCCTGTTTCGACAACTTCACAGAAGCTCTCGCTGAGACAGCCTGTAGG 450 . : . : . : . : . : 424 CAGATGGGCTACAGCAG CAAACCCACTTTCAGAGCTGTGGA |||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||| 109989 CAGATGGGCTACAGCAGGTA...CAGCAAACCCACTTTCAGAGCTGTGGA 500 . : . : . : . : . : 465 GATTGGCCCAGACCAGGATCTGGATGTTGTTGAAATCACAGAAAACAGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112983 GATTGGCCCAGACCAGGATCTGGATGTTGTTGAAATCACAGAAAACAGCC 550 . : . : . : . : . : 515 AGGAGCTTCGCATGCGGAACTCAAGTGG GCCCTGTCTCTCA ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||| 113033 AGGAGCTTCGCATGCGGAACTCAAGTGGGTA...CAGGCCCTGTCTCTCA 600 . : . : . : . : . : 556 GGCTCCCTGGTCTCCCTGCACTGTCTTG CCTGTGGGAAGAG ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||| 114054 GGCTCCCTGGTCTCCCTGCACTGTCTTGGTG...CAGCCTGTGGGAAGAG 650 . : . : . : . : . : 597 CCTGAAGACCCCCCGTGTGGTGGGTGGGGAGGAGGCCTCTGTGGATTCTT |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| 116939 CCTGAAGACCCCCCGTGTGGTGGGTGTGGAGGAGGCCTCTGTGGATTCTT 700 . : . : . : . : . : 647 GGCCTTGGCAGGTCAGCATCCAGTACGACAAACAGCACGTCTGTGGAGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116989 GGCCTTGGCAGGTCAGCATCCAGTACGACAAACAGCACGTCTGTGGAGGG 750 . : . : . : . : . : 697 AGCATCCTGGACCCCCACTGGGTCCTCACGGCAGCCCACTGCTTCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>> 117039 AGCATCCTGGACCCCCACTGGGTCCTCACGGCAGCCCACTGCTTCAGGTA 800 . : . : . : . : . : 744 GAAACATACCGATGTGTTCAACTGGAAGGTGCGGGCAGGCTCAG ...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 117089 ...CAGGAAACATACCGATGTGTTCAACTGGAAGGTGCGGGCAGGCTCAG 850 . : . : . : . : . : 788 ACAAACTGGGCAGCTTCCCATCCCTGGCTGTGGCCAAGATCATCATCATT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 118498 ACAAACTGGGCAGCTTCCCATCCCTGGCTGTGGCCAAGATCATCATCATT 900 . : . : . : . : . : 838 GAATTCAACCCCATGTACCCCAAAGACAATGACATCGCCCTCATGAAGCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 118548 GAATTCAACCCCATGTACCCCAAAGACAATGACATCGCCCTCATGAAGCT 950 . : . : . : . : . : 888 GCAGTTCCCACTCACTTTCTCAG GCACAGTCAGGCCCATCT |||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||| 118598 GCAGTTCCCACTCACTTTCTCAGGTG...CAGGCACAGTCAGGCCCATCT 1000 . : . : . : . : . : 929 GTCTGCCCTTCTTTGATGAGGAGCTCACTCCAGCCACCCCACTCTGGATC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120032 GTCTGCCCTTCTTTGATGAGGAGCTCACTCCAGCCACCCCACTCTGGATC 1050 . : . : . : . : . : 979 ATTGGATGGGGCTTTACGAAGCAGAATGGAG GGAAGATGTC |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||| 120082 ATTGGATGGGGCTTTACGAAGCAGAATGGAGGTA...CAGGGAAGATGTC 1100 . : . : . : . : . : 1020 TGACATACTGCTGCAGGCGTCAGTCCAGGTCATTGACAGCACACGGTGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120333 TGACATACTGCTGCAGGCGTCAGTCCAGGTCATTGACAGCACACGGTGCA 1150 . : . : . : . : . : 1070 ATGCAGACGATGCGTACCAGGGGGAAGTCACCGAGAAGATGATGTGTGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120383 ATGCAGACGATGCGTACCAGGGGGAAGTCACCGAGAAGATGATGTGTGCA 1200 . : . : . : . : . : 1120 GGCATCCCGGAAGGGGGTGTGGACACCTGCCAG GGTGACAG |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||| 120433 GGCATCCCGGAAGGGGGTGTGGACACCTGCCAGGTG...CAGGGTGACAG 1250 . : . : . : . : . : 1161 TGGTGGGCCCCTGATGTACCAATCTGACCAGTGGCATGTGGTGGGCATCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 122498 TGGTGGGCCCCTGATGTACCAATCTGACCAGTGGCATGTGGTGGGCATCG 1300 . : . : . : . : . : 1211 TTAGCTGGGGCTATGGCTGCGGGGGCCCGAGCACCCCAGGAGTATACACC |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 122548 TTAGTTGGGGCTATGGCTGCGGGGGCCCGAGCACCCCAGGAGTATACACC 1350 . : . : . : . : . : 1261 AAGGTCTCAGCCTATCTCAACTGGATCTACAATGTCTGGAAGGCTGAGCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-| ||-- 122598 AAGGTCTCAGCCTATCTCAACTGGATCTACAATGTCTGGAAGG TAAG 1400 1311 G | 122645 G