seq1 = pF1KE6542.tfa, 294 bp seq2 = pF1KE6542/gi568815597r_212735873.tfa (gi568815597r:212735873_212936149), 200277 bp >pF1KE6542 294 >gi568815597r:212735873_212936149 (Chr1) (complement) 1-277 (100001-100277) 100% -> 278-294 (105889-105905) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGCATCTATAAACAGAACCATTGAAATAATGAAAAAACATGGAGTAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGGCATCTATAAACAGAACCATTGAAATAATGAAAAAACATGGAGTAAG 50 . : . : . : . : . : 51 CAAACAACATCTCCTGGAGGAGATAAACAAAAAGCGTGAATCCAACTGCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 CAAACAACATCTCCTGGAGGAGATAAACAAAAAGCGTGAATCCAACTGCT 100 . : . : . : . : . : 101 TGGTGGAACGAAGCAATCAAGTCAGCTTACTGAGAGTTCAAAAGAGGCAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100101 TGGTGGAACGAAGCAATCAAGTCAGCTTACTGAGAGTTCAAAAGAGGCAC 150 . : . : . : . : . : 151 TTCCCGGATGCCTATCAGTCCTTTACTGATACCACAACCAAAGAGCCTGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100151 TTCCCGGATGCCTATCAGTCCTTTACTGATACCACAACCAAAGAGCCTGT 200 . : . : . : . : . : 201 TCCCAACAGTGGCAGGAGCTCCTGGATCAAGCTGAGTCTCCTTGCTCACA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100201 TCCCAACAGTGGCAGGAGCTCCTGGATCAAGCTGAGTCTCCTTGCTCACA 250 . : . : . : . : . : 251 TGGAGAGAAAGCACTTTCCACCAAAAA ATAATGCCATATTT |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||| 100251 TGGAGAGAAAGCACTTTCCACCAAAAAGTA...CAGATAATGCCATATTT 300 292 GGA ||| 105903 GGA