Result of FASTA (ccds) for pF1KE9635
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE9635, 1544 aa
  1>>>pF1KE9635 1544 - 1544 aa - 1544 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8855+/-0.000972; mu= 17.4770+/- 0.059
 mean_var=131.2701+/-25.716, 0's: 0 Z-trim(109.6): 112  B-trim: 5 in 1/51
 Lambda= 0.111942
 statistics sampled from 10902 (11015) to 10902 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.68), E-opt: 0.2 (0.338), width:  16
 Scan time:  5.840

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS30974.1 KDM5B gene_id:10765|Hs108|chr1         (1544) 10553 1716.9       0
CCDS81417.1 KDM5B gene_id:10765|Hs108|chr1         (1580) 8878 1446.4       0
CCDS41736.1 KDM5A gene_id:5927|Hs108|chr12         (1690) 4883 801.2       0
CCDS55554.1 KDM5D gene_id:8284|Hs108|chrY          (1482) 3442 568.5 5.6e-161
CCDS14794.1 KDM5D gene_id:8284|Hs108|chrY          (1539) 3442 568.5 5.8e-161
CCDS55417.1 KDM5C gene_id:8242|Hs108|chrX          (1379) 3359 555.0 5.8e-157
CCDS65269.1 KDM5C gene_id:8242|Hs108|chrX          (1559) 3359 555.1 6.3e-157
CCDS14351.1 KDM5C gene_id:8242|Hs108|chrX          (1560) 3359 555.1 6.3e-157
CCDS55555.1 KDM5D gene_id:8284|Hs108|chrY          (1570) 2616 435.1 8.4e-121
CCDS44713.1 KDM4E gene_id:390245|Hs108|chr11       ( 506)  450 84.9 7.1e-16
CCDS8302.1 KDM4D gene_id:55693|Hs108|chr11         ( 523)  446 84.3 1.1e-15
CCDS491.1 KDM4A gene_id:9682|Hs108|chr1            (1064)  445 84.3 2.2e-15
CCDS55286.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9         ( 813)  434 82.5 6.1e-15
CCDS55285.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9         ( 835)  434 82.5 6.2e-15
CCDS6471.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9          (1056)  434 82.6 7.5e-15
CCDS12138.1 KDM4B gene_id:23030|Hs108|chr19        (1096)  426 81.3 1.9e-14


>>CCDS30974.1 KDM5B gene_id:10765|Hs108|chr1              (1544 aa)
 initn: 10553 init1: 10553 opt: 10553  Z-score: 9209.8  bits: 1716.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 10553; 100.0% identity (100.0% similar) in 1544 aa overlap (1-1544:1-1544)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE9 MEAATTLHPGPRPALPLGGPGPLGEFLPPPECPVFEPSWEEFADPFAFIHKIRPIAEQTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MEAATTLHPGPRPALPLGGPGPLGEFLPPPECPVFEPSWEEFADPFAFIHKIRPIAEQTG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE9 ICKVRPPPDWQPPFACDVDKLHFTPRIQRLNELEAQTRVKLNFLDQIAKYWELQGSTLKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ICKVRPPPDWQPPFACDVDKLHFTPRIQRLNELEAQTRVKLNFLDQIAKYWELQGSTLKI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE9 PHVERKILDLFQLNKLVAEEGGFAVVCKDRKWTKIATKMGFAPGKAVGSHIRGHYERILN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 PHVERKILDLFQLNKLVAEEGGFAVVCKDRKWTKIATKMGFAPGKAVGSHIRGHYERILN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE9 PYNLFLSGDSLRCLQKPNLTTDTKDKEYKPHDIPQRQSVQPSETCPPARRAKRMRAEAMN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 PYNLFLSGDSLRCLQKPNLTTDTKDKEYKPHDIPQRQSVQPSETCPPARRAKRMRAEAMN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE9 IKIEPEETTEARTHNLRRRMGCPTPKCENEKEMKSSIKQEPIERKDYIVENEKEKPKSRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 IKIEPEETTEARTHNLRRRMGCPTPKCENEKEMKSSIKQEPIERKDYIVENEKEKPKSRS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE9 KKATNAVDLYVCLLCGSGNDEDRLLLCDGCDDSYHTFCLIPPLHDVPKGDWRCPKCLAQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 KKATNAVDLYVCLLCGSGNDEDRLLLCDGCDDSYHTFCLIPPLHDVPKGDWRCPKCLAQE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE9 CSKPQEAFGFEQAARDYTLRTFGEMADAFKSDYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVSTIEED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 CSKPQEAFGFEQAARDYTLRTFGEMADAFKSDYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVSTIEED
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE9 VTVEYGADIASKEFGSGFPVRDGKIKLSPEEEEYLDSGWNLNNMPVMEQSVLAHITADIC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VTVEYGADIASKEFGSGFPVRDGKIKLSPEEEEYLDSGWNLNNMPVMEQSVLAHITADIC
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE9 GMKLPWLYVGMCFSSFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPGYAAEQLENVMKKLAPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 GMKLPWLYVGMCFSSFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPGYAAEQLENVMKKLAPE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE9 LFVSQPDLLHQLVTIMNPNTLMTHEVPVYRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGFNFAEAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LFVSQPDLLHQLVTIMNPNTLMTHEVPVYRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGFNFAEAV
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE9 NFCTVDWLPLGRQCVEHYRLLHRYCVFSHDEMICKMASKADVLDVVVASTVQKDMAIMIE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 NFCTVDWLPLGRQCVEHYRLLHRYCVFSHDEMICKMASKADVLDVVVASTVQKDMAIMIE
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE9 DEKALRETVRKLGVIDSERMDFELLPDDERQCVKCKTTCFMSAISCSCKPGLLVCLHHVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DEKALRETVRKLGVIDSERMDFELLPDDERQCVKCKTTCFMSAISCSCKPGLLVCLHHVK
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE9 ELCSCPPYKYKLRYRYTLDDLYPMMNALKLRAESYNEWALNVNEALEAKINKKKSLVSFK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ELCSCPPYKYKLRYRYTLDDLYPMMNALKLRAESYNEWALNVNEALEAKINKKKSLVSFK
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE9 ALIEESEMKKFPDNDLLRHLRLVTQDAEKCASVAQQLLNGKRQTRYRSGGGKSQNQLTVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ALIEESEMKKFPDNDLLRHLRLVTQDAEKCASVAQQLLNGKRQTRYRSGGGKSQNQLTVN
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE9 ELRQFVTQLYALPCVLSQTPLLKDLLNRVEDFQQHSQKLLSEETPSAAELQDLLDVSFEF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ELRQFVTQLYALPCVLSQTPLLKDLLNRVEDFQQHSQKLLSEETPSAAELQDLLDVSFEF
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE9 DVELPQLAEMRIRLEQARWLEEVQQACLDPSSLTLDDMRRLIDLGVGLAPYSAVEKAMAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DVELPQLAEMRIRLEQARWLEEVQQACLDPSSLTLDDMRRLIDLGVGLAPYSAVEKAMAR
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE9 LQELLTVSEHWDDKAKSLLKARPRHSLNSLATAVKEIEEIPAYLPNGAALKDSVQRARDW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LQELLTVSEHWDDKAKSLLKARPRHSLNSLATAVKEIEEIPAYLPNGAALKDSVQRARDW
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE9 LQDVEGLQAGGRVPVLDTLIELVTRGRSIPVHLNSLPRLETLVAEVQAWKECAVNTFLTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LQDVEGLQAGGRVPVLDTLIELVTRGRSIPVHLNSLPRLETLVAEVQAWKECAVNTFLTE
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE9 NSPYSLLEVLCPRCDIGLLGLKRKQRKLKEPLPNGKKKSTKLESLSDLERALTESKETAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 NSPYSLLEVLCPRCDIGLLGLKRKQRKLKEPLPNGKKKSTKLESLSDLERALTESKETAS
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE9 AMATLGEARLREMEALQSLRLANEGKLLSPLQDVDIKICLCQKAPAAPMIQCELCRDAFH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 AMATLGEARLREMEALQSLRLANEGKLLSPLQDVDIKICLCQKAPAAPMIQCELCRDAFH
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE9 TSCVAVPSISQGLRIWLCPHCRRSEKPPLEKILPLLASLQRIRVRLPEGDALRYMIERTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 TSCVAVPSISQGLRIWLCPHCRRSEKPPLEKILPLLASLQRIRVRLPEGDALRYMIERTV
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE9 NWQHRAQQLLSSGNLKFVQDRVGSGLLYSRWQASAGQVSDTNKVSQPPGTTSFSLPDDWD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 NWQHRAQQLLSSGNLKFVQDRVGSGLLYSRWQASAGQVSDTNKVSQPPGTTSFSLPDDWD
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE9 NRTSYLHSPFSTGRSCIPLHGVSPEVNELLMEAQLLQVSLPEIQELYQTLLAKPSPAQQT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 NRTSYLHSPFSTGRSCIPLHGVSPEVNELLMEAQLLQVSLPEIQELYQTLLAKPSPAQQT
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KE9 DRSSPVRPSSEKNDCCRGKRDGINSLERKLKRRLEREGLSSERWERVKKMRTPKKKKIKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DRSSPVRPSSEKNDCCRGKRDGINSLERKLKRRLEREGLSSERWERVKKMRTPKKKKIKL
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KE9 SHPKDMNNFKLERERSYELVRSAETHSLPSDTSYSEQEDSEDEDAICPAVSCLQPEGDEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SHPKDMNNFKLERERSYELVRSAETHSLPSDTSYSEQEDSEDEDAICPAVSCLQPEGDEV
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540    
pF1KE9 DWVQCDGSCNQWFHQVCVGVSPEMAEKEDYICVRCTVKDAPSRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DWVQCDGSCNQWFHQVCVGVSPEMAEKEDYICVRCTVKDAPSRK
             1510      1520      1530      1540    

>>CCDS81417.1 KDM5B gene_id:10765|Hs108|chr1              (1580 aa)
 initn: 8878 init1: 8878 opt: 8878  Z-score: 7747.7  bits: 1446.4 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 10448; 97.7% identity (97.7% similar) in 1576 aa overlap (5-1544:5-1580)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE9 MEAATTLHPGPRPALPLGGPGPLGEFLPPPECPVFEPSWEEFADPFAFIHKIRPIAEQTG
           ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MEAATTLHPGPRPALPLGGPGPLGEFLPPPECPVFEPSWEEFADPFAFIHKIRPIAEQTG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE9 ICKVRPPPDWQPPFACDVDKLHFTPRIQRLNELEAQTRVKLNFLDQIAKYWELQGSTLKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ICKVRPPPDWQPPFACDVDKLHFTPRIQRLNELEAQTRVKLNFLDQIAKYWELQGSTLKI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE9 PHVERKILDLFQLNKLVAEEGGFAVVCKDRKWTKIATKMGFAPGKAVGSHIRGHYERILN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PHVERKILDLFQLNKLVAEEGGFAVVCKDRKWTKIATKMGFAPGKAVGSHIRGHYERILN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230          
pF1KE9 PYNLFLSGDSLRCLQKPNLTTDTKDKEYKPHDIPQRQSVQPSETCPPARRAKRMRAE---
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::   
CCDS81 PYNLFLSGDSLRCLQKPNLTTDTKDKEYKPHDIPQRQSVQPSETCPPARRAKRMRAERQS
              190       200       210       220       230       240

                                        240       250       260    
pF1KE9 ---------------------------------AMNIKIEPEETTEARTHNLRRRMGCPT
                                        :::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LAVLPRLECSGAILAHCNLRLLDSSNSSASASQAMNIKIEPEETTEARTHNLRRRMGCPT
              250       260       270       280       290       300

          270       280       290       300       310       320    
pF1KE9 PKCENEKEMKSSIKQEPIERKDYIVENEKEKPKSRSKKATNAVDLYVCLLCGSGNDEDRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PKCENEKEMKSSIKQEPIERKDYIVENEKEKPKSRSKKATNAVDLYVCLLCGSGNDEDRL
              310       320       330       340       350       360

          330       340       350       360       370       380    
pF1KE9 LLCDGCDDSYHTFCLIPPLHDVPKGDWRCPKCLAQECSKPQEAFGFEQAARDYTLRTFGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LLCDGCDDSYHTFCLIPPLHDVPKGDWRCPKCLAQECSKPQEAFGFEQAARDYTLRTFGE
              370       380       390       400       410       420

          390       400       410       420       430       440    
pF1KE9 MADAFKSDYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVSTIEEDVTVEYGADIASKEFGSGFPVRDGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MADAFKSDYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVSTIEEDVTVEYGADIASKEFGSGFPVRDGK
              430       440       450       460       470       480

          450       460       470       480       490       500    
pF1KE9 IKLSPEEEEYLDSGWNLNNMPVMEQSVLAHITADICGMKLPWLYVGMCFSSFCWHIEDHW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 IKLSPEEEEYLDSGWNLNNMPVMEQSVLAHITADICGMKLPWLYVGMCFSSFCWHIEDHW
              490       500       510       520       530       540

          510       520       530       540       550       560    
pF1KE9 SYSINYLHWGEPKTWYGVPGYAAEQLENVMKKLAPELFVSQPDLLHQLVTIMNPNTLMTH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SYSINYLHWGEPKTWYGVPGYAAEQLENVMKKLAPELFVSQPDLLHQLVTIMNPNTLMTH
              550       560       570       580       590       600

          570       580       590       600       610       620    
pF1KE9 EVPVYRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGFNFAEAVNFCTVDWLPLGRQCVEHYRLLHRY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EVPVYRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGFNFAEAVNFCTVDWLPLGRQCVEHYRLLHRY
              610       620       630       640       650       660

          630       640       650       660       670       680    
pF1KE9 CVFSHDEMICKMASKADVLDVVVASTVQKDMAIMIEDEKALRETVRKLGVIDSERMDFEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 CVFSHDEMICKMASKADVLDVVVASTVQKDMAIMIEDEKALRETVRKLGVIDSERMDFEL
              670       680       690       700       710       720

          690       700       710       720       730       740    
pF1KE9 LPDDERQCVKCKTTCFMSAISCSCKPGLLVCLHHVKELCSCPPYKYKLRYRYTLDDLYPM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LPDDERQCVKCKTTCFMSAISCSCKPGLLVCLHHVKELCSCPPYKYKLRYRYTLDDLYPM
              730       740       750       760       770       780

          750       760       770       780       790       800    
pF1KE9 MNALKLRAESYNEWALNVNEALEAKINKKKSLVSFKALIEESEMKKFPDNDLLRHLRLVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MNALKLRAESYNEWALNVNEALEAKINKKKSLVSFKALIEESEMKKFPDNDLLRHLRLVT
              790       800       810       820       830       840

          810       820       830       840       850       860    
pF1KE9 QDAEKCASVAQQLLNGKRQTRYRSGGGKSQNQLTVNELRQFVTQLYALPCVLSQTPLLKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QDAEKCASVAQQLLNGKRQTRYRSGGGKSQNQLTVNELRQFVTQLYALPCVLSQTPLLKD
              850       860       870       880       890       900

          870       880       890       900       910       920    
pF1KE9 LLNRVEDFQQHSQKLLSEETPSAAELQDLLDVSFEFDVELPQLAEMRIRLEQARWLEEVQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LLNRVEDFQQHSQKLLSEETPSAAELQDLLDVSFEFDVELPQLAEMRIRLEQARWLEEVQ
              910       920       930       940       950       960

          930       940       950       960       970       980    
pF1KE9 QACLDPSSLTLDDMRRLIDLGVGLAPYSAVEKAMARLQELLTVSEHWDDKAKSLLKARPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QACLDPSSLTLDDMRRLIDLGVGLAPYSAVEKAMARLQELLTVSEHWDDKAKSLLKARPR
              970       980       990      1000      1010      1020

          990      1000      1010      1020      1030      1040    
pF1KE9 HSLNSLATAVKEIEEIPAYLPNGAALKDSVQRARDWLQDVEGLQAGGRVPVLDTLIELVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 HSLNSLATAVKEIEEIPAYLPNGAALKDSVQRARDWLQDVEGLQAGGRVPVLDTLIELVT
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

         1050      1060      1070      1080      1090      1100    
pF1KE9 RGRSIPVHLNSLPRLETLVAEVQAWKECAVNTFLTENSPYSLLEVLCPRCDIGLLGLKRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RGRSIPVHLNSLPRLETLVAEVQAWKECAVNTFLTENSPYSLLEVLCPRCDIGLLGLKRK
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

         1110      1120      1130      1140      1150      1160    
pF1KE9 QRKLKEPLPNGKKKSTKLESLSDLERALTESKETASAMATLGEARLREMEALQSLRLANE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QRKLKEPLPNGKKKSTKLESLSDLERALTESKETASAMATLGEARLREMEALQSLRLANE
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

         1170      1180      1190      1200      1210      1220    
pF1KE9 GKLLSPLQDVDIKICLCQKAPAAPMIQCELCRDAFHTSCVAVPSISQGLRIWLCPHCRRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GKLLSPLQDVDIKICLCQKAPAAPMIQCELCRDAFHTSCVAVPSISQGLRIWLCPHCRRS
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

         1230      1240      1250      1260      1270      1280    
pF1KE9 EKPPLEKILPLLASLQRIRVRLPEGDALRYMIERTVNWQHRAQQLLSSGNLKFVQDRVGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EKPPLEKILPLLASLQRIRVRLPEGDALRYMIERTVNWQHRAQQLLSSGNLKFVQDRVGS
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

         1290      1300      1310      1320      1330      1340    
pF1KE9 GLLYSRWQASAGQVSDTNKVSQPPGTTSFSLPDDWDNRTSYLHSPFSTGRSCIPLHGVSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GLLYSRWQASAGQVSDTNKVSQPPGTTSFSLPDDWDNRTSYLHSPFSTGRSCIPLHGVSP
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

         1350      1360      1370      1380      1390      1400    
pF1KE9 EVNELLMEAQLLQVSLPEIQELYQTLLAKPSPAQQTDRSSPVRPSSEKNDCCRGKRDGIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EVNELLMEAQLLQVSLPEIQELYQTLLAKPSPAQQTDRSSPVRPSSEKNDCCRGKRDGIN
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

         1410      1420      1430      1440      1450      1460    
pF1KE9 SLERKLKRRLEREGLSSERWERVKKMRTPKKKKIKLSHPKDMNNFKLERERSYELVRSAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SLERKLKRRLEREGLSSERWERVKKMRTPKKKKIKLSHPKDMNNFKLERERSYELVRSAE
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

         1470      1480      1490      1500      1510      1520    
pF1KE9 THSLPSDTSYSEQEDSEDEDAICPAVSCLQPEGDEVDWVQCDGSCNQWFHQVCVGVSPEM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 THSLPSDTSYSEQEDSEDEDAICPAVSCLQPEGDEVDWVQCDGSCNQWFHQVCVGVSPEM
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

         1530      1540    
pF1KE9 AEKEDYICVRCTVKDAPSRK
       ::::::::::::::::::::
CCDS81 AEKEDYICVRCTVKDAPSRK
             1570      1580

>>CCDS41736.1 KDM5A gene_id:5927|Hs108|chr12              (1690 aa)
 initn: 5217 init1: 3675 opt: 4883  Z-score: 4260.4  bits: 801.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5090; 55.9% identity (80.6% similar) in 1333 aa overlap (17-1331:1-1322)

               10        20           30        40        50       
pF1KE9 MEAATTLHPGPRPALPLGGPGPLG---EFLPPPECPVFEPSWEEFADPFAFIHKIRPIAE
                       ..: :: :   ::.:::::::::::::::.::..:: .:::.::
CCDS41                 MAGVGPGGYAAEFVPPPECPVFEPSWEEFTDPLSFIGRIRPLAE
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pF1KE9 QTGICKVRPPPDWQPPFACDVDKLHFTPRIQRLNELEAQTRVKLNFLDQIAKYWELQGST
       .:::::.::: ::::::::.: ...::::.::::::::.:::.:.::::.::.:::::::
CCDS41 KTGICKIRPPKDWQPPFACEVKSFRFTPRVQRLNELEAMTRVRLDFLDQLAKFWELQGST
           50        60        70        80        90       100    

       120       130       140       150       160       170       
pF1KE9 LKIPHVERKILDLFQLNKLVAEEGGFAVVCKDRKWTKIATKMGFAPGKAVGSHIRGHYER
       :::: ::::::::. :.:.:: .::: .: :..::.:.....:. :::..:: ...::::
CCDS41 LKIPVVERKILDLYALSKIVASKGGFEMVTKEKKWSKVGSRLGYLPGKGTGSLLKSHYER
          110       120       130       140       150       160    

       180       190       200       210       220       230       
pF1KE9 ILNPYNLFLSGDSLRCLQKPNLTTDTKDKEYKPHDIPQRQSVQPSETCPPARRAKRMRAE
       :: ::.:: :: ::  .: :::  : :.:  .:. .    ...:     :. : . .  .
CCDS41 ILYPYELFQSGVSLMGVQMPNL--DLKEK-VEPEVLSTDTQTSPE----PGTRMNILPKR
          170       180         190        200           210       

       240       250        260       270       280       290      
pF1KE9 AMNIKIEPEETTEARTHNLRR-RMGCPTPKCENEKEMKSSIKQEPIERKDYIVE-NEKEK
       .  .: . :    .:. .:.. ..    ::  .   : .. :.. . :.  ... ..  .
CCDS41 TRRVKTQSESGDVSRNTELKKLQIFGAGPKVVGLA-MGTKDKEDEVTRRRKVTNRSDAFN
       220       230       240       250        260       270      

         300          310       320       330       340       350  
pF1KE9 PKSRSKKAT---NAVDLYVCLLCGSGNDEDRLLLCDGCDDSYHTFCLIPPLHDVPKGDWR
        . :..:.:   : ::::::..:: ::.::.:::::::::::::::::::: ::::::::
CCDS41 MQMRQRKGTLSVNFVDLYVCMFCGRGNNEDKLLLCDGCDDSYHTFCLIPPLPDVPKGDWR
        280       290       300       310       320       330      

            360       370       380       390       400       410  
pF1KE9 CPKCLAQECSKPQEAFGFEQAARDYTLRTFGEMADAFKSDYFNMPVHMVPTELVEKEFWR
       ::::.:.:::::.::::::::.:.:::..:::::: ::::::::::::::::::::::::
CCDS41 CPKCVAEECSKPREAFGFEQAVREYTLQSFGEMADNFKSDYFNMPVHMVPTELVEKEFWR
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pF1KE9 LVSTIEEDVTVEYGADIASKEFGSGFPVRDGKIKLSPEEEEYLDSGWNLNNMPVMEQSVL
       :::.::::: :::::::.::.:::::::.::. :. ::::::  ::::::::::.:::::
CCDS41 LVSSIEEDVIVEYGADISSKDFGSGFPVKDGRRKILPEEEEYALSGWNLNNMPVLEQSVL
        400       410       420       430       440       450      

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pF1KE9 AHITADICGMKLPWLYVGMCFSSFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPGYAAEQLEN
       :::..:: :::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..::::::.
CCDS41 AHINVDISGMKVPWLYVGMCFSSFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSHAAEQLEE
        460       470       480       490       500       510      

            540       550       560       570       580       590  
pF1KE9 VMKKLAPELFVSQPDLLHQLVTIMNPNTLMTHEVPVYRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQ
       ::..:::::: ::::::::::::::::.:: : ::::::::::::::.::::::::::::
CCDS41 VMRELAPELFESQPDLLHQLVTIMNPNVLMEHGVPVYRTNQCAGEFVVTFPRAYHSGFNQ
        520       530       540       550       560       570      

            600       610       620       630       640       650  
pF1KE9 GFNFAEAVNFCTVDWLPLGRQCVEHYRLLHRYCVFSHDEMICKMASKADVLDVVVASTVQ
       :.::::::::::.::::.:::::.::: :.:.:::::.:.: :::.  . ::: .:. : 
CCDS41 GYNFAEAVNFCTADWLPIGRQCVNHYRRLRRHCVFSHEELIFKMAADPECLDVGLAAMVC
        580       590       600       610       620       630      

            660       670       680       690       700       710  
pF1KE9 KDMAIMIEDEKALRETVRKLGVIDSERMDFELLPDDERQCVKCKTTCFMSAISCSCKPGL
       :....: :.:  :::.: ..::. ::.  :::.:::::::  :.::::.::..:::.:  
CCDS41 KELTLMTEEETRLRESVVQMGVLMSEEEVFELVPDDERQCSACRTTCFLSALTCSCNPER
        640       650       660       670       680       690      

            720       730       740       750       760       770  
pF1KE9 LVCLHHVKELCSCPPYKYKLRYRYTLDDLYPMMNALKLRAESYNEWALNVNEALEAKINK
       ::::.:  .:: ::  :  ::::: :.::  .. ..:.::.::. :.  :.::: :..:.
CCDS41 LVCLYHPTDLCPCPMQKKCLRYRYPLEDLPSLLYGVKVRAQSYDTWVSRVTEALSANFNH
        700       710       720       730       740       750      

            780       790       800       810       820       830  
pF1KE9 KKSLVSFKALIEESEMKKFPDNDLLRHLRLVTQDAEKCASVAQQLLNGKRQTRYRSGGGK
       ::.:. .....:..: .:.:.:::.:.:: ....:: :::::: ::. :.. :    .:.
CCDS41 KKDLIELRVMLEDAEDRKYPENDLFRKLRDAVKEAETCASVAQLLLSKKQKHRQSPDSGR
        760       770       780       790       800       810      

            840       850       860       870       880       890  
pF1KE9 SQNQLTVNELRQFVTQLYALPCVLSQTPLLKDLLNRVEDFQQHSQKLLSEETPSAAELQD
       ....:::.::. :: ::..::::.::.  .:.::. ::.:....:. . .:::....:: 
CCDS41 TRTKLTVEELKAFVQQLFSLPCVISQARQVKNLLDDVEEFHERAQEAMMDETPDSSKLQM
        820       830       840       850       860       870      

            900       910       920       930       940       950  
pF1KE9 LLDVSFEFDVELPQLAEMRIRLEQARWLEEVQQACLDPSSLTLDDMRRLIDLGVGLAPYS
       :.:..  . ::::.: ... .:.:::::.::. .  ::...::: :..::: ::::::. 
CCDS41 LIDMGSSLYVELPELPRLKQELQQARWLDEVRLTLSDPQQVTLDVMKKLIDSGVGLAPHH
        880       890       900       910       920       930      

            960       970       980       990      1000      1010  
pF1KE9 AVEKAMARLQELLTVSEHWDDKAKSLLKARPRHSLNSLATAVKEIEEIPAYLPNGAALKD
       :::::::.:::::::::.:..:::  :.::::::. :: . :.: ..:::.:::  .::.
CCDS41 AVEKAMAELQELLTVSERWEEKAKVCLQARPRHSVASLESIVNEAKNIPAFLPNVLSLKE
        940       950       960       970       980       990      

           1020      1030      1040      1050      1060      1070  
pF1KE9 SVQRARDWLQDVEGLQAGGRVPVLDTLIELVTRGRSIPVHLNSLPRLETLVAEVQAWKEC
       ..:.::.:   ::..:.:.    :. :  : ..:: :::.:..::..:. :: ..::.: 
CCDS41 ALQKAREWTAKVEAIQSGSNYAYLEQLESLSAKGRPIPVRLEALPQVESQVAAARAWRER
       1000      1010      1020      1030      1040      1050      

           1080      1090      1100       1110      1120      1130 
pF1KE9 AVNTFLTENSPYSLLEVLCPRCDIGLLGL-KRKQRKLKEPLPNGKKKSTKLESLSDLERA
       .  ::: .:: ..::.:: :: :::. :  : ...:.:: . . :.:.  :: :::::..
CCDS41 TGRTFLKKNSSHTLLQVLSPRTDIGVYGSGKNRRKKVKELIEKEKEKDLDLEPLSDLEEG
       1060      1070      1080      1090      1100      1110      

            1140      1150      1160      1170      1180      1190 
pF1KE9 LTESKETASAMATLGEARLREMEALQSLRLANEGKLLSPLQDVDIKICLCQKAPAAPMIQ
       : :...:: ..:.. : . .:.::..::: :: .:.    .  ..:.:.:.:. .. :.:
CCDS41 LEETRDTAMVVAVFKEREQKEIEAMHSLRAANLAKMTMVDRIEEVKFCICRKTASGFMLQ
       1120      1130      1140      1150      1160      1170      

            1200      1210               1220      1230      1240  
pF1KE9 CELCRDAFHTSCVAVPSISQGLR--IW-------LCPHCRRSEKPPLEKILPLLASLQRI
       ::::.: ::.::: .:. :.  .   :       ::: : ::..: :: :: ::.:::..
CCDS41 CELCKDWFHNSCVPLPKSSSQKKGSSWQAKEVKFLCPLCMRSRRPRLETILSLLVSLQKL
       1180      1190      1200      1210      1220      1230      

           1250      1260      1270      1280      1290      1300  
pF1KE9 RVRLPEGDALRYMIERTVNWQHRAQQLLSSGNLKFVQDRVGSGLLYSRWQASAGQVSDTN
        ::::::.::. . ::...:: ::.: :.. .:. .  ...  .: .:   .:..   :.
CCDS41 PVRLPEGEALQCLTERAMSWQDRARQALATDELSSALAKLS--VLSQRMVEQAAR-EKTE
       1240      1250      1260      1270        1280       1290   

           1310      1320      1330      1340      1350      1360  
pF1KE9 KVSQPPGTTSFSLPDDWDNRTSYLHSPFSTGRSCIPLHGVSPEVNELLMEAQLLQVSLPE
       :. .     . . ::   .  :. .: :.                               
CCDS41 KIISAELQKAAANPDLQGHLPSFQQSAFNRVVSSVSSSPRQTMDYDDEETDSDEDIRETY
          1300      1310      1320      1330      1340      1350   

>--
 initn: 496 init1: 366 opt: 403  Z-score: 350.3  bits: 77.7 E(32554): 3.4e-13
Smith-Waterman score: 497; 40.7% identity (67.5% similar) in 231 aa overlap (1341-1541:1440-1664)

             1320      1330      1340      1350      1360      1370
pF1KE9 TSFSLPDDWDNRTSYLHSPFSTGRSCIPLHGVSPEVNELLMEAQLLQVSLPEIQELYQTL
                                     :.. ...::.: ..::.::: : :.... :
CCDS41 SQGSSTPRKQPRKSPLVPRSLEPPVLELSPGAKAQLEELMMVGDLLEVSLDETQHIWRIL
    1410      1420      1430      1440      1450      1460         

             1380      1390         1400      1410          1420   
pF1KE9 LAKPSPAQQTDRSSPVRPSS---EKNDCCRGKRDGINSLERKLKRRLERE----GLSSER
        :   :..  ::   .  ..   ::    .::    .: :.: ::.::.     : ....
CCDS41 QATHPPSE--DRFLHIMEDDSMEEKPLKVKGK----DSSEKKRKRKLEKVEQLFGEGKQK
    1470        1480      1490          1500      1510      1520   

          1430      1440          1450                  1460       
pF1KE9 WERVKKMRTPKKKKIKLS--HPKDMNNF--KL--ERERS----------YELVR-SAETH
        ...:::  :.:::.::.  . :..:..  ::  :.::.           :::. :.: .
CCDS41 SKELKKMDKPRKKKLKLGADKSKELNKLAKKLAKEEERKKKKEKAAAAKVELVKESTEKK
          1530      1540      1550      1560      1570      1580   

             1470      1480      1490      1500      1510      1520
pF1KE9 ------SLPSDTSYSEQEDSEDEDAICPAVSCLQPEGDEVDWVQCDGSCNQWFHQVCVGV
             ..::  ..:  :.:.::.:.: : .: .:  :.::::::::.:..:::::::::
CCDS41 REKKVLDIPSKYDWSGAEESDDENAVCAAQNCQRPCKDKVDWVQCDGGCDEWFHQVCVGV
          1590      1600      1610      1620      1630      1640   

             1530      1540                           
pF1KE9 SPEMAEKEDYICVRCTVKDAPSRK                       
       ::::::.:::::. :. :..:                          
CCDS41 SPEMAENEDYICINCAKKQGPVSPGPAPPPSFIMSYKLPMEDLKETS
          1650      1660      1670      1680      1690

>>CCDS55554.1 KDM5D gene_id:8284|Hs108|chrY               (1482 aa)
 initn: 4253 init1: 2529 opt: 3442  Z-score: 3003.5  bits: 568.5 E(32554): 5.6e-161
Smith-Waterman score: 4205; 44.9% identity (69.1% similar) in 1555 aa overlap (20-1490:3-1468)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE9 MEAATTLHPGPRPALPLGGPGPLGEFLPPPECPVFEPSWEEFADPFAFIHKIRPIAEQTG
                          ::   ::::::::::::::: :: ::...: :::::::..:
CCDS55                  MEPG-CDEFLPPPECPVFEPSWAEFQDPLGYIAKIRPIAEKSG
                                 10        20        30        40  

               70        80        90       100       110       120
pF1KE9 ICKVRPPPDWQPPFACDVDKLHFTPRIQRLNELEAQTRVKLNFLDQIAKYWELQGSTLKI
       :::.::: ::::::: .::...::::.:::::::::::::::.::::::.::.:::.:::
CCDS55 ICKIRPPADWQPPFAVEVDNFRFTPRVQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKI
             50        60        70        80        90       100  

              130       140       150       160       170       180
pF1KE9 PHVERKILDLFQLNKLVAEEGGFAVVCKDRKWTKIATKMGFAPGKAVGSHIRGHYERILN
       :.::::::::..:.:           :.                    .:          
CCDS55 PNVERKILDLYSLSKQ----------CN--------------------TH----------
            110                 120                                

              190       200       210       220       230          
pF1KE9 PYNLFLSGDSLRCLQKPNLTTDTKDKEYKPHDIPQRQSVQPSETCPPARRAKRMRAEAM-
       :..                 ...::::::::.:: :::::::.    .:::::.. .   
CCDS55 PFD-----------------NEVKDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFSSYSRRAKRLQPDPEP
                             130       140       150       160     

        240                        250       260        270        
pF1KE9 ---NIKIEPEET-----------------TEARTHNLRRRMGCP-TPKCENEKEMKSSIK
          .:. .::                   .. . ....... :: :   ..:.   ....
CCDS55 TEEDIEKHPELKKLQIYGPGPKMMGLGLMAKDKDKTVHKKVTCPPTVTVKDEQSGGGNVS
         170       180       190       200       210       220     

      280       290       300        310       320       330       
pF1KE9 QEPIERKDYIVENEKEKPKSRSKKATNA-VDLYVCLLCGSGNDEDRLLLCDGCDDSYHTF
       .  ....  .    :   . :.....   .: :.: .:. :...:.::.::::::.:: :
CCDS55 STLLKQHLSLEPCTKTTMQLRKNHSSAQFIDSYICQVCSRGDEDDKLLFCDGCDDNYHIF
         230       240       250       260       270       280     

       340       350       360       370       380       390       
pF1KE9 CLIPPLHDVPKGDWRCPKCLAQECSKPQEAFGFEQAARDYTLRTFGEMADAFKSDYFNMP
       ::.::: ..:.: ::::::.  ::..: ::::::::...:.:..::::::.:::::::::
CCDS55 CLLPPLPEIPRGIWRCPKCILAECKQPPEAFGFEQATQEYSLQSFGEMADSFKSDYFNMP
         290       300       310       320       330       340     

       400       410       420       430       440       450       
pF1KE9 VHMVPTELVEKEFWRLVSTIEEDVTVEYGADIASKEFGSGFPVRDGKIKLSPEEEEYLDS
       ::::::::::::::::::.::::::::::::: :::::::::: ..: .:::::.::  :
CCDS55 VHMVPTELVEKEFWRLVSSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSNSKQNLSPEEKEYATS
         350       360       370       380       390       400     

       460       470       480       490       500       510       
pF1KE9 GWNLNNMPVMEQSVLAHITADICGMKLPWLYVGMCFSSFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPK
       ::::: :::..:::: ::.::: :::.::::::: ::.::::::::::::::::::::::
CCDS55 GWNLNVMPVLDQSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPK
         410       420       430       440       450       460     

       520       530       540       550       560       570       
pF1KE9 TWYGVPGYAAEQLENVMKKLAPELFVSQPDLLHQLVTIMNPNTLMTHEVPVYRTNQCAGE
       ::::::. :::.::.::: :.:::: :::::::::::.:::::::.: ::: ::::::::
CCDS55 TWYGVPSLAAEHLEEVMKMLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGE
         470       480       490       500       510       520     

       580       590       600       610       620       630       
pF1KE9 FVITFPRAYHSGFNQGFNFAEAVNFCTVDWLPLGRQCVEHYRLLHRYCVFSHDEMICKMA
       ::::::::::::::::.::::::::::.:::: ::::.:::: :.:::::::.:.:::::
CCDS55 FVITFPRAYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKMA
         530       540       550       560       570       580     

       640       650       660       670       680       690       
pF1KE9 SKADVLDVVVASTVQKDMAIMIEDEKALRETVRKLGVIDSERMDFELLPDDERQCVKCKT
       .  ..::. .: .:.:.: ::...:. ::... . :: ..::  :::::::::::.::::
CCDS55 AFPETLDLNLAVAVHKEMFIMVQEERRLRKALLEKGVTEAEREAFELLPDDERQCIKCKT
         590       600       610       620       630       640     

       700       710       720       730       740       750       
pF1KE9 TCFMSAISCSCKPGLLVCLHHVKELCSCPPYKYKLRYRYTLDDLYPMMNALKLRAESYNE
       :::.::..:   :  :::: :...::.:   .  ::::::::.:  :.. ::.::::.. 
CCDS55 TCFLSALACYDCPDGLVCLSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPTMLHKLKIRAESFDT
         650       660       670       680       690       700     

       760       770       780       790       800       810       
pF1KE9 WALNVNEALEAKINKKKSLVSFKALIEESEMKKFPDNDLLRHLRLVTQDAEKCASVAQQL
       :: .:  :::.. ..:.:.  ..::  :.. ..::...::..:.   ...: : . .  :
CCDS55 WANKVRVALEVEDGRKRSFEELRALESEARERRFPNSELLQRLKNCLSEVEACIAQVLGL
         710       720       730       740       750       760     

       820       830       840       850       860       870       
pF1KE9 LNGKRQTRYRSGGGKSQNQLTVNELRQFVTQLYALPCVLSQTPLLKDLLNRVEDFQQHSQ
       ..:.  .:. .       :::..::: .. :. .:::.. :   .::.:..:: .: ...
CCDS55 VSGQV-ARMDT------PQLTLTELRVLLEQMGSLPCAMHQIGDVKDVLEQVEAYQAEAR
         770              780       790       800       810        

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pF1KE9 KLLSEETPSAAELQDLLDVSFEFDVELPQLAEMRIRLEQARWLEEVQQACLDPSSL--TL
       . :.    : . :..::. . .. ::.:.  ... ..:::.::.::.:: : ::.   .:
CCDS55 EALATLPSSPGLLRSLLERGQQLGVEVPEAHQLQQQVEQAQWLDEVKQA-LAPSAHRGSL
      820       830       840       850       860        870       

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pF1KE9 DDMRRLIDLGVGLAPYSAVEKAMARLQELLTVSEHWDDKAKSLLKARPRHSLNSLATAVK
         :. :. .:. .:   .:.:: :.::::::..:.:..::.  :.:: .:   .: . ..
CCDS55 VIMQGLLVMGAKIASSPSVDKARAELQELLTIAERWEEKAHFCLEARQKHPPATLEAIIR
       880       890       900       910       920       930       

        1000      1010      1020      1030      1040      1050     
pF1KE9 EIEEIPAYLPNGAALKDSVQRARDWLQDVEGLQAGGRVPVLDTLIELVTRGRSIPVHLNS
       : :.::..:::  :::... .:. :. ::. .: : . : :: :  ::. ::..:: :. 
CCDS55 ETENIPVHLPNIQALKEALTKAQAWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLVAVGRDLPVGLEE
       940       950       960       970       980       990       

        1060      1070      1080      1090      1100      1110     
pF1KE9 LPRLETLVAEVQAWKECAVNTFLTENSPYSLLEVLCPRCDIGLLGLKRKQRKLKEPLPNG
       : .::  :  ...:.: : .::: .:: :.:::::::  : :  . ::. : ... : . 
CCDS55 LRQLELQVLTAHSWREKASKTFLKKNSCYTLLEVLCPCADAGSDSTKRS-RWMEKAL-GL
      1000      1010      1020      1030      1040       1050      

        1120      1130      1140      1150      1160        1170   
pF1KE9 KKKSTKLESLSDLERALTESKETASAMATLGEARLREMEALQSLRLANEGKL--LSP--L
        . .:.: .::       . .. .:..... :.. .: :.. .:: .: .:   :.:  .
CCDS55 YQCDTELLGLSA-----QDLRDPGSVIVAFKEGEQKEKEGILQLRRTNSAKPSPLAPSLM
        1060           1070      1080      1090      1100      1110

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pF1KE9 QDVDIKICLCQKAPAA-PMIQCELCRDAFHTSCVAVPSI---------SQGLRIW-----
        .   .::.: ..::.  ..::.::.: :: .::.:: .         :. :  :     
CCDS55 ASSPTSICVCGQVPAGVGVLQCDLCQDWFHGQCVSVPHLLTSPKPSLTSSPLLAWWEWDT
             1120      1130      1140      1150      1160      1170

         1220      1230      1240      1250      1260      1270    
pF1KE9 --LCPHCRRSEKPPLEKILPLLASLQRIRVRLPEGDALRYMIERTVNWQHRAQQLLSSGN
         ::: : ::..: :: :: ::..:::. ::::::.::. . ::...:: ::.. :.: .
CCDS55 KFLCPLCMRSRRPRLETILALLVALQRLPVRLPEGEALQCLTERAIGWQDRARKALASED
             1180      1190      1200      1210      1220      1230

                 1280                            1290      1300    
pF1KE9 L--------KFVQD----------------------RVGSGLLYSRWQASAGQVSDTNKV
       .        .. :.                      : :::   :. :   : . . ..:
CCDS55 VTALLRQLAELRQQLQAKPRPEEASVYTSATACDPIREGSGNNISKVQ---GLLENGDSV
             1240      1250      1260      1270         1280       

             1310      1320      1330      1340      1350      1360
pF1KE9 SQP----PGTTSFSLPDDWDNRTSYLHSPFSTGRSCIPLHGVSPEVNELLMEAQLLQVSL
       ..:    ::  :     : .  .: :  :  ::      ...   ..::.::..::.:.:
CCDS55 TSPENMAPGKGS-----DLELLSSLL--PQLTGPVLELPEAIRAPLEELMMEGDLLEVTL
      1290           1300        1310      1320      1330      1340

             1370      1380      1390       1400      1410         
pF1KE9 PEIQELYQTLLAKPSPAQQTDRSSPVRPSSEKNDCC-RGKRDGINSLERKLKRRLEREGL
        : . ..: : :   :  . ::   .:   : .    .:.:    .:::. .:.   .: 
CCDS55 DENHSIWQLLQAGQPP--DLDR---IRTLLELEKFEHQGSRTRSRALERRRRRQKVDQGR
             1350        1360         1370      1380      1390     

    1420       1430      1440      1450      1460        1470      
pF1KE9 SSERW-ERVKKMRTPKKKKIKLSHPKDMNNFKLERERSYELVRSAETHS--LPSDTSYSE
       . :   ..  . .  ... :  .  .. .... . .:   ..  .  ::  : .. .  .
CCDS55 NVENLVQQELQSKRARSSGIMSQVGREEEHYQEKADRENMFLTPSTDHSPFLKGNQNSLQ
        1400      1410      1420      1430      1440      1450     

       1480      1490      1500      1510      1520      1530      
pF1KE9 QEDSEDEDAICPAVSCLQPEGDEVDWVQCDGSCNQWFHQVCVGVSPEMAEKEDYICVRCT
       ..::   .: ::..                                              
CCDS55 HKDS-GSSAACPSLMPLLQLSYSDEQQL                                
         1460      1470      1480                                  

>>CCDS14794.1 KDM5D gene_id:8284|Hs108|chrY               (1539 aa)
 initn: 4486 init1: 2529 opt: 3442  Z-score: 3003.3  bits: 568.5 E(32554): 5.8e-161
Smith-Waterman score: 4550; 46.5% identity (71.9% similar) in 1556 aa overlap (20-1490:3-1525)

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pF1KE9 MEAATTLHPGPRPALPLGGPGPLGEFLPPPECPVFEPSWEEFADPFAFIHKIRPIAEQTG
                          ::   ::::::::::::::: :: ::...: :::::::..:
CCDS14                  MEPG-CDEFLPPPECPVFEPSWAEFQDPLGYIAKIRPIAEKSG
                                 10        20        30        40  

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pF1KE9 ICKVRPPPDWQPPFACDVDKLHFTPRIQRLNELEAQTRVKLNFLDQIAKYWELQGSTLKI
       :::.::: ::::::: .::...::::.:::::::::::::::.::::::.::.:::.:::
CCDS14 ICKIRPPADWQPPFAVEVDNFRFTPRVQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKI
             50        60        70        80        90       100  

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pF1KE9 PHVERKILDLFQLNKLVAEEGGFAVVCKDRKWTKIATKMGFAPGKAVGSHIRGHYERILN
       :.::::::::..:.:.: ::::. ..::::.:...: .. . ::: .:: .:.:::::. 
CCDS14 PNVERKILDLYSLSKIVIEEGGYEAICKDRRWARVAQRLHYPPGKNIGSLLRSHYERIIY
            110       120       130       140       150       160  

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pF1KE9 PYNLFLSG-DSLRCLQKPNLTTDTKDKEYKPHDIPQRQSVQPSETCPPARRAKRMRAEAM
       ::..: :: . ..:  .: . ...::::::::.:: :::::::.    .:::::.. .  
CCDS14 PYEMFQSGANHVQCNTHP-FDNEVKDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFSSYSRRAKRLQPDPE
            170       180        190       200       210       220 

         240                        250       260        270       
pF1KE9 ----NIKIEPEET-----------------TEARTHNLRRRMGCP-TPKCENEKEMKSSI
           .:. .::                   .. . ....... :: :   ..:.   ...
CCDS14 PTEEDIEKHPELKKLQIYGPGPKMMGLGLMAKDKDKTVHKKVTCPPTVTVKDEQSGGGNV
             230       240       250       260       270       280 

       280       290       300        310       320       330      
pF1KE9 KQEPIERKDYIVENEKEKPKSRSKKATNA-VDLYVCLLCGSGNDEDRLLLCDGCDDSYHT
       ..  ....  .    :   . :.....   .: :.: .:. :...:.::.::::::.:: 
CCDS14 SSTLLKQHLSLEPCTKTTMQLRKNHSSAQFIDSYICQVCSRGDEDDKLLFCDGCDDNYHI
             290       300       310       320       330       340 

        340       350       360       370       380       390      
pF1KE9 FCLIPPLHDVPKGDWRCPKCLAQECSKPQEAFGFEQAARDYTLRTFGEMADAFKSDYFNM
       :::.::: ..:.: ::::::.  ::..: ::::::::...:.:..::::::.::::::::
CCDS14 FCLLPPLPEIPRGIWRCPKCILAECKQPPEAFGFEQATQEYSLQSFGEMADSFKSDYFNM
             350       360       370       380       390       400 

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pF1KE9 PVHMVPTELVEKEFWRLVSTIEEDVTVEYGADIASKEFGSGFPVRDGKIKLSPEEEEYLD
       :::::::::::::::::::.::::::::::::: :::::::::: ..: .:::::.::  
CCDS14 PVHMVPTELVEKEFWRLVSSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSNSKQNLSPEEKEYAT
             410       420       430       440       450       460 

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pF1KE9 SGWNLNNMPVMEQSVLAHITADICGMKLPWLYVGMCFSSFCWHIEDHWSYSINYLHWGEP
       :::::: :::..:::: ::.::: :::.::::::: ::.:::::::::::::::::::::
CCDS14 SGWNLNVMPVLDQSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEP
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pF1KE9 KTWYGVPGYAAEQLENVMKKLAPELFVSQPDLLHQLVTIMNPNTLMTHEVPVYRTNQCAG
       :::::::. :::.::.::: :.:::: :::::::::::.:::::::.: ::: :::::::
CCDS14 KTWYGVPSLAAEHLEEVMKMLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAG
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pF1KE9 EFVITFPRAYHSGFNQGFNFAEAVNFCTVDWLPLGRQCVEHYRLLHRYCVFSHDEMICKM
       :::::::::::::::::.::::::::::.:::: ::::.:::: :.:::::::.:.::::
CCDS14 EFVITFPRAYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKM
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pF1KE9 ASKADVLDVVVASTVQKDMAIMIEDEKALRETVRKLGVIDSERMDFELLPDDERQCVKCK
       :.  ..::. .: .:.:.: ::...:. ::... . :: ..::  :::::::::::.:::
CCDS14 AAFPETLDLNLAVAVHKEMFIMVQEERRLRKALLEKGVTEAEREAFELLPDDERQCIKCK
             650       660       670       680       690       700 

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pF1KE9 TTCFMSAISCSCKPGLLVCLHHVKELCSCPPYKYKLRYRYTLDDLYPMMNALKLRAESYN
       ::::.::..:   :  :::: :...::.:   .  ::::::::.:  :.. ::.::::..
CCDS14 TTCFLSALACYDCPDGLVCLSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPTMLHKLKIRAESFD
             710       720       730       740       750       760 

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pF1KE9 EWALNVNEALEAKINKKKSLVSFKALIEESEMKKFPDNDLLRHLRLVTQDAEKCASVAQQ
        :: .:  :::.. ..:.:.  ..::  :.. ..::...::..:.   ...: : . .  
CCDS14 TWANKVRVALEVEDGRKRSFEELRALESEARERRFPNSELLQRLKNCLSEVEACIAQVLG
             770       780       790       800       810       820 

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pF1KE9 LLNGKRQTRYRSGGGKSQNQLTVNELRQFVTQLYALPCVLSQTPLLKDLLNRVEDFQQHS
       :..:.  .:. .       :::..::: .. :. .:::.. :   .::.:..:: .: ..
CCDS14 LVSGQV-ARMDT------PQLTLTELRVLLEQMGSLPCAMHQIGDVKDVLEQVEAYQAEA
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pF1KE9 QKLLSEETPSAAELQDLLDVSFEFDVELPQLAEMRIRLEQARWLEEVQQACLDPSSL--T
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CCDS14 REALATLPSSPGLLRSLLERGQQLGVEVPEAHQLQQQVEQAQWLDEVKQA-LAPSAHRGS
          880       890       900       910       920        930   

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pF1KE9 LDDMRRLIDLGVGLAPYSAVEKAMARLQELLTVSEHWDDKAKSLLKARPRHSLNSLATAV
       :  :. :. .:. .:   .:.:: :.::::::..:.:..::.  :.:: .:   .: . .
CCDS14 LVIMQGLLVMGAKIASSPSVDKARAELQELLTIAERWEEKAHFCLEARQKHPPATLEAII
           940       950       960       970       980       990   

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pF1KE9 KEIEEIPAYLPNGAALKDSVQRARDWLQDVEGLQAGGRVPVLDTLIELVTRGRSIPVHLN
       .: :.::..:::  :::... .:. :. ::. .: : . : :: :  ::. ::..:: :.
CCDS14 RETENIPVHLPNIQALKEALTKAQAWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLVAVGRDLPVGLE
          1000      1010      1020      1030      1040      1050   

         1060      1070      1080      1090      1100      1110    
pF1KE9 SLPRLETLVAEVQAWKECAVNTFLTENSPYSLLEVLCPRCDIGLLGLKRKQRKLKEPLPN
        : .::  :  ...:.: : .::: .:: :.:::::::  : :  . ::. : ... : .
CCDS14 ELRQLELQVLTAHSWREKASKTFLKKNSCYTLLEVLCPCADAGSDSTKRS-RWMEKAL-G
          1060      1070      1080      1090      1100       1110  

         1120      1130      1140      1150      1160        1170  
pF1KE9 GKKKSTKLESLSDLERALTESKETASAMATLGEARLREMEALQSLRLANEGKL--LSP--
         . .:.: .::       . .. .:..... :.. .: :.. .:: .: .:   :.:  
CCDS14 LYQCDTELLGLSA-----QDLRDPGSVIVAFKEGEQKEKEGILQLRRTNSAKPSPLAPSL
            1120           1130      1140      1150      1160      

             1180       1190      1200               1210          
pF1KE9 LQDVDIKICLCQKAPAA-PMIQCELCRDAFHTSCVAVPSI---------SQGLRIW----
       . .   .::.: ..::.  ..::.::.: :: .::.:: .         :. :  :    
CCDS14 MASSPTSICVCGQVPAGVGVLQCDLCQDWFHGQCVSVPHLLTSPKPSLTSSPLLAWWEWD
       1170      1180      1190      1200      1210      1220      

          1220      1230      1240      1250      1260      1270   
pF1KE9 ---LCPHCRRSEKPPLEKILPLLASLQRIRVRLPEGDALRYMIERTVNWQHRAQQLLSSG
          ::: : ::..: :: :: ::..:::. ::::::.::. . ::...:: ::.. :.: 
CCDS14 TKFLCPLCMRSRRPRLETILALLVALQRLPVRLPEGEALQCLTERAIGWQDRARKALASE
       1230      1240      1250      1260      1270      1280      

                  1280                            1290      1300   
pF1KE9 NL--------KFVQD----------------------RVGSGLLYSRWQASAGQVSDTNK
       ..        .. :.                      : :::   :. :   : . . ..
CCDS14 DVTALLRQLAELRQQLQAKPRPEEASVYTSATACDPIREGSGNNISKVQ---GLLENGDS
       1290      1300      1310      1320      1330         1340   

              1310      1320      1330      1340      1350         
pF1KE9 VSQP----PGTTSFSLPDDWDNRTSYLHSPFSTGRSCIPLHGVSPEVNELLMEAQLLQVS
       :..:    ::  :     : .  .: :  :  ::      ...   ..::.::..::.:.
CCDS14 VTSPENMAPGKGS-----DLELLSSLL--PQLTGPVLELPEAIRAPLEELMMEGDLLEVT
          1350           1360        1370      1380      1390      

    1360      1370      1380      1390       1400      1410        
pF1KE9 LPEIQELYQTLLAKPSPAQQTDRSSPVRPSSEKNDCC-RGKRDGINSLERKLKRRLEREG
       : : . ..: : :   :  . ::   .:   : .    .:.:    .:::. .:.   .:
CCDS14 LDENHSIWQLLQAGQPP--DLDR---IRTLLELEKFEHQGSRTRSRALERRRRRQKVDQG
       1400      1410           1420      1430      1440      1450 

     1420       1430      1440      1450      1460        1470     
pF1KE9 LSSERW-ERVKKMRTPKKKKIKLSHPKDMNNFKLERERSYELVRSAETHS--LPSDTSYS
        . :   ..  . .  ... :  .  .. .... . .:   ..  .  ::  : .. .  
CCDS14 RNVENLVQQELQSKRARSSGIMSQVGREEEHYQEKADRENMFLTPSTDHSPFLKGNQNSL
            1460      1470      1480      1490      1500      1510 

        1480      1490      1500      1510      1520      1530     
pF1KE9 EQEDSEDEDAICPAVSCLQPEGDEVDWVQCDGSCNQWFHQVCVGVSPEMAEKEDYICVRC
       ...::   .: ::..                                             
CCDS14 QHKDS-GSSAACPSLMPLLQLSYSDEQQL                               
             1520      1530                                        

>>CCDS55417.1 KDM5C gene_id:8242|Hs108|chrX               (1379 aa)
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pF1KE9 MEAATTLHPGPRPALPLGGPGPLGEFLPPPECPVFEPSWEEFADPFAFIHKIRPIAEQTG
                          ::   .:::::::::::::: :: ::...: :::::::..:
CCDS55                  MEPGS-DDFLPPPECPVFEPSWAEFRDPLGYIAKIRPIAEKSG
                                 10        20        30        40  

               70        80        90       100       110       120
pF1KE9 ICKVRPPPDWQPPFACDVDKLHFTPRIQRLNELEAQTRVKLNFLDQIAKYWELQGSTLKI
       :::.:::                                                     
CCDS55 ICKIRPPA----------------------------------------------------
             50                                                    

              130       140       150       160       170       180
pF1KE9 PHVERKILDLFQLNKLVAEEGGFAVVCKDRKWTKIATKMGFAPGKAVGSHIRGHYERILN
                      .:.::::. ..::::.:...: .... ::: .:: .:.:::::. 
CCDS55 ---------------IVVEEGGYEAICKDRRWARVAQRLNYPPGKNIGSLLRSHYERIVY
                              60        70        80        90     

              190        200       210       220       230         
pF1KE9 PYNLFLSGDSL-RCLQKPNLTTDTKDKEYKPHDIPQRQSVQPSETCPPARRAKRMRAEAM
       ::... :: .: .:  .: . .. ::::::::.:: :::::::.    .:::::.. .  
CCDS55 PYEMYQSGANLVQCNTRP-FDNEEKDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFNSYGRRAKRLQPDPE
         100       110        120       130       140       150    

     240       250                            260         270      
pF1KE9 NIKIEPEETTE-------------------ARTHNLRRR--MG--CPTPKCENEKEMKSS
         . . :.. :                   :. ..::..   :  :: :    ..:. ..
CCDS55 PTEEDIEKNPELKKLQIYGAGPKMMGLGLMAKDKTLRKKDKEGPECP-PTVVVKEELGGD
          160       170       180       190       200        210   

        280       290         300                310       320     
pF1KE9 IKQEPIERKDYIVENEK--EKPKSRSKKA-------TNA--VDLYVCLLCGSGNDEDRLL
       .: :    : ..  .:.  ..:.  .: .       .::  .. ::: .:. :...:.::
CCDS55 VKVESTSPKTFLESKEELSHSPEPCTKMTMRLRRNHSNAQFIESYVCRMCSRGDEDDKLL
           220       230       240       250       260       270   

         330       340       350       360       370       380     
pF1KE9 LCDGCDDSYHTFCLIPPLHDVPKGDWRCPKCLAQECSKPQEAFGFEQAARDYTLRTFGEM
       :::::::.:: :::.::: ..::: ::::::.  ::..: ::::::::.:.:::..::::
CCDS55 LCDGCDDNYHIFCLLPPLPEIPKGVWRCPKCVMAECKRPPEAFGFEQATREYTLQSFGEM
           280       290       300       310       320       330   

         390       400       410       420       430       440     
pF1KE9 ADAFKSDYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVSTIEEDVTVEYGADIASKEFGSGFPVRDGKI
       ::.::.:::::::::::::::::::::::..::::::::::::: :::::::::: :.: 
CCDS55 ADSFKADYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVNSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSDSKR
           340       350       360       370       380       390   

         450       460       470       480       490       500     
pF1KE9 KLSPEEEEYLDSGWNLNNMPVMEQSVLAHITADICGMKLPWLYVGMCFSSFCWHIEDHWS
       .:.::::::  :::::: :::.::::: ::.::: :::.::::::: ::.::::::::::
CCDS55 HLTPEEEEYATSGWNLNVMPVLEQSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWS
           400       410       420       430       440       450   

         510       520       530       540       550       560     
pF1KE9 YSINYLHWGEPKTWYGVPGYAAEQLENVMKKLAPELFVSQPDLLHQLVTIMNPNTLMTHE
       ::::::::::::::::::. :::.::.:::::.:::: :::::::::::.:::::::.: 
CCDS55 YSINYLHWGEPKTWYGVPSLAAEHLEEVMKKLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHG
           460       470       480       490       500       510   

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pF1KE9 VPVYRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGFNFAEAVNFCTVDWLPLGRQCVEHYRLLHRYC
       ::: ::::::::::::::::::::::::.::::::::::.:::: ::::.:::: :.:::
CCDS55 VPVVRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYC
           520       530       540       550       560       570   

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pF1KE9 VFSHDEMICKMASKADVLDVVVASTVQKDMAIMIEDEKALRETVRKLGVIDSERMDFELL
       ::::.:.:::::.  . ::. .:..:.:.: ::...:. ::... . :. ..::  ::::
CCDS55 VFSHEELICKMAACPEKLDLNLAAAVHKEMFIMVQEERRLRKALLEKGITEAEREAFELL
           580       590       600       610       620       630   

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pF1KE9 PDDERQCVKCKTTCFMSAISCSCKPGLLVCLHHVKELCSCPPYKYKLRYRYTLDDLYPMM
       :::::::.:::::::.::..:   :  :::: :...::.:   .  ::::::::.:  :.
CCDS55 PDDERQCIKCKTTCFLSALACYDCPDGLVCLSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPAML
           640       650       660       670       680       690   

         750       760       770       780       790       800     
pF1KE9 NALKLRAESYNEWALNVNEALEAKINKKKSLVSFKALIEESEMKKFPDNDLLRHLRLVTQ
       . ::.::::.. :: .:  :::.. ..:.::  ..::  :.. ..::...::..:.   .
CCDS55 HKLKVRAESFDTWANKVRVALEVEDGRKRSLEELRALESEARERRFPNSELLQQLKNCLS
           700       710       720       730       740       750   

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pF1KE9 DAEKCASVAQQLLNGKRQTRYRSGGGKSQNQLTVNELRQFVTQLYALPCVLSQTPLLKDL
       .:: :.: :  :..:..   .: .:     :.:..::: :. :.  :::.. :   .: .
CCDS55 EAEACVSRALGLVSGQEAGPHRVAGL----QMTLTELRAFLDQMNNLPCAMHQIGDVKGV
           760       770           780       790       800         

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pF1KE9 LNRVEDFQQHSQKLLSEETPSAAELQDLLDVSFEFDVELPQLAEMRIRLEQARWLEEVQQ
       :..:: .: .... :.    : . ::.::. . .. ::.:.  ... ..::::::.::..
CCDS55 LEQVEAYQAEAREALASLPSSPGLLQSLLERGRQLGVEVPEAQQLQRQVEQARWLDEVKR
     810       820       830       840       850       860         

         930         940       950       960       970       980   
pF1KE9 ACLDPSSL--TLDDMRRLIDLGVGLAPYSAVEKAMARLQELLTVSEHWDDKAKSLLKARP
       . : ::.   ::  :: :.  :...::  ::.::.:.::::::..:.:..::.  :.:: 
CCDS55 T-LAPSARRGTLAVMRGLLVAGASVAPSPAVDKAQAELQELLTIAERWEEKAHLCLEARQ
     870        880       890       900       910       920        

           990      1000      1010      1020      1030      1040   
pF1KE9 RHSLNSLATAVKEIEEIPAYLPNGAALKDSVQRARDWLQDVEGLQAGGRVPVLDTLIELV
       .:   .: . ..: :.::..:::  :::... .:: :. ::. .: : . : :: :  ::
CCDS55 KHPPATLEAIIREAENIPVHLPNIQALKEALAKARAWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLV
      930       940       950       960       970       980        

          1050      1060      1070      1080      1090      1100   
pF1KE9 TRGRSIPVHLNSLPRLETLVAEVQAWKECAVNTFLTENSPYSLLEVLCPRCDIGLLGLKR
       . ::..:: :. : .::  :  ...:.: : .::: .:: :.:::::::  : :  . ::
CCDS55 AVGRDLPVGLEELRQLELQVLTAHSWREKASKTFLKKNSCYTLLEVLCPCADAGSDSTKR
      990      1000      1010      1020      1030      1040        

          1110       1120      1130      1140      1150      1160  
pF1KE9 KQRKLKEPLPNGKKKS-TKLESLSDLERALTESKETASAMATLGEARLREMEALQSLRLA
       . : ... :  :  :: :.: .::       . .. .:..... :.. .: :.. .:: .
CCDS55 S-RWMEKEL--GLYKSDTELLGLSA-----QDLRDPGSVIVAFKEGEQKEKEGILQLRRT
      1050        1060      1070           1080      1090      1100

           1170           1180       1190      1200                
pF1KE9 NEGKLLSPLQDVDI-----KICLCQKAPA-APMIQCELCRDAFHTSCVAVPSI-------
       : .:  ::: . .      .::.: .. : :  .::.::.: ::  ::.:: .       
CCDS55 NSAKP-SPLASSSTASSTTSICVCGQVLAGAGALQCDLCQDWFHGRCVSVPRLLSSPRPN
              1110      1120      1130      1140      1150         

      1210             1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE9 --SQGLRIW-------LCPHCRRSEKPPLEKILPLLASLQRIRVRLPEGDALRYMIERTV
         :. :  :       ::: : ::..: :: :: ::..:::. ::::::.::. . ::..
CCDS55 PTSSPLLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRPRLETILALLVALQRLPVRLPEGEALQCLTERAI
    1160      1170      1180      1190      1200      1210         

             1270      1280      1290      1300      1310          
pF1KE9 NWQHRAQQLLSSGNLKFVQDRVGSGLLYSRWQASAGQVSDTNKVSQPPGT-----TSFSL
       .:: ::.: :.: ..  .  :..   : .: ::        :  . : .      .. ..
CCDS55 SWQGRARQALASEDVTALLGRLAE--LRQRLQAEPRPEEPPNYPAAPASDPLREGSGKDM
    1220      1230      1240        1250      1260      1270       

              1320      1330             1340              1350    
pF1KE9 P------DDWDNRTSYLHSPFSTGR------SCIP-LHGVS---PE-----VNELLMEAQ
       :      .. :. ::  .     :       : .: : :     ::     ..::.::..
CCDS55 PKVQGLLENGDSVTSPEKVAPEEGSDLELLSSLLPQLTGPVLELPEATRAPLEELMMEGD
      1280      1290      1300      1310      1320      1330       

         1360      1370       1380      1390      1400      1410   
pF1KE9 LLQVSLPEIQELYQTL-LAKPSPAQQTDRSSPVRPSSEKNDCCRGKRDGINSLERKLKRR
       ::.:.: : . . ..: .   .:   .: ::                             
CCDS55 LLEVTLDENHSIPESLDFCILTPRYCSDLSSWGPAPGVFPPW                  
      1340      1350      1360      1370                           

          1420      1430      1440      1450      1460      1470   
pF1KE9 LEREGLSSERWERVKKMRTPKKKKIKLSHPKDMNNFKLERERSYELVRSAETHSLPSDTS

>>CCDS65269.1 KDM5C gene_id:8242|Hs108|chrX               (1559 aa)
 initn: 4574 init1: 2583 opt: 3359  Z-score: 2930.8  bits: 555.1 E(32554): 6.3e-157
Smith-Waterman score: 4675; 48.3% identity (72.0% similar) in 1558 aa overlap (20-1489:3-1528)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE9 MEAATTLHPGPRPALPLGGPGPLGEFLPPPECPVFEPSWEEFADPFAFIHKIRPIAEQTG
                          ::   .:::::::::::::: :: ::...: :::::::..:
CCDS65                  MEPGS-DDFLPPPECPVFEPSWAEFRDPLGYIAKIRPIAEKSG
                                 10        20        30        40  

               70        80        90       100       110       120
pF1KE9 ICKVRPPPDWQPPFACDVDKLHFTPRIQRLNELEAQTRVKLNFLDQIAKYWELQGSTLKI
       :::.::: ::::::: .::...::::::::::::::::::::.::::::.::.:::.:::
CCDS65 ICKIRPPADWQPPFAVEVDNFRFTPRIQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKI
             50        60        70        80        90       100  

              130       140       150       160       170       180
pF1KE9 PHVERKILDLFQLNKLVAEEGGFAVVCKDRKWTKIATKMGFAPGKAVGSHIRGHYERILN
       :.:::.::::..:.:.:.::::. ..::::.:...: .... ::: .:: .:.:::::. 
CCDS65 PNVERRILDLYSLSKIVVEEGGYEAICKDRRWARVAQRLNYPPGKNIGSLLRSHYERIVY
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pF1KE9 PYNLFLSGDSLRCLQKPNLTTDTKDKEYKPHDIPQRQSVQPSETCPPARRAKRMRAEAMN
       ::... :: .: :  .: . .. ::::::::.:: :::::::.    .:::::.. .   
CCDS65 PYEMYQSGANLVCNTRP-FDNEEKDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFNSYGRRAKRLQPDPEP
            170        180       190       200       210       220 

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pF1KE9 IKIEPEETTE-------------------ARTHNLRRR--MG--CPTPKCENEKEMKSSI
        . . :.. :                   :. ..::..   :  :: :    ..:. ...
CCDS65 TEEDIEKNPELKKLQIYGAGPKMMGLGLMAKDKTLRKKDKEGPECP-PTVVVKEELGGDV
             230       240       250       260        270       280

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pF1KE9 KQEPIERKDYIVENEK--EKPKSRSKKA-------TNA--VDLYVCLLCGSGNDEDRLLL
       : :    : ..  .:.  ..:.  .: .       .::  .. ::: .:. :...:.:::
CCDS65 KVESTSPKTFLESKEELSHSPEPCTKMTMRLRRNHSNAQFIESYVCRMCSRGDEDDKLLL
              290       300       310       320       330       340

        330       340       350       360       370       380      
pF1KE9 CDGCDDSYHTFCLIPPLHDVPKGDWRCPKCLAQECSKPQEAFGFEQAARDYTLRTFGEMA
       ::::::.:: :::.::: ..::: ::::::.  ::..: ::::::::.:.:::..:::::
CCDS65 CDGCDDNYHIFCLLPPLPEIPKGVWRCPKCVMAECKRPPEAFGFEQATREYTLQSFGEMA
              350       360       370       380       390       400

        390       400       410       420       430       440      
pF1KE9 DAFKSDYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVSTIEEDVTVEYGADIASKEFGSGFPVRDGKIK
       :.::.:::::::::::::::::::::::..::::::::::::: :::::::::: :.: .
CCDS65 DSFKADYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVNSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSDSKRH
              410       420       430       440       450       460

        450       460       470       480       490       500      
pF1KE9 LSPEEEEYLDSGWNLNNMPVMEQSVLAHITADICGMKLPWLYVGMCFSSFCWHIEDHWSY
       :.::::::  :::::: :::.::::: ::.::: :::.::::::: ::.:::::::::::
CCDS65 LTPEEEEYATSGWNLNVMPVLEQSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSY
              470       480       490       500       510       520

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pF1KE9 SINYLHWGEPKTWYGVPGYAAEQLENVMKKLAPELFVSQPDLLHQLVTIMNPNTLMTHEV
       :::::::::::::::::. :::.::.:::::.:::: :::::::::::.:::::::.: :
CCDS65 SINYLHWGEPKTWYGVPSLAAEHLEEVMKKLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGV
              530       540       550       560       570       580

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pF1KE9 PVYRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGFNFAEAVNFCTVDWLPLGRQCVEHYRLLHRYCV
       :: ::::::::::::::::::::::::.::::::::::.:::: ::::.:::: :.::::
CCDS65 PVVRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCV
              590       600       610       620       630       640

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pF1KE9 FSHDEMICKMASKADVLDVVVASTVQKDMAIMIEDEKALRETVRKLGVIDSERMDFELLP
       :::.:.:::::.  . ::. .:..:.:.: ::...:. ::... . :. ..::  :::::
CCDS65 FSHEELICKMAACPEKLDLNLAAAVHKEMFIMVQEERRLRKALLEKGITEAEREAFELLP
              650       660       670       680       690       700

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pF1KE9 DDERQCVKCKTTCFMSAISCSCKPGLLVCLHHVKELCSCPPYKYKLRYRYTLDDLYPMMN
       ::::::.:::::::.::..:   :  :::: :...::.:   .  ::::::::.:  :..
CCDS65 DDERQCIKCKTTCFLSALACYDCPDGLVCLSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPAMLH
              710       720       730       740       750       760

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pF1KE9 ALKLRAESYNEWALNVNEALEAKINKKKSLVSFKALIEESEMKKFPDNDLLRHLRLVTQD
        ::.::::.. :: .:  :::.. ..:.::  ..::  :.. ..::...::..:.   ..
CCDS65 KLKVRAESFDTWANKVRVALEVEDGRKRSLEELRALESEARERRFPNSELLQQLKNCLSE
              770       780       790       800       810       820

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pF1KE9 AEKCASVAQQLLNGKRQTRYRSGGGKSQNQLTVNELRQFVTQLYALPCVLSQTPLLKDLL
       :: :.: :  :..:..   .: .:     :.:..::: :. :.  :::.. :   .: .:
CCDS65 AEACVSRALGLVSGQEAGPHRVAGL----QMTLTELRAFLDQMNNLPCAMHQIGDVKGVL
              830       840           850       860       870      

        870       880       890       900       910       920      
pF1KE9 NRVEDFQQHSQKLLSEETPSAAELQDLLDVSFEFDVELPQLAEMRIRLEQARWLEEVQQA
       ..:: .: .... :.    : . ::.::. . .. ::.:.  ... ..::::::.::...
CCDS65 EQVEAYQAEAREALASLPSSPGLLQSLLERGRQLGVEVPEAQQLQRQVEQARWLDEVKRT
        880       890       900       910       920       930      

        930         940       950       960       970       980    
pF1KE9 CLDPSSL--TLDDMRRLIDLGVGLAPYSAVEKAMARLQELLTVSEHWDDKAKSLLKARPR
        : ::.   ::  :: :.  :...::  ::.::.:.::::::..:.:..::.  :.:: .
CCDS65 -LAPSARRGTLAVMRGLLVAGASVAPSPAVDKAQAELQELLTIAERWEEKAHLCLEARQK
         940       950       960       970       980       990     

          990      1000      1010      1020      1030      1040    
pF1KE9 HSLNSLATAVKEIEEIPAYLPNGAALKDSVQRARDWLQDVEGLQAGGRVPVLDTLIELVT
       :   .: . ..: :.::..:::  :::... .:: :. ::. .: : . : :: :  ::.
CCDS65 HPPATLEAIIREAENIPVHLPNIQALKEALAKARAWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLVA
        1000      1010      1020      1030      1040      1050     

         1050      1060      1070      1080      1090      1100    
pF1KE9 RGRSIPVHLNSLPRLETLVAEVQAWKECAVNTFLTENSPYSLLEVLCPRCDIGLLGLKRK
        ::..:: :. : .::  :  ...:.: : .::: .:: :.:::::::  : :  . ::.
CCDS65 VGRDLPVGLEELRQLELQVLTAHSWREKASKTFLKKNSCYTLLEVLCPCADAGSDSTKRS
        1060      1070      1080      1090      1100      1110     

         1110       1120      1130      1140      1150      1160   
pF1KE9 QRKLKEPLPNGKKKS-TKLESLSDLERALTESKETASAMATLGEARLREMEALQSLRLAN
        : ... :  :  :: :.: .::       . .. .:..... :.. .: :.. .:: .:
CCDS65 -RWMEKEL--GLYKSDTELLGLSA-----QDLRDPGSVIVAFKEGEQKEKEGILQLRRTN
         1120        1130           1140      1150      1160       

          1170           1180       1190      1200                 
pF1KE9 EGKLLSPLQDVDI-----KICLCQKAPA-APMIQCELCRDAFHTSCVAVPSI--------
        .:  ::: . .      .::.: .. : :  .::.::.: ::  ::.:: .        
CCDS65 SAKP-SPLASSSTASSTTSICVCGQVLAGAGALQCDLCQDWFHGRCVSVPRLLSSPRPNP
      1170       1180      1190      1200      1210      1220      

     1210             1220      1230      1240      1250      1260 
pF1KE9 -SQGLRIW-------LCPHCRRSEKPPLEKILPLLASLQRIRVRLPEGDALRYMIERTVN
        :. :  :       ::: : ::..: :: :: ::..:::. ::::::.::. . ::...
CCDS65 TSSPLLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRPRLETILALLVALQRLPVRLPEGEALQCLTERAIS
       1230      1240      1250      1260      1270      1280      

            1270      1280      1290      1300      1310           
pF1KE9 WQHRAQQLLSSGNLKFVQDRVGSGLLYSRWQASAGQVSDTNKVSQPPGT-----TSFSLP
       :: ::.: :.: ..  .  :..   : .: ::        :  . : .      .. ..:
CCDS65 WQGRARQALASEDVTALLGRLAE--LRQRLQAEPRPEEPPNYPAAPASDPLREGSGKDMP
       1290      1300        1310      1320      1330      1340    

             1320       1330               1340              1350  
pF1KE9 ------DDWDNRTSYLH-SPF-STGR-------SCIP-LHGVS---PE-----VNELLME
             .. :. ::  . .:  ..:.       : .: : :     ::     ..::.::
CCDS65 KVQGLLENGDSVTSPEKVAPEEGSGKRDLELLSSLLPQLTGPVLELPEATRAPLEELMME
         1350      1360      1370      1380      1390      1400    

           1360      1370      1380      1390      1400      1410  
pF1KE9 AQLLQVSLPEIQELYQTLLAKPSPAQQTDRSSPVRPSSEKNDCCRGKRDGINSLERKLKR
       ..::.:.: : . ..: : :   :  .  :.     ..:..    :.:    .:::. .:
CCDS65 GDLLEVTLDENHSIWQLLQAGQPPDLERIRTLLELEKAERH----GSRARGRALERRRRR
         1410      1420      1430      1440          1450      1460

           1420      1430      1440      1450      1460      1470  
pF1KE9 RLEREGLSSERWERVKKMRTPKKKKIKLSHPKDMNNFKLERERSYELVRSAETHSLPSDT
       ...: :   :  . ...   ::.  .. : : . .. . :.:   :    .    .:.  
CCDS65 KVDRGG---EGDDPAREELEPKR--VRSSGP-EAEEVQEEEELEEETGGEGPPAPIPTTG
                1470      1480         1490      1500      1510    

           1480      1490      1500      1510      1520      1530  
pF1KE9 SYSEQEDSEDEDAICPAVSCLQPEGDEVDWVQCDGSCNQWFHQVCVGVSPEMAEKEDYIC
       : : :   :..... ::                                           
CCDS65 SPSTQ---ENQNGLEPAEGTTSGPSAPFSTLTPRLHLPCPQQPPQQQL            
            1520      1530      1540      1550                     

>>CCDS14351.1 KDM5C gene_id:8242|Hs108|chrX               (1560 aa)
 initn: 4556 init1: 2583 opt: 3359  Z-score: 2930.8  bits: 555.1 E(32554): 6.3e-157
Smith-Waterman score: 4667; 48.3% identity (72.0% similar) in 1559 aa overlap (20-1489:3-1529)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE9 MEAATTLHPGPRPALPLGGPGPLGEFLPPPECPVFEPSWEEFADPFAFIHKIRPIAEQTG
                          ::   .:::::::::::::: :: ::...: :::::::..:
CCDS14                  MEPGS-DDFLPPPECPVFEPSWAEFRDPLGYIAKIRPIAEKSG
                                 10        20        30        40  

               70        80        90       100       110       120
pF1KE9 ICKVRPPPDWQPPFACDVDKLHFTPRIQRLNELEAQTRVKLNFLDQIAKYWELQGSTLKI
       :::.::: ::::::: .::...::::::::::::::::::::.::::::.::.:::.:::
CCDS14 ICKIRPPADWQPPFAVEVDNFRFTPRIQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKI
             50        60        70        80        90       100  

              130       140       150       160       170       180
pF1KE9 PHVERKILDLFQLNKLVAEEGGFAVVCKDRKWTKIATKMGFAPGKAVGSHIRGHYERILN
       :.:::.::::..:.:.:.::::. ..::::.:...: .... ::: .:: .:.:::::. 
CCDS14 PNVERRILDLYSLSKIVVEEGGYEAICKDRRWARVAQRLNYPPGKNIGSLLRSHYERIVY
            110       120       130       140       150       160  

              190        200       210       220       230         
pF1KE9 PYNLFLSGDSL-RCLQKPNLTTDTKDKEYKPHDIPQRQSVQPSETCPPARRAKRMRAEAM
       ::... :: .: .:  .: . .. ::::::::.:: :::::::.    .:::::.. .  
CCDS14 PYEMYQSGANLVQCNTRP-FDNEEKDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFNSYGRRAKRLQPDPE
            170       180        190       200       210       220 

     240       250                            260         270      
pF1KE9 NIKIEPEETTE-------------------ARTHNLRRR--MG--CPTPKCENEKEMKSS
         . . :.. :                   :. ..::..   :  :: :    ..:. ..
CCDS14 PTEEDIEKNPELKKLQIYGAGPKMMGLGLMAKDKTLRKKDKEGPECP-PTVVVKEELGGD
             230       240       250       260        270       280

        280       290         300                310       320     
pF1KE9 IKQEPIERKDYIVENEK--EKPKSRSKKA-------TNA--VDLYVCLLCGSGNDEDRLL
       .: :    : ..  .:.  ..:.  .: .       .::  .. ::: .:. :...:.::
CCDS14 VKVESTSPKTFLESKEELSHSPEPCTKMTMRLRRNHSNAQFIESYVCRMCSRGDEDDKLL
              290       300       310       320       330       340

         330       340       350       360       370       380     
pF1KE9 LCDGCDDSYHTFCLIPPLHDVPKGDWRCPKCLAQECSKPQEAFGFEQAARDYTLRTFGEM
       :::::::.:: :::.::: ..::: ::::::.  ::..: ::::::::.:.:::..::::
CCDS14 LCDGCDDNYHIFCLLPPLPEIPKGVWRCPKCVMAECKRPPEAFGFEQATREYTLQSFGEM
              350       360       370       380       390       400

         390       400       410       420       430       440     
pF1KE9 ADAFKSDYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVSTIEEDVTVEYGADIASKEFGSGFPVRDGKI
       ::.::.:::::::::::::::::::::::..::::::::::::: :::::::::: :.: 
CCDS14 ADSFKADYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVNSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSDSKR
              410       420       430       440       450       460

         450       460       470       480       490       500     
pF1KE9 KLSPEEEEYLDSGWNLNNMPVMEQSVLAHITADICGMKLPWLYVGMCFSSFCWHIEDHWS
       .:.::::::  :::::: :::.::::: ::.::: :::.::::::: ::.::::::::::
CCDS14 HLTPEEEEYATSGWNLNVMPVLEQSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWS
              470       480       490       500       510       520

         510       520       530       540       550       560     
pF1KE9 YSINYLHWGEPKTWYGVPGYAAEQLENVMKKLAPELFVSQPDLLHQLVTIMNPNTLMTHE
       ::::::::::::::::::. :::.::.:::::.:::: :::::::::::.:::::::.: 
CCDS14 YSINYLHWGEPKTWYGVPSLAAEHLEEVMKKLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHG
              530       540       550       560       570       580

         570       580       590       600       610       620     
pF1KE9 VPVYRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGFNFAEAVNFCTVDWLPLGRQCVEHYRLLHRYC
       ::: ::::::::::::::::::::::::.::::::::::.:::: ::::.:::: :.:::
CCDS14 VPVVRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYC
              590       600       610       620       630       640

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pF1KE9 VFSHDEMICKMASKADVLDVVVASTVQKDMAIMIEDEKALRETVRKLGVIDSERMDFELL
       ::::.:.:::::.  . ::. .:..:.:.: ::...:. ::... . :. ..::  ::::
CCDS14 VFSHEELICKMAACPEKLDLNLAAAVHKEMFIMVQEERRLRKALLEKGITEAEREAFELL
              650       660       670       680       690       700

         690       700       710       720       730       740     
pF1KE9 PDDERQCVKCKTTCFMSAISCSCKPGLLVCLHHVKELCSCPPYKYKLRYRYTLDDLYPMM
       :::::::.:::::::.::..:   :  :::: :...::.:   .  ::::::::.:  :.
CCDS14 PDDERQCIKCKTTCFLSALACYDCPDGLVCLSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPAML
              710       720       730       740       750       760

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pF1KE9 NALKLRAESYNEWALNVNEALEAKINKKKSLVSFKALIEESEMKKFPDNDLLRHLRLVTQ
       . ::.::::.. :: .:  :::.. ..:.::  ..::  :.. ..::...::..:.   .
CCDS14 HKLKVRAESFDTWANKVRVALEVEDGRKRSLEELRALESEARERRFPNSELLQQLKNCLS
              770       780       790       800       810       820

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pF1KE9 DAEKCASVAQQLLNGKRQTRYRSGGGKSQNQLTVNELRQFVTQLYALPCVLSQTPLLKDL
       .:: :.: :  :..:..   .: .:     :.:..::: :. :.  :::.. :   .: .
CCDS14 EAEACVSRALGLVSGQEAGPHRVAGL----QMTLTELRAFLDQMNNLPCAMHQIGDVKGV
              830       840           850       860       870      

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pF1KE9 LNRVEDFQQHSQKLLSEETPSAAELQDLLDVSFEFDVELPQLAEMRIRLEQARWLEEVQQ
       :..:: .: .... :.    : . ::.::. . .. ::.:.  ... ..::::::.::..
CCDS14 LEQVEAYQAEAREALASLPSSPGLLQSLLERGRQLGVEVPEAQQLQRQVEQARWLDEVKR
        880       890       900       910       920       930      

         930         940       950       960       970       980   
pF1KE9 ACLDPSSL--TLDDMRRLIDLGVGLAPYSAVEKAMARLQELLTVSEHWDDKAKSLLKARP
       . : ::.   ::  :: :.  :...::  ::.::.:.::::::..:.:..::.  :.:: 
CCDS14 T-LAPSARRGTLAVMRGLLVAGASVAPSPAVDKAQAELQELLTIAERWEEKAHLCLEARQ
         940       950       960       970       980       990     

           990      1000      1010      1020      1030      1040   
pF1KE9 RHSLNSLATAVKEIEEIPAYLPNGAALKDSVQRARDWLQDVEGLQAGGRVPVLDTLIELV
       .:   .: . ..: :.::..:::  :::... .:: :. ::. .: : . : :: :  ::
CCDS14 KHPPATLEAIIREAENIPVHLPNIQALKEALAKARAWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLV
        1000      1010      1020      1030      1040      1050     

          1050      1060      1070      1080      1090      1100   
pF1KE9 TRGRSIPVHLNSLPRLETLVAEVQAWKECAVNTFLTENSPYSLLEVLCPRCDIGLLGLKR
       . ::..:: :. : .::  :  ...:.: : .::: .:: :.:::::::  : :  . ::
CCDS14 AVGRDLPVGLEELRQLELQVLTAHSWREKASKTFLKKNSCYTLLEVLCPCADAGSDSTKR
        1060      1070      1080      1090      1100      1110     

          1110       1120      1130      1140      1150      1160  
pF1KE9 KQRKLKEPLPNGKKKS-TKLESLSDLERALTESKETASAMATLGEARLREMEALQSLRLA
       . : ... :  :  :: :.: .::       . .. .:..... :.. .: :.. .:: .
CCDS14 S-RWMEKEL--GLYKSDTELLGLSA-----QDLRDPGSVIVAFKEGEQKEKEGILQLRRT
         1120        1130           1140      1150      1160       

           1170           1180       1190      1200                
pF1KE9 NEGKLLSPLQDVDI-----KICLCQKAPA-APMIQCELCRDAFHTSCVAVPSI-------
       : .:  ::: . .      .::.: .. : :  .::.::.: ::  ::.:: .       
CCDS14 NSAKP-SPLASSSTASSTTSICVCGQVLAGAGALQCDLCQDWFHGRCVSVPRLLSSPRPN
      1170       1180      1190      1200      1210      1220      

      1210             1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE9 --SQGLRIW-------LCPHCRRSEKPPLEKILPLLASLQRIRVRLPEGDALRYMIERTV
         :. :  :       ::: : ::..: :: :: ::..:::. ::::::.::. . ::..
CCDS14 PTSSPLLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRPRLETILALLVALQRLPVRLPEGEALQCLTERAI
       1230      1240      1250      1260      1270      1280      

             1270      1280      1290      1300      1310          
pF1KE9 NWQHRAQQLLSSGNLKFVQDRVGSGLLYSRWQASAGQVSDTNKVSQPPGT-----TSFSL
       .:: ::.: :.: ..  .  :..   : .: ::        :  . : .      .. ..
CCDS14 SWQGRARQALASEDVTALLGRLAE--LRQRLQAEPRPEEPPNYPAAPASDPLREGSGKDM
       1290      1300      1310        1320      1330      1340    

              1320       1330               1340              1350 
pF1KE9 P------DDWDNRTSYLH-SPF-STGR-------SCIP-LHGVS---PE-----VNELLM
       :      .. :. ::  . .:  ..:.       : .: : :     ::     ..::.:
CCDS14 PKVQGLLENGDSVTSPEKVAPEEGSGKRDLELLSSLLPQLTGPVLELPEATRAPLEELMM
         1350      1360      1370      1380      1390      1400    

            1360      1370      1380      1390      1400      1410 
pF1KE9 EAQLLQVSLPEIQELYQTLLAKPSPAQQTDRSSPVRPSSEKNDCCRGKRDGINSLERKLK
       :..::.:.: : . ..: : :   :  .  :.     ..:..    :.:    .:::. .
CCDS14 EGDLLEVTLDENHSIWQLLQAGQPPDLERIRTLLELEKAERH----GSRARGRALERRRR
         1410      1420      1430      1440          1450      1460

            1420      1430      1440      1450      1460      1470 
pF1KE9 RRLEREGLSSERWERVKKMRTPKKKKIKLSHPKDMNNFKLERERSYELVRSAETHSLPSD
       :...: :   :  . ...   ::.  .. : : . .. . :.:   :    .    .:. 
CCDS14 RKVDRGG---EGDDPAREELEPKR--VRSSGP-EAEEVQEEEELEEETGGEGPPAPIPTT
                1470      1480         1490      1500      1510    

            1480      1490      1500      1510      1520      1530 
pF1KE9 TSYSEQEDSEDEDAICPAVSCLQPEGDEVDWVQCDGSCNQWFHQVCVGVSPEMAEKEDYI
        : : :   :..... ::                                          
CCDS14 GSPSTQ---ENQNGLEPAEGTTSGPSAPFSTLTPRLHLPCPQQPPQQQL           
         1520         1530      1540      1550      1560           

>>CCDS55555.1 KDM5D gene_id:8284|Hs108|chrY               (1570 aa)
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                               ::::::::::::::: :: ::...: :::::::..:
CCDS55                   MEPGCDEFLPPPECPVFEPSWAEFQDPLGYIAKIRPIAEKSG
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pF1KE9 ICKVRPPPDWQPPFACDVDKLHFTPRIQRLNELEAQTRVKLNFLDQIAKYWELQGSTLKI
       :::.::: ::::::: .::...::::.:::::::::::::::.::::::.::.:::.:::
CCDS55 ICKIRPPADWQPPFAVEVDNFRFTPRVQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKI
             50        60        70        80        90       100  

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pF1KE9 PHVERKILDLFQLNKLVAEEGGFAVVCKDRKWTKIATKMGFAPGKAVGSHIRGHYERILN
       :.::::::::..:.:.: ::::. ..::::.:...: .. . ::: .:: .:.:::::. 
CCDS55 PNVERKILDLYSLSKIVIEEGGYEAICKDRRWARVAQRLHYPPGKNIGSLLRSHYERIIY
            110       120       130       140       150       160  

               190       200       210       220       230         
pF1KE9 PYNLFLSG-DSLRCLQKPNLTTDTKDKEYKPHDIPQRQSVQPSETCPPARRAKRMRAEAM
       ::..: :: . ..:  .: . ...::::::::.:: :::::::.    .:::::.. .  
CCDS55 PYEMFQSGANHVQCNTHP-FDNEVKDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFSSYSRRAKRLQPDPE
            170       180        190       200       210       220 

         240                        250       260        270       
pF1KE9 ----NIKIEPEET-----------------TEARTHNLRRRMGCP-TPKCENEKEMKSSI
           .:. .::                   .. . ....... :: :   ..:.   ...
CCDS55 PTEEDIEKHPELKKLQIYGPGPKMMGLGLMAKDKDKTVHKKVTCPPTVTVKDEQSGGGNV
             230       240       250       260       270       280 

       280       290       300        310       320       330      
pF1KE9 KQEPIERKDYIVENEKEKPKSRSKKATNA-VDLYVCLLCGSGNDEDRLLLCDGCDDSYHT
       ..  ....  .    :   . :.....   .: :.: .:. :...:.::.::::::.:: 
CCDS55 SSTLLKQHLSLEPCTKTTMQLRKNHSSAQFIDSYICQVCSRGDEDDKLLFCDGCDDNYHI
             290       300       310       320       330       340 

        340       350       360       370       380       390      
pF1KE9 FCLIPPLHDVPKGDWRCPKCLAQECSKPQEAFGFEQAARDYTLRTFGEMADAFKSDYFNM
       :::.::: ..:.: ::::::.  ::..: ::::::::...:.:..::::::.::::::::
CCDS55 FCLLPPLPEIPRGIWRCPKCILAECKQPPEAFGFEQATQEYSLQSFGEMADSFKSDYFNM
             350       360       370       380       390       400 

        400       410       420       430       440       450      
pF1KE9 PVHMVPTELVEKEFWRLVSTIEEDVTVEYGADIASKEFGSGFPVRDGKIKLSPEE-----
       :::::::::::::::::::.::::::::::::: :::::::::: ..: .:::::     
CCDS55 PVHMVPTELVEKEFWRLVSSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSNSKQNLSPEEKRQSL
             410       420       430       440       450       460 

                                       460       470       480     
pF1KE9 --------------------------EEYLDSGWNLNNMPVMEQSVLAHITADICGMKLP
                                 .::  :::::: :::..:::: ::.::: :::.:
CCDS55 TVLTRLISSFWAQAVLPPWPPKVLGLQEYATSGWNLNVMPVLDQSVLCHINADISGMKVP
             470       480       490       500       510       520 

         490       500       510       520       530       540     
pF1KE9 WLYVGMCFSSFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPGYAAEQLENVMKKLAPELFVSQ
       :::::: ::.::::::::::::::::::::::::::::. :::.::.::: :.:::: ::
CCDS55 WLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSLAAEHLEEVMKMLTPELFDSQ
             530       540       550       560       570       580 

         550       560       570       580       590       600     
pF1KE9 PDLLHQLVTIMNPNTLMTHEVPVYRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGFNFAEAVNFCTV
       :::::::::.:::::::.: ::: ::::::::::::::::::::::::.::::::::::.
CCDS55 PDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGYNFAEAVNFCTA
             590       600       610       620       630       640 

         610       620       630       640       650       660     
pF1KE9 DWLPLGRQCVEHYRLLHRYCVFSHDEMICKMASKADVLDVVVASTVQKDMAIMIEDEKAL
       :::: ::::.:::: :.:::::::.:.:::::.  ..::. .: .:.:.: ::...:. :
CCDS55 DWLPAGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKMAAFPETLDLNLAVAVHKEMFIMVQEERRL
             650       660       670       680       690       700 

         670       680       690       700       710       720     
pF1KE9 RETVRKLGVIDSERMDFELLPDDERQCVKCKTTCFMSAISCSCKPGLLVCLHHVKELCSC
       :... . :: ..::  :::::::::::.:::::::.::..:   :  :::: :...::.:
CCDS55 RKALLEKGVTEAEREAFELLPDDERQCIKCKTTCFLSALACYDCPDGLVCLSHINDLCKC
             710       720       730       740       750       760 

         730       740       750       760       770       780     
pF1KE9 PPYKYKLRYRYTLDDLYPMMNALKLRAESYNEWALNVNEALEAKINKKKSLVSFKALIEE
          .  ::::::::.:  :.. ::.::::.. :: .:  :::.. ..:.:.  ..::  :
CCDS55 SSSRQYLRYRYTLDELPTMLHKLKIRAESFDTWANKVRVALEVEDGRKRSFEELRALESE
             770       780       790       800       810       820 

         790       800       810       820       830       840     
pF1KE9 SEMKKFPDNDLLRHLRLVTQDAEKCASVAQQLLNGKRQTRYRSGGGKSQNQLTVNELRQF
       .. ..::...::..:.   ...: : . .  :..:.  .:. .       :::..::: .
CCDS55 ARERRFPNSELLQRLKNCLSEVEACIAQVLGLVSGQV-ARMDTP------QLTLTELRVL
             830       840       850        860             870    

         850       860       870       880       890       900     
pF1KE9 VTQLYALPCVLSQTPLLKDLLNRVEDFQQHSQKLLSEETPSAAELQDLLDVSFEFDVELP
       . :. .:::.. :   .::.:..:: .: .... :.    : . :..::. . .. ::.:
CCDS55 LEQMGSLPCAMHQIGDVKDVLEQVEAYQAEAREALATLPSSPGLLRSLLERGQQLGVEVP
          880       890       900       910       920       930    

         910       920       930         940       950       960   
pF1KE9 QLAEMRIRLEQARWLEEVQQACLDPSSL--TLDDMRRLIDLGVGLAPYSAVEKAMARLQE
       .  ... ..:::.::.::.:: : ::.   .:  :. :. .:. .:   .:.:: :.:::
CCDS55 EAHQLQQQVEQAQWLDEVKQA-LAPSAHRGSLVIMQGLLVMGAKIASSPSVDKARAELQE
          940       950        960       970       980       990   

           970       980       990      1000      1010      1020   
pF1KE9 LLTVSEHWDDKAKSLLKARPRHSLNSLATAVKEIEEIPAYLPNGAALKDSVQRARDWLQD
       :::..:.:..::.  :.:: .:   .: . ..: :.::..:::  :::... .:. :. :
CCDS55 LLTIAERWEEKAHFCLEARQKHPPATLEAIIRETENIPVHLPNIQALKEALTKAQAWIAD
          1000      1010      1020      1030      1040      1050   

          1030      1040      1050      1060      1070      1080   
pF1KE9 VEGLQAGGRVPVLDTLIELVTRGRSIPVHLNSLPRLETLVAEVQAWKECAVNTFLTENSP
       :. .: : . : :: :  ::. ::..:: :. : .::  :  ...:.: : .::: .:: 
CCDS55 VDEIQNGDHYPCLDDLEGLVAVGRDLPVGLEELRQLELQVLTAHSWREKASKTFLKKNSC
          1060      1070      1080      1090      1100      1110   

          1090      1100      1110      1120      1130      1140   
pF1KE9 YSLLEVLCPRCDIGLLGLKRKQRKLKEPLPNGKKKSTKLESLSDLERALTESKETASAMA
       :.:::::::  : :  . ::. : ... : .  . .:.: .::       . .. .:...
CCDS55 YTLLEVLCPCADAGSDSTKRS-RWMEKAL-GLYQCDTELLGLSA-----QDLRDPGSVIV
          1120      1130       1140       1150           1160      

          1150      1160        1170        1180       1190        
pF1KE9 TLGEARLREMEALQSLRLANEGKL--LSP--LQDVDIKICLCQKAPAA-PMIQCELCRDA
       .. :.. .: :.. .:: .: .:   :.:  . .   .::.: ..::.  ..::.::.: 
CCDS55 AFKEGEQKEKEGILQLRRTNSAKPSPLAPSLMASSPTSICVCGQVPAGVGVLQCDLCQDW
       1170      1180      1190      1200      1210      1220      

     1200               1210             1220      1230      1240  
pF1KE9 FHTSCVAVPSI---------SQGLRIW-------LCPHCRRSEKPPLEKILPLLASLQRI
       :: .::.:: .         :. :  :       ::: : ::..: :: :: ::..:::.
CCDS55 FHGQCVSVPHLLTSPKPSLTSSPLLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRPRLETILALLVALQRL
       1230      1240      1250      1260      1270      1280      

           1250      1260      1270              1280              
pF1KE9 RVRLPEGDALRYMIERTVNWQHRAQQLLSSGNL--------KFVQD--------------
        ::::::.::. . ::...:: ::.. :.: ..        .. :.              
CCDS55 PVRLPEGEALQCLTERAIGWQDRARKALASEDVTALLRQLAELRQQLQAKPRPEEASVYT
       1290      1300      1310      1320      1330      1340      

                     1290      1300          1310      1320        
pF1KE9 --------RVGSGLLYSRWQASAGQVSDTNKVSQP----PGTTSFSLPDDWDNRTSYLHS
               : :::   :. :   : . . ..:..:    ::  :     : .  .: :  
CCDS55 SATACDPIREGSGNNISKVQ---GLLENGDSVTSPENMAPGKGS-----DLELLSSLL--
       1350      1360         1370      1380           1390        

     1330      1340      1350      1360      1370      1380        
pF1KE9 PFSTGRSCIPLHGVSPEVNELLMEAQLLQVSLPEIQELYQTLLAKPSPAQQTDRSSPVRP
       :  ::      ...   ..::.::..::.:.: : . ..: : :   :  . ::   .: 
CCDS55 PQLTGPVLELPEAIRAPLEELMMEGDLLEVTLDENHSIWQLLQAGQPP--DLDR---IRT
       1400      1410      1420      1430      1440           1450 

     1390       1400      1410      1420       1430      1440      
pF1KE9 SSEKNDCC-RGKRDGINSLERKLKRRLEREGLSSERW-ERVKKMRTPKKKKIKLSHPKDM
         : .    .:.:    .:::. .:.   .: . :   ..  . .  ... :  .  .. 
CCDS55 LLELEKFEHQGSRTRSRALERRRRRQKVDQGRNVENLVQQELQSKRARSSGIMSQVGREE
            1460      1470      1480      1490      1500      1510 

       1450      1460        1470      1480      1490      1500    
pF1KE9 NNFKLERERSYELVRSAETHS--LPSDTSYSEQEDSEDEDAICPAVSCLQPEGDEVDWVQ
       .... . .:   ..  .  ::  : .. .  ...::   .: ::..              
CCDS55 EHYQEKADRENMFLTPSTDHSPFLKGNQNSLQHKDS-GSSAACPSLMPLLQLSYSDEQQL
            1520      1530      1540       1550      1560      1570

         1510      1520      1530      1540    
pF1KE9 CDGSCNQWFHQVCVGVSPEMAEKEDYICVRCTVKDAPSRK

>>CCDS44713.1 KDM4E gene_id:390245|Hs108|chr11            (506 aa)
 initn: 485 init1: 418 opt: 450  Z-score: 398.5  bits: 84.9 E(32554): 7.1e-16
Smith-Waterman score: 452; 30.5% identity (55.0% similar) in 331 aa overlap (370-692:83-381)

     340       350       360       370       380       390         
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                                     : :  .       :..    .:  .. : :
CCDS44 EWKARQMYDDIEDILIATPLQQVTSGQGGVFTQYHKKKKAMRVGQYRRLANSKKYQTPPH
             60        70        80        90       100       110  

     400       410       420       430       440       450         
pF1KE9 MVPTELVEKEFWRLVSTIEEDVTVEYGADIASKEFGSGFPVRDGKIKLSPEEEEYLDSGW
       .  ..: :...:.   .   .  . :::::.    :: :           ::     . :
CCDS44 QNFADL-EQRYWK---SHPGNPPI-YGADIS----GSLF-----------EEST---KQW
             120          130            140                       

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pF1KE9 NLNNMPVMEQSVLAHITADICGMKLPWLYVGMCFSSFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTW
       ::... .. . .  .  . : :.. :.:: ::  ..: :: ::   :::::::.::::::
CCDS44 NLGHLGTILDLLEQECGVVIEGVNTPYLYFGMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKTW
     150       160       170       180       190       200         

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       : ::   ...:: . ..: :..  .   .:.. :....:..:  . .:    .: ::::.
CCDS44 YVVPPEHGQHLERLARELFPDISRGCEAFLRHKVALISPTVLKENGIPFNCMTQEAGEFM
     210       220       230       240       250       260         

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pF1KE9 ITFPRAYHSGFNQGFNFAEAVNFCTVDWLPLGR---QCVEHYRLLHRYCVFSHDEMICKM
       .::: .::.:::.::: :::.:: :  :.  :.   ::      .    .:: : ..  .
CCDS44 VTFPYGYHAGFNHGFNCAEAINFATPRWIDYGKMASQCSCGESTV----TFSMDPFVRIV
     270       280       290       300       310           320     

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pF1KE9 ASKADVLDVVVASTVQKDMAIMIEDEKALRETV-----RKLGVIDSERMDFELLPDDERQ
         ..  :        ..:.::. . :  . :.      :   :.    . ..:::.   :
CCDS44 QPESYEL-----WKHRQDLAIVEHTEPRVAESQELSNWRDDIVLRRAALGLRLLPNLTAQ
         330            340       350       360       370       380

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pF1KE9 CVKCKTTCFMSAISCSCKPGLLVCLHHVKELCSCPPYKYKLRYRYTLDDLYPMMNALKLR
       :                                                           
CCDS44 CPTQPVSSGHCYNPKGCGTDAVPGSAFQSSAYHTQTQSLTLGMSARVLLPSTGSWGSGRG
              390       400       410       420       430       440




1544 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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 start: Sat Nov  5 19:19:33 2016 done: Sat Nov  5 19:19:34 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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