seq1 = pF1KB7056.tfa, 1752 bp
seq2 = pF1KB7056/gi568815579r_3947755.tfa (gi568815579r:3947755_4155232), 207478 bp

>pF1KB7056 1752
>gi568815579r:3947755_4155232 (Chr19)

(complement)

1-1262  (100001-101262)   100% ->
1263-1752  (106989-107478)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGGCGGCGTGGACGGCCCCATCGGGATCCCGTTCCCCGACCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCGGCGGCGTGGACGGCCCCATCGGGATCCCGTTCCCCGACCACAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGCGACATCCTGAGTGGGCTGAACGAGCAGCGGACGCAGGGCCTGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGCGACATCCTGAGTGGGCTGAACGAGCAGCGGACGCAGGGCCTGCTGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGACGTGGTGATCCTGGTGGAGGGCCGCGAGTTCCCCACGCACCGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCGACGTGGTGATCCTGGTGGAGGGCCGCGAGTTCCCCACGCACCGCTCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTGCTGGCCGCCTGCAGCCAGTACTTCAAGAAGCTGTTCACGTCGGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTGCTGGCCGCCTGCAGCCAGTACTTCAAGAAGCTGTTCACGTCGGGCGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGTGGTGGACCAGCAGAACGTGTACGAGATCGACTTCGTCAGCGCCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGTGGTGGACCAGCAGAACGTGTACGAGATCGACTTCGTCAGCGCCGAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CGCTCACCGCGCTCATGGACTTCGCCTACACGGCCACGCTCACCGTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CGCTCACCGCGCTCATGGACTTCGCCTACACGGCCACGCTCACCGTCAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACAGCCAACGTGGGTGACATCCTCAGCGCCGCCCGCCTGCTGGAGATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACAGCCAACGTGGGTGACATCCTCAGCGCCGCCCGCCTGCTGGAGATCCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGCCGTGAGCCACGTGTGCGCCGACCTCCTGGACCGGCAGATCCTGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGCCGTGAGCCACGTGTGCGCCGACCTCCTGGACCGGCAGATCCTGGCGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCGACGCGGGCGCCGACGCCGGGCAGCTGGACCTTGTAGATCAAATTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCGACGCGGGCGCCGACGCCGGGCAGCTGGACCTTGTAGATCAAATTGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CAGCGCAACCTCCTCCGCGCCAAGGAGTACCTCGAGTTCTTCCAGAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CAGCGCAACCTCCTCCGCGCCAAGGAGTACCTCGAGTTCTTCCAGAGCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCCCATGAACAGCCTGCCCCCCGCGGCCGCCGCCGCCGCTGCCAGCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCCCATGAACAGCCTGCCCCCCGCGGCCGCCGCCGCCGCTGCCAGCTTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CGTGGTCCGCCTTTGGGGCGTCCGATGATGACCTGGATGCCACCAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CGTGGTCCGCCTTTGGGGCGTCCGATGATGACCTGGATGCCACCAAGGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCCGTGGCCGCCGCTGTGGCCGCCGTGGCCGCGGGCGACTGCAACGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCCGTGGCCGCCGCTGTGGCCGCCGTGGCCGCGGGCGACTGCAACGGCTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AGACTTCTATGGGCCGGGCCCCCCGGCCGAGCGGCCCCCGACGGGGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AGACTTCTATGGGCCGGGCCCCCCGGCCGAGCGGCCCCCGACGGGGGACG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGGACGAGGGCGACAGCAACCCGGGTCTGTGGCCAGAGCGGGATGAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GGGACGAGGGCGACAGCAACCCGGGTCTGTGGCCAGAGCGGGATGAGGAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GCCCCCACCGGGGGTCTCTTTCCGCCGCCGGTGGCCCCGCCGGCCGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GCCCCCACCGGGGGTCTCTTTCCGCCGCCGGTGGCCCCGCCGGCCGCCAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GCAGAACGGCCACTACGGCCGCGGCGGAGAGGAGGAGGCCGCCTCGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GCAGAACGGCCACTACGGCCGCGGCGGAGAGGAGGAGGCCGCCTCGCTGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CGGAGGCGGCCCCCGAGCCGGGCGACTCTCCGGGCTTCCTGTCGGGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CGGAGGCGGCCCCCGAGCCGGGCGACTCTCCGGGCTTCCTGTCGGGAGCG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GCCGAGGGCGAGGACGGGGACGGGCCCGACGTGGACGGGCTGGCGGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GCCGAGGGCGAGGACGGGGACGGGCCCGACGTGGACGGGCTGGCGGCCAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CACGCTGCTGCAGCAGATGATGTCATCGGTGGGCCGGGCGGGGGCCGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CACGCTGCTGCAGCAGATGATGTCATCGGTGGGCCGGGCGGGGGCCGCGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CGGGGGACAGCGACGAGGAGTCGCGGGCCGACGACAAGGGCGTCATGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CGGGGGACAGCGACGAGGAGTCGCGGGCCGACGACAAGGGCGTCATGGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 TACTACCTGAAGTACTTCAGCGGCGCCCACGACGGCGACGTCTACCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 TACTACCTGAAGTACTTCAGCGGCGCCCACGACGGCGACGTCTACCCGGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CTGGTCGCAGAAGGTGGAGAAGAAGATCCGAGCCAAGGCCTTCCAGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CTGGTCGCAGAAGGTGGAGAAGAAGATCCGAGCCAAGGCCTTCCAGAAGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 GCCCCATCTGCGAGAAGGTCATCCAGGGCGCCGGCAAGCTGCCGCGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 GCCCCATCTGCGAGAAGGTCATCCAGGGCGCCGGCAAGCTGCCGCGACAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 ATCCGCACCCACACGGGCGAGAAGCCCTACGAGTGCAACATCTGCAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 ATCCGCACCCACACGGGCGAGAAGCCCTACGAGTGCAACATCTGCAAGGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CCGCTTCACCAG         GCAGGACAAGCTGAAGGTGCACATGCGGA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CCGCTTCACCAGGTG...CAGGCAGGACAAGCTGAAGGTGCACATGCGGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 AGCACACGGGCGAGAAGCCGTACCTGTGCCAGCAGTGCGGCGCCGCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107018 AGCACACGGGCGAGAAGCCGTACCTGTGCCAGCAGTGCGGCGCCGCCTTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 GCCCACAACTACGACCTGAAGAACCACATGCGCGTGCACACGGGCCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107068 GCCCACAACTACGACCTGAAGAACCACATGCGCGTGCACACGGGCCTGCG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 CCCCTACCAGTGCGACAGCTGCTGCAAGACCTTCGTCCGCTCCGACCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107118 CCCCTACCAGTGCGACAGCTGCTGCAAGACCTTCGTCCGCTCCGACCACC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 TGCACAGACACCTCAAGAAAGACGGCTGCAACGGCGTCCCCTCGCGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107168 TGCACAGACACCTCAAGAAAGACGGCTGCAACGGCGTCCCCTCGCGCCGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1492 GGCCGCAAGCCCCGCGTCCGGGGCGGGGCGCCCGACCCCAGCCCGGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107218 GGCCGCAAGCCCCGCGTCCGGGGCGGGGCGCCCGACCCCAGCCCGGGGGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1542 CACCGCGACCCCCGGCGCCCCCGCCCAGCCCAGCTCCCCCGACGCCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107268 CACCGCGACCCCCGGCGCCCCCGCCCAGCCCAGCTCCCCCGACGCCCGGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1592 GCAACGGCCAGGAGAAGCACTTTAAGGACGAGGACGAGGACGAGGACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107318 GCAACGGCCAGGAGAAGCACTTTAAGGACGAGGACGAGGACGAGGACGTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1642 GCCAGCCCCGACGGCTTGGGCCGGTTGAATGTAGCGGGCGCCGGTGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107368 GCCAGCCCCGACGGCTTGGGCCGGTTGAATGTAGCGGGCGCCGGTGGAGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1692 AGGTGACAGCGGAGGTGGCCCCGGGGCCGCCACCGACGGTAACTTCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107418 AGGTGACAGCGGAGGTGGCCCCGGGGCCGCCACCGACGGTAACTTCACAG

   1750     .    :
   1742 CCGGACTCGCC
        |||||||||||
 107468 CCGGACTCGCC