FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2611, 295 aa 1>>>pF1KE2611 295 - 295 aa - 295 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.5185+/-0.000411; mu= 19.2911+/- 0.025 mean_var=61.1231+/-12.298, 0's: 0 Z-trim(111.2): 42 B-trim: 22 in 1/52 Lambda= 0.164048 statistics sampled from 19632 (19673) to 19632 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.591), E-opt: 0.2 (0.231), width: 16 Scan time: 4.300 The best scores are: opt bits E(85289) NP_066190 (OMIM: 602914) aquaporin-9 isoform 1 [Ho ( 295) 1929 465.3 6.6e-131 NP_001307565 (OMIM: 602914) aquaporin-9 isoform 3 ( 230) 1516 367.4 1.4e-101 NP_001307564 (OMIM: 602914) aquaporin-9 isoform 2 ( 193) 1077 263.4 2.4e-70 NP_536354 (OMIM: 606578) aquaporin-10 [Homo sapien ( 301) 953 234.3 2.3e-61 NP_004916 (OMIM: 600170,607457) aquaporin-3 isofor ( 292) 952 234.0 2.6e-61 XP_011508406 (OMIM: 606578) PREDICTED: aquaporin-1 ( 302) 941 231.4 1.6e-60 XP_016870189 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 341) 830 205.2 1.5e-52 XP_005251510 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 342) 830 205.2 1.5e-52 NP_001161 (OMIM: 602974,614411) aquaporin-7 isofor ( 342) 830 205.2 1.5e-52 XP_011516168 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 342) 830 205.2 1.5e-52 XP_006716828 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 285) 739 183.6 3.9e-46 XP_011516169 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 285) 739 183.6 3.9e-46 NP_001305086 (OMIM: 602974,614411) aquaporin-7 iso ( 256) 702 174.8 1.5e-43 NP_001305087 (OMIM: 602974,614411) aquaporin-7 iso ( 257) 702 174.8 1.5e-43 XP_016870194 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 250) 636 159.2 7.6e-39 XP_016870192 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 250) 636 159.2 7.6e-39 XP_016870193 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 250) 636 159.2 7.6e-39 XP_016870191 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 250) 636 159.2 7.6e-39 XP_016870190 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 250) 636 159.2 7.6e-39 NP_001305085 (OMIM: 602974,614411) aquaporin-7 iso ( 216) 620 155.3 9.5e-38 XP_016870195 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 200) 611 153.2 3.9e-37 NP_001305073 (OMIM: 600170,607457) aquaporin-3 iso ( 237) 550 138.8 9.8e-33 XP_005268895 (OMIM: 600442) PREDICTED: aquaporin-5 ( 222) 217 60.0 5e-09 NP_001642 (OMIM: 600442) aquaporin-5 [Homo sapiens ( 265) 217 60.0 5.7e-09 NP_001643 (OMIM: 601383) aquaporin-6 [Homo sapiens ( 282) 198 55.6 1.3e-07 NP_001160 (OMIM: 603750) aquaporin-8 [Homo sapiens ( 261) 197 55.3 1.5e-07 XP_011544124 (OMIM: 603750) PREDICTED: aquaporin-8 ( 262) 197 55.3 1.5e-07 NP_000477 (OMIM: 107777,125800) aquaporin-2 [Homo ( 271) 196 55.1 1.8e-07 NP_001304316 (OMIM: 600308) aquaporin-4 isoform de ( 296) 196 55.1 1.9e-07 NP_004019 (OMIM: 600308) aquaporin-4 isoform M23 [ ( 301) 196 55.1 2e-07 XP_011524244 (OMIM: 600308) PREDICTED: aquaporin-4 ( 316) 196 55.1 2e-07 NP_001641 (OMIM: 600308) aquaporin-4 isoform M1 [H ( 323) 196 55.1 2.1e-07 NP_001304313 (OMIM: 600308) aquaporin-4 isoform M1 ( 352) 196 55.2 2.2e-07 NP_036196 (OMIM: 154050,615274) lens fiber major i ( 263) 185 52.5 1.1e-06 NP_932766 (OMIM: 107776,110450) aquaporin-1 isofor ( 269) 163 47.3 4e-05 NP_001316801 (OMIM: 107776,110450) aquaporin-1 iso ( 323) 163 47.3 4.6e-05 XP_011544125 (OMIM: 603750) PREDICTED: aquaporin-8 ( 148) 131 39.5 0.0049 >>NP_066190 (OMIM: 602914) aquaporin-9 isoform 1 [Homo s (295 aa) initn: 1929 init1: 1929 opt: 1929 Z-score: 2471.2 bits: 465.3 E(85289): 6.6e-131 Smith-Waterman score: 1929; 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NP_536 MVFTQAPAEIMGHLRIRSLLARQCLAEFLGVFVLMLLTQGAVAQAVTSGETKGNFFTM 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 NVGFSMAVAMAIYVAGGVSGGHINPAVSLAMCLFGRMKWFKLPFYVGAQFLGAFVGAATV .. :.::..::::.:.:::.:.::: :::::. ::. : :::.:. .:.:.:: ..... NP_536 FLAGSLAVTIAIYVGGNVSGAHLNPAFSLAMCIVGRLPWVKLPIYILVQLLSAFCASGAT 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 FGIYYDGLMSFAGGKLLIVGENATAHIFATYPAPYLSLANAFADQVVATMILLIIVFAIF . .:.:.:....::.: ..: . :: :::::::::::: :.: :::..: .:.. ..::. NP_536 YVLYHDALQNYTGGNLTVTGPKETASIFATYPAPYLSLNNGFLDQVLGTGMLIVGLLAIL 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 DSRNLGAPRGLEPIAIGLLIIVIASSLGLNSGCAMNPARDLSPRLFTALAGWGFEVFRAG : :: :.: ::::...:.::.... :.: : : .::::::.::::: .:::: ::: :: NP_536 DRRNKGVPAGLEPVVVGMLILALGLSMGANCGIPLNPARDLGPRLFTYVAGWGPEVFSAG 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 pF1KE2 NNFWWIPVVGPLVGAVIGGLIYVLVIEIHHPE-PDSVFKAEQSEDKPEKYELSVIM :..::.:::.:::::..: : :.. .:::: :. . ... : . : NP_536 NGWWWVPVVAPLVGATVGTATYQLLVALHHPEGPEPAQDLVSAQHKASELETPASAQMLE 240 250 260 270 280 290 NP_536 CKL 300 >>NP_004916 (OMIM: 600170,607457) aquaporin-3 isoform 1 (292 aa) initn: 943 init1: 918 opt: 952 Z-score: 1221.6 bits: 234.0 E(85289): 2.6e-61 Smith-Waterman score: 952; 51.6% identity (82.2% similar) in 258 aa overlap (16-273:15-272) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MQPEGAEKGKSFKQRLVLKSSLAKETLSEFLGTFILIVLGCGCVAQAILSRGRFGGVITI : .. : ...:.: :::.::...::: :::..:::: :: .:: NP_004 MGRQKELVSRCGEMLHIRYRLLRQALAECLGTLILVMFGCGSVAQVVLSRGTHGGFLTI 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 NVGFSMAVAMAIYVAGGVSGGHINPAVSLAMCLFGRMKWFKLPFYVGAQFLGAFVGAATV :..:..::...: .:: :::.:.::::..:::...: :.:::.:. :: ::::.::. : NP_004 NLAFGFAVTLGILIAGQVSGAHLNPAVTFAMCFLAREPWIKLPIYTLAQTLGAFLGAGIV 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 FGIYYDGLMSFAGGKLLIVGENATAHIFATYPAPYLSLANAFADQVVATMILLIIVFAIF ::.:::.. :: ..:.. : :.:: ::::::. .:.. :.: :: ..: :.. :.:: NP_004 FGLYYDAIWHFADNQLFVSGPNGTAGIFATYPSGHLDMINGFFDQFIGTASLIVCVLAIV 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 DSRNLGAPRGLEPIAIGLLIIVIASSLGLNSGCAMNPARDLSPRLFTALAGWGFEVFRAG : : .::::: ...::...::..:.:.::: :.:::::..::::::::::: :: .: NP_004 DPYNNPVPRGLEAFTVGLVVLVIGTSMGFNSGYAVNPARDFGPRLFTALAGWGSAVFTTG 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 pF1KE2 NNFWWIPVVGPLVGAVIGGLIYVLVIEIHHPEPDSVFKAEQSEDKPEKYELSVIM ...::.:.:.::.:.. : ..: :.: : .: NP_004 QHWWWVPIVSPLLGSIAGVFVYQLMIGCHLEQPPPSNEEENVKLAHVKHKEQI 240 250 260 270 280 290 >>XP_011508406 (OMIM: 606578) PREDICTED: aquaporin-10 is (302 aa) initn: 876 init1: 876 opt: 941 Z-score: 1207.4 bits: 231.4 E(85289): 1.6e-60 Smith-Waterman score: 941; 49.8% identity (79.8% similar) in 277 aa overlap (16-290:14-290) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MQPEGAEKGKSFKQRLVLKSSLAKETLSEFLGTFILI-VLGCGCVAQAILSRGRFGGVIT : ..: ::.. :.::::.:.:. .: : ::::. : :. .: XP_011 MVFTQAPAEIMGHLRIRSLLARQCLAEFLGVFVLMQLLTQGAVAQAVTSGETKGNFFT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 INVGFSMAVAMAIYVAGGVSGGHINPAVSLAMCLFGRMKWFKLPFYVGAQFLGAFVGAAT . .. :.::..::::.:.:::.:.::: :::::. ::. : :::.:. .:.:.:: .... XP_011 MFLAGSLAVTIAIYVGGNVSGAHLNPAFSLAMCIVGRLPWVKLPIYILVQLLSAFCASGA 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 VFGIYYDGLMSFAGGKLLIVGENATAHIFATYPAPYLSLANAFADQVVATMILLIIVFAI .. .:.:.:....::.: ..: . :: :::::::::::: :.: :::..: .:.. ..:: XP_011 TYVLYHDALQNYTGGNLTVTGPKETASIFATYPAPYLSLNNGFLDQVLGTGMLIVGLLAI 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 FDSRNLGAPRGLEPIAIGLLIIVIASSLGLNSGCAMNPARDLSPRLFTALAGWGFEVFRA .: :: :.: ::::...:.::.... :.: : : .::::::.::::: .:::: ::: : XP_011 LDRRNKGVPAGLEPVVVGMLILALGLSMGANCGIPLNPARDLGPRLFTYVAGWGPEVFSA 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 GNNFWWIPVVGPLVGAVIGGLIYVLVIEIHHPE-PDSVFKAEQSEDKPEKYELSVIM ::..::.:::.:::::..: : :.. .:::: :. . ... : . : XP_011 GNGWWWVPVVAPLVGATVGTATYQLLVALHHPEGPEPAQDLVSAQHKASELETPASAQML 240 250 260 270 280 290 XP_011 ECKL 300 >>XP_016870189 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aquapori (341 aa) initn: 753 init1: 708 opt: 830 Z-score: 1064.7 bits: 205.2 E(85289): 1.5e-52 Smith-Waterman score: 830; 42.9% identity (77.7% similar) in 273 aa overlap (13-284:23-294) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MQPEGAEKGKSFKQRLVLKSSLAKETLSEFLGTFILIVLGCGCVAQAILS : . .:. ....: :.::..:....:.: : ::. .:. 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