Result of FASTA (ccds) for pF1KE2611
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2611, 295 aa
  1>>>pF1KE2611 295 - 295 aa - 295 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2220+/-0.000891; mu= 14.9927+/- 0.053
 mean_var=57.1448+/-11.660, 0's: 0 Z-trim(105.3): 27  B-trim: 227 in 2/46
 Lambda= 0.169662
 statistics sampled from 8354 (8376) to 8354 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.626), E-opt: 0.2 (0.257), width:  16
 Scan time:  2.070

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS10165.1 AQP9 gene_id:366|Hs108|chr15           ( 295) 1929 480.4 6.8e-136
CCDS81887.1 AQP9 gene_id:366|Hs108|chr15           ( 230) 1516 379.3 1.5e-105
CCDS1065.1 AQP10 gene_id:89872|Hs108|chr1          ( 301)  953 241.5 5.7e-64
CCDS6542.1 AQP3 gene_id:360|Hs108|chr9             ( 292)  952 241.3 6.5e-64
CCDS6541.1 AQP7 gene_id:364|Hs108|chr9             ( 342)  830 211.4 7.3e-55
CCDS83354.1 AQP7 gene_id:364|Hs108|chr9            ( 256)  702 180.1 1.5e-45
CCDS83356.1 AQP7 gene_id:364|Hs108|chr9            ( 257)  702 180.1 1.5e-45
CCDS83353.1 AQP7 gene_id:364|Hs108|chr9            ( 216)  620 160.0 1.5e-39


>>CCDS10165.1 AQP9 gene_id:366|Hs108|chr15                (295 aa)
 initn: 1929 init1: 1929 opt: 1929  Z-score: 2553.2  bits: 480.4 E(32554): 6.8e-136
Smith-Waterman score: 1929; 99.7% identity (100.0% similar) in 295 aa overlap (1-295:1-295)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MQPEGAEKGKSFKQRLVLKSSLAKETLSEFLGTFILIVLGCGCVAQAILSRGRFGGVITI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MQPEGAEKGKSFKQRLVLKSSLAKETLSEFLGTFILIVLGCGCVAQAILSRGRFGGVITI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 NVGFSMAVAMAIYVAGGVSGGHINPAVSLAMCLFGRMKWFKLPFYVGAQFLGAFVGAATV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NVGFSMAVAMAIYVAGGVSGGHINPAVSLAMCLFGRMKWFKLPFYVGAQFLGAFVGAATV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 FGIYYDGLMSFAGGKLLIVGENATAHIFATYPAPYLSLANAFADQVVATMILLIIVFAIF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FGIYYDGLMSFAGGKLLIVGENATAHIFATYPAPYLSLANAFADQVVATMILLIIVFAIF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 DSRNLGAPRGLEPIAIGLLIIVIASSLGLNSGCAMNPARDLSPRLFTALAGWGFEVFRAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DSRNLGAPRGLEPIAIGLLIIVIASSLGLNSGCAMNPARDLSPRLFTALAGWGFEVFRAG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290     
pF1KE2 NNFWWIPVVGPLVGAVIGGLIYVLVIEIHHPEPDSVFKAEQSEDKPEKYELSVIM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS10 NNFWWIPVVGPLVGAVIGGLIYVLVIEIHHPEPDSVFKTEQSEDKPEKYELSVIM
              250       260       270       280       290     

>>CCDS81887.1 AQP9 gene_id:366|Hs108|chr15                (230 aa)
 initn: 1516 init1: 1516 opt: 1516  Z-score: 2008.6  bits: 379.3 E(32554): 1.5e-105
Smith-Waterman score: 1516; 99.6% identity (100.0% similar) in 230 aa overlap (66-295:1-230)

          40        50        60        70        80        90     
pF1KE2 LIVLGCGCVAQAILSRGRFGGVITINVGFSMAVAMAIYVAGGVSGGHINPAVSLAMCLFG
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81                               MAVAMAIYVAGGVSGGHINPAVSLAMCLFG
                                             10        20        30

         100       110       120       130       140       150     
pF1KE2 RMKWFKLPFYVGAQFLGAFVGAATVFGIYYDGLMSFAGGKLLIVGENATAHIFATYPAPY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RMKWFKLPFYVGAQFLGAFVGAATVFGIYYDGLMSFAGGKLLIVGENATAHIFATYPAPY
               40        50        60        70        80        90

         160       170       180       190       200       210     
pF1KE2 LSLANAFADQVVATMILLIIVFAIFDSRNLGAPRGLEPIAIGLLIIVIASSLGLNSGCAM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LSLANAFADQVVATMILLIIVFAIFDSRNLGAPRGLEPIAIGLLIIVIASSLGLNSGCAM
              100       110       120       130       140       150

         220       230       240       250       260       270     
pF1KE2 NPARDLSPRLFTALAGWGFEVFRAGNNFWWIPVVGPLVGAVIGGLIYVLVIEIHHPEPDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 NPARDLSPRLFTALAGWGFEVFRAGNNFWWIPVVGPLVGAVIGGLIYVLVIEIHHPEPDS
              160       170       180       190       200       210

         280       290     
pF1KE2 VFKAEQSEDKPEKYELSVIM
       :::.::::::::::::::::
CCDS81 VFKTEQSEDKPEKYELSVIM
              220       230

>>CCDS1065.1 AQP10 gene_id:89872|Hs108|chr1               (301 aa)
 initn: 952 init1: 952 opt: 953  Z-score: 1262.0  bits: 241.5 E(32554): 5.7e-64
Smith-Waterman score: 953; 50.0% identity (80.1% similar) in 276 aa overlap (16-290:14-289)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MQPEGAEKGKSFKQRLVLKSSLAKETLSEFLGTFILIVLGCGCVAQAILSRGRFGGVITI
                      : ..: ::.. :.::::.:.:..:  : ::::. :    :. .:.
CCDS10   MVFTQAPAEIMGHLRIRSLLARQCLAEFLGVFVLMLLTQGAVAQAVTSGETKGNFFTM
                 10        20        30        40        50        

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 NVGFSMAVAMAIYVAGGVSGGHINPAVSLAMCLFGRMKWFKLPFYVGAQFLGAFVGAATV
        .. :.::..::::.:.:::.:.::: :::::. ::. : :::.:. .:.:.:: .....
CCDS10 FLAGSLAVTIAIYVGGNVSGAHLNPAFSLAMCIVGRLPWVKLPIYILVQLLSAFCASGAT
       60        70        80        90       100       110        

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 FGIYYDGLMSFAGGKLLIVGENATAHIFATYPAPYLSLANAFADQVVATMILLIIVFAIF
       . .:.:.:....::.: ..: . :: :::::::::::: :.: :::..: .:.. ..::.
CCDS10 YVLYHDALQNYTGGNLTVTGPKETASIFATYPAPYLSLNNGFLDQVLGTGMLIVGLLAIL
      120       130       140       150       160       170        

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 DSRNLGAPRGLEPIAIGLLIIVIASSLGLNSGCAMNPARDLSPRLFTALAGWGFEVFRAG
       : :: :.: ::::...:.::.... :.: : :  .::::::.::::: .:::: ::: ::
CCDS10 DRRNKGVPAGLEPVVVGMLILALGLSMGANCGIPLNPARDLGPRLFTYVAGWGPEVFSAG
      180       190       200       210       220       230        

              250       260       270        280       290         
pF1KE2 NNFWWIPVVGPLVGAVIGGLIYVLVIEIHHPE-PDSVFKAEQSEDKPEKYELSVIM    
       :..::.:::.:::::..:   : :.. .:::: :. .    ... :  . :         
CCDS10 NGWWWVPVVAPLVGATVGTATYQLLVALHHPEGPEPAQDLVSAQHKASELETPASAQMLE
      240       250       260       270       280       290        

CCDS10 CKL
      300 

>>CCDS6542.1 AQP3 gene_id:360|Hs108|chr9                  (292 aa)
 initn: 943 init1: 918 opt: 952  Z-score: 1260.9  bits: 241.3 E(32554): 6.5e-64
Smith-Waterman score: 952; 51.6% identity (82.2% similar) in 258 aa overlap (16-273:15-272)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MQPEGAEKGKSFKQRLVLKSSLAKETLSEFLGTFILIVLGCGCVAQAILSRGRFGGVITI
                      : ..  : ...:.: :::.::...::: :::..::::  :: .::
CCDS65  MGRQKELVSRCGEMLHIRYRLLRQALAECLGTLILVMFGCGSVAQVVLSRGTHGGFLTI
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 NVGFSMAVAMAIYVAGGVSGGHINPAVSLAMCLFGRMKWFKLPFYVGAQFLGAFVGAATV
       :..:..::...: .:: :::.:.::::..:::...:  :.:::.:. :: ::::.::. :
CCDS65 NLAFGFAVTLGILIAGQVSGAHLNPAVTFAMCFLAREPWIKLPIYTLAQTLGAFLGAGIV
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 FGIYYDGLMSFAGGKLLIVGENATAHIFATYPAPYLSLANAFADQVVATMILLIIVFAIF
       ::.:::..  :: ..:.. : :.:: ::::::. .:.. :.: :: ..:  :.. :.:: 
CCDS65 FGLYYDAIWHFADNQLFVSGPNGTAGIFATYPSGHLDMINGFFDQFIGTASLIVCVLAIV
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 DSRNLGAPRGLEPIAIGLLIIVIASSLGLNSGCAMNPARDLSPRLFTALAGWGFEVFRAG
       :  :  .::::: ...::...::..:.:.::: :.:::::..:::::::::::  :: .:
CCDS65 DPYNNPVPRGLEAFTVGLVVLVIGTSMGFNSGYAVNPARDFGPRLFTALAGWGSAVFTTG
     180       190       200       210       220       230         

              250       260       270       280       290     
pF1KE2 NNFWWIPVVGPLVGAVIGGLIYVLVIEIHHPEPDSVFKAEQSEDKPEKYELSVIM
       ...::.:.:.::.:.. : ..: :.:  :  .:                      
CCDS65 QHWWWVPIVSPLLGSIAGVFVYQLMIGCHLEQPPPSNEEENVKLAHVKHKEQI  
     240       250       260       270       280       290    

>>CCDS6541.1 AQP7 gene_id:364|Hs108|chr9                  (342 aa)
 initn: 753 init1: 708 opt: 830  Z-score: 1098.4  bits: 211.4 E(32554): 7.3e-55
Smith-Waterman score: 830; 42.9% identity (77.7% similar) in 273 aa overlap (13-284:24-295)

                          10        20        30        40         
pF1KE2            MQPEGAEKGKSFKQRLVLKSSLAKETLSEFLGTFILIVLGCGCVAQAIL
                              : . .:. ....: :.::..:....:.: : ::. .:
CCDS65 MVQASGHRRSTRGSKMVSWSVIAKIQEILQRKMVREFLAEFMSTYVMMVFGLGSVAHMVL
               10        20        30        40        50        60

      50        60        70        80        90       100         
pF1KE2 SRGRFGGVITINVGFSMAVAMAIYVAGGVSGGHINPAVSLAMCLFGRMKWFKLPFYVGAQ
       .. ..:. . .:.::...:.:...::: .::.:.: ::..: : .::. : :.: :: .:
CCDS65 NK-KYGSYLGVNLGFGFGVTMGVHVAGRISGAHMNAAVTFANCALGRVPWRKFPVYVLGQ
                70        80        90       100       110         

     110       120       130       140       150       160         
pF1KE2 FLGAFVGAATVFGIYYDGLMSFAGGKLLIVGENATAHIFATYPAPYLSLANAFADQVVAT
       :::.:..:::.....: ... :.::.:...:  ::: :::::   ...:  .: ...  :
CCDS65 FLGSFLAAATIYSLFYTAILHFSGGQLMVTGPVATAGIFATYLPDHMTLWRGFLNEAWLT
     120       130       140       150       160       170         

     170       180       190       200       210       220         
pF1KE2 MILLIIVFAIFDSRNLGAPRGLEPIAIGLLIIVIASSLGLNSGCAMNPARDLSPRLFTAL
        .: . .::: :..:  :  : : ..::.:...:. :::.:.: :.::.::: ::.:: .
CCDS65 GMLQLCLFAITDQENNPALPGTEALVIGILVVIIGVSLGMNTGYAINPSRDLPPRIFTFI
     180       190       200       210       220       230         

     230       240       250       260       270        280        
pF1KE2 AGWGFEVFRAGNNFWWIPVVGPLVGAVIGGLIYVLVIEIHHP-EPDSVFKAEQSEDKPEK
       :::: .::  :.:.::.:::.::.:: .::.::.. :    : :: ..  .   ::    
CCDS65 AGWGKQVFSNGENWWWVPVVAPLLGAYLGGIIYLVFIGSTIPREPLKLEDSVAYEDHGIT
     240       250       260       270       280       290         

      290                                         
pF1KE2 YELSVIM                                    
                                                  
CCDS65 VLPKMGSHEPTISPLTPVSVSPANRSSVHPAPPLHESMALEHF
     300       310       320       330       340  

>>CCDS83354.1 AQP7 gene_id:364|Hs108|chr9                 (256 aa)
 initn: 606 init1: 606 opt: 702  Z-score: 931.1  bits: 180.1 E(32554): 1.5e-45
Smith-Waterman score: 702; 41.5% identity (77.2% similar) in 241 aa overlap (13-253:23-256)

                         10        20        30        40        50
pF1KE2           MQPEGAEKGKSFKQRLVLKSSLAKETLSEFLGTFILIVLGCGCVAQAILS
                             : . .:. ....: :.::..:....:.: : ::. .:.
CCDS83 MGSGHCLRSTRGSKMVSWSVIAKIQEILQRKMVREFLAEFMSTYVMMVFGLGSVAHMVLN
               10        20        30        40        50        60

               60        70        80        90       100       110
pF1KE2 RGRFGGVITINVGFSMAVAMAIYVAGGVSGGHINPAVSLAMCLFGRMKWFKLPFYVGAQF
       . ..:. . .:.::...:.:...::: .::.:.: ::..: : .::. : :.: :: .::
CCDS83 K-KYGSYLGVNLGFGFGVTMGVHVAGRISGAHMNAAVTFANCALGRVPWRKFPVYVLGQF
                70        80        90       100       110         

              120       130       140       150       160       170
pF1KE2 LGAFVGAATVFGIYYDGLMSFAGGKLLIVGENATAHIFATYPAPYLSLANAFADQVVATM
       ::.:..:::.....: ... :.::.:...:  ::: :::::   ...:  .: ...  : 
CCDS83 LGSFLAAATIYSLFYTAILHFSGGQLMVTGPVATAGIFATYLPDHMTLWRGFLNEAWLTG
     120       130       140       150       160       170         

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pF1KE2 ILLIIVFAIFDSRNLGAPRGLEPIAIGLLIIVIASSLGLNSGCAMNPARDLSPRLFTALA
       .: . .::: :..:  :  : : ..::.:...:. :::.:.: :.::.::: ::.:: .:
CCDS83 MLQLCLFAITDQENNPALPGTEALVIGILVVIIGVSLGMNTGYAINPSRDLPPRIFTFIA
     180       190       200       210       220       230         

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pF1KE2 GWGFEVFRAGNNFWWIPVVGPLVGAVIGGLIYVLVIEIHHPEPDSVFKAEQSEDKPEKYE
       ::: .:::      . :  ::..                                     
CCDS83 GWGKQVFR------YCPCPGPFL                                     
     240             250                                           

>>CCDS83356.1 AQP7 gene_id:364|Hs108|chr9                 (257 aa)
 initn: 606 init1: 606 opt: 702  Z-score: 931.1  bits: 180.1 E(32554): 1.5e-45
Smith-Waterman score: 702; 41.5% identity (77.2% similar) in 241 aa overlap (13-253:24-257)

                          10        20        30        40         
pF1KE2            MQPEGAEKGKSFKQRLVLKSSLAKETLSEFLGTFILIVLGCGCVAQAIL
                              : . .:. ....: :.::..:....:.: : ::. .:
CCDS83 MVQASGHRRSTRGSKMVSWSVIAKIQEILQRKMVREFLAEFMSTYVMMVFGLGSVAHMVL
               10        20        30        40        50        60

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pF1KE2 SRGRFGGVITINVGFSMAVAMAIYVAGGVSGGHINPAVSLAMCLFGRMKWFKLPFYVGAQ
       .. ..:. . .:.::...:.:...::: .::.:.: ::..: : .::. : :.: :: .:
CCDS83 NK-KYGSYLGVNLGFGFGVTMGVHVAGRISGAHMNAAVTFANCALGRVPWRKFPVYVLGQ
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pF1KE2 FLGAFVGAATVFGIYYDGLMSFAGGKLLIVGENATAHIFATYPAPYLSLANAFADQVVAT
       :::.:..:::.....: ... :.::.:...:  ::: :::::   ...:  .: ...  :
CCDS83 FLGSFLAAATIYSLFYTAILHFSGGQLMVTGPVATAGIFATYLPDHMTLWRGFLNEAWLT
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pF1KE2 MILLIIVFAIFDSRNLGAPRGLEPIAIGLLIIVIASSLGLNSGCAMNPARDLSPRLFTAL
        .: . .::: :..:  :  : : ..::.:...:. :::.:.: :.::.::: ::.:: .
CCDS83 GMLQLCLFAITDQENNPALPGTEALVIGILVVIIGVSLGMNTGYAINPSRDLPPRIFTFI
     180       190       200       210       220       230         

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pF1KE2 AGWGFEVFRAGNNFWWIPVVGPLVGAVIGGLIYVLVIEIHHPEPDSVFKAEQSEDKPEKY
       :::: .:::      . :  ::..                                    
CCDS83 AGWGKQVFR------YCPCPGPFL                                    
     240             250                                           

>>CCDS83353.1 AQP7 gene_id:364|Hs108|chr9                 (216 aa)
 initn: 624 init1: 606 opt: 620  Z-score: 823.8  bits: 160.0 E(32554): 1.5e-39
Smith-Waterman score: 620; 41.9% identity (76.7% similar) in 215 aa overlap (48-258:2-215)

        20        30        40        50        60        70       
pF1KE2 LKSSLAKETLSEFLGTFILIVLGCGCVAQAILSRGRFGGVITINVGFSMAVAMAIYVAGG
                                     .:.. ..:. . .:.::...:.:...::: 
CCDS83                              MVLNK-KYGSYLGVNLGFGFGVTMGVHVAGR
                                             10        20        30

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pF1KE2 VSGGHINPAVSLAMCLFGRMKWFKLPFYVGAQFLGAFVGAATVFGIYYDGLMSFAGGKLL
       .::.:.: ::..: : .::. : :.: :: .::::.:..:::.....: ... :.::.:.
CCDS83 ISGAHMNAAVTFANCALGRVPWRKFPVYVLGQFLGSFLAAATIYSLFYTAILHFSGGQLM
               40        50        60        70        80        90

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pF1KE2 IVGENATAHIFATYPAPYLSLANAFADQVVATMILLIIVFAIFDSRNLGAPRGLEPIAIG
       ..:  ::: :::::   ...:  .: ...  : .: . .::: :..:  :  : : ..::
CCDS83 VTGPVATAGIFATYLPDHMTLWRGFLNEAWLTGMLQLCLFAITDQENNPALPGTEALVIG
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pF1KE2 LLIIVIASSLGLNSGCAMNPARDLSPRLFTALAGWGFEVFRAGN--NFWWI--PVVGPLV
       .:...:. :::.:.: :.::.::: ::.:: .:::: .:::  .  .. :.  :. .: .
CCDS83 ILVVIIGVSLGMNTGYAINPSRDLPPRIFTFIAGWGKQVFRWHHLPGLHWLHHPTGAPEI
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       :.  :                                     
CCDS83 GGFCGV                                    
                                                 




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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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