Result of FASTA (omim) for pF1KE6355
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE6355, 349 aa
  1>>>pF1KE6355     349 - 349 aa - 349 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  64704883 residues in 91410 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7479+/-0.000405; mu= 19.1908+/- 0.025
 mean_var=68.5609+/-14.435, 0's: 0 Z-trim(111.6): 41  B-trim: 1203 in 1/50
 Lambda= 0.154895
 statistics sampled from 20889 (20923) to 20889 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.585), E-opt: 0.2 (0.229), width:  16
 Scan time:  3.440

The best scores are:                                      opt bits E(91410)
NP_003040 (OMIM: 182396) sodium/bile acid cotransp ( 349) 2311 525.8 5.9e-149
NP_932069 (OMIM: 613366) solute carrier family 10  ( 377)  722 170.7 4.9e-42
NP_000443 (OMIM: 601295,613291) ileal sodium/bile  ( 348)  709 167.8 3.4e-41
NP_001135863 (OMIM: 312090) P3 protein isoform 2 p ( 448)  438 107.3   7e-23
NP_001135864 (OMIM: 312090) P3 protein isoform 1 p ( 477)  438 107.4 7.4e-23
NP_062822 (OMIM: 312090) P3 protein isoform 1 prec ( 477)  438 107.4 7.4e-23
XP_011529503 (OMIM: 312090) P3 protein isoform X5  ( 477)  438 107.4 7.4e-23
XP_011529502 (OMIM: 312090) P3 protein isoform X3  ( 532)  438 107.4   8e-23
XP_005277970 (OMIM: 312090) P3 protein isoform X4  ( 532)  438 107.4   8e-23
XP_006724911 (OMIM: 312090) P3 protein isoform X2  ( 541)  438 107.4 8.1e-23
XP_006724910 (OMIM: 312090) P3 protein isoform X1  ( 570)  438 107.4 8.4e-23


>>NP_003040 (OMIM: 182396) sodium/bile acid cotransporte  (349 aa)
 initn: 2311 init1: 2311 opt: 2311  Z-score: 2795.8  bits: 525.8 E(91410): 5.9e-149
Smith-Waterman score: 2311; 100.0% identity (100.0% similar) in 349 aa overlap (1-349:1-349)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MEAHNASAPFNFTLPPNFGKRPTDLALSVILVFMLFFIMLSLGCTMEFSKIKAHLWKPKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MEAHNASAPFNFTLPPNFGKRPTDLALSVILVFMLFFIMLSLGCTMEFSKIKAHLWKPKG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 LAIALVAQYGIMPLTAFVLGKVFRLKNIEALAILVCGCSPGGNLSNVFSLAMKGDMNLSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LAIALVAQYGIMPLTAFVLGKVFRLKNIEALAILVCGCSPGGNLSNVFSLAMKGDMNLSI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 VMTTCSTFCALGMMPLLLYIYSRGIYDGDLKDKVPYKGIVISLVLVLIPCTIGIVLKSKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 VMTTCSTFCALGMMPLLLYIYSRGIYDGDLKDKVPYKGIVISLVLVLIPCTIGIVLKSKR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 PQYMRYVIKGGMIIILLCSVAVTVLSAINVGKSIMFAMTPLLIATSSLMPFIGFLLGYVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 PQYMRYVIKGGMIIILLCSVAVTVLSAINVGKSIMFAMTPLLIATSSLMPFIGFLLGYVL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE6 SALFCLNGRCRRTVSMETGCQNVQLCSTILNVAFPPEVIGPLFFFPLLYMIFQLGEGLLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SALFCLNGRCRRTVSMETGCQNVQLCSTILNVAFPPEVIGPLFFFPLLYMIFQLGEGLLL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340         
pF1KE6 IAIFWCYEKFKTPKDKTKMIYTAATTEETIPGALGNGTYKGEDCSPCTA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 IAIFWCYEKFKTPKDKTKMIYTAATTEETIPGALGNGTYKGEDCSPCTA
              310       320       330       340         

>>NP_932069 (OMIM: 613366) solute carrier family 10 memb  (377 aa)
 initn: 695 init1: 402 opt: 722  Z-score: 876.3  bits: 170.7 E(91410): 4.9e-42
Smith-Waterman score: 722; 38.7% identity (73.6% similar) in 292 aa overlap (24-309:31-313)

                      10        20        30        40        50   
pF1KE6        MEAHNASAPFNFTLPPNFGKRPTDLALSVILVFMLFFIMLSLGCTMEFSKIKA
                                     .:...:. . :. ..:.::::..:. :. .
NP_932 MRANCSSSSACPANSSEEELPVGLEVHGNLELVFTVVSTVMMGLLMFSLGCSVEIRKLWS
               10        20        30        40        50        60

            60        70        80        90       100       110   
pF1KE6 HLWKPKGLAIALVAQYGIMPLTAFVLGKVFRLKNIEALAILVCGCSPGGNLSNVFSLAMK
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NP_932 HIRRPWGIAVGLLCQFGLMPFTAYLLAISFSLKPVQAIAVLIMGCCPGGTISNIFTFWVD
               70        80        90       100       110       120

           120       130       140       150         160       170 
pF1KE6 GDMNLSIVMTTCSTFCALGMMPLLLYIYSRGIYDGDLKDK--VPYKGIVISLVLVLIPCT
       :::.::: ::::::  ::::::: .:.:.   .. .:...  .::..: :.:: . :: .
NP_932 GDMDLSISMTTCSTVAALGMMPLCIYLYT---WSWSLQQNLTIPYQNIGITLVCLTIPVA
              130       140          150       160       170       

             180       190         200       210       220         
pF1KE6 IGIVLKSKRPQYMRYVIKGGMII--ILLCSVAVTVLSAINVGKSIMFAMTPLLIATSSLM
       .:. .. . :.  . ..: : ..  .::  :::   ... ..:.  .     :.. : ..
NP_932 FGVYVNYRWPKQSKIILKIGAVVGGVLLLVVAV---AGVVLAKG-SWNSDITLLTISFIF
       180       190       200       210           220       230   

     230       240         250       260       270       280       
pF1KE6 PFIGFLLGYVLSALFCLNG--RCRRTVSMETGCQNVQLCSTILNVAFPPEVIGPLFFFPL
       :.:: . :..: :::  ..  ::: :.:.::: ::.:.: :.:...:  : .  .. :::
NP_932 PLIGHVTGFLL-ALFTHQSWQRCR-TISLETGAQNIQMCITMLQLSFTAEHLVQMLSFPL
           240        250        260       270       280       290 

       290       300       310       320       330       340       
pF1KE6 LYMIFQLGEGLLLIAIFWCYEKFKTPKDKTKMIYTAATTEETIPGALGNGTYKGEDCSPC
        : .::: .:.:..: .  :..                                      
NP_932 AYGLFQLIDGFLIVAAYQTYKRRLKNKHGKKNSGCTEVCHTRKSTSSRETNAFLEVNEEG
             300       310       320       330       340       350 

>>NP_000443 (OMIM: 601295,613291) ileal sodium/bile acid  (348 aa)
 initn: 691 init1: 401 opt: 709  Z-score: 861.0  bits: 167.8 E(91410): 3.4e-41
Smith-Waterman score: 709; 38.4% identity (73.4% similar) in 297 aa overlap (25-319:32-322)

                     10        20        30        40        50    
pF1KE6       MEAHNASAPFNFTLPPNFGKRPTDLALSVILVFMLFFIMLSLGCTMEFSKIKAH
                                     ..::..:...: ..:.:.::..:..:. .:
NP_000 NDPNSCVDNATVCSGASCVVPESNFNNILSVVLSTVLTILLALVMFSMGCNVEIKKFLGH
              10        20        30        40        50        60 

           60        70        80        90       100       110    
pF1KE6 LWKPKGLAIALVAQYGIMPLTAFVLGKVFRLKNIEALAILVCGCSPGGNLSNVFSLAMKG
       . .: :. .... :.::::::.:.:. .: .  ..:...:. :: :::. ::...  . :
NP_000 IKRPWGICVGFLCQFGIMPLTGFILSVAFDILPLQAVVVLIIGCCPGGTASNILAYWVDG
              70        80        90       100       110       120 

          120       130       140        150       160       170   
pF1KE6 DMNLSIVMTTCSTFCALGMMPLLLYIYSRGIYD-GDLKDKVPYKGIVISLVLVLIPCTIG
       ::.::. ::::::. ::::::: : ::..   : :..   .:: .:  ::: ...: .::
NP_000 DMDLSVSMTTCSTLLALGMMPLCLLIYTKMWVDSGSI--VIPYDNIGTSLVALVVPVSIG
             130       140       150         160       170         

           180       190       200       210       220       230   
pF1KE6 IVLKSKRPQYMRYVIKGGMIIILLCSVAVTVLSAINVGKSIMFAMTPLLIATSSLMPFIG
       . .. : ::  . ..: : :   .  : ..:...:   .. ..:  : :   ....:  :
NP_000 MFVNHKWPQKAKIILKIGSIAGAILIVLIAVVGGILYQSAWIIA--PKLWIIGTIFPVAG
     180       190       200       210       220         230       

           240        250       260       270       280       290  
pF1KE6 FLLGYVLSALFCLNG-RCRRTVSMETGCQNVQLCSTILNVAFPPEVIGPLFFFPLLYMIF
       . ::..:. .  :   ::: ::..::: ::.::::::....: :: .. .: :::.: ::
NP_000 YSLGFLLARIAGLPWYRCR-TVAFETGMQNTQLCSTIVQLSFTPEELNVVFTFPLIYSIF
       240       250        260       270       280       290      

            300       310       320       330       340         
pF1KE6 QLGEGLLLIAIFWCYEKFKTPKDKTKMIYTAATTEETIPGALGNGTYKGEDCSPCTA
       ::. . ......  :.: .  :.:...                              
NP_000 QLAFAAIFLGFYVAYKKCHG-KNKAEIPESKENGTEPESSFYKANGGFQPDEK    
        300       310        320       330       340            

>>NP_001135863 (OMIM: 312090) P3 protein isoform 2 precu  (448 aa)
 initn: 409 init1: 271 opt: 438  Z-score: 532.3  bits: 107.3 E(91410): 7e-23
Smith-Waterman score: 438; 32.7% identity (66.1% similar) in 248 aa overlap (30-274:166-408)

                10        20        30        40        50         
pF1KE6  MEAHNASAPFNFTLPPNFGKRPTDLALSVILVFMLFFIMLSLGCTMEFSKIKAHLWKPK
                                     .:. ..:    :.:: .:.  .:. . .:.
NP_001 DFCIKVSPAEDTPATLSADLAHFSENPILYLLLPLIFVNKCSFGCKVELEVLKGLMQSPQ
         140       150       160       170       180       190     

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE6 GLAIALVAQYGIMPLTAFVLGKVFRLKNIEALAILVCGCSPGGNLSNVFSLAMKGDMNLS
        . ..:..:. .::: ::...::: : .  ::....   ::::. : .::: . ::..:.
NP_001 PMLLGLLGQFLVMPLYAFLMAKVFMLPKALALGLIITCSSPGGGGSYLFSLLLGGDVTLA
         200       210       220       230       240       250     

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE6 IVMTTCSTFCALGMMPLLLYIYSRGIYDGDLKDKVPYKGIVISLVLVLIPCTIGIVLKSK
       : ::  ::  : :..::   :::: .   .   .:: . :. .:... :: ..:...:::
NP_001 ISMTFLSTVAATGFLPLSSAIYSRLLSIHETL-HVPISKILGTLLFIAIPIAVGVLIKSK
         260       270       280        290       300       310    

     180          190       200       210       220       230      
pF1KE6 RPQY---MRYVIKGGMIIILLCSVAVTVLSAINVGKSIMFAMTPLLIATSSLMPFIGFLL
        :..   .  :.:   ...:: ..    . :  .:  :. ..   .. ..  .:..:.:.
NP_001 LPKFSQLLLQVVKPFSFVLLLGGL----FLAYRMGVFILAGIRLPIVLVGITVPLVGLLV
          320       330           340       350       360       370

        240       250       260       270       280       290      
pF1KE6 GYVLSALFCLNGRCRRTVSMETGCQNVQLCSTILNVAFPPEVIGPLFFFPLLYMIFQLGE
       :: :.. . :    :::::.:.: ::  :  ..:....                      
NP_001 GYCLATCLKLPVAQRRTVSIEVGVQNSLLALAMLQLSLRRLQADYASQAPFIVALSGTSE
              380       390       400       410       420       430

        300       310       320       330       340         
pF1KE6 GLLLIAIFWCYEKFKTPKDKTKMIYTAATTEETIPGALGNGTYKGEDCSPCTA
                                                            
NP_001 MLALVIGHFIYSSLFPVP                                   
              440                                           

>>NP_001135864 (OMIM: 312090) P3 protein isoform 1 precu  (477 aa)
 initn: 409 init1: 271 opt: 438  Z-score: 531.9  bits: 107.4 E(91410): 7.4e-23
Smith-Waterman score: 438; 32.7% identity (66.1% similar) in 248 aa overlap (30-274:195-437)

                10        20        30        40        50         
pF1KE6  MEAHNASAPFNFTLPPNFGKRPTDLALSVILVFMLFFIMLSLGCTMEFSKIKAHLWKPK
                                     .:. ..:    :.:: .:.  .:. . .:.
NP_001 DFCIKVSPAEDTPATLSADLAHFSENPILYLLLPLIFVNKCSFGCKVELEVLKGLMQSPQ
          170       180       190       200       210       220    

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE6 GLAIALVAQYGIMPLTAFVLGKVFRLKNIEALAILVCGCSPGGNLSNVFSLAMKGDMNLS
        . ..:..:. .::: ::...::: : .  ::....   ::::. : .::: . ::..:.
NP_001 PMLLGLLGQFLVMPLYAFLMAKVFMLPKALALGLIITCSSPGGGGSYLFSLLLGGDVTLA
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pF1KE6 IVMTTCSTFCALGMMPLLLYIYSRGIYDGDLKDKVPYKGIVISLVLVLIPCTIGIVLKSK
       : ::  ::  : :..::   :::: .   .   .:: . :. .:... :: ..:...:::
NP_001 ISMTFLSTVAATGFLPLSSAIYSRLLSIHETL-HVPISKILGTLLFIAIPIAVGVLIKSK
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pF1KE6 RPQY---MRYVIKGGMIIILLCSVAVTVLSAINVGKSIMFAMTPLLIATSSLMPFIGFLL
        :..   .  :.:   ...:: ..    . :  .:  :. ..   .. ..  .:..:.:.
NP_001 LPKFSQLLLQVVKPFSFVLLLGGL----FLAYRMGVFILAGIRLPIVLVGITVPLVGLLV
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pF1KE6 GYVLSALFCLNGRCRRTVSMETGCQNVQLCSTILNVAFPPEVIGPLFFFPLLYMIFQLGE
       :: :.. . :    :::::.:.: ::  :  ..:....                      
NP_001 GYCLATCLKLPVAQRRTVSIEVGVQNSLLALAMLQLSLRRLQADYASQAPFIVALSGTSE
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pF1KE6 GLLLIAIFWCYEKFKTPKDKTKMIYTAATTEETIPGALGNGTYKGEDCSPCTA
                                                            
NP_001 MLALVIGHFIYSSLFPVP                                   
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>>NP_062822 (OMIM: 312090) P3 protein isoform 1 precurso  (477 aa)
 initn: 409 init1: 271 opt: 438  Z-score: 531.9  bits: 107.4 E(91410): 7.4e-23
Smith-Waterman score: 438; 32.7% identity (66.1% similar) in 248 aa overlap (30-274:195-437)

                10        20        30        40        50         
pF1KE6  MEAHNASAPFNFTLPPNFGKRPTDLALSVILVFMLFFIMLSLGCTMEFSKIKAHLWKPK
                                     .:. ..:    :.:: .:.  .:. . .:.
NP_062 DFCIKVSPAEDTPATLSADLAHFSENPILYLLLPLIFVNKCSFGCKVELEVLKGLMQSPQ
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pF1KE6 GLAIALVAQYGIMPLTAFVLGKVFRLKNIEALAILVCGCSPGGNLSNVFSLAMKGDMNLS
        . ..:..:. .::: ::...::: : .  ::....   ::::. : .::: . ::..:.
NP_062 PMLLGLLGQFLVMPLYAFLMAKVFMLPKALALGLIITCSSPGGGGSYLFSLLLGGDVTLA
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pF1KE6 IVMTTCSTFCALGMMPLLLYIYSRGIYDGDLKDKVPYKGIVISLVLVLIPCTIGIVLKSK
       : ::  ::  : :..::   :::: .   .   .:: . :. .:... :: ..:...:::
NP_062 ISMTFLSTVAATGFLPLSSAIYSRLLSIHETL-HVPISKILGTLLFIAIPIAVGVLIKSK
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pF1KE6 RPQY---MRYVIKGGMIIILLCSVAVTVLSAINVGKSIMFAMTPLLIATSSLMPFIGFLL
        :..   .  :.:   ...:: ..    . :  .:  :. ..   .. ..  .:..:.:.
NP_062 LPKFSQLLLQVVKPFSFVLLLGGL----FLAYRMGVFILAGIRLPIVLVGITVPLVGLLV
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pF1KE6 GYVLSALFCLNGRCRRTVSMETGCQNVQLCSTILNVAFPPEVIGPLFFFPLLYMIFQLGE
       :: :.. . :    :::::.:.: ::  :  ..:....                      
NP_062 GYCLATCLKLPVAQRRTVSIEVGVQNSLLALAMLQLSLRRLQADYASQAPFIVALSGTSE
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pF1KE6 GLLLIAIFWCYEKFKTPKDKTKMIYTAATTEETIPGALGNGTYKGEDCSPCTA
                                                            
NP_062 MLALVIGHFIYSSLFPVP                                   
     460       470                                          

>>XP_011529503 (OMIM: 312090) P3 protein isoform X5 [Hom  (477 aa)
 initn: 409 init1: 271 opt: 438  Z-score: 531.9  bits: 107.4 E(91410): 7.4e-23
Smith-Waterman score: 438; 32.7% identity (66.1% similar) in 248 aa overlap (30-274:195-437)

                10        20        30        40        50         
pF1KE6  MEAHNASAPFNFTLPPNFGKRPTDLALSVILVFMLFFIMLSLGCTMEFSKIKAHLWKPK
                                     .:. ..:    :.:: .:.  .:. . .:.
XP_011 DFCIKVSPAEDTPATLSADLAHFSENPILYLLLPLIFVNKCSFGCKVELEVLKGLMQSPQ
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pF1KE6 GLAIALVAQYGIMPLTAFVLGKVFRLKNIEALAILVCGCSPGGNLSNVFSLAMKGDMNLS
        . ..:..:. .::: ::...::: : .  ::....   ::::. : .::: . ::..:.
XP_011 PMLLGLLGQFLVMPLYAFLMAKVFMLPKALALGLIITCSSPGGGGSYLFSLLLGGDVTLA
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pF1KE6 IVMTTCSTFCALGMMPLLLYIYSRGIYDGDLKDKVPYKGIVISLVLVLIPCTIGIVLKSK
       : ::  ::  : :..::   :::: .   .   .:: . :. .:... :: ..:...:::
XP_011 ISMTFLSTVAATGFLPLSSAIYSRLLSIHETL-HVPISKILGTLLFIAIPIAVGVLIKSK
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pF1KE6 RPQY---MRYVIKGGMIIILLCSVAVTVLSAINVGKSIMFAMTPLLIATSSLMPFIGFLL
        :..   .  :.:   ...:: ..    . :  .:  :. ..   .. ..  .:..:.:.
XP_011 LPKFSQLLLQVVKPFSFVLLLGGL----FLAYRMGVFILAGIRLPIVLVGITVPLVGLLV
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pF1KE6 GYVLSALFCLNGRCRRTVSMETGCQNVQLCSTILNVAFPPEVIGPLFFFPLLYMIFQLGE
       :: :.. . :    :::::.:.: ::  :  ..:....                      
XP_011 GYCLATCLKLPVAQRRTVSIEVGVQNSLLALAMLQLSLRRLQADYASQAPFIVALSGTSE
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pF1KE6 GLLLIAIFWCYEKFKTPKDKTKMIYTAATTEETIPGALGNGTYKGEDCSPCTA
                                                            
XP_011 MLALVIGHFIYSSLFPVP                                   
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>>XP_011529502 (OMIM: 312090) P3 protein isoform X3 [Hom  (532 aa)
 initn: 409 init1: 271 opt: 438  Z-score: 531.3  bits: 107.4 E(91410): 8e-23
Smith-Waterman score: 438; 32.7% identity (66.1% similar) in 248 aa overlap (30-274:250-492)

                10        20        30        40        50         
pF1KE6  MEAHNASAPFNFTLPPNFGKRPTDLALSVILVFMLFFIMLSLGCTMEFSKIKAHLWKPK
                                     .:. ..:    :.:: .:.  .:. . .:.
XP_011 DFCIKVSPAEDTPATLSADLAHFSENPILYLLLPLIFVNKCSFGCKVELEVLKGLMQSPQ
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pF1KE6 GLAIALVAQYGIMPLTAFVLGKVFRLKNIEALAILVCGCSPGGNLSNVFSLAMKGDMNLS
        . ..:..:. .::: ::...::: : .  ::....   ::::. : .::: . ::..:.
XP_011 PMLLGLLGQFLVMPLYAFLMAKVFMLPKALALGLIITCSSPGGGGSYLFSLLLGGDVTLA
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pF1KE6 IVMTTCSTFCALGMMPLLLYIYSRGIYDGDLKDKVPYKGIVISLVLVLIPCTIGIVLKSK
       : ::  ::  : :..::   :::: .   .   .:: . :. .:... :: ..:...:::
XP_011 ISMTFLSTVAATGFLPLSSAIYSRLLSIHETL-HVPISKILGTLLFIAIPIAVGVLIKSK
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pF1KE6 RPQY---MRYVIKGGMIIILLCSVAVTVLSAINVGKSIMFAMTPLLIATSSLMPFIGFLL
        :..   .  :.:   ...:: ..    . :  .:  :. ..   .. ..  .:..:.:.
XP_011 LPKFSQLLLQVVKPFSFVLLLGGL----FLAYRMGVFILAGIRLPIVLVGITVPLVGLLV
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pF1KE6 GYVLSALFCLNGRCRRTVSMETGCQNVQLCSTILNVAFPPEVIGPLFFFPLLYMIFQLGE
       :: :.. . :    :::::.:.: ::  :  ..:....                      
XP_011 GYCLATCLKLPVAQRRTVSIEVGVQNSLLALAMLQLSLRRLQADYASQAPFIVALSGTSE
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pF1KE6 GLLLIAIFWCYEKFKTPKDKTKMIYTAATTEETIPGALGNGTYKGEDCSPCTA
                                                            
XP_011 MLALVIGHFIYSSLFPVP                                   
          520       530                                     

>>XP_005277970 (OMIM: 312090) P3 protein isoform X4 [Hom  (532 aa)
 initn: 409 init1: 271 opt: 438  Z-score: 531.3  bits: 107.4 E(91410): 8e-23
Smith-Waterman score: 438; 32.7% identity (66.1% similar) in 248 aa overlap (30-274:250-492)

                10        20        30        40        50         
pF1KE6  MEAHNASAPFNFTLPPNFGKRPTDLALSVILVFMLFFIMLSLGCTMEFSKIKAHLWKPK
                                     .:. ..:    :.:: .:.  .:. . .:.
XP_005 DFCIKVSPAEDTPATLSADLAHFSENPILYLLLPLIFVNKCSFGCKVELEVLKGLMQSPQ
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pF1KE6 GLAIALVAQYGIMPLTAFVLGKVFRLKNIEALAILVCGCSPGGNLSNVFSLAMKGDMNLS
        . ..:..:. .::: ::...::: : .  ::....   ::::. : .::: . ::..:.
XP_005 PMLLGLLGQFLVMPLYAFLMAKVFMLPKALALGLIITCSSPGGGGSYLFSLLLGGDVTLA
     280       290       300       310       320       330         

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pF1KE6 IVMTTCSTFCALGMMPLLLYIYSRGIYDGDLKDKVPYKGIVISLVLVLIPCTIGIVLKSK
       : ::  ::  : :..::   :::: .   .   .:: . :. .:... :: ..:...:::
XP_005 ISMTFLSTVAATGFLPLSSAIYSRLLSIHETL-HVPISKILGTLLFIAIPIAVGVLIKSK
     340       350       360       370        380       390        

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pF1KE6 RPQY---MRYVIKGGMIIILLCSVAVTVLSAINVGKSIMFAMTPLLIATSSLMPFIGFLL
        :..   .  :.:   ...:: ..    . :  .:  :. ..   .. ..  .:..:.:.
XP_005 LPKFSQLLLQVVKPFSFVLLLGGL----FLAYRMGVFILAGIRLPIVLVGITVPLVGLLV
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pF1KE6 GYVLSALFCLNGRCRRTVSMETGCQNVQLCSTILNVAFPPEVIGPLFFFPLLYMIFQLGE
       :: :.. . :    :::::.:.: ::  :  ..:....                      
XP_005 GYCLATCLKLPVAQRRTVSIEVGVQNSLLALAMLQLSLRRLQADYASQAPFIVALSGTSE
          460       470       480       490       500       510    

        300       310       320       330       340         
pF1KE6 GLLLIAIFWCYEKFKTPKDKTKMIYTAATTEETIPGALGNGTYKGEDCSPCTA
                                                            
XP_005 MLALVIGHFIYSSLFPVP                                   
          520       530                                     

>>XP_006724911 (OMIM: 312090) P3 protein isoform X2 [Hom  (541 aa)
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