Result of FASTA (omim) for
pF1KB6172
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6172, 604 aa
1>>>pF1KB6172 604 - 604 aa - 604 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
64369986 residues in 92320 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5183+/-0.000373; mu= 19.3269+/- 0.023
mean_var=103.6962+/-22.019, 0's: 0 Z-trim(114.5): 189 B-trim: 774 in 1/50
Lambda= 0.125948
statistics sampled from 25193 (25429) to 25193 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.64), E-opt: 0.2 (0.275), width: 16
Scan time: 5.400
The best scores are: opt bits E(92320)
NP_001156 (OMIM: 601721) baculoviral IAP repeat-co ( 604) 4083 753.1 6.5e-217
NP_892007 (OMIM: 601721) baculoviral IAP repeat-co ( 604) 4083 753.1 6.5e-217
NP_001157 (OMIM: 601712) baculoviral IAP repeat-co ( 618) 3045 564.5 3.9e-160
NP_001243092 (OMIM: 601712) baculoviral IAP repeat ( 618) 3045 564.5 3.9e-160
NP_001243095 (OMIM: 601712) baculoviral IAP repeat ( 569) 2951 547.4 5.1e-155
XP_024304235 (OMIM: 601721) baculoviral IAP repeat ( 381) 2148 401.3 3.3e-111
NP_071444 (OMIM: 605737) baculoviral IAP repeat-co ( 280) 389 81.6 4.3e-15
NP_647478 (OMIM: 605737) baculoviral IAP repeat-co ( 298) 389 81.6 4.5e-15
NP_001191330 (OMIM: 300079,300635,308240) E3 ubiqu ( 497) 344 73.7 1.9e-12
XP_006724817 (OMIM: 300079,300635,308240) E3 ubiqu ( 497) 344 73.7 1.9e-12
NP_001158 (OMIM: 300079,300635,308240) E3 ubiquiti ( 497) 344 73.7 1.9e-12
XP_011529631 (OMIM: 300079,300635,308240) E3 ubiqu ( 497) 344 73.7 1.9e-12
NP_004527 (OMIM: 600355) baculoviral IAP repeat-co (1403) 321 69.9 6.9e-11
NP_001333799 (OMIM: 600355) baculoviral IAP repeat (1403) 321 69.9 6.9e-11
NP_075043 (OMIM: 600355) baculoviral IAP repeat-co (1241) 245 56.1 9.1e-07
XP_005249090 (OMIM: 610082) E3 ubiquitin-protein l ( 264) 220 50.8 7.3e-06
XP_005249089 (OMIM: 610082) E3 ubiquitin-protein l ( 390) 220 51.0 9.5e-06
NP_037394 (OMIM: 610082) E3 ubiquitin-protein liga ( 445) 220 51.1 1e-05
XP_016860049 (OMIM: 605638) baculoviral IAP repeat (3983) 225 53.0 2.6e-05
XP_011531307 (OMIM: 605638) baculoviral IAP repeat (3989) 225 53.0 2.6e-05
XP_016860048 (OMIM: 605638) baculoviral IAP repeat (4715) 225 53.0 2.9e-05
XP_011531305 (OMIM: 605638) baculoviral IAP repeat (4779) 225 53.0 2.9e-05
XP_016860047 (OMIM: 605638) baculoviral IAP repeat (4837) 225 53.0 2.9e-05
XP_005264512 (OMIM: 605638) baculoviral IAP repeat (4840) 225 53.0 2.9e-05
XP_016860046 (OMIM: 605638) baculoviral IAP repeat (4847) 225 53.0 2.9e-05
XP_005264511 (OMIM: 605638) baculoviral IAP repeat (4847) 225 53.0 2.9e-05
XP_006712119 (OMIM: 605638) baculoviral IAP repeat (4851) 225 53.0 2.9e-05
NP_057336 (OMIM: 605638) baculoviral IAP repeat-co (4857) 225 53.0 2.9e-05
XP_016860045 (OMIM: 605638) baculoviral IAP repeat (4858) 225 53.0 2.9e-05
XP_005264510 (OMIM: 605638) baculoviral IAP repeat (4861) 225 53.0 2.9e-05
XP_006712118 (OMIM: 605638) baculoviral IAP repeat (4864) 225 53.0 2.9e-05
XP_005264509 (OMIM: 605638) baculoviral IAP repeat (4870) 225 53.0 2.9e-05
XP_005264508 (OMIM: 605638) baculoviral IAP repeat (4875) 225 53.0 2.9e-05
XP_006712117 (OMIM: 605638) baculoviral IAP repeat (4878) 225 53.0 2.9e-05
XP_005264507 (OMIM: 605638) baculoviral IAP repeat (4880) 225 53.0 2.9e-05
XP_005264506 (OMIM: 605638) baculoviral IAP repeat (4884) 225 53.0 2.9e-05
NP_001017368 (OMIM: 609735) E3 ubiquitin-protein l ( 363) 192 45.9 0.00031
NP_001243787 (OMIM: 608299) E3 ubiquitin-protein l ( 180) 188 44.9 0.00031
XP_024304959 (OMIM: 608299) E3 ubiquitin-protein l ( 365) 188 45.2 0.00051
NP_079402 (OMIM: 608299) E3 ubiquitin-protein liga ( 372) 188 45.2 0.00052
XP_024304958 (OMIM: 608299) E3 ubiquitin-protein l ( 373) 188 45.2 0.00052
NP_919247 (OMIM: 608299) E3 ubiquitin-protein liga ( 373) 188 45.2 0.00052
XP_016870773 (OMIM: 610933,614436) E3 ubiquitin-pr ( 460) 182 44.2 0.0013
XP_006717379 (OMIM: 610933,614436) E3 ubiquitin-pr ( 690) 182 44.4 0.0017
NP_001177652 (OMIM: 610933,614436) E3 ubiquitin-pr ( 696) 182 44.4 0.0017
NP_001005373 (OMIM: 610933,614436) E3 ubiquitin-pr ( 723) 182 44.4 0.0018
XP_016870772 (OMIM: 610933,614436) E3 ubiquitin-pr ( 723) 182 44.4 0.0018
NP_612370 (OMIM: 610933,614436) E3 ubiquitin-prote ( 723) 182 44.4 0.0018
NP_001005374 (OMIM: 610933,614436) E3 ubiquitin-pr ( 723) 182 44.4 0.0018
XP_011524400 (OMIM: 608677,615092) E3 ubiquitin-pr ( 516) 178 43.5 0.0023
>>NP_001156 (OMIM: 601721) baculoviral IAP repeat-contai (604 aa)
initn: 4083 init1: 4083 opt: 4083 Z-score: 4015.9 bits: 753.1 E(92320): 6.5e-217
Smith-Waterman score: 4083; 100.0% identity (100.0% similar) in 604 aa overlap (1-604:1-604)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MNIVENSIFLSNLMKSANTFELKYDLSCELYRMSTYSTFPAGVPVSERSLARAGFYYTGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MNIVENSIFLSNLMKSANTFELKYDLSCELYRMSTYSTFPAGVPVSERSLARAGFYYTGV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 NDKVKCFCCGLMLDNWKRGDSPTEKHKKLYPSCRFVQSLNSVNNLEATSQPTFPSSVTNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NDKVKCFCCGLMLDNWKRGDSPTEKHKKLYPSCRFVQSLNSVNNLEATSQPTFPSSVTNS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 THSLLPGTENSGYFRGSYSNSPSNPVNSRANQDFSALMRSSYHCAMNNENARLLTFQTWP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 THSLLPGTENSGYFRGSYSNSPSNPVNSRANQDFSALMRSSYHCAMNNENARLLTFQTWP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LTFLSPTDLAKAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDNAMSEHLRHFPKCPFIENQLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LTFLSPTDLAKAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDNAMSEHLRHFPKCPFIENQLQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 DTSRYTVSNLSMQTHAARFKTFFNWPSSVLVNPEQLASAGFYYVGNSDDVKCFCCDGGLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DTSRYTVSNLSMQTHAARFKTFFNWPSSVLVNPEQLASAGFYYVGNSDDVKCFCCDGGLR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 CWESGDDPWVQHAKWFPRCEYLIRIKGQEFIRQVQASYPHLLEQLLSTSDSPGDENAESS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CWESGDDPWVQHAKWFPRCEYLIRIKGQEFIRQVQASYPHLLEQLLSTSDSPGDENAESS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 IIHFEPGEDHSEDAIMMNTPVINAAVEMGFSRSLVKQTVQRKILATGENYRLVNDLVLDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IIHFEPGEDHSEDAIMMNTPVINAAVEMGFSRSLVKQTVQRKILATGENYRLVNDLVLDL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 LNAEDEIREEERERATEEKESNDLLLIRKNRMALFQHLTCVIPILDSLLTAGIINEQEHD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LNAEDEIREEERERATEEKESNDLLLIRKNRMALFQHLTCVIPILDSLLTAGIINEQEHD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 VIKQKTQTSLQARELIDTILVKGNIAATVFRNSLQEAEAVLYEHLFVQQDIKYIPTEDVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VIKQKTQTSLQARELIDTILVKGNIAATVFRNSLQEAEAVLYEHLFVQQDIKYIPTEDVS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 DLPVEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSIVFIPCGHLVVCKDCAPSLRKCPICRSTIKGTVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLPVEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSIVFIPCGHLVVCKDCAPSLRKCPICRSTIKGTVR
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 TFLS
::::
NP_001 TFLS
>>NP_892007 (OMIM: 601721) baculoviral IAP repeat-contai (604 aa)
initn: 4083 init1: 4083 opt: 4083 Z-score: 4015.9 bits: 753.1 E(92320): 6.5e-217
Smith-Waterman score: 4083; 100.0% identity (100.0% similar) in 604 aa overlap (1-604:1-604)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MNIVENSIFLSNLMKSANTFELKYDLSCELYRMSTYSTFPAGVPVSERSLARAGFYYTGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_892 MNIVENSIFLSNLMKSANTFELKYDLSCELYRMSTYSTFPAGVPVSERSLARAGFYYTGV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 NDKVKCFCCGLMLDNWKRGDSPTEKHKKLYPSCRFVQSLNSVNNLEATSQPTFPSSVTNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_892 NDKVKCFCCGLMLDNWKRGDSPTEKHKKLYPSCRFVQSLNSVNNLEATSQPTFPSSVTNS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 THSLLPGTENSGYFRGSYSNSPSNPVNSRANQDFSALMRSSYHCAMNNENARLLTFQTWP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_892 THSLLPGTENSGYFRGSYSNSPSNPVNSRANQDFSALMRSSYHCAMNNENARLLTFQTWP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LTFLSPTDLAKAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDNAMSEHLRHFPKCPFIENQLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_892 LTFLSPTDLAKAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDNAMSEHLRHFPKCPFIENQLQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 DTSRYTVSNLSMQTHAARFKTFFNWPSSVLVNPEQLASAGFYYVGNSDDVKCFCCDGGLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_892 DTSRYTVSNLSMQTHAARFKTFFNWPSSVLVNPEQLASAGFYYVGNSDDVKCFCCDGGLR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 CWESGDDPWVQHAKWFPRCEYLIRIKGQEFIRQVQASYPHLLEQLLSTSDSPGDENAESS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_892 CWESGDDPWVQHAKWFPRCEYLIRIKGQEFIRQVQASYPHLLEQLLSTSDSPGDENAESS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 IIHFEPGEDHSEDAIMMNTPVINAAVEMGFSRSLVKQTVQRKILATGENYRLVNDLVLDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_892 IIHFEPGEDHSEDAIMMNTPVINAAVEMGFSRSLVKQTVQRKILATGENYRLVNDLVLDL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 LNAEDEIREEERERATEEKESNDLLLIRKNRMALFQHLTCVIPILDSLLTAGIINEQEHD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_892 LNAEDEIREEERERATEEKESNDLLLIRKNRMALFQHLTCVIPILDSLLTAGIINEQEHD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 VIKQKTQTSLQARELIDTILVKGNIAATVFRNSLQEAEAVLYEHLFVQQDIKYIPTEDVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_892 VIKQKTQTSLQARELIDTILVKGNIAATVFRNSLQEAEAVLYEHLFVQQDIKYIPTEDVS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 DLPVEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSIVFIPCGHLVVCKDCAPSLRKCPICRSTIKGTVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_892 DLPVEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSIVFIPCGHLVVCKDCAPSLRKCPICRSTIKGTVR
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 TFLS
::::
NP_892 TFLS
>>NP_001157 (OMIM: 601712) baculoviral IAP repeat-contai (618 aa)
initn: 2444 init1: 1945 opt: 3045 Z-score: 2996.5 bits: 564.5 E(92320): 3.9e-160
Smith-Waterman score: 3045; 72.8% identity (89.2% similar) in 604 aa overlap (2-604:20-618)
10 20 30 40
pF1KB6 MNIVENSIFLSNLMKSANTFELKYDLSCELYRMSTYSTFPAG
.:.:.: .::. .: : ..:::.::::::::::::::::
NP_001 MHKTASQRLFPGPSYQNIKSIMEDSTILSDWTNS-NKQKMKYDFSCELYRMSTYSTFPAG
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 VPVSERSLARAGFYYTGVNDKVKCFCCGLMLDNWKRGDSPTEKHKKLYPSCRFVQSLNSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::: .:::.::::: :.:.: :.
NP_001 VPVSERSLARAGFYYTGVNDKVKCFCCGLMLDNWKLGDSPIQKHKQLYPSCSFIQNLVSA
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 NNLEATSQPTFPSSVTNS-THSLLPGTENSGYFRGSYSNSPSNPVNSRANQDFSALMRSS
. : .::. : : . :: .::: : :.:. : ::::. ::.:::: .:.:. .
NP_001 S-LGSTSKNTSP--MRNSFAHSLSPTLEHSSLFSGSYSSLSPNPLNSRAVEDISSSRTNP
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 YHCAMNNENARLLTFQTWPLTFLSPTDLAKAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDNA
: ::..:.::.::.. ::::::::..::.::::::::::::::::::::::::::::.:
NP_001 YSYAMSTEEARFLTYHMWPLTFLSPSELARAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDDA
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 MSEHLRHFPKCPFIENQLQDTSRYTVSNLSMQTHAARFKTFFNWPSSVLVNPEQLASAGF
:::: ::::.:::.::.:. : :...:::::::::::..::. ::::: :.:::::::::
NP_001 MSEHRRHFPNCPFLENSLE-TLRFSISNLSMQTHAARMRTFMYWPSSVPVQPEQLASAGF
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 YYVGNSDDVKCFCCDGGLRCWESGDDPWVQHAKWFPRCEYLIRIKGQEFIRQVQASYPHL
:::: .:::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::.:::::. ..:. ::::
NP_001 YYVGRNDDVKCFCCDGGLRCWESGDDPWVEHAKWFPRCEFLIRMKGQEFVDEIQGRYPHL
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 LEQLLSTSDSPGDENAESSIIHFEPGEDHSEDAIMMNTPVINAAVEMGFSRSLVKQTVQR
:::::::::. :.:::. :::: :::. ::::.::::::...:.::::.:.:::::::
NP_001 LEQLLSTSDTTGEENADPPIIHFGPGESSSEDAVMMNTPVVKSALEMGFNRDLVKQTVQS
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB6 KILATGENYRLVNDLVLDLLNAEDEIREEERERATEEKESNDLLLIRKNRMALFQHLTCV
:::.:::::. :::.: ::::::: ::::.:. .:: :.:: :::::::::::.::::
NP_001 KILTTGENYKTVNDIVSALLNAEDEKREEEKEKQAEEMASDDLSLIRKNRMALFQQLTCV
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB6 IPILDSLLTAGIINEQEHDVIKQKTQTSLQARELIDTILVKGNIAATVFRNSLQEAEAVL
.::::.:: :..::.::::.:::::: ::::::::::::::: ::..:.: :.: ...:
NP_001 LPILDNLLKANVINKQEHDIIKQKTQIPLQARELIDTILVKGNAAANIFKNCLKEIDSTL
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KB6 YEHLFVQQDIKYIPTEDVSDLPVEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSIVFIPCGHLVVCKDC
:..:::....::::::::: : .::::::::::::::::::::::.:::::::::::..:
NP_001 YKNLFVDKNMKYIPTEDVSGLSLEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSVVFIPCGHLVVCQEC
540 550 560 570 580 590
590 600
pF1KB6 APSLRKCPICRSTIKGTVRTFLS
:::::::::::. ::::::::::
NP_001 APSLRKCPICRGIIKGTVRTFLS
600 610
>>NP_001243092 (OMIM: 601712) baculoviral IAP repeat-con (618 aa)
initn: 2444 init1: 1945 opt: 3045 Z-score: 2996.5 bits: 564.5 E(92320): 3.9e-160
Smith-Waterman score: 3045; 72.8% identity (89.2% similar) in 604 aa overlap (2-604:20-618)
10 20 30 40
pF1KB6 MNIVENSIFLSNLMKSANTFELKYDLSCELYRMSTYSTFPAG
.:.:.: .::. .: : ..:::.::::::::::::::::
NP_001 MHKTASQRLFPGPSYQNIKSIMEDSTILSDWTNS-NKQKMKYDFSCELYRMSTYSTFPAG
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 VPVSERSLARAGFYYTGVNDKVKCFCCGLMLDNWKRGDSPTEKHKKLYPSCRFVQSLNSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::: .:::.::::: :.:.: :.
NP_001 VPVSERSLARAGFYYTGVNDKVKCFCCGLMLDNWKLGDSPIQKHKQLYPSCSFIQNLVSA
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 NNLEATSQPTFPSSVTNS-THSLLPGTENSGYFRGSYSNSPSNPVNSRANQDFSALMRSS
. : .::. : : . :: .::: : :.:. : ::::. ::.:::: .:.:. .
NP_001 S-LGSTSKNTSP--MRNSFAHSLSPTLEHSSLFSGSYSSLSPNPLNSRAVEDISSSRTNP
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 YHCAMNNENARLLTFQTWPLTFLSPTDLAKAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDNA
: ::..:.::.::.. ::::::::..::.::::::::::::::::::::::::::::.:
NP_001 YSYAMSTEEARFLTYHMWPLTFLSPSELARAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDDA
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 MSEHLRHFPKCPFIENQLQDTSRYTVSNLSMQTHAARFKTFFNWPSSVLVNPEQLASAGF
:::: ::::.:::.::.:. : :...:::::::::::..::. ::::: :.:::::::::
NP_001 MSEHRRHFPNCPFLENSLE-TLRFSISNLSMQTHAARMRTFMYWPSSVPVQPEQLASAGF
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 YYVGNSDDVKCFCCDGGLRCWESGDDPWVQHAKWFPRCEYLIRIKGQEFIRQVQASYPHL
:::: .:::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::.:::::. ..:. ::::
NP_001 YYVGRNDDVKCFCCDGGLRCWESGDDPWVEHAKWFPRCEFLIRMKGQEFVDEIQGRYPHL
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 LEQLLSTSDSPGDENAESSIIHFEPGEDHSEDAIMMNTPVINAAVEMGFSRSLVKQTVQR
:::::::::. :.:::. :::: :::. ::::.::::::...:.::::.:.:::::::
NP_001 LEQLLSTSDTTGEENADPPIIHFGPGESSSEDAVMMNTPVVKSALEMGFNRDLVKQTVQS
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB6 KILATGENYRLVNDLVLDLLNAEDEIREEERERATEEKESNDLLLIRKNRMALFQHLTCV
:::.:::::. :::.: ::::::: ::::.:. .:: :.:: :::::::::::.::::
NP_001 KILTTGENYKTVNDIVSALLNAEDEKREEEKEKQAEEMASDDLSLIRKNRMALFQQLTCV
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB6 IPILDSLLTAGIINEQEHDVIKQKTQTSLQARELIDTILVKGNIAATVFRNSLQEAEAVL
.::::.:: :..::.::::.:::::: ::::::::::::::: ::..:.: :.: ...:
NP_001 LPILDNLLKANVINKQEHDIIKQKTQIPLQARELIDTILVKGNAAANIFKNCLKEIDSTL
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KB6 YEHLFVQQDIKYIPTEDVSDLPVEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSIVFIPCGHLVVCKDC
:..:::....::::::::: : .::::::::::::::::::::::.:::::::::::..:
NP_001 YKNLFVDKNMKYIPTEDVSGLSLEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSVVFIPCGHLVVCQEC
540 550 560 570 580 590
590 600
pF1KB6 APSLRKCPICRSTIKGTVRTFLS
:::::::::::. ::::::::::
NP_001 APSLRKCPICRGIIKGTVRTFLS
600 610
>>NP_001243095 (OMIM: 601712) baculoviral IAP repeat-con (569 aa)
initn: 2373 init1: 1945 opt: 2951 Z-score: 2904.6 bits: 547.4 E(92320): 5.1e-155
Smith-Waterman score: 2951; 74.0% identity (89.7% similar) in 573 aa overlap (33-604:1-569)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 IVENSIFLSNLMKSANTFELKYDLSCELYRMSTYSTFPAGVPVSERSLARAGFYYTGVND
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSTYSTFPAGVPVSERSLARAGFYYTGVND
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 KVKCFCCGLMLDNWKRGDSPTEKHKKLYPSCRFVQSLNSVNNLEATSQPTFPSSVTNS-T
::::::::::::::: :::: .:::.::::: :.:.: :.. : .::. : : . :: .
NP_001 KVKCFCCGLMLDNWKLGDSPIQKHKQLYPSCSFIQNLVSAS-LGSTSKNTSP--MRNSFA
40 50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 HSLLPGTENSGYFRGSYSNSPSNPVNSRANQDFSALMRSSYHCAMNNENARLLTFQTWPL
::: : :.:. : ::::. ::.:::: .:.:. . : ::..:.::.::.. :::
NP_001 HSLSPTLEHSSLFSGSYSSLSPNPLNSRAVEDISSSRTNPYSYAMSTEEARFLTYHMWPL
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 TFLSPTDLAKAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDNAMSEHLRHFPKCPFIENQLQD
:::::..::.::::::::::::::::::::::::::::.::::: ::::.:::.::.:.
NP_001 TFLSPSELARAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDDAMSEHRRHFPNCPFLENSLE-
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 TSRYTVSNLSMQTHAARFKTFFNWPSSVLVNPEQLASAGFYYVGNSDDVKCFCCDGGLRC
: :...:::::::::::..::. ::::: :.::::::::::::: .::::::::::::::
NP_001 TLRFSISNLSMQTHAARMRTFMYWPSSVPVQPEQLASAGFYYVGRNDDVKCFCCDGGLRC
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 WESGDDPWVQHAKWFPRCEYLIRIKGQEFIRQVQASYPHLLEQLLSTSDSPGDENAESSI
:::::::::.:::::::::.:::.:::::. ..:. :::::::::::::. :.:::. :
NP_001 WESGDDPWVEHAKWFPRCEFLIRMKGQEFVDEIQGRYPHLLEQLLSTSDTTGEENADPPI
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 IHFEPGEDHSEDAIMMNTPVINAAVEMGFSRSLVKQTVQRKILATGENYRLVNDLVLDLL
::: :::. ::::.::::::...:.::::.:.::::::: :::.:::::. :::.: ::
NP_001 IHFGPGESSSEDAVMMNTPVVKSALEMGFNRDLVKQTVQSKILTTGENYKTVNDIVSALL
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 NAEDEIREEERERATEEKESNDLLLIRKNRMALFQHLTCVIPILDSLLTAGIINEQEHDV
::::: ::::.:. .:: :.:: :::::::::::.::::.::::.:: :..::.::::.
NP_001 NAEDEKREEEKEKQAEEMASDDLSLIRKNRMALFQQLTCVLPILDNLLKANVINKQEHDI
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 IKQKTQTSLQARELIDTILVKGNIAATVFRNSLQEAEAVLYEHLFVQQDIKYIPTEDVSD
:::::: ::::::::::::::: ::..:.: :.: ...::..:::....:::::::::
NP_001 IKQKTQIPLQARELIDTILVKGNAAANIFKNCLKEIDSTLYKNLFVDKNMKYIPTEDVSG
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 LPVEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSIVFIPCGHLVVCKDCAPSLRKCPICRSTIKGTVRT
: .::::::::::::::::::::::.:::::::::::..::::::::::::. :::::::
NP_001 LSLEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSVVFIPCGHLVVCQECAPSLRKCPICRGIIKGTVRT
510 520 530 540 550 560
pF1KB6 FLS
:::
NP_001 FLS
>>XP_024304235 (OMIM: 601721) baculoviral IAP repeat-con (381 aa)
initn: 2146 init1: 2146 opt: 2148 Z-score: 2118.2 bits: 401.3 E(92320): 3.3e-111
Smith-Waterman score: 2148; 89.9% identity (94.6% similar) in 367 aa overlap (238-604:22-381)
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 CGGKLSNWEPKDNAMSEHLRHFPKCPFIENQLQDTSRYTVSNLSMQTHAARFKTFFNWPS
.:.:. : . :. :. :: .. .. .
XP_024 MQTTGRSAERLVQIGVGIWVTHLKDSVRLAPSG----TEKARRQVSLEKTG
10 20 30 40
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 SVLVNPEQLASAGFYYVGNSDDVKCFCCDGGLRCWESGDDPWVQHAKWFPRCEYLIRIKG
::.. .:.. .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_024 LVLAGA---CVVGLWAAGNSDDVKCFCCDGGLRCWESGDDPWVQHAKWFPRCEYLIRIKG
50 60 70 80 90 100
330 340 350 360 370 380
pF1KB6 QEFIRQVQASYPHLLEQLLSTSDSPGDENAESSIIHFEPGEDHSEDAIMMNTPVINAAVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_024 QEFIRQVQASYPHLLEQLLSTSDSPGDENAESSIIHFEPGEDHSEDAIMMNTPVINAAVE
110 120 130 140 150 160
390 400 410 420 430 440
pF1KB6 MGFSRSLVKQTVQRKILATGENYRLVNDLVLDLLNAEDEIREEERERATEEKESNDLLLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_024 MGFSRSLVKQTVQRKILATGENYRLVNDLVLDLLNAEDEIREEERERATEEKESNDLLLI
170 180 190 200 210 220
450 460 470 480 490 500
pF1KB6 RKNRMALFQHLTCVIPILDSLLTAGIINEQEHDVIKQKTQTSLQARELIDTILVKGNIAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_024 RKNRMALFQHLTCVIPILDSLLTAGIINEQEHDVIKQKTQTSLQARELIDTILVKGNIAA
230 240 250 260 270 280
510 520 530 540 550 560
pF1KB6 TVFRNSLQEAEAVLYEHLFVQQDIKYIPTEDVSDLPVEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_024 TVFRNSLQEAEAVLYEHLFVQQDIKYIPTEDVSDLPVEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSI
290 300 310 320 330 340
570 580 590 600
pF1KB6 VFIPCGHLVVCKDCAPSLRKCPICRSTIKGTVRTFLS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_024 VFIPCGHLVVCKDCAPSLRKCPICRSTIKGTVRTFLS
350 360 370 380
>>NP_071444 (OMIM: 605737) baculoviral IAP repeat-contai (280 aa)
initn: 617 init1: 380 opt: 389 Z-score: 392.5 bits: 81.6 E(92320): 4.3e-15
Smith-Waterman score: 436; 29.4% identity (45.2% similar) in 394 aa overlap (215-604:48-280)
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 SPTDLAKAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDNAMSEHLRHFPKCPFIENQLQDTSR
:. :. . .:: :. :.. .. .
NP_071 HWAAGDGPTQERCGPRSLGSPVLGLDTCRAWDHVDGQILGQLR-----PLTEEEEEEGAG
20 30 40 50 60 70
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 YTVSNL----SMQTHAARFKTFFNWPSSVLVNPEQLASAGFYYVGNSDDVKCFCCDGGLR
:.: .: .. :. .:..:: .. : :: ::.:::...:..: :.:: : :::.
NP_071 ATLSRGPAFPGMGSEELRLASFYDWPLTAEVPPELLAAAGFFHTGHQDKVRCFFCYGGLQ
80 90 100 110 120 130
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 CWESGDDPWVQHAKWFPRCEYLIRIKGQEFIRQVQASYPHLLEQLLSTSDSPGDENAESS
:. :::::..:::::: :..:.: ::..:...:: .. :::.. : : .:
NP_071 SWKRGDDPWTEHAKWFPSCQFLLRSKGRDFVHSVQETHS----QLLGSWD-PWEE-----
140 150 160 170 180
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 IIHFEPGEDHSEDAIMMNTPVINAAVEMGFSRSLVKQTVQRKILATGENYRLVNDLVLDL
: ::: .:: .. :.
NP_071 -----P-----EDA----APVAPSVPASGYP-----------------------------
190
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 LNAEDEIREEERERATEEKESNDLLLIRKNRMALFQHLTCVIPILDSLLTAGIINEQEHD
:. .:: .:
NP_071 -----ELPTPRREVQSE-------------------------------------------
200 210
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 VIKQKTQTSLQARELIDTILVKGNIAATVFRNSLQEAEAVLYEHLFVQQDIKYIPTEDVS
: :: : .:
NP_071 --------------------------------SAQEPGA---------RD----------
220
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 DLPVEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSIVFIPCGHLVVCKDCAPSLRKCPICRSTIKGTVR
:: ::::::::::::::.:. :::::.:::::: : .:::.:. :::::. ... ::
NP_071 ---VEAQLRRLQEERTCKVCLDRAVSIVFVPCGHLV-CAECAPGLQLCPICRAPVRSRVR
230 240 250 260 270
pF1KB6 TFLS
::::
NP_071 TFLS
280
>>NP_647478 (OMIM: 605737) baculoviral IAP repeat-contai (298 aa)
initn: 617 init1: 380 opt: 389 Z-score: 392.2 bits: 81.6 E(92320): 4.5e-15
Smith-Waterman score: 472; 31.0% identity (47.5% similar) in 394 aa overlap (215-604:48-298)
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 SPTDLAKAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDNAMSEHLRHFPKCPFIENQLQDTSR
:. :. . .:: :. :.. .. .
NP_647 HWAAGDGPTQERCGPRSLGSPVLGLDTCRAWDHVDGQILGQLR-----PLTEEEEEEGAG
20 30 40 50 60 70
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 YTVSNL----SMQTHAARFKTFFNWPSSVLVNPEQLASAGFYYVGNSDDVKCFCCDGGLR
:.: .: .. :. .:..:: .. : :: ::.:::...:..: :.:: : :::.
NP_647 ATLSRGPAFPGMGSEELRLASFYDWPLTAEVPPELLAAAGFFHTGHQDKVRCFFCYGGLQ
80 90 100 110 120 130
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 CWESGDDPWVQHAKWFPRCEYLIRIKGQEFIRQVQASYPHLLEQLLSTSDSPGDENAESS
:. :::::..:::::: :..:.: ::..:...:: .. :::.. : : .:
NP_647 SWKRGDDPWTEHAKWFPSCQFLLRSKGRDFVHSVQETHS----QLLGSWD-PWEE-----
140 150 160 170 180
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 IIHFEPGEDHSEDAIMMNTPVINAAVEMGFSRSLVKQTVQRKILATGENYRLVNDLVLDL
: ::: .:: .. :. . : : .
NP_647 -----P-----EDA----APVAPSVPASGYPE-----------LPTPR------------
190 200
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 LNAEDEIREEERERATEEKESNDLLLIRKNRMALFQHLTCVIPILDSLLTAGIINEQEHD
:: . : : : : : .. :
NP_647 -------REVQSESAQE-------------------------P--------GGVSPAEA-
210 220
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 VIKQKTQTSLQARELIDTILVKGNIAATVFRNSLQEAEAVLYEHLFVQQDIKYIPTEDVS
:.: :: : .
NP_647 ----------------------------------QRAWWVL---------------EPPG
230
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 DLPVEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSIVFIPCGHLVVCKDCAPSLRKCPICRSTIKGTVR
:: ::::::::::::::.:. :::::.:::::: : .:::.:. :::::. ... ::
NP_647 ARDVEAQLRRLQEERTCKVCLDRAVSIVFVPCGHLV-CAECAPGLQLCPICRAPVRSRVR
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 TFLS
::::
NP_647 TFLS
>>NP_001191330 (OMIM: 300079,300635,308240) E3 ubiquitin (497 aa)
initn: 1195 init1: 302 opt: 344 Z-score: 345.2 bits: 73.7 E(92320): 1.9e-12
Smith-Waterman score: 1075; 34.7% identity (55.9% similar) in 594 aa overlap (29-604:26-497)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MNIVENSIFLSNLMKSANTFELKYDLSCELYRMSTYSTFPAGVPVSERSLARAGFYYTGV
:. :..:...::.: ::: .:::::: :::
NP_001 MTFNSFEGSKTCVPADINKEEEFVEEFNRLKTFANFPSGSPVSASTLARAGFLYTGE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 NDKVKCFCCGLMLDNWKRGDSPTEKHKKLYPSCRFVQSLNSVNNLEATSQPTFPSSVTNS
.: :.:: : .: :. ::: . .:.:. :.:::.... :: .. . :.. :.
NP_001 GDTVRCFSCHAAVDRWQYGDSAVGRHRKVSPNCRFINGFY----LENSATQSTNSGIQNG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB6 THSLLPGTENSGYFRGSYSNSPSNPVNSRANQ--DFSALMRSSYHCAMNNENARLLTFQT
... . .: . . :..: :.: . . :: .:.::: .::.
NP_001 QYKVENYLGSRDHFALDRPSETHADYLLRTGQVVDISDTIYPR-NPAMYSEEARLKSFQN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 WP-LTFLSPTDLAKAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDNAMSEHLRHFPKCPFI--
:: . :.: .::.::.:: : ::.: :: :::::.:::: : : ::: ::::.: :.
NP_001 WPDYAHLTPRELASAGLYYTGIGDQVQCFCCGGKLKNWEPCDRAWSEHRRHFPNCFFVLG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB6 -------ENQLQDTSRY--TVSNL----SMQTHAARFKTFFNWPSSVLVNPEQLASAGFY
:.. ...: . .:: :: . ::. :: .: :: : :::: ::::
NP_001 RNLNIRSESDAVSSDRNFPNSTNLPRNPSMADYEARIFTFGTWIYSV--NKEQLARAGFY
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 YVGNSDDVKCFCCDGGLRCWESGDDPWVQHAKWFPRCEYLIRIKGQEFIRQVQASYPHLL
.:..: :::: : ::: :. ..::: :::::.: :.::.. ::::.: ... . : :
NP_001 ALGEGDKVKCFHCGGGLTDWKPSEDPWEQHAKWYPGCKYLLEQKGQEYINNIHLT--HSL
300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 EQLLSTSDSPGDENAESSIIHFEPGEDHSEDAIMMNTPVINAAVEMGFSRSLVKQTVQRK
:. : . .:.. :. . : ....:... :..:::: . .:. ...:
NP_001 EECLVRT-------TEKT-----PSLTRRIDDTIFQNPMVQEAIRMGFSFKDIKKIMEEK
350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KB6 ILATGENYRLVNDLVLDLLNAEDEIREEERERATEEKESNDLLLIRKNRMALFQHLTCVI
: .: ::. .. :: ::.::. . ..:
NP_001 IQISGSNYKSLEVLVADLVNAQKDSMQDE-------------------------------
400 410 420
470 480 490 500 510 520
pF1KB6 PILDSLLTAGIINEQEHDVIKQKTQTSLQARELIDTILVKGNIAATVFRNSLQEAEAVLY
..:::::
NP_001 ----------------------SSQTSLQ-------------------------------
430
530 540 550 560 570 580
pF1KB6 EHLFVQQDIKYIPTEDVSDLPVEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSIVFIPCGHLVVCKDCA
: : :: :::::::::. ::.:::....:::.::::::.::.::
NP_001 ---------KEISTE--------EQLRRLQEEKLCKICMDRNIAIVFVPCGHLVTCKQCA
440 450 460 470
590 600
pF1KB6 PSLRKCPICRSTIKGTVRTFLS
.. :::.: ..: . :.:
NP_001 EAVDKCPMCYTVITFKQKIFMS
480 490
>>XP_006724817 (OMIM: 300079,300635,308240) E3 ubiquitin (497 aa)
initn: 1195 init1: 302 opt: 344 Z-score: 345.2 bits: 73.7 E(92320): 1.9e-12
Smith-Waterman score: 1075; 34.7% identity (55.9% similar) in 594 aa overlap (29-604:26-497)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MNIVENSIFLSNLMKSANTFELKYDLSCELYRMSTYSTFPAGVPVSERSLARAGFYYTGV
:. :..:...::.: ::: .:::::: :::
XP_006 MTFNSFEGSKTCVPADINKEEEFVEEFNRLKTFANFPSGSPVSASTLARAGFLYTGE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 NDKVKCFCCGLMLDNWKRGDSPTEKHKKLYPSCRFVQSLNSVNNLEATSQPTFPSSVTNS
.: :.:: : .: :. ::: . .:.:. :.:::.... :: .. . :.. :.
XP_006 GDTVRCFSCHAAVDRWQYGDSAVGRHRKVSPNCRFINGFY----LENSATQSTNSGIQNG
60 70 80 90 100 110
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