Result of FASTA (ccds) for pF1KB6172
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6172, 604 aa
  1>>>pF1KB6172     604 - 604 aa - 604 aa
Library: human.CCDS.faa
  18921897 residues in 33420 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7668+/-0.000952; mu= 17.5399+/- 0.057
 mean_var=93.5738+/-19.552, 0's: 0 Z-trim(107.0): 86  B-trim: 985 in 2/50
 Lambda= 0.132586
 statistics sampled from 9330 (9421) to 9330 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.642), E-opt: 0.2 (0.282), width:  16
 Scan time:  1.670

The best scores are:                                      opt bits E(33420)
CCDS8315.1 BIRC3 gene_id:330|Hs109|chr11           ( 604) 4083 791.7       0
CCDS8316.1 BIRC2 gene_id:329|Hs109|chr11           ( 618) 3045 593.2 3.4e-169
CCDS58169.1 BIRC2 gene_id:329|Hs109|chr11          ( 569) 2951 575.2 8.3e-164
CCDS13512.1 BIRC7 gene_id:79444|Hs109|chr20        ( 280)  389 84.9 1.6e-16
CCDS13513.1 BIRC7 gene_id:79444|Hs109|chr20        ( 298)  389 84.9 1.7e-16
CCDS14606.1 XIAP gene_id:331|Hs109|chrX            ( 497)  344 76.5 9.7e-14
CCDS12863.1 BIRC8 gene_id:112401|Hs109|chr19       ( 236)  320 71.6 1.3e-12
CCDS4009.1 NAIP gene_id:4671|Hs109|chr5            (1403)  321 72.4 4.5e-12


>>CCDS8315.1 BIRC3 gene_id:330|Hs109|chr11                (604 aa)
 initn: 4083 init1: 4083 opt: 4083  Z-score: 4224.4  bits: 791.7 E(33420):    0
Smith-Waterman score: 4083; 100.0% identity (100.0% similar) in 604 aa overlap (1-604:1-604)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MNIVENSIFLSNLMKSANTFELKYDLSCELYRMSTYSTFPAGVPVSERSLARAGFYYTGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MNIVENSIFLSNLMKSANTFELKYDLSCELYRMSTYSTFPAGVPVSERSLARAGFYYTGV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 NDKVKCFCCGLMLDNWKRGDSPTEKHKKLYPSCRFVQSLNSVNNLEATSQPTFPSSVTNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 NDKVKCFCCGLMLDNWKRGDSPTEKHKKLYPSCRFVQSLNSVNNLEATSQPTFPSSVTNS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 THSLLPGTENSGYFRGSYSNSPSNPVNSRANQDFSALMRSSYHCAMNNENARLLTFQTWP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 THSLLPGTENSGYFRGSYSNSPSNPVNSRANQDFSALMRSSYHCAMNNENARLLTFQTWP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 LTFLSPTDLAKAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDNAMSEHLRHFPKCPFIENQLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LTFLSPTDLAKAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDNAMSEHLRHFPKCPFIENQLQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 DTSRYTVSNLSMQTHAARFKTFFNWPSSVLVNPEQLASAGFYYVGNSDDVKCFCCDGGLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 DTSRYTVSNLSMQTHAARFKTFFNWPSSVLVNPEQLASAGFYYVGNSDDVKCFCCDGGLR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 CWESGDDPWVQHAKWFPRCEYLIRIKGQEFIRQVQASYPHLLEQLLSTSDSPGDENAESS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 CWESGDDPWVQHAKWFPRCEYLIRIKGQEFIRQVQASYPHLLEQLLSTSDSPGDENAESS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 IIHFEPGEDHSEDAIMMNTPVINAAVEMGFSRSLVKQTVQRKILATGENYRLVNDLVLDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 IIHFEPGEDHSEDAIMMNTPVINAAVEMGFSRSLVKQTVQRKILATGENYRLVNDLVLDL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB6 LNAEDEIREEERERATEEKESNDLLLIRKNRMALFQHLTCVIPILDSLLTAGIINEQEHD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LNAEDEIREEERERATEEKESNDLLLIRKNRMALFQHLTCVIPILDSLLTAGIINEQEHD
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB6 VIKQKTQTSLQARELIDTILVKGNIAATVFRNSLQEAEAVLYEHLFVQQDIKYIPTEDVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 VIKQKTQTSLQARELIDTILVKGNIAATVFRNSLQEAEAVLYEHLFVQQDIKYIPTEDVS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB6 DLPVEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSIVFIPCGHLVVCKDCAPSLRKCPICRSTIKGTVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 DLPVEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSIVFIPCGHLVVCKDCAPSLRKCPICRSTIKGTVR
              550       560       570       580       590       600

           
pF1KB6 TFLS
       ::::
CCDS83 TFLS
           

>>CCDS8316.1 BIRC2 gene_id:329|Hs109|chr11                (618 aa)
 initn: 2444 init1: 1945 opt: 3045  Z-score: 3151.3  bits: 593.2 E(33420): 3.4e-169
Smith-Waterman score: 3045; 72.8% identity (89.2% similar) in 604 aa overlap (2-604:20-618)

                                 10        20        30        40  
pF1KB6                   MNIVENSIFLSNLMKSANTFELKYDLSCELYRMSTYSTFPAG
                          .:.:.: .::.  .: :  ..:::.::::::::::::::::
CCDS83 MHKTASQRLFPGPSYQNIKSIMEDSTILSDWTNS-NKQKMKYDFSCELYRMSTYSTFPAG
               10        20        30         40        50         

             50        60        70        80        90       100  
pF1KB6 VPVSERSLARAGFYYTGVNDKVKCFCCGLMLDNWKRGDSPTEKHKKLYPSCRFVQSLNSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::: .:::.::::: :.:.: :.
CCDS83 VPVSERSLARAGFYYTGVNDKVKCFCCGLMLDNWKLGDSPIQKHKQLYPSCSFIQNLVSA
      60        70        80        90       100       110         

            110       120        130       140       150       160 
pF1KB6 NNLEATSQPTFPSSVTNS-THSLLPGTENSGYFRGSYSNSPSNPVNSRANQDFSALMRSS
       . : .::. : :  . :: .::: :  :.:. : ::::.   ::.:::: .:.:.   . 
CCDS83 S-LGSTSKNTSP--MRNSFAHSLSPTLEHSSLFSGSYSSLSPNPLNSRAVEDISSSRTNP
     120        130         140       150       160       170      

             170       180       190       200       210       220 
pF1KB6 YHCAMNNENARLLTFQTWPLTFLSPTDLAKAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDNA
       :  ::..:.::.::.. ::::::::..::.::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS83 YSYAMSTEEARFLTYHMWPLTFLSPSELARAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDDA
        180       190       200       210       220       230      

             230       240       250       260       270       280 
pF1KB6 MSEHLRHFPKCPFIENQLQDTSRYTVSNLSMQTHAARFKTFFNWPSSVLVNPEQLASAGF
       :::: ::::.:::.::.:. : :...:::::::::::..::. ::::: :.:::::::::
CCDS83 MSEHRRHFPNCPFLENSLE-TLRFSISNLSMQTHAARMRTFMYWPSSVPVQPEQLASAGF
        240       250        260       270       280       290     

             290       300       310       320       330       340 
pF1KB6 YYVGNSDDVKCFCCDGGLRCWESGDDPWVQHAKWFPRCEYLIRIKGQEFIRQVQASYPHL
       :::: .:::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::.:::::. ..:. ::::
CCDS83 YYVGRNDDVKCFCCDGGLRCWESGDDPWVEHAKWFPRCEFLIRMKGQEFVDEIQGRYPHL
         300       310       320       330       340       350     

             350       360       370       380       390       400 
pF1KB6 LEQLLSTSDSPGDENAESSIIHFEPGEDHSEDAIMMNTPVINAAVEMGFSRSLVKQTVQR
       :::::::::. :.:::.  :::: :::. ::::.::::::...:.::::.:.::::::: 
CCDS83 LEQLLSTSDTTGEENADPPIIHFGPGESSSEDAVMMNTPVVKSALEMGFNRDLVKQTVQS
         360       370       380       390       400       410     

             410       420       430       440       450       460 
pF1KB6 KILATGENYRLVNDLVLDLLNAEDEIREEERERATEEKESNDLLLIRKNRMALFQHLTCV
       :::.:::::. :::.:  ::::::: ::::.:. .::  :.:: :::::::::::.::::
CCDS83 KILTTGENYKTVNDIVSALLNAEDEKREEEKEKQAEEMASDDLSLIRKNRMALFQQLTCV
         420       430       440       450       460       470     

             470       480       490       500       510       520 
pF1KB6 IPILDSLLTAGIINEQEHDVIKQKTQTSLQARELIDTILVKGNIAATVFRNSLQEAEAVL
       .::::.:: :..::.::::.::::::  ::::::::::::::: ::..:.: :.: ...:
CCDS83 LPILDNLLKANVINKQEHDIIKQKTQIPLQARELIDTILVKGNAAANIFKNCLKEIDSTL
         480       490       500       510       520       530     

             530       540       550       560       570       580 
pF1KB6 YEHLFVQQDIKYIPTEDVSDLPVEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSIVFIPCGHLVVCKDC
       :..:::....::::::::: : .::::::::::::::::::::::.:::::::::::..:
CCDS83 YKNLFVDKNMKYIPTEDVSGLSLEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSVVFIPCGHLVVCQEC
         540       550       560       570       580       590     

             590       600    
pF1KB6 APSLRKCPICRSTIKGTVRTFLS
       :::::::::::. ::::::::::
CCDS83 APSLRKCPICRGIIKGTVRTFLS
         600       610        

>>CCDS58169.1 BIRC2 gene_id:329|Hs109|chr11               (569 aa)
 initn: 2373 init1: 1945 opt: 2951  Z-score: 3054.6  bits: 575.2 E(33420): 8.3e-164
Smith-Waterman score: 2951; 74.0% identity (89.7% similar) in 573 aa overlap (33-604:1-569)

             10        20        30        40        50        60  
pF1KB6 IVENSIFLSNLMKSANTFELKYDLSCELYRMSTYSTFPAGVPVSERSLARAGFYYTGVND
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58                               MSTYSTFPAGVPVSERSLARAGFYYTGVND
                                             10        20        30

             70        80        90       100       110       120  
pF1KB6 KVKCFCCGLMLDNWKRGDSPTEKHKKLYPSCRFVQSLNSVNNLEATSQPTFPSSVTNS-T
       ::::::::::::::: :::: .:::.::::: :.:.: :.. : .::. : :  . :: .
CCDS58 KVKCFCCGLMLDNWKLGDSPIQKHKQLYPSCSFIQNLVSAS-LGSTSKNTSP--MRNSFA
               40        50        60        70         80         

             130       140       150       160       170       180 
pF1KB6 HSLLPGTENSGYFRGSYSNSPSNPVNSRANQDFSALMRSSYHCAMNNENARLLTFQTWPL
       ::: :  :.:. : ::::.   ::.:::: .:.:.   . :  ::..:.::.::.. :::
CCDS58 HSLSPTLEHSSLFSGSYSSLSPNPLNSRAVEDISSSRTNPYSYAMSTEEARFLTYHMWPL
        90       100       110       120       130       140       

             190       200       210       220       230       240 
pF1KB6 TFLSPTDLAKAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDNAMSEHLRHFPKCPFIENQLQD
       :::::..::.::::::::::::::::::::::::::::.::::: ::::.:::.::.:. 
CCDS58 TFLSPSELARAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDDAMSEHRRHFPNCPFLENSLE-
       150       160       170       180       190       200       

             250       260       270       280       290       300 
pF1KB6 TSRYTVSNLSMQTHAARFKTFFNWPSSVLVNPEQLASAGFYYVGNSDDVKCFCCDGGLRC
       : :...:::::::::::..::. ::::: :.::::::::::::: .::::::::::::::
CCDS58 TLRFSISNLSMQTHAARMRTFMYWPSSVPVQPEQLASAGFYYVGRNDDVKCFCCDGGLRC
        210       220       230       240       250       260      

             310       320       330       340       350       360 
pF1KB6 WESGDDPWVQHAKWFPRCEYLIRIKGQEFIRQVQASYPHLLEQLLSTSDSPGDENAESSI
       :::::::::.:::::::::.:::.:::::. ..:. :::::::::::::. :.:::.  :
CCDS58 WESGDDPWVEHAKWFPRCEFLIRMKGQEFVDEIQGRYPHLLEQLLSTSDTTGEENADPPI
        270       280       290       300       310       320      

             370       380       390       400       410       420 
pF1KB6 IHFEPGEDHSEDAIMMNTPVINAAVEMGFSRSLVKQTVQRKILATGENYRLVNDLVLDLL
       ::: :::. ::::.::::::...:.::::.:.::::::: :::.:::::. :::.:  ::
CCDS58 IHFGPGESSSEDAVMMNTPVVKSALEMGFNRDLVKQTVQSKILTTGENYKTVNDIVSALL
        330       340       350       360       370       380      

             430       440       450       460       470       480 
pF1KB6 NAEDEIREEERERATEEKESNDLLLIRKNRMALFQHLTCVIPILDSLLTAGIINEQEHDV
       ::::: ::::.:. .::  :.:: :::::::::::.::::.::::.:: :..::.::::.
CCDS58 NAEDEKREEEKEKQAEEMASDDLSLIRKNRMALFQQLTCVLPILDNLLKANVINKQEHDI
        390       400       410       420       430       440      

             490       500       510       520       530       540 
pF1KB6 IKQKTQTSLQARELIDTILVKGNIAATVFRNSLQEAEAVLYEHLFVQQDIKYIPTEDVSD
       ::::::  ::::::::::::::: ::..:.: :.: ...::..:::....::::::::: 
CCDS58 IKQKTQIPLQARELIDTILVKGNAAANIFKNCLKEIDSTLYKNLFVDKNMKYIPTEDVSG
        450       460       470       480       490       500      

             550       560       570       580       590       600 
pF1KB6 LPVEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSIVFIPCGHLVVCKDCAPSLRKCPICRSTIKGTVRT
       : .::::::::::::::::::::::.:::::::::::..::::::::::::. :::::::
CCDS58 LSLEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSVVFIPCGHLVVCQECAPSLRKCPICRGIIKGTVRT
        510       520       530       540       550       560      

          
pF1KB6 FLS
       :::
CCDS58 FLS
          

>>CCDS13512.1 BIRC7 gene_id:79444|Hs109|chr20             (280 aa)
 initn: 617 init1: 380 opt: 389  Z-score: 410.3  bits: 84.9 E(33420): 1.6e-16
Smith-Waterman score: 436; 29.4% identity (45.2% similar) in 394 aa overlap (215-604:48-280)

          190       200       210       220       230       240    
pF1KB6 SPTDLAKAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDNAMSEHLRHFPKCPFIENQLQDTSR
                                     :.  :. .  .::     :. :.. .. . 
CCDS13 HWAAGDGPTQERCGPRSLGSPVLGLDTCRAWDHVDGQILGQLR-----PLTEEEEEEGAG
        20        30        40        50        60             70  

          250           260       270       280       290       300
pF1KB6 YTVSNL----SMQTHAARFKTFFNWPSSVLVNPEQLASAGFYYVGNSDDVKCFCCDGGLR
        :.:      .: ..  :. .:..:: .. : :: ::.:::...:..: :.:: : :::.
CCDS13 ATLSRGPAFPGMGSEELRLASFYDWPLTAEVPPELLAAAGFFHTGHQDKVRCFFCYGGLQ
             80        90       100       110       120       130  

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 CWESGDDPWVQHAKWFPRCEYLIRIKGQEFIRQVQASYPHLLEQLLSTSDSPGDENAESS
        :. :::::..:::::: :..:.: ::..:...:: ..     :::.. : : .:     
CCDS13 SWKRGDDPWTEHAKWFPSCQFLLRSKGRDFVHSVQETHS----QLLGSWD-PWEE-----
            140       150       160       170            180       

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 IIHFEPGEDHSEDAIMMNTPVINAAVEMGFSRSLVKQTVQRKILATGENYRLVNDLVLDL
            :     :::    .::  ..   :.                              
CCDS13 -----P-----EDA----APVAPSVPASGYP-----------------------------
                          190                                      

              430       440       450       460       470       480
pF1KB6 LNAEDEIREEERERATEEKESNDLLLIRKNRMALFQHLTCVIPILDSLLTAGIINEQEHD
            :.   .::  .:                                           
CCDS13 -----ELPTPRREVQSE-------------------------------------------
          200       210                                            

              490       500       510       520       530       540
pF1KB6 VIKQKTQTSLQARELIDTILVKGNIAATVFRNSLQEAEAVLYEHLFVQQDIKYIPTEDVS
                                       : ::  :         .:          
CCDS13 --------------------------------SAQEPGA---------RD----------
                                                      220          

              550       560       570       580       590       600
pF1KB6 DLPVEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSIVFIPCGHLVVCKDCAPSLRKCPICRSTIKGTVR
          :: ::::::::::::::.:. :::::.:::::: : .:::.:. :::::. ... ::
CCDS13 ---VEAQLRRLQEERTCKVCLDRAVSIVFVPCGHLV-CAECAPGLQLCPICRAPVRSRVR
                 230       240       250        260       270      

           
pF1KB6 TFLS
       ::::
CCDS13 TFLS
        280

>>CCDS13513.1 BIRC7 gene_id:79444|Hs109|chr20             (298 aa)
 initn: 617 init1: 380 opt: 389  Z-score: 409.9  bits: 84.9 E(33420): 1.7e-16
Smith-Waterman score: 472; 31.0% identity (47.5% similar) in 394 aa overlap (215-604:48-298)

          190       200       210       220       230       240    
pF1KB6 SPTDLAKAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDNAMSEHLRHFPKCPFIENQLQDTSR
                                     :.  :. .  .::     :. :.. .. . 
CCDS13 HWAAGDGPTQERCGPRSLGSPVLGLDTCRAWDHVDGQILGQLR-----PLTEEEEEEGAG
        20        30        40        50        60             70  

          250           260       270       280       290       300
pF1KB6 YTVSNL----SMQTHAARFKTFFNWPSSVLVNPEQLASAGFYYVGNSDDVKCFCCDGGLR
        :.:      .: ..  :. .:..:: .. : :: ::.:::...:..: :.:: : :::.
CCDS13 ATLSRGPAFPGMGSEELRLASFYDWPLTAEVPPELLAAAGFFHTGHQDKVRCFFCYGGLQ
             80        90       100       110       120       130  

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 CWESGDDPWVQHAKWFPRCEYLIRIKGQEFIRQVQASYPHLLEQLLSTSDSPGDENAESS
        :. :::::..:::::: :..:.: ::..:...:: ..     :::.. : : .:     
CCDS13 SWKRGDDPWTEHAKWFPSCQFLLRSKGRDFVHSVQETHS----QLLGSWD-PWEE-----
            140       150       160       170            180       

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 IIHFEPGEDHSEDAIMMNTPVINAAVEMGFSRSLVKQTVQRKILATGENYRLVNDLVLDL
            :     :::    .::  ..   :. .           : : .            
CCDS13 -----P-----EDA----APVAPSVPASGYPE-----------LPTPR------------
                          190       200                            

              430       440       450       460       470       480
pF1KB6 LNAEDEIREEERERATEEKESNDLLLIRKNRMALFQHLTCVIPILDSLLTAGIINEQEHD
              :: . : : :                         :        : ..  :  
CCDS13 -------REVQSESAQE-------------------------P--------GGVSPAEA-
                210                                        220     

              490       500       510       520       530       540
pF1KB6 VIKQKTQTSLQARELIDTILVKGNIAATVFRNSLQEAEAVLYEHLFVQQDIKYIPTEDVS
                                         :.:  ::               :  .
CCDS13 ----------------------------------QRAWWVL---------------EPPG
                                            230                    

              550       560       570       580       590       600
pF1KB6 DLPVEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSIVFIPCGHLVVCKDCAPSLRKCPICRSTIKGTVR
          :: ::::::::::::::.:. :::::.:::::: : .:::.:. :::::. ... ::
CCDS13 ARDVEAQLRRLQEERTCKVCLDRAVSIVFVPCGHLV-CAECAPGLQLCPICRAPVRSRVR
         240       250       260       270        280       290    

           
pF1KB6 TFLS
       ::::
CCDS13 TFLS
           

>>CCDS14606.1 XIAP gene_id:331|Hs109|chrX                 (497 aa)
 initn: 1195 init1: 302 opt: 344  Z-score: 360.3  bits: 76.5 E(33420): 9.7e-14
Smith-Waterman score: 1075; 34.7% identity (55.9% similar) in 594 aa overlap (29-604:26-497)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MNIVENSIFLSNLMKSANTFELKYDLSCELYRMSTYSTFPAGVPVSERSLARAGFYYTGV
                                   :. :..:...::.: :::  .:::::: ::: 
CCDS14    MTFNSFEGSKTCVPADINKEEEFVEEFNRLKTFANFPSGSPVSASTLARAGFLYTGE
                  10        20        30        40        50       

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 NDKVKCFCCGLMLDNWKRGDSPTEKHKKLYPSCRFVQSLNSVNNLEATSQPTFPSSVTNS
       .: :.:: :   .: :. ::: . .:.:. :.:::....     :: ..  .  :.. :.
CCDS14 GDTVRCFSCHAAVDRWQYGDSAVGRHRKVSPNCRFINGFY----LENSATQSTNSGIQNG
        60        70        80        90           100       110   

              130       140       150         160       170        
pF1KB6 THSLLPGTENSGYFRGSYSNSPSNPVNSRANQ--DFSALMRSSYHCAMNNENARLLTFQT
        ...     .  .:  .  .        :..:  :.:  .    . :: .:.::: .::.
CCDS14 QYKVENYLGSRDHFALDRPSETHADYLLRTGQVVDISDTIYPR-NPAMYSEEARLKSFQN
           120       130       140       150        160       170  

      180        190       200       210       220       230       
pF1KB6 WP-LTFLSPTDLAKAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDNAMSEHLRHFPKCPFI--
       ::  . :.: .::.::.:: : ::.: :: :::::.:::: : : ::: ::::.: :.  
CCDS14 WPDYAHLTPRELASAGLYYTGIGDQVQCFCCGGKLKNWEPCDRAWSEHRRHFPNCFFVLG
            180       190       200       210       220       230  

                240         250           260       270       280  
pF1KB6 -------ENQLQDTSRY--TVSNL----SMQTHAARFKTFFNWPSSVLVNPEQLASAGFY
              :..  ...:   . .::    ::  . ::. :: .:  ::  : :::: ::::
CCDS14 RNLNIRSESDAVSSDRNFPNSTNLPRNPSMADYEARIFTFGTWIYSV--NKEQLARAGFY
            240       250       260       270         280       290

            290       300       310       320       330       340  
pF1KB6 YVGNSDDVKCFCCDGGLRCWESGDDPWVQHAKWFPRCEYLIRIKGQEFIRQVQASYPHLL
        .:..: :::: : :::  :. ..::: :::::.: :.::.. ::::.: ... .  : :
CCDS14 ALGEGDKVKCFHCGGGLTDWKPSEDPWEQHAKWYPGCKYLLEQKGQEYINNIHLT--HSL
              300       310       320       330       340          

            350       360       370       380       390       400  
pF1KB6 EQLLSTSDSPGDENAESSIIHFEPGEDHSEDAIMMNTPVINAAVEMGFSRSLVKQTVQRK
       :. :  .       .:..     :.  .  :  ....:... :..:::: . .:. ...:
CCDS14 EECLVRT-------TEKT-----PSLTRRIDDTIFQNPMVQEAIRMGFSFKDIKKIMEEK
      350                   360       370       380       390      

            410       420       430       440       450       460  
pF1KB6 ILATGENYRLVNDLVLDLLNAEDEIREEERERATEEKESNDLLLIRKNRMALFQHLTCVI
       :  .: ::. .. :: ::.::. .  ..:                               
CCDS14 IQISGSNYKSLEVLVADLVNAQKDSMQDE-------------------------------
        400       410       420                                    

            470       480       490       500       510       520  
pF1KB6 PILDSLLTAGIINEQEHDVIKQKTQTSLQARELIDTILVKGNIAATVFRNSLQEAEAVLY
                             ..:::::                               
CCDS14 ----------------------SSQTSLQ-------------------------------
                               430                                 

            530       540       550       560       570       580  
pF1KB6 EHLFVQQDIKYIPTEDVSDLPVEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSIVFIPCGHLVVCKDCA
                : : ::        :::::::::. ::.:::....:::.::::::.::.::
CCDS14 ---------KEISTE--------EQLRRLQEEKLCKICMDRNIAIVFVPCGHLVTCKQCA
                             440       450       460       470     

            590       600    
pF1KB6 PSLRKCPICRSTIKGTVRTFLS
        .. :::.: ..:    . :.:
CCDS14 EAVDKCPMCYTVITFKQKIFMS
         480       490       

>>CCDS12863.1 BIRC8 gene_id:112401|Hs109|chr19            (236 aa)
 initn: 687 init1: 295 opt: 320  Z-score: 340.0  bits: 71.6 E(33420): 1.3e-12
Smith-Waterman score: 497; 31.4% identity (50.4% similar) in 353 aa overlap (252-604:1-236)

             230       240       250       260       270       280 
pF1KB6 MSEHLRHFPKCPFIENQLQDTSRYTVSNLSMQTHAARFKTFFNWPSSVLVNPEQLASAGF
                                     :  . ::. :: .:  ::  : :::: :::
CCDS12                               MTGYEARLITFGTWMYSV--NKEQLARAGF
                                             10          20        

             290       300       310       320       330       340 
pF1KB6 YYVGNSDDVKCFCCDGGLRCWESGDDPWVQHAKWFPRCEYLIRIKGQEFIRQVQASYPHL
       : .:. : :.:: : :::  :.  .::: :::::.: :.::.. ::.:.: ..     ::
CCDS12 YAIGQEDKVQCFHCGGGLANWKPKEDPWEQHAKWYPGCKYLLEEKGHEYINNI-----HL
       30        40        50        60        70        80        

             350       360       370       380       390       400 
pF1KB6 LEQLLSTSDSPGDENAESSIIHFEPGEDHSEDAIMMNTPVINAAVEMGFSRSLVKQTVQR
        ..:         :.:  .  .  :.  .  .  .. .:... :..:::. . ::. ...
CCDS12 TRSL---------EGALVQTTKKTPSLTKRISDTIFPNPMLQEAIRMGFDFKDVKKIMEE
                     90       100       110       120       130    

             410       420       430       440       450       460 
pF1KB6 KILATGENYRLVNDLVLDLLNAEDEIREEERERATEEKESNDLLLIRKNRMALFQHLTCV
       .: ..: ::. .. :: ::..:. .         : :.: :                   
CCDS12 RIQTSGSNYKTLEVLVADLVSAQKD---------TTENELN-------------------
          140       150                160                         

             470       480       490       500       510       520 
pF1KB6 IPILDSLLTAGIINEQEHDVIKQKTQTSLQARELIDTILVKGNIAATVFRNSLQEAEAVL
                                ::::: ::.                          
CCDS12 -------------------------QTSLQ-REIS-------------------------
                                 170                               

             530       540       550       560       570       580 
pF1KB6 YEHLFVQQDIKYIPTEDVSDLPVEEQLRRLQEERTCKVCMDKEVSIVFIPCGHLVVCKDC
                    :         :: :::::::. ::.:::.....:::::::::.::.:
CCDS12 -------------P---------EEPLRRLQEEKLCKICMDRHIAVVFIPCGHLVTCKQC
                               180       190       200       210   

             590       600    
pF1KB6 APSLRKCPICRSTIKGTVRTFLS
       : .. .::.: ..:    :.:.:
CCDS12 AEAVDRCPMCSAVIDFKQRVFMS
           220       230      

>>CCDS4009.1 NAIP gene_id:4671|Hs109|chr5                 (1403 aa)
 initn: 739 init1: 262 opt: 321  Z-score: 330.4  bits: 72.4 E(33420): 4.5e-12
Smith-Waterman score: 514; 30.1% identity (51.5% similar) in 369 aa overlap (26-361:57-380)

                    10        20        30        40        50     
pF1KB6      MNIVENSIFLSNLMKSANTFELKYDLSCELYRMSTYSTFPAGVPVSERSLARAGF
                                     .  :  :..:. :.        . .: :::
CCDS40 LGLDAVQLAKELEEEEQKERAKMQKGYNSQMRSEAKRLKTFVTYEPYSSWIPQEMAAAGF
         30        40        50        60        70        80      

          60        70        80        90       100       110     
pF1KB6 YYTGVNDKVKCFCCGLMLDNWKRGDSPTEKHKKLYPSCRFVQSLNSVNNLEATSQPTFPS
       :.:::.. ..::::.:.: .      : : ::...:.: :. . ..:.:.       .  
CCDS40 YFTGVKSGIQCFCCSLILFGAGLTRLPIEDHKRFHPDCGFLLN-KDVGNIAK-----YDI
         90       100       110       120        130            140

         120       130       140       150       160       170     
pF1KB6 SVTNSTHSLLPGTENSGYFRGSYSNSPSNPVNSRANQDFSALMRSSYHCAMNNENARLLT
        : :    :          ::.                    ::      ...:.::: .
CCDS40 RVKNLKSRL----------RGGK-------------------MR------YQEEEARLAS
                        150                                160     

         180         190       200       210       220       230   
pF1KB6 FQTWPLTF--LSPTDLAKAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDNAMSEHLRHFPKCP
       :..::.    .::  :..::: . :  : : ::.::: :.:::  :.  .:: . :::: 
CCDS40 FRNWPFYVQGISPCVLSEAGFVFTGKQDTVQCFSCGGCLGNWEEGDDPWKEHAKWFPKCE
         170       180       190       200       210       220     

             240                          250                 260  
pF1KB6 FIENQL--QDTSRYTVS-------------------NLSMQT----------HAARFKTF
       :....   .. ..:  :                   .: : .          .  :. .:
CCDS40 FLRSKKSSEEITQYIQSYKGFVDITGEHFVNSWVQRELPMASAYCNDSIFAYEELRLDSF
         230       240       250       260       270       280     

            270       280       290       300       310       320  
pF1KB6 FNWPSSVLVNPEQLASAGFYYVGNSDDVKCFCCDGGLRCWESGDDPWVQHAKWFPRCEYL
        .::    :.   ::.::..:.: .: :.:: : : :. :. ::::  .:.. :: : .:
CCDS40 KDWPRESAVGVAALAKAGLFYTGIKDIVQCFSCGGCLEKWQEGDDPLDDHTRCFPNCPFL
         290       300       310       320       330       340     

            330       340       350       360       370       380  
pF1KB6 IRIKGQEFIRQVQASYPHLLEQLLSTSDSPGDENAESSIIHFEPGEDHSEDAIMMNTPVI
         .:..  .     :  .: : : .::.:    : :.::                     
CCDS40 QNMKSSAEVTPDLQSRGELCELLETTSES----NLEDSIAVGPIVPEMAQGEAQWFQEAK
         350       360       370           380       390       400 

            390       400       410       420       430       440  
pF1KB6 NAAVEMGFSRSLVKQTVQRKILATGENYRLVNDLVLDLLNAEDEIREEERERATEEKESN
                                                                   
CCDS40 NLNEQLRAAYTSASFRHMSLLDISSDLATDHLLGCDLSIASKHISKPVQEPLVLPEVFGN
             410       420       430       440       450       460 




604 residues in 1 query   sequences
18921897 residues in 33420 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Oct 24 21:45:03 2019 done: Thu Oct 24 21:45:04 2019
 Total Scan time:  1.670 Total Display time:  0.080

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com