Result of SIM4 for pF1KE2524

seq1 = pF1KE2524.tfa, 1371 bp
seq2 = pF1KE2524/gi568815587r_67953991.tfa (gi568815587r:67953991_68221177), 267187 bp

>pF1KE2524 1371
>gi568815587r:67953991_68221177 (Chr11)

(complement)

1-350  (100001-100350)   100% ->
351-462  (124048-124159)   100% ->
463-516  (139721-139774)   100% ->
517-630  (146348-146461)   100% ->
631-764  (150321-150454)   100% ->
765-869  (150885-150989)   100% ->
870-928  (152241-152299)   100% ->
929-1016  (154662-154749)   100% ->
1017-1125  (155284-155392)   100% ->
1126-1232  (156547-156653)   100% ->
1233-1314  (159144-159225)   100% ->
1315-1371  (167131-167187)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAAACCAAATTCTGCACCGGGGGCGAGGCGGAGCCCTCGCCGCTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAAACCAAATTCTGCACCGGGGGCGAGGCGGAGCCCTCGCCGCTCGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGCTGCTGAGCTGCGGTAGCGGCAGCGCGGCCCCGGCGCCCGGCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGCTGCTGAGCTGCGGTAGCGGCAGCGCGGCCCCGGCGCCCGGCGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGCAGCAGCGCGACGCCGCCAGCGACCTCGAGTCCAAGCAGCTGGGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGCAGCAGCGCGACGCCGCCAGCGACCTCGAGTCCAAGCAGCTGGGCGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAACAGCCGCCGCTCGCGCTGCCCCCTCCGCCGCCGCTGCCGCTGCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAACAGCCGCCGCTCGCGCTGCCCCCTCCGCCGCCGCTGCCGCTGCCGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCCGCTGCCCCAGCCCCCGCCGCCGCAGCCGCCCGCAGACGAGCAGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCCGCTGCCCCAGCCCCCGCCGCCGCAGCCGCCCGCAGACGAGCAGCCGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGCCCCGGACGCGGCGCAGGGCCTATCTGTGGTGCAAGGAGTTCCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGCCCCGGACGCGGCGCAGGGCCTATCTGTGGTGCAAGGAGTTCCTGCCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGCGCCTGGCGGGGCCTCCGCGAGGACGAGTTCCACATCAGTGTCATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGCGCCTGGCGGGGCCTCCGCGAGGACGAGTTCCACATCAGTGTCATCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351          AGGCGGCCTTAGCAACATGCTGTTCCAGTGCTCCCTACCTG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GTC...CAGAGGCGGCCTTAGCAACATGCTGTTCCAGTGCTCCCTACCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ACACCACAGCCACCCTTGGTGATGAGCCTCGGAAAGTGCTCCTGCGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124089 ACACCACAGCCACCCTTGGTGATGAGCCTCGGAAAGTGCTCCTGCGGCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TATGGAGCGATTTTGCAGATG         AGGTCCTGTAATAAAGAGGG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 124139 TATGGAGCGATTTTGCAGATGGTG...TAGAGGTCCTGTAATAAAGAGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 ATCCGAACAAGCTCAGAAAGAAAATGAATTTCAA         GGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 139741 ATCCGAACAAGCTCAGAAAGAAAATGAATTTCAAGTA...TAGGGGGCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGGCCATGGTTCTGGAGAGCGTTATGTTTGCCATTCTCGCAGAGAGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146355 AGGCCATGGTTCTGGAGAGCGTTATGTTTGCCATTCTCGCAGAGAGGTCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CTTGGGCCAAAACTCTATGGCATCTTTCCCCAAGGCCGACTGGAGCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146405 CTTGGGCCAAAACTCTATGGCATCTTTCCCCAAGGCCGACTGGAGCAGTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CATCCCG         AGCCGGCGATTAGATACTGAAGAATTAAGTTTGC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146455 CATCCCGGTA...CAGAGCCGGCGATTAGATACTGAAGAATTAAGTTTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CAGATATTTCTGCAGAAATCGCCGAGAAAATGGCTACATTTCATGGTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150355 CAGATATTTCTGCAGAAATCGCCGAGAAAATGGCTACATTTCATGGTATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 AAAATGCCATTCAATAAGGAACCAAAATGGCTTTTTGGCACAATGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150405 AAAATGCCATTCAATAAGGAACCAAAATGGCTTTTTGGCACAATGGAAAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765          GTATCTAAAGGAAGTGCTGAGAATTAAATTTACTGAGGAAT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150455 GTA...TAGGTATCTAAAGGAAGTGCTGAGAATTAAATTTACTGAGGAAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CCAGAATTAAAAAGCTCCACAAATTGCTCAGTTACAATCTGCCCTTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150926 CCAGAATTAAAAAGCTCCACAAATTGCTCAGTTACAATCTGCCCTTGGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CTGGAAAACCTGAG         ATCATTGCTTGAATCTACTCCATCTCC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 150976 CTGGAAAACCTGAGGTG...CAGATCATTGCTTGAATCTACTCCATCTCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 AGTTGTATTTTGTCATAATGACTGTCAAGAAG         GTAATATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 152268 AGTTGTATTTTGTCATAATGACTGTCAAGAAGGTA...CAGGTAATATCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TGTTGCTGGAAGGCCGAGAGAATTCTGAAAAACAGAAACTGATGCTCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154671 TGTTGCTGGAAGGCCGAGAGAATTCTGAAAAACAGAAACTGATGCTCATT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GATTTCGAATACAGCAGTTACAATTACAG         GGGATTCGACAT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 154721 GATTTCGAATACAGCAGTTACAATTACAGGTA...CAGGGGATTCGACAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 TGGAAATCACTTCTGTGAGTGGATGTATGATTATAGCTATGAAAAATACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155296 TGGAAATCACTTCTGTGAGTGGATGTATGATTATAGCTATGAAAAATACC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 CTTTTTTCAGAGCAAACATCCGGAAGTATCCCACCAAGAAACAACAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 155346 CTTTTTTCAGAGCAAACATCCGGAAGTATCCCACCAAGAAACAACAGGTA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1126       CTCCATTTTATTTCCAGTTACTTGCCTGCATTCCAAAATGACTT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155396 ...AAGCTCCATTTTATTTCCAGTTACTTGCCTGCATTCCAAAATGACTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 TGAAAACCTCAGTACTGAAGAAAAATCCATTATAAAAGAAGAAATGTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156591 TGAAAACCTCAGTACTGAAGAAAAATCCATTATAAAAGAAGAAATGTTGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 TTGAAGTTAATAG         GTTTGCCCTTGCATCTCATTTCCTCTGG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 156641 TTGAAGTTAATAGGTA...CAGGTTTGCCCTTGCATCTCATTTCCTCTGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 GGACTGTGGTCCATTGTACAAGCCAAGATTTCATCTATTGAATTTGGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159172 GGACTGTGGTCCATTGTACAAGCCAAGATTTCATCTATTGAATTTGGGTA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 CATG         GACTACGCCCAAGCAAGGTTTGATGCCTATTTCCACC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159222 CATGGTA...TAGGACTACGCCCAAGCAAGGTTTGATGCCTATTTCCACC

   1450     .    :    .    :
   1352 AGAAGAGGAAGCTTGGGGTG
        ||||||||||||||||||||
 167168 AGAAGAGGAAGCTTGGGGTG

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