seq1 = pF1KE4182.tfa, 2181 bp
seq2 = pF1KE4182/gi568815588r_45516439.tfa (gi568815588r:45516439_45763725), 247287 bp

>pF1KE4182 2181
>gi568815588r:45516439_45763725 (Chr10)

(complement)

1-184  (100001-100184)   100% ->
185-260  (110667-110742)   100% ->
261-328  (111693-111760)   100% ->
329-569  (115192-115432)   100% ->
570-717  (123763-123910)   100% ->
718-1872  (136621-137775)   100% ->
1873-1927  (139089-139143)   100% ->
1928-2048  (145466-145586)   100% ->
2049-2181  (147155-147287)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATAACAGAAAAGAGCCTCCATTCTTCAATGATGATAACATGGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATAACAGAAAAGAGCCTCCATTCTTCAATGATGATAACATGGGACC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATTTTACTACAGACTTCATTTCTGTGATACCATGGAGCTCTTCATTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ATTTTACTACAGACTTCATTTCTGTGATACCATGGAGCTCTTCATTGAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CATTAACTGGAACATGTTTTGAGCTGAGAGTTTCACCTTTTGAAACTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CATTAACTGGAACATGTTTTGAGCTGAGAGTTTCACCTTTTGAAACTGTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATTTCTGTGAAAGCAAAAATTCGAAGATTGGAAG         GTATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100151 ATTTCTGTGAAAGCAAAAATTCGAAGATTGGAAGGTA...AAGGTATTCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CATCTGTCGACAACACTTAATTTGGAATAACATGGAACTTGAAAATGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110674 CATCTGTCGACAACACTTAATTTGGAATAACATGGAACTTGAAAATGATT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATTGCTTGAATGATTACAA         CATTTCAGAAGGGTGTACCTTG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 110724 ATTGCTTGAATGATTACAAGTG...CAGCATTTCAGAAGGGTGTACCTTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAGCTAGTTTTGGCTATGCGTGGCGGACCTATAAATACTAGAAGAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 111715 AAGCTAGTTTTGGCTATGCGTGGCGGACCTATAAATACTAGAAGAGGTA.

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    329      TTCCTACAGACGATCCACTTAGGAAGATGGCAGAGTACTTGGATT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111765 ..TAGTTCCTACAGACGATCCACTTAGGAAGATGGCAGAGTACTTGGATT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCAGTCGAGTTGAGGTCTGGGAGAAGACCTCCTGCAGCAAACAAGTTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115237 CCAGTCGAGTTGAGGTCTGGGAGAAGACCTCCTGCAGCAAACAAGTTACA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TTTTTGGTATACCAAGAAGGAGATCAATTGAATTTCTTTCCTGCAGTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115287 TTTTTGGTATACCAAGAAGGAGATCAATTGAATTTCTTTCCTGCAGTAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TAGGGGAGATGGCACTTTAACACCGTTATCTGACTCTTCAAAGAAAATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115337 TAGGGGAGATGGCACTTTAACACCGTTATCTGACTCTTCAAAGAAAATAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ATTTTCATTTGCATGTCCTACGGAGAAAAGGAGAACATCGTATGAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 115387 ATTTTCATTTGCATGTCCTACGGAGAAAAGGAGAACATCGTATGAGGTA.

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    570      TGGTGGTTCTATGTATAATTCAGATACAGATGAGGATGAAGAAAC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115437 ..CAGTGGTGGTTCTATGTATAATTCAGATACAGATGAGGATGAAGAAAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGAGCCTTCTTCTTCTGGGCAACAGATAATTGAAAATTCAATAACTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123808 TGAGCCTTCTTCTTCTGGGCAACAGATAATTGAAAATTCAATAACTATGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ATAAGATGAAGCTGCTGAAGGCTAAGATGAAGAACATGAATCTCAGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123858 ATAAGATGAAGCTGCTGAAGGCTAAGATGAAGAACATGAATCTCAGCAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 AAG         CCTAAGAAAGCTGTCAAGATAAAACCTCACCCACCTGT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123908 AAGGTG...TAGCCTAAGAAAGCTGTCAAGATAAAACCTCACCCACCTGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 AGCTCCTCGACCTTCTAGTGGTTCCACTGCACCATCTCGCCACCGATTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136659 AGCTCCTCGACCTTCTAGTGGTTCCACTGCACCATCTCGCCACCGATTGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TAAGGGTCCTCCCCAACATTGGTCAATCTTGTTCACCTGCTTTTGGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136709 TAAGGGTCCTCCCCAACATTGGTCAATCTTGTTCACCTGCTTTTGGGAAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GCATATCCGCCCGAAATCTCCAGGAATGGAATTTCAAGTTTGGCAACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136759 GCATATCCGCCCGAAATCTCCAGGAATGGAATTTCAAGTTTGGCAACTCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 ACTCTCTGCTGAGAGATACATATCTTCTATCACTGGTGAATTTCTTAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136809 ACTCTCTGCTGAGAGATACATATCTTCTATCACTGGTGAATTTCTTAAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 AAGATAATAGCTGGGAGAATAACACACTGTCTCACTTCAGTAGCAACGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136859 AAGATAATAGCTGGGAGAATAACACACTGTCTCACTTCAGTAGCAACGTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 AAACTACCTCCTCAGATACCCCATTTGGAGTTGGGAAATGACCAGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136909 AAACTACCTCCTCAGATACCCCATTTGGAGTTGGGAAATGACCAGGAGCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 TGCTGACTCTGTTCTCCATCTTGGATCATCCCTGCCTAGGCAAACAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136959 TGCTGACTCTGTTCTCCATCTTGGATCATCCCTGCCTAGGCAAACAAAAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 ATTTTTTAGGAAACTTGCCATCTAGTAATGGGAACATTGTCTTACCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137009 ATTTTTTAGGAAACTTGCCATCTAGTAATGGGAACATTGTCTTACCTTCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 GAAGAATGTGTAACCGAACAATCACTTCTACCTAAAGTGGGCTCACTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137059 GAAGAATGTGTAACCGAACAATCACTTCTACCTAAAGTGGGCTCACTGGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 TTCATTTGCAGAAGGAAATGCTGATGAACAGAGCAGCGGCTTAGAAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137109 TTCATTTGCAGAAGGAAATGCTGATGAACAGAGCAGCGGCTTAGAAGGTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 CGTGCAAAGTGAATCTGGAGTTGCTACTCACTAATGCTGACAAAGGGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137159 CGTGCAAAGTGAATCTGGAGTTGCTACTCACTAATGCTGACAAAGGGTTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 AAAGCTCCAGAGCAGCATCTCAAGCATGTTGCAGGAGTGCTGAATGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137209 AAAGCTCCAGAGCAGCATCTCAAGCATGTTGCAGGAGTGCTGAATGGGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 ATCAGTAGAGACTTCAGTTCTTAACTACCGGGAATTAAGTCCTCACAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137259 ATCAGTAGAGACTTCAGTTCTTAACTACCGGGAATTAAGTCCTCACAAGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 ATAGACTCTTGTCACCTCTTCGCTGTTCTGCACCAATGTCGCTACATAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137309 ATAGACTCTTGTCACCTCTTCGCTGTTCTGCACCAATGTCGCTACATAAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 TCTCTGGTGAAACCAGAGAGACAGTCCAAATGTTTTGAGTTTGGGAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137359 TCTCTGGTGAAACCAGAGAGACAGTCCAAATGTTTTGAGTTTGGGAAGCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 ACAGCCTTCTTCTTCTCAGTCACTGGATGTTCAAAACATAACTGATTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137409 ACAGCCTTCTTCTTCTCAGTCACTGGATGTTCAAAACATAACTGATTCTT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1556 CTTTCTCTAGGACTACTTGCTTTCAAGGTGTTAAAGTTGATTCACTTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137459 CTTTCTCTAGGACTACTTGCTTTCAAGGTGTTAAAGTTGATTCACTTGGG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1606 AAAAGATCTGATGTTATTTCCAAAGTTGAGGCTCGGGATATCACAGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137509 AAAAGATCTGATGTTATTTCCAAAGTTGAGGCTCGGGATATCACAGAAAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1656 GACTAACAAGGCTTCCAAAGAGCCTGTTGGTTGTGTAAATAATATCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137559 GACTAACAAGGCTTCCAAAGAGCCTGTTGGTTGTGTAAATAATATCAGTT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1706 TTCTTGCCTCACTGGCCGGGAGCACAAGCAGAAATAGATTACAGAGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137609 TTCTTGCCTCACTGGCCGGGAGCACAAGCAGAAATAGATTACAGAGCACA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1756 CGTGGGGCAGGCAGGCTTCAGAACTCTGGAACTGGGCTGTCTACAAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137659 CGTGGGGCAGGCAGGCTTCAGAACTCTGGAACTGGGCTGTCTACAAACCT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1806 CCAGCATTTTCAGGAAGAAAACTTTAGGAAAAGTTCTCCCCAGTTAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137709 CCAGCATTTTCAGGAAGAAAACTTTAGGAAAAGTTCTCCCCAGTTAGAAC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1856 ATACAGGAGTTTTTTTG         TCTACCCATGGTGTTGGAATGAAT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 137759 ATACAGGAGTTTTTTTGGTC...TAGTCTACCCATGGTGTTGGAATGAAT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1897 GGAAATAATGCAGCAGCAGGGAAAAGCGTAG         GAGAATGTAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 139113 GGAAATAATGCAGCAGCAGGGAAAAGCGTAGGTA...CAGGAGAATGTAC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1938 TACTCATCACCTCCCACCTGTGAAAGCCCCTCTTCAGACAAAGAAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145476 TACTCATCACCTCCCACCTGTGAAAGCCCCTCTTCAGACAAAGAAGAAAA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1988 CAACAAATCATTGTTTTCTTTGTGGAAAGAAAACAGGACTGGCTAGTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145526 CAACAAATCATTGTTTTCTTTGTGGAAAGAAAACAGGACTGGCTAGTAGC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2038 TACGAATGCAG         ATGTGGAAACAACTTCTGTGCATCTCATCG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 145576 TACGAATGCAGGCA...TAGATGTGGAAACAACTTCTGTGCATCTCATCG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2079 TTATGCAGAAACTCATGGCTGTACCTATGATTACAAGAGTGCAGGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147185 TTATGCAGAAACTCATGGCTGTACCTATGATTACAAGAGTGCAGGGAGGA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2129 GATACTTGCACGAGGCAAATCCTGTGGTTAATGCACCAAAGCTTCCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147235 GATACTTGCACGAGGCAAATCCTGTGGTTAATGCACCAAAGCTTCCAAAA

   2250 
   2179 ATC
        |||
 147285 ATC