Result of SIM4 for pF1KE6502

seq1 = pF1KE6502.tfa, 621 bp
seq2 = pF1KE6502/gi568815590r_95147620.tfa (gi568815590r:95147620_95369189), 221570 bp

>pF1KE6502 621
>gi568815590r:95147620_95369189 (Chr8)

(complement)

1-155  (100001-100155)   100% ->
156-243  (105416-105503)   100% ->
244-308  (108658-108722)   100% ->
309-374  (109285-109350)   98% ->
375-470  (116907-117002)   100% ->
471-621  (121420-121570)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGAGGACCTGGACGAGCTCTTGGATGAAGTCGAGTCCAAGTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGAGGACCTGGACGAGCTCTTGGATGAAGTCGAGTCCAAGTTTTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACACCTGACCTTCTAAGACGGGGTATGGTCGAGCAGCCCAAAGGCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACACCTGACCTTCTAAGACGGGGTATGGTCGAGCAGCCCAAAGGCTGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGGCGGCACCCACAGTAGCGACCGGAACCAAGCCAAGGCGAAAGAGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCGGCGGCACCCACAGTAGCGACCGGAACCAAGCCAAGGCGAAAGAGACG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTCAG         ATCAACAGAAACATTTAAAAAAGAAGATGATCTTGA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTCAGGTT...CAGATCAACAGAAACATTTAAAAAAGAAGATGATCTTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAGTCTTATTAATGAAATACTTGAAGAGCCCAACTTGGACAAAAAACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105452 CAGTCTTATTAATGAAATACTTGAAGAGCCCAACTTGGACAAAAAACCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CT         AAATTAAAATCTAAATCTTCAGGTAACACATCTGTCAGA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105502 CTGTA...CAGAAATTAAAATCTAAATCTTCAGGTAACACATCTGTCAGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCTTCCATTGAAGGCCTTGGTAAAAG         TTGCAGTCCGGTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 108697 GCTTCCATTGAAGGCCTTGGTAAAAGGTA...TAGTTGCAGTCCGGTGTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CCTTGGTGGGAGCTCTATTCCATGTGGGATTGGAACAAATATTTCATGGA
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109300 CCTTGGTGGAAGCTCTATTCCATGTGGGATTGGAACAAATATTTCATGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 G         AGCATGTGACCATCTGCGTTGTATAGCCTGTGATTTCTTG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109350 GGTA...CAGAGCATGTGACCATCTGCGTTGTATAGCCTGTGATTTCTTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GTAGTCAGCTATGATGACTATATGTGGGACAAATCGTGTGATTATCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116947 GTAGTCAGCTATGATGACTATATGTGGGACAAATCGTGTGATTATCTGTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TTTCAG         GAACAACATGCCAGAATTTCACAAATTAAAAGCAA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116997 TTTCAGGTA...TAGGAACAACATGCCAGAATTTCACAAATTAAAAGCAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 AGTTGATAAAGAAGAAAGGAACACGGGCATATGCCTGCCAGTGTAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121455 AGTTGATAAAGAAGAAAGGAACACGGGCATATGCCTGCCAGTGTAGCTGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AGAACTATTGAAGAAGTGACTGACCTTCAGACAGATCATCAGCTTCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121505 AGAACTATTGAAGAAGTGACTGACCTTCAGACAGATCATCAGCTTCGCTG

    650     .    :    .
    606 GGTTTGTGGTAAACAT
        ||||||||||||||||
 121555 GGTTTGTGGTAAACAT

Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com