Result of SIM4 for pF1KE2379

seq1 = pF1KE2379.tfa, 3477 bp
seq2 = pF1KE2379/gi568815591r_150845368.tfa (gi568815591r:150845368_151077913), 232546 bp

>pF1KE2379 3477
>gi568815591r:150845368_151077913 (Chr7)

(complement)

1-76  (100001-100076)   100% ->
77-307  (102973-103203)   100% ->
308-472  (118178-118342)   100% ->
473-916  (119412-119855)   100% ->
917-1128  (120412-120623)   100% ->
1129-1557  (125061-125489)   100% ->
1558-1945  (126079-126466)   100% ->
1946-2145  (126794-126993)   100% ->
2146-2398  (127494-127746)   100% ->
2399-2592  (128865-129058)   100% ->
2593-2692  (129371-129470)   100% ->
2693-2965  (130036-130308)   100% ->
2966-3152  (130400-130586)   100% ->
3153-3330  (130860-131037)   100% ->
3331-3477  (132400-132546)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGGTGCGGAGGGGCCACGTCGCGCCGCAGAACACCTTCCTGGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCGGTGCGGAGGGGCCACGTCGCGCCGCAGAACACCTTCCTGGACAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATCATCCGCAAGTTTGAGGGCCAGA         GCCGTAAGTTCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100051 CATCATCCGCAAGTTTGAGGGCCAGAGTG...TAGGCCGTAAGTTCATCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCGCCAACGCTCGGGTGGAGAACTGCGCCGTCATCTACTGCAACGACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102988 TCGCCAACGCTCGGGTGGAGAACTGCGCCGTCATCTACTGCAACGACGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTCTGCGAGCTGTGCGGCTACTCGCGGGCCGAGGTGATGCAGCGACCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103038 TTCTGCGAGCTGTGCGGCTACTCGCGGGCCGAGGTGATGCAGCGACCCTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CACCTGCGACTTCCTGCACGGGCCGCGCACGCAGCGCCGCGCTGCCGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103088 CACCTGCGACTTCCTGCACGGGCCGCGCACGCAGCGCCGCGCTGCCGCGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGATCGCGCAGGCACTGCTGGGCGCCGAGGAGCGCAAAGTGGAAATCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103138 AGATCGCGCAGGCACTGCTGGGCGCCGAGGAGCGCAAAGTGGAAATCGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTCTACCGGAAAGATG         GGAGCTGCTTCCTATGTCTGGTGGA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 103188 TTCTACCGGAAAGATGGTA...CAGGGAGCTGCTTCCTATGTCTGGTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGTGGTGCCCGTGAAGAACGAGGATGGGGCTGTCATCATGTTCATCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118203 TGTGGTGCCCGTGAAGAACGAGGATGGGGCTGTCATCATGTTCATCCTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATTTCGAGGTGGTGATGGAGAAGGACATGGTGGGGTCCCCGGCTCATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118253 ATTTCGAGGTGGTGATGGAGAAGGACATGGTGGGGTCCCCGGCTCATGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ACCAACCACCGGGGCCCCCCCACCAGCTGGCTGGCCCCAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 118303 ACCAACCACCGGGGCCCCCCCACCAGCTGGCTGGCCCCAGGTA...CAGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CCGCGCCAAGACCTTCCGCCTGAAGCTGCCCGCGCTGCTGGCGCTGACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119413 CCGCGCCAAGACCTTCCGCCTGAAGCTGCCCGCGCTGCTGGCGCTGACGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CCCGGGAGTCGTCGGTGCGGTCGGGCGGCGCGGGCGGCGCGGGCGCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119463 CCCGGGAGTCGTCGGTGCGGTCGGGCGGCGCGGGCGGCGCGGGCGCCCCG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GGGGCCGTGGTGGTGGACGTGGACCTGACGCCCGCGGCACCCAGCAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119513 GGGGCCGTGGTGGTGGACGTGGACCTGACGCCCGCGGCACCCAGCAGCGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GTCGCTGGCCCTGGACGAAGTGACAGCCATGGACAACCACGTGGCAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119563 GTCGCTGGCCCTGGACGAAGTGACAGCCATGGACAACCACGTGGCAGGGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TCGGGCCCGCGGAGGAGCGGCGTGCGCTGGTGGGTCCCGGCTCTCCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119613 TCGGGCCCGCGGAGGAGCGGCGTGCGCTGGTGGGTCCCGGCTCTCCGCCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CGCAGCGCGCCCGGCCAGCTCCCATCGCCCCGGGCGCACAGCCTCAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119663 CGCAGCGCGCCCGGCCAGCTCCCATCGCCCCGGGCGCACAGCCTCAACCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CGACGCCTCGGGCTCCAGCTGCAGCCTGGCCCGGACGCGCTCCCGAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119713 CGACGCCTCGGGCTCCAGCTGCAGCCTGGCCCGGACGCGCTCCCGAGAAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 GCTGCGCCAGCGTGCGCCGCGCCTCGTCGGCCGACGACATCGAGGCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119763 GCTGCGCCAGCGTGCGCCGCGCCTCGTCGGCCGACGACATCGAGGCCATG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 CGCGCCGGGGTGCTGCCCCCGCCACCGCGCCACGCCAGCACCG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 119813 CGCGCCGGGGTGCTGCCCCCGCCACCGCGCCACGCCAGCACCGGTG...T

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    917   GGGCCATGCACCCACTGCGCAGCGGCTTGCTCAACTCCACCTCGGACT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120410 AGGGGCCATGCACCCACTGCGCAGCGGCTTGCTCAACTCCACCTCGGACT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 CCGACCTCGTGCGCTACCGCACCATTAGCAAGATTCCCCAAATCACCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120460 CCGACCTCGTGCGCTACCGCACCATTAGCAAGATTCCCCAAATCACCCTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 AACTTTGTGGACCTCAAGGGCGACCCCTTCTTGGCTTCGCCCACCAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120510 AACTTTGTGGACCTCAAGGGCGACCCCTTCTTGGCTTCGCCCACCAGTGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 CCGTGAGATCATAGCACCTAAGATAAAGGAGCGAACCCACAATGTCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120560 CCGTGAGATCATAGCACCTAAGATAAAGGAGCGAACCCACAATGTCACTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 AGAAGGTCACCCAG         GTCCTGTCCCTGGGCGCCGACGTGCTG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 120610 AGAAGGTCACCCAGGTA...CAGGTCCTGTCCCTGGGCGCCGACGTGCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 CCTGAGTACAAGCTGCAGGCACCGCGCATCCACCGCTGGACCATCCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125088 CCTGAGTACAAGCTGCAGGCACCGCGCATCCACCGCTGGACCATCCTGCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 TTACAGCCCCTTCAAGGCCGTGTGGGACTGGCTCATCCTGCTGCTGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125138 TTACAGCCCCTTCAAGGCCGTGTGGGACTGGCTCATCCTGCTGCTGGTCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 TCTACACGGCTGTCTTCACACCCTACTCGGCTGCCTTCCTGCTGAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125188 TCTACACGGCTGTCTTCACACCCTACTCGGCTGCCTTCCTGCTGAAGGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 ACGGAAGAAGGCCCGCCTGCTACCGAGTGTGGCTACGCCTGCCAGCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125238 ACGGAAGAAGGCCCGCCTGCTACCGAGTGTGGCTACGCCTGCCAGCCGCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 GGCTGTGGTGGACCTCATCGTGGACATCATGTTCATTGTGGACATCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125288 GGCTGTGGTGGACCTCATCGTGGACATCATGTTCATTGTGGACATCCTCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 TCAACTTCCGCACCACCTACGTCAATGCCAACGAGGAGGTGGTCAGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125338 TCAACTTCCGCACCACCTACGTCAATGCCAACGAGGAGGTGGTCAGCCAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 CCCGGCCGCATCGCCGTCCACTACTTCAAGGGCTGGTTCCTCATCGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125388 CCCGGCCGCATCGCCGTCCACTACTTCAAGGGCTGGTTCCTCATCGACAT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 GGTGGCCGCCATCCCCTTCGACCTGCTCATCTTCGGCTCTGGCTCTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125438 GGTGGCCGCCATCCCCTTCGACCTGCTCATCTTCGGCTCTGGCTCTGAGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1556 AG         CTGATCGGGCTGCTGAAGACTGCGCGGCTGCTGCGGCTG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125488 AGGTG...CAGCTGATCGGGCTGCTGAAGACTGCGCGGCTGCTGCGGCTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1597 GTGCGCGTGGCGCGGAAGCTGGATCGCTACTCAGAGTACGGCGCGGCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126118 GTGCGCGTGGCGCGGAAGCTGGATCGCTACTCAGAGTACGGCGCGGCCGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1647 GCTGTTCTTGCTCATGTGCACCTTTGCGCTCATCGCGCACTGGCTAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126168 GCTGTTCTTGCTCATGTGCACCTTTGCGCTCATCGCGCACTGGCTAGCCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1697 GCATCTGGTACGCCATCGGCAACATGGAGCAGCCACACATGGACTCACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126218 GCATCTGGTACGCCATCGGCAACATGGAGCAGCCACACATGGACTCACGC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1747 ATCGGCTGGCTGCACAACCTGGGCGACCAGATAGGCAAACCCTACAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126268 ATCGGCTGGCTGCACAACCTGGGCGACCAGATAGGCAAACCCTACAACAG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1797 CAGCGGCCTGGGCGGCCCCTCCATCAAGGACAAGTATGTGACGGCGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126318 CAGCGGCCTGGGCGGCCCCTCCATCAAGGACAAGTATGTGACGGCGCTCT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1847 ACTTCACCTTCAGCAGCCTCACCAGTGTGGGCTTCGGCAACGTCTCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126368 ACTTCACCTTCAGCAGCCTCACCAGTGTGGGCTTCGGCAACGTCTCTCCC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1897 AACACCAACTCAGAGAAGATCTTCTCCATCTGCGTCATGCTCATTGGCT 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 126418 AACACCAACTCAGAGAAGATCTTCTCCATCTGCGTCATGCTCATTGGCTG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1946         CCCTCATGTATGCTAGCATCTTCGGCAACGTGTCGGCCATCA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126468 TG...CAGCCCTCATGTATGCTAGCATCTTCGGCAACGTGTCGGCCATCA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1988 TCCAGCGGCTGTACTCGGGCACAGCCCGCTACCACACACAGATGCTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126836 TCCAGCGGCTGTACTCGGGCACAGCCCGCTACCACACACAGATGCTGCGG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2038 GTGCGGGAGTTCATCCGCTTCCACCAGATCCCCAATCCCCTGCGCCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126886 GTGCGGGAGTTCATCCGCTTCCACCAGATCCCCAATCCCCTGCGCCAGCG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2088 CCTCGAGGAGTACTTCCAGCACGCCTGGTCCTACACCAACGGCATCGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126936 CCTCGAGGAGTACTTCCAGCACGCCTGGTCCTACACCAACGGCATCGACA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2138 TGAACGCG         GTGCTGAAGGGCTTCCCTGAGTGCCTGCAGGCT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 126986 TGAACGCGGTG...CAGGTGCTGAAGGGCTTCCCTGAGTGCCTGCAGGCT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2179 GACATCTGCCTGCACCTGAACCGCTCACTGCTGCAGCACTGCAAACCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127527 GACATCTGCCTGCACCTGAACCGCTCACTGCTGCAGCACTGCAAACCCTT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2229 CCGAGGGGCCACCAAGGGCTGCCTTCGGGCCCTGGCCATGAAGTTCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127577 CCGAGGGGCCACCAAGGGCTGCCTTCGGGCCCTGGCCATGAAGTTCAAGA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2279 CCACACATGCACCGCCAGGGGACACACTGGTGCATGCTGGGGACCTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127627 CCACACATGCACCGCCAGGGGACACACTGGTGCATGCTGGGGACCTGCTC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2329 ACCGCCCTGTACTTCATCTCCCGGGGCTCCATCGAGATCCTGCGGGGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127677 ACCGCCCTGTACTTCATCTCCCGGGGCTCCATCGAGATCCTGCGGGGCGA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2379 CGTCGTCGTGGCCATCCTGG         GGAAGAATGACATCTTTGGGG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 127727 CGTCGTCGTGGCCATCCTGGGTA...CAGGGAAGAATGACATCTTTGGGG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2420 AGCCTCTGAACCTGTATGCAAGGCCTGGCAAGTCGAACGGGGATGTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128886 AGCCTCTGAACCTGTATGCAAGGCCTGGCAAGTCGAACGGGGATGTGCGG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2470 GCCCTCACCTACTGTGACCTACACAAGATCCATCGGGACGACCTGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128936 GCCCTCACCTACTGTGACCTACACAAGATCCATCGGGACGACCTGCTGGA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2520 GGTGCTGGACATGTACCCTGAGTTCTCCGACCACTTCTGGTCCAGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128986 GGTGCTGGACATGTACCCTGAGTTCTCCGACCACTTCTGGTCCAGCCTGG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2570 AGATCACCTTCAACCTGCGAGAT         ACCAACATGATCCCGGGC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 129036 AGATCACCTTCAACCTGCGAGATGTG...CAGACCAACATGATCCCGGGC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2611 TCCCCCGGCAGTACGGAGTTAGAGGGTGGCTTCAGTCGGCAACGCAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129389 TCCCCCGGCAGTACGGAGTTAGAGGGTGGCTTCAGTCGGCAACGCAAGCG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2661 CAAGTTGTCCTTCCGCAGGCGCACGGACAAGG         ACACGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 129439 CAAGTTGTCCTTCCGCAGGCGCACGGACAAGGGTG...CAGACACGGAGC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2702 AGCCAGGGGAGGTGTCGGCCTTGGGGCCGGGCCGGGCGGGGGCAGGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130045 AGCCAGGGGAGGTGTCGGCCTTGGGGCCGGGCCGGGCGGGGGCAGGGCCG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2752 AGTAGCCGGGGCCGGCCGGGGGGGCCGTGGGGGGAGAGCCCGTCCAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130095 AGTAGCCGGGGCCGGCCGGGGGGGCCGTGGGGGGAGAGCCCGTCCAGTGG

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2802 CCCCTCCAGCCCTGAGAGCAGTGAGGATGAGGGCCCAGGCCGCAGCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130145 CCCCTCCAGCCCTGAGAGCAGTGAGGATGAGGGCCCAGGCCGCAGCTCCA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2852 GCCCCCTCCGCCTGGTGCCCTTCTCCAGCCCCAGGCCCCCCGGAGAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130195 GCCCCCTCCGCCTGGTGCCCTTCTCCAGCCCCAGGCCCCCCGGAGAGCCG

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2902 CCGGGTGGGGAGCCCCTGATGGAGGACTGCGAGAAGAGCAGCGACACTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130245 CCGGGTGGGGAGCCCCTGATGGAGGACTGCGAGAAGAGCAGCGACACTTG

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2952 CAACCCCCTGTCAG         GCGCCTTCTCAGGAGTGTCCAACATTT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 130295 CAACCCCCTGTCAGGTA...CAGGCGCCTTCTCAGGAGTGTCCAACATTT

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2993 TCAGCTTCTGGGGGGACAGTCGGGGCCGCCAGTACCAGGAGCTCCCTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130427 TCAGCTTCTGGGGGGACAGTCGGGGCCGCCAGTACCAGGAGCTCCCTCGA

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3043 TGCCCCGCCCCCACCCCCAGCCTCCTCAACATCCCCCTCTCCAGCCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130477 TGCCCCGCCCCCACCCCCAGCCTCCTCAACATCCCCCTCTCCAGCCCGGG

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3093 TCGGCGGCCCCGGGGCGACGTGGAGAGCAGGCTGGATGCCCTCCAGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130527 TCGGCGGCCCCGGGGCGACGTGGAGAGCAGGCTGGATGCCCTCCAGCGCC

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3143 AGCTCAACAG         GCTGGAGACCCGGCTGAGTGCAGACATGGCC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 130577 AGCTCAACAGGTG...CAGGCTGGAGACCCGGCTGAGTGCAGACATGGCC

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3184 ACTGTCCTGCAGCTGCTACAGAGGCAGATGACGCTGGTCCCGCCCGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130891 ACTGTCCTGCAGCTGCTACAGAGGCAGATGACGCTGGTCCCGCCCGCCTA

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3234 CAGTGCTGTGACCACCCCGGGGCCTGGCCCCACTTCCACATCCCCGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130941 CAGTGCTGTGACCACCCCGGGGCCTGGCCCCACTTCCACATCCCCGCTGT

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3284 TGCCCGTCAGCCCCCTCCCCACCCTCACCTTGGACTCGCTTTCTCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 130991 TGCCCGTCAGCCCCCTCCCCACCCTCACCTTGGACTCGCTTTCTCAGGTA

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3331       GTTTCCCAGTTCATGGCGTGTGAGGAGCTGCCCCCGGGGGCCCC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131041 ...CAGGTTTCCCAGTTCATGGCGTGTGAGGAGCTGCCCCCGGGGGCCCC

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3375 AGAGCTTCCCCAAGAAGGCCCCACACGACGCCTCTCCCTACCGGGCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132444 AGAGCTTCCCCAAGAAGGCCCCACACGACGCCTCTCCCTACCGGGCCAGC

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3425 TGGGGGCCCTCACCTCCCAGCCCCTGCACAGACACGGCTCGGACCCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132494 TGGGGGCCCTCACCTCCCAGCCCCTGCACAGACACGGCTCGGACCCGGGC

   3600 
   3475 AGT
        |||
 132544 AGT

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