seq1 = pF1KE2447.tfa, 2556 bp
seq2 = pF1KE2447/gi568815591r_20040949.tfa (gi568815591r:20040949_20261862), 220914 bp

>pF1KE2447 2556
>gi568815591r:20040949_20261862 (Chr7)

(complement)

1-115  (100001-100115)   100% ->
116-2157  (101618-103659)   100% ->
2158-2346  (107482-107670)   100% ->
2347-2556  (120705-120914)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTAATCACTGAAAGAAAACATTTTCGGTCAGGAAGAATTGCACAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTAATCACTGAAAGAAAACATTTTCGGTCAGGAAGAATTGCACAAAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TATGTCTGAAGCAAATTTGATTGACATGGAAGCTGGAAAACTCTCAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TATGTCTGAAGCAAATTTGATTGACATGGAAGCTGGAAAACTCTCAAAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTTGCAATATTACAG         AATGCCAGGACCCAGACTTGCTTCAC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTTGCAATATTACAGGTA...AAGAATGCCAGGACCCAGACTTGCTTCAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AATTGGCCGGATGCTTTCACCCTTCGTGGTAATAATGCTTCCAAAGTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101644 AATTGGCCGGATGCTTTCACCCTTCGTGGTAATAATGCTTCCAAAGTTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AAATCCATTCTGGAATCAACTGTCTGCTTCTAACCCATTTTTGGATGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101694 AAATCCATTCTGGAATCAACTGTCTGCTTCTAACCCATTTTTGGATGACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TAACTCAACTAAGAAATAACAGGAAGAGAAATAATATTTCCATCTTAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101744 TAACTCAACTAAGAAATAACAGGAAGAGAAATAATATTTCCATCTTAAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GAAGATCCTTTTCTTTTCTGTAGAGAAATAGAAAATGGAAATTCTTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101794 GAAGATCCTTTTCTTTTCTGTAGAGAAATAGAAAATGGAAATTCTTTTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TTCCTCCGGTGATGAACTTGATGTGCATCAGTTACTTAGGCAGACTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101844 TTCCTCCGGTGATGAACTTGATGTGCATCAGTTACTTAGGCAGACTTCCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CAAGAAATTCTGGAAGATCTAAAAGTGTTTCAGAACTTCTGGACATTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101894 CAAGAAATTCTGGAAGATCTAAAAGTGTTTCAGAACTTCTGGACATTTTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GACGACACAGCACATGCCCATCAGAGTATACATAACTCTGACCAGATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101944 GACGACACAGCACATGCCCATCAGAGTATACATAACTCTGACCAGATCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 ACTACACGACTTAGAGTGGCTTAAAAATGATCGGGAGGCTTATAAAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101994 ACTACACGACTTAGAGTGGCTTAAAAATGATCGGGAGGCTTATAAAATGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CTTGGTTAAGTCAACGCCAGCTGGCCCGCTCCTGCCTTGATTTGAATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102044 CTTGGTTAAGTCAACGCCAGCTGGCCCGCTCCTGCCTTGATTTGAATACA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 ATTAGTCAGAGCCCTGGATGGGCCCAGACACAACTTGCGGAGGTCACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102094 ATTAGTCAGAGCCCTGGATGGGCCCAGACACAACTTGCGGAGGTCACCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 AGCTTGCAAAGTAAACCATCAAGGAGGGTCAGTACAATTACCTGAATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102144 AGCTTGCAAAGTAAACCATCAAGGAGGGTCAGTACAATTACCTGAATCAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 ACATCACTGTTCATGTGCCCCAAGGTCATGTGGCTGTGGGAGAATTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102194 ACATCACTGTTCATGTGCCCCAAGGTCATGTGGCTGTGGGAGAATTCCAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GAGGTGTCTCTAAGGGCTTTCCTTGATCCGCCACACATGCTTAACCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102244 GAGGTGTCTCTAAGGGCTTTCCTTGATCCGCCACACATGCTTAACCATGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TCTTTCGTGCACTGTGAGCCCGTTGTTGGAAATCATGTTAGGCAACCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102294 TCTTTCGTGCACTGTGAGCCCGTTGTTGGAAATCATGTTAGGCAACCTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 ATACAATGGAAGCCCTTTTGCTGGAGATGAAAATTGGGGCTGAAGTAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102344 ATACAATGGAAGCCCTTTTGCTGGAGATGAAAATTGGGGCTGAAGTAAGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 AAGGATCCTTTCAGCCAAGTCATGACAGAAATGGTGTGTTTACACAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102394 AAGGATCCTTTCAGCCAAGTCATGACAGAAATGGTGTGTTTACACAGCTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 GGGTAAAGAAGGCCCTTTTAAAGTTTTAAGCAACTGCTACATTTATAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102444 GGGTAAAGAAGGCCCTTTTAAAGTTTTAAGCAACTGCTACATTTATAAAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 ACACCATCCAAGTCAAGCTAATCGACTTGAGTCAGGTAATGTATCTAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102494 ACACCATCCAAGTCAAGCTAATCGACTTGAGTCAGGTAATGTATCTAGTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 GTTGCTGCACAAGCTAAAGCTCTTCCGTCACCAGCTGCCACCATTTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102544 GTTGCTGCACAAGCTAAAGCTCTTCCGTCACCAGCTGCCACCATTTGGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 TTATATCCACAAAACCACCTCAATTGGAATTTATGGACCCAAATATATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102594 TTATATCCACAAAACCACCTCAATTGGAATTTATGGACCCAAATATATCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 ATCCCAGTTTTACTGTTGTTTTAACAGTTTGTGGACACAATTATATGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102644 ATCCCAGTTTTACTGTTGTTTTAACAGTTTGTGGACACAATTATATGCCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 GGACAGCTTACAATTTCTGATATTAAGAAGGGTGGAAAAAACATATCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102694 GGACAGCTTACAATTTCTGATATTAAGAAGGGTGGAAAAAACATATCTCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 AGTTGTGTTTCAGCTCTGGGGGAAGCAGTCATTTTTACTTGACAAGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102744 AGTTGTGTTTCAGCTCTGGGGGAAGCAGTCATTTTTACTTGACAAGCCAC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 AAGATTTAAGTATTTCTATTTTTTCCTGTGATCCTGATTTTGAAGTAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102794 AAGATTTAAGTATTTCTATTTTTTCCTGTGATCCTGATTTTGAAGTAAAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 ACAGAAGGAGAAAGGAAAGAAATTAAACAAAAGCAGTTGGAAGCAGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102844 ACAGAAGGAGAAAGGAAAGAAATTAAACAAAAGCAGTTGGAAGCAGGTGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 AGTAGTTCATCAACAATTTTTATTTTCTTTAGTTGAGCACAGAGAGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102894 AGTAGTTCATCAACAATTTTTATTTTCTTTAGTTGAGCACAGAGAGATGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 ACTTGTTTGATTTTTGTGTTCAAGTGGAGCCTCCCAATGGTGAACCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102944 ACTTGTTTGATTTTTGTGTTCAAGTGGAGCCTCCCAATGGTGAACCAGTT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1492 GCACAGTTCTCTATCACTACTCCTGATCCAACCCCAAACCTAAAAAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102994 GCACAGTTCTCTATCACTACTCCTGATCCAACCCCAAACCTAAAAAGACT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1542 CTCGAATCTGCCAGGCTATTTGCAGAAGAAGGAGGAAATCAAGTCTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103044 CTCGAATCTGCCAGGCTATTTGCAGAAGAAGGAGGAAATCAAGTCTGCTC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1592 CTTTATCACCAAAAATTCTTGTTAAATATCCTACATTTCAAGATAAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103094 CTTTATCACCAAAAATTCTTGTTAAATATCCTACATTTCAAGATAAAACA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1642 TTGAACTTTAGCAACTATGGGGTAACCCTGAAGGCAGTGCTAAGACAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103144 TTGAACTTTAGCAACTATGGGGTAACCCTGAAGGCAGTGCTAAGACAAAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1692 CAAGATTGATTACTTCCTTGAATATTTCAAAGGGGACACAATAGCTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103194 CAAGATTGATTACTTCCTTGAATATTTCAAAGGGGACACAATAGCTCTCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1742 TCGGGGAAGGTAAGGTAAAAGCTATTGGTCAGTCCAAAGTGAAAGAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103244 TCGGGGAAGGTAAGGTAAAAGCTATTGGTCAGTCCAAAGTGAAAGAATGG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1792 TATGTAGGAGTCCTCAGAGGTAAGATTGGACTTGTACACTGCAAAAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103294 TATGTAGGAGTCCTCAGAGGTAAGATTGGACTTGTACACTGCAAAAATGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1842 CAAGGTGATTTCAAAGGAGCAAGTAATGTTTATGTCAGATAGTGTCTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103344 CAAGGTGATTTCAAAGGAGCAAGTAATGTTTATGTCAGATAGTGTCTTTA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1892 CAACCAGAAATCTTCTTGAACAGATTGTCCTGCCTTTAAAAAAATTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103394 CAACCAGAAATCTTCTTGAACAGATTGTCCTGCCTTTAAAAAAATTGACT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1942 TATATCTACTCAGTTGTATTAACCTTGGTGTCAGAAAAAGTTTATGATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103444 TATATCTACTCAGTTGTATTAACCTTGGTGTCAGAAAAAGTTTATGATTG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1992 GAAAGTTTTAGCTGATGTCCTGGGTTACTCACATCTGTCCCTGGAAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103494 GAAAGTTTTAGCTGATGTCCTGGGTTACTCACATCTGTCCCTGGAAGATT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2042 TTGATCAAATTCAAGCAGACAAAGAATCAGAGAAAGTTTCTTATGTTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103544 TTGATCAAATTCAAGCAGACAAAGAATCAGAGAAAGTTTCTTATGTTATA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2092 AAGAAGTTAAAGGAAGATTGCCACACAGAGAGAAATACAAGGAAGTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103594 AAGAAGTTAAAGGAAGATTGCCACACAGAGAGAAATACAAGGAAGTTTCT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2142 GTATGAACTTATTGTG         GCTCTTCTGAAAATGGATTGCCAAG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 103644 GTATGAACTTATTGTGGTG...CAGGCTCTTCTGAAAATGGATTGCCAAG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2183 AGTTAGTCGCACGTCTCATCCAAGAAGCTGCTGTTCTGACTTCAGCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107507 AGTTAGTCGCACGTCTCATCCAAGAAGCTGCTGTTCTGACTTCAGCTGTC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2233 AAGCTTGGAAAAGGCTGGAGGGAACTAGCTGAAAAGTTAGTACGACTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107557 AAGCTTGGAAAAGGCTGGAGGGAACTAGCTGAAAAGTTAGTACGACTCAC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2283 AAAGCAACAAATGGAGGCATATGAAATTCCTCATCGAGGAAACACTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107607 AAAGCAACAAATGGAGGCATATGAAATTCCTCATCGAGGAAACACTGGAG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2333 ATGTTGCTGTTGAG         ATGATGTGGAAACCTGCCTATGATTTT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 107657 ATGTTGCTGTTGAGGTA...TAGATGATGTGGAAACCTGCCTATGATTTT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2374 CTGTATACCTGGAGTGCTCACTATGGAAATAACTACACAGATGTGTTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
 120732 CTGTATACCTGGAGTGCTCACTATGGAAATAACTACAGAGATGTGTTACA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2424 AGACCTTCAGTCAGCTTTGGACAGAATGAAAAACCCTGTGACTAAACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120782 AGACCTTCAGTCAGCTTTGGACAGAATGAAAAACCCTGTGACTAAACACT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2474 GGAGAGAATTAACTGGAGTTTTAATACTAGTAAATTCTTTGGAGGTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120832 GGAGAGAATTAACTGGAGTTTTAATACTAGTAAATTCTTTGGAGGTTTTG

   2550     .    :    .    :    .    :
   2524 AGAGTAACTGCATTCTCCACTTCTGAGGAAGTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 120882 AGAGTAACTGCATTCTCCACTTCTGAGGAAGTA