seq1 = pF1KE5431.tfa, 1044 bp
seq2 = pF1KE5431/gi568815592f_25987441.tfa (gi568815592f:25987441_26194223), 206783 bp

>pF1KE5431 1044
>gi568815592f:25987441_26194223 (Chr6)

1-76  (100001-100076)   100% ->
77-340  (103401-103664)   100% ->
341-616  (103874-104149)   100% ->
617-892  (105245-105520)   100% ->
893-1006  (105679-105792)   100% ->
1007-1044  (106746-106783)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCCCGCGAGCCAGGCCGGCGCTTCTCCTCCTGATGCTTTTGCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCCCGCGAGCCAGGCCGGCGCTTCTCCTCCTGATGCTTTTGCAGAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCGGTCCTGCAGGGGCGCTTGCTGC         GTTCACACTCTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100051 CGCGGTCCTGCAGGGGCGCTTGCTGCGTG...CAGGTTCACACTCTCTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACTACCTCTTCATGGGTGCCTCAGAGCAGGACCTTGGTCTTTCCTTGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103416 ACTACCTCTTCATGGGTGCCTCAGAGCAGGACCTTGGTCTTTCCTTGTTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAAGCTTTGGGCTACGTGGATGACCAGCTGTTCGTGTTCTATGATCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103466 GAAGCTTTGGGCTACGTGGATGACCAGCTGTTCGTGTTCTATGATCATGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAGTCGCCGTGTGGAGCCCCGAACTCCATGGGTTTCCAGTAGAATTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103516 GAGTCGCCGTGTGGAGCCCCGAACTCCATGGGTTTCCAGTAGAATTTCAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCCAGATGTGGCTGCAGCTGAGTCAGAGTCTGAAAGGGTGGGATCACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103566 GCCAGATGTGGCTGCAGCTGAGTCAGAGTCTGAAAGGGTGGGATCACATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTCACTGTTGACTTCTGGACTATTATGGAAAATCACAACCACAGCAAGG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 103616 TTCACTGTTGACTTCTGGACTATTATGGAAAATCACAACCACAGCAAGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    341         AGTCCCACACCCTGCAGGTCATCCTGGGCTGTGAAATGCAAG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103666 TA...CAGAGTCCCACACCCTGCAGGTCATCCTGGGCTGTGAAATGCAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AAGACAACAGTACCGAGGGCTACTGGAAGTACGGGTATGATGGGCAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103916 AAGACAACAGTACCGAGGGCTACTGGAAGTACGGGTATGATGGGCAGGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CACCTTGAATTCTGCCCTGACACACTGGATTGGAGAGCAGCAGAACCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103966 CACCTTGAATTCTGCCCTGACACACTGGATTGGAGAGCAGCAGAACCCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGCCTGGCCCACCAAGCTGGAGTGGGAAAGGCACAAGATTCGGGCCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104016 GGCCTGGCCCACCAAGCTGGAGTGGGAAAGGCACAAGATTCGGGCCAGGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AGAACAGGGCCTACCTGGAGAGGGACTGCCCTGCACAGCTGCAGCAGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104066 AGAACAGGGCCTACCTGGAGAGGGACTGCCCTGCACAGCTGCAGCAGTTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CTGGAGCTGGGGAGAGGTGTTTTGGACCAACAAG         TGCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 104116 CTGGAGCTGGGGAGAGGTGTTTTGGACCAACAAGGTA...AAGTGCCTCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TTTGGTGAAGGTGACACATCATGTGACCTCTTCAGTGACCACTCTACGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105252 TTTGGTGAAGGTGACACATCATGTGACCTCTTCAGTGACCACTCTACGGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GTCGGGCCTTGAACTACTACCCCCAGAACATCACCATGAAGTGGCTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105302 GTCGGGCCTTGAACTACTACCCCCAGAACATCACCATGAAGTGGCTGAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GATAAGCAGCCAATGGATGCCAAGGAGTTCGAACCTAAAGACGTATTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105352 GATAAGCAGCCAATGGATGCCAAGGAGTTCGAACCTAAAGACGTATTGCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CAATGGGGATGGGACCTACCAGGGCTGGATAACCTTGGCTGTACCCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105402 CAATGGGGATGGGACCTACCAGGGCTGGATAACCTTGGCTGTACCCCCTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 GGGAAGAGCAGAGATATACGTGCCAGGTGGAGCACCCAGGCCTGGATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105452 GGGAAGAGCAGAGATATACGTGCCAGGTGGAGCACCCAGGCCTGGATCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 CCCCTCATTGTGATCTGGG         AGCCCTCACCGTCTGGCACCCT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 105502 CCCCTCATTGTGATCTGGGGTA...TAGAGCCCTCACCGTCTGGCACCCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 AGTCATTGGAGTCATCAGTGGAATTGCTGTTTTTGTCGTCATCTTGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105701 AGTCATTGGAGTCATCAGTGGAATTGCTGTTTTTGTCGTCATCTTGTTCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 TTGGAATTTTGTTCATAATATTAAGGAAGAGGCAGGGTTCAA        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 105751 TTGGAATTTTGTTCATAATATTAAGGAAGAGGCAGGGTTCAAGTG...CA

   1050     .    :    .    :    .    :    .
   1007  GAGGAGCCATGGGGCACTACGTCTTAGCTGAACGTGAG
        >||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106745 GGAGGAGCCATGGGGCACTACGTCTTAGCTGAACGTGAG