seq1 = pF1KE4381.tfa, 1203 bp seq2 = pF1KE4381/gi568815595f_156191908.tfa (gi568815595f:156191908_156636744), 444837 bp >pF1KE4381 1203 >gi568815595f:156191908_156636744 (Chr3) 1-221 (100001-100221) 99% -> 222-265 (229709-229752) 100% -> 266-303 (260992-261029) 100% -> 304-383 (265546-265625) 100% -> 384-428 (267920-267964) 100% -> 429-473 (271795-271839) 100% -> 474-517 (273736-273779) 100% -> 518-604 (282827-282913) 100% -> 605-690 (322457-322542) 100% -> 691-811 (323193-323313) 100% -> 812-906 (324363-324457) 100% -> 907-1027 (331920-332040) 100% -> 1028-1116 (339502-339590) 98% -> 1117-1203 (344751-344837) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGCAAGTCTCCATAGCCTGCACAGAGCACAATTTGAAGAGTCGGAATGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGCAAGTCTCCATAGCCTGCACAGAGCACAATTTGAAGAGTCGGAATGG 50 . : . : . : . : . : 51 TGAGGACCGACTTCTGAGCAAGCAGAGCTCCACCGCCCCCAATGTGGTAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | 100051 TGAGGACCGACTTCTGAGCAAGCAGAGCTCCACCGCCCCCAATGTGGTGA 100 . : . : . : . : . : 101 ACGCAGCCCGGGCCAAATTCCGCACGGTCGCTATCATCGCGCGCAGCCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100101 ACGCAGCCCGGGCCAAATTCCGCACGGTCGCTATCATCGCGCGCAGCCTG 150 . : . : . : . : . : 151 GGGACGTTCACGCCTCAGCATCACATTTCTCTCAAAGAGTCCACCGCAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100151 GGGACGTTCACGCCTCAGCATCACATTTCTCTCAAAGAGTCCACCGCAAA 200 . : . : . : . : . : 201 GCAGACTGGCATGAAATATAG GAATCTTGGAAAATCAGGAC |||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||| 100201 GCAGACTGGCATGAAATATAGGTA...TAGGAATCTTGGAAAATCAGGAC 250 . : . : . : . : . : 242 TCAGAGTTTCTTGCTTGGGTCTTG GAACATGGGTGACATTT ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||| 229729 TCAGAGTTTCTTGCTTGGGTCTTGGTA...TAGGAACATGGGTGACATTT 300 . : . : . : . : . : 283 GGAGGTCAAATTTCAGATGAG GTTGCTGAACGGCTGATGAC |||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||| 261009 GGAGGTCAAATTTCAGATGAGGTA...CAGGTTGCTGAACGGCTGATGAC 350 . : . : . : . : . : 324 CATCGCCTATGAAAGTGGTGTTAACCTCTTTGATACTGCCGAAGTCTATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 265566 CATCGCCTATGAAAGTGGTGTTAACCTCTTTGATACTGCCGAAGTCTATG 400 . : . : . : . : . : 374 CTGCTGGAAA GGCTGAAGTGATTCTGGGGAGCATCATCAAG ||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||| 265616 CTGCTGGAAAGTA...CAGGGCTGAAGTGATTCTGGGGAGCATCATCAAG 450 . : . : . : . : . : 415 AAGAAAGGCTGGAG GAGGTCCAGTCTGGTCATAACAACCAA ||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||| 267951 AAGAAAGGCTGGAGGTA...CAGGAGGTCCAGTCTGGTCATAACAACCAA 500 . : . : . : . : . : 456 ACTCTACTGGGGTGGAAA AGCTGAAACAGAAAGAGGGCTGT ||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||| 271822 ACTCTACTGGGGTGGAAAGTA...CAGAGCTGAAACAGAAAGAGGGCTGT 550 . : . : . : . : . : 497 CAAGAAAGCATATTATTGAAG GATTGAAGGGCTCCCTCCAG |||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||| 273759 CAAGAAAGCATATTATTGAAGGTG...CAGGATTGAAGGGCTCCCTCCAG 600 . : . : . : . : . : 538 AGGCTGCAGCTCGAGTATGTGGATGTGGTCTTTGCAAATCGACCGGACAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 282847 AGGCTGCAGCTCGAGTATGTGGATGTGGTCTTTGCAAATCGACCGGACAG 650 . : . : . : . : . : 588 TAACACTCCCATGGAAG AAATTGTCCGAGCCATGACACATG |||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||| 282897 TAACACTCCCATGGAAGGTA...CAGAAATTGTCCGAGCCATGACACATG 700 . : . : . : . : . : 629 TGATAAACCAAGGCATGGCGATGTACTGGGGCACCTCGAGATGGAGTGCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 322481 TGATAAACCAAGGCATGGCGATGTACTGGGGCACCTCGAGATGGAGTGCT 750 . : . : . : . : . : 679 ATGGAGATCATG GAAGCCTATTCTGTAGCAAGACAGTTCAA ||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||| 322531 ATGGAGATCATGGTA...TAGGAAGCCTATTCTGTAGCAAGACAGTTCAA 800 . : . : . : . : . : 720 TATGATCCCACCGGTCTGTGAACAAGCTGAGTACCATCTTTTCCAGAGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 323222 TATGATCCCACCGGTCTGTGAACAAGCTGAGTACCATCTTTTCCAGAGAG 850 . : . : . : . : . : 770 AGAAAGTGGAGGTCCAGCTGCCAGAGCTCTACCACAAAATAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>> 323272 AGAAAGTGGAGGTCCAGCTGCCAGAGCTCTACCACAAAATAGGTA...TA 900 . : . : . : . : . : 812 GTGTTGGCGCAATGACATGGTCTCCACTTGCCTGTGGAATCATCTCAGG >||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 324362 GGTGTTGGCGCAATGACATGGTCTCCACTTGCCTGTGGAATCATCTCAGG 950 . : . : . : . : . : 861 AAAATACGGAAACGGGGTGCCTGAAAGTTCCAGGGCTTCACTGAAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>. 324412 AAAATACGGAAACGGGGTGCCTGAAAGTTCCAGGGCTTCACTGAAGGTA. 1000 . : . : . : . : . : 907 TGCTACCAGTGGTTGAAAGAAAGAATTGTAAGTGAAGAAGGGAGA ..>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 324462 ..CAGTGCTACCAGTGGTTGAAAGAAAGAATTGTAAGTGAAGAAGGGAGA 1050 . : . : . : . : . : 952 AAACAGCAAAACAAGCTAAAAGACCTTTCCCCAATTGCGGAGCGTCTGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 331965 AAACAGCAAAACAAGCTAAAAGACCTTTCCCCAATTGCGGAGCGTCTGGG 1100 . : . : . : . : . : 1002 ATGCACACTACCTCAGCTAGCTGTTG CGTGGTGCCTGAGAA ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||| 332015 ATGCACACTACCTCAGCTAGCTGTTGGTA...CAGCGTGGTGCCTGAGAA 1150 . : . : . : . : . : 1043 ACGAAGGTGTGAGTTCTGTGCTCCTGGGATCATCCACTCCTGAACAACTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 339517 ATGAAGGTGTGAGTTCTGTGCTCCTGGGATCATCCACTCCTGAACAACTC 1200 . : . : . : . : . : 1093 ATTGAAAACCTTGGTGCCATTCAG GTTCTCCCAAAGATGAC ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||| 339567 ATTGAAAACCTTGGTGCCATTCAGGCA...CAGGTTCTCCCAAAGATGAC 1250 . : . : . : . : . : 1134 ATCACATGTGGTAAATGAGATTGATAACATACTGCGCAACAAGCCCTACA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 344768 ATCACATGTGGTAAATGAGATTGATAACATACTGCGCAACAAGCCCTACA 1300 . : . : 1184 GCAAGAAGGACTATAGATCA |||||||||||||||||||| 344818 GCAAGAAGGACTATAGATCA