Result of FASTA (ccds) for pF1KB9893
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9893, 1292 aa
  1>>>pF1KB9893 1292 - 1292 aa - 1292 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.2615+/-0.00173; mu= 9.7295+/- 0.102
 mean_var=397.3722+/-87.328, 0's: 0 Z-trim(108.0): 554  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.064339
 statistics sampled from 9265 (9924) to 9265 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.649), E-opt: 0.2 (0.305), width:  16
 Scan time:  4.470

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS42811.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs108|chr2          (1292) 9030 855.0       0
CCDS2394.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs108|chr2           (1308) 7348 698.9 2.3e-200
CCDS32642.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17         (1255) 3921 380.8 1.3e-104
CCDS74052.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17         (1240) 3917 380.4 1.6e-104
CCDS45667.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17         (1225) 3885 377.4 1.3e-103
CCDS77016.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17         (1055) 3802 369.6 2.4e-101
CCDS31833.1 ERBB3 gene_id:2065|Hs108|chr12         (1342) 3589 350.0 2.5e-95
CCDS5514.1 EGFR gene_id:1956|Hs108|chr7            (1210) 3188 312.7 3.8e-84
CCDS5516.1 EGFR gene_id:1956|Hs108|chr7            ( 628) 2194 220.0 1.6e-56
CCDS5515.1 EGFR gene_id:1956|Hs108|chr7            ( 705) 2194 220.1 1.7e-56
CCDS77017.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17         ( 603) 1655 169.9 1.8e-41
CCDS47587.1 EGFR gene_id:1956|Hs108|chr7           ( 405) 1353 141.6   4e-33
CCDS6381.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8            (1052)  749 86.2   5e-16
CCDS56557.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8           (1065)  749 86.2   5e-16
CCDS44283.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1             ( 542)  731 84.1 1.1e-15
CCDS6058.1 PTK2B gene_id:2185|Hs108|chr8           ( 967)  732 84.6 1.4e-15
CCDS169.1 EPHA2 gene_id:1969|Hs108|chr1            ( 976)  732 84.6 1.4e-15
CCDS6057.1 PTK2B gene_id:2185|Hs108|chr8           (1009)  732 84.6 1.4e-15
CCDS33928.1 TNK2 gene_id:10188|Hs108|chr3          (1038)  731 84.5 1.6e-15
CCDS77875.1 TNK2 gene_id:10188|Hs108|chr3          (1040)  731 84.5 1.6e-15
CCDS53435.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1             (1043)  731 84.5 1.6e-15
CCDS53437.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1             (1058)  731 84.5 1.6e-15
CCDS44282.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1             (1064)  731 84.5 1.6e-15
CCDS53438.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1             (1079)  731 84.6 1.6e-15
CCDS33927.1 TNK2 gene_id:10188|Hs108|chr3          (1086)  731 84.6 1.6e-15
CCDS53436.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1             (1161)  731 84.6 1.7e-15
CCDS41441.2 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1             (1167)  731 84.6 1.7e-15
CCDS30947.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1             (1182)  731 84.6 1.7e-15
CCDS46921.1 EPHB1 gene_id:2047|Hs108|chr3          ( 984)  719 83.4 3.3e-15
CCDS47992.1 SYK gene_id:6850|Hs108|chr9            ( 612)  715 82.7 3.3e-15
CCDS6688.1 SYK gene_id:6850|Hs108|chr9             ( 635)  715 82.7 3.4e-15
CCDS35166.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9             (1130)  717 83.3   4e-15
CCDS35165.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9             (1149)  717 83.3 4.1e-15
CCDS2447.1 EPHA4 gene_id:2043|Hs108|chr2           ( 986)  710 82.5 5.9e-15
CCDS2922.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3           ( 983)  704 82.0 8.7e-15
CCDS33255.1 ZAP70 gene_id:7535|Hs108|chr2          ( 312)  687 79.6 1.4e-14
CCDS75132.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4          (1004)  695 81.2 1.6e-14
CCDS3514.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4           (1015)  695 81.2 1.6e-14
CCDS75131.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4          (1016)  695 81.2 1.6e-14
CCDS3513.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4           (1037)  695 81.2 1.6e-14
CCDS75133.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4          (1038)  695 81.2 1.6e-14
CCDS5884.1 EPHA1 gene_id:2041|Hs108|chr7           ( 976)  691 80.8   2e-14
CCDS33254.1 ZAP70 gene_id:7535|Hs108|chr2          ( 619)  687 80.1   2e-14
CCDS229.2 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1            ( 986)  687 80.4 2.6e-14
CCDS230.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1            ( 987)  687 80.4 2.6e-14
CCDS5706.1 EPHB4 gene_id:2050|Hs108|chr7           ( 987)  687 80.4 2.6e-14
CCDS81279.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1          (1055)  687 80.5 2.7e-14
CCDS43636.1 MET gene_id:4233|Hs108|chr7            (1390)  685 80.5 3.5e-14
CCDS47689.1 MET gene_id:4233|Hs108|chr7            (1408)  685 80.5 3.6e-14
CCDS3481.1 TEC gene_id:7006|Hs108|chr4             ( 631)  678 79.3 3.6e-14


>>CCDS42811.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs108|chr2               (1292 aa)
 initn: 9030 init1: 9030 opt: 9030  Z-score: 4554.6  bits: 855.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 9030; 100.0% identity (100.0% similar) in 1292 aa overlap (1-1292:1-1292)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MKPATGLWVWVSLLVAAGTVQPSDSQSVCAGTENKLSSLSDLEQQYRALRKYYENCEVVM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MKPATGLWVWVSLLVAAGTVQPSDSQSVCAGTENKLSSLSDLEQQYRALRKYYENCEVVM
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 GNLEITSIEHNRDLSFLRSVREVTGYVLVALNQFRYLPLENLRIIRGTKLYEDRYALAIF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GNLEITSIEHNRDLSFLRSVREVTGYVLVALNQFRYLPLENLRIIRGTKLYEDRYALAIF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 LNYRKDGNFGLQELGLKNLTEILNGGVYVDQNKFLCYADTIHWQDIVRNPWPSNLTLVST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LNYRKDGNFGLQELGLKNLTEILNGGVYVDQNKFLCYADTIHWQDIVRNPWPSNLTLVST
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 NGSSGCGRCHKSCTGRCWGPTENHCQTLTRTVCAEQCDGRCYGPYVSDCCHRECAGGCSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NGSSGCGRCHKSCTGRCWGPTENHCQTLTRTVCAEQCDGRCYGPYVSDCCHRECAGGCSG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 PKDTDCFACMNFNDSGACVTQCPQTFVYNPTTFQLEHNFNAKYTYGAFCVKKCPHNFVVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PKDTDCFACMNFNDSGACVTQCPQTFVYNPTTFQLEHNFNAKYTYGAFCVKKCPHNFVVD
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 SSSCVRACPSSKMEVEENGIKMCKPCTDICPKACDGIGTGSLMSAQTVDSSNIDKFINCT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SSSCVRACPSSKMEVEENGIKMCKPCTDICPKACDGIGTGSLMSAQTVDSSNIDKFINCT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 KINGNLIFLVTGIHGDPYNAIEAIDPEKLNVFRTVREITGFLNIQSWPPNMTDFSVFSNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KINGNLIFLVTGIHGDPYNAIEAIDPEKLNVFRTVREITGFLNIQSWPPNMTDFSVFSNL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 VTIGGRVLYSGLSLLILKQQGITSLQFQSLKEISAGNIYITDNSNLCYYHTINWTTLFST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VTIGGRVLYSGLSLLILKQQGITSLQFQSLKEISAGNIYITDNSNLCYYHTINWTTLFST
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 INQRIVIRDNRKAENCTAEGMVCNHLCSSDGCWGPGPDQCLSCRRFSRGRICIESCNLYD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 INQRIVIRDNRKAENCTAEGMVCNHLCSSDGCWGPGPDQCLSCRRFSRGRICIESCNLYD
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB9 GEFREFENGSICVECDPQCEKMEDGLLTCHGPGPDNCTKCSHFKDGPNCVEKCPDGLQGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GEFREFENGSICVECDPQCEKMEDGLLTCHGPGPDNCTKCSHFKDGPNCVEKCPDGLQGA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB9 NSFIFKYADPDRECHPCHPNCTQGCNGPTSHDCIYYPWTGHSTLPQHARTPLIAAGVIGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NSFIFKYADPDRECHPCHPNCTQGCNGPTSHDCIYYPWTGHSTLPQHARTPLIAAGVIGG
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB9 LFILVIVGLTFAVYVRRKSIKKKRALRRFLETELVEPLTPSGTAPNQAQLRILKETELKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LFILVIVGLTFAVYVRRKSIKKKRALRRFLETELVEPLTPSGTAPNQAQLRILKETELKR
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB9 VKVLGSGAFGTVYKGIWVPEGETVKIPVAIKILNETTGPKANVEFMDEALIMASMDHPHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VKVLGSGAFGTVYKGIWVPEGETVKIPVAIKILNETTGPKANVEFMDEALIMASMDHPHL
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB9 VRLLGVCLSPTIQLVTQLMPHGCLLEYVHEHKDNIGSQLLLNWCVQIAKGMMYLEERRLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VRLLGVCLSPTIQLVTQLMPHGCLLEYVHEHKDNIGSQLLLNWCVQIAKGMMYLEERRLV
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB9 HRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLEGDEKEYNADGGKMPIKWMALECIHYRKFTHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 HRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLEGDEKEYNADGGKMPIKWMALECIHYRKFTHQ
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB9 SDVWSYGVTIWELMTFGGKPYDGIPTREIPDLLEKGERLPQPPICTIDVYMVMVKCWMID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SDVWSYGVTIWELMTFGGKPYDGIPTREIPDLLEKGERLPQPPICTIDVYMVMVKCWMID
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB9 ADSRPKFKELAAEFSRMARDPQRYLVIQGDDRMKLPSPNDSKFFQNLLDEEDLEDMMDAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ADSRPKFKELAAEFSRMARDPQRYLVIQGDDRMKLPSPNDSKFFQNLLDEEDLEDMMDAE
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB9 EYLVPQAFNIPPPIYTSRARIDSNRNQFVYRDGGFAAEQGVSVPYRAPTSTIPEAPVAQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EYLVPQAFNIPPPIYTSRARIDSNRNQFVYRDGGFAAEQGVSVPYRAPTSTIPEAPVAQG
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KB9 ATAEIFDDSCCNGTLRKPVAPHVQEDSSTQRYSADPTVFAPERSPRGELDEEGYMTPMRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ATAEIFDDSCCNGTLRKPVAPHVQEDSSTQRYSADPTVFAPERSPRGELDEEGYMTPMRD
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KB9 KPKQEYLNPVEENPFVSRRKNGDLQALDNPEYHNASNGPPKAEDEYVNEPLYLNTFANTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KPKQEYLNPVEENPFVSRRKNGDLQALDNPEYHNASNGPPKAEDEYVNEPLYLNTFANTL
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KB9 GKAEYLKNNILSMPEKAKKAFDNPDYWNHSLPPRSTLQHPDYLQEYSTKYFYKQNGRIRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GKAEYLKNNILSMPEKAKKAFDNPDYWNHSLPPRSTLQHPDYLQEYSTKYFYKQNGRIRP
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290  
pF1KB9 IVAENPEYLSEFSLKPGTVLPPPPYRHRNTVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 IVAENPEYLSEFSLKPGTVLPPPPYRHRNTVV
             1270      1280      1290  

>>CCDS2394.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs108|chr2                (1308 aa)
 initn: 7328 init1: 7328 opt: 7348  Z-score: 3710.8  bits: 698.9 E(32554): 2.3e-200
Smith-Waterman score: 8988; 98.8% identity (98.8% similar) in 1308 aa overlap (1-1292:1-1308)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MKPATGLWVWVSLLVAAGTVQPSDSQSVCAGTENKLSSLSDLEQQYRALRKYYENCEVVM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 MKPATGLWVWVSLLVAAGTVQPSDSQSVCAGTENKLSSLSDLEQQYRALRKYYENCEVVM
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               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 GNLEITSIEHNRDLSFLRSVREVTGYVLVALNQFRYLPLENLRIIRGTKLYEDRYALAIF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 GNLEITSIEHNRDLSFLRSVREVTGYVLVALNQFRYLPLENLRIIRGTKLYEDRYALAIF
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pF1KB9 LNYRKDGNFGLQELGLKNLTEILNGGVYVDQNKFLCYADTIHWQDIVRNPWPSNLTLVST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 LNYRKDGNFGLQELGLKNLTEILNGGVYVDQNKFLCYADTIHWQDIVRNPWPSNLTLVST
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 NGSSGCGRCHKSCTGRCWGPTENHCQTLTRTVCAEQCDGRCYGPYVSDCCHRECAGGCSG
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pF1KB9 PKDTDCFACMNFNDSGACVTQCPQTFVYNPTTFQLEHNFNAKYTYGAFCVKKCPHNFVVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 PKDTDCFACMNFNDSGACVTQCPQTFVYNPTTFQLEHNFNAKYTYGAFCVKKCPHNFVVD
              250       260       270       280       290       300

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pF1KB9 SSSCVRACPSSKMEVEENGIKMCKPCTDICPKACDGIGTGSLMSAQTVDSSNIDKFINCT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 SSSCVRACPSSKMEVEENGIKMCKPCTDICPKACDGIGTGSLMSAQTVDSSNIDKFINCT
              310       320       330       340       350       360

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pF1KB9 KINGNLIFLVTGIHGDPYNAIEAIDPEKLNVFRTVREITGFLNIQSWPPNMTDFSVFSNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 KINGNLIFLVTGIHGDPYNAIEAIDPEKLNVFRTVREITGFLNIQSWPPNMTDFSVFSNL
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pF1KB9 VTIGGRVLYSGLSLLILKQQGITSLQFQSLKEISAGNIYITDNSNLCYYHTINWTTLFST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 VTIGGRVLYSGLSLLILKQQGITSLQFQSLKEISAGNIYITDNSNLCYYHTINWTTLFST
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pF1KB9 INQRIVIRDNRKAENCTAEGMVCNHLCSSDGCWGPGPDQCLSCRRFSRGRICIESCNLYD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 INQRIVIRDNRKAENCTAEGMVCNHLCSSDGCWGPGPDQCLSCRRFSRGRICIESCNLYD
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pF1KB9 GEFREFENGSICVECDPQCEKMEDGLLTCHGPGPDNCTKCSHFKDGPNCVEKCPDGLQGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 GEFREFENGSICVECDPQCEKMEDGLLTCHGPGPDNCTKCSHFKDGPNCVEKCPDGLQGA
              550       560       570       580       590       600

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pF1KB9 NSFIFKYADPDRECHPCHPNCTQGCNGPTSHDCIYYPWTGHSTLPQHARTPLIAAGVIGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 NSFIFKYADPDRECHPCHPNCTQGCNGPTSHDCIYYPWTGHSTLPQHARTPLIAAGVIGG
              610       620       630       640       650       660

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pF1KB9 LFILVIVGLTFAVYVRRKSIKKKRALRRFLETELVEPLTPSGTAPNQAQLRILKETELKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 LFILVIVGLTFAVYVRRKSIKKKRALRRFLETELVEPLTPSGTAPNQAQLRILKETELKR
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pF1KB9 VKVLGSGAFGTVYKGIWVPEGETVKIPVAIKILNETTGPKANVEFMDEALIMASMDHPHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 VKVLGSGAFGTVYKGIWVPEGETVKIPVAIKILNETTGPKANVEFMDEALIMASMDHPHL
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pF1KB9 VRLLGVCLSPTIQLVTQLMPHGCLLEYVHEHKDNIGSQLLLNWCVQIAKGMMYLEERRLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 VRLLGVCLSPTIQLVTQLMPHGCLLEYVHEHKDNIGSQLLLNWCVQIAKGMMYLEERRLV
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pF1KB9 HRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLEGDEKEYNADGGKMPIKWMALECIHYRKFTHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 HRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLEGDEKEYNADGGKMPIKWMALECIHYRKFTHQ
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pF1KB9 SDVWSYGVTIWELMTFGGKPYDGIPTREIPDLLEKGERLPQPPICTIDVYMVMVKCWMID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 SDVWSYGVTIWELMTFGGKPYDGIPTREIPDLLEKGERLPQPPICTIDVYMVMVKCWMID
              910       920       930       940       950       960

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pF1KB9 ADSRPKFKELAAEFSRMARDPQRYLVIQGDDRMKLPSPNDSKFFQNLLDEEDLEDMMDAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 ADSRPKFKELAAEFSRMARDPQRYLVIQGDDRMKLPSPNDSKFFQNLLDEEDLEDMMDAE
              970       980       990      1000      1010      1020

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pF1KB9 EYLVPQAFNIPPPIYTSRARIDSNR----------------NQFVYRDGGFAAEQGVSVP
       :::::::::::::::::::::::::                :::::::::::::::::::
CCDS23 EYLVPQAFNIPPPIYTSRARIDSNRSEIGHSPPPAYTPMSGNQFVYRDGGFAAEQGVSVP
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

         1070      1080      1090      1100      1110      1120    
pF1KB9 YRAPTSTIPEAPVAQGATAEIFDDSCCNGTLRKPVAPHVQEDSSTQRYSADPTVFAPERS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 YRAPTSTIPEAPVAQGATAEIFDDSCCNGTLRKPVAPHVQEDSSTQRYSADPTVFAPERS
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

         1130      1140      1150      1160      1170      1180    
pF1KB9 PRGELDEEGYMTPMRDKPKQEYLNPVEENPFVSRRKNGDLQALDNPEYHNASNGPPKAED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 PRGELDEEGYMTPMRDKPKQEYLNPVEENPFVSRRKNGDLQALDNPEYHNASNGPPKAED
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

         1190      1200      1210      1220      1230      1240    
pF1KB9 EYVNEPLYLNTFANTLGKAEYLKNNILSMPEKAKKAFDNPDYWNHSLPPRSTLQHPDYLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 EYVNEPLYLNTFANTLGKAEYLKNNILSMPEKAKKAFDNPDYWNHSLPPRSTLQHPDYLQ
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         1250      1260      1270      1280      1290  
pF1KB9 EYSTKYFYKQNGRIRPIVAENPEYLSEFSLKPGTVLPPPPYRHRNTVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 EYSTKYFYKQNGRIRPIVAENPEYLSEFSLKPGTVLPPPPYRHRNTVV
             1270      1280      1290      1300        

>>CCDS32642.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17              (1255 aa)
 initn: 3387 init1: 1682 opt: 3921  Z-score: 1991.8  bits: 380.8 E(32554): 1.3e-104
Smith-Waterman score: 3966; 47.6% identity (71.1% similar) in 1287 aa overlap (10-1269:9-1249)

               10        20         30        40        50         
pF1KB9 MKPATGLWVWVSLLVAAGTVQP-SDSQSVCAGTENKLSSLSDLEQQYRALRKYYENCEVV
                : .::.:   . : . : .::.::. ::   .. : .   ::. :..:.::
CCDS32  MELAALCRW-GLLLA--LLPPGAASTQVCTGTDMKLRLPASPETHLDMLRHLYQGCQVV
                 10          20        30        40        50      

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB9 MGNLEITSIEHNRDLSFLRSVREVTGYVLVALNQFRYLPLENLRIIRGTKLYEDRYALAI
       .::::.: .  : .::::....:: ::::.: :: : .::. :::.:::.:.:: ::::.
CCDS32 QGNLELTYLPTNASLSFLQDIQEVQGYVLIAHNQVRQVPLQRLRIVRGTQLFEDNYALAV
         60        70        80        90       100       110      

     120                130       140       150       160       170
pF1KB9 FLNYRKDGNF---------GLQELGLKNLTEILNGGVYVDQNKFLCYADTIHWQDIVRNP
       . :    .:          ::.:: :..:::::.::: ...:  ::: ::: :.:: .. 
CCDS32 LDNGDPLNNTTPVTGASPGGLRELQLRSLTEILKGGVLIQRNPQLCYQDTILWKDIFHKN
        120       130       140       150       160       170      

              180       190        200       210       220         
pF1KB9 WPSNLTLVSTNGSSGCGRCHKSCTG-RCWGPTENHCQTLTRTVCAEQCDGRCYGPYVSDC
           :::..:: : .:  :   : : :::: . . ::.:::::::  : .:: ::  .::
CCDS32 NQLALTLIDTNRSRACHPCSPMCKGSRCWGESSEDCQSLTRTVCAGGC-ARCKGPLPTDC
        180       190       200       210       220        230     

     230       240       250       260       270       280         
pF1KB9 CHRECAGGCSGPKDTDCFACMNFNDSGACVTQCPQTFVYNPTTFQLEHNFNAKYTYGAFC
       ::..::.::.::: .::.::..:: :: :  .::   .::  ::.   : ...::.:: :
CCDS32 CHEQCAAGCTGPKHSDCLACLHFNHSGICELHCPALVTYNTDTFESMPNPEGRYTFGASC
         240       250       260       270       280       290     

     290        300       310        320       330       340       
pF1KB9 VKKCPHNFV-VDSSSCVRACPSSKMEVE-ENGIKMCKPCTDICPKACDGIGTGSLMSAQT
       :  ::.:.. .: .::. .::  ..::  :.: . :. :.  : ..: :.:   :  ...
CCDS32 VTACPYNYLSTDVGSCTLVCPLHNQEVTAEDGTQRCEKCSKPCARVCYGLGMEHLREVRA
         300       310       320       330       340       350     

       350       360       370       380       390       400       
pF1KB9 VDSSNIDKFINCTKINGNLIFLVTGIHGDPYNAIEAIDPEKLNVFRTVREITGFLNIQSW
       : :.::..: .: :: :.: ::  .. ::: .    ..::.:.::.:..::::.: :..:
CCDS32 VTSANIQEFAGCKKIFGSLAFLPESFDGDPASNTAPLQPEQLQVFETLEEITGYLYISAW
         360       370       380       390       400       410     

       410       420       430       440       450       460       
pF1KB9 PPNMTDFSVFSNLVTIGGRVLYSGLSLLILKQQGITSLQFQSLKEISAGNIYITDNSNLC
       : .. :.:::.:: .: ::.:..:   : :.  ::. : ..::.:...:   :  :..::
CCDS32 PDSLPDLSVFQNLQVIRGRILHNGAYSLTLQGLGISWLGLRSLRELGSGLALIHHNTHLC
         420       430       440       450       460       470     

       470       480       490       500       510       520       
pF1KB9 YYHTINWTTLFSTINQRIVIRDNRKAENCTAEGMVCNHLCSSDGCWGPGPDQCLSCRRFS
       . ::. :  :: . .: ..   ::  ..:..::..:..::.   :::::: ::..: .: 
CCDS32 FVHTVPWDQLFRNPHQALLHTANRPEDECVGEGLACHQLCARGHCWGPGPTQCVNCSQFL
         480       490       500       510       520       530     

       530       540       550       560       570       580       
pF1KB9 RGRICIESCNLYDGEFREFENGSICVECDPQCEKMEDGLLTCHGPGPDNCTKCSHFKDGP
       ::. :.: : . .:  ::. :.  :. : :.:.  ..: .:: ::  :.:. :.:.:: :
CCDS32 RGQECVEECRVLQGLPREYVNARHCLPCHPECQP-QNGSVTCFGPEADQCVACAHYKDPP
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        :: .::.:..   :.  :.:. : .  :.::  :::..:    .. :           :
CCDS32 FCVARCPSGVKPDLSYMPIWKFPDEEGACQPCPINCTHSCVDLDDKGC-----------P
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        . : .::  : ..:.: ....:..:..:.. ..:.. : .: ..::.: ::::::::::
CCDS32 AEQRASPLTSIISAVVG-ILLVVVLGVVFGILIKRRQQKIRKYTMRRLLQETELVEPLTP
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       ::. :::::.::::::::..:::::::::::::::::.:.::.::::::::.: :.:.::
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       :: :..::: .::..  :.. ::::.::. :.::::::::.::::..:.:..  .::: :
CCDS32 ANKEILDEAYVMAGVGSPYVSRLLGICLTSTVQLVTQLMPYGCLLDHVRENRGRLGSQDL
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       ::::.:::::: :::. :::::::::::::::::::::::::::::::. :: ::.::::
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       :.:::::::: :  :.:::::::::::::.:::::::.:::::::.::::::::::::::
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pF1KB9 QPPICTIDVYMVMVKCWMIDADSRPKFKELAAEFSRMARDPQRYLVIQGDDRMKLPSPND
       :::::::::::.::::::::.. ::.:.::..:::::::::::..:::..: .   :: :
CCDS32 QPPICTIDVYMIMVKCWMIDSECRPRFRELVSEFSRMARDPQRFVVIQNED-LGPASPLD
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pF1KB9 SKFFQNLLDEEDLEDMMDAEEYLVPQ-AFNIPPPIYTSRARIDSNRNQFVYRDGGFAAEQ
       : :...::...:. :..::::::::: .:  : :   . . .   . .   :.::     
CCDS32 STFYRSLLEDDDMGDLVDAEEYLVPQQGFFCPDPAPGAGGMVHHRHRSSSTRSGGGDLTL
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pF1KB9 GVSVPYRAPTSTIPEAPVAQGATAEIFDDSCCNGTLRKPVAPHVQEDSSTQRYSADPTVF
       :.  : .  .   : :: ..:: ...:: .   :. .   .  ... :  :::: :::: 
CCDS32 GLE-PSEEEAPRSPLAP-SEGAGSDVFDGDLGMGAAKGLQSLPTHDPSPLQRYSEDPTVP
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pF1KB9 APERSPRGELDEEGYMTPMRDKPKQEYLNPVEENPFVSRRKNGDLQALDNPEYHNASNGP
        :     .: :  ::..:.  .:. ::.:  .  :     ..: : :   :   .:.   
CCDS32 LP-----SETD--GYVAPLTCSPQPEYVNQPDVRPQPPSPREGPLPAA-RPA--GATLER
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pF1KB9 PKAEDEYVNEPLY-LNTFANTLGKAEYLKNNILSMPEKA-----KKAFDNPDYWNHSLPP
       ::. .   :  .  . .:.... . :::  .  . :.       . ::::  ::... : 
CCDS32 PKTLSPGKNGVVKDVFAFGGAVENPEYLTPQGGAAPQPHPPPAFSPAFDNLYYWDQDPPE
    1170      1180      1190      1200      1210      1220         

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pF1KB9 RSTLQHPDYLQEYSTKYFYKQNGRIRPIVAENPEYLSEFSLKPGTVLPPPPYRHRNTVV
       :..   :. ..   :              :::::::                       
CCDS32 RGA--PPSTFKGTPT--------------AENPEYLGLDVPV                 
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CCDS74               MPRGSWKP----QVCTGTDMKLRLPASPETHLDMLRHLYQGCQVVQ
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pF1KB9 GNLEITSIEHNRDLSFLRSVREVTGYVLVALNQFRYLPLENLRIIRGTKLYEDRYALAIF
       ::::.: .  : .::::....:: ::::.: :: : .::. :::.:::.:.:: ::::..
CCDS74 GNLELTYLPTNASLSFLQDIQEVQGYVLIAHNQVRQVPLQRLRIVRGTQLFEDNYALAVL
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CCDS74 DNGDPLNNTTPVTGASPGGLRELQLRSLTEILKGGVLIQRNPQLCYQDTILWKDIFHKNN
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          :::..:: : .:  :   : : :::: . . ::.:::::::  : .:: ::  .:::
CCDS74 QLALTLIDTNRSRACHPCSPMCKGSRCWGESSEDCQSLTRTVCAGGC-ARCKGPLPTDCC
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pF1KB9 HRECAGGCSGPKDTDCFACMNFNDSGACVTQCPQTFVYNPTTFQLEHNFNAKYTYGAFCV
       :..::.::.::: .::.::..:: :: :  .::   .::  ::.   : ...::.:: ::
CCDS74 HEQCAAGCTGPKHSDCLACLHFNHSGICELHCPALVTYNTDTFESMPNPEGRYTFGASCV
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pF1KB9 KKCPHNFV-VDSSSCVRACPSSKMEVE-ENGIKMCKPCTDICPKACDGIGTGSLMSAQTV
         ::.:.. .: .::. .::  ..::  :.: . :. :.  : ..: :.:   :  ...:
CCDS74 TACPYNYLSTDVGSCTLVCPLHNQEVTAEDGTQRCEKCSKPCARVCYGLGMEHLREVRAV
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pF1KB9 DSSNIDKFINCTKINGNLIFLVTGIHGDPYNAIEAIDPEKLNVFRTVREITGFLNIQSWP
        :.::..: .: :: :.: ::  .. ::: .    ..::.:.::.:..::::.: :..::
CCDS74 TSANIQEFAGCKKIFGSLAFLPESFDGDPASNTAPLQPEQLQVFETLEEITGYLYISAWP
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pF1KB9 PNMTDFSVFSNLVTIGGRVLYSGLSLLILKQQGITSLQFQSLKEISAGNIYITDNSNLCY
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CCDS74 DSLPDLSVFQNLQVIRGRILHNGAYSLTLQGLGISWLGLRSLRELGSGLALIHHNTHLCF
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pF1KB9 YHTINWTTLFSTINQRIVIRDNRKAENCTAEGMVCNHLCSSDGCWGPGPDQCLSCRRFSR
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CCDS74 VHTVPWDQLFRNPHQALLHTANRPEDECVGEGLACHQLCARGHCWGPGPTQCVNCSQFLR
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pF1KB9 GRICIESCNLYDGEFREFENGSICVECDPQCEKMEDGLLTCHGPGPDNCTKCSHFKDGPN
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CCDS74 GQECVEECRVLQGLPREYVNARHCLPCHPECQP-QNGSVTCFGPEADQCVACAHYKDPPF
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CCDS74 CVARCPSGVKPDLSYMPIWKFPDEEGACQPCPINCTHSCVDLDDKGC-----------PA
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pF1KB9 HAR-TPL--IAAGVIGGLFILVIVGLTFAVYVRRKSIK-KKRALRRFL-ETELVEPLTPS
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CCDS74 EQRASPLTSIISAVVGILLV-VVLGVVFGILIKRRQQKIRKYTMRRLLQETELVEPLTPS
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       :. :::::.::::::::..:::::::::::::::::.:.::.::::::::.: :.:.:::
CCDS74 GAMPNQAQMRILKETELRKVKVLGSGAFGTVYKGIWIPDGENVKIPVAIKVLRENTSPKA
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       : :..::: .::..  :.. ::::.::. :.::::::::.::::..:.:..  .::: ::
CCDS74 NKEILDEAYVMAGVGSPYVSRLLGICLTSTVQLVTQLMPYGCLLDHVRENRGRLGSQDLL
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       :::.:::::: :::. :::::::::::::::::::::::::::::::. :: ::.:::::
CCDS74 NWCMQIAKGMSYLEDVRLVHRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLDIDETEYHADGGK
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       .:::::::: :  :.:::::::::::::.:::::::.:::::::.:::::::::::::::
CCDS74 VPIKWMALESILRRRFTHQSDVWSYGVTVWELMTFGAKPYDGIPAREIPDLLEKGERLPQ
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pF1KB9 PPICTIDVYMVMVKCWMIDADSRPKFKELAAEFSRMARDPQRYLVIQGDDRMKLPSPNDS
       ::::::::::.::::::::.. ::.:.::..:::::::::::..:::..: .   :: ::
CCDS74 PPICTIDVYMIMVKCWMIDSECRPRFRELVSEFSRMARDPQRFVVIQNED-LGPASPLDS
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pF1KB9 KFFQNLLDEEDLEDMMDAEEYLVPQ-AFNIPPPIYTSRARIDSNRNQFVYRDGGFAAEQG
        :...::...:. :..::::::::: .:  : :   . . .   . .   :.::     :
CCDS74 TFYRSLLEDDDMGDLVDAEEYLVPQQGFFCPDPAPGAGGMVHHRHRSSSTRSGGGDLTLG
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pF1KB9 VSVPYRAPTSTIPEAPVAQGATAEIFDDSCCNGTLRKPVAPHVQEDSSTQRYSADPTVFA
       .  : .  .   : :: ..:: ...:: .   :. .   .  ... :  :::: ::::  
CCDS74 LE-PSEEEAPRSPLAP-SEGAGSDVFDGDLGMGAAKGLQSLPTHDPSPLQRYSEDPTVPL
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       : ..       .::..:.  .:. ::.:  .  :     ..: : :   :   .:.   :
CCDS74 PSET-------DGYVAPLTCSPQPEYVNQPDVRPQPPSPREGPLPAA-RPA--GATLERP
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       :. .   :  .  . .:.... . :::  .  . :.       . ::::  ::... : :
CCDS74 KTLSPGKNGVVKDVFAFGGAVENPEYLTPQGGAAPQPHPPPAFSPAFDNLYYWDQDPPER
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       ..   :. ..   :              :::::::                       
CCDS74 GA--PPSTFKGTPT--------------AENPEYLGLDVPV                 
          1220                    1230      1240                 

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CCDS45                      MKLRLPASPETHLDMLRHLYQGCQVVQGNLELTYLPTNA
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       .::::....:: ::::.: :: : .::. :::.:::.:.:: ::::.. :    .:    
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             ::.:: :..:::::.::: ...:  ::: ::: :.:: ..     :::..:: :
CCDS45 TGASPGGLRELQLRSLTEILKGGVLIQRNPQLCYQDTILWKDIFHKNNQLALTLIDTNRS
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        .:  :   : : :::: . . ::.:::::::  : .:: ::  .::::..::.::.:::
CCDS45 RACHPCSPMCKGSRCWGESSEDCQSLTRTVCAGGC-ARCKGPLPTDCCHEQCAAGCTGPK
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        .::.::..:: :: :  .::   .::  ::.   : ...::.:: ::  ::.:.. .: 
CCDS45 HSDCLACLHFNHSGICELHCPALVTYNTDTFESMPNPEGRYTFGASCVTACPYNYLSTDV
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       .::. .::  ..::  :.: . :. :.  : ..: :.:   :  ...: :.::..: .: 
CCDS45 GSCTLVCPLHNQEVTAEDGTQRCEKCSKPCARVCYGLGMEHLREVRAVTSANIQEFAGCK
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       :: :.: ::  .. ::: .    ..::.:.::.:..::::.: :..:: .. :.:::.::
CCDS45 KIFGSLAFLPESFDGDPASNTAPLQPEQLQVFETLEEITGYLYISAWPDSLPDLSVFQNL
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        .: ::.:..:   : :.  ::. : ..::.:...:   :  :..::. ::. :  :: .
CCDS45 QVIRGRILHNGAYSLTLQGLGISWLGLRSLRELGSGLALIHHNTHLCFVHTVPWDQLFRN
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        .: ..   ::  ..:..::..:..::.   :::::: ::..: .: ::. :.: : . .
CCDS45 PHQALLHTANRPEDECVGEGLACHQLCARGHCWGPGPTQCVNCSQFLRGQECVEECRVLQ
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       :  ::. :.  :. : :.:.  ..: .:: ::  :.:. :.:.:: : :: .::.:..  
CCDS45 GLPREYVNARHCLPCHPECQP-QNGSVTCFGPEADQCVACAHYKDPPFCVARCPSGVKPD
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        :.  :.:. : .  :.::  :::..:    .. :           : . : .::  : .
CCDS45 LSYMPIWKFPDEEGACQPCPINCTHSCVDLDDKGC-----------PAEQRASPLTSIIS
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pF1KB9 GVIGGLFILVIVGLTFAVYVRRKSIK-KKRALRRFL-ETELVEPLTPSGTAPNQAQLRIL
       .:.: ....:..:..:.. ..:.. : .: ..::.: ::::::::::::. :::::.:::
CCDS45 AVVG-ILLVVVLGVVFGILIKRRQQKIRKYTMRRLLQETELVEPLTPSGAMPNQAQMRIL
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       :::::..:::::::::::::::::.:.::.::::::::.: :.:.:::: :..::: .::
CCDS45 KETELRKVKVLGSGAFGTVYKGIWIPDGENVKIPVAIKVLRENTSPKANKEILDEAYVMA
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       ..  :.. ::::.::. :.::::::::.::::..:.:..  .::: :::::.:::::: :
CCDS45 GVGSPYVSRLLGICLTSTVQLVTQLMPYGCLLDHVRENRGRLGSQDLLNWCMQIAKGMSY
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       ::. :::::::::::::::::::::::::::::::. :: ::.:::::.:::::::: : 
CCDS45 LEDVRLVHRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLDIDETEYHADGGKVPIKWMALESIL
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        :.:::::::::::::.:::::::.:::::::.:::::::::::::::::::::::::.:
CCDS45 RRRFTHQSDVWSYGVTVWELMTFGAKPYDGIPAREIPDLLEKGERLPQPPICTIDVYMIM
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pF1KB9 VKCWMIDADSRPKFKELAAEFSRMARDPQRYLVIQGDDRMKLPSPNDSKFFQNLLDEEDL
       :::::::.. ::.:.::..:::::::::::..:::..: .   :: :: :...::...:.
CCDS45 VKCWMIDSECRPRFRELVSEFSRMARDPQRFVVIQNED-LGPASPLDSTFYRSLLEDDDM
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pF1KB9 EDMMDAEEYLVPQ-AFNIPPPIYTSRARIDSNRNQFVYRDGGFAAEQGVSVPYRAPTSTI
        :..::::::::: .:  : :   . . .   . .   :.::     :.  : .  .   
CCDS45 GDLVDAEEYLVPQQGFFCPDPAPGAGGMVHHRHRSSSTRSGGGDLTLGLE-PSEEEAPRS
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pF1KB9 PEAPVAQGATAEIFDDSCCNGTLRKPVAPHVQEDSSTQRYSADPTVFAPERSPRGELDEE
       : :: ..:: ...:: .   :. .   .  ... :  :::: ::::  : ..       .
CCDS45 PLAP-SEGAGSDVFDGDLGMGAAKGLQSLPTHDPSPLQRYSEDPTVPLPSET-------D
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pF1KB9 GYMTPMRDKPKQEYLNPVEENPFVSRRKNGDLQALDNPEYHNASNGPPKAEDEYVNEPLY
       ::..:.  .:. ::.:  .  :     ..: : :   :   .:.   ::. .   :  . 
CCDS45 GYVAPLTCSPQPEYVNQPDVRPQPPSPREGPLPAA-RPA--GATLERPKTLSPGKNGVVK
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pF1KB9 -LNTFANTLGKAEYLKNNILSMPEKA-----KKAFDNPDYWNHSLPPRSTLQHPDYLQEY
        . .:.... . :::  .  . :.       . ::::  ::... : :..   :. ..  
CCDS45 DVFAFGGAVENPEYLTPQGGAAPQPHPPPAFSPAFDNLYYWDQDPPERGA--PPSTFKGT
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pF1KB9 STKYFYKQNGRIRPIVAENPEYLSEFSLKPGTVLPPPPYRHRNTVV
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CCDS45 PT--------------AENPEYLGLDVPV                 
                           1220                      

>>CCDS77016.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17              (1055 aa)
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CCDS77  MELAALCRW-GLLLA--LLPPGAASTQVCTGTDMKLRLPASPETHLDMLRHLYQGCQVV
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CCDS77 QGNLELTYLPTNASLSFLQDIQEVQGYVLIAHNQVRQVPLQRLRIVRGTQLFEDNYALAV
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       . :    .:          ::.:: :..:::::.::: ...:  ::: ::: :.:: .. 
CCDS77 LDNGDPLNNTTPVTGASPGGLRELQLRSLTEILKGGVLIQRNPQLCYQDTILWKDIFHKN
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pF1KB9 WPSNLTLVSTNGSSGCGRCHKSCTG-RCWGPTENHCQTLTRTVCAEQCDGRCYGPYVSDC
           :::..:: : .:  :   : : :::: . . ::.:::::::  : .:: ::  .::
CCDS77 NQLALTLIDTNRSRACHPCSPMCKGSRCWGESSEDCQSLTRTVCAGGC-ARCKGPLPTDC
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       ::..::.::.::: .::.::..:: :: :  .::   .::  ::.   : ...::.:: :
CCDS77 CHEQCAAGCTGPKHSDCLACLHFNHSGICELHCPALVTYNTDTFESMPNPEGRYTFGASC
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       :  ::.:.. .: .::. .::  ..::  :.: . :. :.  : ..: :.:   :  ...
CCDS77 VTACPYNYLSTDVGSCTLVCPLHNQEVTAEDGTQRCEKCSKPCARVCYGLGMEHLREVRA
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       ::::.:::::: :::. :::::::::::::::::::::::::::::::. :: ::.::::
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       :.:::::::: :  :.:::::::::::::.:::::::.:::::::.::::::::::::::
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       :::::::::::.::::::::.. ::.:.::..:::::::::::..:::..: .   :: :
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CCDS77 STFYRSLLEDDDMGDLVDAEEYLVPQQGFFCPDPAPGAGGMVHHRHRSSSTRNM      
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CCDS31 TTIGGRSLYNRGFSLLIMKNLNVTSLGFRSLKEISAGRIYISANRQLCYHHSLNWTKVLR
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CCDS31 GPTEERLDIKHNRPRRDCVAEGKVCDPLCSSGGCWGPGPGQCLSCRNYSRGGVCVTHCNF
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CCDS31 LNGEPREFAHEAECFSCHPECQPME-GTATCNGSGSDTCAQCAHFRDGPHCVSSCPHGVL
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CCDS31 GAKGPIYKYPDVQNECRPCHENCTQGCKGPELQDCL-----GQ-TLVLIGKTHLTMALTV
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CCDS31 IAGLVVIFMMLGGTF-LYWRGRRIQNKRAMRRYLERGESIEPLDPSEKA-NKVLARIFKE
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CCDS31 TELRKLKVLGSGVFGTVHKGVWIPEGESIKIPVCIKVIEDKSGRQSFQAVTDHMLAIGSL
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CCDS31 DHAHIVRLLGLCPGSSLQLVTQYLPLGSLLDHVRQHRGALGPQLLLNWGVQIAKGMYYLE
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CCDS31 EHGMVHRNLAARNVLLKSPSQVQVADFGVADLLPPDDKQLLYSEAKTPIKWMALESIHFG
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CCDS31 KYTHQSDVWSYGVTVWELMTFGAEPYAGLRLAEVPDLLEKGERLAQPQICTIDVYMVMVK
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CCDS31 CWMIDENIRPTFKELANEFTRMARDPPRYLVIKRESGPGIAPGPEPHGLTNKKLEEVELE
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pF1KB9 DMMDAEEYLVPQAFNIPPPIYTSRARIDSNRNQFVYRDGGFAAEQGVSVPYRAPTSTIPE
         .: .  :  .  :.      :   .           : .   .: :    .:.:    
CCDS31 PELDLDLDLEAEEDNLATTTLGSALSLPV---------GTLNRPRG-SQSLLSPSSGY--
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pF1KB9 APVAQGATAEIFDDSCCNGTLRK---PVAPHVQEDSSTQRYSADPTVFAPERSPRGELDE
        :. ::  .:  ..:  .:. ..   ::. : .  .     :..  : . :    .::.:
CCDS31 MPMNQGNLGESCQESAVSGSSERCPRPVSLHPMPRGCLASESSEGHVTGSE----AELQE
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pF1KB9 EGYMTPMRDKPKQEYLNPVEENPFVSRRKNGDLQALDNPEYHNASNGPPKAEDEYVNEPL
       .  :   :.. ...   :  .. . :.:     ..: .:    .  .::  :.: ::   
CCDS31 KVSMC--RSRSRSRSPRPRGDSAYHSQR-----HSLLTP---VTPLSPPGLEEEDVNGYV
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CCDS31 MPDTHLKGTPSSREGTLSSVGLSSVLGTEEEDEDEEYEYMNRRRRHSPPHPPRPSSLEEL
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>>CCDS5514.1 EGFR gene_id:1956|Hs108|chr7                 (1210 aa)
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       :.:. :.  . ..::.:   .. . . ..:: :: :::..:. .:... .:.....::::
CCDS55 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
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       .. ::  :.:  ::.:: ..:: :::.:.:  ..:  :: ...:.:.::: . . ::...
CCDS55 VLSNY--DANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSM
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CCDS55 GCTGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRN
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       .:: : .:::::: ....:.::.:.. :: :   : :.:.::: : . .. .....:: .
CCDS55 YVVTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKH
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       : :::.:.:.: .: ....:: ..    .::..:....::.:::::: ::.:: : ::. 
CCDS55 FKNCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLH
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       .: ::  : ::.   :   : . . .:::: ..:::::: :.. :. :.:::: .:::: 
CCDS55 AFENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWK
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        ::.: .:.  : .::  ..: : :.::. ::: .::::: : .:.:::  :::: :...
CCDS55 KLFGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPRDCVSCRNVSRGRECVDK
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pF1KB9 CNLYDGEFREFENGSICVECDPQCEKMEDGL-LTCHGPGPDNCTKCSHFKDGPNCVEKCP
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CCDS55 CNLLEGEPREFVENSECIQCHPEC--LPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCP
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pF1KB9 DGLQGAN-SFIFKYADPDRECHPCHPNCTQGCNGPTSHDCIYYPWTGHSTLPQHARTPLI
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CCDS55 AGVMGENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGCTGPGLEGC---PTNG----P---KIPSI
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       :.:..:.:..:..:.: .....::. : .::.:::.: : :::::::::: ::::: :::
CCDS55 ATGMVGALLLLLVVALGIGLFMRRRHIVRKRTLRRLLQERELVEPLTPSGEAPNQALLRI
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pF1KB9 LKETELKRVKVLGSGAFGTVYKGIWVPEGETVKIPVAIKILNETTGPKANVEFMDEALIM
       :::::.:..::::::::::::::.:.:::: :::::::: : :.:.:::: :..::: .:
CCDS55 LKETEFKKIKVLGSGAFGTVYKGLWIPEGEKVKIPVAIKELREATSPKANKEILDEAYVM
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       ::.:.::. ::::.::. :.::.::::: ::::.::.::::::::: :::::::::::: 
CCDS55 ASVDNPHVCRLLGICLTSTVQLITQLMPFGCLLDYVREHKDNIGSQYLLNWCVQIAKGMN
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       :::.::::::::::::::::.:.::::::::::.:: ..::::.:.:::.:::::::: :
CCDS55 YLEDRRLVHRDLAARNVLVKTPQHVKITDFGLAKLLGAEEKEYHAEGGKVPIKWMALESI
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        .: .::::::::::::.:::::::.:::::::. :: ..:::::::::::::::::::.
CCDS55 LHRIYTHQSDVWSYGVTVWELMTFGSKPYDGIPASEISSILEKGERLPQPPICTIDVYMI
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       :::::::::::::::.::  :::.::::::::::::::.::.::::.::.:.. :.::::
CCDS55 MVKCWMIDADSRPKFRELIIEFSKMARDPQRYLVIQGDERMHLPSPTDSNFYRALMDEED
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pF1KB9 LEDMMDAEEYLVPQAFNIPPPIYTSRARIDSNRNQFVYRDGGFAAEQGVSVPYRAPTSTI
       ..:..::.:::.::                           :: .  ..:   :.:  . 
CCDS55 MDDVVDADEYLIPQQ--------------------------GFFSSPSTS---RTPLLSS
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pF1KB9 PEAPVAQGATAEIFDDSCCNGTLRKPVAPHVQEDSSTQRYSADPTVFAPERSPRGELDEE
         : .....:.  .:    ::    :.    .:::  ::::.:::         : : :.
CCDS55 LSA-TSNNSTVACIDR---NGLQSCPI----KEDSFLQRYSSDPT---------GALTED
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pF1KB9 GYMTPMRDKPKQEYLNPVEENPFVSRRKNGDLQALDNPEYHNASNGPPKAEDEYVNEPLY
       .    .   :  ::.:       : .:  :..:   :: :::   .:  ..:     : :
CCDS55 SIDDTFL--PVPEYINQS-----VPKRPAGSVQ---NPVYHNQPLNPAPSRD-----PHY
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pF1KB9 LNTFANTLGKAEYLKNNILSMPEKAKKAFDNPDYWNHSLPPRSTLQHPDYLQEYSTKYFY
        .  ....:. ::: :..  .:  ....::.: .: ..   . .:..::: :..  :   
CCDS55 QDPHSTAVGNPEYL-NTV--QPTCVNSTFDSPAHWAQKGSHQISLDNPDYQQDFFPKE-A
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pF1KB9 KQNGRIRPIVAENPEYLSEFSLKPGTVLPPPPYRHRNTVV
       : :: ..  .::: :::                       
CCDS55 KPNGIFKGSTAENAEYLRVAPQSSEFIGA           
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>>CCDS5516.1 EGFR gene_id:1956|Hs108|chr7                 (628 aa)
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pF1KB9 MKPA-TGLWVWVSLLVAAGTVQPS-DSQSVCAGTENKLSSLSDLEQQYRALRKYYENCEV
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CCDS55 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
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pF1KB9 VMGNLEITSIEHNRDLSFLRSVREVTGYVLVALNQFRYLPLENLRIIRGTKLYEDRYALA
       :.:::::: ...: :::::....::.::::.:::  . .:::::.::::.  ::. ::::
CCDS55 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
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pF1KB9 IFLNYRKDGN-FGLQELGLKNLTEILNGGVYVDQNKFLCYADTIHWQDIVRNPWPSNLTL
       .. ::  :.:  ::.:: ..:: :::.:.:  ..:  :: ...:.:.::: . . ::...
CCDS55 VLSNY--DANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSM
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pF1KB9 VSTNGSSGCGRCHKSC-TGRCWGPTENHCQTLTRTVCAEQCDGRCYGPYVSDCCHRECAG
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CCDS55 DFQNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAA
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pF1KB9 GCSGPKDTDCFACMNFNDSGACVTQCPQTFVYNPTTFQLEHNFNAKYTYGAFCVKKCPHN
       ::.::...::..: .: : ..:   ::  ..:::::.:.. : ..::..:: ::::::.:
CCDS55 GCTGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRN
      240       250       260       270       280       290        

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pF1KB9 FVV-DSSSCVRACPSSKMEVEENGIKMCKPCTDICPKACDGIGTGSLMSAQTVDSSNIDK
       .:: : .:::::: ....:.::.:.. :: :   : :.:.::: : . .. .....:: .
CCDS55 YVVTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKH
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pF1KB9 FINCTKINGNLIFLVTGIHGDPYNAIEAIDPEKLNVFRTVREITGFLNIQSWPPNMTDFS
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CCDS55 FKNCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLH
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pF1KB9 VFSNLVTIGGRVLYSGLSLLILKQQGITSLQFQSLKEISAGNIYITDNSNLCYYHTINWT
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CCDS55 AFENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWK
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