Result of FASTA (ccds) for pF1KE2394
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2394, 821 aa
  1>>>pF1KE2394 821 - 821 aa - 821 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1372+/-0.00112; mu= 15.4360+/- 0.067
 mean_var=70.7882+/-13.736, 0's: 0 Z-trim(102.6): 40  B-trim: 0 in 0/50
 Lambda= 0.152438
 statistics sampled from 7026 (7042) to 7026 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.571), E-opt: 0.2 (0.216), width:  16
 Scan time:  3.330

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS2179.1 MCM6 gene_id:4175|Hs108|chr2            ( 821) 5347 1185.9       0
CCDS5684.1 MCM7 gene_id:4176|Hs108|chr7            ( 543)  894 206.5 9.8e-53
CCDS5683.1 MCM7 gene_id:4176|Hs108|chr7            ( 719)  894 206.5 1.3e-52
CCDS13915.1 MCM5 gene_id:4174|Hs108|chr22          ( 734)  882 203.9 8.1e-52
CCDS6143.1 MCM4 gene_id:4173|Hs108|chr8            ( 863)  845 195.8 2.7e-49
CCDS56447.1 MCM9 gene_id:254394|Hs108|chr6         (1143)  783 182.2 4.4e-45
CCDS3043.1 MCM2 gene_id:4171|Hs108|chr3            ( 904)  772 179.7 1.9e-44
CCDS75468.1 MCM3 gene_id:4172|Hs108|chr6           ( 818)  750 174.9 4.9e-43
CCDS4940.2 MCM3 gene_id:4172|Hs108|chr6            ( 853)  750 174.9 5.1e-43
CCDS13094.1 MCM8 gene_id:84515|Hs108|chr20         ( 840)  663 155.8 2.9e-37
CCDS13095.1 MCM8 gene_id:84515|Hs108|chr20         ( 824)  659 154.9 5.2e-37
CCDS63227.1 MCM8 gene_id:84515|Hs108|chr20         ( 880)  590 139.7 2.1e-32
CCDS63226.1 MCM8 gene_id:84515|Hs108|chr20         ( 793)  478 115.1 4.9e-25


>>CCDS2179.1 MCM6 gene_id:4175|Hs108|chr2                 (821 aa)
 initn: 5347 init1: 5347 opt: 5347  Z-score: 6349.9  bits: 1185.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5347; 100.0% identity (100.0% similar) in 821 aa overlap (1-821:1-821)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MDLAAAAEPGAGSQHLEVRDEVAEKCQKLFLDFLEEFQSSDGEIKYLQLAEELIRPERNT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 MDLAAAAEPGAGSQHLEVRDEVAEKCQKLFLDFLEEFQSSDGEIKYLQLAEELIRPERNT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 LVVSFVDLEQFNQQLSTTIQEEFYRVYPYLCRALKTFVKDRKEIPLAKDFYVAFQDLPTR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 LVVSFVDLEQFNQQLSTTIQEEFYRVYPYLCRALKTFVKDRKEIPLAKDFYVAFQDLPTR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 HKIRELTSSRIGLLTRISGQVVRTHPVHPELVSGTFLCLDCQTVIRDVEQQFKYTQPNIC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 HKIRELTSSRIGLLTRISGQVVRTHPVHPELVSGTFLCLDCQTVIRDVEQQFKYTQPNIC
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 RNPVCANRRRFLLDTNKSRFVDFQKVRIQETQAELPRGSIPRSLEVILRAEAVESAQAGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 RNPVCANRRRFLLDTNKSRFVDFQKVRIQETQAELPRGSIPRSLEVILRAEAVESAQAGD
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 KCDFTGTLIVVPDVSKLSTPGARAETNSRVSGVDGYETEGIRGLRALGVRDLSYRLVFLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 KCDFTGTLIVVPDVSKLSTPGARAETNSRVSGVDGYETEGIRGLRALGVRDLSYRLVFLA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 CCVAPTNPRFGGKELRDEEQTAESIKNQMTVKEWEKVFEMSQDKNLYHNLCTSLFPTIHG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 CCVAPTNPRFGGKELRDEEQTAESIKNQMTVKEWEKVFEMSQDKNLYHNLCTSLFPTIHG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 NDEVKRGVLLMLFGGVPKTTGEGTSLRGDINVCIVGDPSTAKSQFLKHVEEFSPRAVYTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 NDEVKRGVLLMLFGGVPKTTGEGTSLRGDINVCIVGDPSTAKSQFLKHVEEFSPRAVYTS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 GKASSAAGLTAAVVRDEESHEFVIEAGALMLADNGVCCIDEFDKMDVRDQVAIHEAMEQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 GKASSAAGLTAAVVRDEESHEFVIEAGALMLADNGVCCIDEFDKMDVRDQVAIHEAMEQQ
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 TISITKAGVKATLNARTSILAAANPISGHYDRSKSLKQNINLSAPIMSRFDLFFILVDEC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 TISITKAGVKATLNARTSILAAANPISGHYDRSKSLKQNINLSAPIMSRFDLFFILVDEC
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 NEVTDYAIARRIVDLHSRIEESIDRVYSLDDIRRYLLFARQFKPKISKESEDFIVEQYKH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 NEVTDYAIARRIVDLHSRIEESIDRVYSLDDIRRYLLFARQFKPKISKESEDFIVEQYKH
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 LRQRDGSGVTKSSWRITVRQLESMIRLSEAMARMHCCDEVQPKHVKEAFRLLNKSIIRVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 LRQRDGSGVTKSSWRITVRQLESMIRLSEAMARMHCCDEVQPKHVKEAFRLLNKSIIRVE
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE2 TPDVNLDQEEEIQMEVDEGAGGINGHADSPAPVNGINGYNEDINQESAPKASLRLGFSEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 TPDVNLDQEEEIQMEVDEGAGGINGHADSPAPVNGINGYNEDINQESAPKASLRLGFSEY
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE2 CRISNLIVLHLRKVEEEEDESALKRSELVNWYLKEIESEIDSEEELINKKRIIEKVIHRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 CRISNLIVLHLRKVEEEEDESALKRSELVNWYLKEIESEIDSEEELINKKRIIEKVIHRL
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820 
pF1KE2 THYDHVLIELTQAGLKGSTEGSESYEEDPYLVVNPNYLLED
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 THYDHVLIELTQAGLKGSTEGSESYEEDPYLVVNPNYLLED
              790       800       810       820 

>>CCDS5684.1 MCM7 gene_id:4176|Hs108|chr7                 (543 aa)
 initn: 941 init1: 725 opt: 894  Z-score: 1060.2  bits: 206.5 E(32554): 9.8e-53
Smith-Waterman score: 1009; 37.6% identity (68.2% similar) in 510 aa overlap (151-655:1-464)

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 HKIRELTSSRIGLLTRISGQVVRTHPVHPELVSGTFLCLDCQTVIRDVEQQFKYTQPNIC
                                     .: .:. : .: .   .  :.  .    .:
CCDS56                               MVVATYTCDQCGAETYQPIQSPTFMPLIMC
                                             10        20        30

                 190       200       210       220       230       
pF1KE2 RNPVCANRR---RFLLDTNKSRFVDFQKVRIQETQAELPRGSIPRSLEVILRAEAVESAQ
        .  : . :   :. :.:  :::. ::....:: . ..: :.::::. :....: .. ::
CCDS56 PSQECQTNRSGGRLYLQTRGSRFIKFQEMKMQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQ
               40        50        60        70        80        90

       240       250       260       270       280       290       
pF1KE2 AGDKCDFTGTLIVVPDVSKLSTPGARAETNSRVSGVDGYETEGIRGLRALGVRDLSYRLV
        ::. . ::  : .:    .   : :     .:  :.:  .:    :.:       .:.:
CCDS56 PGDHVSVTG--IFLP----ILRTGFR-----QV--VQGLLSETY--LEA-------HRIV
                100           110              120                 

       300       310       320       330       340       350       
pF1KE2 FLACCVAPTNPRFGGKELRDEEQTAESIKNQMTVKEWEKVFEMSQDKNLYHNLCTSLFPT
                      :  ..:..  ::  ...: .: ... :    ...:..: .:. : 
CCDS56 ---------------KMNKSEDD--ESGAGELTREELRQIAE----EDFYEKLAASIAPE
                     130         140       150           160       

       360       370       380       390       400       410       
pF1KE2 IHGNDEVKRGVLLMLFGGVPKTTGEGTSLRGDINVCIVGDPSTAKSQFLKHVEEFSPRAV
       :.:...::...::.: ::: ..  .: ..::.::.:..:::..::::.:.......::. 
CCDS56 IYGHEDVKKALLLLLVGGVDQSP-RGMKIRGNINICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQ
       170       180       190        200       210       220      

       420       430       440       450       460       470       
pF1KE2 YTSGKASSAAGLTAAVVRDEESHEFVIEAGALMLADNGVCCIDEFDKMDVRDQVAIHEAM
       ::.:..::..::::::.::  : :...:.:::.:::.:::::::::::   :..::::.:
CCDS56 YTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVSGELTLEGGALVLADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVM
        230       240       250       260       270       280      

       480       490       500       510       520       530       
pF1KE2 EQQTISITKAGVKATLNARTSILAAANPISGHYDRSKSLKQNINLSAPIMSRFDLFFILV
       :::::::.:::. .::::: ::::::::  :.:.  .::.:::.: : ..:::::.... 
CCDS56 EQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYNPRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQ
        290       300       310       320       330       340      

       540       550         560       570       580       590     
pF1KE2 DECNEVTDYAIARRI--VDLHSRIEESIDRVYSLDDIRRYLLFARQFKPKISKESEDFIV
       :. .. .:  .:..:  :  :::   :  .  ..  .:::. . :. .: . .   :.:.
CCDS56 DRPDRDNDLRLAQHITYVHQHSRQPPSQFEPLDMKLMRRYIAMCREKQPMVPESLADYIT
        350       360       370       380       390       400      

         600       610       620       630       640       650     
pF1KE2 EQYKHLRQRDGSGVTKSSWRITVRQLESMIRLSEAMARMHCCDEVQPKHVKEAFRLLNKS
         : ..:..  . ..:..   ..: : ...::: :.::..  : :. . :.::.::.. :
CCDS56 AAYVEMRRE--AWASKDATYTSARTLLAILRLSTALARLRMVDVVEKEDVNEAIRLMEMS
        410         420       430       440       450       460    

         660       670       680       690       700       710     
pF1KE2 IIRVETPDVNLDQEEEIQMEVDEGAGGINGHADSPAPVNGINGYNEDINQESAPKASLRL
                                                                   
CCDS56 KDSLLGDKGQTARTQRPADVIFATVRELVSGGRSVRFSEAEQRCVSRGFTPAQFQAALDE
          470       480       490       500       510       520    

>>CCDS5683.1 MCM7 gene_id:4176|Hs108|chr7                 (719 aa)
 initn: 941 init1: 725 opt: 894  Z-score: 1058.2  bits: 206.5 E(32554): 1.3e-52
Smith-Waterman score: 1088; 37.1% identity (67.6% similar) in 558 aa overlap (106-655:130-640)

          80        90       100       110       120          130  
pF1KE2 STTIQEEFYRVYPYLCRALKTFVKDRKEIPLAKDFYVAFQDLPTRHK---IRELTSSRIG
                                     : . : . ::  :. .:   :::. .. .:
CCDS56 DVYIEHRLMMEQRSRDPGMVRSPQNQYPAELMRRFELYFQG-PSSNKPRVIREVRADSVG
     100       110       120       130       140        150        

            140       150       160       170       180            
pF1KE2 LLTRISGQVVRTHPVHPELVSGTFLCLDCQTVIRDVEQQFKYTQPNICRNPVCANRR---
        :. . : :.:.  :.:..: .:. : .: .   .  :.  .    .: .  : . :   
CCDS56 KLVTVRGIVTRVSEVKPKMVVATYTCDQCGAETYQPIQSPTFMPLIMCPSQECQTNRSGG
      160       170       180       190       200       210        

     190       200       210       220       230       240         
pF1KE2 RFLLDTNKSRFVDFQKVRIQETQAELPRGSIPRSLEVILRAEAVESAQAGDKCDFTGTLI
       :. :.:  :::. ::....:: . ..: :.::::. :....: .. :: ::. . :: ..
CCDS56 RLYLQTRGSRFIKFQEMKMQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQPGDHVSVTGIFL
      220       230       240       250       260       270        

     250       260       270       280       290       300         
pF1KE2 VVPDVSKLSTPGARAETNSRVSGVDGYETEGIRGLRALGVRDLSYRLVFLACCVAPTNPR
        .     : : : :         :.:  .:    :.:       .:.:            
CCDS56 PI-----LRT-GFRQV-------VQGLLSETY--LEA-------HRIV------------
      280                    290         300                       

     310       320       330       340       350       360         
pF1KE2 FGGKELRDEEQTAESIKNQMTVKEWEKVFEMSQDKNLYHNLCTSLFPTIHGNDEVKRGVL
          :  ..:..  ::  ...: .: ... :    ...:..: .:. : :.:...::...:
CCDS56 ---KMNKSEDD--ESGAGELTREELRQIAE----EDFYEKLAASIAPEIYGHEDVKKALL
             310         320           330       340       350     

     370       380       390       400       410       420         
pF1KE2 LMLFGGVPKTTGEGTSLRGDINVCIVGDPSTAKSQFLKHVEEFSPRAVYTSGKASSAAGL
       :.: ::: ..  .: ..::.::.:..:::..::::.:.......::. ::.:..::..::
CCDS56 LLLVGGVDQSP-RGMKIRGNINICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGL
         360        370       380       390       400       410    

     430       440       450       460       470       480         
pF1KE2 TAAVVRDEESHEFVIEAGALMLADNGVCCIDEFDKMDVRDQVAIHEAMEQQTISITKAGV
       ::::.::  : :...:.:::.:::.:::::::::::   :..::::.::::::::.:::.
CCDS56 TAAVLRDSVSGELTLEGGALVLADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGI
          420       430       440       450       460       470    

     490       500       510       520       530       540         
pF1KE2 KATLNARTSILAAANPISGHYDRSKSLKQNINLSAPIMSRFDLFFILVDECNEVTDYAIA
        .::::: ::::::::  :.:.  .::.:::.: : ..:::::.... :. .. .:  .:
CCDS56 LTTLNARCSILAAANPAYGRYNPRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLA
          480       490       500       510       520       530    

     550         560       570       580       590       600       
pF1KE2 RRI--VDLHSRIEESIDRVYSLDDIRRYLLFARQFKPKISKESEDFIVEQYKHLRQRDGS
       ..:  :  :::   :  .  ..  .:::. . :. .: . .   :.:.  : ..:..  .
CCDS56 QHITYVHQHSRQPPSQFEPLDMKLMRRYIAMCREKQPMVPESLADYITAAYVEMRRE--A
          540       550       560       570       580       590    

       610       620       630       640       650       660       
pF1KE2 GVTKSSWRITVRQLESMIRLSEAMARMHCCDEVQPKHVKEAFRLLNKSIIRVETPDVNLD
        ..:..   ..: : ...::: :.::..  : :. . :.::.::.. :            
CCDS56 WASKDATYTSARTLLAILRLSTALARLRMVDVVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTA
            600       610       620       630       640       650  

       670       680       690       700       710       720       
pF1KE2 QEEEIQMEVDEGAGGINGHADSPAPVNGINGYNEDINQESAPKASLRLGFSEYCRISNLI
                                                                   
CCDS56 RTQRPADVIFATVRELVSGGRSVRFSEAEQRCVSRGFTPAQFQAALDEYEELNVWQVNAS
            660       670       680       690       700       710  

>>CCDS13915.1 MCM5 gene_id:4174|Hs108|chr22               (734 aa)
 initn: 917 init1: 638 opt: 882  Z-score: 1043.8  bits: 203.9 E(32554): 8.1e-52
Smith-Waterman score: 1011; 31.3% identity (62.0% similar) in 658 aa overlap (27-657:32-649)

                   10        20        30        40         50     
pF1KE2     MDLAAAAEPGAGSQHLEVRDEVAEKCQKLFLDFLEEFQSSDGEIKY-LQLAEELIR
                                     :. : .::.... .  .  . ..  .:: :
CCDS13 SGFDDPGIFYSDSFGGDAQADEGQARKSQLQRRFKEFLRQYRVGTDRTGFTFKYRDELKR
              10        20        30        40        50        60 

          60            70        80        90       100           
pF1KE2 PERNT----LVVSFVDLEQFNQQLSTTIQEEFYRVYPYLCRALKTFVKDRKEIP------
        . :     . : . :: .:...:.  . ..  .    : .: :  : :.   :      
CCDS13 -HYNLGEYWIEVEMEDLASFDEDLADYLYKQPAEHLQLLEEAAKE-VADEVTRPRPSGEE
               70        80        90       100        110         

         110       120       130       140       150       160     
pF1KE2 LAKDFYVAFQDLPTRHKIRELTSSRIGLLTRISGQVVRTHPVHPELVSGTFLCLDCQTVI
       . .:. : ...  .  .:: : :. .. :..: : .. .  :. . .  .. : .:....
CCDS13 VLQDIQVMLKSDASPSSIRSLKSDMMSHLVKIPGIIIAASAVRAKATRISIQCRSCRNTL
     120       130       140       150       160       170         

         170          180            190       200       210       
pF1KE2 RDVEQQ---FKYTQPNICRN-----PVCANRRRFLLDTNKSRFVDFQKVRIQETQAELPR
        .. ..     :. :  : .     : :     :..  .: . :::: ...::    .:.
CCDS13 TNIAMRPGLEGYALPRKCNTDQAGRPKCPLDPYFIMP-DKCKCVDFQTLKLQELPDAVPH
     180       190       200       210        220       230        

       220       230       240       250       260       270       
pF1KE2 GSIPRSLEVILRAEAVESAQAGDKCDFTGTLIVVPDVSKLSTPGARAETNSRVSGVDGYE
       : .:: ...       ...  :..  . :    . ...:..       :.::     : .
CCDS13 GEMPRHMQLYCDRYLCDKVVPGNRVTIMG----IYSIKKFGL------TTSR-----GRD
      240       250       260           270             280        

       280       290       300       310       320       330       
pF1KE2 TEGIRGLRALGVRDLSYRLVFLACCVAPTNPRFGGKELRDEEQTAESIKNQMTVKEWEKV
         :. :.:.  .: :. ..                    : . ...:. . .. .: :. 
CCDS13 RVGV-GIRSSYIRVLGIQV--------------------DTDGSGRSFAGAVSPQEEEEF
            290       300                           310       320  

       340       350       360       370       380       390       
pF1KE2 FEMSQDKNLYHNLCTSLFPTIHGNDEVKRGVLLMLFGGVPKTTGEGTSLRGDINVCIVGD
        ...   :.:. .  :. :.: :. ..:...  .::::  :   .: . :::::. ..::
CCDS13 RRLAALPNVYEVISKSIAPSIFGGTDMKKAIACLLFGGSRKRLPDGLTRRGDINLLMLGD
            330       340       350       360       370       380  

       400       410       420       430       440       450       
pF1KE2 PSTAKSQFLKHVEEFSPRAVYTSGKASSAAGLTAAVVRDEESHEFVIEAGALMLADNGVC
       :.:::::.:: ::. :: .::::::.::::::::.:.::  :..:..:.::..:::.:: 
CCDS13 PGTAKSQLLKFVEKCSPIGVYTSGKGSSAAGLTASVMRDPSSRNFIMEGGAMVLADGGVV
            390       400       410       420       430       440  

       460       470       480       490       500       510       
pF1KE2 CIDEFDKMDVRDQVAIHEAMEQQTISITKAGVKATLNARTSILAAANPISGHYDRSKSLK
       ::::::::   :.::::::::::::::.:::. .:::.: :.::::: . :..:..:. .
CCDS13 CIDEFDKMREDDRVAIHEAMEQQTISIAKAGITTTLNSRCSVLAAANSVFGRWDETKG-E
            450       460       470       480       490       500  

       520       530       540       550          560       570    
pF1KE2 QNINLSAPIMSRFDLFFILVDECNEVTDYAIARRIVDLHSRI---EESIDRVYSLDDIRR
       .::..   :.::::..::. :: ::  :  .:.... ::       ....   .:  ...
CCDS13 DNIDFMPTILSRFDMIFIVKDEHNEERDVMLAKHVITLHVSALTQTQAVEGEIDLAKLKK
             510       520       530       540       550       560 

          580        590       600           610       620         
pF1KE2 YLLFAR-QFKPKISKESEDFIVEQYKHLR----QRDGSGVTKSSWRITVRQLESMIRLSE
       .. . : .  :..: :. . . ..:  .:    :.. ..  .::  :::::::...:..:
CCDS13 FIAYCRVKCGPRLSAEAAEKLKNRYIIMRSGARQHERDSDRRSSIPITVRQLEAIVRIAE
             570       580       590       600       610       620 

     630       640       650       660       670       680         
pF1KE2 AMARMHCCDEVQPKHVKEAFRLLNKSIIRVETPDVNLDQEEEIQMEVDEGAGGINGHADS
       :...:.    .    :.::.::.. : .                                
CCDS13 ALSKMKLQPFATEADVEEALRLFQVSTLDAALSGTLSGVEGFTSQEDQEMLSRIEKQLKR
             630       640       650       660       670       680 

>>CCDS6143.1 MCM4 gene_id:4173|Hs108|chr8                 (863 aa)
 initn: 784 init1: 594 opt: 845  Z-score: 998.6  bits: 195.8 E(32554): 2.7e-49
Smith-Waterman score: 1044; 32.4% identity (63.1% similar) in 666 aa overlap (6-651:141-764)

                                        10          20        30   
pF1KE2                          MDLAAAAEPGAGSQHLEV--RDEVAEKCQKLFLDF
                                     :.: . : :.: .   :  .  :.. :  :
CCDS61 PVRQRPDLGSAQKGLQVDLQSDGAAAEDIVASEQSLG-QKLVIWGTDVNVAACKENFQRF
              120       130       140        150       160         

                   40            50        60        70        80  
pF1KE2 LEEF-------QSSDG----EIKYLQLAEELIRPERNTLVVSFVDLEQFNQQLSTTIQEE
       :..:       . . :    :  :.:   :.    .  : :.   ...:...:   .   
CCDS61 LQRFIDPLAKEEENVGIDITEPLYMQRLGEINVIGEPFLNVNCEHIKSFDKNLYRQLISY
     170       180       190       200       210       220         

             90       100        110        120       130       140
pF1KE2 FYRVYPYLCRALKTFVKDR-KEIPLAKDFYV-AFQDLPTRHKIRELTSSRIGLLTRISGQ
         .: : .  :.. .  ::  .  : ... :  :. : :.. .:.:.   :  :  :::.
CCDS61 PQEVIPTFDMAVNEIFFDRYPDSILEHQIQVRPFNALKTKN-MRNLNPEDIDQLITISGM
     230       240       250       260       270        280        

              150       160       170       180       190       200
pF1KE2 VVRTHPVHPELVSGTFLCLDCQTVIRDVEQQFKYTQPNICRNPVCANRRRFLLDTNKSRF
       :.::  . ::.  . : :  :  . :   .. . ..:..:    : . . . :  :.: :
CCDS61 VIRTSQLIPEMQEAFFQCQVCAHTTRVEMDRGRIAEPSVCGR--CHTTHSMALIHNRSLF
      290       300       310       320       330         340      

              210       220       230       240       250       260
pF1KE2 VDFQKVRIQETQAELPRGSIPRSLEVILRAEAVESAQAGDKCDFTGTLIVVPDVSKLSTP
        : : ...::.  ..: :. :... .. . . :...: ::. . ::   .::        
CCDS61 SDKQMIKLQESPEDMPAGQTPHTVILFAHNDLVDKVQPGDRVNVTGIYRAVP--------
        350       360       370       380       390                

              270       280       290       300       310       320
pF1KE2 GARAETNSRVSGVDGYETEGIRGLRALGVRDLSYRLVFLACCVAPTNPRFGGKELRDEEQ
           ..: :::.:        ...    .  . ::             .  .:.:.  ..
CCDS61 ---IRVNPRVSNV--------KSVYKTHIDVIHYR-------------KTDAKRLHGLDE
         400               410       420                    430    

              330       340       350       360       370          
pF1KE2 TAESIKNQMTVKEWEKVFEMSQDKNLYHNLCTSLFPTIHGNDEVKRGVLLMLFGGVPKT-
        ::  .. .. :. : . :.:.  ..:. : ..: :.:. ....:.:.::.::::. :  
CCDS61 EAE--QKLFSEKRVELLKELSRKPDIYERLASALAPSIYEHEDIKKGILLQLFGGTRKDF
            440       450       460       470       480       490  

       380       390       400       410       420       430       
pF1KE2 --TGEGTSLRGDINVCIVGDPSTAKSQFLKHVEEFSPRAVYTSGKASSAAGLTAAVVRDE
         ::.: ..:..::. . :::.:.:::.:..: .. ::. :::::.:::.:::: :..: 
CCDS61 SHTGRG-KFRAEINILLCGDPGTSKSQLLQYVYNLVPRGQYTSGKGSSAVGLTAYVMKDP
             500       510       520       530       540       550 

       440       450       460       470       480       490       
pF1KE2 ESHEFVIEAGALMLADNGVCCIDEFDKMDVRDQVAIHEAMEQQTISITKAGVKATLNART
       :....:...:::.:.:::.:::::::::.   . ..::.:::::.::.:::.   :::::
CCDS61 ETRQLVLQTGALVLSDNGICCIDEFDKMNESTRSVLHEVMEQQTLSIAKAGIICQLNART
             560       570       580       590       600       610 

       500       510       520       530       540       550       
pF1KE2 SILAAANPISGHYDRSKSLKQNINLSAPIMSRFDLFFILVDECNEVTDYAIARRIVDLHS
       :.::::::: .... .:.  .::.:   ..:::::.:.:.:  .:. :  .:...: :. 
CCDS61 SVLAAANPIESQWNPKKTTIENIQLPHTLLSRFDLIFLLLDPQDEAYDRRLAHHLVALYY
             620       630       640       650       660       670 

       560        570       580        590       600       610     
pF1KE2 RIEESIDR-VYSLDDIRRYLLFARQ-FKPKISKESEDFIVEQYKHLRQRDGSGVTKSSWR
       . ::. .. . ..  .. :. .:.. . :..:.:. . ..: :  .:.    : ...   
CCDS61 QSEEQAEEELLDMAVLKDYIAYAHSTIMPRLSEEASQALIEAYVDMRK---IGSSRGMVS
             680       690       700       710          720        

         620       630       640       650       660       670     
pF1KE2 ITVRQLESMIRLSEAMARMHCCDEVQPKHVKEAFRLLNKSIIRVETPDVNLDQEEEIQME
          :::::.:::.:: :...  ..:.   :.:: ::                        
CCDS61 AYPRQLESLIRLAEAHAKVRLSNKVEAIDVEEAKRLHREALKQSATDPRTGIVDISILTT
      730       740       750       760       770       780        

         680       690       700       710       720       730     
pF1KE2 VDEGAGGINGHADSPAPVNGINGYNEDINQESAPKASLRLGFSEYCRISNLIVLHLRKVE
                                                                   
CCDS61 GMSATSRKRKEELAEALKKLILSKGKTPALKYQQLFEDIRGQSDIAITKDMFEEALRALA
      790       800       810       820       830       840        

>>CCDS56447.1 MCM9 gene_id:254394|Hs108|chr6              (1143 aa)
 initn: 526 init1: 282 opt: 783  Z-score: 922.9  bits: 182.2 E(32554): 4.4e-45
Smith-Waterman score: 909; 30.8% identity (61.2% similar) in 637 aa overlap (28-640:11-588)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MDLAAAAEPGAGSQHLEVRDEVAEKCQKLFLDFLEEFQSSDGEIKYLQLAEELIRPERNT
                                  ..: ... :....:     : . .:  .  .  
CCDS56                  MNSDQVTLVGQVFESYVSEYHKND----ILLILKERDEDAHYP
                                10        20            30         

               70        80                 90       100           
pF1KE2 LVVSFVDLEQFNQQLSTTIQEEFYRVYPY---------LCRALKTFVKDRKE---IPLAK
       .::. . : . :....     :.. ..:          : :.  :.... ..   . . .
CCDS56 VVVNAMTLFETNMEIG-----EYFNMFPSEVLTIFDSALRRSALTILQSLSQPEAVSMKQ
      40        50             60        70        80        90    

      110       120          130       140       150       160     
pF1KE2 DFYVAFQDLPTRHK-IRELT--SSRIGLLTRISGQVVRTHPVHPELVSGTFLCLDCQTVI
       .... .. ::.  . .::    .. .: .  ..: :.::  :.       ..:  :. :.
CCDS56 NLHARISGLPVCPELVREHIPKTKDVGHFLSVTGTVIRTSLVKVLEFERDYMCNKCKHVF
          100       110       120       130       140       150    

            170       180       190           200       210        
pF1KE2 ---RDVEQQFKYTQPNICRNPVCANRRRFL----LDTNKSRFVDFQKVRIQETQAELPRG
           : :: . . .:. : .    .  .:     :... .:  :.:...:::   .:  :
CCDS56 VIKADFEQYYTFCRPSSCPSLESCDSSKFTCLSGLSSSPTRCRDYQEIKIQEQVQRLSVG
          160       170       180       190       200       210    

      220       230       240       250       260       270        
pF1KE2 SIPRSLEVILRAEAVESAQAGDKCDFTGTLIVVPDVSKLSTPGARAETNSRVSGVDGYET
       :::::..:::. . :.: ..::   . :   .: .  :     .: :.            
CCDS56 SIPRSMKVILEDDLVDSCKSGDDLTIYG---IVMQRWKPFQQDVRCEV------------
          220       230       240          250                     

      280       290       300       310       320       330        
pF1KE2 EGIRGLRALGVRDLSYRLVFLACCVAPTNPRFGGKELRDEEQTAESIKNQMTVKEWEKVF
                       ..:. :  .  .:           ::..  : .. . ::.:  .
CCDS56 ----------------EIVLKANYIQVNN-----------EQSSGIIMDEEVQKEFEDFW
                     260       270                  280       290  

      340         350       360       370       380       390      
pF1KE2 EMSQ-DKNLYHN-LCTSLFPTIHGNDEVKRGVLLMLFGGVPKTTGEGTSLRGDINVCIVG
       :. . :    .: . .:: : . :   :: .: ..: ::. .: . :: .::. .. .::
CCDS56 EYYKSDPFAGRNVILASLCPQVFGMYLVKLAVAMVLAGGIQRTDATGTRVRGESHLLLVG
            300       310       320       330       340       350  

        400       410       420       430       440       450      
pF1KE2 DPSTAKSQFLKHVEEFSPRAVYTSGKASSAAGLTAAVVRDEESHEFVIEAGALMLADNGV
       ::.:.::::::.. ...::.: :.: .:..::::...:.:  : :. .:::::.::: :.
CCDS56 DPGTGKSQFLKYAAKITPRSVLTTGIGSTSAGLTVTAVKD--SGEWNLEAGALVLADAGL
            360       370       380       390         400       410

        460       470       480       490       500       510      
pF1KE2 CCIDEFDKMDVRDQVAIHEAMEQQTISITKAGVKATLNARTSILAAANPISGHYDRSKSL
       ::::::...  .:...:::::::::::..:::.   ::.::.::::.:: .:.:: ..:.
CCDS56 CCIDEFNSLKEHDRTSIHEAMEQQTISVAKAGLVCKLNTRTTILAATNP-KGQYDPQESV
              420       430       440       450        460         

        520       530       540       550       560       570      
pF1KE2 KQNINLSAPIMSRFDLFFILVDECNEVTDYAIARRIVDLHSRIEESIDRVYSLDDIRRYL
       . :: :..:..:::::...:.:  ::  :  :.  :.. ..   .: ....:.. .. :.
CCDS56 SVNIALGSPLLSRFDLILVLLDTKNEDWDRIISSFILENKGYPSKS-EKLWSMEKMKTYF
     470       480       490       500       510        520        

        580       590       600       610       620       630      
pF1KE2 LFARQFKPKISKESEDFIVEQYKHLRQRDGSGVTKSSWRITVRQLESMIRLSEAMARMHC
        . :...: .:  ... ... :.  :: :     ... : :.: :::.:::.:: ::.  
CCDS56 CLIRNLQPTLSDVGNQVLLRYYQMQRQSD----CRNAARTTIRLLESLIRLAEAHARLMF
      530       540       550           560       570       580    

        640       650       660       670       680       690      
pF1KE2 CDEVQPKHVKEAFRLLNKSIIRVETPDVNLDQEEEIQMEVDEGAGGINGHADSPAPVNGI
        : :                                                        
CCDS56 RDTVTLEDAITVVSVMESSMQGGALLGGVNALHTSFPENPGEQYQRQCELILEKLELQSL
          590       600       610       620       630       640    

>>CCDS3043.1 MCM2 gene_id:4171|Hs108|chr3                 (904 aa)
 initn: 969 init1: 767 opt: 772  Z-score: 911.5  bits: 179.7 E(32554): 1.9e-44
Smith-Waterman score: 1095; 32.9% identity (63.0% similar) in 657 aa overlap (30-657:199-803)

                10        20        30        40        50         
pF1KE2  MDLAAAAEPGAGSQHLEVRDEVAEKCQKLFLDFLEEFQSSDGEIKYLQLAEELIRPERN
                                     : .::.   .: :.  . .   .. . .:.
CCDS30 ESIENLEDLKGHSVREWVSMAGPRLEIHHRFKNFLRTHVDSHGHNVFKERISDMCKENRE
      170       180       190       200       210       220        

      60        70        80             90        100       110   
pF1KE2 TLVVSFVDLEQFNQQLSTTIQE---EFYRVYPY--LCRALKTFVK-DRKEIPLAKDFYVA
       .:::.. ::   .. :.  . :   :. ...    :  .:  . : ::    ... ..: 
CCDS30 SLVVNYEDLAAREHVLAYFLPEAPAELLQIFDEAALEVVLAMYPKYDR----ITNHIHVR
      230       240       250       260       270           280    

           120       130       140       150       160       170   
pF1KE2 FQDLPTRHKIRELTSSRIGLLTRISGQVVRTHPVHPELVSGTFLCLDCQTVIRDVEQ-QF
       .. ::  ...: : . ... : : :: :.    : :.:    . :  :. :.    : : 
CCDS30 ISHLPLVEELRSLRQLHLNQLIRTSGVVTSCTGVLPQLSMVKYNCNKCNFVLGPFCQSQN
          290       300       310       320       330       340    

            180       190       200       210       220       230  
pF1KE2 KYTQPNICRNPVCANRRRFLLDTNKSRFVDFQKVRIQETQAELPRGSIPRSLEVILRAEA
       . ..:. :  : : .   : .. ... . ..:..::::. ...  : .::: ..:: :. 
CCDS30 QEVKPGSC--PECQSAGPFEVNMEETIYQNYQRIRIQESPGKVAAGRLPRSKDAILLADL
          350         360       370       380       390       400  

            240       250       260       270       280       290  
pF1KE2 VESAQAGDKCDFTGTLIVVPDVSKLSTPGARAETNSRVSGVDGYETEGIRGLRALGVRDL
       :.: . ::. ..::                . . .. .. ..:. .              
CCDS30 VDSCKPGDEIELTGIY--------------HNNYDGSLNTANGFPV--------------
            410                     420       430                  

            300       310       320       330       340       350  
pF1KE2 SYRLVFLACCVAPTNPRFGGKELRDEEQTAESIKNQMTVKEWEKVFEMSQDKNLYHNLCT
        .  :.::  ::  . . .  :: ::.           ::    .  .:.:... ... .
CCDS30 -FATVILANHVAKKDNKVAVGELTDED-----------VKM---ITSLSKDQQIGEKIFA
           440       450       460                     470         

            360       370       380       390       400       410  
pF1KE2 SLFPTIHGNDEVKRGVLLMLFGGVPKTTGEGTSLRGDINVCIVGDPSTAKSQFLKHVEEF
       :. :.:.:....:::. : :::: ::. :   ..:::::: . :::.::::::::..:. 
CCDS30 SIAPSIYGHEDIKRGLALALFGGEPKNPGGKHKVRGDINVLLCGDPGTAKSQFLKYIEKV
     480       490       500       510       520       530         

            420       430       440       450       460       470  
pF1KE2 SPRAVYTSGKASSAAGLTAAVVRDEESHEFVIEAGALMLADNGVCCIDEFDKMDVRDQVA
       : ::..:.:...::.:::: : :   :.:...:::::.::: ::: :::::::. .:...
CCDS30 SSRAIFTTGQGASAVGLTAYVQRHPVSREWTLEAGALVLADRGVCLIDEFDKMNDQDRTS
     540       550       560       570       580       590         

            480       490       500       510       520       530  
pF1KE2 IHEAMEQQTISITKAGVKATLNARTSILAAANPISGHYDRSKSLKQNINLSAPIMSRFDL
       ::::::::.:::.:::. ..:.:: ...::::::.:.:: : ....:..:. ::.::::.
CCDS30 IHEAMEQQSISISKAGIVTSLQARCTVIAAANPIGGRYDPSLTFSENVDLTEPIISRFDI
     600       610       620       630       640       650         

            540       550                       560       570      
pF1KE2 FFILVDECNEVTDYAIARRIVDLHSR----------------IEESIDRVYSLDDI----
       . .. :  . : :  .:: .:  : :                 : ..  .:... .    
CCDS30 LCVVRDTVDPVQDEMLARFVVGSHVRHHPSNKEEEGLANGSAAEPAMPNTYGVEPLPQEV
     660       670       680       690       700       710         

             580        590       600       610       620       630
pF1KE2 -RRYLLFARQ-FKPKISKESEDFIVEQYKHLRQRDGSGVTKSSWRITVRQLESMIRLSEA
        ..:...:..  .::... ..: ....:. ::..   ... .:  ::::..:::::..::
CCDS30 LKKYIIYAKERVHPKLNQMDQDKVAKMYSDLRKE---SMATGSIPITVRHIESMIRMAEA
     720       730       740       750          760       770      

              640       650       660       670       680       690
pF1KE2 MARMHCCDEVQPKHVKEAFRLLNKSIIRVETPDVNLDQEEEIQMEVDEGAGGINGHADSP
        ::.:  : :    :. :.:.. .:.:                                 
CCDS30 HARIHLRDYVIEDDVNMAIRVMLESFIDTQKFSVMRSMRKTFARYLSFRRDNNELLLFIL
        780       790       800       810       820       830      

>>CCDS75468.1 MCM3 gene_id:4172|Hs108|chr6                (818 aa)
 initn: 919 init1: 743 opt: 750  Z-score: 886.1  bits: 174.9 E(32554): 4.9e-43
Smith-Waterman score: 945; 31.8% identity (59.0% similar) in 622 aa overlap (92-658:88-665)

              70        80        90         100       110         
pF1KE2 VVSFVDLEQFNQQLSTTIQEEFYRVYPYLCRALKTFVK--DRKEIPLAKDFYVAFQ-DLP
                                     :::: ::   :       ..:::... .. 
CCDS75 WSCGRLREITWTSWTTRLLNNAFEELVAFQRALKDFVASIDATYAKQYEEFYVGLEGSFG
        60        70        80        90       100       110       

      120        130       140       150       160         170     
pF1KE2 TRH-KIRELTSSRIGLLTRISGQVVRTHPVHPELVSGTFLCLDCQTVI--RDVEQQFKYT
       ..: . : :::  .. .. . : :..   :.:..: ..  :   . .:  :  .     .
CCDS75 SKHVSPRTLTSCFLSCVVCVEGIVTKCSLVRPKVVRSVHYCPATKKTIERRYSDLTTLVA
       120       130       140       150       160       170       

         180       190        200       210       220       230    
pF1KE2 QPNICRNPVCANRRRFL-LDTNKSRFVDFQKVRIQETQAELPRGSIPRSLEVILRAEAVE
        :.    :.  ..   :  . . : . : : . :::   . : :..:::..:::  . :.
CCDS75 FPSSSVYPTKDEENNPLETEYGLSVYKDHQTITIQEMPEKAPAGQLPRSVDVILDDDLVD
       180       190       200       210       220       230       

          240       250       260       270       280       290    
pF1KE2 SAQAGDKCDFTGTLIVVPDVSKLSTPGARAETNSRVSGVDGYETEGIRGLRALGVRDLSY
       .:. ::. . .::   .:                   :  :  : :            ..
CCDS75 KAKPGDRVQVVGTYRCLP-------------------GKKGGYTSG------------TF
       240       250                          260                  

          300       310       320       330       340       350    
pF1KE2 RLVFLACCVAPTNPRFGGKELRDEEQTAESIKNQMTVKEWEKVFEMSQDKNLYHNLCTSL
       : :..:: :         :..  . : . : ..   .:.. :    ...:... .:  ::
CCDS75 RTVLIACNV---------KQMSKDAQPSFSAEDIAKIKKFSK----TRSKDIFDQLAKSL
        270                280       290           300       310   

          360       370       380       390       400       410    
pF1KE2 FPTIHGNDEVKRGVLLMLFGGVPKTTGEGTSLRGDINVCIVGDPSTAKSQFLKHVEEFSP
        :.:::.: ::...: .:.::: .   .:. .:::::. ..::::.::::.:..:   .:
CCDS75 APSIHGHDYVKKAILCLLLGGVERDLENGSHIRGDINILLIGDPSVAKSQLLRYVLCTAP
           320       330       340       350       360       370   

          420       430       440       450       460       470    
pF1KE2 RAVYTSGKASSAAGLTAAVVRDEESHEFVIEAGALMLADNGVCCIDEFDKMDVRDQVAIH
       ::. :.:..::..::::::. :.:. :  .::::..::: :: ::::::::.  :..:::
CCDS75 RAIPTTGRGSSGVGLTAAVTTDQETGERRLEAGAMVLADRGVVCIDEFDKMSDMDRTAIH
           380       390       400       410       420       430   

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pF1KE2 EAMEQQTISITKAGVKATLNARTSILAAANPISGHYDRSKSLKQNINLSAPIMSRFDLFF
       :.:::  ..:.:::..: :::: :.::::::. :.::. :.  .::.:.  ..:::::.:
CCDS75 EVMEQGRVTIAKAGIHARLNARCSVLAAANPVYGRYDQYKTPMENIGLQDSLLSRFDLLF
           440       450       460       470       480       490   

          540       550                                    560     
pF1KE2 ILVDECNEVTDYAIARRIVDLH-----------------------------SRIEESIDR
       :..:. .   :  :. ... .:                             :. ...  .
CCDS75 IMLDQMDPEQDREISDHVLRMHRYRAPGEQDGDAMPLGSAVDILATDDPNFSQEDQQDTQ
           500       510       520       530       540       550   

         570                         580       590       600       
pF1KE2 VYSLDD------------------IRRYLLFARQFKPKISKESEDFIVEQYKHLRQRDG-
       .:   :                  ...:.  :. .:: ...::  .:.:.:..::..:. 
CCDS75 IYEKHDNLLHGTKKKKEKMVSAAFMKKYIHVAKIIKPVLTQESATYIAEEYSRLRSQDSM
           560       570       580       590       600       610   

        610       620       630       640       650       660      
pF1KE2 SGVTKSSWRITVRQLESMIRLSEAMARMHCCDEVQPKHVKEAFRLLNKSIIRVETPDVNL
       :. :  .  .:.: ::..:::. : :. .    :. . ..:: .:.. . ..        
CCDS75 SSDTARTSPVTARTLETLIRLATAHAKARMSKTVDLQDAEEAVELVQYAYFKKVLEKEKK
           620       630       640       650       660       670   

        670       680       690       700       710       720      
pF1KE2 DQEEEIQMEVDEGAGGINGHADSPAPVNGINGYNEDINQESAPKASLRLGFSEYCRISNL
                                                                   
CCDS75 RKKRSEDESETEDEEEKSQEDQEQKRKRRKTRQPDAKDGDSYDPYDFSDTEEEMPQVHTP
           680       690       700       710       720       730   

>>CCDS4940.2 MCM3 gene_id:4172|Hs108|chr6                 (853 aa)
 initn: 971 init1: 743 opt: 750  Z-score: 885.8  bits: 174.9 E(32554): 5.1e-43
Smith-Waterman score: 1013; 30.9% identity (59.2% similar) in 713 aa overlap (2-658:35-700)

                                            10        20         30
pF1KE2                              MDLAAAAEPGAGSQHLEVRDEVA-EKCQKLF
                                     :.....  .::     : :.:  .. :. .
CCDS49 SPPLPRGNLWWREEFGSFRAGVESSWEPPRDFGGGSSLAAGMAGTVVLDDVELREAQRDY
           10        20        30        40        50        60    

               40        50        60        70        80        90
pF1KE2 LDFLEEFQSSDGEIKYLQLAEELIRPERNTLVVSFVDLEQFNQQLSTTIQEEFYRVYPYL
       ::::.. .  :  : : . ..:::  ..  :.:.  ::.. :.. .. . .. ..    .
CCDS49 LDFLDDEE--DQGI-YQSKVRELISDNQYRLIVNVNDLRRKNEKRANRLLNNAFEELVAF
           70           80        90       100       110       120 

                100       110        120        130       140      
pF1KE2 CRALKTFVK--DRKEIPLAKDFYVAFQ-DLPTRH-KIRELTSSRIGLLTRISGQVVRTHP
        :::: ::   :       ..:::... .. ..: . : :::  .. .. . : :..   
CCDS49 QRALKDFVASIDATYAKQYEEFYVGLEGSFGSKHVSPRTLTSCFLSCVVCVEGIVTKCSL
             130       140       150       160       170       180 

        150       160         170       180       190        200   
pF1KE2 VHPELVSGTFLCLDCQTVI--RDVEQQFKYTQPNICRNPVCANRRRFL-LDTNKSRFVDF
       :.:..: ..  :   . .:  :  .     . :.    :.  ..   :  . . : . : 
CCDS49 VRPKVVRSVHYCPATKKTIERRYSDLTTLVAFPSSSVYPTKDEENNPLETEYGLSVYKDH
             190       200       210       220       230       240 

           210       220       230       240       250       260   
pF1KE2 QKVRIQETQAELPRGSIPRSLEVILRAEAVESAQAGDKCDFTGTLIVVPDVSKLSTPGAR
       : . :::   . : :..:::..:::  . :..:. ::. . .::   .:           
CCDS49 QTITIQEMPEKAPAGQLPRSVDVILDDDLVDKAKPGDRVQVVGTYRCLP-----------
             250       260       270       280       290           

           270       280       290       300       310       320   
pF1KE2 AETNSRVSGVDGYETEGIRGLRALGVRDLSYRLVFLACCVAPTNPRFGGKELRDEEQTAE
               :  :  : :            ..: :..:: :         :..  . : . 
CCDS49 --------GKKGGYTSG------------TFRTVLIACNV---------KQMSKDAQPSF
                                  300       310                320 

           330       340       350       360       370       380   
pF1KE2 SIKNQMTVKEWEKVFEMSQDKNLYHNLCTSLFPTIHGNDEVKRGVLLMLFGGVPKTTGEG
       : ..   .:.. :    ...:... .:  :: :.:::.: ::...: .:.::: .   .:
CCDS49 SAEDIAKIKKFSK----TRSKDIFDQLAKSLAPSIHGHDYVKKAILCLLLGGVERDLENG
             330           340       350       360       370       

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pF1KE2 TSLRGDINVCIVGDPSTAKSQFLKHVEEFSPRAVYTSGKASSAAGLTAAVVRDEESHEFV
       . .:::::. ..::::.::::.:..:   .:::. :.:..::..::::::. :.:. :  
CCDS49 SHIRGDINILLIGDPSVAKSQLLRYVLCTAPRAIPTTGRGSSGVGLTAAVTTDQETGERR
       380       390       400       410       420       430       

           450       460       470       480       490       500   
pF1KE2 IEAGALMLADNGVCCIDEFDKMDVRDQVAIHEAMEQQTISITKAGVKATLNARTSILAAA
       .::::..::: :: ::::::::.  :..::::.:::  ..:.:::..: :::: :.::::
CCDS49 LEAGAMVLADRGVVCIDEFDKMSDMDRTAIHEVMEQGRVTIAKAGIHARLNARCSVLAAA
       440       450       460       470       480       490       

           510       520       530       540       550             
pF1KE2 NPISGHYDRSKSLKQNINLSAPIMSRFDLFFILVDECNEVTDYAIARRIVDLH-------
       ::. :.::. :.  .::.:.  ..:::::.::..:. .   :  :. ... .:       
CCDS49 NPVYGRYDQYKTPMENIGLQDSLLSRFDLLFIMLDQMDPEQDREISDHVLRMHRYRAPGE
       500       510       520       530       540       550       

                              560       570                        
pF1KE2 ----------------------SRIEESIDRVYSLDD------------------IRRYL
                             :. ...  ..:   :                  ...:.
CCDS49 QDGDAMPLGSAVDILATDDPNFSQEDQQDTQIYEKHDNLLHGTKKKKEKMVSAAFMKKYI
       560       570       580       590       600       610       

        580       590       600        610       620       630     
pF1KE2 LFARQFKPKISKESEDFIVEQYKHLRQRDG-SGVTKSSWRITVRQLESMIRLSEAMARMH
         :. .:: ...::  .:.:.:..::..:. :. :  .  .:.: ::..:::. : :. .
CCDS49 HVAKIIKPVLTQESATYIAEEYSRLRSQDSMSSDTARTSPVTARTLETLIRLATAHAKAR
       620       630       640       650       660       670       

         640       650       660       670       680       690     
pF1KE2 CCDEVQPKHVKEAFRLLNKSIIRVETPDVNLDQEEEIQMEVDEGAGGINGHADSPAPVNG
           :. . ..:: .:.. . ..                                     
CCDS49 MSKTVDLQDAEEAVELVQYAYFKKVLEKEKKRKKRSEDESETEDEEEKSQEDQEQKRKRR
       680       690       700       710       720       730       

>>CCDS13094.1 MCM8 gene_id:84515|Hs108|chr20              (840 aa)
 initn: 587 init1: 290 opt: 663  Z-score: 782.5  bits: 155.8 E(32554): 2.9e-37
Smith-Waterman score: 885; 28.5% identity (59.7% similar) in 737 aa overlap (13-701:104-788)

                                 10          20        30        40
pF1KE2                   MDLAAAAEPGAGSQHLEV--RDEVAEKCQKLFLDFLEEFQSS
                                     ..:...  .::. :.  ....:: :   . 
CCDS13 PYKGWKLYFSEVYSDSSPLIEKIQAFEKFFTRHIDLYDKDEI-ERKGSILVDFKE--LTE
            80        90       100       110        120         130

                 50        60        70         80        90       
pF1KE2 DGEIKYL--QLAEELIRPERNTLVVSFVDLEQ-FNQQLSTTIQEEFYRVYPYLCRALKTF
        ::.  :  ..: ::    ..::.   . ..: ....:     :   ..   :    .:.
CCDS13 GGEVTNLIPDIATELRDAPEKTLACMGLAIHQVLTKDLERHAAE--LQAQEGLSNDGETM
              140       150       160       170         180        

       100       110       120       130       140       150       
pF1KE2 VKDRKEIPLAKDFYVAFQDLPTRHKIRELTSSRIGLLTRISGQVVRTHPVHPELVSGTFL
       :.    .:  .     .. :   ...:   ..  :    . : :::.  ..:  .. .::
CCDS13 VN----VPHIHARVYNYEPLTQLKNVR---ANYYGKYIALRGTVVRVSNIKPLCTKMAFL
      190           200       210          220       230       240 

       160       170       180       190        200       210      
pF1KE2 CLDCQTVIRDVEQQFKYTQPNICRNPVCANRRRFLLDTNK-SRFVDFQKVRIQETQAELP
       :  :  .      . ::. :. :  ::: .:    : ..  .  .:.:...::: ...  
CCDS13 CAACGEIQSFPLPDGKYSLPTKCPVPVCRGRSFTALRSSPLTVTMDWQSIKIQELMSDDQ
             250       260       270       280       290       300 

          220       230       240       250       260       270    
pF1KE2 R--GSIPRSLEVILRAEAVESAQAGDKCDFTGTLIVVPDVSKLSTPGARAETNSRVSGVD
       :  : :::..:  :  . :.:   ::   .::       . :.:.    :: .:: ..  
CCDS13 REAGRIPRTIECELVHDLVDSCVPGDTVTITG-------IVKVSN----AEEGSRNKN--
             310       320       330                  340          

          280       290       300       310       320       330    
pF1KE2 GYETEGIRGLRALGVRDLSYRLVFLACCVAPTNPRFGGKELRDEEQTAESIKNQMTVKEW
                       :  . :...    . .: . : :   .:.   ...  ....:. 
CCDS13 ----------------DKCMFLLYIEAN-SISNSK-GQKTKSSEDGCKHGMLMEFSLKDL
                      350       360         370       380       390

          340       350       360       370       380         390  
pF1KE2 EKVFEMSQDKNLYHNLCTSLFPTIHGNDEVKRGVLLMLFGGVPKTTGEGTSL--RGDINV
         . :.. ..::.. . .:: :.: :.. :: :. : ::::  : . . . .  ::: ..
CCDS13 YAIQEIQAEENLFKLIVNSLCPVIFGHELVKAGLALALFGGSQKYADDKNRIPIRGDPHI
              400       410       420       430       440       450

            400       410       420       430       440       450  
pF1KE2 CIVGDPSTAKSQFLKHVEEFSPRAVYTSGKASSAAGLTAAVVRDEESHEFVIEAGALMLA
        .::::. .:::.:. . . .::.::. :......:::... .:  : .:..:::::.:.
CCDS13 LVVGDPGLGKSQMLQAACNVAPRGVYVCGNTTTTSGLTVTLSKDSSSGDFALEAGALVLG
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            460       470       480       490       500       510  
pF1KE2 DNGVCCIDEFDKMDVRDQVAIHEAMEQQTISITKAGVKATLNARTSILAAANPISGHYDR
       :.:.: :::::::  . : :. ::::::.::..::::  .: :::::.:::::..:::..
CCDS13 DQGICGIDEFDKMGNQHQ-ALLEAMEQQSISLAKAGVVCSLPARTSIIAAANPVGGHYNK
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pF1KE2 SKSLKQNINLSAPIMSRFDLFFILVDECNEVTDYAIARRIVDLHSRIEESID-----RVY
       .:....:..... ..::::: :::.:  ::  :. ...... ...  ...:.     :. 
CCDS13 AKTVSENLKMGSALLSRFDLVFILLDTPNEHHDHLLSEHVIAIRAGKQRTISSATVARMN
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pF1KE2 SLDD--------------------------------IRRYLLFARQF-KPKISKESEDFI
       : :.                                .:.:. .:::.  :..: :.   .
CCDS13 SQDSNTSVLEVVSEKPLSERLKVVPGETIDPIPHQLLRKYIGYARQYVYPRLSTEAARVL
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pF1KE2 VEQYKHLRQRDGSGVTKSSWRITVRQLESMIRLSEAMARMHCCDEVQPKHVKEAFRLLNK
        . : .::..  :   .::  ::.:::::.:::.:: ::..  .:.  . ...  .... 
CCDS13 QDFYLELRKQ--SQRLNSS-PITTRQLESLIRLTEARARLELREEATKEDAEDIVEIMKY
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pF1KE2 SIIRVETPDVNLDQEEEIQMEVDEGAGGINGHADSPAPVNGINGYNEDINQESAPKASLR
       :.. . .     :.  ....: .. ..:..... .   ....:.  :             
CCDS13 SMLGTYS-----DEFGNLDFERSQHGSGMSNRSTAKRFISALNNVAERTYNNIFQFHQLR
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CCDS13 QIAKELNIQVADFENFIGSLNDQGYLLKKGPKVYQLQTM                     
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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