Result of SIM4 for pF1KE6370

seq1 = pF1KE6370.tfa, 978 bp
seq2 = pF1KE6370/gi568815597f_227715717.tfa (gi568815597f:227715717_227946205), 230489 bp

>pF1KE6370 978
>gi568815597f:227715717_227946205 (Chr1)

1-148  (100001-100148)   100% ->
149-311  (100374-100536)   100% ->
312-583  (101493-101764)   99% ->
584-726  (129754-129896)   99% ->
727-978  (130238-130489)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGCCCCTGCTTCCGTCATGGGCCCACTCGGGCCCTCTGCCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGCCCCTGCTTCCGTCATGGGCCCACTCGGGCCCTCTGCCCTGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTTCTGCTGCTGCTCCTGGTGGTGGCCCCTCCCCGGGTCGCAGCATTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTTCTGCTGCTGCTCCTGGTGGTGGCCCCTCCCCGGGTCGCAGCATTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCCACAGACAGCCAGAGAACCAGGGAATCTCCCTAACTGGCAGCGTGG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100101 TCCACAGACAGCCAGAGAACCAGGGAATCTCCCTAACTGGCAGCGTGGGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    149        CCTGTGGTCGGCCCAGCATGGAGGGGAAAATCCTGGGCGGCGT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 A...CAGCCTGTGGTCGGCCCAGCATGGAGGGGAAAATCCTGGGCGGCGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCCTGCGCCCGAGAGGAAGTGGCCGTGGCAGGTCAGCGTGCACTACGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100417 CCCTGCGCCCGAGAGGAAGTGGCCGTGGCAGGTCAGCGTGCACTACGCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCCTCCACGTCTGCGGCGGCTCCATCCTCAATGAGTACTGGGTGCTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100467 GCCTCCACGTCTGCGGCGGCTCCATCCTCAATGAGTACTGGGTGCTGTCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCTGCGCACTGCTTTCACAG         GGACAAGAATATCAAAATCTA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100517 GCTGCGCACTGCTTTCACAGGTA...CAGGGACAAGAATATCAAAATCTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGACATGTACGTAGGCCTCGTAAACCTCAGGGTGGACGGCAACCACACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
 101514 TGACATGTACGTAGGCCTCGTAAACCTCAGGGTGGCCGGCAACCACACCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGTGGTATGAGGTGAACAGGGTGATCCTGCACCCCACATATGAGATGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101564 AGTGGTATGAGGTGAACAGGGTGATCCTGCACCCCACATATGAGATGTAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CACCCCATCGGAGGTGACGTGGCCCTGGTGCAGCTGAAGACCCGCATTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101614 CACCCCATCGGAGGTGACGTGGCCCTGGTGCAGCTGAAGACCCGCATTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GTTTTCTGAGTCCGTGCTCCCGGTTTGCCTTGCAACTCCAGAAGTGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101664 GTTTTCTGAGTCCGTGCTCCCGGTTTGCCTTGCAACTCCAGAAGTGAACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TTACCAGTGCCAATTGCTGGGCTACGGGATGGGGACTAGTCTCAAAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101714 TTACCAGTGCCAATTGCTGGGCTACGGGATGGGGACTAGTCTCAAAACAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 G         GTGAGACCTCAGACGAGCTGCAGGAGGTGCAGCTCCCGCT
        |>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
 101764 GGTA...CAGGTGAGACCTCAGACGAGCTGCAGGAGATGCAGCTCCCGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GATCCTGGAGCCCTGGTGCCACCTGCTCTACGGACACATGTCCTACATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129794 GATCCTGGAGCCCTGGTGCCACCTGCTCTACGGACACATGTCCTACATCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TGCCCGACATGCTGTGTGCTGGGGACATCCTGAATGCTAAGACCGTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129844 TGCCCGACATGCTGTGTGCTGGGGACATCCTGAATGCTAAGACCGTGTGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GAG         GGCGACTCCGGGGGCCCACTTGTCTGTGAATTCAACCG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129894 GAGGTG...TAGGGCGACTCCGGGGGCCCACTTGTCTGTGAATTCAACCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CAGCTGGTTGCAGATTGGAATTGTGAGCTGGGGCCGAGGCTGCTCCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130276 CAGCTGGTTGCAGATTGGAATTGTGAGCTGGGGCCGAGGCTGCTCCAACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 CTCTGTACCCTGGAGTGTATGCCAGTGTTTCCTATTTCTCAAAATGGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130326 CTCTGTACCCTGGAGTGTATGCCAGTGTTTCCTATTTCTCAAAATGGATA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 TGTGATAACATAGAAATCACGCCCACTCCTGCTCAGCCAGCCCCTGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130376 TGTGATAACATAGAAATCACGCCCACTCCTGCTCAGCCAGCCCCTGCTCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CTCTCCAGCTCTGGGGCCCACTCTCAGCGTCCTAATGGCCATGCTGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130426 CTCTCCAGCTCTGGGGCCCACTCTCAGCGTCCTAATGGCCATGCTGGCTG

   1000     .    :
    965 GCTGGTCAGTGCTG
        ||||||||||||||
 130476 GCTGGTCAGTGCTG

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