seq1 = pF1KE3960.tfa, 1686 bp seq2 = pF1KE3960/gi568815597r_117012308.tfa (gi568815597r:117012308_117221201), 208894 bp >pF1KE3960 1686 >gi568815597r:117012308_117221201 (Chr1) (complement) 1-488 (100001-100488) 99% -> 489-1168 (102435-103114) 99% -> 1169-1298 (104457-104586) 100% -> 1299-1413 (105513-105627) 100% -> 1414-1540 (107717-107843) 99% -> 1541-1686 (108749-108894) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGTCAGAAAACAGAAAAACGCTGCTGGGCTTTGTAAGCAAACTCACTAG |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGTCAGAAAACAGAAAACCGCTGCTGGGCTTTGTAAGCAAACTCACTAG 50 . : . : . : . : . : 51 TGGGACTGCACTTGGGAACTCAGGCAAGACTCACTGCCCCCTGTGCTTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 TGGGACTGCACTTGGGAACTCAGGCAAGACTCACTGCCCCCTGTGCTTGG 100 . : . : . : . : . : 101 GGCTTTTCAAAGCCCCCAGGCTCTTGCCTTGTTTGCATACAGTTTGCACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100101 GGCTTTTCAAAGCCCCCAGGCTCTTGCCTTGTTTGCATACAGTTTGCACC 150 . : . : . : . : . : 151 ACGTGTCTGGAGCAGCTGGAGCCCTTCTCAGTAGTGGACATCCGAGGGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100151 ACGTGTCTGGAGCAGCTGGAGCCCTTCTCAGTAGTGGACATCCGAGGGGG 200 . : . : . : . : . : 201 AGACTCTGACACAAGCTCTGAGGGGTCAATATTCCAGGAACTCAAGCCAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100201 AGACTCTGACACAAGCTCTGAGGGGTCAATATTCCAGGAACTCAAGCCAC 250 . : . : . : . : . : 251 GAAGTCTGCAGTCGCAGATCGGCATCCTTTGTCCTGTATGTGATGCTCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100251 GAAGTCTGCAGTCGCAGATCGGCATCCTTTGTCCTGTATGTGATGCTCAG 300 . : . : . : . : . : 301 GTGGACCTGCCCATGGGTGGAGTGAAGGCTTTAACCATAGACCACCTGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100301 GTGGACCTGCCCATGGGTGGAGTGAAGGCTTTAACCATAGACCACCTGGC 350 . : . : . : . : . : 351 CGTGAATGATGTGATGCTGGAGAGCCTACGTGGGGAAGGCCAGGGCCTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100351 CGTGAATGATGTGATGCTGGAGAGCCTACGTGGGGAAGGCCAGGGCCTGG 400 . : . : . : . : . : 401 TGTGTGACCTGTGCAACGACAGGGAAGTAGAGAAGAGGTGTCAGACCTGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100401 TGTGTGACCTGTGCAACGACAGGGAAGTAGAGAAGAGGTGTCAGACCTGC 450 . : . : . : . : . : 451 AAAGCCAACCTCTGCCACTTCTGCTGCCAGGCTCATAG GCG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||| 100451 AAAGCCAACCTCTGCCACTTCTGCTGCCAGGCTCATAGGTA...TAGGCG 500 . : . : . : . : . : 492 GCAGAAGAAAACGACTTACCACACCATGGTGGACCTAAAAGACTTGAAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 102438 GCAGAAGAAAACGACTTACCACACCATGGTGGACCTAAAAGACTTGAAAG 550 . : . : . : . : . : 542 GCTACAGCCGGATTGGGAAGCCCATCCTGTGTCCTGTTCACCCTGCAGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 102488 GCTACAGCCGGATTGGGAAGCCCATCCTGTGTCCTGTTCACCCTGCAGAG 600 . : . : . : . : . : 592 GAACTGAGGCTGTTCTGTGAGTTCTGTGACCGGCCCGTGTGCCAGGATTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 102538 GAACTGAGGCTGTTCTGTGAGTTCTGTGACCGGCCCGTGTGCCAGGATTG 650 . : . : . : . : . : 642 TGTGGTGGGGGAGCATCGGGAACACCCCTGTGACTTCACCAGCAATGTCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 102588 TGTGGTGGGGGAGCATCGGGAACACCCCTGTGACTTCACCAGCAATGTCA 700 . : . : . : . : . : 692 TCCACAAGCATGGGGACTCTGTGTGGGAGCTCCTCAAAGATACTCAGCCC ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| 102638 TCCACAAGCATGGGGACTCTGTGTGGGAGCTCCTCAAAGGTACTCAGCCC 750 . : . : . : . : . : 742 CACGTGGAGGCCCTGGAGGAAGCCCTGGCTCAGATCCACATAATAAACAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 102688 CACGTGGAGGCCCTGGAGGAAGCCCTGGCTCAGATCCACATAATAAACAG 800 . : . : . : . : . : 792 TGCCCTCCAGAAGCGAGTGGAGGCAGTGGCAGCTGATGTCCGGACATTCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 102738 TGCCCTCCAGAAGCGAGTGGAGGCAGTGGCAGCTGATGTCCGGACATTCT 850 . : . : . : . : . : 842 CGGAGGGCTACATTAAGGCCATTGAGGAGCATCGGGACAAGCTGCTGAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 102788 CGGAGGGCTACATTAAGGCCATTGAGGAGCATCGGGACAAGCTGCTGAAG 900 . : . : . : . : . : 892 CAGCTGGAAGACATACGGGCCCAGAAGGAAAATTCCCTGCAGCTGCAGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 102838 CAGCTGGAAGACATACGGGCCCAGAAGGAAAATTCCCTGCAGCTGCAGAA 950 . : . : . : . : . : 942 GGCCCAGCTGGAACAGTTACTGGCAGACATGCGGACTGGAGTGGAGTTCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 102888 GGCCCAGCTGGAACAGTTACTGGCAGACATGCGGACTGGAGTGGAGTTCA 1000 . : . : . : . : . : 992 CCGAGCACTTGCTGACCAGCGGCTCAGACTTGGAGATCCTCATCACCAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 102938 CCGAGCACTTGCTGACCAGCGGCTCAGACTTGGAGATCCTCATCACCAAG 1050 . : . : . : . : . : 1042 AGGGTGGTGGTAGAACGGCTCAGGAAGCTGAACAAAGTTCAATATAGCAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 102988 AGGGTGGTGGTAGAACGGCTCAGGAAGCTGAACAAAGTTCAATATAGCAC 1100 . : . : . : . : . : 1092 CCGTCCTGGAGTAAATGATAAGATACGCTTCTGTCCTCAGGAGAAAGCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103038 CCGTCCTGGAGTAAATGATAAGATACGCTTCTGTCCTCAGGAGAAAGCAG 1150 . : . : . : . : . : 1142 GCCAGTGCCGTGGCTATGAAATTTATG ACCTCCACAGAGCC |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||| 103088 GCCAGTGCCGTGGCTATGAAATTTATGGTA...CAGACCTCCACAGAGCC 1200 . : . : . : . : . : 1183 CGGGAGAAACAGACGGCCTCTTTCACCCTGCTTTGTAAGGATGCCGCAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104471 CGGGAGAAACAGACGGCCTCTTTCACCCTGCTTTGTAAGGATGCCGCAGG 1250 . : . : . : . : . : 1233 AGAAATCATGGGCAGGGGAGGAGACAACGTTCAAGTTGCCGTTGTCCCTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104521 AGAAATCATGGGCAGGGGAGGAGACAACGTTCAAGTTGCCGTTGTCCCTA 1300 . : . : . : . : . : 1283 AAGATAAGAAAGACAG CCCAGTCAGAACAATGGTCCAGGAT ||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||| 104571 AAGATAAGAAAGACAGGTT...CAGCCCAGTCAGAACAATGGTCCAGGAT 1350 . : . : . : . : . : 1324 AACAAGGATGGGACATACTACATTTCCTACACCCCCAAGGAACCTGGCGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105538 AACAAGGATGGGACATACTACATTTCCTACACCCCCAAGGAACCTGGCGT 1400 . : . : . : . : . : 1374 CTATACTGTGTGGGTCTGCATCAAAGAACAGCATGTGCAG G ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>| 105588 CTATACTGTGTGGGTCTGCATCAAAGAACAGCATGTGCAGGTA...CAGG 1450 . : . : . : . : . : 1415 GCTCGCCATTCACTGTGACGGTGAGGAGAAAGCACCGCCCACACTCAGGC |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| 107718 GCTCGCCATTCACTGTGATGGTGAGGAGAAAGCACCGCCCACACTCAGGC 1500 . : . : . : . : . : 1465 GTGTTTCACTGCTGCACCTTCTGCTCCAGCGGGGGCCAGAAAACCGCTCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107768 GTGTTTCACTGCTGCACCTTCTGCTCCAGCGGGGGCCAGAAAACCGCTCG 1550 . : . : . : . : . : 1515 CTGCGCCTGTGGAGGCACCATGCCAG GTGGGTACCTAGGCT ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||| 107818 CTGCGCCTGTGGAGGCACCATGCCAGGTA...TAGGTGGGTACCTAGGCT 1600 . : . : . : . : . : 1556 GTGGCCATGGACACAAAGGCCACCCAGGTCATCCCCACTGGTCATGCTGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 108764 GTGGCCATGGACACAAAGGCCACCCAGGTCATCCCCACTGGTCATGCTGT 1650 . : . : . : . : . : 1606 GGAAAATTTAATGAGAAATCTGAATGCACATGGACAGGTGGGCAGAGCGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 108814 GGAAAATTTAATGAGAAATCTGAATGCACATGGACAGGTGGGCAGAGCGC 1700 . : . : . : 1656 ACCGAGGAGTCTACTTAGGACTGTGGCTCTC ||||||||||||||||||||||||||||||| 108864 ACCGAGGAGTCTACTTAGGACTGTGGCTCTC