seq1 = pF1KE5740.tfa, 2106 bp seq2 = pF1KE5740/gi568815597r_6425857.tfa (gi568815597r:6425857_6654502), 228646 bp >pF1KE5740 2106 >gi568815597r:6425857_6654502 (Chr1) (complement) 1-396 (100001-100396) 98% -> 397-616 (103888-104107) 100% -> 617-744 (104805-104932) 100% -> 745-880 (109323-109458) 100% -> 881-977 (109581-109677) 100% -> 978-1075 (112576-112673) 100% -> 1076-1237 (121062-121223) 100% -> 1238-1535 (121743-122040) 100% -> 1536-1647 (122424-122535) 100% -> 1648-1825 (125332-125509) 100% -> 1826-1959 (127674-127807) 100% -> 1960-2106 (128500-128646) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGCGGACTCGGGACTGCTGCTAAAGTGGGGTTCCTGCCGTTCCACTTG ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| 100001 ATGGCGGACTCGGGACTGCTGCTAAAGCGGGGTTCCTGCCGTTCCACTTG 50 . : . : . : . : . : 51 GCTGCGGGTCCGCAAGGCCCGGCCCCAGCTCATCCTCAGCCGCCGGCCCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 GCTGCGGGTCCGCAAGGCCCGGCCCCAGCTCATCCTCAGCCGCCGGCCCC 100 . : . : . : . : . : 101 GCCGCCGGCTCGGGAGCCTGCGCTGGTGCGGTCGGCGGCGCCTACGGCGG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || 100101 GCCGCCGGCTCGGGAGCCTGCGCTGGTGCGGTCGGCGGCGCCTACGGTGG 150 . : . : . : . : . : 151 CGGTTACTGCAAGCCCAGGCGGCCGGCGTGGACTGGAGGGAGGGAGCCCG ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| 100151 CGGTTACTGCAAGCCCAGGCGTCCGGCGTGGACTGGAGGGAGGGAGCCCG 200 . : . : . : . : . : 201 CCAGGTGTCGCGTGCGGCGGCGGCCCGGAGACCCAACACCGCGACCCCCA |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100201 CCAGGTGTCGCGCGCGGCGGCGGCCCGGAGACCCAACACCGCGACCCCCA 250 . : . : . : . : . : 251 GCCCGATCCCTAGCCCGACCCCGGCCTCCGAACCCGAGTCCGAACCCGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100251 GCCCGATCCCTAGCCCGACCCCGGCCTCCGAACCCGAGTCCGAACCCGAA 300 . : . : . : . : . : 301 CTCGAATCCGCCTCGAGTTGCCACCGGCCTCTCCTCATCCCACCGGTGCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100301 CTCGAATCCGCCTCGAGTTGCCACCGGCCTCTCCTCATCCCACCGGTGCG 350 . : . : . : . : . : 351 GCCCGTGGGCCCCGGCCGCGCGTTGCTGCTGCTGCCGGTCGAGCAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>. 100351 GCCCGTGGGCCCCGGCCGCGCGTTGCTGCTGCTGCCGGTCGAGCAGGTA. 400 . : . : . : . : . : 397 GGTTTTACTTTTAGTGGGATCTGTCGTGTGACTTGCCTCTATGGC ..>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100401 ..TAGGGTTTTACTTTTAGTGGGATCTGTCGTGTGACTTGCCTCTATGGC 450 . : . : . : . : . : 442 CAGGTGCAGGTATTTGGTTTTACCATCAGCCAAGGCCAGCCTGCCCAAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103933 CAGGTGCAGGTATTTGGTTTTACCATCAGCCAAGGCCAGCCTGCCCAAGA 500 . : . : . : . : . : 492 CATCTTCTCTGTGTATACCCACTCTTGCTTGAGTATCCATGCACTTCACT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103983 CATCTTCTCTGTGTATACCCACTCTTGCTTGAGTATCCATGCACTTCACT 550 . : . : . : . : . : 542 ACTCACAGCCTGAGAAAAGCAAGAAGGAACTGAAAAGGGAAGCCCGGAAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104033 ACTCACAGCCTGAGAAAAGCAAGAAGGAACTGAAAAGGGAAGCCCGGAAT 600 . : . : . : . : . : 592 TTGCTCAAATCTCATCTTAACCTTG ATGACAGGCGTTGGTC |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||| 104083 TTGCTCAAATCTCATCTTAACCTTGGTA...CAGATGACAGGCGTTGGTC 650 . : . : . : . : . : 633 GATGCAGAATTTTTCTCCTCAGTGTTCCATTGTGTTGCTAGAACATCTGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104821 GATGCAGAATTTTTCTCCTCAGTGTTCCATTGTGTTGCTAGAACATCTGA 700 . : . : . : . : . : 683 AAACTGCCACTGTAAACTTCATAACCAGCTATCCGGGTTCATCCTACATT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104871 AAACTGCCACTGTAAACTTCATAACCAGCTATCCGGGTTCATCCTACATT 750 . : . : . : . : . : 733 TTTGTGCAAGAG AGTCCAACTCCCCAGATTAAACCTGAATA ||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||| 104921 TTTGTGCAAGAGGTA...CAGAGTCCAACTCCCCAGATTAAACCTGAATA 800 . : . : . : . : . : 774 TTTAGCCTTGAGGTCTGTTGGCATCAGAAGAGAGAAAAAAAGGAAAGGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 109352 TTTAGCCTTGAGGTCTGTTGGCATCAGAAGAGAGAAAAAAAGGAAAGGCC 850 . : . : . : . : . : 824 TTCAGTTAACTGAGAGTACCCTTTCAGCCCTGGAAGAGTTAGTCAATGTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 109402 TTCAGTTAACTGAGAGTACCCTTTCAGCCCTGGAAGAGTTAGTCAATGTT 900 . : . : . : . : . : 874 TCCTGTG AAGAAGTAGATGGCTGCCCTGTCATTCTAGTTTG |||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||| 109452 TCCTGTGGTG...CAGAAGAAGTAGATGGCTGCCCTGTCATTCTAGTTTG 950 . : . : . : . : . : 915 TGGATCCCAGGATGTTGGAAAGTCAACATTTAATAGATACCTGATTAACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 109615 TGGATCCCAGGATGTTGGAAAGTCAACATTTAATAGATACCTGATTAACC 1000 . : . : . : . : . : 965 ATTTGTTAAATAG TCTTCCCTGCGTTGACTATTTGGAATGT |||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||| 109665 ATTTGTTAAATAGGTA...CAGTCTTCCCTGCGTTGACTATTTGGAATGT 1050 . : . : . : . : . : 1006 GATCTGGGACAGACAGAATTTACCCCTCCTGGTTGCATTTCTTTGCTTAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112604 GATCTGGGACAGACAGAATTTACCCCTCCTGGTTGCATTTCTTTGCTTAA 1100 . : . : . : . : . : 1056 TATTACAGAACCAGTTCTGG GACCACCTTTCACTCACCTGA ||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||| 112654 TATTACAGAACCAGTTCTGGGTA...TAGGACCACCTTTCACTCACCTGA 1150 . : . : . : . : . : 1097 GGACTCCACAGAAGATGGTATATTATGGGAAACCTTCTTGTAAAAACAAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 121083 GGACTCCACAGAAGATGGTATATTATGGGAAACCTTCTTGTAAAAACAAC 1200 . : . : . : . : . : 1147 TATGAGAATTATATTGACATAGTGAAATATGTGTTCAGCGCTTACAAGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 121133 TATGAGAATTATATTGACATAGTGAAATATGTGTTCAGCGCTTACAAGAG 1250 . : . : . : . : . : 1197 AGAGTCCCCTCTCATCGTCAACACTATGGGATGGGTTTCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>> 121183 AGAGTCCCCTCTCATCGTCAACACTATGGGATGGGTTTCAGGTA...CAG 1300 . : . : . : . : . : 1238 ACCAGGGGCTCCTGCTTCTCATTGATCTGATCCGATTGCTGTCTCCCAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 121743 ACCAGGGGCTCCTGCTTCTCATTGATCTGATCCGATTGCTGTCTCCCAGC 1350 . : . : . : . : . : 1288 CACGTGGTTCAGTTCCGCTCTGACCACAGTAAATATATGCCAGACCTTAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 121793 CACGTGGTTCAGTTCCGCTCTGACCACAGTAAATATATGCCAGACCTTAC 1400 . : . : . : . : . : 1338 CCCGCAGTATGTAGATGACATGGATGGCTTGTACACAAAAAGCAAGACCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 121843 CCCGCAGTATGTAGATGACATGGATGGCTTGTACACAAAAAGCAAGACCA 1450 . : . : . : . : . : 1388 AGATGAGAAATCGACGTTTCAGACTCGCAGCATTTGCAGATGCTTTGGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 121893 AGATGAGAAATCGACGTTTCAGACTCGCAGCATTTGCAGATGCTTTGGAA 1500 . : . : . : . : . : 1438 TTTGCTGATGAAGAAAAAGAGAGTCCAGTTGAGTTCACTGGACATAAACT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 121943 TTTGCTGATGAAGAAAAAGAGAGTCCAGTTGAGTTCACTGGACATAAACT 1550 . : . : . : . : . : 1488 GATAGGTGTTTATACAGACTTTGCATTCAGAATAACTCCAAGAAATAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>> 121993 GATAGGTGTTTATACAGACTTTGCATTCAGAATAACTCCAAGAAATAGGT 1600 . : . : . : . : . : 1536 AGAGTCACATAACAAAATTCTTCGAGATCTGTCCATCTTGAGT >...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 122043 A...CAGAGAGTCACATAACAAAATTCTTCGAGATCTGTCCATCTTGAGT 1650 . : . : . : . : . : 1579 TACCTTAGCCAGCTGCAGCCCCCGATGCCCAAACCACTTTCTCCTTTACA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 122467 TACCTTAGCCAGCTGCAGCCCCCGATGCCCAAACCACTTTCTCCTTTACA 1700 . : . : . : . : . : 1629 TAGCCTGACACCCTATCAG GTCCCTTTCAATGCAGTCGCAC |||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||| 122517 TAGCCTGACACCCTATCAGGTA...CAGGTCCCTTTCAATGCAGTCGCAC 1750 . : . : . : . : . : 1670 TCCGGATTACCCACTCTGATGTCGCCCCTACCCATATACTATATGCTGTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 125354 TCCGGATTACCCACTCTGATGTCGCCCCTACCCATATACTATATGCTGTA 1800 . : . : . : . : . : 1720 AACGCCAGCTGGGTTGGTCTTTGCAAGATCCAGGATGACGTCAGAGGATA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 125404 AACGCCAGCTGGGTTGGTCTTTGCAAGATCCAGGATGACGTCAGAGGATA 1850 . : . : . : . : . : 1770 CACGAATGGGCCCATCCTGCTTGCCCAGACTCCAATCTGTGACTGCTTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 125454 CACGAATGGGCCCATCCTGCTTGCCCAGACTCCAATCTGTGACTGCTTGG 1900 . : . : . : . : . : 1820 GCTTTG GCATCTGTAGAGGCATTGACATGGAGAAGCGGCTG ||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||| 125504 GCTTTGGTG...AAGGCATCTGTAGAGGCATTGACATGGAGAAGCGGCTG 1950 . : . : . : . : . : 1861 TACCACATCCTCACCCCTGTGCCCCCGGAAGAGCTAAGGACCGTGAATTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 127709 TACCACATCCTCACCCCTGTGCCCCCGGAAGAGCTAAGGACCGTGAATTG 2000 . : . : . : . : . : 1911 TCTGCTCGTTGGAGCTATTGCCATTCCACATTGTGTCCTTAAGTGCCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||> 127759 TCTGCTCGTTGGAGCTATTGCCATTCCACATTGTGTCCTTAAGTGCCAGG 2050 . : . : . : . : . : 1960 CGTGGGATCGAAGGGACAGTACCTTATGTCACAACGGATTAC >>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 127809 TG...CAGCGTGGGATCGAAGGGACAGTACCTTATGTCACAACGGATTAC 2100 . : . : . : . : . : 2002 AATTTTAAACTTCCTGGAGCATCAGAGAAAATTGGAGCAAGAGAACCTGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128542 AATTTTAAACTTCCTGGAGCATCAGAGAAAATTGGAGCAAGAGAACCTGA 2150 . : . : . : . : . : 2052 GGAGGCACATAAAGAGAAACCATACCGAAGACCTAAGTTCTGTCGAAAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128592 GGAGGCACATAAAGAGAAACCATACCGAAGACCTAAGTTCTGTCGAAAAA 2200 . 2102 TGAAG ||||| 128642 TGAAG