seq1 = pF1KE6795.tfa, 1782 bp seq2 = pF1KE6795/gi568815595f_38206027.tfa (gi568815595f:38206027_38418246), 212220 bp >pF1KE6795 1782 >gi568815595f:38206027_38418246 (Chr3) 1-516 (100001-100516) 99% -> 517-620 (101228-101331) 100% -> 621-775 (101540-101694) 100% -> 776-944 (102928-103096) 98% -> 945-1065 (106973-107093) 100% -> 1066-1163 (107362-107459) 100% -> 1164-1378 (107701-107915) 100% -> 1379-1532 (109532-109685) 100% -> 1533-1733 (110298-110498) 100% -> 1734-1782 (112172-112220) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGCAGGAGAGGAGAACTTCAAGGAAGAGCTCAGATCCCAGGATGCTTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGGCAGGAGAGGAGAACTTCAAGGAAGAGCTCAGATCCCAGGATGCTTC 50 . : . : . : . : . : 51 CAGGAACTTGAACCAGCATGAGGTAGCAGGACATCCACATTCCTGGTCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 CAGGAACTTGAACCAGCATGAGGTAGCAGGACATCCACATTCCTGGTCTC 100 . : . : . : . : . : 101 TGGAGATGCTGTTACGCAGATTGAGGGCTGTCCACACCAAGCAGGATGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100101 TGGAGATGCTGTTACGCAGATTGAGGGCTGTCCACACCAAGCAGGATGAC 150 . : . : . : . : . : 151 AAGTTTGCCAACCTCCTGGATGCGGTGGGGGAGTTTGGCACATTCCAGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100151 AAGTTTGCCAACCTCCTGGATGCGGTGGGGGAGTTTGGCACATTCCAGCA 200 . : . : . : . : . : 201 GAGGCTAGTAGCCCTCACCTTTATCCCCAGCATCATGTCGGCCTTCTTCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100201 GAGGCTAGTAGCCCTCACCTTTATCCCCAGCATCATGTCGGCCTTCTTCA 250 . : . : . : . : . : 251 TGTTTGCTGACCACTTCGTGTTCACAGCCCAGAAGCCCTATTGCAATACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100251 TGTTTGCTGACCACTTCGTGTTCACAGCCCAGAAGCCCTATTGCAATACC 300 . : . : . : . : . : 301 AGCTGGATCCTGGCAGTGGGCCCCCACCTGTCCAAAGCTGAGCAGCTGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100301 AGCTGGATCCTGGCAGTGGGCCCCCACCTGTCCAAAGCTGAGCAGCTGAA 350 . : . : . : . : . : 351 TCTGACCATACCCCAAGCACCCAATGGCAGTTTCCTGACATGCTTCATGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100351 TCTGACCATACCCCAAGCACCCAATGGCAGTTTCCTGACATGCTTCATGT 400 . : . : . : . : . : 401 ACCTTCCTGTGCCTTGGAATCTGGATTCTATCATCCAGTTTGGCCTCAAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100401 ACCTTCCTGTGCCTTGGAATCTGGATTCTATCATCCAGTTTGGCCTCAAT 450 . : . : . : . : . : 451 GACACAGACACATGCCAAGATGGGTGGATCTATCCTGACGCTAAGAAGCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100451 GACACAGACACATGCCAAGATGGGTGGATCTATCCTGACGCTAAGAAGCG 500 . : . : . : . : . : 501 ATCACTGATCAATGAG TTTGACTTGGTATGTGGCATGGAGA ||| ||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||| 100501 ATCGCTGATCAATGAGGTA...CAGTTTGACTTGGTATGTGGCATGGAGA 550 . : . : . : . : . : 542 CGAAGAAGGACACTGCACAGATCATGTTCATGGCAGGGCTCCCGATAGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101253 CGAAGAAGGACACTGCACAGATCATGTTCATGGCAGGGCTCCCGATAGGC 600 . : . : . : . : . : 592 TCTCTCATCTTCAGGCTCATAACTGACAA GATGGGCCGCTA |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||| 101303 TCTCTCATCTTCAGGCTCATAACTGACAAGTG...TAGGATGGGCCGCTA 650 . : . : . : . : . : 633 CCCTGCCATCCTGCTGTCACTGCTGGGGCTGATCATCTTCGGCTTTGGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101552 CCCTGCCATCCTGCTGTCACTGCTGGGGCTGATCATCTTCGGCTTTGGGA 700 . : . : . : . : . : 683 CAGCCTTCATGAACAGCTTTCACCTGTATTTGTTCTTTCGCTTTGGCATC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101602 CAGCCTTCATGAACAGCTTTCACCTGTATTTGTTCTTTCGCTTTGGCATC 750 . : . : . : . : . : 733 TCGCAGTCAGTGGTGGGCTACGCCATCAGCAGCATTTCTTTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...> 101652 TCGCAGTCAGTGGTGGGCTACGCCATCAGCAGCATTTCTTTGGGTG...C 800 . : . : . : . : . : 776 CCACTGAGTGGTTAGTGGGTGAGCACCGGGCCCACGCCATTATCCTGG >>|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| 102926 AGCCACTGAGTGGTTAGTGGGTGAGCACCGGGCCCATGCCATTATCCTGG 850 . : . : . : . : . : 824 GACACTGCTTTTTCGCTGTTGGGGCCATGTTGCTGACAGGGATCGCCTAC |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| 102976 GACACTGCTTTTTCGCTGTTGGGGCCGTGTTGCTGACAGGGATCGCCTAC 900 . : . : . : . : . : 874 GGTCTTCCCCACTGGCAGCTGCTGTTTCTGGTGGGTGGGATACTTGTGAT ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103026 AGTCTTCCCCACTGGCAGCTGCTGTTTCTGGTGGGTGGGATACTTGTGAT 950 . : . : . : . : . : 924 CCCCTTCATCTCCTATATCTG GATTCTCCCGGAGTCCCCGC |||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||| 103076 CCCCTTCATCTCCTATATCTGGTG...CAGGATTCTCCCGGAGTCCCCGC 1000 . : . : . : . : . : 965 GGTGGCTGATGATGAAAGGGAAGGTGAAGGAGGCCAAGCAGGTGCTGTGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 106993 GGTGGCTGATGATGAAAGGGAAGGTGAAGGAGGCCAAGCAGGTGCTGTGC 1050 . : . : . : . : . : 1015 TACGCCGCAAGTGTGAACAAGAAGACCATTCCTTCAAATCTGCTGGACGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107043 TACGCCGCAAGTGTGAACAAGAAGACCATTCCTTCAAATCTGCTGGACGA 1100 . : . : . : . : . : 1065 G CTGCAGCTGCCCAGAAAGAAGGTGACTCGGGCCTCTGTCC |>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107093 GGTA...TAGCTGCAGCTGCCCAGAAAGAAGGTGACTCGGGCCTCTGTCC 1150 . : . : . : . : . : 1106 TGGACTTCTGTAAGAATAGGCAGCTCTGCAAGGTGACCTTGGTGATGAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107402 TGGACTTCTGTAAGAATAGGCAGCTCTGCAAGGTGACCTTGGTGATGAGC 1200 . : . : . : . : . : 1156 TGTGTGTG GTTTACCGTCAGTTACACCTATTTTACGTTGAG ||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||| 107452 TGTGTGTGGTG...CAGGTTTACCGTCAGTTACACCTATTTTACGTTGAG 1250 . : . : . : . : . : 1197 CCTGAGAATGAGAGAGCTGGGCGTGAGCGTCCACTTCAGACACGTGGTCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107734 CCTGAGAATGAGAGAGCTGGGCGTGAGCGTCCACTTCAGACACGTGGTCC 1300 . : . : . : . : . : 1247 CCAGCATCATGGAGGTGCCTGCCCGGCTGTGCTGCATCTTTCTCCTCCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107784 CCAGCATCATGGAGGTGCCTGCCCGGCTGTGCTGCATCTTTCTCCTCCAG 1350 . : . : . : . : . : 1297 CAGATTGGGAGGAAGTGGAGCCTGGCTGTGACTCTCCTCCAAGCCATCAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107834 CAGATTGGGAGGAAGTGGAGCCTGGCTGTGACTCTCCTCCAAGCCATCAT 1400 . : . : . : . : . : 1347 CTGGTGCTTGCTTCTCCTTTTCCTCCCTGAAG GGGAGGATG ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||| 107884 CTGGTGCTTGCTTCTCCTTTTCCTCCCTGAAGGTA...CAGGGGAGGATG 1450 . : . : . : . : . : 1388 GCCTCAGACTCAAGTGGCCACGTTGTCCGGCCACAGAGCTGAAATCCATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 109541 GCCTCAGACTCAAGTGGCCACGTTGTCCGGCCACAGAGCTGAAATCCATG 1500 . : . : . : . : . : 1438 ACGATCTTGGTGCTCATGCTCAGAGAGTTCAGCCTGGCCGCCACTGTCAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 109591 ACGATCTTGGTGCTCATGCTCAGAGAGTTCAGCCTGGCCGCCACTGTCAC 1550 . : . : . : . : . : 1488 TGTGTTCTTCCTCTACACCGCTGAGCTCCTCCCCACTGTGCTCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.. 109641 TGTGTTCTTCCTCTACACCGCTGAGCTCCTCCCCACTGTGCTCAGGTA.. 1600 . : . : . : . : . : 1533 GGCGACAGGTCTGGGGCTGGTGTCTCTGGCCTCGGTGGCTGGAGCC .>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 109691 .CAGGGCGACAGGTCTGGGGCTGGTGTCTCTGGCCTCGGTGGCTGGAGCC 1650 . : . : . : . : . : 1579 ATCTTGTCCCTGACAATCATCAGCCAGACCCCCTCCCTCCTGCCCATCTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 110344 ATCTTGTCCCTGACAATCATCAGCCAGACCCCCTCCCTCCTGCCCATCTT 1700 . : . : . : . : . : 1629 TCTCTGCTGCGTCTTAGCCATCGTGGCCTTTTCCCTCTCCTCCCTGCTGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 110394 TCTCTGCTGCGTCTTAGCCATCGTGGCCTTTTCCCTCTCCTCCCTGCTGC 1750 . : . : . : . : . : 1679 CGGAAACGCGAGATCAGCCCCTCTCCGAGAGCCTGAACCACTCCTCACAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 110444 CGGAAACGCGAGATCAGCCCCTCTCCGAGAGCCTGAACCACTCCTCACAG 1800 . : . : . : . : . : 1729 ATAAG GAATAAGGTCAAGGACATGAAGACTAAGGAAACATC |||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 110494 ATAAGGTA...CAGGAATAAGGTCAAGGACATGAAGACTAAGGAAACATC 1850 . : 1770 ATCTGATGATGTC ||||||||||||| 112208 ATCTGATGATGTC