seq1 = pF1KE5575.tfa, 1386 bp seq2 = pF1KE5575/gi568815597f_15944493.tfa (gi568815597f:15944493_16157282), 212790 bp >pF1KE5575 1386 >gi568815597f:15944493_16157282 (Chr1) 1-100 (100001-100100) 100% -> 101-229 (101066-101194) 100% -> 230-358 (102043-102171) 99% -> 359-498 (103413-103552) 99% -> 499-584 (103851-103934) 94% -> 585-669 (106024-106108) 100% -> 670-843 (106383-106556) 100% -> 844-913 (106986-107055) 100% -> 914-1024 (107218-107328) 100% -> 1025-1238 (107706-107919) 100% -> 1239-1290 (109147-109198) 100% -> 1291-1386 (112695-112790) 98% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGAGGAGTTTGTGGGGCTGCGTGAAGGCTCCTCAGGGAACCCTGTGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGGAGGAGTTTGTGGGGCTGCGTGAAGGCTCCTCAGGGAACCCTGTGAC 50 . : . : . : . : . : 51 TCTGCAGGAGCTGTGGGGCCCCTGTCCCCGCATCCGCCGAGGCATCCGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 TCTGCAGGAGCTGTGGGGCCCCTGTCCCCGCATCCGCCGAGGCATCCGAG 100 . : . : . : . : . : 101 GTGGCCTGGAGTGGCTGAAGCAGAAGCTCTTCCGCCTGGGC >>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100101 GTG...CAGGTGGCCTGGAGTGGCTGAAGCAGAAGCTCTTCCGCCTGGGC 150 . : . : . : . : . : 142 GAGGACTGGTACTTCCTGATGACCCTCGGGGTGCTCATGGCCCTGGTCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101107 GAGGACTGGTACTTCCTGATGACCCTCGGGGTGCTCATGGCCCTGGTCAG 200 . : . : . : . : . : 192 CTGTGCCATGGACTTGGCTGTTGAGAGTGTGGTCCGAG CGC ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||| 101157 CTGTGCCATGGACTTGGCTGTTGAGAGTGTGGTCCGAGGTA...CAGCGC 250 . : . : . : . : . : 233 ACCAGTGGCTGTACAGGGAGATTGGGGACAGCCACCTGCTCCGGTATCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 102046 ACCAGTGGCTGTACAGGGAGATTGGGGACAGCCACCTGCTCCGGTATCTC 300 . : . : . : . : . : 283 TCCTGGACTGTGTACCCTGTGGCCCTCGTCTCTTTCTCTTCGGGCTTCTC ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| 102096 TCCTGGACTGTGTACCCTGTGGCCCTCGTCTCTTTCTCTTCAGGCTTCTC 350 . : . : . : . : . : 333 TCAGAGCATCACACCCTCCTCTGGAG GTTCTGGAATCCCGG ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||| 102146 TCAGAGCATCACACCCTCCTCTGGAGGTG...AAGGTTCTGGAATCCCGG 400 . : . : . : . : . : 374 AGGTGAAGACCATGTTGGCGGGTGTGGTCTTGGAGGACTACCTGGATATC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103428 AGGTGAAGACCATGTTGGCGGGTGTGGTCTTGGAGGACTACCTGGATATC 450 . : . : . : . : . : 424 AAGAACTTTGGGGCCAAAGTGGTGGGCCTCTCCTGCACCCTGGCCTGTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103478 AAGAACTTTGGGGCCAAAGTGGTGGGCCTCTCCTGCACCCTGGCCTGTGG 500 . : . : . : . : . : 474 CAGCACCCTCTTCCTCGGCAAAGTG GGCCCTTTCGTGCACC |||||||||||||||||| ||||||>>>...>>>|||||||||||||||| 103528 CAGCACCCTCTTCCTCGGGAAAGTGGTA...CAGGGCCCTTTCGTGCACC 550 . : . : . : . : . : 515 TGTCTGTGATGATGGCTGCCTACCTGGGCCGTGTGCGCACCACGACCATC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103867 TGTCTGTGATGATGGCTGCCTACCTGGGCCGTGTGCGCACCACGACCATC 600 . : . : . : . : . : 565 GGGGAGCCTGAGAACAAGAG CAAGCCTGTGTACTCCGCTCT |||||||||||| -||-|>>>...>>>||||||||||||||||||||| 103917 GGGGAGCCTGAGGTT AG GGAC...CAGCAAGCCTGTGTACTCCGCTCT 650 . : . : . : . : . : 606 GGCCACCTTGGTTCTCGCCTCCATCACCTACCCACCCAGCGCCGGCCGCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 106045 GGCCACCTTGGTTCTCGCCTCCATCACCTACCCACCCAGCGCCGGCCGCT 700 . : . : . : . : . : 656 TCCTAGCTTCTCGG CTGTCCATGAAGCAGCATCTGGACTCG ||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||| 106095 TCCTAGCTTCTCGGGTA...CAGCTGTCCATGAAGCAGCATCTGGACTCG 750 . : . : . : . : . : 697 CTGTTCGACAACCACTCCTGGGCGCTGATGACCCAGAACTCCAGCCCACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 106410 CTGTTCGACAACCACTCCTGGGCGCTGATGACCCAGAACTCCAGCCCACC 800 . : . : . : . : . : 747 CTGGCCCGAGGAGCTCGACCCCCAGCACCTGTGGTGGGAATGGTACCACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 106460 CTGGCCCGAGGAGCTCGACCCCCAGCACCTGTGGTGGGAATGGTACCACC 850 . : . : . : . : . : 797 CGCGGTTCACCATCTTTGGGACCCTTGCCTTCTTCCTGGTTATGAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>> 106510 CGCGGTTCACCATCTTTGGGACCCTTGCCTTCTTCCTGGTTATGAAGGTG 900 . : . : . : . : . : 844 TTCTGGATGCTGATTCTGGCCACCACCATCCCCATGCCTGCCGG ...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 106560 ...CAGTTCTGGATGCTGATTCTGGCCACCACCATCCCCATGCCTGCCGG 950 . : . : . : . : . : 888 GTACTTCATGCCCATCTTTGTCTATG GAGCTGCTATCGGGC ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||| 107030 GTACTTCATGCCCATCTTTGTCTATGGTG...CAGGAGCTGCTATCGGGC 1000 . : . : . : . : . : 929 GCCTCTTTGGGGAGACTCTCTCTTTTATCTTCCCTGAGGGCATCGTGGCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107233 GCCTCTTTGGGGAGACTCTCTCTTTTATCTTCCCTGAGGGCATCGTGGCT 1050 . : . : . : . : . : 979 GGAGGGATCACCAATCCCATCATGCCAGGGGGGTATGCTCTGGCAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>. 107283 GGAGGGATCACCAATCCCATCATGCCAGGGGGGTATGCTCTGGCAGGTG. 1100 . : . : . : . : . : 1025 GGGCTGCAGCCTTCTCAGGGGCTGTGACCCACACCATCTCCACGG ..>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107333 ..CAGGGGCTGCAGCCTTCTCAGGGGCTGTGACCCACACCATCTCCACGG 1150 . : . : . : . : . : 1070 CGCTGCTGGCCTTCGAGGTGACCGGCCAGATAGTGCATGCACTGCCCGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107751 CGCTGCTGGCCTTCGAGGTGACCGGCCAGATAGTGCATGCACTGCCCGTG 1200 . : . : . : . : . : 1120 CTGATGGCGGTGCTGGCAGCCAACGCCATTGCACAGAGCTGCCAGCCCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107801 CTGATGGCGGTGCTGGCAGCCAACGCCATTGCACAGAGCTGCCAGCCCTC 1250 . : . : . : . : . : 1170 CTTCTATGATGGCACCGTCATTGTCAAGAAGCTGCCATACCTGCCACGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107851 CTTCTATGATGGCACCGTCATTGTCAAGAAGCTGCCATACCTGCCACGGA 1300 . : . : . : . : . : 1220 TTCTGGGCCGCAACATCGG TTCCCACCGCGTGAGGGTGGAG |||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||| 107901 TTCTGGGCCGCAACATCGGGTG...CAGTTCCCACCGCGTGAGGGTGGAG 1350 . : . : . : . : . : 1261 CACTTCATGAACCACAGCATCACCACACTG GCCATCACATT ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||| 109169 CACTTCATGAACCACAGCATCACCACACTGGCC...CTGGCCATCACATT 1400 . : . : . : . : . : 1302 AATGAATGATGAGATTGGAGTACACTGTCACCAAGGGCAGGCACAGATGG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112706 AATGAATGATGAGATTGGAGTACACTGTCACCAAGGGCAGGCACAGATGC 1450 . : . : . : . 1352 CTTCTGGGGTTGTCTGGTTCCCAGTGAGAGGCTCC ||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112756 CTTCTGGGGTTGTCTGGTTCCCAGTGAGAGGCTCC