Result of FASTA (omim) for pF1KE9652
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE9652, 2581 aa
  1>>>pF1KE9652     2581 - 2581 aa - 2581 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  64092750 residues in 91774 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.1357+/-0.000439; mu= -5.7220+/- 0.027
 mean_var=384.3204+/-80.944, 0's: 0 Z-trim(121.1): 236  B-trim: 390 in 1/60
 Lambda= 0.065423
 statistics sampled from 38351 (38615) to 38351 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.711), E-opt: 0.2 (0.421), width:  16
 Scan time: 13.490

The best scores are:                                      opt bits E(91774)
NP_001164100 (OMIM: 610528,615032) chromodomain-he (2581) 17294 1648.6       0
NP_065971 (OMIM: 610528,615032) chromodomain-helic (2302) 15484 1477.7       0
XP_016883593 (OMIM: 616114) chromodomain-helicase- (2378) 6352 615.8 2.4e-174
XP_016883591 (OMIM: 616114) chromodomain-helicase- (2424) 6352 615.8 2.4e-174
XP_016883589 (OMIM: 616114) chromodomain-helicase- (2693) 6352 615.8 2.6e-174
XP_005260630 (OMIM: 616114) chromodomain-helicase- (2693) 6352 615.8 2.6e-174
XP_011527382 (OMIM: 616114) chromodomain-helicase- (2713) 6352 615.8 2.6e-174
NP_115597 (OMIM: 616114) chromodomain-helicase-DNA (2715) 6352 615.8 2.6e-174
XP_016883588 (OMIM: 616114) chromodomain-helicase- (2716) 6352 615.8 2.6e-174
NP_060250 (OMIM: 214800,608892,612370) chromodomai (2997) 6154 597.2 1.2e-168
XP_016869102 (OMIM: 214800,608892,612370) chromodo (2996) 6153 597.1 1.3e-168
XP_016883592 (OMIM: 616114) chromodomain-helicase- (2381) 6036 586.0 2.3e-165
XP_016879212 (OMIM: 616936) chromodomain-helicase- (2881) 5840 567.5 9.8e-160
NP_079410 (OMIM: 616936) chromodomain-helicase-DNA (2881) 5840 567.5 9.8e-160
NP_001339056 (OMIM: 616936) chromodomain-helicase- (2881) 5840 567.5 9.8e-160
XP_016879211 (OMIM: 616936) chromodomain-helicase- (2882) 5840 567.5 9.8e-160
NP_001295248 (OMIM: 616936) chromodomain-helicase- (2897) 5840 567.5 9.8e-160
XP_016879210 (OMIM: 616936) chromodomain-helicase- (2897) 5840 567.5 9.8e-160
XP_016879208 (OMIM: 616936) chromodomain-helicase- (2898) 5840 567.5 9.8e-160
XP_005256225 (OMIM: 616936) chromodomain-helicase- (2898) 5840 567.5 9.8e-160
XP_016879207 (OMIM: 616936) chromodomain-helicase- (2898) 5840 567.5 9.8e-160
XP_024306227 (OMIM: 616936) chromodomain-helicase- (2898) 5840 567.5 9.8e-160
XP_011521649 (OMIM: 616936) chromodomain-helicase- (2898) 5840 567.5 9.8e-160
XP_005256226 (OMIM: 616936) chromodomain-helicase- (2898) 5840 567.5 9.8e-160
XP_006721344 (OMIM: 616936) chromodomain-helicase- (2898) 5840 567.5 9.8e-160
XP_016879209 (OMIM: 616936) chromodomain-helicase- (2898) 5840 567.5 9.8e-160
XP_006721346 (OMIM: 616936) chromodomain-helicase- (2898) 5840 567.5 9.8e-160
XP_016879214 (OMIM: 616936) chromodomain-helicase- (2431) 5829 566.4 1.8e-159
XP_016879213 (OMIM: 616936) chromodomain-helicase- (2447) 5829 566.4 1.8e-159
NP_001339086 (OMIM: 616936) chromodomain-helicase- (2408) 5828 566.3 1.9e-159
NP_001339085 (OMIM: 616936) chromodomain-helicase- (2424) 5828 566.3 1.9e-159
NP_001339087 (OMIM: 616936) chromodomain-helicase- (2375) 5811 564.7 5.6e-159
XP_005256233 (OMIM: 616936) chromodomain-helicase- (2391) 5811 564.7 5.6e-159
XP_024306228 (OMIM: 616936) chromodomain-helicase- (2391) 5811 564.7 5.6e-159
XP_024306229 (OMIM: 616936) chromodomain-helicase- (2237) 5780 561.8 4.1e-158
XP_011515857 (OMIM: 214800,608892,612370) chromodo (3026) 5140 501.5 7.9e-140
XP_011515855 (OMIM: 214800,608892,612370) chromodo (3027) 5140 501.5 7.9e-140
XP_011515856 (OMIM: 214800,608892,612370) chromodo (3027) 5140 501.5 7.9e-140
XP_016869101 (OMIM: 214800,608892,612370) chromodo (3027) 5140 501.5 7.9e-140
XP_011515862 (OMIM: 214800,608892,612370) chromodo (1621) 4511 441.9 3.6e-122
XP_016883590 (OMIM: 616114) chromodomain-helicase- (2668) 4360 427.8  1e-117
XP_011527384 (OMIM: 616114) chromodomain-helicase- (2038) 4303 422.4 3.5e-116
NP_001350535 (OMIM: 603277,617159) chromodomain-he (1902) 1585 165.8 5.5e-39
NP_001284482 (OMIM: 603277,617159) chromodomain-he (1905) 1585 165.8 5.5e-39
NP_001264 (OMIM: 603277,617159) chromodomain-helic (1912) 1585 165.8 5.6e-39
XP_016879558 (OMIM: 602120,618205) chromodomain-he (1888) 1557 163.2 3.4e-38
NP_005843 (OMIM: 602120,618205) chromodomain-helic (1966) 1557 163.2 3.5e-38
NP_001005273 (OMIM: 602120,618205) chromodomain-he (2000) 1557 163.2 3.6e-38
XP_006721491 (OMIM: 602120,618205) chromodomain-he (2025) 1557 163.2 3.6e-38
XP_016879555 (OMIM: 602120,618205) chromodomain-he (2036) 1557 163.2 3.6e-38


>>NP_001164100 (OMIM: 610528,615032) chromodomain-helica  (2581 aa)
 initn: 17294 init1: 17294 opt: 17294  Z-score: 8832.7  bits: 1648.6 E(91774):    0
Smith-Waterman score: 17294; 100.0% identity (100.0% similar) in 2581 aa overlap (1-2581:1-2581)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE9 MADPIMDLFDDPNLFGLDSLTDDSFNQVTQDPIEEALGLPSSLDSLDQMNQDGGGGDVGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MADPIMDLFDDPNLFGLDSLTDDSFNQVTQDPIEEALGLPSSLDSLDQMNQDGGGGDVGN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE9 SSASELVPPPEETAPTELSKESTAPAPESITLHDYTTQPASQEQPAQPVLQTSTPTSGLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSASELVPPPEETAPTELSKESTAPAPESITLHDYTTQPASQEQPAQPVLQTSTPTSGLL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE9 QVSKSQEILSQGNPFMGVSATAVSSSSAGGQPPQSAPKIVILKAPPSSSVTGAHVAQIQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QVSKSQEILSQGNPFMGVSATAVSSSSAGGQPPQSAPKIVILKAPPSSSVTGAHVAQIQA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE9 QGITSTAQPLVAGTANGGKVTFTKVLTGTPLRPGVSIVSGNTVLAAKVPGNQAAVQRIVQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QGITSTAQPLVAGTANGGKVTFTKVLTGTPLRPGVSIVSGNTVLAAKVPGNQAAVQRIVQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE9 PSRPVKQLVLQPVKGSAPAGNPGATGPPLKPAVTLTSTPTQGESKRITLVLQQPQSGGPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PSRPVKQLVLQPVKGSAPAGNPGATGPPLKPAVTLTSTPTQGESKRITLVLQQPQSGGPQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE9 GHRHVVLGSLPGKIVLQGNQLAALTQAKNAQGQPAKVVTIQLQVQQPQQKIQIVPQPPSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GHRHVVLGSLPGKIVLQGNQLAALTQAKNAQGQPAKVVTIQLQVQQPQQKIQIVPQPPSS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE9 QPQPQQPPSTQPVTLSSVQQAQIMGPGQSPGQRLSVPVKVVLQPQAGSSQGASSGLSVVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QPQPQQPPSTQPVTLSSVQQAQIMGPGQSPGQRLSVPVKVVLQPQAGSSQGASSGLSVVK
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE9 VLSASEVAALSSPASSAPHSGGKTGMEENRRLEHQKKQEKANRIVAEAIARARARGEQNI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VLSASEVAALSSPASSAPHSGGKTGMEENRRLEHQKKQEKANRIVAEAIARARARGEQNI
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE9 PRVLNEDELPSVRPEEEGEKKRRKKSAGERLKEEKPKKSKTSGASKTKGKSKLNTITPVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PRVLNEDELPSVRPEEEGEKKRRKKSAGERLKEEKPKKSKTSGASKTKGKSKLNTITPVV
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE9 GKKRKRNTSSDNSDVEVMPAQSPREDEESSIQKRRSNRQVKRKKYTEDLDIKITDDEEEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GKKRKRNTSSDNSDVEVMPAQSPREDEESSIQKRRSNRQVKRKKYTEDLDIKITDDEEEE
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE9 EVDVTGPIKPEPILPEPVQEPDGETLPSMQFFVENPSEEDAAIVDKVLSMRIVKKELPSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EVDVTGPIKPEPILPEPVQEPDGETLPSMQFFVENPSEEDAAIVDKVLSMRIVKKELPSG
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE9 QYTEAEEFFVKYKNYSYLHCEWATISQLEKDKRIHQKLKRFKTKMAQMRHFFHEDEEPFN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QYTEAEEFFVKYKNYSYLHCEWATISQLEKDKRIHQKLKRFKTKMAQMRHFFHEDEEPFN
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE9 PDYVEVDRILDESHSIDKDNGEPVIYYLVKWCSLPYEDSTWELKEDVDEGKIREFKRIQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PDYVEVDRILDESHSIDKDNGEPVIYYLVKWCSLPYEDSTWELKEDVDEGKIREFKRIQS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE9 RHPELKRVNRPQASAWKKLELSHEYKNRNQLREYQLEGVNWLLFNWYNRQNCILADEMGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RHPELKRVNRPQASAWKKLELSHEYKNRNQLREYQLEGVNWLLFNWYNRQNCILADEMGL
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE9 GKTIQSIAFLQEVYNVGIHGPFLVIAPLSTITNWEREFNTWTEMNTIVYHGSLASRQMIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GKTIQSIAFLQEVYNVGIHGPFLVIAPLSTITNWEREFNTWTEMNTIVYHGSLASRQMIQ
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE9 QYEMYCKDSRGRLIPGAYKFDALITTFEMILSDCPELREIEWRCVIIDEAHRLKNRNCKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QYEMYCKDSRGRLIPGAYKFDALITTFEMILSDCPELREIEWRCVIIDEAHRLKNRNCKL
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE9 LDSLKHMDLEHKVLLTGTPLQNTVEELFSLLHFLEPSQFPSESEFLKDFGDLKTEEQVQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LDSLKHMDLEHKVLLTGTPLQNTVEELFSLLHFLEPSQFPSESEFLKDFGDLKTEEQVQK
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE9 LQAILKPMMLRRLKEDVEKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLSKGAGHTN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LQAILKPMMLRRLKEDVEKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLSKGAGHTN
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE9 MPNLLNTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILTEFREACHIIPHDFHLQAMVRSAGKLVLIDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MPNLLNTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILTEFREACHIIPHDFHLQAMVRSAGKLVLIDK
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE9 LLPKLKAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYLYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLPKLKAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYLYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDS
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE9 DRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLITR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLITR
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE9 NSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQSMSGRDGNITGIQQFSKKEIEDLLRKGAYAAIMEEDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQSMSGRDGNITGIQQFSKKEIEDLLRKGAYAAIMEEDD
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE9 EGSKFCEEDIDQILLRRTTTITIESEGKGSTFAKASFVASENRTDISLDDPNFWQKWAKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EGSKFCEEDIDQILLRRTTTITIESEGKGSTFAKASFVASENRTDISLDDPNFWQKWAKK
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KE9 ADLDMDLLNSKNNLVIDTPRVRKQTRHFSTLKDDDLVEFSDLESEDDERPRSRRHDRHHA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ADLDMDLLNSKNNLVIDTPRVRKQTRHFSTLKDDDLVEFSDLESEDDERPRSRRHDRHHA
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KE9 YGRTDCFRVEKHLLVYGWGRWRDILSHGRFKRRMTERDVETICRAILVYCLLHYRGDENI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YGRTDCFRVEKHLLVYGWGRWRDILSHGRFKRRMTERDVETICRAILVYCLLHYRGDENI
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KE9 KGFIWDLISPAENGKTKELQNHSGLSIPVPRGRKGKKVKSQSTFDIHKADWIRKYNPDTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KGFIWDLISPAENGKTKELQNHSGLSIPVPRGRKGKKVKSQSTFDIHKADWIRKYNPDTL
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KE9 FQDESYKKHLKHQCNKVLLRVRMLYYLRQEVIGDQAEKVLGGAIASEIDIWFPVVDQLEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FQDESYKKHLKHQCNKVLLRVRMLYYLRQEVIGDQAEKVLGGAIASEIDIWFPVVDQLEV
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KE9 PTTWWDSEADKSLLIGVFKHGYEKYNTMRADPALCFLEKAGRPDDKAIAAEHRVLDNFSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PTTWWDSEADKSLLIGVFKHGYEKYNTMRADPALCFLEKAGRPDDKAIAAEHRVLDNFSD
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

             1690      1700      1710      1720      1730      1740
pF1KE9 IVEGVDFDKDCEDPEYKPLQGPPKDQDDEGDPLMMMDEEISVIDGDEAQVTQQPGHLFWP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IVEGVDFDKDCEDPEYKPLQGPPKDQDDEGDPLMMMDEEISVIDGDEAQVTQQPGHLFWP
             1690      1700      1710      1720      1730      1740

             1750      1760      1770      1780      1790      1800
pF1KE9 PGSALTARLRRLVTAYQRSYKREQMKIEAAERGDRRRRRCEAAFKLKEIARREKQQRWTR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PGSALTARLRRLVTAYQRSYKREQMKIEAAERGDRRRRRCEAAFKLKEIARREKQQRWTR
             1750      1760      1770      1780      1790      1800

             1810      1820      1830      1840      1850      1860
pF1KE9 REQTDFYRVVSTFGVEYDPDTMQFHWDRFRTFARLDKKTDESLTKYFHGFVAMCRQVCRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 REQTDFYRVVSTFGVEYDPDTMQFHWDRFRTFARLDKKTDESLTKYFHGFVAMCRQVCRL
             1810      1820      1830      1840      1850      1860

             1870      1880      1890      1900      1910      1920
pF1KE9 PPAAGDEPPDPNLFIEPITEERASRTLYRIELLRRLREQVLCHPLLEDRLALCQPPGPEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PPAAGDEPPDPNLFIEPITEERASRTLYRIELLRRLREQVLCHPLLEDRLALCQPPGPEL
             1870      1880      1890      1900      1910      1920

             1930      1940      1950      1960      1970      1980
pF1KE9 PKWWEPVRHDGELLRGAARHGVSQTDCNIMQDPDFSFLAARMNYMQNHQAGAPAPSLSRC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PKWWEPVRHDGELLRGAARHGVSQTDCNIMQDPDFSFLAARMNYMQNHQAGAPAPSLSRC
             1930      1940      1950      1960      1970      1980

             1990      2000      2010      2020      2030      2040
pF1KE9 STPLLHQQYTSRTASPLPLRPDAPVEKSPEETATQVPSLESLTLKLEHEVVARSRPTPQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 STPLLHQQYTSRTASPLPLRPDAPVEKSPEETATQVPSLESLTLKLEHEVVARSRPTPQD
             1990      2000      2010      2020      2030      2040

             2050      2060      2070      2080      2090      2100
pF1KE9 YEMRVSPSDTTPLVSRSVPPVKLEDEDDSDSELDLSKLSPSSSSSSSSSSSSSSTDESED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YEMRVSPSDTTPLVSRSVPPVKLEDEDDSDSELDLSKLSPSSSSSSSSSSSSSSTDESED
             2050      2060      2070      2080      2090      2100

             2110      2120      2130      2140      2150      2160
pF1KE9 EKEEKLTDQSRSKLYDEESLLSLTMSQDGFPNEDGEQMTPELLLLQERQRASEWPKDRVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EKEEKLTDQSRSKLYDEESLLSLTMSQDGFPNEDGEQMTPELLLLQERQRASEWPKDRVL
             2110      2120      2130      2140      2150      2160

             2170      2180      2190      2200      2210      2220
pF1KE9 INRIDLVCQAVLSGKWPSSRRSQEMVTGGILGPGNHLLDSPSLTPGEYGDSPVPTPRSSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 INRIDLVCQAVLSGKWPSSRRSQEMVTGGILGPGNHLLDSPSLTPGEYGDSPVPTPRSSS
             2170      2180      2190      2200      2210      2220

             2230      2240      2250      2260      2270      2280
pF1KE9 AASMAEEEASAVSTAAAQFTKLRRGMDEKEFTVQIKDEEGLKLTFQKHKLMANGVMGDGH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AASMAEEEASAVSTAAAQFTKLRRGMDEKEFTVQIKDEEGLKLTFQKHKLMANGVMGDGH
             2230      2240      2250      2260      2270      2280

             2290      2300      2310      2320      2330      2340
pF1KE9 PLFHKKKGNRKKLVELEVECMEEPNHLDVDLETRIPVINKVDGTLLVGEDAPRRAELEMW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PLFHKKKGNRKKLVELEVECMEEPNHLDVDLETRIPVINKVDGTLLVGEDAPRRAELEMW
             2290      2300      2310      2320      2330      2340

             2350      2360      2370      2380      2390      2400
pF1KE9 LQGHPEFAVDPRFLAYMEDRRKQKWQRCKKNNKAELNCLGMEPVQTANSRNGKKGHHTET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LQGHPEFAVDPRFLAYMEDRRKQKWQRCKKNNKAELNCLGMEPVQTANSRNGKKGHHTET
             2350      2360      2370      2380      2390      2400

             2410      2420      2430      2440      2450      2460
pF1KE9 VFNRVLPGPIAPESSKKRARRMRPDLSKMMALMQGGSTGSLSLHNTFQHSSSGLQSVSSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VFNRVLPGPIAPESSKKRARRMRPDLSKMMALMQGGSTGSLSLHNTFQHSSSGLQSVSSL
             2410      2420      2430      2440      2450      2460

             2470      2480      2490      2500      2510      2520
pF1KE9 GHSSATSASLPFMPFVMGGAPSSPHVDSSTMLHHHHHHPHPHHHHHHHPGLRAPGYPSSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GHSSATSASLPFMPFVMGGAPSSPHVDSSTMLHHHHHHPHPHHHHHHHPGLRAPGYPSSP
             2470      2480      2490      2500      2510      2520

             2530      2540      2550      2560      2570      2580
pF1KE9 VTTASGTTLRLPPLQPEEDDDEDEEDDDDLSQGYDSSERDFSLIDDPMMPANSDSSEDAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VTTASGTTLRLPPLQPEEDDDEDEEDDDDLSQGYDSSERDFSLIDDPMMPANSDSSEDAD
             2530      2540      2550      2560      2570      2580

        
pF1KE9 D
       :
NP_001 D
        

>>NP_065971 (OMIM: 610528,615032) chromodomain-helicase-  (2302 aa)
 initn: 15484 init1: 15484 opt: 15484  Z-score: 7910.1  bits: 1477.7 E(91774):    0
Smith-Waterman score: 15484; 100.0% identity (100.0% similar) in 2301 aa overlap (281-2581:2-2302)

              260       270       280       290       300       310
pF1KE9 QPVKGSAPAGNPGATGPPLKPAVTLTSTPTQGESKRITLVLQQPQSGGPQGHRHVVLGSL
                                     .:::::::::::::::::::::::::::::
NP_065                              MKGESKRITLVLQQPQSGGPQGHRHVVLGSL
                                            10        20        30 

              320       330       340       350       360       370
pF1KE9 PGKIVLQGNQLAALTQAKNAQGQPAKVVTIQLQVQQPQQKIQIVPQPPSSQPQPQQPPST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 PGKIVLQGNQLAALTQAKNAQGQPAKVVTIQLQVQQPQQKIQIVPQPPSSQPQPQQPPST
              40        50        60        70        80        90 

              380       390       400       410       420       430
pF1KE9 QPVTLSSVQQAQIMGPGQSPGQRLSVPVKVVLQPQAGSSQGASSGLSVVKVLSASEVAAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 QPVTLSSVQQAQIMGPGQSPGQRLSVPVKVVLQPQAGSSQGASSGLSVVKVLSASEVAAL
             100       110       120       130       140       150 

              440       450       460       470       480       490
pF1KE9 SSPASSAPHSGGKTGMEENRRLEHQKKQEKANRIVAEAIARARARGEQNIPRVLNEDELP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SSPASSAPHSGGKTGMEENRRLEHQKKQEKANRIVAEAIARARARGEQNIPRVLNEDELP
             160       170       180       190       200       210 

              500       510       520       530       540       550
pF1KE9 SVRPEEEGEKKRRKKSAGERLKEEKPKKSKTSGASKTKGKSKLNTITPVVGKKRKRNTSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SVRPEEEGEKKRRKKSAGERLKEEKPKKSKTSGASKTKGKSKLNTITPVVGKKRKRNTSS
             220       230       240       250       260       270 

              560       570       580       590       600       610
pF1KE9 DNSDVEVMPAQSPREDEESSIQKRRSNRQVKRKKYTEDLDIKITDDEEEEEVDVTGPIKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 DNSDVEVMPAQSPREDEESSIQKRRSNRQVKRKKYTEDLDIKITDDEEEEEVDVTGPIKP
             280       290       300       310       320       330 

              620       630       640       650       660       670
pF1KE9 EPILPEPVQEPDGETLPSMQFFVENPSEEDAAIVDKVLSMRIVKKELPSGQYTEAEEFFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 EPILPEPVQEPDGETLPSMQFFVENPSEEDAAIVDKVLSMRIVKKELPSGQYTEAEEFFV
             340       350       360       370       380       390 

              680       690       700       710       720       730
pF1KE9 KYKNYSYLHCEWATISQLEKDKRIHQKLKRFKTKMAQMRHFFHEDEEPFNPDYVEVDRIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 KYKNYSYLHCEWATISQLEKDKRIHQKLKRFKTKMAQMRHFFHEDEEPFNPDYVEVDRIL
             400       410       420       430       440       450 

              740       750       760       770       780       790
pF1KE9 DESHSIDKDNGEPVIYYLVKWCSLPYEDSTWELKEDVDEGKIREFKRIQSRHPELKRVNR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 DESHSIDKDNGEPVIYYLVKWCSLPYEDSTWELKEDVDEGKIREFKRIQSRHPELKRVNR
             460       470       480       490       500       510 

              800       810       820       830       840       850
pF1KE9 PQASAWKKLELSHEYKNRNQLREYQLEGVNWLLFNWYNRQNCILADEMGLGKTIQSIAFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 PQASAWKKLELSHEYKNRNQLREYQLEGVNWLLFNWYNRQNCILADEMGLGKTIQSIAFL
             520       530       540       550       560       570 

              860       870       880       890       900       910
pF1KE9 QEVYNVGIHGPFLVIAPLSTITNWEREFNTWTEMNTIVYHGSLASRQMIQQYEMYCKDSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 QEVYNVGIHGPFLVIAPLSTITNWEREFNTWTEMNTIVYHGSLASRQMIQQYEMYCKDSR
             580       590       600       610       620       630 

              920       930       940       950       960       970
pF1KE9 GRLIPGAYKFDALITTFEMILSDCPELREIEWRCVIIDEAHRLKNRNCKLLDSLKHMDLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 GRLIPGAYKFDALITTFEMILSDCPELREIEWRCVIIDEAHRLKNRNCKLLDSLKHMDLE
             640       650       660       670       680       690 

              980       990      1000      1010      1020      1030
pF1KE9 HKVLLTGTPLQNTVEELFSLLHFLEPSQFPSESEFLKDFGDLKTEEQVQKLQAILKPMML
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 HKVLLTGTPLQNTVEELFSLLHFLEPSQFPSESEFLKDFGDLKTEEQVQKLQAILKPMML
             700       710       720       730       740       750 

             1040      1050      1060      1070      1080      1090
pF1KE9 RRLKEDVEKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLSKGAGHTNMPNLLNTMME
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 RRLKEDVEKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLSKGAGHTNMPNLLNTMME
             760       770       780       790       800       810 

             1100      1110      1120      1130      1140      1150
pF1KE9 LRKCCNHPYLINGAEEKILTEFREACHIIPHDFHLQAMVRSAGKLVLIDKLLPKLKAGGH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 LRKCCNHPYLINGAEEKILTEFREACHIIPHDFHLQAMVRSAGKLVLIDKLLPKLKAGGH
             820       830       840       850       860       870 

             1160      1170      1180      1190      1200      1210
pF1KE9 KVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYLYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 KVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYLYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTR
             880       890       900       910       920       930 

             1220      1230      1240      1250      1260      1270
pF1KE9 AGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLITRNSYEREMFDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 AGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLITRNSYEREMFDK
             940       950       960       970       980       990 

             1280      1290      1300      1310      1320      1330
pF1KE9 ASLKLGLDKAVLQSMSGRDGNITGIQQFSKKEIEDLLRKGAYAAIMEEDDEGSKFCEEDI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 ASLKLGLDKAVLQSMSGRDGNITGIQQFSKKEIEDLLRKGAYAAIMEEDDEGSKFCEEDI
            1000      1010      1020      1030      1040      1050 

             1340      1350      1360      1370      1380      1390
pF1KE9 DQILLRRTTTITIESEGKGSTFAKASFVASENRTDISLDDPNFWQKWAKKADLDMDLLNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 DQILLRRTTTITIESEGKGSTFAKASFVASENRTDISLDDPNFWQKWAKKADLDMDLLNS
            1060      1070      1080      1090      1100      1110 

             1400      1410      1420      1430      1440      1450
pF1KE9 KNNLVIDTPRVRKQTRHFSTLKDDDLVEFSDLESEDDERPRSRRHDRHHAYGRTDCFRVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 KNNLVIDTPRVRKQTRHFSTLKDDDLVEFSDLESEDDERPRSRRHDRHHAYGRTDCFRVE
            1120      1130      1140      1150      1160      1170 

             1460      1470      1480      1490      1500      1510
pF1KE9 KHLLVYGWGRWRDILSHGRFKRRMTERDVETICRAILVYCLLHYRGDENIKGFIWDLISP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 KHLLVYGWGRWRDILSHGRFKRRMTERDVETICRAILVYCLLHYRGDENIKGFIWDLISP
            1180      1190      1200      1210      1220      1230 

             1520      1530      1540      1550      1560      1570
pF1KE9 AENGKTKELQNHSGLSIPVPRGRKGKKVKSQSTFDIHKADWIRKYNPDTLFQDESYKKHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 AENGKTKELQNHSGLSIPVPRGRKGKKVKSQSTFDIHKADWIRKYNPDTLFQDESYKKHL
            1240      1250      1260      1270      1280      1290 

             1580      1590      1600      1610      1620      1630
pF1KE9 KHQCNKVLLRVRMLYYLRQEVIGDQAEKVLGGAIASEIDIWFPVVDQLEVPTTWWDSEAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 KHQCNKVLLRVRMLYYLRQEVIGDQAEKVLGGAIASEIDIWFPVVDQLEVPTTWWDSEAD
            1300      1310      1320      1330      1340      1350 

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pF1KE9 KSLLIGVFKHGYEKYNTMRADPALCFLEKAGRPDDKAIAAEHRVLDNFSDIVEGVDFDKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 KSLLIGVFKHGYEKYNTMRADPALCFLEKAGRPDDKAIAAEHRVLDNFSDIVEGVDFDKD
            1360      1370      1380      1390      1400      1410 

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pF1KE9 CEDPEYKPLQGPPKDQDDEGDPLMMMDEEISVIDGDEAQVTQQPGHLFWPPGSALTARLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 CEDPEYKPLQGPPKDQDDEGDPLMMMDEEISVIDGDEAQVTQQPGHLFWPPGSALTARLR
            1420      1430      1440      1450      1460      1470 

             1760      1770      1780      1790      1800      1810
pF1KE9 RLVTAYQRSYKREQMKIEAAERGDRRRRRCEAAFKLKEIARREKQQRWTRREQTDFYRVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 RLVTAYQRSYKREQMKIEAAERGDRRRRRCEAAFKLKEIARREKQQRWTRREQTDFYRVV
            1480      1490      1500      1510      1520      1530 

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pF1KE9 STFGVEYDPDTMQFHWDRFRTFARLDKKTDESLTKYFHGFVAMCRQVCRLPPAAGDEPPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 STFGVEYDPDTMQFHWDRFRTFARLDKKTDESLTKYFHGFVAMCRQVCRLPPAAGDEPPD
            1540      1550      1560      1570      1580      1590 

             1880      1890      1900      1910      1920      1930
pF1KE9 PNLFIEPITEERASRTLYRIELLRRLREQVLCHPLLEDRLALCQPPGPELPKWWEPVRHD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 PNLFIEPITEERASRTLYRIELLRRLREQVLCHPLLEDRLALCQPPGPELPKWWEPVRHD
            1600      1610      1620      1630      1640      1650 

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pF1KE9 GELLRGAARHGVSQTDCNIMQDPDFSFLAARMNYMQNHQAGAPAPSLSRCSTPLLHQQYT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 GELLRGAARHGVSQTDCNIMQDPDFSFLAARMNYMQNHQAGAPAPSLSRCSTPLLHQQYT
            1660      1670      1680      1690      1700      1710 

             2000      2010      2020      2030      2040      2050
pF1KE9 SRTASPLPLRPDAPVEKSPEETATQVPSLESLTLKLEHEVVARSRPTPQDYEMRVSPSDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SRTASPLPLRPDAPVEKSPEETATQVPSLESLTLKLEHEVVARSRPTPQDYEMRVSPSDT
            1720      1730      1740      1750      1760      1770 

             2060      2070      2080      2090      2100      2110
pF1KE9 TPLVSRSVPPVKLEDEDDSDSELDLSKLSPSSSSSSSSSSSSSSTDESEDEKEEKLTDQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 TPLVSRSVPPVKLEDEDDSDSELDLSKLSPSSSSSSSSSSSSSSTDESEDEKEEKLTDQS
            1780      1790      1800      1810      1820      1830 

             2120      2130      2140      2150      2160      2170
pF1KE9 RSKLYDEESLLSLTMSQDGFPNEDGEQMTPELLLLQERQRASEWPKDRVLINRIDLVCQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 RSKLYDEESLLSLTMSQDGFPNEDGEQMTPELLLLQERQRASEWPKDRVLINRIDLVCQA
            1840      1850      1860      1870      1880      1890 

             2180      2190      2200      2210      2220      2230
pF1KE9 VLSGKWPSSRRSQEMVTGGILGPGNHLLDSPSLTPGEYGDSPVPTPRSSSAASMAEEEAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 VLSGKWPSSRRSQEMVTGGILGPGNHLLDSPSLTPGEYGDSPVPTPRSSSAASMAEEEAS
            1900      1910      1920      1930      1940      1950 

             2240      2250      2260      2270      2280      2290
pF1KE9 AVSTAAAQFTKLRRGMDEKEFTVQIKDEEGLKLTFQKHKLMANGVMGDGHPLFHKKKGNR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 AVSTAAAQFTKLRRGMDEKEFTVQIKDEEGLKLTFQKHKLMANGVMGDGHPLFHKKKGNR
            1960      1970      1980      1990      2000      2010 

             2300      2310      2320      2330      2340      2350
pF1KE9 KKLVELEVECMEEPNHLDVDLETRIPVINKVDGTLLVGEDAPRRAELEMWLQGHPEFAVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 KKLVELEVECMEEPNHLDVDLETRIPVINKVDGTLLVGEDAPRRAELEMWLQGHPEFAVD
            2020      2030      2040      2050      2060      2070 

             2360      2370      2380      2390      2400      2410
pF1KE9 PRFLAYMEDRRKQKWQRCKKNNKAELNCLGMEPVQTANSRNGKKGHHTETVFNRVLPGPI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 PRFLAYMEDRRKQKWQRCKKNNKAELNCLGMEPVQTANSRNGKKGHHTETVFNRVLPGPI
            2080      2090      2100      2110      2120      2130 

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pF1KE9 APESSKKRARRMRPDLSKMMALMQGGSTGSLSLHNTFQHSSSGLQSVSSLGHSSATSASL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 APESSKKRARRMRPDLSKMMALMQGGSTGSLSLHNTFQHSSSGLQSVSSLGHSSATSASL
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pF1KE9 PFMPFVMGGAPSSPHVDSSTMLHHHHHHPHPHHHHHHHPGLRAPGYPSSPVTTASGTTLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 PFMPFVMGGAPSSPHVDSSTMLHHHHHHPHPHHHHHHHPGLRAPGYPSSPVTTASGTTLR
            2200      2210      2220      2230      2240      2250 

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pF1KE9 LPPLQPEEDDDEDEEDDDDLSQGYDSSERDFSLIDDPMMPANSDSSEDADD
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 LPPLQPEEDDDEDEEDDDDLSQGYDSSERDFSLIDDPMMPANSDSSEDADD
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>>XP_016883593 (OMIM: 616114) chromodomain-helicase-DNA-  (2378 aa)
 initn: 4940 init1: 3015 opt: 6352  Z-score: 3251.7  bits: 615.8 E(91774): 2.4e-174
Smith-Waterman score: 6468; 59.9% identity (79.4% similar) in 1677 aa overlap (364-2010:10-1661)

           340       350       360       370       380       390   
pF1KE9 PAKVVTIQLQVQQPQQKIQIVPQPPSSQPQPQQPPSTQPVTLSSVQQAQIMGPGQSPGQR
                                     : :  . . .. : ...:..    .::.  
XP_016                      MASITIKLPPIQLSNLKVLNHSPMSDASVNFDYKSPS--
                                    10        20        30         

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pF1KE9 LSVPVKVVLQPQAGSSQGASSGLSVVKVLSASEVAALSSPASSAPHSG------GKTGME
          :     . .    . ::  :    . .: : ::   : . . :.:      : ::..
XP_016 ---PFDCSTDQEEKIEDVASHCLPQKDLYTAEEEAATLFPRKMTSHNGMEDSGGGGTGVK
           40        50        60        70        80        90    

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pF1KE9 ENRRLEHQKKQE---KANRIVAEAIARARARGEQNIPRVLNEDELPSVRPE---EEGEKK
       ..:. ..   ::   :...       : :   : . ::  .: .  . . :   ..: ::
XP_016 KKRKKKEPGDQEGAAKGSKDREPKPKRKREPKEPKEPRKAKEPKKAKEHKEPKQKDGAKK
          100       110       120       130       140       150    

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pF1KE9 RRKKSAGERLKEEKPKKSKTSGASKTKGK--SKLNTITPVVGKKR-KRNTSSDNSDVEV-
        ::   .   :: : :.: :..:..::..  :: .  :::  ::. ::.. .   ..:. 
XP_016 ARKPREASGTKEAKEKRSCTDSAARTKSRKASKEQGPTPVEKKKKGKRKSETTVESLELD
          160       170       180       190       200       210    

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pF1KE9 ----MPA-QSPREDEESS-IQKRRSNRQVKRKKYTEDLDIKITDDEEEEEVDVTGPIKPE
            :. .::.:. ::.  :::::.:::::.::.::::.:..::. :  . : :  .  
XP_016 QGLTNPSLRSPEESTESTDSQKRRSGRQVKRRKYNEDLDFKVVDDDGET-IAVLGAGRTS
          220       230       240       250       260        270   

             620       630       640       650       660       670 
pF1KE9 PILPEPVQEPDGETLPSMQFFVENPSEEDAAIVDKVLSMRIVKKELPSGQYTEAEEFFVK
        .           .  .. . .:.: :.:: :..:.:. . :..  :.    . : :.::
XP_016 AL-----------SASTLAWQAEEPPEDDANIIEKILASKTVQEVHPGEPPFDLELFYVK
                      280       290       300       310       320  

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pF1KE9 YKNYSYLHCEWATISQLEKDKRIHQKLKRFKTKMAQMRHFFHE-DEEPFNPDYVEVDRIL
       :.:.:::::.:::. .:::: :: ::.:::..:.:::.:.: : ::. ::::::::::::
XP_016 YRNFSYLHCKWATMEELEKDPRIAQKIKRFRNKQAQMKHIFTEPDEDLFNPDYVEVDRIL
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pF1KE9 DESHSIDKDNGEPVIYYLVKWCSLPYEDSTWELKEDVDEGKIREFKRIQSRHPELKRVNR
       . .:. : ..:: : .:::::::::::.:::::.:::: .:..::. .:   ::.:.:.:
XP_016 EVAHTKDAETGEEVTHYLVKWCSLPYEESTWELEEDVDPAKVKEFESLQVL-PEIKHVER
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pF1KE9 PQASAWKKLELSHEYKNRNQLREYQLEGVNWLLFNWYNRQNCILADEMGLGKTIQSIAFL
       : ...:.::: :.:::: ::::::::::.::::::::::.:::::::::::::::::.::
XP_016 PASDSWQKLEKSREYKNSNQLREYQLEGMNWLLFNWYNRKNCILADEMGLGKTIQSITFL
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pF1KE9 QEVYNVGIHGPFLVIAPLSTITNWEREFNTWTEMNTIVYHGSLASRQMIQQYEMYCKDSR
       .:..  :::::::.:::::::::::::: ::::::.::::::  ::::::::::  .:..
XP_016 SEIFLRGIHGPFLIIAPLSTITNWEREFRTWTEMNAIVYHGSQISRQMIQQYEMVYRDAQ
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pF1KE9 GRLIPGAYKFDALITTFEMILSDCPELREIEWRCVIIDEAHRLKNRNCKLLDSLKHMDLE
       :  . :..:: ..::::::::.:::::..:.: ::::::::::::::::::..:: : ::
XP_016 GNPLSGVFKFHVVITTFEMILADCPELKKIHWSCVIIDEAHRLKNRNCKLLEGLKLMALE
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       ::::::::::::.::::::::.::::::::::. ::..::::::::::.:::.:::::::
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       ::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.. :::::.:::::
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       ::::::::::::::::::: .::..      ::.::::...:::::::::::::: ::::
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       :::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::: ::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       :::::::::::::... : :. .:.::.:: :.:::::::::.:.:.:.:::::::::::
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pF1KE9 DQILLRRTTTITIESEGKGSTFAKASFVASENRTDISLDDPNFWQKWAKKADLDMDLLNS
       :::: ::: ::::.:::::::::::::::: :::::::::::::::::: :.:: .  : 
XP_016 DQILQRRTHTITIQSEGKGSTFAKASFVASGNRTDISLDDPNFWQKWAKIAELDTEAKNE
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pF1KE9 KNNLVIDTPRVRKQTRHFSTLKDDDLVEFSDLESEDDERP-RSRR-HDRHHAYGRTDCFR
       :..:::: :::::::.:......:.:.:::.:.:..:::: :::: .:. . : :..:::
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       :::.::..:::::.:::.::::: ...:.:.: ::::.::::. ::.:::.::.:::.::
XP_016 VEKNLLIFGWGRWKDILTHGRFKWHLNEKDMEMICRALLVYCVKHYKGDEKIKSFIWELI
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       .:...:... :::::::: ::::::::::.:.:  . ... :::.   ::.....:..::
XP_016 TPTKDGQAQTLQNHSGLSAPVPRGRKGKKTKNQLLIPELKDADWLATCNPEVVLHDDGYK
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       ::::..::::::::::::::. :..:. :::.. :. : :.:. .: .: .:.:. :::.
XP_016 KHLKQHCNKVLLRVRMLYYLKAEILGEAAEKAFEGSPARELDVPLPDIDYMEIPVDWWDA
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pF1KE9 EADKSLLIGVFKHGYEKYNTMRADPALCFLEKAGRPDDKAIAAEHRVLDNFSDIVEGVDF
       ::::::::::::::::.::.::::::::::::.: ::.:...::. : :. ::: :  . 
XP_016 EADKSLLIGVFKHGYERYNAMRADPALCFLEKVGMPDEKSLSAEQGVTDGTSDIPERGNT
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pF1KE9 DK-DCEDPEYKPLQGPPKDQDDEGDPLMMMDEEISVIDGDEAQVTQQPGHLFWPPGSALT
       :: :  . .   ::   ....: :: ..   ..    :.  ::  ..: .  :: .::::
XP_016 DKEDNAEDKVDGLQKQTESSSDGGDGVFSEKKD----DSRAAQDGSDPDKSPWPVSSALT
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pF1KE9 ARLRRLVTAYQRSYKREQMKIEAAERGDRRRRRCEAAFKLK---EIARREKQQRWTRREQ
       ::::::::.:::  ..:  . :    :..     :  :.     ..  .: :.:::::::
XP_016 ARLRRLVTVYQRCNRKELCRPEILGPGNQGYWVQEEMFRRTSEMDLINKEAQKRWTRREQ
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pF1KE9 TDFYRVVSTFGVEYDPDTMQFHWDRFRTFARLDKKTDESLTKYFHGFVAMCRQVCRLPPA
       .::::.::.::: :: .   : : .:: ..:::::.:::: .::..::::::.:::::  
XP_016 ADFYRTVSSFGVVYDQEKKTFDWTQFRIISRLDKKSDESLEQYFYSFVAMCRNVCRLPTW
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pF1KE9 AGDEPPDPNLFIEPITEERASRTLYRIELLRRLREQVLCHPLLEDRLALCQPPGPELPKW
           ::: ....::::::::.::::::::::..:::::  : :..:: ::.: .  :: :
XP_016 KDGGPPDTTIYVEPITEERAARTLYRIELLRKVREQVLKCPQLHERLQLCRP-SLYLPVW
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pF1KE9 WEPVRHDGELLRGAARHGVSQTDCNIMQDPDFSFLAARMNYMQNHQAGAPAPSLSRCSTP
       ::  .:: .:: :.:.::...::: ::.::..::: :  :: :....:. ::.   :   
XP_016 WECGKHDRDLLIGTAKHGLNRTDCYIMNDPQLSFLDAYRNYAQHKRSGTQAPGNLCCLYQ
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pF1KE9 LLHQQYTSRTASPLPLRPDAPVEKSPEETATQVPSLESLTLKLEHEVVARSRPTPQDYEM
          . : : : : .  : .  .:. ::                                 
XP_016 TNSKLYESLTYSQMS-RTSESLENEPENLVRVESRDDHLSLPDVTCENFISKVQDVISIN
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>>XP_016883591 (OMIM: 616114) chromodomain-helicase-DNA-  (2424 aa)
 initn: 4940 init1: 3015 opt: 6352  Z-score: 3251.6  bits: 615.8 E(91774): 2.4e-174
Smith-Waterman score: 6468; 59.9% identity (79.4% similar) in 1677 aa overlap (364-2010:10-1661)

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XP_016                      MASITIKLPPIQLSNLKVLNHSPMSDASVNFDYKSPS--
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pF1KE9 LSVPVKVVLQPQAGSSQGASSGLSVVKVLSASEVAALSSPASSAPHSG------GKTGME
          :     . .    . ::  :    . .: : ::   : . . :.:      : ::..
XP_016 ---PFDCSTDQEEKIEDVASHCLPQKDLYTAEEEAATLFPRKMTSHNGMEDSGGGGTGVK
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pF1KE9 ENRRLEHQKKQE---KANRIVAEAIARARARGEQNIPRVLNEDELPSVRPE---EEGEKK
       ..:. ..   ::   :...       : :   : . ::  .: .  . . :   ..: ::
XP_016 KKRKKKEPGDQEGAAKGSKDREPKPKRKREPKEPKEPRKAKEPKKAKEHKEPKQKDGAKK
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pF1KE9 RRKKSAGERLKEEKPKKSKTSGASKTKGK--SKLNTITPVVGKKR-KRNTSSDNSDVEV-
        ::   .   :: : :.: :..:..::..  :: .  :::  ::. ::.. .   ..:. 
XP_016 ARKPREASGTKEAKEKRSCTDSAARTKSRKASKEQGPTPVEKKKKGKRKSETTVESLELD
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pF1KE9 ----MPA-QSPREDEESS-IQKRRSNRQVKRKKYTEDLDIKITDDEEEEEVDVTGPIKPE
            :. .::.:. ::.  :::::.:::::.::.::::.:..::. :  . : :  .  
XP_016 QGLTNPSLRSPEESTESTDSQKRRSGRQVKRRKYNEDLDFKVVDDDGET-IAVLGAGRTS
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pF1KE9 PILPEPVQEPDGETLPSMQFFVENPSEEDAAIVDKVLSMRIVKKELPSGQYTEAEEFFVK
        .           .  .. . .:.: :.:: :..:.:. . :..  :.    . : :.::
XP_016 AL-----------SASTLAWQAEEPPEDDANIIEKILASKTVQEVHPGEPPFDLELFYVK
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pF1KE9 YKNYSYLHCEWATISQLEKDKRIHQKLKRFKTKMAQMRHFFHE-DEEPFNPDYVEVDRIL
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XP_016 YRNFSYLHCKWATMEELEKDPRIAQKIKRFRNKQAQMKHIFTEPDEDLFNPDYVEVDRIL
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pF1KE9 DESHSIDKDNGEPVIYYLVKWCSLPYEDSTWELKEDVDEGKIREFKRIQSRHPELKRVNR
       . .:. : ..:: : .:::::::::::.:::::.:::: .:..::. .:   ::.:.:.:
XP_016 EVAHTKDAETGEEVTHYLVKWCSLPYEESTWELEEDVDPAKVKEFESLQVL-PEIKHVER
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       : ...:.::: :.:::: ::::::::::.::::::::::.:::::::::::::::::.::
XP_016 PASDSWQKLEKSREYKNSNQLREYQLEGMNWLLFNWYNRKNCILADEMGLGKTIQSITFL
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       .:..  :::::::.:::::::::::::: ::::::.::::::  ::::::::::  .:..
XP_016 SEIFLRGIHGPFLIIAPLSTITNWEREFRTWTEMNAIVYHGSQISRQMIQQYEMVYRDAQ
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pF1KE9 GRLIPGAYKFDALITTFEMILSDCPELREIEWRCVIIDEAHRLKNRNCKLLDSLKHMDLE
       :  . :..:: ..::::::::.:::::..:.: ::::::::::::::::::..:: : ::
XP_016 GNPLSGVFKFHVVITTFEMILADCPELKKIHWSCVIIDEAHRLKNRNCKLLEGLKLMALE
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       ::::::::::::.::::::::.::::::::::. ::..::::::::::.:::.:::::::
XP_016 HKVLLTGTPLQNSVEELFSLLNFLEPSQFPSETAFLEEFGDLKTEEQVKKLQSILKPMML
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       ::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.. :::::.:::::
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       ::::::::::::::::::: .::..      ::.::::...:::::::::::::: ::::
XP_016 LRKCCNHPYLINGAEEKILEDFRKTHSPDAPDFQLQAMIQAAGKLVLIDKLLPKLIAGGH
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       :::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::: ::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       :::::::::::::... : :. .:.::.:: :.:::::::::.:.:.:.:::::::::::
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       :::: ::: ::::.:::::::::::::::: :::::::::::::::::: :.:: .  : 
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pF1KE9 KNNLVIDTPRVRKQTRHFSTLKDDDLVEFSDLESEDDERP-RSRR-HDRHHAYGRTDCFR
       :..:::: :::::::.:......:.:.:::.:.:..:::: :::: .:. . : :..:::
XP_016 KESLVIDRPRVRKQTKHYNSFEEDELMEFSELDSDSDERPTRSRRLNDKARRYLRAECFR
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       :::.::..:::::.:::.::::: ...:.:.: ::::.::::. ::.:::.::.:::.::
XP_016 VEKNLLIFGWGRWKDILTHGRFKWHLNEKDMEMICRALLVYCVKHYKGDEKIKSFIWELI
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       .:...:... :::::::: ::::::::::.:.:  . ... :::.   ::.....:..::
XP_016 TPTKDGQAQTLQNHSGLSAPVPRGRKGKKTKNQLLIPELKDADWLATCNPEVVLHDDGYK
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       ::::..::::::::::::::. :..:. :::.. :. : :.:. .: .: .:.:. :::.
XP_016 KHLKQHCNKVLLRVRMLYYLKAEILGEAAEKAFEGSPARELDVPLPDIDYMEIPVDWWDA
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pF1KE9 EADKSLLIGVFKHGYEKYNTMRADPALCFLEKAGRPDDKAIAAEHRVLDNFSDIVEGVDF
       ::::::::::::::::.::.::::::::::::.: ::.:...::. : :. ::: :  . 
XP_016 EADKSLLIGVFKHGYERYNAMRADPALCFLEKVGMPDEKSLSAEQGVTDGTSDIPERGNT
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       :: :  . .   ::   ....: :: ..   ..    :.  ::  ..: .  :: .::::
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       ::::::::.:::  ..:  . :    :..     :  :.     ..  .: :.:::::::
XP_016 ARLRRLVTVYQRCNRKELCRPEILGPGNQGYWVQEEMFRRTSEMDLINKEAQKRWTRREQ
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pF1KE9 TDFYRVVSTFGVEYDPDTMQFHWDRFRTFARLDKKTDESLTKYFHGFVAMCRQVCRLPPA
       .::::.::.::: :: .   : : .:: ..:::::.:::: .::..::::::.:::::  
XP_016 ADFYRTVSSFGVVYDQEKKTFDWTQFRIISRLDKKSDESLEQYFYSFVAMCRNVCRLPTW
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pF1KE9 AGDEPPDPNLFIEPITEERASRTLYRIELLRRLREQVLCHPLLEDRLALCQPPGPELPKW
           ::: ....::::::::.::::::::::..:::::  : :..:: ::.: .  :: :
XP_016 KDGGPPDTTIYVEPITEERAARTLYRIELLRKVREQVLKCPQLHERLQLCRP-SLYLPVW
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       ::  .:: .:: :.:.::...::: ::.::..::: :  :: :....:. ::.   :   
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          . : : : : .  : .  .:. ::                                 
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             : ::....:. ..   ::   :...       : :   : . ::  .: .  . 
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       . :   ..: :: ::   .   :: : :.: :..:..::..  :: .  :::  ::. ::
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       .. .   ..:.      :. .::.:. ::.  :::::.:::::.::.::::.:..::. :
XP_016 KSETTVESLELDQGLTNPSLRSPEESTESTDSQKRRSGRQVKRRKYNEDLDFKVVDDDGE
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         . : :  .   .           .  .. . .:.: :.:: :..:.:. . :..  :.
XP_016 T-IAVLGAGRTSAL-----------SASTLAWQAEEPPEDDANIIEKILASKTVQEVHPG
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XP_016 EPPFDLELFYVKYRNFSYLHCKWATMEELEKDPRIAQKIKRFRNKQAQMKHIFTEPDEDL
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       ::::::::::::. .:. : ..:: : .:::::::::::.:::::.:::: .:..::. .
XP_016 FNPDYVEVDRILEVAHTKDAETGEEVTHYLVKWCSLPYEESTWELEEDVDPAKVKEFESL
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       :   ::.:.:.:: ...:.::: :.:::: ::::::::::.::::::::::.::::::::
XP_016 QVL-PEIKHVERPASDSWQKLEKSREYKNSNQLREYQLEGMNWLLFNWYNRKNCILADEM
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       :::::::::.::.:..  :::::::.:::::::::::::: ::::::.::::::  ::::
XP_016 GLGKTIQSITFLSEIFLRGIHGPFLIIAPLSTITNWEREFRTWTEMNAIVYHGSQISRQM
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       ::::::  .:..:  . :..:: ..::::::::.:::::..:.: :::::::::::::::
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       :::..:: : ::::::::::::::.::::::::.::::::::::. ::..::::::::::
XP_016 KLLEGLKLMALEHKVLLTGTPLQNSVEELFSLLNFLEPSQFPSETAFLEEFGDLKTEEQV
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       .:::.:::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::..
XP_016 KKLQSILKPMMLRRLKDDVEKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLTKGANQ
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        :::::.:::::::::::::::::::::::: .::..      ::.::::...:::::::
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       ::::::: :::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::: ::
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       :::::::::::::::::::::::::... : :. .:.::.:: :.:::::::::.:.:.:
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       .::::::::::::::: ::: ::::.:::::::::::::::: :::::::::::::::::
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       . . : :..::::::.::..:::::.:::.::::: ...:.:.: ::::.::::. ::.:
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       ::.....:..::::::..::::::::::::::. :..:. :::.. :. : :.:. .: .
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       .. .   ..:.      :. .::.:. ::.  :::::.:::::.::.::::.:..::. :
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         . : :  .   .           .  .. . .:.: :.:: :..:.:. . :..  :.
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       :   ::.:.:.:: ...:.::: :.:::: ::::::::::.::::::::::.::::::::
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XP_005 KLLEGLKLMALEHKVLLTGTPLQNSVEELFSLLNFLEPSQFPSETAFLEEFGDLKTEEQV
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XP_005 KKLQSILKPMMLRRLKDDVEKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLTKGANQ
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XP_005 DKLLPKLIAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYTYERIDGRVRGNLRQAAIDRFCKP
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       .::::::::::::::: ::: ::::.:::::::::::::::: :::::::::::::::::
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       : :.:: .  : :..:::: :::::::.:......:.:.:::.:.:..:::: :::: .:
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       . . : :..::::::.::..:::::.:::.::::: ...:.:.: ::::.::::. ::.:
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       ::.::.:::.::.:...:... :::::::: ::::::::::.:.:  . ... :::.   
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       ::.....:..::::::..::::::::::::::. :..:. :::.. :. : :.:. .: .
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       : .:.:. :::.::::::::::::::::.::.::::::::::::.: ::.:...::. : 
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        .  :: .::::::::::::.:::  ..:  . :    :..     :  :.     ..  
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       .: :.:::::::.::::.::.::: :: .   : : .:: ..:::::.:::: .::..::
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       ::::.:::::      ::: ....::::::::.::::::::::..:::::  : :..:: 
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       ::.: .  :: :::  .:: .:: :.:.::...::: ::.::..::: :  :: :....:
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       :   ::.:.:.:: ...:.::: :.:::: ::::::::::.::::::::::.::::::::
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       :::::::::.::.:..  :::::::.:::::::::::::: ::::::.::::::  ::::
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       ::::::  .:..:  . :..:: ..::::::::.:::::..:.: :::::::::::::::
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XP_011 KKLQSILKPMMLRRLKDDVEKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLTKGANQ
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XP_011 HNMPNLINTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILEDFRKTHSPDAPDFQLQAMIQAAGKLVLI
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pF1KE9 DKLLPKLKAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYLYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKP
       ::::::: :::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::: ::
XP_011 DKLLPKLIAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYTYERIDGRVRGNLRQAAIDRFCKP
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XP_011 DSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLI
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pF1KE9 TRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQSMSGRDGNITGIQQFSKKEIEDLLRKGAYAAIMEE
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XP_011 TRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQDIN-RKGGTNGVQQLSKMEVEDLLRKGAYGALMDE
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XP_011 EDEGSKFCEEDIDQILQRRTHTITIQSEGKGSTFAKASFVASGNRTDISLDDPNFWQKWA
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pF1KE9 DENIKGFIWDLISPAENGKTKELQNHSGLSIPVPRGRKGKKVKSQSTF-DIHKADWIRKY
       ::.::.:::.::.:...:... :::::::: ::::::::::.:.:  . ... :::.   
XP_011 DEKIKSFIWELITPTKDGQAQTLQNHSGLSAPVPRGRKGKKTKNQLLIPELKDADWLATC
        1150      1160      1170      1180      1190      1200     

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pF1KE9 NPDTLFQDESYKKHLKHQCNKVLLRVRMLYYLRQEVIGDQAEKVLGGAIASEIDIWFPVV
       ::.....:..::::::..::::::::::::::. :..:. :::.. :. : :.:. .: .
XP_011 NPEVVLHDDGYKKHLKQHCNKVLLRVRMLYYLKAEILGEAAEKAFEGSPARELDVPLPDI
        1210      1220      1230      1240      1250      1260     

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pF1KE9 DQLEVPTTWWDSEADKSLLIGVFKHGYEKYNTMRADPALCFLEKAGRPDDKAIAAEHRVL
       : .:.:. :::.::::::::::::::::.::.::::::::::::.: ::.:...::. : 
XP_011 DYMEIPVDWWDAEADKSLLIGVFKHGYERYNAMRADPALCFLEKVGMPDEKSLSAEQGVT
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pF1KE9 DNFSDIVEGVDFDK-DCEDPEYKPLQGPPKDQDDEGDPLMMMDEEISVIDGDEAQVTQQP
       :. ::: :  . :: :  . .   ::   ....: :: ..   ..    :.  ::  ..:
XP_011 DGTSDIPERGNTDKEDNAEDKVDGLQKQTESSSDGGDGVFSEKKD----DSRAAQDGSDP
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pF1KE9 GHLFWPPGSALTARLRRLVTAYQRSYKREQMKIEAAERGDRRRRRCEAAFKLK---EIAR
        .  :: .::::::::::::.:::  ..:  . :    :..     :  :.     ..  
XP_011 DKSPWPVSSALTARLRRLVTVYQRCNRKELCRPEILGPGNQGYWVQEEMFRRTSEMDLIN
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pF1KE9 REKQQRWTRREQTDFYRVVSTFGVEYDPDTMQFHWDRFRTFARLDKKTDESLTKYFHGFV
       .: :.:::::::.::::.::.::: :: .   : : .:: ..:::::.:::: .::..::
XP_011 KEAQKRWTRREQADFYRTVSSFGVVYDQEKKTFDWTQFRIISRLDKKSDESLEQYFYSFV
            1450      1460      1470      1480      1490      1500 

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pF1KE9 AMCRQVCRLPPAAGDEPPDPNLFIEPITEERASRTLYRIELLRRLREQVLCHPLLEDRLA
       ::::.:::::      ::: ....::::::::.::::::::::..:::::  : :..:: 
XP_011 AMCRNVCRLPTWKDGGPPDTTIYVEPITEERAARTLYRIELLRKVREQVLKCPQLHERLQ
            1510      1520      1530      1540      1550      1560 

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pF1KE9 LCQPPGPELPKWWEPVRHDGELLRGAARHGVSQTDCNIMQDPDFSFLAARMNYMQNHQAG
       ::.: .  :: :::  .:: .:: :.:.::...::: ::.::..::: :  :: :....:
XP_011 LCRP-SLYLPVWWECGKHDRDLLIGTAKHGLNRTDCYIMNDPQLSFLDAYRNYAQHKRSG
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pF1KE9 APAPSLSRCSTPLLHQQYTSRTASPLPLRPDAPVEKSPEETATQVPSLESLTLKLEHEVV
       . ::.   :      . : : : : .  : .  .:. ::                     
XP_011 TQAPGNLCCLYQTNSKLYESLTYSQMS-RTSESLENEPENLVRVESRDDHLSLPDVTCEN
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pF1KE9 ARSRPTPQDYEMRVSPSDTTPLVSRSVPPVKLEDEDDSDSELDLSKLSPSSSSSSSSSSS
                                                                   
XP_011 FISKVQDVISINHDESLLPESLESMMYGKKVLSQEPSSFQESPSTNTESRKDVITISISK
    1680      1690      1700      1710      1720      1730         

>>NP_115597 (OMIM: 616114) chromodomain-helicase-DNA-bin  (2715 aa)
 initn: 4940 init1: 3015 opt: 6352  Z-score: 3250.9  bits: 615.8 E(91774): 2.6e-174
Smith-Waterman score: 6470; 59.8% identity (79.3% similar) in 1680 aa overlap (361-2010:6-1660)

              340       350       360       370       380       390
pF1KE9 QGQPAKVVTIQLQVQQPQQKIQIVPQPPSSQPQPQQPPSTQPVTLSSVQQAQIMGPGQSP
                                     : . .:  . . .. : ...:..    .::
NP_115                          MKMKIQKKEKQLSNLKVLNHSPMSDASVNFDYKSP
                                        10        20        30     

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pF1KE9 GQRLSVPVKVVLQPQAGSSQGASSGLSVVKVLSASEVAALSSPASSAPHSG------GKT
       .     :     . .    . ::  :    . .: : ::   : . . :.:      : :
NP_115 S-----PFDCSTDQEEKIEDVASHCLPQKDLYTAEEEAATLFPRKMTSHNGMEDSGGGGT
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pF1KE9 GMEENRRLEHQKKQE---KANRIVAEAIARARARGEQNIPRVLNEDELPSVRPE---EEG
       :....:. ..   ::   :...       : :   : . ::  .: .  . . :   ..:
NP_115 GVKKKRKKKEPGDQEGAAKGSKDREPKPKRKREPKEPKEPRKAKEPKKAKEHKEPKQKDG
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pF1KE9 EKKRRKKSAGERLKEEKPKKSKTSGASKTKGK--SKLNTITPVVGKKR-KRNTSSDNSDV
        :: ::   .   :: : :.: :..:..::..  :: .  :::  ::. ::.. .   ..
NP_115 AKKARKPREASGTKEAKEKRSCTDSAARTKSRKASKEQGPTPVEKKKKGKRKSETTVESL
              160       170       180       190       200       210

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pF1KE9 EV-----MPA-QSPREDEESS-IQKRRSNRQVKRKKYTEDLDIKITDDEEEEEVDVTGPI
       :.      :. .::.:. ::.  :::::.:::::.::.::::.:..::. :  . : :  
NP_115 ELDQGLTNPSLRSPEESTESTDSQKRRSGRQVKRRKYNEDLDFKVVDDDGET-IAVLGAG
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pF1KE9 KPEPILPEPVQEPDGETLPSMQFFVENPSEEDAAIVDKVLSMRIVKKELPSGQYTEAEEF
       .   .           .  .. . .:.: :.:: :..:.:. . :..  :.    . : :
NP_115 RTSAL-----------SASTLAWQAEEPPEDDANIIEKILASKTVQEVHPGEPPFDLELF
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pF1KE9 FVKYKNYSYLHCEWATISQLEKDKRIHQKLKRFKTKMAQMRHFFHE-DEEPFNPDYVEVD
       .:::.:.:::::.:::. .:::: :: ::.:::..:.:::.:.: : ::. :::::::::
NP_115 YVKYRNFSYLHCKWATMEELEKDPRIAQKIKRFRNKQAQMKHIFTEPDEDLFNPDYVEVD
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pF1KE9 RILDESHSIDKDNGEPVIYYLVKWCSLPYEDSTWELKEDVDEGKIREFKRIQSRHPELKR
       :::. .:. : ..:: : .:::::::::::.:::::.:::: .:..::. .:   ::.:.
NP_115 RILEVAHTKDAETGEEVTHYLVKWCSLPYEESTWELEEDVDPAKVKEFESLQVL-PEIKH
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pF1KE9 VNRPQASAWKKLELSHEYKNRNQLREYQLEGVNWLLFNWYNRQNCILADEMGLGKTIQSI
       :.:: ...:.::: :.:::: ::::::::::.::::::::::.:::::::::::::::::
NP_115 VERPASDSWQKLEKSREYKNSNQLREYQLEGMNWLLFNWYNRKNCILADEMGLGKTIQSI
       440       450       460       470       480       490       

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pF1KE9 AFLQEVYNVGIHGPFLVIAPLSTITNWEREFNTWTEMNTIVYHGSLASRQMIQQYEMYCK
       .::.:..  :::::::.:::::::::::::: ::::::.::::::  ::::::::::  .
NP_115 TFLSEIFLRGIHGPFLIIAPLSTITNWEREFRTWTEMNAIVYHGSQISRQMIQQYEMVYR
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pF1KE9 DSRGRLIPGAYKFDALITTFEMILSDCPELREIEWRCVIIDEAHRLKNRNCKLLDSLKHM
       :..:  . :..:: ..::::::::.:::::..:.: ::::::::::::::::::..:: :
NP_115 DAQGNPLSGVFKFHVVITTFEMILADCPELKKIHWSCVIIDEAHRLKNRNCKLLEGLKLM
       560       570       580       590       600       610       

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pF1KE9 DLEHKVLLTGTPLQNTVEELFSLLHFLEPSQFPSESEFLKDFGDLKTEEQVQKLQAILKP
        ::::::::::::::.::::::::.::::::::::. ::..::::::::::.:::.::::
NP_115 ALEHKVLLTGTPLQNSVEELFSLLNFLEPSQFPSETAFLEEFGDLKTEEQVKKLQSILKP
       620       630       640       650       660       670       

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pF1KE9 MMLRRLKEDVEKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLSKGAGHTNMPNLLNT
       :::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.. :::::.::
NP_115 MMLRRLKDDVEKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLTKGANQHNMPNLINT
       680       690       700       710       720       730       

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pF1KE9 MMELRKCCNHPYLINGAEEKILTEFREACHIIPHDFHLQAMVRSAGKLVLIDKLLPKLKA
       :::::::::::::::::::::: .::..      ::.::::...:::::::::::::: :
NP_115 MMELRKCCNHPYLINGAEEKILEDFRKTHSPDAPDFQLQAMIQAAGKLVLIDKLLPKLIA
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pF1KE9 GGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYLYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLL
       ::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::: :::::::::::
NP_115 GGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYTYERIDGRVRGNLRQAAIDRFCKPDSDRFVFLL
       800       810       820       830       840       850       

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pF1KE9 CTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLITRNSYEREM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 CTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLITRNSYEREM
       860       870       880       890       900       910       

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pF1KE9 FDKASLKLGLDKAVLQSMSGRDGNITGIQQFSKKEIEDLLRKGAYAAIMEEDDEGSKFCE
       ::::::::::::::::... : :. .:.::.:: :.:::::::::.:.:.:.::::::::
NP_115 FDKASLKLGLDKAVLQDIN-RKGGTNGVQQLSKMEVEDLLRKGAYGALMDEEDEGSKFCE
       920       930        940       950       960       970      

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pF1KE9 EDIDQILLRRTTTITIESEGKGSTFAKASFVASENRTDISLDDPNFWQKWAKKADLDMDL
       ::::::: ::: ::::.:::::::::::::::: :::::::::::::::::: :.:: . 
NP_115 EDIDQILQRRTHTITIQSEGKGSTFAKASFVASGNRTDISLDDPNFWQKWAKIAELDTEA
        980       990      1000      1010      1020      1030      

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pF1KE9 LNSKNNLVIDTPRVRKQTRHFSTLKDDDLVEFSDLESEDDERP-RSRR-HDRHHAYGRTD
        : :..:::: :::::::.:......:.:.:::.:.:..:::: :::: .:. . : :..
NP_115 KNEKESLVIDRPRVRKQTKHYNSFEEDELMEFSELDSDSDERPTRSRRLNDKARRYLRAE
       1040      1050      1060      1070      1080      1090      

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pF1KE9 CFRVEKHLLVYGWGRWRDILSHGRFKRRMTERDVETICRAILVYCLLHYRGDENIKGFIW
       ::::::.::..:::::.:::.::::: ...:.:.: ::::.::::. ::.:::.::.:::
NP_115 CFRVEKNLLIFGWGRWKDILTHGRFKWHLNEKDMEMICRALLVYCVKHYKGDEKIKSFIW
       1100      1110      1120      1130      1140      1150      

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pF1KE9 DLISPAENGKTKELQNHSGLSIPVPRGRKGKKVKSQSTF-DIHKADWIRKYNPDTLFQDE
       .::.:...:... :::::::: ::::::::::.:.:  . ... :::.   ::.....:.
NP_115 ELITPTKDGQAQTLQNHSGLSAPVPRGRKGKKTKNQLLIPELKDADWLATCNPEVVLHDD
       1160      1170      1180      1190      1200      1210      

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pF1KE9 SYKKHLKHQCNKVLLRVRMLYYLRQEVIGDQAEKVLGGAIASEIDIWFPVVDQLEVPTTW
       .::::::..::::::::::::::. :..:. :::.. :. : :.:. .: .: .:.:. :
NP_115 GYKKHLKQHCNKVLLRVRMLYYLKAEILGEAAEKAFEGSPARELDVPLPDIDYMEIPVDW
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pF1KE9 WDSEADKSLLIGVFKHGYEKYNTMRADPALCFLEKAGRPDDKAIAAEHRVLDNFSDIVEG
       ::.::::::::::::::::.::.::::::::::::.: ::.:...::. : :. ::: : 
NP_115 WDAEADKSLLIGVFKHGYERYNAMRADPALCFLEKVGMPDEKSLSAEQGVTDGTSDIPER
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        . :: :  . .   ::   ....: :: ..   ..    :.  ::  ..: .  :: .:
NP_115 GNTDKEDNAEDKVDGLQKQTESSSDGGDGVFSEKKD----DSRAAQDGSDPDKSPWPVSS
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       :::::::::::.:::  ..:  . :    :..     :  :.     ..  .: :.::::
NP_115 ALTARLRRLVTVYQRCNRKELCRPEILGPGNQGYWVQEEMFRRTSEMDLINKEAQKRWTR
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       :::.::::.::.::: :: .   : : .:: ..:::::.:::: .::..::::::.::::
NP_115 REQADFYRTVSSFGVVYDQEKKTFDWTQFRIISRLDKKSDESLEQYFYSFVAMCRNVCRL
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       :      ::: ....::::::::.::::::::::..:::::  : :..:: ::.: .  :
NP_115 PTWKDGGPPDTTIYVEPITEERAARTLYRIELLRKVREQVLKCPQLHERLQLCRP-SLYL
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       : :::  .:: .:: :.:.::...::: ::.::..::: :  :: :....:. ::.   :
NP_115 PVWWECGKHDRDLLIGTAKHGLNRTDCYIMNDPQLSFLDAYRNYAQHKRSGTQAPGNLCC
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             . : : : : .  : .  .:. ::                              
NP_115 LYQTNSKLYESLTYSQMS-RTSESLENEPENLVRVESRDDHLSLPDVTCENFISKVQDVI
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       ..:. ..   ::   :...       : :   : . ::  .: .  . . :   ..: ::
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        ::   .   :: : :.: :..:..::..  :: .  :::  ::. ::.. .   ..:. 
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            :. .::.:. ::.  :::::.:::::.::.::::.:..::. :  . : :  .  
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        .           .  .. . .:.: :.:: :..:.:. . :..  :.    . : :.::
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       .:..  :::::::.:::::::::::::: ::::::.::::::  ::::::::::  .:..
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XP_016 DQILQRRTHTITIQSEGKGSTFAKASFVASGNRTDISLDDPNFWQKWAKIAELDTEAKNE
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pF1KE9 EADKSLLIGVFKHGYEKYNTMRADPALCFLEKAGRPDDKAIAAEHRVLDNFSDIVEGVDF
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pF1KE9 DK-DCEDPEYKPLQGPPKDQDDEGDPLMMMDEEISVIDGDEAQVTQQPGHLFWPPGSALT
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XP_016 DKEDNAEDKVDGLQKQTESSSDGGDGVFSEKKD----DSRAAQDGSDPDKSPWPVSSALT
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pF1KE9 ARLRRLVTAYQRSYKREQMKIEAAERGDRRRRRCEAAFKLK---EIARREKQQRWTRREQ
       ::::::::.:::  ..:  . :    :..     :  :.     ..  .: :.:::::::
XP_016 ARLRRLVTVYQRCNRKELCRPEILGPGNQGYWVQEEMFRRTSEMDLINKEAQKRWTRREQ
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pF1KE9 TDFYRVVSTFGVEYDPDTMQFHWDRFRTFARLDKKTDESLTKYFHGFVAMCRQVCRLPPA
       .::::.::.::: :: .   : : .:: ..:::::.:::: .::..::::::.:::::  
XP_016 ADFYRTVSSFGVVYDQEKKTFDWTQFRIISRLDKKSDESLEQYFYSFVAMCRNVCRLPTW
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pF1KE9 AGDEPPDPNLFIEPITEERASRTLYRIELLRRLREQVLCHPLLEDRLALCQPPGPELPKW
           ::: ....::::::::.::::::::::..:::::  : :..:: ::.: .  :: :
XP_016 KDGGPPDTTIYVEPITEERAARTLYRIELLRKVREQVLKCPQLHERLQLCRP-SLYLPVW
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       ::  .:: .:: :.:.::...::: ::.::..::: :  :: :....:. ::.   :   
XP_016 WECGKHDRDLLIGTAKHGLNRTDCYIMNDPQLSFLDAYRNYAQHKRSGTQAPGNLCCLYQ
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pF1KE9 LLHQQYTSRTASPLPLRPDAPVEKSPEETATQVPSLESLTLKLEHEVVARSRPTPQDYEM
          . : : : : .  : .  .:. ::                                 
XP_016 TNSKLYESLTYSQMS-RTSESLENEPENLVRVESRDDHLSLPDVTCENFISKVQDVISIN
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>>NP_060250 (OMIM: 214800,608892,612370) chromodomain-he  (2997 aa)
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       .... ..  ....  :     :..    ...:: .  .::    ::            :.
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NP_060 PIHPSGSLNQMNTQTMHPSQPQGTY-ASPPPMSPMKAMSNPAGTPPPQVRPGSAGIPMEV
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NP_060 KKKNNHIVAEDPSKGF--GKDDFPGGVDNQELNRNSLDGSQEEKKKKKRSKAKKDPKEPK
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NP_060 EPKEKKEPKEPKTPKAPKIPKEPKEKKAKTATPKPKSSKKSSNKKPDSEASALKKKVNKG
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       .. .:.:::..  :  ::  .:::. ..:::::.::::::.:::::..::.: :: ...:
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       ..:  .:     .  :  . :.. .     :.:      .:.:..: : :::.  ::. .
NP_060 AAGRDSPS----NTSQSEQQESVDA-----EGP------VVEKIMSSRSVKKQKESGEEV
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       : :::.:::::.:::::.::.: .:::::::.::.::::.:..: . . . ..: :::::
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       ::::::.: ..: : : :::: .:::::::::::::::: ..:.:..::.::....::.:
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pF1KE9 ELKRVNRPQASAWKKLELSHEYKNRNQLREYQLEGVNWLLFNWYNRQNCILADEMGLGKT
       : .::.:: :. ::: : :.:::: :.:::::::::::::::::: .:::::::::::::
NP_060 ETERVERPPADDWKKSESSREYKNNNKLREYQLEGVNWLLFNWYNMRNCILADEMGLGKT
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       ::::.:: :.:  ::::::::::::::: :::::: ::::.:..::::: :::. :: ::
NP_060 IQSITFLYEIYLKGIHGPFLVIAPLSTIPNWEREFRTWTELNVVVYHGSQASRRTIQLYE
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       :: :: .::.: :.::: :.::::::::.::::::.: ::::.:::::::::::::::..
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       :: :::::::::::::::::::::::::::::::.::::. :...:::::::::::::::
NP_060 LKMMDLEHKVLLTGTPLQNTVEELFSLLHFLEPSRFPSETTFMQEFGDLKTEEQVQKLQA
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pF1KE9 ILKPMMLRRLKEDVEKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLSKGAGHTNMPN
       :::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::.:::::.:..:.::
NP_060 ILKPMMLRRLKEDVEKNLAPKEETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFTFLSKGGGQANVPN
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       :::::::::::::::::::::::::: ::.:. .    ::.::::...::::::::::::
NP_060 LLNTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILEEFKETHNAESPDFQLQAMIQAAGKLVLIDKLLP
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NP_060 EREMFDKASLKLGLDKAVLQSMSGRENATNGVQQLSKKEIEDLLRKGAYGALMDEEDEGS
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       ::::::::::::::: ::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::.:
NP_060 KFCEEDIDQILLRRTHTITIESEGKGSTFAKASFVASGNRTDISLDDPNFWQKWAKKAEL
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pF1KE9 DMDLLNSKNNLVIDTPRVRKQTRHFSTLKDDDLVEFSDLESEDDERP--RSRR-HDRHHA
       :.: ::..::::::::::::::: .:..:.:.:.:::::::...:.:  . :: .:. ..
NP_060 DIDALNGRNNLVIDTPRVRKQTRLYSAVKEDELMEFSDLESDSEEKPCAKPRRPQDKSQG
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pF1KE9 YGRTDCFRVEKHLLVYGWGRWRDILSHGRFKRRMTERDVETICRAILVYCLLHYRGDENI
       :.:..::::::.::::::::: :::::::.::..::.:::::::.:::::: ::.:::::
NP_060 YARSECFRVEKNLLVYGWGRWTDILSHGRYKRQLTEQDVETICRTILVYCLNHYKGDENI
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pF1KE9 KGFIWDLISPAENGKTKELQNHSGLSIPVPRGRKGKKVKSQSTFDI-HKADWIRKYNPDT
       :.::::::.:. .:.:. : :::::: ::::::::::::.:::  . . :::. . :::.
NP_060 KSFIWDLITPTADGQTRALVNHSGLSAPVPRGRKGKKVKAQSTQPVVQDADWLASCNPDA
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pF1KE9 LFQDESYKKHLKHQCNKVLLRVRMLYYLRQEVIGDQAEKVLGGAIASEIDIWFPVVDQLE
       :::..::::::::.:::::::::::::::::::::::.:.: :: .:: :.:.:   . :
NP_060 LFQEDSYKKHLKHHCNKVLLRVRMLYYLRQEVIGDQADKILEGADSSEADVWIPEPFHAE
             1730      1740      1750      1760      1770      1780

    1620      1630      1640      1650      1660      1670         
pF1KE9 VPTTWWDSEADKSLLIGVFKHGYEKYNTMRADPALCFLEKAGRPDDKAIAAEHRVLDNFS
       ::. :::.:::::::::::::::::::.:::::::::::..: :: ::::::.:  : ..
NP_060 VPADWWDKEADKSLLIGVFKHGYEKYNSMRADPALCFLERVGMPDAKAIAAEQRGTDMLA
             1790      1800      1810      1820      1830      1840

    1680      1690      1700        1710      1720       1730      
pF1KE9 DIVEGVDFDKDCEDPEYKPLQGPPKDQDDE--GDPLMMMDEEISV-IDGDEAQVTQQPGH
       :  .: .::.. ::::::: . : ::. ::  ..:    .: . .   : ... . . :.
NP_060 DGGDGGEFDREDEDPEYKPTRTPFKDEIDEFANSPSEDKEESMEIHATGKHSESNAELGQ
             1850      1860      1870      1880      1890      1900

       1740      1750      1760      1770      1780      1790      
pF1KE9 LFWPPGSALTARLRRLVTAYQRSYKREQMKIEAAERGDRRRRRCEAAFKLKEIARR----
       :.::  :.::.:::::.:::::::::.::. ::  . :::::: .   .  :  :.    
NP_060 LYWPNTSTLTTRLRRLITAYQRSYKRQQMRQEALMKTDRRRRRPREEVRALEAEREAIIS
             1910      1920      1930      1940      1950      1960

           1800      1810      1820      1830      1840      1850  
pF1KE9 EKQQRWTRREQTDFYRVVSTFGVEYDPDTMQFHWDRFRTFARLDKKTDESLTKYFHGFVA
       ::.:.:::::..::::::::::: .::  .:: :..::.:::::::.:::: :::  :::
NP_060 EKRQKWTRREEADFYRVVSTFGVIFDPVKQQFDWNQFRAFARLDKKSDESLEKYFSCFVA
             1970      1980      1990      2000      2010      2020

           1860      1870      1880      1890      1900      1910  
pF1KE9 MCRQVCRLPPAAGDEPPDPNLFIEPITEERASRTLYRIELLRRLREQVLCHPLLEDRLAL
       :::.:::.:    ::::: . .::::::::::::::::::::..::::: :: : .:: :
NP_060 MCRRVCRMPVKPDDEPPDLSSIIEPITEERASRTLYRIELLRKIREQVLHHPQLGERLKL
             2030      2040      2050      2060      2070      2080

           1920      1930      1940      1950      1960      1970  
pF1KE9 CQPPGPELPKWWEPVRHDGELLRGAARHGVSQTDCNIMQDPDFSFLAARMNYMQNHQAGA
       ::: . .::.:::  ::: .:: :::.::::.:: .:..::..::: :. :. ::. :: 
NP_060 CQP-SLDLPEWWECGRHDRDLLVGAAKHGVSRTDYHILNDPELSFLDAHKNFAQNRGAGN
              2090      2100      2110      2120      2130         

           1980      1990      2000      2010      2020      2030  
pF1KE9 PAPSLSRCSTPLLHQQYTSRTASPLPLRPDAPVEKSPEETATQVPSLESLTLKLEHEVVA
        . ::.  .. ...   .  .:     :    .: . ::  . . . .    . :.:. .
NP_060 TS-SLNPLAVGFVQTPPVISSAHIQDERVLEQAEGKVEEPENPAAKEKCEGKEEEEETDG
    2140       2150      2160      2170      2180      2190        

           2040      2050      2060      2070      2080      2090  
pF1KE9 RSRPTPQDYEMRVSPSDTTPLVSRSVPPVKLEDEDDSDSELDLSKLSPSSSSSSSSSSSS
        .. . :. : ..:       :.  .  :..  .  : :   .:.    ..:  .   . 
NP_060 SGKESKQECEAEASS------VKNELKGVEVGADTGSKS---ISE----KGSEEDEEEKL
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pF1KE9 SSTDESEDEKEEKLTDQSRSKLYDEESLLSLTM----SQDGFPNEDGEQMTPELLLLQER
        . :.::. .. .    ::.: .::::  :..     ..:::  :::.  . .:  :.::
NP_060 EDDDKSEESSQPEAGAVSRGKNFDEESNASMSTARDETRDGFYMEDGDPSVAQL--LHER
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         : : ::::::.:::.: .:.:::.:::: .::..    : : :     .:::      
NP_060 TFAFSFWPKDRVMINRLDNICEAVLKGKWPVNRRQMFDFQGLIPGYTPTTVDSPLQKRSF
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                :.. .:    ::           ::  :          .  ::   .. : 
NP_060 AELSMVGQASISGSEDITTSPQLSKEDALNLSVPRQRRRRRRKIEIEAERAAKRRNLMEM
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pF1KE9 ----EEASAVS------------------TAAAQFTKLRRGMDEKEFTVQIKD-------
           .:...::                  .....:..:   .   . .. ..:       
NP_060 VAQLRESQVVSENGQEKVVDLSKASREATSSTSNFSSLSSKFILPNVSTPVSDAFKTQME
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pF1KE9 --EEGLKLTFQKHKLMANGVMGDGHPLFHKKKGNRKKLVELEVECM--------------
         . ::. :  .: :  :: . ::.: .....: ::..  :..  :              
NP_060 LLQAGLSRTPTRHLL--NGSLVDGEPPMKRRRGRRKNVEGLDLLFMSHKRTSLSAEDAEV
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pF1KE9 ----EE----------PNHLDVDLETRIPVINKVDGTLLVGEDAPRRAELEMWLQGHPEF
           ::          :.  ..: .:::::::  ::: :::::::.  .:  ::. :: .
NP_060 TKAFEEDIETPPTRNIPSPGQLDPDTRIPVINLEDGTRLVGEDAPKNKDLVEWLKLHPTY
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pF1KE9 AVD-PRFLAYMED-------RRKQKWQRCKKNNKAELNCL-GMEPVQTANSRNGKK----
       .:: : ..    :       . ::: .::.. :: ..: : : : : ..:.:::::    
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       . ....  :                                                   
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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