seq1 = pF1KE3294.tfa, 2298 bp
seq2 = pF1KE3294/gi568815589r_128631340.tfa (gi568815589r:128631340_128855565), 224226 bp

>pF1KE3294 2298
>gi568815589r:128631340_128855565 (Chr9)

(complement)

1-158  (100001-100158)   100% ->
159-309  (101607-101757)   100% ->
310-746  (101966-102402)   99% ->
747-923  (102717-102893)   100% ->
924-1038  (104039-104153)   100% ->
1039-1185  (104298-104444)   100% ->
1186-1359  (104777-104950)   100% ->
1360-1575  (112821-113036)   100% ->
1576-1617  (113725-113766)   100% ->
1618-1737  (113912-114031)   100% ->
1738-1853  (114679-114794)   100% ->
1854-2042  (115447-115635)   100% ->
2043-2140  (120135-120232)   100% ->
2141-2243  (122038-122140)   100% ->
2244-2298  (124172-124226)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGTCCGACACTCCCGAGTCGCTGATGGCCCTCTGTACTGACTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGTCCGACACTCCCGAGTCGCTGATGGCCCTCTGTACTGACTTCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTGCGCAACCTGGATGGCACCCTGGGCTACCTGCTGGACAAGGAGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTGCGCAACCTGGATGGCACCCTGGGCTACCTGCTGGACAAGGAGACCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCGGCTACATCCGGACATCTTCTTGCCCAGCGAGATCTGTGACCGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCGGCTACATCCGGACATCTTCTTGCCCAGCGAGATCTGTGACCGGCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTCAATGA         GTATGTGGAGCTGGTGAACGCTGCCTGTAACTT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTCAATGAGTG...CAGGTATGTGGAGCTGGTGAACGCTGCCTGTAACTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGAGCCACACGAGAGCTTCTTCAGCCTCTTTTCGGACCCCCGCAGCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101640 CGAGCCACACGAGAGCTTCTTCAGCCTCTTTTCGGACCCCCGCAGCACCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCCTCACGCGGATCCACCTCCGTGAGGACCTGGTGCAGGACCAGGACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101690 GCCTCACGCGGATCCACCTCCGTGAGGACCTGGTGCAGGACCAGGACCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GAGGCCATCCGCAAGCAG         GACCTGGTGGAGCTGTACCTGAC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 101740 GAGGCCATCCGCAAGCAGGTG...CAGGACCTGGTGGAGCTGTACCTGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TAACTGCGAGAAGCTGTCCGCCAAGAGCCTGCAGACACTGAGGAGCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101989 TAACTGCGAGAAGCTGTCCGCCAAGAGCCTGCAGACACTGAGGAGCTTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GCCACACCCTGGTGTCCTTGAGCCTCTTCGGCTGTACAAACATTTTCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102039 GCCACACCCTGGTGTCCTTGAGCCTCTTCGGCTGTACAAACATTTTCTAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GAGGAGGAGAACCCAGGGGGCTGTGAAGATGAGTACCTCGTCAACCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102089 GAGGAGGAGAACCCAGGGGGCTGTGAAGATGAGTACCTCGTCAACCCCAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CTGCCAGGTGCTGGTTAAGGATTTCACCTTCGAGGGCTTCAGCCGCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102139 CTGCCAGGTGCTGGTTAAGGATTTCACCTTCGAGGGCTTCAGCCGCCTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GCTTCCTCAACTTGGGCCGCATGATTGATTGGGTCCCTGTGGAGTCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102189 GCTTCCTCAACTTGGGCCGCATGATTGATTGGGTCCCTGTGGAGTCCCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CTGCGGCCGCTTAACTCCCTGGCTGCCTTGGACCTCTCAGGCATTCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102239 CTGCGGCCGCTTAACTCCCTGGCTGCCTTGGACCTCTCAGGCATTCAGAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GAGCGACGCAGCCTTCCTCACCCAGTGGAAAGACAGCCTGGTGTCCCTCG
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102289 GAGCGACGCCGCCTTCCTCACCCAGTGGAAAGACAGCCTGGTGTCCCTCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 TCCTCTACAACATGGACCTGTCCGACGACCACATCCGGGTCATCGTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102339 TCCTCTACAACATGGACCTGTCCGACGACCACATCCGGGTCATCGTGCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 CTGCACAAGCTGCG         ACACCTGGACATCTCCCGAGACCGCCT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 102389 CTGCACAAGCTGCGGTG...CAGACACCTGGACATCTCCCGAGACCGCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CTCCAGCTACTACAAGTTCAAGCTGACTCGGGAGGTGCTGAGCCTCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102744 CTCCAGCTACTACAAGTTCAAGCTGACTCGGGAGGTGCTGAGCCTCTTTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 TGCAGAAGCTGGGGAACCTAATGTCCCTGGACATCTCTGGCCACATGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102794 TGCAGAAGCTGGGGAACCTAATGTCCCTGGACATCTCTGGCCACATGATC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 CTAGAGAACTGCAGCATCTCCAAGATGGAAGAGGAAGCGGGGCAGACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102844 CTAGAGAACTGCAGCATCTCCAAGATGGAAGAGGAAGCGGGGCAGACCAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924          CATTGAGCCTTCCAAGAGCAGCATCATACCTTTCCGGGCTC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102894 GTG...CAGCATTGAGCCTTCCAAGAGCAGCATCATACCTTTCCGGGCTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 TGAAGAGGCCGCTGCAGTTCCTCGGGCTCTTTGAGAACTCTCTGTGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104080 TGAAGAGGCCGCTGCAGTTCCTCGGGCTCTTTGAGAACTCTCTGTGCCGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 CTCACGCACATTCCAGCCTACAAA         GTAAGTGGTGACAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 104130 CTCACGCACATTCCAGCCTACAAAGTG...CAGGTAAGTGGTGACAAAAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 CGAAGAGCAGGTGCTGAATGCCATCGAGGCCTACACGGAGCACCGGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104315 CGAAGAGCAGGTGCTGAATGCCATCGAGGCCTACACGGAGCACCGGCCTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 AGATCACCTCGCGGGCCATCAACTTGCTTTTTGACATCGCCCGCATCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104365 AGATCACCTCGCGGGCCATCAACTTGCTTTTTGACATCGCCCGCATCGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 CGTTGCAACCAGCTGCTGCGGGCCCTGAAG         CTGGTCATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 104415 CGTTGCAACCAGCTGCTGCGGGCCCTGAAGGTC...CAGCTGGTCATCAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 GGCCCTCAAGTGCCACAAATATGACAGGAACATTCAAGTGACAGGCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104788 GGCCCTCAAGTGCCACAAATATGACAGGAACATTCAAGTGACAGGCAGCG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 CCGCTCTCTTCTACCTAACAAATTCCGAGTACCGCTCAGAGCAGAGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104838 CCGCTCTCTTCTACCTAACAAATTCCGAGTACCGCTCAGAGCAGAGTGTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 AAGCTGCGCCGGCAGGTTATCCAGGTGGTGCTGAATGGCATGGAATCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104888 AAGCTGCGCCGGCAGGTTATCCAGGTGGTGCTGAATGGCATGGAATCCTA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 CCAGGAGGTGACG         GTGCAGCGGAACTGCTGCCTGACGCTCT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 104938 CCAGGAGGTGACGGTG...CAGGTGCAGCGGAACTGCTGCCTGACGCTCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 GCAACTTCAGCATCCCCGAGGAGCTGGAATTCCAGTACCGCCGGGTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112849 GCAACTTCAGCATCCCCGAGGAGCTGGAATTCCAGTACCGCCGGGTCAAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 GAGCTCCTGCTCAGCATCCTCAACCCCACGCGGCAGGACGAGTCTATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112899 GAGCTCCTGCTCAGCATCCTCAACCCCACGCGGCAGGACGAGTCTATCCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 GCGGATCGCCGTGCACCTGTGCAATGCCCTGGTCTGCCAGGTAGACAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112949 GCGGATCGCCGTGCACCTGTGCAATGCCCTGGTCTGCCAGGTAGACAACG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1538 ACCACAAGGAGGCCGTGGGCAAGATGGGCTTTGTCGTG         ACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 112999 ACCACAAGGAGGCCGTGGGCAAGATGGGCTTTGTCGTGGTA...CAGACC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1579 ATGCTGAAGCTGATTCAGAAGAAGCTGCTGGACAAGACA         TG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 113728 ATGCTGAAGCTGATTCAGAAGAAGCTGCTGGACAAGACAGTA...CAGTG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 TGACCAGGTCATGGAGTTCTCCTGGAGTGCCCTGTGGAACATCACAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113914 TGACCAGGTCATGGAGTTCTCCTGGAGTGCCCTGTGGAACATCACAGATG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1670 AAACTCCTGACAACTGCGAGATGTTCCTCAATTTCAACGGCATGAAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113964 AAACTCCTGACAACTGCGAGATGTTCCTCAATTTCAACGGCATGAAGCTC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1720 TTCCTGGACTGCCTGAAG         GAATTCCCAGAGAAGCAGGAACT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 114014 TTCCTGGACTGCCTGAAGGTA...CAGGAATTCCCAGAGAAGCAGGAACT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 GCATAGGAATATGCTAGGACTTTTGGGGAATGTGGCAGAAGTGAAGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114702 GCATAGGAATATGCTAGGACTTTTGGGGAATGTGGCAGAAGTGAAGGAGC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1811 TGAGGCCTCAACTAATGACTTCCCAGTTCATCAGCGTCTTCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 114752 TGAGGCCTCAACTAATGACTTCCCAGTTCATCAGCGTCTTCAGGTT...C

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1854   CAACCTGTTGGAGAGCAAGGCCGATGGGATCGAGGTTTCCTACAATGC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115445 AGCAACCTGTTGGAGAGCAAGGCCGATGGGATCGAGGTTTCCTACAATGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 CTGCGGCGTCCTCTCCCACATCATGTTTGATGGACCCGAGGCCTGGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115495 CTGCGGCGTCCTCTCCCACATCATGTTTGATGGACCCGAGGCCTGGGGCG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1952 TCTGTGAGCCCCAGCGTGAGGAGGTGGAGGAACGCATGTGGGCTGCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115545 TCTGTGAGCCCCAGCGTGAGGAGGTGGAGGAACGCATGTGGGCTGCCATC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2002 CAGAGCTGGGACATAAACTCTCGGAGAAACATCAATTACAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 115595 CAGAGCTGGGACATAAACTCTCGGAGAAACATCAATTACAGGTG...CAG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2043 GTCATTTGAACCAATTCTCCGCCTCCTTCCCCAGGGAATCTCTCCTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120135 GTCATTTGAACCAATTCTCCGCCTCCTTCCCCAGGGAATCTCTCCTGTCA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2093 GCCAGCACTGGGCAACCTGGGCCCTGTATAACCTCGTGTCTGTCTACC  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 120185 GCCAGCACTGGGCAACCTGGGCCCTGTATAACCTCGTGTCTGTCTACCGT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2141        CGGACAAGTACTGCCCTCTGCTGATCAAAGAAGGGGGGATGCC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120235 G...CAGCGGACAAGTACTGCCCTCTGCTGATCAAAGAAGGGGGGATGCC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2184 CCTTCTGAGGGACATAATTAAGATGGCGACCGCACGGCAGGAGACCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122081 CCTTCTGAGGGACATAATTAAGATGGCGACCGCACGGCAGGAGACCAAGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2234 AAATGGCCCG         CAAGGTGATTGAGCACTGCAGTAACTTTAAA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 122131 AAATGGCCCGGTA...CAGCAAGGTGATTGAGCACTGCAGTAACTTTAAA

   2400     .    :    .    :
   2275 GAGGAGAACATGGACACGTCTAGA
        ||||||||||||||||||||||||
 124203 GAGGAGAACATGGACACGTCTAGA