seq1 = pF1KE4270.tfa, 3375 bp seq2 = pF1KE4270/gi568815597r_173838724.tfa (gi568815597r:173838724_174092985), 254262 bp >pF1KE4270 3375 >gi568815597r:173838724_174092985 (Chr1) (complement) 1-231 (100001-100231) 100% -> 232-352 (108367-108487) 100% -> 353-592 (109329-109568) 100% -> 593-768 (110084-110259) 100% -> 769-969 (111977-112177) 100% -> 970-1102 (114366-114498) 100% -> 1103-1221 (120359-120477) 100% -> 1222-1334 (122369-122481) 100% -> 1335-1616 (127866-128147) 100% -> 1617-1831 (128799-129013) 100% -> 1832-2202 (130891-131261) 99% -> 2203-2370 (131742-131909) 100% -> 2371-2523 (140848-141000) 100% -> 2524-2737 (145404-145617) 100% -> 2738-2828 (146150-146240) 100% -> 2829-2961 (146378-146510) 100% -> 2962-3108 (149398-149544) 100% -> 3109-3224 (151606-151721) 100% -> 3225-3375 (154112-154262) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGCCTGTACAAGCTCCACAATGGACGGATTTCCTCTCCTGCCCAATTTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGCCTGTACAAGCTCCACAATGGACGGATTTCCTCTCCTGCCCAATTTG 50 . : . : . : . : . : 51 CACTCAGACTTTCGACGAAACAATTCGAAAGCCCATCAGTTTGGGTTGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 CACTCAGACTTTCGACGAAACAATTCGAAAGCCCATCAGTTTGGGTTGTG 100 . : . : . : . : . : 101 GCCATACTGTCTGCAAGATGTGCCTGAATAAACTCCACCGCAAGGCTTGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100101 GCCATACTGTCTGCAAGATGTGCCTGAATAAACTCCACCGCAAGGCTTGC 150 . : . : . : . : . : 151 CCATTTGACCAGACCACTATCAATACAGACATTGAGCTCCTCCCTGTGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100151 CCATTTGACCAGACCACTATCAATACAGACATTGAGCTCCTCCCTGTGAA 200 . : . : . : . : . : 201 CTCAGCATTGCTGCAGCTCGTGGGTGCTCAG GTCCCTGAGC |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||| 100201 CTCAGCATTGCTGCAGCTCGTGGGTGCTCAGGTA...CAGGTCCCTGAGC 250 . : . : . : . : . : 242 AGCAGCCTATTACTTTGTGTAGTGGGGTTGAAGACACAAAGCATTATGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 108377 AGCAGCCTATTACTTTGTGTAGTGGGGTTGAAGACACAAAGCATTATGAG 300 . : . : . : . : . : 292 GAAGCCAAGAAATGTGTAGAAGAATTAGCATTGTACTTAAAACCGCTCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 108427 GAAGCCAAGAAATGTGTAGAAGAATTAGCATTGTACTTAAAACCGCTCAG 350 . : . : . : . : . : 342 CAGTGCTAGAG GAGTGGGTCTGAACAGCACTACTCAGAGTG |||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||| 108477 CAGTGCTAGAGGTA...AAGGAGTGGGTCTGAACAGCACTACTCAGAGTG 400 . : . : . : . : . : 383 TTCTGAGTCGCCCAATGCAGAGGAAGCTTGTGACTCTAGTCCACTGTCAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 109359 TTCTGAGTCGCCCAATGCAGAGGAAGCTTGTGACTCTAGTCCACTGTCAA 450 . : . : . : . : . : 433 CTAGTAGAAGAAGAAGGCAGGATTCGTGCCATGAGGGCAGCTCGATCTTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 109409 CTAGTAGAAGAAGAAGGCAGGATTCGTGCCATGAGGGCAGCTCGATCTTT 500 . : . : . : . : . : 483 AGGTGAACGAACAGTTACAGAGCTCATTCTCCAGCACCAGAATCCTCAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 109459 AGGTGAACGAACAGTTACAGAGCTCATTCTCCAGCACCAGAATCCTCAGC 550 . : . : . : . : . : 533 AACTCTCTTCCAATCTTTGGGCAGCAGTAAGGGCTAGGGGATGCCAGTTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 109509 AACTCTCTTCCAATCTTTGGGCAGCAGTAAGGGCTAGGGGATGCCAGTTC 600 . : . : . : . : . : 583 CTTGGACCAG CAATGCAGGAGGAAGCTTTAAAGTTGGTTCT ||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||| 109559 CTTGGACCAGGTA...TAGCAATGCAGGAGGAAGCTTTAAAGTTGGTTCT 650 . : . : . : . : . : 624 GCTGGCCTTAGAAGATGGTTCTGCTTTGTCAAGAAAAGTATTGGTTCTGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 110115 GCTGGCCTTAGAAGATGGTTCTGCTTTGTCAAGAAAAGTATTGGTTCTGT 700 . : . : . : . : . : 674 TTGTGGTGCAAAGATTGGAGCCACGGTTTCCTCAAGCCTCTAAAACTAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 110165 TTGTGGTGCAAAGATTGGAGCCACGGTTTCCTCAAGCCTCTAAAACTAGC 750 . : . : . : . : . : 724 ATTGGGCATGTTGTTCAGCTCCTTTATAGAGCCTCCTGTTTCAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.. 110215 ATTGGGCATGTTGTTCAGCTCCTTTATAGAGCCTCCTGTTTCAAGGTA.. 800 . : . : . : . : . : 769 GTCACCAAACGTGATGAAGACTCTTCTTTGATGCAGCTGAAAGAAG .>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 110265 .TAGGTCACCAAACGTGATGAAGACTCTTCTTTGATGCAGCTGAAAGAAG 850 . : . : . : . : . : 815 AATTTAGAACCTATGAAGCTCTGCGGCGAGAACATGACTCCCAGATAGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112023 AATTTAGAACCTATGAAGCTCTGCGGCGAGAACATGACTCCCAGATAGTG 900 . : . : . : . : . : 865 CAGATTGCTATGGAAGCAGGCTTACGAATTGCACCGGACCAGTGGTCCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112073 CAGATTGCTATGGAAGCAGGCTTACGAATTGCACCGGACCAGTGGTCCTC 950 . : . : . : . : . : 915 TTTGCTTTATGGAGACCAGTCTCACAAATCTCATATGCAGTCCATTATTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112123 TTTGCTTTATGGAGACCAGTCTCACAAATCTCATATGCAGTCCATTATTG 1000 . : . : . : . : . : 965 ACAAG TTGCAGACTCCAGCCTCTTTTGCACAGAGTGTTCAG |||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112173 ACAAGGTA...AAGTTGCAGACTCCAGCCTCTTTTGCACAGAGTGTTCAG 1050 . : . : . : . : . : 1006 GAACTAACAATTGCTCTCCAGCGAACTGGAGACCCAGCAAACTTGAACCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114402 GAACTAACAATTGCTCTCCAGCGAACTGGAGACCCAGCAAACTTGAACCG 1100 . : . : . : . : . : 1056 ACTAAGACCCCATTTGGAGCTGTTAGCAAACATTGACCCTAGTCCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>> 114452 ACTAAGACCCCATTTGGAGCTGTTAGCAAACATTGACCCTAGTCCAGGTA 1150 . : . : . : . : . : 1103 ATGCTCCTCCTCCTACTTGGGAACAGCTGGAAAATGGGCTGGTT ...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114502 ...TAGATGCTCCTCCTCCTACTTGGGAACAGCTGGAAAATGGGCTGGTT 1200 . : . : . : . : . : 1147 GCTGTGCGTACAGTGGTACATGGGCTGGTTGATTATATCCAGAACCACAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120403 GCTGTGCGTACAGTGGTACATGGGCTGGTTGATTATATCCAGAACCACAG 1250 . : . : . : . : . : 1197 CAAAAAAGGAGCAGATCAGCAGCAG CCTCCACAGCATAGCA |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||| 120453 CAAAAAAGGAGCAGATCAGCAGCAGGTA...TAGCCTCCACAGCATAGCA 1300 . : . : . : . : . : 1238 AATACAAAACATACATGTGTCGAGATATGAAGCAGAGAGGAGGATGCCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 122385 AATACAAAACATACATGTGTCGAGATATGAAGCAGAGAGGAGGATGCCCT 1350 . : . : . : . : . : 1288 CGTGGGGCCAGCTGTACATTTGCACACTCACAGGAGGAACTGGAAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>> 122435 CGTGGGGCCAGCTGTACATTTGCACACTCACAGGAGGAACTGGAAAAGTA 1400 . : . : . : . : . : 1335 ATTTCGTAAAATGAATAAGCGCCTGGTTCCGAGAAGACCCTTGA ...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 122485 ...TAGATTTCGTAAAATGAATAAGCGCCTGGTTCCGAGAAGACCCTTGA 1450 . : . : . : . : . : 1379 GTGCCTCTTTGGGTCAACTTAATGAGGTGGGCCTGCCTTCAGCAGCTATC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 127910 GTGCCTCTTTGGGTCAACTTAATGAGGTGGGCCTGCCTTCAGCAGCTATC 1500 . : . : . : . : . : 1429 CTTCCAGATGAAGGTGCAGTGGATCTCCCTAGCAGAAAACCTCCTGCTCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 127960 CTTCCAGATGAAGGTGCAGTGGATCTCCCTAGCAGAAAACCTCCTGCTCT 1550 . : . : . : . : . : 1479 GCCAAATGGAATTGTATCAACAGGGAATACAGTAACACAGCTTATTCCGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128010 GCCAAATGGAATTGTATCAACAGGGAATACAGTAACACAGCTTATTCCGC 1600 . : . : . : . : . : 1529 GAGGGACAGACCCCAGCTATGATTCTAGTCTGAAACCAGGAAAAATAGAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128060 GAGGGACAGACCCCAGCTATGATTCTAGTCTGAAACCAGGAAAAATAGAT 1650 . : . : . : . : . : 1579 CATCTGAGCAGTAGTGCTCCTGGATCCCCTCCTGACCT GCT ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||| 128110 CATCTGAGCAGTAGTGCTCCTGGATCCCCTCCTGACCTGTA...TAGGCT 1700 . : . : . : . : . : 1620 AGAATCTGTTCCTAAGAGTATTTCTGCCTTACCTGTGAATCCACATTCTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128802 AGAATCTGTTCCTAAGAGTATTTCTGCCTTACCTGTGAATCCACATTCTA 1750 . : . : . : . : . : 1670 TACCTCCAAGGGGGCCAGCAGATCTGCCTCCAATGCCTGTTACCAAACCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128852 TACCTCCAAGGGGGCCAGCAGATCTGCCTCCAATGCCTGTTACCAAACCA 1800 . : . : . : . : . : 1720 CTTCAGATGGTACCTCGAGGTTCTCAGTTATATCCAGCACAACAGACGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128902 CTTCAGATGGTACCTCGAGGTTCTCAGTTATATCCAGCACAACAGACGGA 1850 . : . : . : . : . : 1770 TGTTTATTATCAGGATCCTCGAGGAGCAGCTCCGCCATTTGAACCAGCAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128952 TGTTTATTATCAGGATCCTCGAGGAGCAGCTCCGCCATTTGAACCAGCAC 1900 . : . : . : . : . : 1820 CTTATCAGCAGG GTATGTATTATACTCCACCACCACAATGT ||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||| 129002 CTTATCAGCAGGGTA...CAGGTATGTATTATACTCCACCACCACAATGT 1950 . : . : . : . : . : 1861 GTGTCCCGCTTTGTCCGACCTCCACCATCTGCTCCTGAACCTGCTCCTCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 130920 GTGTCCCGCTTTGTCCGACCTCCACCATCTGCTCCTGAACCTGCTCCTCC 2000 . : . : . : . : . : 1911 CTACTTGGATCATTATCCACCCTACCTCCAAGAACGTGTTGTAAACTCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 130970 CTACTTGGATCATTATCCACCCTACCTCCAAGAACGTGTTGTAAACTCTC 2050 . : . : . : . : . : 1961 AGTATGGCACACAGCCACAGCAGTACCCACCTATATACCCATCTCACTAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 131020 AGTATGGCACACAGCCACAGCAGTACCCACCTATATACCCATCTCACTAT 2100 . : . : . : . : . : 2011 GATGGCCGTCGAGTGTACCCTGCTCCATCTTACACAAGAGAAGAGATATT |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| 131070 GATGGCCGTCGAGTGTACCCTGCTCCGTCTTACACAAGAGAAGAGATATT 2150 . : . : . : . : . : 2061 CCGAGAAAGCCCTATACCCATTGAGATTCCACCTGCAGCAGTACCATCGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 131120 CCGAGAAAGCCCTATACCCATTGAGATTCCACCTGCAGCAGTACCATCGT 2200 . : . : . : . : . : 2111 ATGTACCAGAATCCAGAGAAAGATACCAACAGATCGAGAGTTACTATCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 131170 ATGTACCAGAATCCAGAGAAAGATACCAACAGATCGAGAGTTACTATCCA 2250 . : . : . : . : . : 2161 GTGGCTCCTCATCCAACTCAGATCAGACCTTCGTACCTCAGA ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>> 131220 GTGGCTCCTCATCCAACTCAGATCAGACCTTCGTACCTCAGAGTA...TA 2300 . : . : . : . : . : 2203 GAACCTCCTTATAGCCGGCTTCCTCCTCCTCCCCAGCCTCATCCTAGTC >||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 131741 GGAACCTCCTTATAGCCGGCTTCCTCCTCCTCCCCAGCCTCATCCTAGTC 2350 . : . : . : . : . : 2252 TAGATGAACTACATCGCCGACGAAAGGAAATAATGGCCCAGCTAGAGGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 131791 TAGATGAACTACATCGCCGACGAAAGGAAATAATGGCCCAGCTAGAGGAA 2400 . : . : . : . : . : 2302 AGAAAGGTTATCTCTCCACCTCCTTTTGCACCTTCACCAACCTTGCCTCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 131841 AGAAAGGTTATCTCTCCACCTCCTTTTGCACCTTCACCAACCTTGCCTCC 2450 . : . : . : . : . : 2352 TACCTTTCATCCGGAAGAA TTTTTGGATGAAGACTTGAAGG |||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||| 131891 TACCTTTCATCCGGAAGAAGTA...TAGTTTTTGGATGAAGACTTGAAGG 2500 . : . : . : . : . : 2393 TAGCTGGGAAATACAAAGGAAATGATTATAGCCAATACTCTCCCTGGTCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 140870 TAGCTGGGAAATACAAAGGAAATGATTATAGCCAATACTCTCCCTGGTCA 2550 . : . : . : . : . : 2443 TGTGACACCATCGGCTCCTACATTGGAACCAAAGATGCAAAACCCAAAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 140920 TGTGACACCATCGGCTCCTACATTGGAACCAAAGATGCAAAACCCAAAGA 2600 . : . : . : . : . : 2493 TGTTGTGGCAGCAGGGAGTGTGGAAATGATG AATGTGGAGA |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||| 140970 TGTTGTGGCAGCAGGGAGTGTGGAAATGATGGTA...CAGAATGTGGAGA 2650 . : . : . : . : . : 2534 GTAAAGGAATGAGGGACCAGCGATTAGATCTTCAGAGAAGAGCAGCAGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 145414 GTAAAGGAATGAGGGACCAGCGATTAGATCTTCAGAGAAGAGCAGCAGAA 2700 . : . : . : . : . : 2584 ACCAGTGATGATGACCTCATCCCATTTGGAGACCGACCAACAGTGTCTCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 145464 ACCAGTGATGATGACCTCATCCCATTTGGAGACCGACCAACAGTGTCTCG 2750 . : . : . : . : . : 2634 GTTTGGTGCCATCTCACGAACTTCCAAAACTATATATCAGGGTGCTGGTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 145514 GTTTGGTGCCATCTCACGAACTTCCAAAACTATATATCAGGGTGCTGGTC 2800 . : . : . : . : . : 2684 CAATGCAGGCTATGGCACCTCAGGGAGCTCCTACAAAATCTATTAACATT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 145564 CAATGCAGGCTATGGCACCTCAGGGAGCTCCTACAAAATCTATTAACATT 2850 . : . : . : . : . : 2734 TCAG ATTATAGTCCATATGGAACCCACGGTGGCTGGGGAGC ||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 145614 TCAGGTA...CAGATTATAGTCCATATGGAACCCACGGTGGCTGGGGAGC 2900 . : . : . : . : . : 2775 TTCTCCATATTCACCTCATCAAAACATACCTTCTCAGGGACACTTCAGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 146187 TTCTCCATATTCACCTCATCAAAACATACCTTCTCAGGGACACTTCAGTG 2950 . : . : . : . : . : 2825 AGAG GGAGAGAATATCTATGTCAGAAGTGGCCAGTCATGGA ||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 146237 AGAGGTA...AAGGGAGAGAATATCTATGTCAGAAGTGGCCAGTCATGGA 3000 . : . : . : . : . : 2866 AAACCCCTTCCATCTGCTGAGAGAGAACAGCTACGACTAGAATTGCAGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 146415 AAACCCCTTCCATCTGCTGAGAGAGAACAGCTACGACTAGAATTGCAGCA 3050 . : . : . : . : . : 2916 ATTGAACCATCAGATTAGCCAGCAGACCCAGCTACGTGGACTAGAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>. 146465 ATTGAACCATCAGATTAGCCAGCAGACCCAGCTACGTGGACTAGAGGTA. 3100 . : . : . : . : . : 2962 AGGGAGGCAAACACCCTGGCAGGCCAGTCACAGCCCCCACCACCG ..>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 146515 ..CAGAGGGAGGCAAACACCCTGGCAGGCCAGTCACAGCCCCCACCACCG 3150 . : . : . : . : . : 3007 CCACCTCCAAAATGGCCTGGGATGATCTCAAGTGAGCAGTTGAGCTTGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 149443 CCACCTCCAAAATGGCCTGGGATGATCTCAAGTGAGCAGTTGAGCTTGGA 3200 . : . : . : . : . : 3057 ACTGCACCAGGTGGAAAGGGAAATCGGGAAGAGAACACGGGAACTGAGTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 149493 ACTGCACCAGGTGGAAAGGGAAATCGGGAAGAGAACACGGGAACTGAGTA 3250 . : . : . : . : . : 3107 TG GAAAACCAGTGTTCTCTGGACATGAAAAGCAAACTGAAT ||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 149543 TGGTG...AAGGAAAACCAGTGTTCTCTGGACATGAAAAGCAAACTGAAT 3300 . : . : . : . : . : 3148 ACAAGTAAACAAGCAGAAAATGGACAACCAGAACCACAAAACAAGGTTCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 151645 ACAAGTAAACAAGCAGAAAATGGACAACCAGAACCACAAAACAAGGTTCC 3350 . : . : . : . : . : 3198 GGCTGAGGACCTTACATTGACATTCAG CAGTGATGTACCAA |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||| 151695 GGCTGAGGACCTTACATTGACATTCAGGTA...CAGCAGTGATGTACCAA 3400 . : . : . : . : . : 3239 ATGGATCAGCCTTGACACAAGAGAATATCAGCCTCCTATCAAACAAGACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 154126 ATGGATCAGCCTTGACACAAGAGAATATCAGCCTCCTATCAAACAAGACC 3450 . : . : . : . : . : 3289 AGCTCTCTGAACCTGTCAGAGGACCCTGAGGGAGGAGGGGATAATAATGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 154176 AGCTCTCTGAACCTGTCAGAGGACCCTGAGGGAGGAGGGGATAATAATGA 3500 . : . : . : . 3339 CTCCCAGAGATCAGGAGTTACTCCCAGTTCTGCTCCT ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 154226 CTCCCAGAGATCAGGAGTTACTCCCAGTTCTGCTCCT