Result of SIM4 for pF1KB7681

seq1 = pF1KB7681.tfa, 1029 bp
seq2 = pF1KB7681/gi568815597r_109960736.tfa (gi568815597r:109960736_110170612), 209877 bp

>pF1KB7681 1029
>gi568815597r:109960736_110170612 (Chr1)

(complement)

1-277  (100001-100277)   100% ->
278-594  (105710-106026)   100% ->
595-723  (109050-109178)   100% ->
724-1029  (109572-109877)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACCCCGAGCACTGCGCGCCTTTCCGCGTGGGGCCTGCACCCGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACCCCGAGCACTGCGCGCCTTTCCGCGTGGGGCCTGCACCCGGCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTATGTGGCCTCGGGGGACGAGCCTCCGGGCCCGCAGGGAACCCCCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTATGTGGCCTCGGGGGACGAGCCTCCGGGCCCGCAGGGAACCCCCGCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGCGCCTCACCTGCACCCCGCGCCGCCCCGCGGCCCGCGGCTGACCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTGCGCCTCACCTGCACCCCGCGCCGCCCCGCGGCCCGCGGCTGACCCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTTCCGGCCTGCGGGCCCCTGGAGCCCTACCTCCCAGAGCCGGCCAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTTCCGGCCTGCGGGCCCCTGGAGCCCTACCTCCCAGAGCCGGCCAAGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCCCGCCAAGTACCTGCAGGACCTCGGGCCCGGCCCGGCCCTCAACGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCCCGCCAAGTACCTGCAGGACCTCGGGCCCGGCCCGGCCCTCAACGGCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCCACTTCTACGAGGGCCCCGCGGAAG         CTGAGGAGAAGACC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100251 GCCACTTCTACGAGGGCCCCGCGGAAGGTA...CAGCTGAGGAGAAGACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TCCAAAGCTGCCAGCTTCCCCCAGCTGCCCTTGGACTGCCGAGGGGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105724 TCCAAAGCTGCCAGCTTCCCCCAGCTGCCCTTGGACTGCCGAGGGGGCCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CAGAGACGGGCCCTCTAACTTGCAAGGCTCCCCAGGCCCCTGCCTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105774 CAGAGACGGGCCCTCTAACTTGCAAGGCTCCCCAGGCCCCTGCCTGGCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GCCTGCATCTTCCTCTTTCCCCGGGACTCCCTGACTCCATGGAGTTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105824 GCCTGCATCTTCCTCTTTCCCCGGGACTCCCTGACTCCATGGAGTTGGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AAGAACAAGAGCAAGAAGCGTCGTAACCGCACGACCTTCAGCACATTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105874 AAGAACAAGAGCAAGAAGCGTCGTAACCGCACGACCTTCAGCACATTCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GCTGGAGGAGCTGGAGAAGGTCTTCCAGAAAACCCACTATCCTGATGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105924 GCTGGAGGAGCTGGAGAAGGTCTTCCAGAAAACCCACTATCCTGATGTGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 ATGCCCGGGAGCAGCTGGCCCTGCGCACAGACCTGACTGAGGCCCGGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105974 ATGCCCGGGAGCAGCTGGCCCTGCGCACAGACCTGACTGAGGCCCGGGTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CAG         GTCTGGTTCCAGAACCGCAGAGCCAAGTGGCGGAAGCG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106024 CAGGTG...CAGGTCTGGTTCCAGAACCGCAGAGCCAAGTGGCGGAAGCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CGAGCGTTATGGGAAGATCCAGGAGGGGCGGAACCCCTTCACGGCTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109088 CGAGCGTTATGGGAAGATCCAGGAGGGGCGGAACCCCTTCACGGCTGCCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 ATGACATCTCTGTGCTGCCCCGTACTGACAGCCACCCTCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 109138 ATGACATCTCTGTGCTGCCCCGTACTGACAGCCACCCTCAGGTA...CAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CTGCAGAACTCCCTGTGGGCCAGTCCAGGATCTGGGAGCCCTGGAGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109572 CTGCAGAACTCCCTGTGGGCCAGTCCAGGATCTGGGAGCCCTGGAGGCCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CTGCCTTGTGTCTCCAGAGGGCATCCCCTCCCCATGCATGTCTCCATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109622 CTGCCTTGTGTCTCCAGAGGGCATCCCCTCCCCATGCATGTCTCCATATT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 CCCACCCCCATGGGAGTGTGGCTGGCTTCATGGGGGTGCCAGCCCCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109672 CCCACCCCCATGGGAGTGTGGCTGGCTTCATGGGGGTGCCAGCCCCTTCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 GCGGCTCACCCTGGCATCTACTCCATCCATGGCTTTCCCCCCACCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109722 GCGGCTCACCCTGGCATCTACTCCATCCATGGCTTTCCCCCCACCCTGGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 GGGCCACAGCTTTGAGCCTTCCTCAGATGGTGACTATAAGTCTCCAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109772 GGGCCACAGCTTTGAGCCTTCCTCAGATGGTGACTATAAGTCTCCAAGCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 TCGTCTCGCTCAGGGTAAAGCCCAAGGAGCCACCCGGCCTTCTGAACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109822 TCGTCTCGCTCAGGGTAAAGCCCAAGGAGCCACCCGGCCTTCTGAACTGG

   1050     .
   1024 ACCACG
        ||||||
 109872 ACCACG

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