Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2432
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2432, 309 aa
1>>>pF1KE2432 309 - 309 aa - 309 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6503+/-0.00113; mu= 13.6280+/- 0.067
mean_var=75.0443+/-17.183, 0's: 0 Z-trim(102.3): 60 B-trim: 528 in 2/45
Lambda= 0.148052
statistics sampled from 6936 (6984) to 6936 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.551), E-opt: 0.2 (0.209), width: 16
Scan time: 1.040
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs109|chr12 ( 309) 2007 438.5 3.2e-123
CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs109|chr12 ( 309) 1816 397.7 6.1e-111
CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs109|chr12 ( 309) 1734 380.2 1.1e-105
CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs109|chr12 ( 319) 1622 356.3 1.9e-98
CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs109|chr12 ( 299) 1328 293.4 1.4e-79
CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs109|chr12 ( 309) 1311 289.8 1.8e-78
CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs109|chr12 ( 299) 1306 288.8 3.7e-78
CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs109|chr12 ( 303) 808 182.4 3.9e-46
CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs109|chr12 ( 317) 785 177.5 1.2e-44
CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs109|chr12 ( 318) 655 149.7 2.8e-36
CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs109|chr12 ( 312) 654 149.5 3.2e-36
CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs109|chr12 ( 307) 616 141.4 8.8e-34
CCDS31747.1 TAS2R42 gene_id:353164|Hs109|chr12 ( 314) 589 135.6 4.9e-32
CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs109|chr12 ( 309) 556 128.6 6.3e-30
CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs109|chr7 ( 316) 550 127.3 1.6e-29
CCDS43663.1 TAS2R41 gene_id:259287|Hs109|chr7 ( 307) 473 110.8 1.4e-24
CCDS47729.1 TAS2R39 gene_id:259285|Hs109|chr7 ( 338) 427 101.0 1.3e-21
CCDS5869.1 TAS2R5 gene_id:54429|Hs109|chr7 ( 299) 395 94.2 1.4e-19
CCDS3876.1 TAS2R1 gene_id:50834|Hs109|chr5 ( 299) 393 93.7 1.9e-19
CCDS43662.1 TAS2R40 gene_id:259286|Hs109|chr7 ( 323) 375 89.9 2.9e-18
CCDS5885.1 TAS2R60 gene_id:338398|Hs109|chr7 ( 318) 358 86.3 3.5e-17
CCDS5868.1 TAS2R4 gene_id:50832|Hs109|chr7 ( 299) 357 86.0 3.9e-17
CCDS5785.1 TAS2R16 gene_id:50833|Hs109|chr7 ( 291) 320 78.1 9e-15
CCDS34765.1 TAS2R38 gene_id:5726|Hs109|chr7 ( 333) 298 73.5 2.6e-13
>>CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs109|chr12 (309 aa)
initn: 2007 init1: 2007 opt: 2007 Z-score: 2325.9 bits: 438.5 E(33420): 3.2e-123
Smith-Waterman score: 2007; 100.0% identity (100.0% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VLLLNWYSTVFNPAFYSVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VLLLNWYSTVFNPAFYSVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 VKGEKPSSP
:::::::::
CCDS53 VKGEKPSSP
>>CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs109|chr12 (309 aa)
initn: 1816 init1: 1816 opt: 1816 Z-score: 2105.4 bits: 397.7 E(33420): 6.1e-111
Smith-Waterman score: 1816; 89.3% identity (96.1% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
: ::.::::::.::: :::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MITFLPIIFSSLVVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VLLLNWYSTVFNPAFYSVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
::::::::::.:::: ::::::::::.::: .::::::::.::::::::::::::.::::
CCDS53 VLLLNWYSTVLNPAFNSVEVRTTAYNIWAVINHFSNWLATTLSIFYLLKIANFSNFIFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATVT
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CCDS53 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACHLFVINMNEIVRTKEFEGNMTWKIKLKSAMYFSNMTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV
..:::::::::: :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.
CCDS53 MVANLVPFTLTLLSFMLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVISFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :.:::
CCDS53 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVFWQMRYW
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 VKGEKPSSP
::::: :::
CCDS53 VKGEKTSSP
>>CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs109|chr12 (309 aa)
initn: 1734 init1: 1734 opt: 1734 Z-score: 2010.7 bits: 380.2 E(33420): 1.1e-105
Smith-Waterman score: 1734; 85.4% identity (93.8% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
: ::.::::: ..:: :::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VLLLNWYSTVFNPAFYSVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
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CCDS53 VLVLNWYATELNPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATVT
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CCDS53 LKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNTTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV
:.:::::::::. :::::::::::::::::::::::::: :::::::::: ::::::.
CCDS53 ILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW
:::::..::::: :::::::::::.:: ::::: :::::::::::::::::::: .::::
CCDS53 YFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLWHVRYW
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 VKGEKPSSP
::::::::
CCDS53 VKGEKPSSS
>>CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs109|chr12 (319 aa)
initn: 1622 init1: 1622 opt: 1622 Z-score: 1881.2 bits: 356.3 E(33420): 1.9e-98
Smith-Waterman score: 1622; 82.1% identity (93.4% similar) in 302 aa overlap (1-302:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
: ::.::::: ..::.:::::::::::::::::: ::::::::.::::::::::::::::
CCDS53 MITFLPIIFSILIVVIFVIGNFANGFIALVNSIEWVKRQKISFVDQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VLLLNWYSTVFNPAFYSVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
::::.::.: .:::::::::: :::::::::.:::.:::::::.::::.::::::::::.
CCDS53 VLLLHWYATQLNPAFYSVEVRITAYNVWAVTNHFSSWLATSLSMFYLLRIANFSNLIFLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATVT
.:::::::.::.::::::::.:.:::::: : : :::::::.:::::::::.: :. :.:
CCDS53 IKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMDETVWTKEYEGNVTWKIKLRSAMYHSNMTLT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV
:.:.::.::::. ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.
CCDS53 MLANFVPLTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW
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CCDS53 YFLSMIISVCNFGRLEKQPVFMFCQAIIFSYPSTHPFILILGNKKLKQIFLSVLRHVRYW
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 VKGEKPSSP
::
CCDS53 VKDRSLRLHRFTRGALCVF
310
>>CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs109|chr12 (299 aa)
initn: 1322 init1: 1322 opt: 1328 Z-score: 1542.3 bits: 293.4 E(33420): 1.4e-79
Smith-Waterman score: 1328; 69.1% identity (87.2% similar) in 298 aa overlap (1-298:1-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
: ::. :.:: ...::::.:::::::::::: :. :::.::: ::::::::::::.::::
CCDS86 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VLLLNWYSTVFNPAFYSVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
.:::::: ::.::::::::.: :.::.:.::.::: :::..:::::::::::::::.:::
CCDS86 ALLLNWYLTVLNPAFYSVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATVT
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CCDS86 LKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV
:: ...::::.:. ::.::::::::::::::::.:::: :::::::::::.: ::::::.
CCDS86 TLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW
.:: ...:::: :.: :: : ::. : .. ::::: .::::.::: .: :.:
CCDS86 FFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQIRC
250 260 270 280 290
pF1KE2 VKGEKPSSP
>>CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs109|chr12 (309 aa)
initn: 1310 init1: 1286 opt: 1311 Z-score: 1522.4 bits: 289.8 E(33420): 1.8e-78
Smith-Waterman score: 1311; 65.7% identity (84.1% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
: .:. :.:: .::: :..::::::::::.: : ::::::: ::::..:::::::::::
CCDS86 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VLLLNWYSTVFNPAFYSVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
:.::.:::::.::. ...: :.::::.::: ::::::::::::::.::: ::: :
CCDS86 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATVT
:::..:::.::..:: :.::.:.: . . : :.: :::.:::::::.:..::. ::.
CCDS86 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV
:.::.::::::. ::::: ::::::::::::::::::::::.:::::::: ::.: :.
CCDS86 MLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLILLAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW
::: ..:: :.: .. :.:.:.:. . :::.: :::::::: ::::::::: :: :
CCDS86 YFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVLWQVTCW
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 VKGEKPSSP
.::.. :.:
CCDS86 AKGQNQSTP
>>CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs109|chr12 (299 aa)
initn: 1325 init1: 1295 opt: 1306 Z-score: 1516.9 bits: 288.8 E(33420): 3.7e-78
Smith-Waterman score: 1306; 68.0% identity (87.2% similar) in 297 aa overlap (1-297:1-297)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
: :. :: : .:: ::.:: ::::::::: :. :. .::: :.::::::.:::.::::
CCDS86 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VLLLNWYSTVFNPAFYSVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
:.:. ::.:::: :.:..::: .: :.::::.::: :::.::::: ::::::::::: ::
CCDS86 VMLFLWYATVFNSALYGLEVRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLISLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATVT
::.:.:::.::.:::::.:: :.: ::.: : : :::::::.:::::::.:..::. :::
CCDS86 LKKRIKSVVLVILLGPLVFLICNLAVITMDERVWTKEYEGNVTWKIKLRNAIHLSSLTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV
::.::.::::.:.::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::: ::.: :.
CCDS86 TLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLMLFAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW
::: :. :.:.. . ..: :...:... . :::.: :::: :..:::::::::: :.
CCDS86 YFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQMTR
250 260 270 280 290
pF1KE2 VKGEKPSSP
>>CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs109|chr12 (303 aa)
initn: 742 init1: 241 opt: 808 Z-score: 941.9 bits: 182.4 E(33420): 3.9e-46
Smith-Waterman score: 808; 44.4% identity (72.9% similar) in 306 aa overlap (1-302:1-302)
10 20 30 40 50 60
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]