seq1 = pF1KE5142.tfa, 312 bp
seq2 = pF1KE5142/gi568815592r_41644440.tfa (gi568815592r:41644440_41847334), 202895 bp

>pF1KE5142 312
>gi568815592r:41644440_41847334 (Chr6)

(complement)

1-59  (100001-100059)   100% ->
60-210  (102527-102677)   100% ->
211-281  (102821-102891)   100% ->
282-312  (110506-110536)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGTGGATGGTGGTGGTCTTGGTCTGCCTCCAGCTCTTGGAGGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGTGGATGGTGGTGGTCTTGGTCTGCCTCCAGCTCTTGGAGGCAGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGTGGTCAA         AGTGCCCCTGAAGAAATTTAAGTCTATCCGTG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGTGGTCAAGTG...TAGAGTGCCCCTGAAGAAATTTAAGTCTATCCGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGACCATGAAGGAGAAGGGCTTGCTGGGGGAGTTCCTGAGGACCCACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102559 AGACCATGAAGGAGAAGGGCTTGCTGGGGGAGTTCCTGAGGACCCACAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TATGATCCTGCTTGGAAGTACCGCTTTGGTGACCTCAGCGTGACCTACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102609 TATGATCCTGCTTGGAAGTACCGCTTTGGTGACCTCAGCGTGACCTACGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCCCATGGCCTACATGGAT         GCTGCCTACTTTGGTGAGATCA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 102659 GCCCATGGCCTACATGGATGTG...CAGGCTGCCTACTTTGGTGAGATCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GCATCGGGACTCCACCCCAGAACTTCCTGGTCCTTTTTGACACCGGCTC 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 102843 GCATCGGGACTCCACCCCAGAACTTCCTGGTCCTTTTTGACACCGGCTCC

    300     .    :    .    :    .    :    .
    282         CTCCCCTCTTCCTCTTGACCCTGCACCCTCC
        >>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 102893 TC...GGGCTCCCCTCTTCCTCTTGACCCTGCACCCTCC