seq1 = pF1KE3968.tfa, 1215 bp seq2 = pF1KE3968/gi568815581f_44208833.tfa (gi568815581f:44208833_44416726), 207894 bp >pF1KE3968 1215 >gi568815581f:44208833_44416726 (Chr17) 1-107 (100001-100107) 100% -> 108-223 (103748-103863) 100% -> 224-372 (104272-104420) 100% -> 373-458 (104586-104671) 100% -> 459-548 (105903-105992) 100% -> 549-629 (106097-106177) 100% -> 630-795 (106323-106488) 99% -> 796-953 (106620-106777) 100% -> 954-1091 (107553-107690) 100% -> 1092-1198 (107787-107893) 100% -> 1199-1215 (108653-108669) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGAAGCGAGCTTTGTCCAGACCACCATGGCTCTGGGGCTGTCCTCCAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGGAAGCGAGCTTTGTCCAGACCACCATGGCTCTGGGGCTGTCCTCCAA 50 . : . : . : . : . : 51 GAAAGCGTCCTCTCGCAACGTGGCTGTGGAGCGTAAGAACCTGATCACCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 GAAAGCGTCCTCTCGCAACGTGGCTGTGGAGCGTAAGAACCTGATCACCG 100 . : . : . : . : . : 101 TGTGCAG GTTCTCTGTGAAAACGCTGCTGGAGAAGTACACA |||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||| 100101 TGTGCAGGTG...CAGGTTCTCTGTGAAAACGCTGCTGGAGAAGTACACA 150 . : . : . : . : . : 142 GCGGAGCCCATCGATGACTCATCGGAGGAGTTTGTCAATTTTGCAGCCAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103782 GCGGAGCCCATCGATGACTCATCGGAGGAGTTTGTCAATTTTGCAGCCAT 200 . : . : . : . : . : 192 TTTAGAGCAGATCCTCAGCCACCGCTTCAAAG CCTGTGCCC ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||| 103832 TTTAGAGCAGATCCTCAGCCACCGCTTCAAAGGTG...CAGCCTGTGCCC 250 . : . : . : . : . : 233 CAGCAGGTCCAGTGAGCTGGTTCAGCTCAGACGGGCAGCGGGGCTTTTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104281 CAGCAGGTCCAGTGAGCTGGTTCAGCTCAGACGGGCAGCGGGGCTTTTGG 300 . : . : . : . : . : 283 GACTATATCCGGCTGGCCTGCAGCAAAGTGCCCAACAACTGTGTGAGCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104331 GACTATATCCGGCTGGCCTGCAGCAAAGTGCCCAACAACTGTGTGAGCAG 350 . : . : . : . : . : 333 CATCGAGAACATGGAGAACATCAGCACAGCCCGGGCCAAG G ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>| 104381 CATCGAGAACATGGAGAACATCAGCACAGCCCGGGCCAAGGTG...CAGG 400 . : . : . : . : . : 374 GCCGGGCATGGATCCGGGTGGCACTGATGGAGAAGCGCATGTCAGAATAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104587 GCCGGGCATGGATCCGGGTGGCACTGATGGAGAAGCGCATGTCAGAATAC 450 . : . : . : . : . : 424 ATCACCACGGCTCTGCGTGACACCCGGACCACCAG ACGGTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||| 104637 ATCACCACGGCTCTGCGTGACACCCGGACCACCAGGTC...CAGACGGTT 500 . : . : . : . : . : 465 CTATGACTCTGGAGCCATCATGCTGCGGGATGAAGCCACCATCCTCACCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105909 CTATGACTCTGGAGCCATCATGCTGCGGGATGAAGCCACCATCCTCACCG 550 . : . : . : . : . : 515 GAATGCTGATCGGACTGAGCGCCATCGACTTCAG CTTCTGT ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||| 105959 GAATGCTGATCGGACTGAGCGCCATCGACTTCAGGTG...CAGCTTCTGT 600 . : . : . : . : . : 556 CTAAAGGGGGAAGTCCTGGACGGGAAGACCCCCGTGGTCATCGATTACAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 106104 CTAAAGGGGGAAGTCCTGGACGGGAAGACCCCCGTGGTCATCGATTACAC 650 . : . : . : . : . : 606 GCCCTACCTAAAGTTCACGCAGAG CTACGACTACCTGACGG ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||| 106154 GCCCTACCTAAAGTTCACGCAGAGGTG...AAGCTACGACTACCTGACGG 700 . : . : . : . : . : 647 ACGAGGAGGAGCGGCACAGCGCCGAGAGCAGCACGAGCGAGGACAACTCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 106340 ACGAGGAGGAGCGGCACAGCGCCGAGAGCAGCACGAGCGAGGACAACTCG 750 . : . : . : . : . : 697 CCCGAGCACCCGTACCTCCCGCTCGTCACCGACGAGGACAGCTGGTACAG |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| 106390 CCCGAGCACCCGTACCTCCCGCTCGTCACCGATGAGGACAGCTGGTACAG 800 . : . : . : . : . : 747 CAAGTGGCACAAGATGGAGCAGAAGTTCCGCATCGTCTACGCGCAGAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||> 106440 CAAGTGGCACAAGATGGAGCAGAAGTTCCGCATCGTCTACGCGCAGAAGG 850 . : . : . : . : . : 796 GGCTACCTGGAGGAGCTGGTGCGTCTGCGCGAGTCGCAGCTG >>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 106490 TG...CAGGGCTACCTGGAGGAGCTGGTGCGTCTGCGCGAGTCGCAGCTG 900 . : . : . : . : . : 838 AAGGACCTGGAGGCGGAGAACCGGCGGCTTCAGCTGCAGCTGGAGGAGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 106662 AAGGACCTGGAGGCGGAGAACCGGCGGCTTCAGCTGCAGCTGGAGGAGGC 950 . : . : . : . : . : 888 GGCGGCGCAGAACCAGCGCGAGAAACGGGAGCTGGAAGGCGTGATCCTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 106712 GGCGGCGCAGAACCAGCGCGAGAAACGGGAGCTGGAAGGCGTGATCCTGG 1000 . : . : . : . : . : 938 AGCTGCAGGAGCAGCT GACAGGTCTGATCCCCAGTGACCAC ||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||| 106762 AGCTGCAGGAGCAGCTGTG...CAGGACAGGTCTGATCCCCAGTGACCAC 1050 . : . : . : . : . : 979 GCCCCTCTGGCCCAGGGTTCCAAGGAGCTCACTACACCCCTGGTCAATCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107578 GCCCCTCTGGCCCAGGGTTCCAAGGAGCTCACTACACCCCTGGTCAATCA 1100 . : . : . : . : . : 1029 ATGGCCCTCACTGGGAACGCTTAATGGGGCCGAGGGCGCCAGCAACTCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107628 ATGGCCCTCACTGGGAACGCTTAATGGGGCCGAGGGCGCCAGCAACTCCA 1150 . : . : . : . : . : 1079 AGCTCTACCGGAG ACACAGCTTCATGAGCACGGAGCCGCTG |||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||| 107678 AGCTCTACCGGAGGTA...CAGACACAGCTTCATGAGCACGGAGCCGCTG 1200 . : . : . : . : . : 1120 TCAGCTGAAGCCAGTCTGAGCTCGGACTCCCAGCGCCTGGGAGAGGGCAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107815 TCAGCTGAAGCCAGTCTGAGCTCGGACTCCCAGCGCCTGGGAGAGGGCAC 1250 . : . : . : . : . : 1170 GCGGGACGAGGAGCCCTGGGGTCCCATCG GAAGCTCAGAGC |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||| 107865 GCGGGACGAGGAGCCCTGGGGTCCCATCGGTG...CAGGAAGCTCAGAGC 1300 . 1211 CAAAT ||||| 108665 CAAAT