Result of FASTA (ccds) for pF1KE2373
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2373, 1143 aa
  1>>>pF1KE2373 1143 - 1143 aa - 1143 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3545+/-0.000928; mu= 8.1300+/- 0.055
 mean_var=190.0702+/-48.106, 0's: 0 Z-trim(110.9): 22  B-trim: 639 in 1/50
 Lambda= 0.093029
 statistics sampled from 11921 (11943) to 11921 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.705), E-opt: 0.2 (0.367), width:  16
 Scan time:  4.930

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS12700.1 DHX34 gene_id:9704|Hs108|chr19         (1143) 7621 1036.4       0
CCDS77040.1 DHX8 gene_id:1659|Hs108|chr17          (1181) 1222 177.6 1.5e-43
CCDS11464.1 DHX8 gene_id:1659|Hs108|chr17          (1220) 1222 177.6 1.5e-43
CCDS11072.1 DHX33 gene_id:56919|Hs108|chr17        ( 707) 1169 170.3 1.4e-41
CCDS10907.1 DHX38 gene_id:9785|Hs108|chr16         (1227) 1155 168.6 7.8e-41
CCDS4685.1 DHX16 gene_id:8449|Hs108|chr6           (1041) 1131 165.4 6.4e-40
CCDS33966.1 DHX15 gene_id:1665|Hs108|chr4          ( 795) 1127 164.8 7.5e-40
CCDS54463.1 DHX35 gene_id:60625|Hs108|chr20        ( 672)  982 145.2 4.8e-34
CCDS13310.1 DHX35 gene_id:60625|Hs108|chr20        ( 703)  982 145.3 4.9e-34
CCDS3171.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3         (1008)  766 116.4 3.5e-25
CCDS34158.1 DHX29 gene_id:54505|Hs108|chr5         (1369)  748 114.1 2.4e-24
CCDS1949.2 DQX1 gene_id:165545|Hs108|chr2          ( 717)  735 112.1 4.8e-24
CCDS7652.1 DHX32 gene_id:55760|Hs108|chr10         ( 743)  720 110.1   2e-23
CCDS54657.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3        ( 994)  685 105.5 6.4e-22
CCDS4113.1 YTHDC2 gene_id:64848|Hs108|chr5         (1430)  684 105.5 9.4e-22
CCDS54150.1 DHX40 gene_id:79665|Hs108|chr17        ( 702)  643 99.8 2.4e-20
CCDS11617.1 DHX40 gene_id:79665|Hs108|chr17        ( 779)  643 99.8 2.7e-20
CCDS41444.1 DHX9 gene_id:1660|Hs108|chr1           (1270)  629 98.1 1.4e-19
CCDS1800.1 DHX57 gene_id:90957|Hs108|chr2          (1386)  625 97.6 2.2e-19
CCDS2759.1 DHX30 gene_id:22907|Hs108|chr3          (1194)  612 95.8 6.6e-19
CCDS9261.1 DHX37 gene_id:57647|Hs108|chr12         (1157)  472 77.0 2.9e-13
CCDS9987.2 TDRD9 gene_id:122402|Hs108|chr14        (1382)  449 73.9 2.9e-12


>>CCDS12700.1 DHX34 gene_id:9704|Hs108|chr19              (1143 aa)
 initn: 7621 init1: 7621 opt: 7621  Z-score: 5537.1  bits: 1036.4 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 7621; 100.0% identity (100.0% similar) in 1143 aa overlap (1-1143:1-1143)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MPPPRTREGRDRRDHHRAPSEEEALEKWDWNCPETRRLLEDAFFREEDYIRQGSEECQKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MPPPRTREGRDRRDHHRAPSEEEALEKWDWNCPETRRLLEDAFFREEDYIRQGSEECQKF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 WTFFERLQRFQNLKTSRKEEKDPGQPKHSIPALADLPRTYDPRYRINLSVLGPATRGSQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 WTFFERLQRFQNLKTSRKEEKDPGQPKHSIPALADLPRTYDPRYRINLSVLGPATRGSQG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 LGRHLPAERVAEFRRALLHYLDFGQKQAFGRLAKLQRERAALPIAQYGNRILQTLKEHQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LGRHLPAERVAEFRRALLHYLDFGQKQAFGRLAKLQRERAALPIAQYGNRILQTLKEHQV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 VVVAGDTGCGKSTQVPQYLLAAGFSHVACTQPRRIACISLAKRVGFESLSQYGSQVGYQI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VVVAGDTGCGKSTQVPQYLLAAGFSHVACTQPRRIACISLAKRVGFESLSQYGSQVGYQI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 RFESTRSAATKIVFLTVGLLLRQIQREPSLPQYEVLIVDEVHERHLHNDFLLGVLQRLLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RFESTRSAATKIVFLTVGLLLRQIQREPSLPQYEVLIVDEVHERHLHNDFLLGVLQRLLP
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 TRPDLKVILMSATINISLFSSYFSNAPVVQVPGRLFPITVVYQPQEAEPTTSKSEKLDPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TRPDLKVILMSATINISLFSSYFSNAPVVQVPGRLFPITVVYQPQEAEPTTSKSEKLDPR
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 PFLRVLESIDHKYPPEERGDLLVFLSGMAEISAVLEAAQTYASHTQRWVVLPLHSALSVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PFLRVLESIDHKYPPEERGDLLVFLSGMAEISAVLEAAQTYASHTQRWVVLPLHSALSVA
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 DQDKVFDVAPPGVRKCILSTNIAETSVTIDGIRFVVDSGKVKEMSYDPQAKLQRLQEFWI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DQDKVFDVAPPGVRKCILSTNIAETSVTIDGIRFVVDSGKVKEMSYDPQAKLQRLQEFWI
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 SQASAEQRKGRAGRTGPGVCFRLYAESDYDAFAPYPVPEIRRVALDSLVLQMKSMSVGDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SQASAEQRKGRAGRTGPGVCFRLYAESDYDAFAPYPVPEIRRVALDSLVLQMKSMSVGDP
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 RTFPFIEPPPPASLETAILYLRDQGALDSSEALTPIGSLLAQLPVDVVIGKMLILGSMFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RTFPFIEPPPPASLETAILYLRDQGALDSSEALTPIGSLLAQLPVDVVIGKMLILGSMFS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 LVEPVLTIAAALSVQSPFTRSAQSSPECAAARRPLESDQGDPFTLFNVFNAWVQVKSERS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LVEPVLTIAAALSVQSPFTRSAQSSPECAAARRPLESDQGDPFTLFNVFNAWVQVKSERS
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE2 RNSRKWCRRRGIEEHRLYEMANLRRQFKELLEDHGLLAGAQAAQVGDSYSRLQQRRERRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RNSRKWCRRRGIEEHRLYEMANLRRQFKELLEDHGLLAGAQAAQVGDSYSRLQQRRERRA
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE2 LHQLKRQHEEGAGRRRKVLRLQEEQDGGSSDEDRAGPAPPGASDGVDIQDVKFKLRHDLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LHQLKRQHEEGAGRRRKVLRLQEEQDGGSSDEDRAGPAPPGASDGVDIQDVKFKLRHDLA
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE2 QLQAAASSAQDLSREQLALLKLVLGRGLYPQLAVPDAFNSSRKDSDQIFHTQAKQGAVLH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QLQAAASSAQDLSREQLALLKLVLGRGLYPQLAVPDAFNSSRKDSDQIFHTQAKQGAVLH
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE2 PTCVFAGSPEVLHAQELEASNCDGSRDDKDKMSSKHQLLSFVSLLETNKPYLVNCVRIPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PTCVFAGSPEVLHAQELEASNCDGSRDDKDKMSSKHQLLSFVSLLETNKPYLVNCVRIPA
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE2 LQSLLLFSRSLDTNGDCSRLVADGWLELQLADSESAIRLLAASLRLRARWESALDRQLAH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LQSLLLFSRSLDTNGDCSRLVADGWLELQLADSESAIRLLAASLRLRARWESALDRQLAH
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE2 QAQQQLEEEEEDTPVSPKEVATLSKELLQFTASKIPYSLRRLTGLEVQNMYVGPQTIPAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QAQQQLEEEEEDTPVSPKEVATLSKELLQFTASKIPYSLRRLTGLEVQNMYVGPQTIPAT
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE2 PHLPGLFGSSTLSPHPTKGGYAVTDFLTYNCLTNDTDLYSDCLRTFWTCPHCGLHAPLTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PHLPGLFGSSTLSPHPTKGGYAVTDFLTYNCLTNDTDLYSDCLRTFWTCPHCGLHAPLTP
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE2 LERIAHENTCPQAPQDGPPGAEEAALETLQKTSVLQRPYHCEACGKDFLFTPTEVLRHRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LERIAHENTCPQAPQDGPPGAEEAALETLQKTSVLQRPYHCEACGKDFLFTPTEVLRHRK
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

          
pF1KE2 QHV
       :::
CCDS12 QHV
          

>>CCDS77040.1 DHX8 gene_id:1659|Hs108|chr17               (1181 aa)
 initn: 1249 init1: 434 opt: 1222  Z-score: 895.4  bits: 177.6 E(32554): 1.5e-43
Smith-Waterman score: 1324; 37.5% identity (67.2% similar) in 606 aa overlap (119-714:526-1105)

       90       100       110       120       130       140        
pF1KE2 SIPALADLPRTYDPRYRINLSVLGPATRGSQGLGRHLPAERVAEFRRALLHYLDFGQKQA
                                     .:.:  .: . . :...   : .  :.: .
CCDS77 AEMDSIPMGLNKHWVDPLPDAEGRQIAANMRGIG-MMPND-IPEWKK---HAFG-GNKAS
         500       510       520        530        540             

      150         160       170       180       190       200      
pF1KE2 FGRLAKLQ--RERAALPIAQYGNRILQTLKEHQVVVVAGDTGCGKSTQVPQYLLAAGFS-
       .:. ....  ..: .::: .  ....:.....:...: :.:: ::.::. :::  ::.. 
CCDS77 YGKKTQMSILEQRESLPIYKLKEQLVQAVHDNQILIVIGETGSGKTTQITQYLAEAGYTS
     550       560       570       580       590       600         

           210       220       230       240       250       260   
pF1KE2 --HVACTQPRRIACISLAKRVGFESLSQYGSQVGYQIRFESTRSAATKIVFLTVGLLLRQ
         ...::::::.: .:.::::. :     :..::: ::::.  :  : : ..: :.:::.
CCDS77 RGKIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEFGCCLGQEVGYTIRFEDCTSPETVIKYMTDGMLLRE
     610       620       630       640       650       660         

           270       280       290       300       310       320   
pF1KE2 IQREPSLPQYEVLIVDEVHERHLHNDFLLGVLQRLLPTRPDLKVILMSATINISLFSSYF
          .:.: :: ....::.::: .:.: :.:.:.. .  : :.:.:. :::..   ::.::
CCDS77 CLIDPDLTQYAIIMLDEAHERTIHTDVLFGLLKKTVQKRQDMKLIVTSATLDAVKFSQYF
     670       680       690       700       710       720         

           330       340       350       360       370       380   
pF1KE2 SNAPVVQVPGRLFPITVVYQPQEAEPTTSKSEKLDPRPFLRVLESIDHKYPPEERGDLLV
        .::.  .::: .:. ..:     :: :   . ::   .. :.. :    ::   ::.::
CCDS77 YEAPIFTIPGRTYPVEILY---TKEPET---DYLDAS-LITVMQ-IHLTEPP---GDILV
     730       740          750          760         770           

           390           400       410       420       430         
pF1KE2 FLSGMAEISA----VLEAAQTYASHTQRWVVLPLHSALSVADQDKVFDVAPPGVRKCILS
       ::.:. ::..    . :  .. .  . . ..::..:::    : ..:: :::: :: ...
CCDS77 FLTGQEEIDTACEILYERMKSLGPDVPELIILPVYSALPSEMQTRIFDPAPPGSRKVVIA
      780       790       800       810       820       830        

     440       450       460       470       480       490         
pF1KE2 TNIAETSVTIDGIRFVVDSGKVKEMSYDPQAKLQRLQEFWISQASAEQRKGRAGRTGPGV
       :::::::.::::: .::: : ::.  :. .. ...:    ::::.:.:: ::::::::: 
CCDS77 TNIAETSLTIDGIYYVVDPGFVKQKVYNSKTGIDQLVVTPISQAQAKQRAGRAGRTGPGK
      840       850       860       870       880       890        

     500        510       520       530       540       550        
pF1KE2 CFRLYAESDY-DAFAPYPVPEIRRVALDSLVLQMKSMSVGDPRTFPFIEPPPPASLETAI
       :.:::.:  : : .    ::::.:. : : ::..:.:...:  .: :.. ::  .: ::.
CCDS77 CYRLYTERAYRDEMLTTNVPEIQRTNLASTVLSLKAMGINDLLSFDFMDAPPMETLITAM
      900       910       920       930       940       950        

      560       570       580       590       600       610        
pF1KE2 LYLRDQGALDSSEALTPIGSLLAQLPVDVVIGKMLILGSMFSLVEPVLTIAAALSVQSPF
         :   ::::.   :: .:  .:..:.. .. ::::..  ..  : .:::.. ::::. :
CCDS77 EQLYTLGALDDEGLLTRLGRRMAEFPLEPMLCKMLIMSVHLGCSEEMLTIVSMLSVQNVF
      960       970       980       990      1000      1010        

      620       630       640       650       660       670        
pF1KE2 TRSAQSSPECAAARRPLESDQGDPFTLFNVFNAWVQVKSERSRNSRKWCRRRGIEEHRLY
        :  ...      .  ... .:: .::. :.:.:     . .. :  :: .  :. . : 
CCDS77 YRPKDKQALADQKKAKFHQTEGDHLTLLAVYNSW-----KNNKFSNPWCYENFIQARSLR
     1020      1030      1040      1050           1060      1070   

      680       690       700       710       720       730        
pF1KE2 EMANLRRQFKELLEDHGLLAGAQAAQVGDSYSRLQQRRERRALHQLKRQHEEGAGRRRKV
       .  ..:.:.  ... : :    .... : :  :.:.                        
CCDS77 RAQDIRKQMLGIMDRHKL----DVVSCGKSTVRVQKAICSGFFRNAAKKDPQEGYRTLID
          1080      1090          1100      1110      1120         

      740       750       760       770       780       790        
pF1KE2 LRLQEEQDGGSSDEDRAGPAPPGASDGVDIQDVKFKLRHDLAQLQAAASSAQDLSREQLA
                                                                   
CCDS77 QQVVYIHPSSALFNRQPECPKHFLPVVAVAVSLEQCLSKFEDLNKELGLVTC        
    1130      1140      1150      1160      1170      1180         

>>CCDS11464.1 DHX8 gene_id:1659|Hs108|chr17               (1220 aa)
 initn: 1249 init1: 434 opt: 1222  Z-score: 895.2  bits: 177.6 E(32554): 1.5e-43
Smith-Waterman score: 1324; 37.5% identity (67.2% similar) in 606 aa overlap (119-714:526-1105)

       90       100       110       120       130       140        
pF1KE2 SIPALADLPRTYDPRYRINLSVLGPATRGSQGLGRHLPAERVAEFRRALLHYLDFGQKQA
                                     .:.:  .: . . :...   : .  :.: .
CCDS11 AEMDSIPMGLNKHWVDPLPDAEGRQIAANMRGIG-MMPND-IPEWKK---HAFG-GNKAS
         500       510       520        530        540             

      150         160       170       180       190       200      
pF1KE2 FGRLAKLQ--RERAALPIAQYGNRILQTLKEHQVVVVAGDTGCGKSTQVPQYLLAAGFS-
       .:. ....  ..: .::: .  ....:.....:...: :.:: ::.::. :::  ::.. 
CCDS11 YGKKTQMSILEQRESLPIYKLKEQLVQAVHDNQILIVIGETGSGKTTQITQYLAEAGYTS
     550       560       570       580       590       600         

           210       220       230       240       250       260   
pF1KE2 --HVACTQPRRIACISLAKRVGFESLSQYGSQVGYQIRFESTRSAATKIVFLTVGLLLRQ
         ...::::::.: .:.::::. :     :..::: ::::.  :  : : ..: :.:::.
CCDS11 RGKIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEFGCCLGQEVGYTIRFEDCTSPETVIKYMTDGMLLRE
     610       620       630       640       650       660         

           270       280       290       300       310       320   
pF1KE2 IQREPSLPQYEVLIVDEVHERHLHNDFLLGVLQRLLPTRPDLKVILMSATINISLFSSYF
          .:.: :: ....::.::: .:.: :.:.:.. .  : :.:.:. :::..   ::.::
CCDS11 CLIDPDLTQYAIIMLDEAHERTIHTDVLFGLLKKTVQKRQDMKLIVTSATLDAVKFSQYF
     670       680       690       700       710       720         

           330       340       350       360       370       380   
pF1KE2 SNAPVVQVPGRLFPITVVYQPQEAEPTTSKSEKLDPRPFLRVLESIDHKYPPEERGDLLV
        .::.  .::: .:. ..:     :: :   . ::   .. :.. :    ::   ::.::
CCDS11 YEAPIFTIPGRTYPVEILY---TKEPET---DYLDAS-LITVMQ-IHLTEPP---GDILV
     730       740          750          760         770           

           390           400       410       420       430         
pF1KE2 FLSGMAEISA----VLEAAQTYASHTQRWVVLPLHSALSVADQDKVFDVAPPGVRKCILS
       ::.:. ::..    . :  .. .  . . ..::..:::    : ..:: :::: :: ...
CCDS11 FLTGQEEIDTACEILYERMKSLGPDVPELIILPVYSALPSEMQTRIFDPAPPGSRKVVIA
      780       790       800       810       820       830        

     440       450       460       470       480       490         
pF1KE2 TNIAETSVTIDGIRFVVDSGKVKEMSYDPQAKLQRLQEFWISQASAEQRKGRAGRTGPGV
       :::::::.::::: .::: : ::.  :. .. ...:    ::::.:.:: ::::::::: 
CCDS11 TNIAETSLTIDGIYYVVDPGFVKQKVYNSKTGIDQLVVTPISQAQAKQRAGRAGRTGPGK
      840       850       860       870       880       890        

     500        510       520       530       540       550        
pF1KE2 CFRLYAESDY-DAFAPYPVPEIRRVALDSLVLQMKSMSVGDPRTFPFIEPPPPASLETAI
       :.:::.:  : : .    ::::.:. : : ::..:.:...:  .: :.. ::  .: ::.
CCDS11 CYRLYTERAYRDEMLTTNVPEIQRTNLASTVLSLKAMGINDLLSFDFMDAPPMETLITAM
      900       910       920       930       940       950        

      560       570       580       590       600       610        
pF1KE2 LYLRDQGALDSSEALTPIGSLLAQLPVDVVIGKMLILGSMFSLVEPVLTIAAALSVQSPF
         :   ::::.   :: .:  .:..:.. .. ::::..  ..  : .:::.. ::::. :
CCDS11 EQLYTLGALDDEGLLTRLGRRMAEFPLEPMLCKMLIMSVHLGCSEEMLTIVSMLSVQNVF
      960       970       980       990      1000      1010        

      620       630       640       650       660       670        
pF1KE2 TRSAQSSPECAAARRPLESDQGDPFTLFNVFNAWVQVKSERSRNSRKWCRRRGIEEHRLY
        :  ...      .  ... .:: .::. :.:.:     . .. :  :: .  :. . : 
CCDS11 YRPKDKQALADQKKAKFHQTEGDHLTLLAVYNSW-----KNNKFSNPWCYENFIQARSLR
     1020      1030      1040      1050           1060      1070   

      680       690       700       710       720       730        
pF1KE2 EMANLRRQFKELLEDHGLLAGAQAAQVGDSYSRLQQRRERRALHQLKRQHEEGAGRRRKV
       .  ..:.:.  ... : :    .... : :  :.:.                        
CCDS11 RAQDIRKQMLGIMDRHKL----DVVSCGKSTVRVQKAICSGFFRNAAKKDPQEGYRTLID
          1080      1090          1100      1110      1120         

      740       750       760       770       780       790        
pF1KE2 LRLQEEQDGGSSDEDRAGPAPPGASDGVDIQDVKFKLRHDLAQLQAAASSAQDLSREQLA
                                                                   
CCDS11 QQVVYIHPSSALFNRQPEWVVYHELVLTTKEYMREVTTIDPRWLVEFAPAFFKVSDPTKL
    1130      1140      1150      1160      1170      1180         

>>CCDS11072.1 DHX33 gene_id:56919|Hs108|chr17             (707 aa)
 initn: 1099 init1: 469 opt: 1169  Z-score: 860.1  bits: 170.3 E(32554): 1.4e-41
Smith-Waterman score: 1172; 35.9% identity (63.8% similar) in 622 aa overlap (85-690:14-602)

           60        70        80        90       100        110   
pF1KE2 EECQKFWTFFERLQRFQNLKTSRKEEKDPGQPKHSIPALADLPRTYDP-RYRINLSVLGP
                                     .:  . :. :    .. : :  . : . : 
CCDS11                  MPEEAGFPPAKRFRPGSGPPSRAG---SFPPGRQVVMLLTAGS
                                10        20           30        40

           120       130       140       150       160       170   
pF1KE2 ATRGSQGLGRHLPAERVAEFRRALLHYLDFGQKQAFGRLAKLQRERAALPIAQYGNRILQ
       . ::. :  :. :                ..: .:      .. .: .::: :  ...: 
CCDS11 GGRGGGGGRRQQPP---------------LAQPSASPYPEAVELQRRSLPIFQARGQLLA
               50                       60        70        80     

           180       190       200          210       220       230
pF1KE2 TLKEHQVVVVAGDTGCGKSTQVPQYLLAAGFSH---VACTQPRRIACISLAKRVGFESLS
        :.. . .:. :.:: ::.::.::::  .:.:.   .: :::::.: :::: ::. :. .
CCDS11 QLRNLDNAVLIGETGSGKTTQIPQYLYEGGISRQGIIAVTQPRRVAAISLATRVSDEKRT
          90       100       110       120       130       140     

              240       250       260       270       280       290
pF1KE2 QYGSQVGYQIRFESTRSAATKIVFLTVGLLLRQIQREPSLPQYEVLIVDEVHERHLHNDF
       . :. ::: .::... :  :.: ::: :.:::.   .  : .:  .:.::.::: .:.: 
CCDS11 ELGKLVGYTVRFDDVTSEDTRIKFLTDGMLLREAISDSLLRKYSCVILDEAHERTIHTDV
         150       160       170       180       190       200     

              300            310       320       330       340     
pF1KE2 LLGVLQRLLPTRPDL-----KVILMSATINISLFSSYFSNAPVVQVPGRLFPITVVYQPQ
       :.::..     : .:     :::.::::....:::.::..:::. . ::  :: : :  :
CCDS11 LFGVVKAAQKRRKELGKLPLKVIVMSATMDVDLFSQYFNGAPVLYLEGRQHPIQVFYTKQ
         210       220       230       240       250       260     

         350       360       370       380       390       400     
pF1KE2 EAEPTTSKSEKLDPRPFLRVLESIDHKYPPEERGDLLVFLSGMAEISAVLEAAQTYASHT
          :   ... :    .. :..   :.  :  . :.::::.:. :: :. .. .  :.: 
CCDS11 ---P---QNDYLHA-ALVSVFQI--HQEAPSSQ-DILVFLTGQEEIEAMSKTCRDIAKHL
               270        280          290       300       310     

             410       420       430       440       450       460 
pF1KE2 QR----WVVLPLHSALSVADQDKVFDVAPPGVRKCILSTNIAETSVTIDGIRFVVDSGKV
              .::::...:  :.: .::. :: : :: :.::::::::.:: ::..:::.: :
CCDS11 PDGCPAMLVLPLYASLPYAQQLRVFQGAPKGYRKVIISTNIAETSITITGIKYVVDTGMV
         320       330       340       350       360       370     

             470       480       490       500       510       520 
pF1KE2 KEMSYDPQAKLQRLQEFWISQASAEQRKGRAGRTGPGVCFRLYAESDYDAFAPYPVPEIR
       :  .:.:.. :. :    .:...: :: :::::   :.:.:::.:.... :  . ::::.
CCDS11 KAKKYNPDSGLEVLAVQRVSKTQAWQRTGRAGREDSGICYRLYTEDEFEKFDKMTVPEIQ
         380       390       400       410       420       430     

             530       540       550       560          570        
pF1KE2 RVALDSLVLQMKSMSVGDPRTFPFIEPPPPASLETAILYLRDQGAL---DSSEALTPIGS
       :  : :..::. .:.: .  :: :.  : :  ...::  :   :::   :.. .:::.: 
CCDS11 RCNLASVMLQLLAMKVPNVLTFDFMSKPSPDHIQAAIAQLDLLGALEHKDDQLTLTPMGR
         440       450       460       470       480       490     

      580       590       600       610       620       630        
pF1KE2 LLAQLPVDVVIGKMLILGSMFSLVEPVLTIAAALSVQSPFTRSAQSSPECAAARRPLESD
        .: .:..  ..: ....  :  .: .:::.. :::.: .    .   :  ..:. . :.
CCDS11 KMAAFPLEPKFAKTILMSPKFHCTEEILTIVSLLSVDSVLHNPPSRREEVQGVRKKFISS
         500       510       520       530       540       550     

      640       650       660       670       680       690        
pF1KE2 QGDPFTLFNVFNAWVQVKSERSRNSRKWCRRRGIEEHRLYEMANLRRQFKELLEDHGLLA
       .:: .::.:.. .. ..      ... ::..  .. . .  .:..: :....        
CCDS11 EGDHMTLLNIYRTFKNLG-----GNKDWCKENFVNSKNMTLVAEVRAQLRDICLKMSMPI
         560       570            580       590       600       610

      700       710       720       730       740       750        
pF1KE2 GAQAAQVGDSYSRLQQRRERRALHQLKRQHEEGAGRRRKVLRLQEEQDGGSSDEDRAGPA
                                                                   
CCDS11 ASSRGDVESVRRCLAHSLFMSTAELQPDGTYATTDTHQPVAIHPSSVLFHCKPACVVYTE
              620       630       640       650       660       670

>>CCDS10907.1 DHX38 gene_id:9785|Hs108|chr16              (1227 aa)
 initn: 1209 init1: 433 opt: 1155  Z-score: 846.6  bits: 168.6 E(32554): 7.8e-41
Smith-Waterman score: 1205; 36.8% identity (66.3% similar) in 552 aa overlap (149-691:519-1052)

      120       130       140       150       160       170        
pF1KE2 QGLGRHLPAERVAEFRRALLHYLDFGQKQAFGRLAKLQRERAALPIAQYGNRILQTLKEH
                                     :..  .. ..:  :::    ...:  ....
CCDS10 KAVTEDGKVDYRTEQKFADHMKRKSEASSEFAKKKSILEQRQYLPIFAVQQELLTIIRDN
      490       500       510       520       530       540        

      180       190       200          210       220       230     
pF1KE2 QVVVVAGDTGCGKSTQVPQYLLAAGFSH---VACTQPRRIACISLAKRVGFESLSQYGSQ
       ..:.:.:.:: ::.::. :::   :..    ..::::::.: .:.::::. :  .. : .
CCDS10 SIVIVVGETGSGKTTQLTQYLHEDGYTDYGMIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEMGGNLGEE
      550       560       570       580       590       600        

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pF1KE2 VGYQIRFESTRSAATKIVFLTVGLLLRQIQREPSLPQYEVLIVDEVHERHLHNDFLLGVL
       ::: ::::.  :  : : ..: :.:::.  :: .: .: ..:.::.::: :..: :.:.:
CCDS10 VGYAIRFEDCTSENTLIKYMTDGILLRESLREADLDHYSAIIMDEAHERSLNTDVLFGLL
      610       620       630       640       650       660        

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pF1KE2 QRLLPTRPDLKVILMSATINISLFSSYFSNAPVVQVPGRLFPITVVYQ--PQEAEPTTSK
       ....  : :::.:. :::..   :...:.:.:. ..::: ::. ....  :::    .. 
CCDS10 REVVARRSDLKLIVTSATMDAEKFAAFFGNVPIFHIPGRTFPVDILFSKTPQEDYVEAAV
      670       680       690       700       710       720        

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pF1KE2 SEKLDPRPFLRVLESIDHKYPPEERGDLLVFLSGMAEISAVLEAAQTYASHTQR---WVV
       ...:.          .  .  :   ::.:.:. :. .: .. .    .  . .     .:
CCDS10 KQSLQ----------VHLSGAP---GDILIFMPGQEDIEVTSDQIVEHLEELENAPALAV
      730                 740          750       760       770     

              420       430       440       450       460       470
pF1KE2 LPLHSALSVADQDKVFDVAPPGVRKCILSTNIAETSVTIDGIRFVVDSGKVKEMSYDPQA
       ::..: :    : :.:. :: ::::::..:::::::.:.::: ::.:::  :   ..:. 
CCDS10 LPIYSQLPSDLQAKIFQKAPDGVRKCIVATNIAETSLTVDGIMFVIDSGYCKLKVFNPRI
         780       790       800       810       820       830     

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pF1KE2 KLQRLQEFWISQASAEQRKGRAGRTGPGVCFRLYAESDY-DAFAPYPVPEIRRVALDSLV
        .. :: . ::::.:.::.::::::::: :::::..: : . .    ::::.:. : ..:
CCDS10 GMDALQIYPISQANANQRSGRAGRTGPGQCFRLYTQSAYKNELLTTTVPEIQRTNLANVV
         840       850       860       870       880       890     

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pF1KE2 LQMKSMSVGDPRTFPFIEPPPPASLETAILYLRDQGALDSSEALTPIGSLLAQLPVDVVI
       : .::..: :   : :..:::  .. ...  :   ::::.. .::  : :....:.: ..
CCDS10 LLLKSLGVQDLLQFHFMDPPPEDNMLNSMYQLWILGALDNTGGLTSTGRLMVEFPLDPAL
         900       910       920       930       940       950     

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pF1KE2 GKMLILGSMFSLVEPVLTIAAALSVQSPFTRSAQSSPECAAARRPLESDQGDPFTLFNVF
       .::::..  ..    .: :.. ::: . : :      :    :. .   ..: .: .::.
CCDS10 SKMLIVSCDMGCSSEILLIVSMLSVPAIFYRPKGREEESDQIREKFAVPESDHLTYLNVY
         960       970       980       990      1000      1010     

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pF1KE2 NAWVQVKSERSRNSRKWCRRRGIEEHRLYEMANLRRQFKELLEDHGLLAGAQAAQVGDSY
         :     . .  :  ::  . :. . . .. ..: :.:...                  
CCDS10 LQW-----KNNNYSTIWCNDHFIHAKAMRKVREVRAQLKDIMVQQRMSLASCGTDWDIVR
             1020      1030      1040      1050      1060      1070

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pF1KE2 SRLQQRRERRALHQLKRQHEEGAGRRRKVLRLQEEQDGGSSDEDRAGPAPPGASDGVDIQ
                                                                   
CCDS10 KCICAAYFHQAAKLKGIGEYVNIRTGMPCHLHPTSSLFGMGYTPDYIVYHELVMTTKEYM
             1080      1090      1100      1110      1120      1130

>>CCDS4685.1 DHX16 gene_id:8449|Hs108|chr6                (1041 aa)
 initn: 1177 init1: 449 opt: 1131  Z-score: 830.2  bits: 165.4 E(32554): 6.4e-40
Smith-Waterman score: 1248; 33.9% identity (61.8% similar) in 741 aa overlap (4-714:224-941)

                                          10        20        30   
pF1KE2                            MPPPRTREGRDRRDHHRAPSEEEALEKWDWNCP
                                     :. :. ..::..  :  :.: ::  . .  
CCDS46 RNVLERSDKKAYEEAQKRLKMAEEDRKAMVPELRK-KSRREYL-AKREREKLEDLEAELA
           200       210       220        230        240       250 

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pF1KE2 ETRRLLEDAFF----REE-DYIRQGSEECQKFWTFFERLQRFQNLKTSRKEEKDPGQPKH
       . . :. :. .    :.:  : :.  .  ... .  :. ....  .  .  ..  ::: .
CCDS46 DEEFLFGDVELSRHERQELKYKRRVRDLAREYRAAGEQ-EKLEATNRYHMPKETRGQPAR
             260       270       280        290       300       310

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pF1KE2 SIPALADLPRTY-DPRYRINLSVLGPATR--GSQGLGRHLPA-------ERVAEFRRALL
       ..  . .   .  . . : . . :: :.   :..  . . :        :.. :: ::  
CCDS46 AVDLVEEESGAPGEEQRRWEEARLGAASLKFGARDAASQEPKYQLVLEEEETIEFVRATQ
              320       330       340       350       360       370

      140       150            160       170       180       190   
pF1KE2 HYLDFGQKQAFGRLAKLQRE-----RAALPIAQYGNRILQTLKEHQVVVVAGDTGCGKST
          :   .         :.:     : .::.  . ...: .. .:::... :.:: ::.:
CCDS46 LQGDEEPSAPPTSTQAQQKESIQAVRRSLPVFPFREELLAAIANHQVLIIEGETGSGKTT
              380       390       400       410       420       430

           200           210       220       230       240         
pF1KE2 QVPQYLLAAGFSH----VACTQPRRIACISLAKRVGFESLSQYGSQVGYQIRFESTRSAA
       :.::::.  :...    .:::::::.: .:.: ::. :   . :..:::.::::.  :  
CCDS46 QIPQYLFEEGYTNKGMKIACTQPRRVAAMSVAARVAREMGVKLGNEVGYSIRFEDCTSER
              440       450       460       470       480       490

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pF1KE2 TKIVFLTVGLLLRQIQREPSLPQYEVLIVDEVHERHLHNDFLLGVLQRLLPTRPDLKVIL
       : . ..: :.:::..  ::.: .: :..:::.::: ::.:.:.:... .   ::.:::..
CCDS46 TVLRYMTDGMLLREFLSEPDLASYSVVMVDEAHERTLHTDILFGLIKDVARFRPELKVLV
              500       510       520       530       540       550

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pF1KE2 MSATINISLFSSYFSNAPVVQVPGRLFPITVVYQPQEAEPTTSKSEKLDPRPFLRVLESI
        :::.. . ::..:..::: ..::: ::. . :      : ..  :       . ::. :
CCDS46 ASATMDTARFSTFFDDAPVFRIPGRRFPVDIFYTKA---PEADYLEAC----VVSVLQ-I
              560       570       580          590           600   

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pF1KE2 DHKYPPEERGDLLVFLSGMAEISAVLEAAQTY----ASHTQRWVVLPLHSALSVADQDKV
           ::   ::.::::.:. :: :. :  :      .:. .. .:::... :    : ..
CCDS46 HVTQPP---GDILVFLTGQEEIEAACEMLQDRCRRLGSKIRELLVLPIYANLPSDMQARI
               610       620       630       640       650         

         430       440       450       460       470       480     
pF1KE2 FDVAPPGVRKCILSTNIAETSVTIDGIRFVVDSGKVKEMSYDPQAKLQRLQEFWISQASA
       :. .:::.:: ...:::::::.::.:: .:.: :  :. ::.:.. .. :     :.:::
CCDS46 FQPTPPGARKVVVATNIAETSLTIEGIIYVLDPGFCKQKSYNPRTGMESLTVTPCSKASA
     660       670       680       690       700       710         

         490       500       510        520       530       540    
pF1KE2 EQRKGRAGRTGPGVCFRLYAESDYD-AFAPYPVPEIRRVALDSLVLQMKSMSVGDPRTFP
       .:: :::::.. : :::::.   :.  .    ::::.:..: ..:: .::... :   : 
CCDS46 NQRAGRAGRVAAGKCFRLYTAWAYQHELEETTVPEIQRTSLGNVVLLLKSLGIHDLMHFD
     720       730       740       750       760       770         

          550       560       570       580       590       600    
pF1KE2 FIEPPPPASLETAILYLRDQGALDSSEALTPIGSLLAQLPVDVVIGKMLILGSMFSLVEP
       :..:::  .:  :.  :   :::.    ::  :  .:.:::: ...::.. .  .:  : 
CCDS46 FLDPPPYETLLLALEQLYALGALNHLGELTTSGRKMAELPVDPMLSKMILASEKYSCSEE
     780       790       800       810       820       830         

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pF1KE2 VLTIAAALSVQ-SPFTRSAQSSPECAAARRPLESDQGDPFTLFNVFNAWVQVKSERSRNS
       .::.:: :::. : : :  ..  .   ::  .    :: ..:.::.. :..     :  :
CCDS46 ILTVAAMLSVNNSIFYRPKDKVVHADNARVNFFLPGGDHLVLLNVYTQWAE-----SGYS
     840       850       860       870       880       890         

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pF1KE2 RKWCRRRGIEEHRLYEMANLRRQFKELLEDHGLLAGAQAAQVGDSYSRLQQRRERRALHQ
        .:: .  .. . . .  ..:.:.. :::   . .: .. : :: : :...         
CCDS46 SQWCYENFVQFRSMRRARDVREQLEGLLER--VEVGLSSCQ-GD-YIRVRKAITAGYFYH
          900       910       920         930         940       950

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pF1KE2 LKRQHEEGAGRRRKVLRLQEEQDGGSSDEDRAGPAPPGASDGVDIQDVKFKLRHDLAQLQ
                                                                   
CCDS46 TARLTRSGYRTVKQQQTVFIHPNSSLFEQQPRWLLYHELVLTTKEFMRQVLEIESSWLLE
              960       970       980       990      1000      1010

>>CCDS33966.1 DHX15 gene_id:1665|Hs108|chr4               (795 aa)
 initn: 1052 init1: 643 opt: 1127  Z-score: 828.9  bits: 164.8 E(32554): 7.5e-40
Smith-Waterman score: 1201; 38.5% identity (66.6% similar) in 563 aa overlap (151-696:126-673)

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 LGRHLPAERVAEFRRALLHYLDFGQKQAFGRLAKLQRERAALPIAQYGNRILQTLKEHQV
                                     :   . ..:  ::. .: .:. . : .:: 
CCDS33 HSAHSTHAGHAGHTSLPQCINPFTNLPHTPRYYDILKKRLQLPVWEYKDRFTDILVRHQS
         100       110       120       130       140       150     

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pF1KE2 VVVAGDTGCGKSTQVPQ----YL--LAAGFSHVACTQPRRIACISLAKRVGFESLSQYGS
        :..:.:: ::.::.::    :.  : .    ::::::::.: .:.:.::. :   . :.
CCDS33 FVLVGETGSGKTTQIPQWCVEYMRSLPGPKRGVACTQPRRVAAMSVAQRVADEMDVMLGQ
         160       170       180       190       200       210     

          240       250       260       270       280       290    
pF1KE2 QVGYQIRFESTRSAATKIVFLTVGLLLRQIQREPSLPQYEVLIVDEVHERHLHNDFLLGV
       .:::.::::.  :: : . ..: :.:::. . .: : .: :.:.::.::: : .:.:.::
CCDS33 EVGYSIRFEDCSSAKTILKYMTDGMLLREAMNDPLLERYGVIILDEAHERTLATDILMGV
         220       230       240       250       260       270     

          300       310       320       330       340       350    
pF1KE2 LQRLLPTRPDLKVILMSATINISLFSSYFSNAPVVQVPGRLFPITVVYQPQEAEPTTSKS
       :....  : :::::.::::.. . :. ::.: :.. .:::  :. . : :   ::  .  
CCDS33 LKEVVRQRSDLKVIVMSATLDAGKFQIYFDNCPLLTIPGRTHPVEIFYTP---EPERDYL
         280       290       300       310       320          330  

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pF1KE2 EKLDPRPFLRVLESIDHKYPPEERGDLLVFLSGMAEISAVLEAAQTYASHTQRWV----V
       :       .:.. .: : .  ::.::::.::.:. ::. . .  .  ..     :    .
CCDS33 EAA-----IRTVIQI-H-MCEEEEGDLLLFLTGQEEIDEACKRIKREVDDLGPEVGDIKI
                 340         350       360       370       380     

              420       430             440       450       460    
pF1KE2 LPLHSALSVADQDKVFDVAPP----GV--RKCILSTNIAETSVTIDGIRFVVDSGKVKEM
       .::.:.:   .:...:.  ::    :.  :: ..::::::::.::::. ::.: : .:. 
CCDS33 IPLYSTLPPQQQQRIFEPPPPKKQNGAIGRKVVVSTNIAETSLTIDGVVFVIDPGFAKQK
         390       400       410       420       430       440     

          470       480       490       500       510        520   
pF1KE2 SYDPQAKLQRLQEFWISQASAEQRKGRAGRTGPGVCFRLYAESDYDA-FAPYPVPEIRRV
        :.:. ... :    ::.:::.:: :::::: :: :::::.:. : . .     ::: : 
CCDS33 VYNPRIRVESLLVTAISKASAQQRAGRAGRTRPGKCFRLYTEKAYKTEMQDNTYPEILRS
         450       460       470       480       490       500     

           530       540       550       560       570       580   
pF1KE2 ALDSLVLQMKSMSVGDPRTFPFIEPPPPASLETAILYLRDQGALDSSEALTPIGSLLAQL
        : :.:::.:.... :   : :..:: : .:  :.  :   .::...  :: .::..:..
CCDS33 NLGSVVLQLKKLGIDDLVHFDFMDPPAPETLMRALELLNYLAALNDDGDLTELGSMMAEF
         510       520       530       540       550       560     

           590       600       610       620       630       640   
pF1KE2 PVDVVIGKMLILGSMFSLVEPVLTIAAALSVQSPFTRSAQSSPECAAARRPLESDQGDPF
       :.:  ..::.: .  ..  . ::.:.: ::: . :.: ....     :.  .   .:: .
CCDS33 PLDPQLAKMVIASCDYNCSNEVLSITAMLSVPQCFVRPTEAKKAADEAKMRFAHIDGDHL
         570       580       590       600       610       620     

           650       660       670       680       690       700   
pF1KE2 TLFNVFNAWVQVKSERSRNSRKWCRRRGIEEHRLYEMANLRRQFKELLEDHGLLAGAQAA
       ::.::..:. :     ...: .::    :. . :.   :.:.:......  .:       
CCDS33 TLLNVYHAFKQ-----NHESVQWCYDNFINYRSLMSADNVRQQLSRIMDRFNLPRRSTDF
         630            640       650       660       670       680

           710       720       730       740       750       760   
pF1KE2 QVGDSYSRLQQRRERRALHQLKRQHEEGAGRRRKVLRLQEEQDGGSSDEDRAGPAPPGAS
                                                                   
CCDS33 TSRDYYINIRKALVTGYFMQVAHLERTGHYLTVKDNQVVQLHPSTVLDHKPEWVLYNEFV
              690       700       710       720       730       740

>>CCDS54463.1 DHX35 gene_id:60625|Hs108|chr20             (672 aa)
 initn: 820 init1: 432 opt: 982  Z-score: 724.8  bits: 145.2 E(32554): 4.8e-34
Smith-Waterman score: 991; 34.7% identity (66.7% similar) in 519 aa overlap (195-691:56-558)

          170       180       190       200           210       220
pF1KE2 AQYGNRILQTLKEHQVVVVAGDTGCGKSTQVPQYLLAAGFSH----VACTQPRRIACISL
                                     : .::  ::..     :. :::::.: ...
CCDS54 RQSLAENSGTTVVYNPYAALSIEQQRQKLPVFKYLAEAGWTAEGRVVGVTQPRRVAAVTV
          30        40        50        60        70        80     

              230       240        250       260       270         
pF1KE2 AKRVGFESLSQYGSQVGYQIRFES-TRSAATKIVFLTVGLLLRQIQREPSLPQYEVLIVD
       : ::. :  .  : .::: :::.. : . ::.: ::: :.:.:... .: : .: :...:
CCDS54 AGRVAEERGAVLGHEVGYCIRFDDCTDQLATRIKFLTDGMLVREMMVDPLLTKYSVIMLD
          90       100       110       120       130       140     

     280       290       300       310       320                   
pF1KE2 EVHERHLHNDFLLGVLQRLLPTRPDLKVILMSATINISLFSSYF----SNAP------VV
       :.::: :..:. .:.:...   : ::..:. :::.. . : ..:    .. :      ..
CCDS54 EAHERTLYTDIAIGLLKKIQKKRGDLRLIVASATLDADKFRDFFNQNETSDPARDTCVIL
         150       160       170       180       190       200     

     330       340       350       360       370       380         
pF1KE2 QVPGRLFPITVVYQPQEAEPTTSKSEKLDPRPFLRVLESIDHKYPPEERGDLLVFLSGMA
        : :: ::. . :  :   :   ::          ..:.. . .  :  ::.:.::.:. 
CCDS54 TVEGRTFPVDIFYL-QSPVPDYIKS----------TVETVVKIHQTEGDGDVLAFLTGQE
         210        220                 230       240       250    

     390           400         410       420       430       440   
pF1KE2 EI----SAVLEAAQTYA-SHTQRWV-VLPLHSALSVADQDKVFDVAPPGVRKCILSTNIA
       :.    : ..: :.. : .  .: . :::....:   .: :::. .  .::: :..::.:
CCDS54 EVETVVSMLIEQARALARTGMKRHLRVLPMYAGLPSFEQMKVFERVSRSVRKVIVATNVA
          260       270       280       290       300       310    

           450       460       470       480       490       500   
pF1KE2 ETSVTIDGIRFVVDSGKVKEMSYDPQAKLQRLQEFWISQASAEQRKGRAGRTGPGVCFRL
       :::.::.:: .:.: : ::  .:.:.. .. :    .:::::.:: ::.::.  : :.::
CCDS54 ETSITISGIVYVIDCGFVKLRAYNPRTAIECLVVVPVSQASANQRAGRGGRSRSGKCYRL
          320       330       340       350       360       370    

           510       520       530       540       550       560   
pF1KE2 YAESDYDAFAPYPVPEIRRVALDSLVLQMKSMSVGDPRTFPFIEPPPPASLETAILYLRD
       :.:  .: .    :::..:  :  ..::.:.... .   : :. :::  :.  :.  :  
CCDS54 YTEEAFDKLPQSTVPEMQRSNLAPVILQLKALGIDNVLRFHFMSPPPAQSMVQALELLYA
          380       390       400       410       420       430    

           570        580       590       600       610       620  
pF1KE2 QGALDSSEALT-PIGSLLAQLPVDVVIGKMLILGSMFSLVEPVLTIAAALSVQSPFTRSA
        :.::..  :: :.:  .:..:.. ...:::. .. :.  . .:.::: ...:. :.   
CCDS54 LGGLDKDCRLTEPLGMRIAEFPLNPMFAKMLLESGNFGCSQEILSIAAMMQIQNIFVVPP
          440       450       460       470       480       490    

            630       640       650       660       670       680  
pF1KE2 QSSPECAAARRPLESDQGDPFTLFNVFNAWVQVKSERSRNSRKWCRRRGIEEHRLYEMAN
       ... .   ..: .  ..:: .:..:...:...    ....: :::... .. . : . :.
CCDS54 NQKSHAIRVHRKFAVEEGDHLTMLNIYEAFIK----HNKDS-KWCQEHFLNYKGLVRAAT
          500       510       520           530        540         

            690       700       710       720       730       740  
pF1KE2 LRRQFKELLEDHGLLAGAQAAQVGDSYSRLQQRRERRALHQLKRQHEEGAGRRRKVLRLQ
       .:.:.:.::                                                   
CCDS54 VREQLKKLLVKFQVPRKSSEGDPDLVLRCIVSGFFANAARFHSTGAYRTIRDDHELHIHP
     550       560       570       580       590       600         

>>CCDS13310.1 DHX35 gene_id:60625|Hs108|chr20             (703 aa)
 initn: 943 init1: 432 opt: 982  Z-score: 724.5  bits: 145.3 E(32554): 4.9e-34
Smith-Waterman score: 1153; 34.8% identity (67.0% similar) in 594 aa overlap (122-691:14-589)

             100       110       120       130       140       150 
pF1KE2 ALADLPRTYDPRYRINLSVLGPATRGSQGLGRHLPAERVAEFRRALLHYLDFGQKQAFGR
                                     : . :.  ..: :..: .  . :   ... 
CCDS13                  MAAPVGPVKFWRPGTEGPGVSISEERQSLAE--NSGTTVVYNP
                                10        20        30          40 

               160       170       180       190       200         
pF1KE2 LAKL--QRERAALPIAQYGNRILQTLKEHQVVVVAGDTGCGKSTQVPQYLLAAGFSH---
        : :  ...:  ::. .  :.::  ....:.::..:.::::::::.::::  ::..    
CCDS13 YAALSIEQQRQKLPVFKLRNHILYLIENYQTVVIVGETGCGKSTQIPQYLAEAGWTAEGR
              50        60        70        80        90       100 

         210       220       230       240        250       260    
pF1KE2 -VACTQPRRIACISLAKRVGFESLSQYGSQVGYQIRFES-TRSAATKIVFLTVGLLLRQI
        :. :::::.: ...: ::. :  .  : .::: :::.. : . ::.: ::: :.:.:..
CCDS13 VVGVTQPRRVAAVTVAGRVAEERGAVLGHEVGYCIRFDDCTDQLATRIKFLTDGMLVREM
             110       120       130       140       150       160 

          270       280       290       300       310       320    
pF1KE2 QREPSLPQYEVLIVDEVHERHLHNDFLLGVLQRLLPTRPDLKVILMSATINISLFSSYF-
       . .: : .: :...::.::: :..:. .:.:...   : ::..:. :::.. . : ..: 
CCDS13 MVDPLLTKYSVIMLDEAHERTLYTDIAIGLLKKIQKKRGDLRLIVASATLDADKFRDFFN
             170       180       190       200       210       220 

                    330       340       350       360       370    
pF1KE2 ---SNAP------VVQVPGRLFPITVVYQPQEAEPTTSKSEKLDPRPFLRVLESIDHKYP
          .. :      .. : :: ::. . :  :   :   ::          ..:.. . . 
CCDS13 QNETSDPARDTCVILTVEGRTFPVDIFYL-QSPVPDYIKS----------TVETVVKIHQ
             230       240       250        260                 270

          380       390           400         410       420        
pF1KE2 PEERGDLLVFLSGMAEI----SAVLEAAQTYA-SHTQRWV-VLPLHSALSVADQDKVFDV
        :  ::.:.::.:. :.    : ..: :.. : .  .: . :::....:   .: :::. 
CCDS13 TEGDGDVLAFLTGQEEVETVVSMLIEQARALARTGMKRHLRVLPMYAGLPSFEQMKVFER
              280       290       300       310       320       330

      430       440       450       460       470       480        
pF1KE2 APPGVRKCILSTNIAETSVTIDGIRFVVDSGKVKEMSYDPQAKLQRLQEFWISQASAEQR
       .  .::: :..::.::::.::.:: .:.: : ::  .:.:.. .. :    .:::::.::
CCDS13 VSRSVRKVIVATNVAETSITISGIVYVIDCGFVKLRAYNPRTAIECLVVVPVSQASANQR
              340       350       360       370       380       390

      490       500       510       520       530       540        
pF1KE2 KGRAGRTGPGVCFRLYAESDYDAFAPYPVPEIRRVALDSLVLQMKSMSVGDPRTFPFIEP
        ::.::.  : :.:::.:  .: .    :::..:  :  ..::.:.... .   : :. :
CCDS13 AGRGGRSRSGKCYRLYTEEAFDKLPQSTVPEMQRSNLAPVILQLKALGIDNVLRFHFMSP
              400       410       420       430       440       450

      550       560       570        580       590       600       
pF1KE2 PPPASLETAILYLRDQGALDSSEALT-PIGSLLAQLPVDVVIGKMLILGSMFSLVEPVLT
       ::  :.  :.  :   :.::..  :: :.:  .:..:.. ...:::. .. :.  . .:.
CCDS13 PPAQSMVQALELLYALGGLDKDCRLTEPLGMRIAEFPLNPMFAKMLLESGNFGCSQEILS
              460       470       480       490       500       510

       610       620       630       640       650       660       
pF1KE2 IAAALSVQSPFTRSAQSSPECAAARRPLESDQGDPFTLFNVFNAWVQVKSERSRNSRKWC
       ::: ...:. :.   ... .   ..: .  ..:: .:..:...:...    ....: :::
CCDS13 IAAMMQIQNIFVVPPNQKSHAIRVHRKFAVEEGDHLTMLNIYEAFIK----HNKDS-KWC
              520       530       540       550           560      

       670       680       690       700       710       720       
pF1KE2 RRRGIEEHRLYEMANLRRQFKELLEDHGLLAGAQAAQVGDSYSRLQQRRERRALHQLKRQ
       ... .. . : . :..:.:.:.::                                    
CCDS13 QEHFLNYKGLVRAATVREQLKKLLVKFQVPRKSSEGDPDLVLRCIVSGFFANAARFHSTG
         570       580       590       600       610       620     

>>CCDS3171.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3              (1008 aa)
 initn: 911 init1: 433 opt: 766  Z-score: 565.6  bits: 116.4 E(32554): 3.5e-25
Smith-Waterman score: 1181; 33.4% identity (62.4% similar) in 683 aa overlap (142-747:187-865)

             120       130       140       150       160       170 
pF1KE2 GPATRGSQGLGRHLPAERVAEFRRALLHYLDFGQKQAFGRLAKLQRERAALPIAQYGNRI
                                     :. .:.   :  ..:. :  ::   . ...
CCDS31 IRNRSYIDRDSEYLLQENEPDGTLDQKLLEDLQKKKNDLRYIEMQHFREKLPSYGMQKEL
        160       170       180       190       200       210      

             180       190       200              210       220    
pF1KE2 LQTLKEHQVVVVAGDTGCGKSTQVPQYLL------AAGFS-HVACTQPRRIACISLAKRV
       .. . .:::.:..:.:::::.::: :..:      . : . ...:::::::. ::.:.::
CCDS31 VNLIDNHQVTVISGETGCGKTTQVTQFILDNYIERGKGSACRIVCTQPRRISAISVAERV
        220       230       240       250       260       270      

          230         240         250       260       270       280
pF1KE2 GFESLSQYGS--QVGYQIRFEST--RSAATKIVFLTVGLLLRQIQREPSLPQYEVLIVDE
       . :   . ::  ..:::::..:   :. .. :.. :.:..:. .: .: : .   ...::
CCDS31 AAERAESCGSGNSTGYQIRLQSRLPRKQGS-ILYCTTGIILQWLQSDPYLSSVSHIVLDE
        280       290       300        310       320       330     

              290       300       310       320       330          
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       .:::.:..: :. :.. ::  : ::::::::::.:   :: ::.: :....::  ::.. 
CCDS31 IHERNLQSDVLMTVVKDLLNFRSDLKVILMSATLNAEKFSEYFGNCPMIHIPGFTFPVVE
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                . : :.. :  .           ...:: . .       : ..:       
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            :.: . : :                :: : .:::: :  .::.. .  .. .  .
CCDS31 ASTVDVIEMMEDDKVDLNLIVALIRYIVLEEEDGAILVFLPGWDNISTLHDLLMSQVMFK
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       .......:::: . ...: .::  .:::::: ...:::::::.::: . .:.:.::.:: 
CCDS31 SDKFLIIPLHSLMPTVNQTQVFKRTPPGVRKIVIATNIAETSITIDDVVYVIDGGKIKET
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        .: : ... ..  :.:.:.:.::::::::. :: :..::     . .  : .::: :. 
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       :. : ::.: . .:    :   ...::   ..  .: .: . .:::..: :::.:  ::.
CCDS31 LEELCLQIKILRLGGIAYFLSRLMDPPSNEAVLLSIRHLMELNALDKQEELTPLGVHLAR
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       :::.  ::::...:..:  ..:::::::.:: ..::.    .     : :. : .: ..:
CCDS31 LPVEPHIGKMILFGALFCCLDPVLTIAASLSFKDPFVIPLGKEKIADARRKELAKDTRSD
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        .:. :.:..: ... .  :  . .: .  .  . :  . :.. :: : :   :.... .
CCDS31 HLTVVNAFEGWEEARRRGFRYEKDYCWEYFLSSNTLQMLHNMKGQFAEHLLGAGFVSSRN
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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