Result of FASTA (ccds) for pF1KE3330
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE3330, 943 aa
  1>>>pF1KE3330 943 - 943 aa - 943 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.6130+/-0.00131; mu= -24.5262+/- 0.076
 mean_var=573.0001+/-128.394, 0's: 0 Z-trim(110.9): 268  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.053579
 statistics sampled from 11689 (11947) to 11689 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.706), E-opt: 0.2 (0.367), width:  16
 Scan time:  3.960

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS6691.1 ROR2 gene_id:4920|Hs108|chr9            ( 943) 6520 520.2 7.4e-147
CCDS626.1 ROR1 gene_id:4919|Hs108|chr1             ( 937) 3657 298.9 3.1e-80
CCDS41344.1 ROR1 gene_id:4919|Hs108|chr1           ( 393) 1768 152.6 1.4e-36
CCDS75874.1 MUSK gene_id:4593|Hs108|chr9           ( 783)  876 83.9 1.4e-15
CCDS48005.1 MUSK gene_id:4593|Hs108|chr9           ( 869)  876 83.9 1.5e-15
CCDS58399.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15         ( 817)  827 80.1   2e-14
CCDS10340.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15         ( 825)  827 80.1   2e-14
CCDS35050.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9          ( 822)  820 79.5 2.9e-14
CCDS6671.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9           ( 838)  820 79.5 2.9e-14
CCDS30890.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1          ( 760)  795 77.6   1e-13
CCDS30891.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1          ( 790)  795 77.6 1.1e-13
CCDS1161.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1           ( 796)  795 77.6 1.1e-13
CCDS78096.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5          ( 734)  698 70.1 1.8e-11
CCDS1241.1 DDR2 gene_id:4921|Hs108|chr1            ( 855)  695 69.9 2.4e-11
CCDS4411.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5           ( 762)  690 69.5 2.9e-11
CCDS4410.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5           ( 802)  690 69.5   3e-11
CCDS42487.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19          (1370)  695 70.0 3.5e-11
CCDS12176.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19          (1382)  695 70.0 3.5e-11
CCDS53584.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 707)  671 68.0 7.5e-11
CCDS81514.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 593)  667 67.6 8.1e-11
CCDS44485.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 704)  667 67.7 9.2e-11
CCDS44487.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 705)  667 67.7 9.2e-11
CCDS44486.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 709)  667 67.7 9.3e-11
CCDS73210.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 732)  667 67.7 9.5e-11


>>CCDS6691.1 ROR2 gene_id:4920|Hs108|chr9                 (943 aa)
 initn: 6520 init1: 6520 opt: 6520  Z-score: 2750.0  bits: 520.2 E(32554): 7.4e-147
Smith-Waterman score: 6520; 99.8% identity (100.0% similar) in 943 aa overlap (1-943:1-943)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MARGSALPRRPLLCIPAVWAAAALLLSVSRTSGEVEVLDPNDPLGPLDGQDGPIPTLKGY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MARGSALPRRPLLCIPAVWAAAALLLSVSRTSGEVEVLDPNDPLGPLDGQDGPIPTLKGY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 FLNFLEPVNNITIVQGQTAILHCKVAGNPPPNVRWLKNDAPVVQEPRRIIIRKTEYGSRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 FLNFLEPVNNITIVQGQTAILHCKVAGNPPPNVRWLKNDAPVVQEPRRIIIRKTEYGSRL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE3 RIQDLDTTDTGYYQCVATNGMKTITATGVLFVRLGPTHSPNHNFQDDYHEDGFCQPYRGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 RIQDLDTTDTGYYQCVATNGMKTITATGVLFVRLGPTHSPNHNFQDDYHEDGFCQPYRGI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE3 ACARFIGNRTIYVDSLQMQGEIENRITAAFTMIGTSTHLSDQCSQFAIPSFCHFVFPLCD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 ACARFIGNRTIYVDSLQMQGEIENRITAAFTMIGTSTHLSDQCSQFAIPSFCHFVFPLCD
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE3 ARSRAPKPRELCRDECEVLESDLCRQEYTIARSNPLILMRLQLPKCEALPMPESPDAANC
       ::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 ARSRTPKPRELCRDECEVLESDLCRQEYTIARSNPLILMRLQLPKCEALPMPESPDAANC
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE3 MRIGIPAERLGRYHQCYNGSGMDYRGTASTTKSGHQCQPWALQHPHSHHLSSTDFPELGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MRIGIPAERLGRYHQCYNGSGMDYRGTASTTKSGHQCQPWALQHPHSHHLSSTDFPELGG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE3 GHAYCRNPGGQMEGPWCFTQNKNVRMELCDVPSCSPRDSSKMGILYILVPSIAIPLVIAC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 GHAYCRNPGGQMEGPWCFTQNKNVRMELCDVPSCSPRDSSKMGILYILVPSIAIPLVIAC
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE3 LFFLVCMCRNKQKASASTPQRRQLMASPSQDMEMPLINQHKQAKLKEISLSAVRFMEELG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 LFFLVCMCRNKQKASASTPQRRQLMASPSQDMEMPLINQHKQAKLKEISLSAVRFMEELG
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE3 EDRFGKVYKGHLFGPAPGEQTQAVAIKTLKDKAEGPLREEFRHEAMLRARLQHPNVVCLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 EDRFGKVYKGHLFGPAPGEQTQAVAIKTLKDKAEGPLREEFRHEAMLRARLQHPNVVCLL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE3 GVVTKDQPLSMIFSYCSHGDLHEFLVMRSPHSDVGSTDDDRTVKSALEPPDFVHLVAQIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 GVVTKDQPLSMIFSYCSHGDLHEFLVMRSPHSDVGSTDDDRTVKSALEPPDFVHLVAQIA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE3 AGMEYLSSHHVVHKDLATRNVLVYDKLNVKISDLGLFREVYAADYYKLLGNSLLPIRWMA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 AGMEYLSSHHVVHKDLATRNVLVYDKLNVKISDLGLFREVYAADYYKLLGNSLLPIRWMA
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE3 PEAIMYGKFSIDSDIWSYGVVLWEVFSYGLQPYCGYSNQDVVEMIRNRQVLPCPDDCPAW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 PEAIMYGKFSIDSDIWSYGVVLWEVFSYGLQPYCGYSNQDVVEMIRNRQVLPCPDDCPAW
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE3 VYALMIECWNEFPSRRPRFKDIHSRLRAWGNLSNYNSSAQTSGASNTTQTSSLSTSPVSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 VYALMIECWNEFPSRRPRFKDIHSRLRAWGNLSNYNSSAQTSGASNTTQTSSLSTSPVSN
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE3 VSNARYVGPKQKAPPFPQPQFIPMKGQIRPMVPPPQLYIPVNGYQPVPAYGAYLPNFYPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS66 VSNARYVGPKQKAPPFPQPQFIPMKGQIRPMVPPPQLYVPVNGYQPVPAYGAYLPNFYPV
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE3 QIPMQMAPQQVPPQMVPKPSSHHSGSGSTSTGYVTTAPSNTSMADRAALLSEGADDTQNA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 QIPMQMAPQQVPPQMVPKPSSHHSGSGSTSTGYVTTAPSNTSMADRAALLSEGADDTQNA
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940   
pF1KE3 PEDGAQSTVQEAEEEEEGSVPETELLGDCDTLQVDEAQVQLEA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 PEDGAQSTVQEAEEEEEGSVPETELLGDCDTLQVDEAQVQLEA
              910       920       930       940   

>>CCDS626.1 ROR1 gene_id:4919|Hs108|chr1                  (937 aa)
 initn: 2749 init1: 1334 opt: 3657  Z-score: 1554.0  bits: 298.9 E(32554): 3.1e-80
Smith-Waterman score: 3657; 57.6% identity (79.1% similar) in 946 aa overlap (8-942:4-936)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MARGSALPRRPLLCIPAVWAAAALLLSVSRTSGEVEVLDPNDPLGPLDGQDGPIPTLKGY
              :::     : .   :::::..  ....   :. .  : : .. .      :  
CCDS62     MHRPRRRGTRPPLLALLAALLLAARGAAAQETELSVSAELVPTSSWNISSELNKDS
                   10        20        30        40        50      

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 FLNFLEPVNNITIVQGQTAILHCKVAGNPPPNVRWLKNDAPVVQEPRRIIIRKTEYGSRL
       .:.. ::.::::   :::: :::::.:::::..::.::::::::::::. .:.: :::::
CCDS62 YLTLDEPMNNITTSLGQTAELHCKVSGNPPPTIRWFKNDAPVVQEPRRLSFRSTIYGSRL
         60        70        80        90       100       110      

              130       140       150       160       170       180
pF1KE3 RIQDLDTTDTGYYQCVATNGMKTITATGVLFVRLGPTHSPNHNFQDDYHEDGFCQPYRGI
       ::..::::::::.::::::: .....::::::..::  . . ...:.:.:::::::::::
CCDS62 RIRNLDTTDTGYFQCVATNGKEVVSSTGVLFVKFGPPPTASPGYSDEYEEDGFCQPYRGI
        120       130       140       150       160       170      

              190       200       210       220       230       240
pF1KE3 ACARFIGNRTIYVDSLQMQGEIENRITAAFTMIGTSTHLSDQCSQFAIPSFCHFVFPLCD
       ::::::::::.:..::.:::::::.:::::::::::.::::.::::::::.::..:: ::
CCDS62 ACARFIGNRTVYMESLHMQGEIENQITAAFTMIGTSSHLSDKCSQFAIPSLCHYAFPYCD
        180       190       200       210       220       230      

              250       260       270       280       290       300
pF1KE3 ARSRAPKPRELCRDECEVLESDLCRQEYTIARSNPLILMRLQLPKCEALPMPESPDAANC
         : .::::.:::::::.::. ::. :: .:::::.:::::.::.:: ::.::::.::::
CCDS62 ETSSVPKPRDLCRDECEILENVLCQTEYIFARSNPMILMRLKLPNCEDLPQPESPEAANC
        240       250       260       270       280       290      

               310       320       330       340       350         
pF1KE3 MRIGIP-AERLGRYHQCYNGSGMDYRGTASTTKSGHQCQPWALQHPHSHHLSSTDFPELG
       .::::: :. ... :.:::..:.:::::.:.::::.:::::  :.::.: ...  ::::.
CCDS62 IRIGIPMADPINKNHKCYNSTGVDYRGTVSVTKSGRQCQPWNSQYPHTHTFTALRFPELN
        300       310       320       330       340       350      

     360       370       380       390          400       410      
pF1KE3 GGHAYCRNPGGQMEGPWCFTQNKNVRMELCDVPSCSPRDS---SKMGILYILVPSIAIPL
       :::.::::::.: :.::::: ..: . .:::.:.:. .::   .:: ::::::::.::::
CCDS62 GGHSYCRNPGNQKEAPWCFTLDENFKSDLCDIPACDSKDSKEKNKMEILYILVPSVAIPL
        360       370       380       390       400       410      

        420       430       440       450       460        470     
pF1KE3 VIACLFFLVCMCRNKQKASASTPQRRQLMASPSQDMEMPLINQHK-QAKLKEISLSAVRF
       .:: :::..:.:::.:: :.:.: .::     .:..:: ..: .: ..: ::. ::::::
CCDS62 AIALLFFFICVCRNNQK-SSSAPVQRQPKHVRGQNVEMSMLNAYKPKSKAKELPLSAVRF
        420       430        440       450       460       470     

         480       490       500       510       520       530     
pF1KE3 MEELGEDRFGKVYKGHLFGPAPGEQTQAVAIKTLKDKAEGPLREEFRHEAMLRARLQHPN
       ::::::  :::.:::::. :.  ...: ::::::::  .     ::..:: : :.:.:::
CCDS62 MEELGECAFGKIYKGHLYLPGM-DHAQLVAIKTLKDYNNPQQWTEFQQEASLMAELHHPN
         480       490        500       510       520       530    

         540       550       560       570        580       590    
pF1KE3 VVCLLGVVTKDQPLSMIFSYCSHGDLHEFLVMRSPHSDVG-STDDDRTVKSALEPPDFVH
       .:::::.::..::. :.: : ..:::::::.::::::::: :.:.: ::::.:.  ::.:
CCDS62 IVCLLGAVTQEQPVCMLFEYINQGDLHEFLIMRSPHSDVGCSSDEDGTVKSSLDHGDFLH
          540       550       560       570       580       590    

          600       610       620       630       640       650    
pF1KE3 LVAQIAAGMEYLSSHHVVHKDLATRNVLVYDKLNVKISDLGLFREVYAADYYKLLGNSLL
       .. ::::::::::::  ::::::.::.:. ..:.:::::::: ::.:.::::.. ..:::
CCDS62 IAIQIAAGMEYLSSHFFVHKDLAARNILIGEQLHVKISDLGLSREIYSADYYRVQSKSLL
          600       610       620       630       640       650    

          660       670       680       690       700       710    
pF1KE3 PIRWMAPEAIMYGKFSIDSDIWSYGVVLWEVFSYGLQPYCGYSNQDVVEMIRNRQVLPCP
       ::::: :::::::::: ::::::.::::::.::.::::: :.:::.:.::.:.::.::: 
CCDS62 PIRWMPPEAIMYGKFSSDSDIWSFGVVLWEIFSFGLQPYYGFSNQEVIEMVRKRQLLPCS
          660       670       680       690       700       710    

          720       730       740       750       760       770    
pF1KE3 DDCPAWVYALMIECWNEFPSRRPRFKDIHSRLRAWGNLSNYNSSAQTSGASNTTQTSSLS
       .:::  .:.:: :::::.::::::::::: :::.: .::...::.  ::.. ::::.:::
CCDS62 EDCPPRMYSLMTECWNEIPSRRPRFKDIHVRLRSWEGLSSHTSSTTPSGGNATTQTTSLS
          720       730       740       750       760       770    

          780       790          800       810       820       830 
pF1KE3 TSPVSNVSNARYVGPKQKAPP---FPQPQFIPMKGQIRPMVPPPQLYIPVNGYQPVPAYG
       .:::::.:: ::  :.   :     :: :   . : : : .:  : .::.:::   :.:.
CCDS62 ASPVSNLSNPRY--PNYMFPSQGITPQGQ---IAGFIGPPIPQNQRFIPINGYPIPPGYA
          780         790       800          810       820         

             840       850       860       870       880       890 
pF1KE3 AYLPNFYPVQIPMQMAPQQVPPQMVPKPSSHHSGSGSTSTGYVTTAPSNTSMADRAALLS
       :.    :    : ..  :. ::   ::  :  :.:::::::.::. ::. :  .    : 
CCDS62 AFPAAHYQPTGPPRVI-QHCPP---PKSRSPSSASGSTSTGHVTSLPSSGSNQEANIPLL
     830       840        850          860       870       880     

             900         910       920       930       940   
pF1KE3 EGADDTQNAPEDGAQSTV--QEAEEEEEGSVPETELLGDCDTLQVDEAQVQLEA
          .   : :  :   ::  .....  . .  .. :::: .     :.... : 
CCDS62 PHMS-IPNHP-GGMGITVFGNKSQKPYKIDSKQASLLGDANIHGHTESMISAEL
          890        900       910       920       930       

>>CCDS41344.1 ROR1 gene_id:4919|Hs108|chr1                (393 aa)
 initn: 1747 init1: 1334 opt: 1768  Z-score: 770.2  bits: 152.6 E(32554): 1.4e-36
Smith-Waterman score: 1768; 61.9% identity (84.5% similar) in 388 aa overlap (8-394:4-391)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MARGSALPRRPLLCIPAVWAAAALLLSVSRTSGEVEVLDPNDPLGPLDGQDGPIPTLKGY
              :::     : .   :::::..  ....   :. .  : : .. .      :  
CCDS41     MHRPRRRGTRPPLLALLAALLLAARGAAAQETELSVSAELVPTSSWNISSELNKDS
                   10        20        30        40        50      

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 FLNFLEPVNNITIVQGQTAILHCKVAGNPPPNVRWLKNDAPVVQEPRRIIIRKTEYGSRL
       .:.. ::.::::   :::: :::::.:::::..::.::::::::::::. .:.: :::::
CCDS41 YLTLDEPMNNITTSLGQTAELHCKVSGNPPPTIRWFKNDAPVVQEPRRLSFRSTIYGSRL
         60        70        80        90       100       110      

              130       140       150       160       170       180
pF1KE3 RIQDLDTTDTGYYQCVATNGMKTITATGVLFVRLGPTHSPNHNFQDDYHEDGFCQPYRGI
       ::..::::::::.::::::: .....::::::..::  . . ...:.:.:::::::::::
CCDS41 RIRNLDTTDTGYFQCVATNGKEVVSSTGVLFVKFGPPPTASPGYSDEYEEDGFCQPYRGI
        120       130       140       150       160       170      

              190       200       210       220       230       240
pF1KE3 ACARFIGNRTIYVDSLQMQGEIENRITAAFTMIGTSTHLSDQCSQFAIPSFCHFVFPLCD
       ::::::::::.:..::.:::::::.:::::::::::.::::.::::::::.::..:: ::
CCDS41 ACARFIGNRTVYMESLHMQGEIENQITAAFTMIGTSSHLSDKCSQFAIPSLCHYAFPYCD
        180       190       200       210       220       230      

              250       260       270       280       290       300
pF1KE3 ARSRAPKPRELCRDECEVLESDLCRQEYTIARSNPLILMRLQLPKCEALPMPESPDAANC
         : .::::.:::::::.::. ::. :: .:::::.:::::.::.:: ::.::::.::::
CCDS41 ETSSVPKPRDLCRDECEILENVLCQTEYIFARSNPMILMRLKLPNCEDLPQPESPEAANC
        240       250       260       270       280       290      

               310       320       330       340       350         
pF1KE3 MRIGIP-AERLGRYHQCYNGSGMDYRGTASTTKSGHQCQPWALQHPHSHHLSSTDFPELG
       .::::: :. ... :.:::..:.:::::.:.::::.:::::  :.::.: ...  ::::.
CCDS41 IRIGIPMADPINKNHKCYNSTGVDYRGTVSVTKSGRQCQPWNSQYPHTHTFTALRFPELN
        300       310       320       330       340       350      

     360       370       380       390       400       410         
pF1KE3 GGHAYCRNPGGQMEGPWCFTQNKNVRMELCDVPSCSPRDSSKMGILYILVPSIAIPLVIA
       :::.::::::.: :.::::: ..: . .:::.:.:                         
CCDS41 GGHSYCRNPGNQKEAPWCFTLDENFKSDLCDIPACGK                       
        360       370       380       390                          

     420       430       440       450       460       470         
pF1KE3 CLFFLVCMCRNKQKASASTPQRRQLMASPSQDMEMPLINQHKQAKLKEISLSAVRFMEEL

>>CCDS75874.1 MUSK gene_id:4593|Hs108|chr9                (783 aa)
 initn: 910 init1: 608 opt: 876  Z-score: 393.3  bits: 83.9 E(32554): 1.4e-15
Smith-Waterman score: 995; 30.5% identity (57.2% similar) in 732 aa overlap (67-753:126-782)

         40        50        60        70        80        90      
pF1KE3 VLDPNDPLGPLDGQDGPIPTLKGYFLNFLEPVNNITIVQGQTAILHCKVAGNPPPNVRWL
                                     :  :. :..:  :.: : . ::: :.: :.
CCDS75 IYCCTANNGVGGAVESCGALQVKMKPKITRPPINVKIIEGLKAVLPCTTMGNPKPSVSWI
         100       110       120       130       140       150     

        100       110       120       130       140       150      
pF1KE3 KNDAPVVQEPRRIIIRKTEYGSRLRIQDLDTTDTGYYQCVATNGMKTITATGVLFVRLGP
       :.:.:. .:  :: .   : :: :::....  :.: :.::: :.. :  .     :.:  
CCDS75 KGDSPL-RENSRIAV--LESGS-LRIHNVQKEDAGQYRCVAKNSLGTAYSK---VVKL--
         160          170        180       190       200           

        160       170       180       190       200       210      
pF1KE3 THSPNHNFQDDYHEDGFCQPYRGIACARFIGNRTIYVDSLQMQGEIENRITAAFTMIGTS
                 . .:..  .:                        : .... : .     :
CCDS75 ----------EVEEES--EP------------------------EQDTKVFARILRAPES
                  210                                 220       230

        220       230       240       250       260       270      
pF1KE3 THLSDQCSQFAIPSFCHFVFPLCDARSRAPKPRELCRDECEVLESDLCRQEYTIARSNPL
        ...          :  ::   : : .  : :     .. ... :    :: .  :   .
CCDS75 HNVT----------FGSFVTLHCTA-TGIPVPTITWIENGNAVSSG-SIQESVKDR---V
                        240        250       260        270        

        280       290       300       310       320       330      
pF1KE3 ILMRLQLPKCEALPMPESPDAANCMRIGIPAERLGRYHQCYNGSGMDYRGTASTTKSGHQ
       :  ::::       .  .:   .:.  .  .:...  .   . :  ..:    ..:    
CCDS75 IDSRLQL-------FITKPGLYTCIATNKHGEKFSTAKAAATISIAEWREYCLAVKELFC
         280              290       300       310       320        

        340               350           360        370       380   
pF1KE3 CQPWALQHPHSH--------HLSS----TDFPELGGGHAYC-RNPGGQMEGPWCFTQNKN
        . : ... ..:        :: :    . .: .    . : : :  ..  :   ... .
CCDS75 AKEWLVMEEKTHRGLYRSEMHLLSVPECSKLPSMHWDPTACARLP--HLAFPPMTSSKPS
      330       340       350       360       370         380      

           390       400            410       420             430  
pF1KE3 VRMELCDVPSCSPRDSS-----KMGILYILVPSIAIPLVIACLFFLVCMCR------NKQ
       :  .. ..:: :  . :     .: ..  .. :.:: .:.  .  : : ::      ::.
CCDS75 V--DIPNLPSSSSSSFSVSPTYSMTVIISIMSSFAI-FVLLTITTLYC-CRRRKQWKNKK
          390       400       410       420        430        440  

                 440          450       460       470       480    
pF1KE3 KASAST-----PQR---RQLMASPSQDMEMPLINQHKQAKLKEISLSAVRFMEELGEDRF
       . ::..     :..    .:  .: . ..:::. . :  .: :   . .......::  :
CCDS75 RESAAVTLTTLPSELLLDRLHPNP-MYQRMPLLLNPKLLSL-EYPRNNIEYVRDIGEGAF
            450       460        470       480        490       500

          490       500       510       520       530       540    
pF1KE3 GKVYKGHLFGPAPGEQTQAVAIKTLKDKAEGPLREEFRHEAMLRARLQHPNVVCLLGVVT
       :.:....  :  : :    ::.: ::..: . .. .:..:: : :....::.: :::: .
CCDS75 GRVFQARAPGLLPYEPFTMVAVKMLKEEASADMQADFQREAALMAEFDNPNIVKLLGVCA
              510       520       530       540       550       560

          550       560       570       580          590           
pF1KE3 KDQPLSMIFSYCSHGDLHEFLVMRSPHSDVGSTDDDRTVKSALE---PPDF-----VHLV
         .:. ..: : ..:::.:::   :::.  . . .: .... .    :: .     . ..
CCDS75 VGKPMCLLFEYMAYGDLNEFLRSMSPHTVCSLSHSDLSMRAQVSSPGPPPLSCAEQLCIA
              570       580       590       600       610       620

        600       610       620       630       640       650      
pF1KE3 AQIAAGMEYLSSHHVVHKDLATRNVLVYDKLNVKISDLGLFREVYAADYYKLLGNSLLPI
        :.:::: ::: .. ::.:::::: :: ... :::.:.:: :..:.:::::   :. .::
CCDS75 RQVAAGMAYLSERKFVHRDLATRNCLVGENMVVKIADFGLSRNIYSADYYKANENDAIPI
              630       640       650       660       670       680

        660       670       680       690       700       710      
pF1KE3 RWMAPEAIMYGKFSIDSDIWSYGVVLWEVFSYGLQPYCGYSNQDVVEMIRNRQVLPCPDD
       ::: ::.:.:.... .::.:.:::::::.:::::::: :.....:. ..:. ..: ::..
CCDS75 RWMPPESIFYNRYTTESDVWAYGVVLWEIFSYGLQPYYGMAHEEVIYYVRDGNILSCPEN
              690       700       710       720       730       740

        720       730       740            750       760       770 
pF1KE3 CPAWVYALMIECWNEFPSRRPRFKDIHSRL-----RAWGNLSNYNSSAQTSGASNTTQTS
       ::. .: ::  ::...:. :: : .::  :     :: :..:                  
CCDS75 CPVELYNLMRLCWSKLPADRPSFTSIHRILERMCERAEGTVSV                 
              750       760       770       780                    

             780       790       800       810       820       830 
pF1KE3 SLSTSPVSNVSNARYVGPKQKAPPFPQPQFIPMKGQIRPMVPPPQLYIPVNGYQPVPAYG

>>CCDS48005.1 MUSK gene_id:4593|Hs108|chr9                (869 aa)
 initn: 910 init1: 608 opt: 876  Z-score: 392.7  bits: 83.9 E(32554): 1.5e-15
Smith-Waterman score: 1072; 31.6% identity (57.8% similar) in 722 aa overlap (69-753:221-868)

       40        50        60        70        80        90        
pF1KE3 DPNDPLGPLDGQDGPIPTLKGYFLNFLEPVNNITIVQGQTAILHCKVAGNPPPNVRWLKN
                                     .:.:.  :. . ::: ..: : :.. :..:
CCDS48 VAKNSLGTAYSKVVKLEVEVFARILRAPESHNVTF--GSFVTLHCTATGIPVPTITWIEN
              200       210       220         230       240        

      100       110       120       130         140       150      
pF1KE3 DAPVVQEPRRIIIRKTEYGSRLRIQDLDTTDTGYYQCVATN--GMKTITATGVLFVRLGP
          : .   .  ..     :::.   :  :  : : :.:::  : :  :: ..  . .. 
CCDS48 GNAVSSGSIQESVKDRVIDSRLQ---LFITKPGLYTCIATNKHGEKFSTAKAAATISIAE
      250       260       270          280       290       300     

        160       170       180        190       200       210     
pF1KE3 THSPNHNFQDDYHEDGFCQPYRGIAC-ARFIGNRTIYVDSLQMQGEIENRITAAFTMIGT
         .:    : :  . :.:  ::: .: : .  .  .....   . : : .   . :  . 
CCDS48 WSKP----QKD--NKGYCAQYRGEVCNAVLAKDALVFLNTSYADPE-EAQELLVHTAWNE
             310         320       330       340        350        

         220       230       240       250       260       270     
pF1KE3 STHLSDQCSQFAIPSFCHFVFPLCDARSRAPKPRELCRDECEVLESDLCRQEYTIARSNP
          .:  :   :   .:. .:  :.  . .: :  .::. : ...  .: .:. . . . 
CCDS48 LKVVSPVCRPAAEALLCNHIFQECSP-GVVPTPIPICREYCLAVKELFCAKEWLVMEEKT
      360       370       380        390       400       410       

          280            290        300       310       320        
pF1KE3 LI-LMR-----LQLPKCEALP-MPESPDAANCMRIGIPAERLGRYHQCYNGSGMDYRGTA
          :.:     :..:.:  :: :  .: :  : :  .:       :       .::    
CCDS48 HRGLYRSEMHLLSVPECSKLPSMHWDPTA--CAR--LP-------H-------LDY----
       420       430       440           450                       

      330       340       350       360       370       380        
pF1KE3 STTKSGHQCQPWALQHPHSHHLSSTDFPELGGGHAYCRNPGGQMEGPWCFTQNKNVRMEL
         .: . .  :     : .    :.:.:.:         :...  .   :          
CCDS48 --NKENLKTFP-----PMTSSKPSVDIPNL---------PSSSSSS---F----------
           460            470                480                   

      390       400       410       420             430            
pF1KE3 CDVPSCSPRDSSKMGILYILVPSIAIPLVIACLFFLVCMCR------NKQKASAST----
           : ::  :  : ..  .. :.:: .:.  .  : : ::      ::.. ::..    
CCDS48 ----SVSPTYS--MTVIISIMSSFAI-FVLLTITTLYC-CRRRKQWKNKKRESAAVTLTT
            490         500        510        520       530        

       440          450       460       470       480       490    
pF1KE3 -PQR---RQLMASPSQDMEMPLINQHKQAKLKEISLSAVRFMEELGEDRFGKVYKGHLFG
        :..    .:  .: . ..:::. . :  .: :   . .......::  ::.:....  :
CCDS48 LPSELLLDRLHPNP-MYQRMPLLLNPKLLSL-EYPRNNIEYVRDIGEGAFGRVFQARAPG
      540       550        560        570       580       590      

          500       510       520       530       540       550    
pF1KE3 PAPGEQTQAVAIKTLKDKAEGPLREEFRHEAMLRARLQHPNVVCLLGVVTKDQPLSMIFS
         : :    ::.: ::..: . .. .:..:: : :....::.: :::: .  .:. ..: 
CCDS48 LLPYEPFTMVAVKMLKEEASADMQADFQREAALMAEFDNPNIVKLLGVCAVGKPMCLLFE
        600       610       620       630       640       650      

          560       570       580          590            600      
pF1KE3 YCSHGDLHEFLVMRSPHSDVGSTDDDRTVKSALE---PPDF-----VHLVAQIAAGMEYL
       : ..:::.:::   :::.  . . .: .... .    :: .     . .. :.:::: ::
CCDS48 YMAYGDLNEFLRSMSPHTVCSLSHSDLSMRAQVSSPGPPPLSCAEQLCIARQVAAGMAYL
        660       670       680       690       700       710      

        610       620       630       640       650       660      
pF1KE3 SSHHVVHKDLATRNVLVYDKLNVKISDLGLFREVYAADYYKLLGNSLLPIRWMAPEAIMY
       : .. ::.:::::: :: ... :::.:.:: :..:.:::::   :. .::::: ::.:.:
CCDS48 SERKFVHRDLATRNCLVGENMVVKIADFGLSRNIYSADYYKANENDAIPIRWMPPESIFY
        720       730       740       750       760       770      

        670       680       690       700       710       720      
pF1KE3 GKFSIDSDIWSYGVVLWEVFSYGLQPYCGYSNQDVVEMIRNRQVLPCPDDCPAWVYALMI
       .... .::.:.:::::::.:::::::: :.....:. ..:. ..: ::..::. .: :: 
CCDS48 NRYTTESDVWAYGVVLWEIFSYGLQPYYGMAHEEVIYYVRDGNILSCPENCPVELYNLMR
        780       790       800       810       820       830      

        730       740            750       760       770       780 
pF1KE3 ECWNEFPSRRPRFKDIHSRL-----RAWGNLSNYNSSAQTSGASNTTQTSSLSTSPVSNV
        ::...:. :: : .::  :     :: :..:                            
CCDS48 LCWSKLPADRPSFTSIHRILERMCERAEGTVSV                           
        840       850       860                                    

             790       800       810       820       830       840 
pF1KE3 SNARYVGPKQKAPPFPQPQFIPMKGQIRPMVPPPQLYIPVNGYQPVPAYGAYLPNFYPVQ

>>CCDS58399.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15              (817 aa)
 initn: 849 init1: 701 opt: 827  Z-score: 372.6  bits: 80.1 E(32554): 2e-14
Smith-Waterman score: 827; 43.2% identity (73.1% similar) in 294 aa overlap (458-750:514-806)

       430       440       450       460        470       480      
pF1KE3 CRNKQKASASTPQRRQLMASPSQDMEMPLINQHK-QAKLKEISLSAVRFMEELGEDRFGK
                                     : :: .. ...:.   . . .::::  :::
CCDS58 SSLDAGPDTVVIGMTRIPVIENPQYFRQGHNCHKPDTYVQHIKRRDIVLKRELGEGAFGK
           490       500       510       520       530       540   

        490       500       510       520       530       540      
pF1KE3 VYKGHLFGPAPGEQTQAVAIKTLKDKAEGPLREEFRHEAMLRARLQHPNVVCLLGVVTKD
       :. .. .. .: .. . ::.:.::: . .  :..:..:: : . ::: ..: . ::    
CCDS58 VFLAECYNLSPTKDKMLVAVKALKDPTLAA-RKDFQREAELLTNLQHEHIVKFYGVCGDG
           550       560       570        580       590       600  

        550       560       570       580       590       600      
pF1KE3 QPLSMIFSYCSHGDLHEFLVMRSPHSDVGSTDDDRTVKSALEPPDFVHLVAQIAAGMEYL
       .:: :.: : .::::..::  ..: . .    . : .:. :   ...:...:::.:: ::
CCDS58 DPLIMVFEYMKHGDLNKFLRAHGPDAMILVDGQPRQAKGELGLSQMLHIASQIASGMVYL
            610       620       630       640       650       660  

        610       620       630       640       650       660      
pF1KE3 SSHHVVHKDLATRNVLVYDKLNVKISDLGLFREVYAADYYKLLGNSLLPIRWMAPEAIMY
       .:.: ::.:::::: ::  .: :::.:.:. :.::..:::.. :...:::::: ::.:::
CCDS58 ASQHFVHRDLATRNCLVGANLLVKIGDFGMSRDVYSTDYYRVGGHTMLPIRWMPPESIMY
            670       680       690       700       710       720  

        670       680       690       700       710       720      
pF1KE3 GKFSIDSDIWSYGVVLWEVFSYGLQPYCGYSNQDVVEMIRNRQVLPCPDDCPAWVYALMI
        ::. .::.::.::.:::.:.:: ::.   :: .:.: : . .::  :  ::  :: .:.
CCDS58 RKFTTESDVWSFGVILWEIFTYGKQPWFQLSNTEVIECITQGRVLERPRVCPKEVYDVML
            730       740       750       760       770       780  

        730       740       750       760       770       780      
pF1KE3 ECWNEFPSRRPRFKDIHSRLRAWGNLSNYNSSAQTSGASNTTQTSSLSTSPVSNVSNARY
        ::.. :..:  .:.:.. :.: :                                    
CCDS58 GCWQREPQQRLNIKEIYKILHALGKATPIYLDILG                         
            790       800       810                                

>>CCDS10340.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15              (825 aa)
 initn: 849 init1: 701 opt: 827  Z-score: 372.6  bits: 80.1 E(32554): 2e-14
Smith-Waterman score: 827; 43.2% identity (73.1% similar) in 294 aa overlap (458-750:522-814)

       430       440       450       460        470       480      
pF1KE3 CRNKQKASASTPQRRQLMASPSQDMEMPLINQHK-QAKLKEISLSAVRFMEELGEDRFGK
                                     : :: .. ...:.   . . .::::  :::
CCDS10 SSLDAGPDTVVIGMTRIPVIENPQYFRQGHNCHKPDTYVQHIKRRDIVLKRELGEGAFGK
             500       510       520       530       540       550 

        490       500       510       520       530       540      
pF1KE3 VYKGHLFGPAPGEQTQAVAIKTLKDKAEGPLREEFRHEAMLRARLQHPNVVCLLGVVTKD
       :. .. .. .: .. . ::.:.::: . .  :..:..:: : . ::: ..: . ::    
CCDS10 VFLAECYNLSPTKDKMLVAVKALKDPTLAA-RKDFQREAELLTNLQHEHIVKFYGVCGDG
             560       570       580        590       600       610

        550       560       570       580       590       600      
pF1KE3 QPLSMIFSYCSHGDLHEFLVMRSPHSDVGSTDDDRTVKSALEPPDFVHLVAQIAAGMEYL
       .:: :.: : .::::..::  ..: . .    . : .:. :   ...:...:::.:: ::
CCDS10 DPLIMVFEYMKHGDLNKFLRAHGPDAMILVDGQPRQAKGELGLSQMLHIASQIASGMVYL
              620       630       640       650       660       670

        610       620       630       640       650       660      
pF1KE3 SSHHVVHKDLATRNVLVYDKLNVKISDLGLFREVYAADYYKLLGNSLLPIRWMAPEAIMY
       .:.: ::.:::::: ::  .: :::.:.:. :.::..:::.. :...:::::: ::.:::
CCDS10 ASQHFVHRDLATRNCLVGANLLVKIGDFGMSRDVYSTDYYRVGGHTMLPIRWMPPESIMY
              680       690       700       710       720       730

        670       680       690       700       710       720      
pF1KE3 GKFSIDSDIWSYGVVLWEVFSYGLQPYCGYSNQDVVEMIRNRQVLPCPDDCPAWVYALMI
        ::. .::.::.::.:::.:.:: ::.   :: .:.: : . .::  :  ::  :: .:.
CCDS10 RKFTTESDVWSFGVILWEIFTYGKQPWFQLSNTEVIECITQGRVLERPRVCPKEVYDVML
              740       750       760       770       780       790

        730       740       750       760       770       780      
pF1KE3 ECWNEFPSRRPRFKDIHSRLRAWGNLSNYNSSAQTSGASNTTQTSSLSTSPVSNVSNARY
        ::.. :..:  .:.:.. :.: :                                    
CCDS10 GCWQREPQQRLNIKEIYKILHALGKATPIYLDILG                         
              800       810       820                              

>>CCDS35050.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9               (822 aa)
 initn: 866 init1: 585 opt: 820  Z-score: 369.6  bits: 79.5 E(32554): 2.9e-14
Smith-Waterman score: 858; 29.5% identity (53.0% similar) in 759 aa overlap (11-747:149-808)

                                   10         20        30         
pF1KE3                     MARGSALPRRPLLC-IPAVWAAAALLLSVSRTSGEVEVLD
                                     :. :    .:  .    . :  . ..  :.
CCDS35 HINFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKTLQEAKSSPDTQDLYCLN
      120       130       140       150       160       170        

      40           50        60        70        80        90      
pF1KE3 P---NDPLGPLDGQDGPIPTLKGYFLNFLEPVNNITIVQGQTAILHCKVAGNPPPNVRWL
           : ::. :.  .  .:.      :.  :  :.:. .:..  : :.:::.: ::. : 
CCDS35 ESSKNIPLANLQIPNCGLPS-----ANLAAP--NLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYW-
      180       190            200         210       220       230 

        100       110       120       130        140       150     
pF1KE3 KNDAPVVQEPRRIIIRKTEYGSRLRIQDLDTTDTG-YYQCVATNGMKTITATGVLFVRLG
         :.  .   .     .:. :: ::: .... :.:   .::: : .     .  : :...
CCDS35 --DVGNLVSKHMNETSHTQ-GS-LRITNISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFA
                240         250       260       270       280      

         160       170       180       190         200       210   
pF1KE3 PTHSPNHNFQDDYHEDGFCQPYRGIACARFIGNRTIYVDSLQ--MQGEIENRITAAFTMI
       :: .  ..  .:.:   .: :.         ::      .::  ..: : :.     : :
CCDS35 PTITFLESPTSDHH---WCIPF------TVKGNPK---PALQWFYNGAILNESKYICTKI
        290       300                310          320       330    

           220        230       240       250       260       270  
pF1KE3 GTSTHLSDQ-CSQFAIPSFCHFVFPLCDARSRAPKPRELCRDECEVLESDLCRQEYTIAR
        ...:   . : :.  :.  :    . ..        :  .:: ..              
CCDS35 HVTNHTEYHGCLQLDNPT--H----MNNGDYTLIAKNEYGKDEKQI--------------
          340       350             360       370                  

            280       290       300       310       320       330  
pF1KE3 SNPLILMRLQLPKCEALPMPESPDAANCMRIGIPAERLGRYHQCYNGSGMDYRGTASTTK
       :  .    .  :  .    :. ::.      :  :. .:   .  : :. .  .:  : :
CCDS35 SAHF----MGWPGIDDGANPNYPDVIY-EDYGTAANDIG---DTTNRSN-EIPSTDVTDK
              380       390        400          410        420     

            340       350       360                  370       380 
pF1KE3 SGHQCQPWALQHPHSHHLSSTDFPELGGGHAYC-----------RNPGGQMEGPWCFTQN
       .:..            :::      ...  ..:           :.    :.::    .:
CCDS35 TGRE------------HLSVYAVVVIASVVGFCLLVMLFLLKLARHSKFGMKGPASVISN
                     430       440       450       460       470   

                390       400       410       420       430        
pF1KE3 KNVR---MELCDVPSCSPRDSSKMGILYILVPSIAIPLVIACLFFLVCMCRNKQKASAST
        .     ..  .  : .: .::. :   ...    ::..           .: :  . ..
CCDS35 DDDSASPLHHISNGSNTP-SSSEGGPDAVIIGMTKIPVI-----------ENPQYFGITN
           480       490        500       510                  520 

      440       450       460       470       480       490        
pF1KE3 PQRRQLMASPSQDMEMPLINQHKQAKLKEISLSAVRFMEELGEDRFGKVYKGHLFGPAPG
        : .     :  :  .  :..:.           . . .::::  ::::. .. ..  : 
CCDS35 SQLK-----P--DTFVQHIKRHN-----------IVLKRELGEGAFGKVFLAECYNLCPE
                    530                  540       550       560   

      500       510       520       530       540       550        
pF1KE3 EQTQAVAIKTLKDKAEGPLREEFRHEAMLRARLQHPNVVCLLGVVTKDQPLSMIFSYCSH
       ..   ::.::::: ...  :..:..:: : . ::: ..: . :: .. .:: :.: : .:
CCDS35 QDKILVAVKTLKDASDNA-RKDFHREAELLTNLQHEHIVKFYGVCVEGDPLIMVFEYMKH
           570       580        590       600       610       620  

      560       570       580       590       600       610        
pF1KE3 GDLHEFLVMRSPHSDVGSTDDDRTVKSALEPPDFVHLVAQIAAGMEYLSSHHVVHKDLAT
       :::..::  ..: . . .  .  :    :   ...:.. :::::: ::.:.: ::.::::
CCDS35 GDLNKFLRAHGPDAVLMAEGNPPT---ELTQSQMLHIAQQIAAGMVYLASQHFVHRDLAT
            630       640          650       660       670         

      620       630       640       650       660       670        
pF1KE3 RNVLVYDKLNVKISDLGLFREVYAADYYKLLGNSLLPIRWMAPEAIMYGKFSIDSDIWSY
       :: :: ..: :::.:.:. :.::..:::.. :...:::::: ::.::: ::. .::.:: 
CCDS35 RNCLVGENLLVKIGDFGMSRDVYSTDYYRVGGHTMLPIRWMPPESIMYRKFTTESDVWSL
     680       690       700       710       720       730         

      680       690       700       710       720       730        
pF1KE3 GVVLWEVFSYGLQPYCGYSNQDVVEMIRNRQVLPCPDDCPAWVYALMIECWNEFPSRRPR
       ::::::.:.:: ::.   ::..:.: : . .::  :  ::  :: ::. ::.. :  :  
CCDS35 GVVLWEIFTYGKQPWYQLSNNEVIECITQGRVLQRPRTCPQEVYELMLGCWQREPHMRKN
     740       750       760       770       780       790         

      740       750       760       770       780       790        
pF1KE3 FKDIHSRLRAWGNLSNYNSSAQTSGASNTTQTSSLSTSPVSNVSNARYVGPKQKAPPFPQ
       .: ::. :.                                                   
CCDS35 IKGIHTLLQNLAKASPVYLDILG                                     
     800       810       820                                       

>>CCDS6671.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9                (838 aa)
 initn: 866 init1: 585 opt: 820  Z-score: 369.5  bits: 79.5 E(32554): 2.9e-14
Smith-Waterman score: 877; 29.5% identity (54.1% similar) in 749 aa overlap (11-747:149-824)

                                   10         20        30         
pF1KE3                     MARGSALPRRPLLC-IPAVWAAAALLLSVSRTSGEVEVLD
                                     :. :    .:  .    . :  . ..  :.
CCDS66 HINFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKTLQEAKSSPDTQDLYCLN
      120       130       140       150       160       170        

      40           50        60        70        80        90      
pF1KE3 P---NDPLGPLDGQDGPIPTLKGYFLNFLEPVNNITIVQGQTAILHCKVAGNPPPNVRWL
           : ::. :.  .  .:.      :.  :  :.:. .:..  : :.:::.: ::. : 
CCDS66 ESSKNIPLANLQIPNCGLPS-----ANLAAP--NLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYW-
      180       190            200         210       220       230 

        100       110       120       130        140       150     
pF1KE3 KNDAPVVQEPRRIIIRKTEYGSRLRIQDLDTTDTG-YYQCVATNGMKTITATGVLFVRLG
         :.  .   .     .:. :: ::: .... :.:   .::: : .     .  : :...
CCDS66 --DVGNLVSKHMNETSHTQ-GS-LRITNISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFA
                240         250       260       270       280      

         160       170       180       190         200       210   
pF1KE3 PTHSPNHNFQDDYHEDGFCQPYRGIACARFIGNRTIYVDSLQ--MQGEIENRITAAFTMI
       :: .  ..  .:.:   .: :.         ::      .::  ..: : :.     : :
CCDS66 PTITFLESPTSDHH---WCIPF------TVKGNPK---PALQWFYNGAILNESKYICTKI
        290       300                310          320       330    

           220        230       240       250       260       270  
pF1KE3 GTSTHLSDQ-CSQFAIPSFCHFVFPLCDARSRAPKPRELCRDECEVLESDLCRQEYTIAR
        ...:   . : :.  :.  :    . ..        :  .:: ..  . .         
CCDS66 HVTNHTEYHGCLQLDNPT--H----MNNGDYTLIAKNEYGKDEKQI-SAHFMGWPGIDDG
          340       350             360       370        380       

             280       290       300       310       320       330 
pF1KE3 SNP-LILMRLQLPKCEALPMPESPDAANCMRIGIPAERLGRYHQCYNGSGMDYRGTASTT
       .::    .  .     :  . .. . .: .     ... :: :     : .     ::..
CCDS66 ANPNYPDVIYEDYGTAANDIGDTTNRSNEIPSTDVTDKTGREHL----SVYAVVVIASVV
       390       400       410       420       430           440   

             340       350       360       370       380           
pF1KE3 KSGHQCQPWALQHPHSHHLSSTDFPELGGGHAYCRNPGGQMEGPWCFTQNKNVR---MEL
             . . :.  .  ...  ::  .: :..  :    :  ::    .: .     .. 
CCDS66 GFCLLVMLFLLKLARHSKFGMKDFSWFGFGKVKSR----QGVGPASVISNDDDSASPLHH
           450       460       470           480       490         

      390       400       410       420       430       440        
pF1KE3 CDVPSCSPRDSSKMGILYILVPSIAIPLVIACLFFLVCMCRNKQKASASTPQRRQLMASP
        .  : .: .::. :   ...    ::..           .: :  . .. : .     :
CCDS66 ISNGSNTP-SSSEGGPDAVIIGMTKIPVI-----------ENPQYFGITNSQLK-----P
     500        510       520                  530       540       

      450       460       470       480       490       500        
pF1KE3 SQDMEMPLINQHKQAKLKEISLSAVRFMEELGEDRFGKVYKGHLFGPAPGEQTQAVAIKT
         :  .  :..:.           . . .::::  ::::. .. ..  : ..   ::.::
CCDS66 --DTFVQHIKRHN-----------IVLKRELGEGAFGKVFLAECYNLCPEQDKILVAVKT
              550                  560       570       580         

      510       520       530       540       550       560        
pF1KE3 LKDKAEGPLREEFRHEAMLRARLQHPNVVCLLGVVTKDQPLSMIFSYCSHGDLHEFLVMR
       ::: ...  :..:..:: : . ::: ..: . :: .. .:: :.: : .::::..::  .
CCDS66 LKDASDNA-RKDFHREAELLTNLQHEHIVKFYGVCVEGDPLIMVFEYMKHGDLNKFLRAH
     590        600       610       620       630       640        

      570       580       590       600       610       620        
pF1KE3 SPHSDVGSTDDDRTVKSALEPPDFVHLVAQIAAGMEYLSSHHVVHKDLATRNVLVYDKLN
       .: . . .  .  :    :   ...:.. :::::: ::.:.: ::.:::::: :: ..: 
CCDS66 GPDAVLMAEGNPPT---ELTQSQMLHIAQQIAAGMVYLASQHFVHRDLATRNCLVGENLL
      650       660          670       680       690       700     

      630       640       650       660       670       680        
pF1KE3 VKISDLGLFREVYAADYYKLLGNSLLPIRWMAPEAIMYGKFSIDSDIWSYGVVLWEVFSY
       :::.:.:. :.::..:::.. :...:::::: ::.::: ::. .::.:: ::::::.:.:
CCDS66 VKIGDFGMSRDVYSTDYYRVGGHTMLPIRWMPPESIMYRKFTTESDVWSLGVVLWEIFTY
         710       720       730       740       750       760     

      690       700       710       720       730       740        
pF1KE3 GLQPYCGYSNQDVVEMIRNRQVLPCPDDCPAWVYALMIECWNEFPSRRPRFKDIHSRLRA
       : ::.   ::..:.: : . .::  :  ::  :: ::. ::.. :  :  .: ::. :. 
CCDS66 GKQPWYQLSNNEVIECITQGRVLQRPRTCPQEVYELMLGCWQREPHMRKNIKGIHTLLQN
         770       780       790       800       810       820     

      750       760       770       780       790       800        
pF1KE3 WGNLSNYNSSAQTSGASNTTQTSSLSTSPVSNVSNARYVGPKQKAPPFPQPQFIPMKGQI
                                                                   
CCDS66 LAKASPVYLDILG                                               
         830                                                       

>>CCDS30890.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1               (760 aa)
 initn: 706 init1: 562 opt: 795  Z-score: 359.7  bits: 77.6 E(32554): 1e-13
Smith-Waterman score: 807; 31.6% identity (60.5% similar) in 529 aa overlap (264-748:235-747)

           240       250       260       270       280       290   
pF1KE3 FVFPLCDARSRAPKPRELCRDECEVLESDLCRQEYTIARSNPLILMRLQLPKCEALPMPE
                                     :  :  ..:..  . . ...:   .. .  
CCDS30 SATVMKSGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVSVQVNVSFPA--SVQLHT
          210       220       230       240       250         260  

            300       310       320               330       340    
pF1KE3 SPDAAN-CMRIGIPAERLGRYHQCYNGSGMD--------YRGTASTTKSGHQCQPWALQH
       . .  . :. ... ..     .  .::: ..        .   :..    : :    :..
CCDS30 AVEMHHWCIPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAANETVRHGCL--RLNQ
            270       280       290       300       310         320

          350       360          370       380       390           
pF1KE3 PHSHHLSSTDFPELGG---GHAYCRNPGGQMEGPWCFTQNKNVRMELCDVPSCSP---RD
       :   :... ..  :..   :.:     .. :..:. :  : .  .   .  : .:   .:
CCDS30 P--THVNNGNYTLLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEF--NPEDPIPDTNSTSGDPVEKKD
                330       340       350         360       370      

      400       410        420              430          440       
pF1KE3 SSKMGILYILVPSIAIPL-VIACLFF----LV---CMCRNK---QKASASTPQRRQLMA-
        . .:.      :.:. : :.::::.    ::   :  :::   .. .. .:.    :. 
CCDS30 ETPFGV------SVAVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRPAVLAPEDGLAMSL
        380             390       400       410       420       430

                  450          460           470       480         
pF1KE3 ----------SPSQDMEMPL---INQHKQ----AKLKEISLSAVRFMEELGEDRFGKVYK
                 ::..     :   : .. :    : ...:.   . .  ::::  ::::. 
CCDS30 HFMTLGGSSLSPTEGKGSGLQGHIIENPQYFSDACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFL
              440       450       460       470       480       490

     490       500       510       520       530       540         
pF1KE3 GHLFGPAPGEQTQAVAIKTLKDKAEGPLREEFRHEAMLRARLQHPNVVCLLGVVTKDQPL
       ..  .  : .. . ::.:.::. .:.  :..:..:: : . ::: ..: ..:: :. .::
CCDS30 AECHNLLPEQDKMLVAVKALKEASESA-RQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPL
              500       510        520       530       540         

     550       560       570       580       590       600         
pF1KE3 SMIFSYCSHGDLHEFLVMRSPHSDVGSTDDDRTVKSALEPPDFVHLVAQIAAGMEYLSSH
        :.: :  ::::..::  ..: . . .  .: .. . :   ... ...:.:::: ::.. 
CCDS30 LMVFEYMRHGDLNRFLRSHGPDAKLLAGGED-VAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGL
     550       560       570       580        590       600        

     610       620       630       640       650       660         
pF1KE3 HVVHKDLATRNVLVYDKLNVKISDLGLFREVYAADYYKLLGNSLLPIRWMAPEAIMYGKF
       : ::.:::::: :: . : :::.:.:. :..:..:::.. : ..:::::: ::.:.: ::
CCDS30 HFVHRDLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKF
      610       620       630       640       650       660        

     670       680       690       700       710       720         
pF1KE3 SIDSDIWSYGVVLWEVFSYGLQPYCGYSNQDVVEMIRNRQVLPCPDDCPAWVYALMIECW
       . .::.::.::::::.:.:: ::.   :: .... : . . :  :  ::  :::.:  ::
CCDS30 TTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCW
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CCDS30 QREPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLDVLG                            
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