Result of FASTA (ccds) for pF1KE5724
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE5724, 774 aa
  1>>>pF1KE5724     774 - 774 aa - 774 aa
Library: human.CCDS.faa
  18921897 residues in 33420 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0128+/-0.00102; mu= 1.2589+/- 0.062
 mean_var=281.7722+/-57.113, 0's: 0 Z-trim(114.2): 35  B-trim: 159 in 1/53
 Lambda= 0.076406
 statistics sampled from 14960 (14990) to 14960 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.746), E-opt: 0.2 (0.449), width:  16
 Scan time:  2.010

The best scores are:                                      opt bits E(33420)
CCDS1108.1 HCN3 gene_id:57657|Hs109|chr1           ( 774) 5227 589.9 5.4e-168
CCDS10248.1 HCN4 gene_id:10021|Hs109|chr15         (1203) 3180 364.4 6.4e-100
CCDS12035.1 HCN2 gene_id:610|Hs109|chr19           ( 889) 3083 353.6 8.3e-97
CCDS3952.1 HCN1 gene_id:348980|Hs109|chr5          ( 890) 2947 338.6 2.7e-92
CCDS42719.1 CNGA3 gene_id:1261|Hs109|chr2          ( 676)  550 74.3 7.6e-13
CCDS2034.1 CNGA3 gene_id:1261|Hs109|chr2           ( 694)  550 74.3 7.8e-13
CCDS9756.1 KCNH5 gene_id:27133|Hs109|chr14         ( 988)  548 74.2 1.2e-12
CCDS11638.1 KCNH6 gene_id:81033|Hs109|chr17        ( 994)  548 74.2 1.2e-12
CCDS31015.1 KCNH1 gene_id:3756|Hs109|chr1          ( 962)  547 74.1 1.3e-12
CCDS62290.1 KCNH6 gene_id:81033|Hs109|chr17        ( 958)  534 72.6 3.4e-12
CCDS43226.1 CNGA1 gene_id:1259|Hs109|chr4          ( 690)  519 70.9 8.3e-12
CCDS47050.1 CNGA1 gene_id:1259|Hs109|chr4          ( 759)  519 70.9 8.9e-12
CCDS2632.1 KCNH8 gene_id:131096|Hs109|chr3         (1107)  510 70.0 2.4e-11
CCDS14701.1 CNGA2 gene_id:1260|Hs109|chrX          ( 664)  493 68.0 5.8e-11
CCDS45122.1 KCNH5 gene_id:27133|Hs109|chr14        ( 611)  492 67.9 5.9e-11
CCDS5911.1 KCNH2 gene_id:3757|Hs109|chr7           ( 819)  489 67.6 9.3e-11


>>CCDS1108.1 HCN3 gene_id:57657|Hs109|chr1                (774 aa)
 initn: 5227 init1: 5227 opt: 5227  Z-score: 3129.7  bits: 589.9 E(33420): 5.4e-168
Smith-Waterman score: 5227; 100.0% identity (100.0% similar) in 774 aa overlap (1-774:1-774)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MEAEQRPAAGASEGATPGLEAVPPVAPPPATAASGPIPKSGPEPKRRHLGTLLQPTVNKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MEAEQRPAAGASEGATPGLEAVPPVAPPPATAASGPIPKSGPEPKRRHLGTLLQPTVNKF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 SLRVFGSHKAVEIEQERVKSAGAWIIHPYSDFRFYWDLIMLLLMVGNLIVLPVGITFFKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SLRVFGSHKAVEIEQERVKSAGAWIIHPYSDFRFYWDLIMLLLMVGNLIVLPVGITFFKE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 ENSPPWIVFNVLSDTFFLLDLVLNFRTGIVVEEGAEILLAPRAIRTRYLRTWFLVDLISS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ENSPPWIVFNVLSDTFFLLDLVLNFRTGIVVEEGAEILLAPRAIRTRYLRTWFLVDLISS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 IPVDYIFLVVELEPRLDAEVYKTARALRIVRFTKILSLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IPVDYIFLVVELEPRLDAEVYKTARALRIVRFTKILSLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHM
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 TYDLASAVVRIFNLIGMMLLLCHWDGCLQFLVPMLQDFPPDCWVSINHMVNHSWGRQYSH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TYDLASAVVRIFNLIGMMLLLCHWDGCLQFLVPMLQDFPPDCWVSINHMVNHSWGRQYSH
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE5 ALFKAMSHMLCIGYGQQAPVGMPDVWLTMLSMIVGATCYAMFIGHATALIQSLDSSRRQY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ALFKAMSHMLCIGYGQQAPVGMPDVWLTMLSMIVGATCYAMFIGHATALIQSLDSSRRQY
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE5 QEKYKQVEQYMSFHKLPADTRQRIHEYYEHRYQGKMFDEESILGELSEPLREEIINFTCR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QEKYKQVEQYMSFHKLPADTRQRIHEYYEHRYQGKMFDEESILGELSEPLREEIINFTCR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE5 GLVAHMPLFAHADPSFVTAVLTKLRFEVFQPGDLVVREGSVGRKMYFIQHGLLSVLARGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GLVAHMPLFAHADPSFVTAVLTKLRFEVFQPGDLVVREGSVGRKMYFIQHGLLSVLARGA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE5 RDTRLTDGSYFGEICLLTRGRRTASVRADTYCRLYSLSVDHFNAVLEEFPMMRRAFETVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RDTRLTDGSYFGEICLLTRGRRTASVRADTYCRLYSLSVDHFNAVLEEFPMMRRAFETVA
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE5 MDRLLRIGKKNSILQRKRSEPSPGSSGGIMEQHLVQHDRDMARGVRGRAPSTGAQLSGKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MDRLLRIGKKNSILQRKRSEPSPGSSGGIMEQHLVQHDRDMARGVRGRAPSTGAQLSGKP
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE5 VLWEPLVHAPLQAAAVTSNVAIALTHQRGPLPLSPDSPATLLARSAWRSAGSPASPLVPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VLWEPLVHAPLQAAAVTSNVAIALTHQRGPLPLSPDSPATLLARSAWRSAGSPASPLVPV
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE5 RAGPWASTSRLPAPPARTLHASLSRAGRSQVSLLGPPPGGGGRRLGPRGRPLSASQPSLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RAGPWASTSRLPAPPARTLHASLSRAGRSQVSLLGPPPGGGGRRLGPRGRPLSASQPSLP
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770    
pF1KE5 QRATGDGSPGRKGSGSERLPPSGLLAKPPRTAQPPRPPVPEPATPRGLQLSANM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QRATGDGSPGRKGSGSERLPPSGLLAKPPRTAQPPRPPVPEPATPRGLQLSANM
              730       740       750       760       770    

>>CCDS10248.1 HCN4 gene_id:10021|Hs109|chr15              (1203 aa)
 initn: 2485 init1: 2227 opt: 3180  Z-score: 1907.6  bits: 364.4 E(33420): 6.4e-100
Smith-Waterman score: 3254; 64.9% identity (79.4% similar) in 812 aa overlap (1-758:148-946)

                                              10        20         
pF1KE5                               MEAE-QRPAAGASEGATPGLEAVPPVAPPP
                                     . :: .::.:.:. .:.:     ::  :: 
CCDS10 SHGHLHDSAEERRLIAEGDASPGEDRTPPGLAAEPERPGASAQPAASPP----PPQQPPQ
       120       130       140       150       160           170   

      30                40                         50        60    
pF1KE5 ATAASGPIP--------KSG--------PEPK---------RRHLGTLLQPTVNKFSLRV
        ..::   :        ..:        :: .         .:..:..::: :::::::.
CCDS10 PASASCEQPSVDTAIKVEGGAAAGDQILPEAEVRLGQAGFMQRQFGAMLQPGVNKFSLRM
           180       190       200       210       220       230   

           70        80        90       100       110       120    
pF1KE5 FGSHKAVEIEQERVKSAGAWIIHPYSDFRFYWDLIMLLLMVGNLIVLPVGITFFKEENSP
       :::.:::: ::::::::: ::::::::::::::: ::::::::::..::::::::.::. 
CCDS10 FGSQKAVEREQERVKSAGFWIIHPYSDFRFYWDLTMLLLMVGNLIIIPVGITFFKDENTT
           240       250       260       270       280       290   

          130       140       150       160       170       180    
pF1KE5 PWIVFNVLSDTFFLLDLVLNFRTGIVVEEGAEILLAPRAIRTRYLRTWFLVDLISSIPVD
       :::::::.::::::.:::::::::::::...::.: :. :. .::..::.::.:::::::
CCDS10 PWIVFNVVSDTFFLIDLVLNFRTGIVVEDNTEIILDPQRIKMKYLKSWFMVDFISSIPVD
           300       310       320       330       340       350   

          190       200       210       220       230       240    
pF1KE5 YIFLVVELEPRLDAEVYKTARALRIVRFTKILSLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTYDL
       ::::.::   :.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YIFLIVET--RIDSEVYKTARALRIVRFTKILSLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTYDL
           360         370       380       390       400       410 

          250       260       270       280       290       300    
pF1KE5 ASAVVRIFNLIGMMLLLCHWDGCLQFLVPMLQDFPPDCWVSINHMVNHSWGRQYSHALFK
       ::::::: ::::::::::::::::::::::::::: :::::::.:::.:::.:::.::::
CCDS10 ASAVVRIVNLIGMMLLLCHWDGCLQFLVPMLQDFPDDCWVSINNMVNNSWGKQYSYALFK
             420       430       440       450       460       470 

          310       320       330       340       350       360    
pF1KE5 AMSHMLCIGYGQQAPVGMPDVWLTMLSMIVGATCYAMFIGHATALIQSLDSSRRQYQEKY
       :::::::::::.:::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AMSHMLCIGYGRQAPVGMSDVWLTMLSMIVGATCYAMFIGHATALIQSLDSSRRQYQEKY
             480       490       500       510       520       530 

          370       380       390       400       410       420    
pF1KE5 KQVEQYMSFHKLPADTRQRIHEYYEHRYQGKMFDEESILGELSEPLREEIINFTCRGLVA
       ::::::::::::: :::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:: :::
CCDS10 KQVEQYMSFHKLPPDTRQRIHDYYEHRYQGKMFDEESILGELSEPLREEIINFNCRKLVA
             540       550       560       570       580       590 

          430       440       450       460       470       480    
pF1KE5 HMPLFAHADPSFVTAVLTKLRFEVFQPGDLVVREGSVGRKMYFIQHGLLSVLARGARDTR
        :::::.:::.:::..::::::::::::: ..:::..:.::::::::..:::..: ..:.
CCDS10 SMPLFANADPNFVTSMLTKLRFEVFQPGDYIIREGTIGKKMYFIQHGVVSVLTKGNKETK
             600       610       620       630       640       650 

          490       500       510       520       530       540    
pF1KE5 LTDGSYFGEICLLTRGRRTASVRADTYCRLYSLSVDHFNAVLEEFPMMRRAFETVAMDRL
       :.::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: ::::.:::::::::::.:::
CCDS10 LADGSYFGEICLLTRGRRTASVRADTYCRLYSLSVDNFNEVLEEYPMMRRAFETVALDRL
             660       670       680       690       700       710 

          550       560       570           580       590       600
pF1KE5 LRIGKKNSILQRKRSEPSPGSSGGIME----QHLVQHDRDMARGVRGRAPSTGAQLSGKP
        ::::::::: .: ..   ..  . .:    :..:::::.::. ..    ...:  .  :
CCDS10 DRIGKKNSILLHKVQHDLNSGVFNYQENEIIQQIVQHDREMAHCAHRVQAAASATPTPTP
             720       730       740       750       760       770 

              610       620        630       640       650         
pF1KE5 VLWEPLVHAPLQAAAVTSNVAIALTHQ-RGPLPLSPDSPATLLARSAWRSAGSPASP---
       :.: ::..:::::::.:..:::::::. : :  .    :.. :.     . :.  .:   
CCDS10 VIWTPLIQAPLQAAAATTSVAIALTHHPRLPAAIFRPPPGSGLG-----NLGAGQTPRHL
             780       790       800       810            820      

             660          670       680       690         700      
pF1KE5 -----LVPVRAG---PWASTSRLPAPPARTLHASLSRAGRSQVSLLGP--PPGGGGRRLG
            :.:   :   : .: :.. .: . ..: . . :: :  . :.:  : ....   :
CCDS10 KRLQSLIPSALGSASPASSPSQVDTPSSSSFHIQ-QLAGFSAPAGLSPLLPSSSSSPPPG
        830       840       850       860        870       880     

        710       720          730       740             750       
pF1KE5 PRGRPLSASQPSLPQRAT---GDGSPGRKGSGSERLPPSGLL------AKPPRTAQP-PR
         : : ::  ::    ::   : :   .  .::     : ::      :. :..::: : 
CCDS10 ACGSP-SAPTPSAGVAATTIAGFGHFHKALGGSLSSSDSPLLTPLQPGARSPQAAQPSPA
         890        900       910       920       930       940    

        760       770                                              
pF1KE5 PPVPEPATPRGLQLSANM                                          
       ::                                                          
CCDS10 PPGARGGLGLPEHFLPPPPSSRSPSSSPGQLGQPPGELSLGLATGPLSTPETPPRQPEPP
          950       960       970       980       990      1000    

>>CCDS12035.1 HCN2 gene_id:610|Hs109|chr19                (889 aa)
 initn: 2322 init1: 2127 opt: 3083  Z-score: 1851.6  bits: 353.6 E(33420): 8.3e-97
Smith-Waterman score: 3098; 64.6% identity (80.0% similar) in 771 aa overlap (10-765:129-869)

                                    10        20        30         
pF1KE5                      MEAEQRPAAGASEGATPGLEAVPPVAPPPATAASGPI--
                                     ::. : .::    :  :   ..  .::   
CCDS12 NGECGRGEPQCSPAGPEGPARGPKVSFSCRGAASGPAPG----PGPAEEAGSEEAGPAGE
      100       110       120       130           140       150    

        40         50        60        70        80        90      
pF1KE5 PKSGPEP-KRRHLGTLLQPTVNKFSLRVFGSHKAVEIEQERVKSAGAWIIHPYSDFRFYW
       :...     .:..:.:::: :::::::.:::.:::: :::::::::::::::::::::::
CCDS12 PRGSQASFMQRQFGALLQPGVNKFSLRMFGSQKAVEREQERVKSAGAWIIHPYSDFRFYW
          160       170       180       190       200       210    

        100       110       120       130       140       150      
pF1KE5 DLIMLLLMVGNLIVLPVGITFFKEENSPPWIVFNVLSDTFFLLDLVLNFRTGIVVEEGAE
       :. :::.::::::..::::::::.:.. :::::::.::::::.:::::::::::.:...:
CCDS12 DFTMLLFMVGNLIIIPVGITFFKDETTAPWIVFNVVSDTFFLMDLVLNFRTGIVIEDNTE
          220       230       240       250       260       270    

        160       170       180       190       200       210      
pF1KE5 ILLAPRAIRTRYLRTWFLVDLISSIPVDYIFLVVELEPRLDAEVYKTARALRIVRFTKIL
       :.: :. :. .::::::.::..::::::::::.:  :  .:.::::::::::::::::::
CCDS12 IILDPEKIKKKYLRTWFVVDFVSSIPVDYIFLIV--EKGIDSEVYKTARALRIVRFTKIL
          280       290       300         310       320       330  

        220       230       240       250       260       270      
pF1KE5 SLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTYDLASAVVRIFNLIGMMLLLCHWDGCLQFLVPMLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::.:: :::.::::::::::::::::::::
CCDS12 SLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTYDLASAVMRICNLISMMLLLCHWDGCLQFLVPMLQ
            340       350       360       370       380       390  

        280       290       300       310       320       330      
pF1KE5 DFPPDCWVSINHMVNHSWGRQYSHALFKAMSHMLCIGYGQQAPVGMPDVWLTMLSMIVGA
       ::: .:::::: ::::::.. :: :::::::::::::::.::: .: :.:::::::::::
CCDS12 DFPRNCWVSINGMVNHSWSELYSFALFKAMSHMLCIGYGRQAPESMTDIWLTMLSMIVGA
            400       410       420       430       440       450  

        340       350       360       370       380       390      
pF1KE5 TCYAMFIGHATALIQSLDSSRRQYQEKYKQVEQYMSFHKLPADTRQRIHEYYEHRYQGKM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::.::.::::::::::
CCDS12 TCYAMFIGHATALIQSLDSSRRQYQEKYKQVEQYMSFHKLPADFRQKIHDYYEHRYQGKM
            460       470       480       490       500       510  

        400       410       420       430       440       450      
pF1KE5 FDEESILGELSEPLREEIINFTCRGLVAHMPLFAHADPSFVTAVLTKLRFEVFQPGDLVV
       :::.::::::. ::::::.::.:: ::: :::::.:::.::::.::::.:::::::: ..
CCDS12 FDEDSILGELNGPLREEIVNFNCRKLVASMPLFANADPNFVTAMLTKLKFEVFQPGDYII
            520       530       540       550       560       570  

        460       470       480       490       500       510      
pF1KE5 REGSVGRKMYFIQHGLLSVLARGARDTRLTDGSYFGEICLLTRGRRTASVRADTYCRLYS
       :::..:.::::::::..:::..: .. .:.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 REGTIGKKMYFIQHGVVSVLTKGNKEMKLSDGSYFGEICLLTRGRRTASVRADTYCRLYS
            580       590       600       610       620       630  

        520       530       540       550        560          570  
pF1KE5 LSVDHFNAVLEEFPMMRRAFETVAMDRLLRIGKKNSILQRK-RSEPSPG---SSGGIMEQ
       ::::.:: ::::.:::::::::::.::: ::::::::: .: . . . :   .. . . :
CCDS12 LSVDNFNEVLEEYPMMRRAFETVAIDRLDRIGKKNSILLHKVQHDLNSGVFNNQENAIIQ
            640       650       660       670       680       690  

            580       590       600       610          620         
pF1KE5 HLVQHDRDMARGVRGRAPSTGAQLSGKPVLWEPLVHAPLQAAAVTS---NVAIALTHQRG
       ..:..::.:..          :.:. .  :. :    :  ..:...    .:...  : .
CCDS12 EIVKYDREMVQQ---------AELGQRVGLFPPPPPPPQVTSAIATLQQAAAMSFCPQVA
            700                710       720       730       740   

      630         640       650       660       670       680      
pF1KE5 -PL--PLSPDSPATLLARSAWRSAGSPASPLVPVRAGPWASTSRLPAPPARTLHASLSRA
        ::  ::.  ::  :. :     : . :::  :    : ::    :: : :. ..:   .
CCDS12 RPLVGPLALGSP-RLVRRPPPGPAPAAASPGPP----PPASPPGAPASP-RAPRTS-PYG
           750        760       770           780        790       

        690        700       710       720       730        740    
pF1KE5 GRSQVSLLGPP-PGGGGRRLGPRGRPLSASQPSLPQRATGDGSPGRKGSGSE-RLPPSGL
       :   . : ::  :.   :::.  .:::::::::::. : : ..  : .:.:  :: :.  
CCDS12 GLPAAPLAGPALPA---RRLSRASRPLSASQPSLPHGAPGPAASTRPASSSTPRLGPT--
        800       810          820       830       840       850   

          750       760       770               
pF1KE5 LAKPPRTAQPPRPPVPEPATPRGLQLSANM           
          :   :  : :   . :.:                    
CCDS12 ---PAARAAAPSPDRRDSASPGAAGGLDPQDSARSRLSSNL
                860       870       880         

>>CCDS3952.1 HCN1 gene_id:348980|Hs109|chr5               (890 aa)
 initn: 2281 init1: 2151 opt: 2947  Z-score: 1770.6  bits: 338.6 E(33420): 2.7e-92
Smith-Waterman score: 2967; 61.5% identity (79.1% similar) in 769 aa overlap (33-764:84-840)

             10        20        30        40        50        60  
pF1KE5 AEQRPAAGASEGATPGLEAVPPVAPPPATAASGPIPKSGPEPKRRHLGTLLQPTVNKFSL
                                     : ::  . :    .:.. ..::: ::::::
CCDS39 GNSVCFKVDGGGGGGGGGGGGEEPAGGFEDAEGPRRQYGFM--QRQFTSMLQPGVNKFSL
            60        70        80        90         100       110 

             70        80        90       100       110       120  
pF1KE5 RVFGSHKAVEIEQERVKSAGAWIIHPYSDFRFYWDLIMLLLMVGNLIVLPVGITFFKEEN
       :.:::.:::: ::::::.:: ::::::::::::::::::..:::::...::::::: :..
CCDS39 RMFGSQKAVEKEQERVKTAGFWIIHPYSDFRFYWDLIMLIMMVGNLVIIPVGITFFTEQT
             120       130       140       150       160       170 

            130       140       150       160       170       180  
pF1KE5 SPPWIVFNVLSDTFFLLDLVLNFRTGIVVEEGAEILLAPRAIRTRYLRTWFLVDLISSIP
       . :::.::: ::: :::::..::::: : :...::.: :..:.  ::..::.::.:::::
CCDS39 TTPWIIFNVASDTVFLLDLIMNFRTGTVNEDSSEIILDPKVIKMNYLKSWFVVDFISSIP
             180       190       200       210       220       230 

            190       200       210       220       230       240  
pF1KE5 VDYIFLVVELEPRLDAEVYKTARALRIVRFTKILSLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTY
       ::::::.:  :  .:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 VDYIFLIV--EKGMDSEVYKTARALRIVRFTKILSLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTY
               240       250       260       270       280         

            250       260       270       280       290       300  
pF1KE5 DLASAVVRIFNLIGMMLLLCHWDGCLQFLVPMLQDFPPDCWVSINHMVNHSWGRQYSHAL
       :::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::.:.::: :::.:::.::
CCDS39 DLASAVVRIFNLIGMMLLLCHWDGCLQFLVPLLQDFPPDCWVSLNEMVNDSWGKQYSYAL
     290       300       310       320       330       340         

            310       320       330       340       350       360  
pF1KE5 FKAMSHMLCIGYGQQAPVGMPDVWLTMLSMIVGATCYAMFIGHATALIQSLDSSRRQYQE
       ::::::::::::: ::::.: :.:.:::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS39 FKAMSHMLCIGYGAQAPVSMSDLWITMLSMIVGATCYAMFVGHATALIQSLDSSRRQYQE
     350       360       370       380       390       400         

            370       380       390       400       410       420  
pF1KE5 KYKQVEQYMSFHKLPADTRQRIHEYYEHRYQGKMFDEESILGELSEPLREEIINFTCRGL
       ::::::::::::::::: ::.::.:::::::::.::::.::.::..::::::.::.:: :
CCDS39 KYKQVEQYMSFHKLPADMRQKIHDYYEHRYQGKIFDEENILNELNDPLREEIVNFNCRKL
     410       420       430       440       450       460         

            430       440       450       460       470       480  
pF1KE5 VAHMPLFAHADPSFVTAVLTKLRFEVFQPGDLVVREGSVGRKMYFIQHGLLSVLARGARD
       :: :::::.:::.::::.:.::::::::::: ..:::.::.::::::::. .:.......
CCDS39 VATMPLFANADPNFVTAMLSKLRFEVFQPGDYIIREGAVGKKMYFIQHGVAGVITKSSKE
     470       480       490       500       510       520         

            490       500       510       520       530       540  
pF1KE5 TRLTDGSYFGEICLLTRGRRTASVRADTYCRLYSLSVDHFNAVLEEFPMMRRAFETVAMD
        .::::::::::::::.:::::::::::::::::::::.:: ::::.:::::::::::.:
CCDS39 MKLTDGSYFGEICLLTKGRRTASVRADTYCRLYSLSVDNFNEVLEEYPMMRRAFETVAID
     530       540       550       560       570       580         

            550        560           570       580       590       
pF1KE5 RLLRIGKKNSIL-QRKRSEPSPG----SSGGIMEQHLVQHDRDMARGVRGRAPSTGAQ--
       :: ::::::::: :. ... . :    . . :..: .:.:::.:....   :: .  :  
CCDS39 RLDRIGKKNSILLQKFQKDLNTGVFNNQENEILKQ-IVKHDREMVQAI---APINYPQMT
     590       600       610       620        630          640     

          600       610       620       630        640       650   
pF1KE5 -LSGKPVLWEPLVHAPLQAAAVTSNVAIALTHQRGPLPLSPD-SPATLLARSAWRSA-GS
        :..      :  .   :.  : . .... .. ..: : .   .:...:.  .. .:  :
CCDS39 TLNSTSSTTTPTSRMRTQSPPVYTATSLSHSNLHSPSPSTQTPQPSAILSPCSYTTAVCS
         650       660       670       680       690       700     

              660           670       680       690       700      
pF1KE5 PA--SPLVPVR---AGPWAST-SRLPAPPARTLHASLSRAGRSQVSLLGPPPGGGGRRLG
       :   :::.      :.: ::  : .   : . ..   :.  ..: .  .: :   :    
CCDS39 PPVQSPLAARTFHYASPTASQLSLMQQQPQQQVQQ--SQPPQTQPQQPSPQPQTPGSST-
         710       720       730       740         750       760   

                          710       720       730       740        
pF1KE5 PRG------------------RPLSASQPSLPQRATGDGSPGRKGSGSERLP--PSGLLA
       :..                  :::::::::::....   :  .   : : :   :. . :
CCDS39 PKNEVHKSTQALHNTNLTREVRPLSASQPSLPHEVSTLISRPHPTVG-ESLASIPQPVTA
            770       780       790       800        810       820 

        750        760       770                                   
pF1KE5 KPPRTAQPP-RPPVPEPATPRGLQLSANM                               
        :    :   :  ::. .:                                         
CCDS39 VPGTGLQAGGRSTVPQRVTLFRQMSSGAIPPNRGVPPAPPPPAAALPRESSSVLNTDPDA
             830       840       850       860       870       880 

>>CCDS42719.1 CNGA3 gene_id:1261|Hs109|chr2               (676 aa)
 initn: 469 init1: 159 opt: 550  Z-score: 344.3  bits: 74.3 E(33420): 7.6e-13
Smith-Waterman score: 655; 26.3% identity (57.8% similar) in 581 aa overlap (38-602:95-644)

        10        20        30        40        50        60       
pF1KE5 AAGASEGATPGLEAVPPVAPPPATAASGPIPKSGPEPKRRHLGTLLQPTVNKFS--LRVF
                                     : : :.   :  :. :. . .. :      
CCDS42 FTGQGIARLSRLIFLLRRWAARHVHHQDQGPDSFPD---RFRGAELKEVSSQESNAQANV
           70        80        90       100          110       120 

          70         80        90       100       110         120  
pF1KE5 GSHKAVEI-EQERVKSAGAWIIHPYSDFRFYWDLIMLLLMVGNLIVLPVGITF--FKEEN
       ::.. ..  .....:.  : .. : :.. . :   . : .  :  .:     :  .. : 
CCDS42 GSQEPADRGRRKKTKKKDAIVVDPSSNLYYRWLTAIALPVFYNWYLLICRACFDELQSEY
             130       140       150       160       170       180 

            130       140       150       160       170       180  
pF1KE5 SPPWIVFNVLSDTFFLLDLVLNFRTGIVVEEGAEILLAPRAIRTRYLRTWFLVDLISSIP
          :.:..  .:....::...  :::.. :.:  .  . :  .     : : .:..: .:
CCDS42 LMLWLVLDYSADVLYVLDVLVRARTGFL-EQGLMVSDTNRLWQHYKTTTQFKLDVLSLVP
             190       200        210       220       230       240

            190       200       210       220       230       240  
pF1KE5 VDYIFLVVELEPRLDAEVYKTARALRIVRFTKILSLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTY
       .:  .:             :..     :::.      :::..:::.... . :     : 
CCDS42 TDLAYL-------------KVGTNYPEVRFN------RLLKFSRLFEFFDRTE-----TR
                           250             260       270           

            250       260       270       280       290         300
pF1KE5 DLASAVVRIFNLIGMMLLLCHWDGCLQFLVPMLQDFPPDCWVSINHMV-NHS-WGRQYSH
            . :: ::. ..:.. ::..:. : .  .  :  : ::  :  . .:.  .:.: .
CCDS42 TNYPNMFRIGNLVLYILIIIHWNACIYFAISKFIGFGTDSWVYPNISIPEHGRLSRKYIY
        280       290       300       310       320       330      

              310       320       330       340       350       360
pF1KE5 ALFKAMSHMLCIGYGQQAPVGMPDVWLTMLSMIVGATCYAMFIGHATALIQSLDSSRRQY
       .:. .   .  ::     ::   .  .......::.  .: ..:.. ..:.....:: ..
CCDS42 SLYWSTLTLTTIGE-TPPPVKDEEYLFVVVDFLVGVLIFATIVGNVGSMISNMNASRAEF
        340       350        360       370       380       390     

              370       380       390        400       410         
pF1KE5 QEKYKQVEQYMSFHKLPADTRQRIHEYYEHRYQGK-MFDEESILGELSEPLREEIINFTC
       : :  ...:::.:.:.  : . :. ..... . .:   ::. .:  : . :. ::   . 
CCDS42 QAKIDSIKQYMQFRKVTKDLETRVIRWFDYLWANKKTVDEKEVLKSLPDKLKAEIAINVH
         400       410       420       430       440       450     

     420       430       440       450       460       470         
pF1KE5 RGLVAHMPLFAHADPSFVTAVLTKLRFEVFQPGDLVVREGSVGRKMYFIQHGLLSVLAR-
          . .. .:   . .... .. :::  ::.::: . ..:..:..::.:..: :.:.:  
CCDS42 LDTLKKVRIFQDCEAGLLVELVLKLRPTVFSPGDYICKKGDIGKEMYIINEGKLAVVADD
         460       470       480       490       500       510     

      480        490        500            510       520       530 
pF1KE5 GARD-TRLTDGSYFGEICLLT-RG-----RRTASVRADTYCRLYSLSVDHFNAVLEEFPM
       :. . . :.:::::::: .:. .:     ::::..:.  :  :. :: : .  .: :.: 
CCDS42 GVTQFVVLSDGSYFGEISILNIKGSKSGNRRTANIRSIGYSDLFCLSKDDLMEALTEYPE
         520       530       540       550       560       570     

             540       550       560       570       580       590 
pF1KE5 MRRAFETVAMDRLLRIGKKNSILQRKRSEPSPGSSGGIMEQHLVQHDRDMARGVRGRAPS
        ..:.:  . . :.. .  .  : :  ..:.       .::   . :  ..: .:  :  
CCDS42 AKKALEEKGRQILMKDNLIDEELARAGADPKDLEEK--VEQLGSSLDTLQTRFARLLAEY
         580       590       600       610         620       630   

             600       610       620       630       640       650 
pF1KE5 TGAQLSGKPVLWEPLVHAPLQAAAVTSNVAIALTHQRGPLPLSPDSPATLLARSAWRSAG
       ...:.. :  :                                                 
CCDS42 NATQMKMKQRLSQLESQVKGGGDKPLADGEVPGDATKTEDKQQ                 
           640       650       660       670                       

>>CCDS2034.1 CNGA3 gene_id:1261|Hs109|chr2                (694 aa)
 initn: 469 init1: 159 opt: 550  Z-score: 344.1  bits: 74.3 E(33420): 7.8e-13
Smith-Waterman score: 661; 26.8% identity (58.5% similar) in 542 aa overlap (74-602:149-662)

            50        60        70        80        90       100   
pF1KE5 PKRRHLGTLLQPTVNKFSLRVFGSHKAVEIEQERVKSAGAWIIHPYSDFRFYWDLIMLLL
                                     :....:.  : .. : :.. . :   . : 
CCDS20 ANVGSQEPADRGRSAWPLAKCNTNTSNNTEEEKKTKKKDAIVVDPSSNLYYRWLTAIALP
      120       130       140       150       160       170        

           110         120       130       140       150       160 
pF1KE5 MVGNLIVLPVGITF--FKEENSPPWIVFNVLSDTFFLLDLVLNFRTGIVVEEGAEILLAP
       .  :  .:     :  .. :    :.:..  .:....::...  :::.. :.:  .  . 
CCDS20 VFYNWYLLICRACFDELQSEYLMLWLVLDYSADVLYVLDVLVRARTGFL-EQGLMVSDTN
      180       190       200       210       220        230       

             170       180       190       200       210       220 
pF1KE5 RAIRTRYLRTWFLVDLISSIPVDYIFLVVELEPRLDAEVYKTARALRIVRFTKILSLLRL
       :  .     : : .:..: .:.:  .:             :..     :::.      ::
CCDS20 RLWQHYKTTTQFKLDVLSLVPTDLAYL-------------KVGTNYPEVRFN------RL
       240       250       260                    270              

             230       240       250       260       270       280 
pF1KE5 LRLSRLIRYIHQWEEIFHMTYDLASAVVRIFNLIGMMLLLCHWDGCLQFLVPMLQDFPPD
       :..:::.... . :     :      . :: ::. ..:.. ::..:. : .  .  :  :
CCDS20 LKFSRLFEFFDRTE-----TRTNYPNMFRIGNLVLYILIIIHWNACIYFAISKFIGFGTD
      280       290            300       310       320       330   

             290         300       310       320       330         
pF1KE5 CWVSINHMV-NHS-WGRQYSHALFKAMSHMLCIGYGQQAPVGMPDVWLTMLSMIVGATCY
        ::  :  . .:.  .:.: ..:. .   .  ::     ::   .  .......::.  .
CCDS20 SWVYPNISIPEHGRLSRKYIYSLYWSTLTLTTIGE-TPPPVKDEEYLFVVVDFLVGVLIF
           340       350       360        370       380       390  

     340       350       360       370       380       390         
pF1KE5 AMFIGHATALIQSLDSSRRQYQEKYKQVEQYMSFHKLPADTRQRIHEYYEHRYQGK-MFD
       : ..:.. ..:.....:: ..: :  ...:::.:.:.  : . :. ..... . .:   :
CCDS20 ATIVGNVGSMISNMNASRAEFQAKIDSIKQYMQFRKVTKDLETRVIRWFDYLWANKKTVD
            400       410       420       430       440       450  

      400       410       420       430       440       450        
pF1KE5 EESILGELSEPLREEIINFTCRGLVAHMPLFAHADPSFVTAVLTKLRFEVFQPGDLVVRE
       :. .:  : . :. ::   .    . .. .:   . .... .. :::  ::.::: . ..
CCDS20 EKEVLKSLPDKLKAEIAINVHLDTLKKVRIFQDCEAGLLVELVLKLRPTVFSPGDYICKK
            460       470       480       490       500       510  

      460       470        480        490        500            510
pF1KE5 GSVGRKMYFIQHGLLSVLAR-GARD-TRLTDGSYFGEICLLT-RG-----RRTASVRADT
       :..:..::.:..: :.:.:  :. . . :.:::::::: .:. .:     ::::..:.  
CCDS20 GDIGKEMYIINEGKLAVVADDGVTQFVVLSDGSYFGEISILNIKGSKSGNRRTANIRSIG
            520       530       540       550       560       570  

              520       530       540       550       560       570
pF1KE5 YCRLYSLSVDHFNAVLEEFPMMRRAFETVAMDRLLRIGKKNSILQRKRSEPSPGSSGGIM
       :  :. :: : .  .: :.:  ..:.:  . . :.. .  .  : :  ..:.       .
CCDS20 YSDLFCLSKDDLMEALTEYPEAKKALEEKGRQILMKDNLIDEELARAGADPKDLEEK--V
            580       590       600       610       620         630

              580       590       600       610       620       630
pF1KE5 EQHLVQHDRDMARGVRGRAPSTGAQLSGKPVLWEPLVHAPLQAAAVTSNVAIALTHQRGP
       ::   . :  ..: .:  :  ...:.. :  :                            
CCDS20 EQLGSSLDTLQTRFARLLAEYNATQMKMKQRLSQLESQVKGGGDKPLADGEVPGDATKTE
              640       650       660       670       680       690

              640       650       660       670       680       690
pF1KE5 LPLSPDSPATLLARSAWRSAGSPASPLVPVRAGPWASTSRLPAPPARTLHASLSRAGRSQ
                                                                   
CCDS20 DKQQ                                                        
                                                                   

>>CCDS9756.1 KCNH5 gene_id:27133|Hs109|chr14              (988 aa)
 initn: 416 init1: 168 opt: 548  Z-score: 340.8  bits: 74.2 E(33420): 1.2e-12
Smith-Waterman score: 577; 25.7% identity (55.2% similar) in 522 aa overlap (65-560:187-681)

           40        50        60        70        80        90    
pF1KE5 GPIPKSGPEPKRRHLGTLLQPTVNKFSLRVFGSHKAVEIEQERVKSAGAWIIHPYSDFRF
                                     .::    . .::  :.    :.: :  :. 
CCDS97 TNSRSVLQQLTPMNKTEVVHKHSRLAEVLQLGSDILPQYKQEAPKTPPHIILH-YCAFKT
        160       170       180       190       200        210     

          100       110       120       130       140       150    
pF1KE5 YWDLIMLLLMVGNLIVLPVGITFFKEENSPPWIVFNVLSDTFFLLDLVLNFRTGIVVEEG
        :: ..:.:   . :..: ...:  ..:.  :.:.. . :..::.:.::::.: .:   :
CCDS97 TWDWVILILTFYTAIMVPYNVSFKTKQNNIAWLVLDSVVDVIFLVDIVLNFHTTFV-GPG
         220       230       240       250       260       270     

          160       170       180       190       200       210    
pF1KE5 AEILLAPRAIRTRYLRTWFLVDLISSIPVDYIFLVVELEPRLDAEVYKTARALRIVRFTK
       .:..  :. ::  ::.:::..::.: .: :    ...    .:  . .   .:..::   
CCDS97 GEVISDPKLIRMNYLKTWFVIDLLSCLPYD----IINAFENVDEGISSLFSSLKVVR---
          280       290       300           310       320          

          220       230       240       250       260       270    
pF1KE5 ILSLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTYDLASAVVRIFNLIGMMLLLCHWDGCLQFLV--
             ::::.:. : . .. :     :  :  :.    :. .. :. :: .:. . .  
CCDS97 ------LLRLGRVARKLDHYLE-----YGAAVLVL----LVCVFGLVAHWLACIWYSIGD
             330       340            350           360       370  

                 280              290                300       310 
pF1KE5 -----PMLQDFPPDCWV-----SIN--HMVNHSWG---------RQYSHALFKAMSHMLC
             . . .  : :.     ::.  .  : : :           :  .:. .:. .  
CCDS97 YEVIDEVTNTIQIDSWLYQLALSIGTPYRYNTSAGIWEGGPSKDSLYVSSLYFTMTSLTT
            380       390       400       410       420       430  

             320       330       340       350       360       370 
pF1KE5 IGYGQQAPVGMPDVWLTMLSMIVGATCYAMFIGHATALIQSLDSSRRQYQEKYKQVEQYM
       ::.:. ::.   .  ...  :.::.  :: ..:..:...:.. ..  .:.:  ..:....
CCDS97 IGFGNIAPTTDVEKMFSVAMMMVGSLLYATIFGNVTTIFQQMYANTNRYHEMLNNVRDFL
            440       450       460       470       480       490  

             380       390        400       410       420       430
pF1KE5 SFHKLPADTRQRIHEYYEHRYQ-GKMFDEESILGELSEPLREEIINFTCRGLVAHMPLFA
       .....:    .:. .:    .. .: .: :..:.   . .: .:     : .  . : : 
CCDS97 KLYQVPKGLSERVMDYIVSTWSMSKGIDTEKVLSICPKDMRADICVHLNRKVFNEHPAFR
            500       510       520       530       540       550  

              440       450       460       470       480       490
pF1KE5 HADPSFVTAVLTKLRFEVFQPGDLVVREGSVGRKMYFIQHGLLSVLARGARDTRLTDGSY
        :. . . :. ....     ::::. . :     . :.  : : :.      . :  :. 
CCDS97 LASDGCLRALAVEFQTIHCAPGDLIYHAGESVDALCFVVSGSLEVIQDDEVVAILGKGDV
            560       570       580       590       600       610  

                500       510       520       530       540        
pF1KE5 FGEICL--LTRGRRTASVRADTYCRLYSLSVDHFNAVLEEFPMMRRAFETVAMDRLLRIG
       ::.:     : ..  :.::: ::: :. .. . .  ::. .  .  .:   . .  :  .
CCDS97 FGDIFWKETTLAHACANVRALTYCDLHIIKREALLKVLDFYTAFANSF---SRNLTLTCN
            620       630       640       650       660            

      550       560       570       580       590       600        
pF1KE5 KKNSILQRKRSEPSPGSSGGIMEQHLVQHDRDMARGVRGRAPSTGAQLSGKPVLWEPLVH
        .. :. :: :.                                                
CCDS97 LRKRIIFRKISDVKKEEEERLRQKNEVTLSIPVDHPVRKLFQKFKQQKELRNQGSTQGDP
     670       680       690       700       710       720         

>>CCDS11638.1 KCNH6 gene_id:81033|Hs109|chr17             (994 aa)
 initn: 438 init1: 148 opt: 548  Z-score: 340.8  bits: 74.2 E(33420): 1.2e-12
Smith-Waterman score: 645; 24.8% identity (52.5% similar) in 824 aa overlap (35-769:165-955)

           10        20        30        40        50          60  
pF1KE5 QRPAAGASEGATPGLEAVPPVAPPPATAASGPIPKSGPEPKRRHLGTLLQPTVN--KFSL
                                     :: : .: . : : .. . : :.:  .:.:
CCDS11 LLAKCSSRSLSQRLLSQSFLGSEGSHGRPGGPGPGTG-RGKYRTISQIPQFTLNFVEFNL
          140       150       160       170        180       190   

                        70              80                       90
pF1KE5 R-----------VFGSHKAVEIEQ---ERVK---SAGA---------------WIIHPYS
       .           ... ::.::  :   :.:    : ::               : :  ::
CCDS11 EKHRSSSTTEIEIIAPHKVVERTQNVTEKVTQVLSLGADVLPEYKLQAPRIHRWTILHYS
           200       210       220       230       240       250   

              100       110          120               130         
pF1KE5 DFRFYWDLIMLLLMVGNLIVLPVGITFF---KEENS--------PPWIVFNVLSDTFFLL
        :.  :: ..:::.. . .  : . .:.   ..:.          :  : ... : .:..
CCDS11 PFKAVWDWLILLLVIYTAVFTPYSAAFLLSDQDESRRGACSYTCSPLTVVDLIVDIMFVV
           260       270       280       290       300       310   

     140       150       160       170       180       190         
pF1KE5 DLVLNFRTGIVVEEGAEILLAPRAIRTRYLRTWFLVDLISSIPVDYIFLVVELEPRLDAE
       :.:.::::   :. . :..  :: : ..:.. :::.:....:: : .             
CCDS11 DIVINFRT-TYVNTNDEVVSHPRRIAVHYFKGWFLIDMVAAIPFDLL-------------
           320        330       340       350                      

     200       210       220       230       240       250         
pF1KE5 VYKTARALRIVRFTKILSLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTYDLASAVVRIFNLIGMML
       ...:.      . : ...::.  :: ::.:  .. ..     :.  .:.: .: :.  . 
CCDS11 IFRTGSD----ETTTLIGLLKTARLLRLVRVARKLDR-----YSEYGAAV-LFLLMCTFA
     360           370       380       390            400          

     260       270               280       290              300    
pF1KE5 LLCHWDGCLQFLV-----PMLQD---FPPDCWVSINHMVNHS-------WGRQYSHALFK
       :. :: .:. . .     :.:.    .  .  :....  : :          .:  ::. 
CCDS11 LIAHWLACIWYAIGNVERPYLEHKIGWLDSLGVQLGKRYNGSDPASGPSVQDKYVTALYF
     410       420       430       440       450       460         

          310       320       330       340       350       360    
pF1KE5 AMSHMLCIGYGQQAPVGMPDVWLTMLSMIVGATCYAMFIGHATALIQSLDSSRRQYQEKY
       ..: .  .:.:. .:    .  ...  :..:.  :: ..:...:.:: : :.  .:. ..
CCDS11 TFSSLTSVGFGNVSPNTNSEKVFSICVMLIGSLMYASIFGNVSAIIQRLYSGTARYHTQM
     470       480       490       500       510       520         

          370       380       390        400       410       420   
pF1KE5 KQVEQYMSFHKLPADTRQRIHEYYEHRYQ-GKMFDEESILGELSEPLREEIINFTCRGLV
        .:.... ::..:   :::..::..: ..  . .: ...:  . : :. .:     :.:.
CCDS11 LRVKEFIRFHQIPNPLRQRLEEYFQHAWSYTNGIDMNAVLKGFPECLQADICLHLHRALL
     530       540       550       560       570       580         

           430       440       450       460       470       480   
pF1KE5 AHMPLFAHADPSFVTAVLTKLRFEVFQPGDLVVREGSVGRKMYFIQHGLLSVLARGARDT
        : : :. :  . . :. .:..     ::: .:. :.:   .:::..: . .:   .  .
CCDS11 QHCPAFSGAGKGCLRALAVKFKTTHAPPGDTLVHLGDVLSTLYFISRGSIEILRDDVVVA
     590       600       610       620       630       640         

           490         500       510       520       530        540
pF1KE5 RLTDGSYFGE-ICLLTR-GRRTASVRADTYCRLYSLSVDHFNAVLEEFPMMRRAFET-VA
        :  .. ::: . : .. :. .:.::: ::: :....   .  ::. .: . ..: . . 
CCDS11 ILGKNDIFGEPVSLHAQPGKSSADVRALTYCDLHKIQRADLLEVLDMYPAFAESFWSKLE
     650       660       670       680       690       700         

              550       560       570          580          590    
pF1KE5 MDRLLRIGKKNSILQRKRSEPSPGSSGGIM---EQHLVQHDRDMARGVRGRA---PSTGA
       .   ::    ... .  :. :.  .  :..   .:    :.       .: .   :..  
CCDS11 VTFNLR-DAAGGLHSSPRQAPGSQDHQGFFLSDNQSGSPHELGPQFPSKGYSLLGPGSQN
     710        720       730       740       750       760        

          600        610       620       630       640       650   
pF1KE5 QLSGKPVL-WEPLVHAPLQAAAVTSNVAIALTHQRGPLPLSPDSPATLLARSAWRSAGSP
       .... :    .: .  ::. . . :..   :  :. :   ::.::      . :    . 
CCDS11 SMGAGPCAPGHPDAAPPLSISDA-SGLWPELL-QEMPPRHSPQSPQE--DPDCW--PLKL
      770       780       790         800       810           820  

           660       670       680       690       700       710   
pF1KE5 ASPLVPVRAGPWASTSRLPAPPARTLHASLSRAGRSQVSLLGPPPGGGGRRLGPRGRPLS
       .: :  ..:      ::. .  .: :.   .   ....: .   :...   : : .   .
CCDS11 GSRLEQLQAQMNRLESRVSSDLSRILQLLQKPMPQGHASYILEAPASNDLALVPIASETT
            830       840       850       860       870       880  

           720                  730       740            750       
pF1KE5 ASQPSLPQR--------ATGD---GSPGRKGSGSERLPPSGL-----LAKPPRTAQPPR-
       .  : :::         . ::    :: ...: : :.:  ..     ::   .  ::   
CCDS11 SPGPRLPQGFLPPAQTPSYGDLDDCSPKHRNS-SPRMPHLAVATDKTLAPSSEQEQPEGL
            890       900       910        920       930       940 

         760       770                                      
pF1KE5 -PPVPEPATPRGLQLSANM                                  
        ::.  :  :  .:                                       
CCDS11 WPPLASPLHPLEVQGLICGPCFSSLPEHLGSVPKQLDFQRHGSDPGFAGSWGH
             950       960       970       980       990    

>>CCDS31015.1 KCNH1 gene_id:3756|Hs109|chr1               (962 aa)
 initn: 338 init1: 165 opt: 547  Z-score: 340.4  bits: 74.1 E(33420): 1.3e-12
Smith-Waterman score: 577; 25.4% identity (54.5% similar) in 523 aa overlap (65-560:190-685)

           40        50        60        70        80        90    
pF1KE5 GPIPKSGPEPKRRHLGTLLQPTVNKFSLRVFGSHKAVEIEQERVKSAGAWIIHPYSDFRF
                                     .::    . .::  :.    :.: :  :. 
CCDS31 SSRGVLQQLAPSVQKGENVHKHSRLAEVLQLGSDILPQYKQEAPKTPPHIILH-YCVFKT
     160       170       180       190       200       210         

          100       110       120       130       140       150    
pF1KE5 YWDLIMLLLMVGNLIVLPVGITFFKEENSPPWIVFNVLSDTFFLLDLVLNFRTGIVVEEG
        :: :.:.:   . :..: ...:  ..:.  :.: . . :..::.:.::::.: .:   :
CCDS31 TWDWIILILTFYTAILVPYNVSFKTRQNNVAWLVVDSIVDVIFLVDIVLNFHTTFVGPAG
      220       230       240       250       260       270        

          160       170       180       190       200       210    
pF1KE5 AEILLAPRAIRTRYLRTWFLVDLISSIPVDYIFLVVELEPRLDAEVYKTARALRIVRFTK
        :..  :. ::  ::.:::..::.: .: :    :..    .:  . .   .:..::   
CCDS31 -EVISDPKLIRMNYLKTWFVIDLLSCLPYD----VINAFENVDEGISSLFSSLKVVR---
       280       290       300           310       320       330   

          220       230       240       250       260       270    
pF1KE5 ILSLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTYDLASAVVRIFNLIGMMLLLCHWDGCLQFLVPM
             ::::.:. : . .. :     :  :  :.    :. .. :  :: .:. . .  
CCDS31 ------LLRLGRVARKLDHYIE-----YGAAVLVL----LVCVFGLAAHWMACIWYSIGD
                    340            350           360       370     

          280                     290                 300       310
pF1KE5 LQDFPPDC-------W-------VSINHMVNHS----W------GRQYSHALFKAMSHML
        . :  :        :       ..  .. : :    :      .  :  .:. .:. . 
CCDS31 YEIFDEDTKTIRNNSWLYQLAMDIGTPYQFNGSGSGKWEGGPSKNSVYISSLYFTMTSLT
         380       390       400       410       420       430     

              320       330       340       350       360       370
pF1KE5 CIGYGQQAPVGMPDVWLTMLSMIVGATCYAMFIGHATALIQSLDSSRRQYQEKYKQVEQY
        .:.:. ::    .  ...  :..:.  :: ..:..:...:.. ..  .:.:  ..:...
CCDS31 SVGFGNIAPSTDIEKIFAVAIMMIGSLLYATIFGNVTTIFQQMYANTNRYHEMLNSVRDF
         440       450       460       470       480       490     

              380       390        400       410       420         
pF1KE5 MSFHKLPADTRQRIHEYYEHRYQ-GKMFDEESILGELSEPLREEIINFTCRGLVAHMPLF
       ......:    .:. .:    .. .. .: :..:    . .: .:     : .  . : :
CCDS31 LKLYQVPKGLSERVMDYIVSTWSMSRGIDTEKVLQICPKDMRADICVHLNRKVFKEHPAF
         500       510       520       530       540       550     

     430       440       450       460       470       480         
pF1KE5 AHADPSFVTAVLTKLRFEVFQPGDLVVREGSVGRKMYFIQHGLLSVLARGARDTRLTDGS
         :. . . :.  ...     ::::. . :    .. :.  : : :.      . :  :.
CCDS31 RLASDGCLRALAMEFQTVHCAPGDLIYHAGESVDSLCFVVSGSLEVIQDDEVVAILGKGD
         560       570       580       590       600       610     

     490         500       510       520       530       540       
pF1KE5 YFGEICL--LTRGRRTASVRADTYCRLYSLSVDHFNAVLEEFPMMRRAFETVAMDRLLRI
        ::..     : ..  :.::: ::: :. .. : .. ::: .  . ..:   . . .:  
CCDS31 VFGDVFWKEATLAQSCANVRALTYCDLHVIKRDALQKVLEFYTAFSHSF---SRNLILTY
         620       630       640       650       660          670  

       550       560       570       580       590       600       
pF1KE5 GKKNSILQRKRSEPSPGSSGGIMEQHLVQHDRDMARGVRGRAPSTGAQLSGKPVLWEPLV
       . .. :. :: :.                                               
CCDS31 NLRKRIVFRKISDVKREEEERMKRKNEAPLILPPDHPVRRLFQRFRQQKEARLAAERGGR
            680       690       700       710       720       730  

>>CCDS62290.1 KCNH6 gene_id:81033|Hs109|chr17             (958 aa)
 initn: 438 init1: 148 opt: 534  Z-score: 332.7  bits: 72.6 E(33420): 3.4e-12
Smith-Waterman score: 629; 25.5% identity (51.8% similar) in 813 aa overlap (35-769:165-919)

           10        20        30        40        50          60  
pF1KE5 QRPAAGASEGATPGLEAVPPVAPPPATAASGPIPKSGPEPKRRHLGTLLQPTVN--KFSL
                                     :: : .: . : : .. . : :.:  .:.:
CCDS62 LLAKCSSRSLSQRLLSQSFLGSEGSHGRPGGPGPGTG-RGKYRTISQIPQFTLNFVEFNL
          140       150       160       170        180       190   

                        70              80                       90
pF1KE5 R-----------VFGSHKAVEIEQ---ERVK---SAGA---------------WIIHPYS
       .           ... ::.::  :   :.:    : ::               : :  ::
CCDS62 EKHRSSSTTEIEIIAPHKVVERTQNVTEKVTQVLSLGADVLPEYKLQAPRIHRWTILHYS
           200       210       220       230       240       250   

              100       110          120               130         
pF1KE5 DFRFYWDLIMLLLMVGNLIVLPVGITFF---KEENS--------PPWIVFNVLSDTFFLL
        :.  :: ..:::.. . .  : . .:.   ..:.          :  : ... : .:..
CCDS62 PFKAVWDWLILLLVIYTAVFTPYSAAFLLSDQDESRRGACSYTCSPLTVVDLIVDIMFVV
           260       270       280       290       300       310   

     140       150       160       170       180       190         
pF1KE5 DLVLNFRTGIVVEEGAEILLAPRAIRTRYLRTWFLVDLISSIPVDYIFLVVELEPRLDAE
       :.:.::::   :. . :..  :: : ..:.. :::.:....:: : .             
CCDS62 DIVINFRT-TYVNTNDEVVSHPRRIAVHYFKGWFLIDMVAAIPFDLL-------------
           320        330       340       350                      

     200       210       220       230       240       250         
pF1KE5 VYKTARALRIVRFTKILSLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTYDLASAVVRIFNLIGMML
       ...:.      . : ...::.  :: ::.:  .. ..     :.  .:.: .: :.  . 
CCDS62 IFRTGSD----ETTTLIGLLKTARLLRLVRVARKLDR-----YSEYGAAV-LFLLMCTFA
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     260       270               280       290              300    
pF1KE5 LLCHWDGCLQFLV-----PMLQD---FPPDCWVSINHMVNHS-------WGRQYSHALFK
       :. :: .:. . .     :.:.    .  .  :....  : :          .:  ::. 
CCDS62 LIAHWLACIWYAIGNVERPYLEHKIGWLDSLGVQLGKRYNGSDPASGPSVQDKYVTALYF
     410       420       430       440       450       460         

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pF1KE5 AMSHMLCIGYGQQAPVGMPDVWLTMLSMIVGATCYAMFIGHATALIQSLDSSRRQYQEKY
       ..: .  .:.:. .:    .  ...  :..:.  :: ..:...:.:: : :.  .:. ..
CCDS62 TFSSLTSVGFGNVSPNTNSEKVFSICVMLIGSLMYASIFGNVSAIIQRLYSGTARYHTQM
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        .:.... ::..:   :::..::..: ..  . .: ...:  . : :. .:     :.:.
CCDS62 LRVKEFIRFHQIPNPLRQRLEEYFQHAWSYTNGIDMNAVLKGFPECLQADICLHLHRALL
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pF1KE5 AHMPLFAHADPSFVTAVLTKLRFEVFQPGDLVVREGSVGRKMYFIQHGLLSVLARGARDT
        : : :. :  . . :. .:..     ::: .:. :.:   .:::..: . .:   .  .
CCDS62 QHCPAFSGAGKGCLRALAVKFKTTHAPPGDTLVHLGDVLSTLYFISRGSIEILRDDVVVA
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pF1KE5 RLTDGSYFGE-ICLLTR-GRRTASVRADTYCRLYSLSVDHFNAVLEEFPMMRRAFET-VA
        :  .. ::: . : .. :. .:.::: ::: :....   .  ::. .: . ..: . . 
CCDS62 ILGKNDIFGEPVSLHAQPGKSSADVRALTYCDLHKIQRADLLEVLDMYPAFAESFWSKLE
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pF1KE5 MDRLLRIGKKNSILQRKRSEPSPGSSGGIMEQHLVQHDRDMARGVRGRAPSTGAQLSGKP
       .   ::    ... .  :. :.  .  :..   : ... : :       : . .. ::  
CCDS62 VTFNLR-DAAGGLHSSPRQAPGSQDHQGFF---LSDNQSDAA------PPLSISDASG--
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pF1KE5 VLWEPLVHAPLQAAAVTSNVAIALTHQRGP--LPLSPDSPATLLARSAWRSAGSPASPLV
        ::  :    ::      .     . :. :   ::.  :    :  .  :  .  .: : 
CCDS62 -LWPEL----LQEMPPRHS---PQSPQEDPDCWPLKLGSRLEQLQAQMNRLESRVSSDLS
        760           770          780       790       800         

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pF1KE5 PV-----RAGPWASTSRLPAPPARTLHASLSRAGRSQVSLLGPPPGGGGRRLGPRGRPLS
        .     .  : . .: .   :: .  : .  :  :...  ::       :: :.:    
CCDS62 RILQLLQKPMPQGHASYILEAPASNDLALVPIA--SETTSPGP-------RL-PQGFLPP
     810       820       830       840         850                 

           720       730       740            750         760      
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       :. ::  .    : :: ...: : :.:  ..     ::   .  ::    ::.  :  : 
CCDS62 AQTPSYGD--LDDCSPKHRNS-SPRMPHLAVATDKTLAPSSEQEQPEGLWPPLASPLHPL
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        .:                                       
CCDS62 EVQGLICGPCFSSLPEHLGSVPKQLDFQRHGSDPGFAGSWGH
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