Result of FASTA (ccds) for pF1KE1590
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE1590, 1168 aa
  1>>>pF1KE1590 1168 - 1168 aa - 1168 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0748+/-0.000921; mu= 9.9668+/- 0.055
 mean_var=142.7275+/-29.282, 0's: 0 Z-trim(110.3): 76  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.107355
 statistics sampled from 11426 (11500) to 11426 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.694), E-opt: 0.2 (0.353), width:  16
 Scan time:  5.750

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS33972.1 TBC1D1 gene_id:23216|Hs108|chr4        (1168) 7754 1213.3       0
CCDS58897.1 TBC1D1 gene_id:23216|Hs108|chr4        (1159) 4238 668.7 2.2e-191
CCDS66563.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13        (1235) 2315 370.9 1.1e-101
CCDS41901.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13        (1298) 2179 349.8 2.4e-95
CCDS66564.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13        (1290) 2175 349.2 3.7e-95
CCDS6848.2 RABGAP1 gene_id:23637|Hs108|chr9        (1069)  732 125.7 5.9e-28
CCDS1314.1 RABGAP1L gene_id:9910|Hs108|chr1        ( 815)  629 109.7   3e-23
CCDS12188.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19       ( 794)  584 102.7 3.6e-21
CCDS30774.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1           ( 810)  583 102.6 4.1e-21
CCDS76179.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1           ( 821)  580 102.1 5.7e-21
CCDS54209.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19       ( 805)  574 101.2 1.1e-20
CCDS53492.1 USP6NL gene_id:9712|Hs108|chr10        ( 828)  440 80.4 1.9e-14
CCDS44357.1 USP6NL gene_id:9712|Hs108|chr10        ( 845)  440 80.4   2e-14
CCDS13874.1 TBC1D10A gene_id:83874|Hs108|chr22     ( 508)  416 76.6 1.7e-13
CCDS56227.1 TBC1D10A gene_id:83874|Hs108|chr22     ( 515)  416 76.6 1.7e-13
CCDS10676.2 TBC1D10B gene_id:26000|Hs108|chr16     ( 808)  412 76.1 3.9e-13
CCDS9534.2 GRTP1 gene_id:79774|Hs108|chr13         ( 336)  397 73.6   9e-13
CCDS14002.1 SGSM3 gene_id:27352|Hs108|chr22        ( 749)  403 74.7 9.5e-13
CCDS66591.1 GRTP1 gene_id:79774|Hs108|chr13        ( 344)  393 73.0 1.4e-12
CCDS8162.1 TBC1D10C gene_id:374403|Hs108|chr11     ( 446)  394 73.2 1.6e-12
CCDS32301.2 TBC1D2B gene_id:23102|Hs108|chr15      ( 914)  380 71.1 1.3e-11
CCDS45314.1 TBC1D2B gene_id:23102|Hs108|chr15      ( 963)  380 71.2 1.4e-11
CCDS59137.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9        ( 468)  374 70.1 1.4e-11
CCDS47136.1 TBC1D9 gene_id:23158|Hs108|chr4        (1266)  377 70.7 2.4e-11
CCDS75865.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9        ( 928)  374 70.2 2.6e-11


>>CCDS33972.1 TBC1D1 gene_id:23216|Hs108|chr4             (1168 aa)
 initn: 7754 init1: 7754 opt: 7754  Z-score: 6492.4  bits: 1213.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 7754; 99.9% identity (99.9% similar) in 1168 aa overlap (1-1168:1-1168)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MEPITFTARKHLLSNEVSVDFGLQLVGSLPVHSLTTMPMLPWVVAEVRRLSRQSTRKEPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MEPITFTARKHLLSNEVSVDFGLQLVGSLPVHSLTTMPMLPWVVAEVRRLSRQSTRKEPV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 TKQVRLCVSPSGLRCEPEPGRSQQWDPLIYSSIFECKPQRVHKLIHNSHDPSYFACLIKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TKQVRLCVSPSGLRCEPEPGRSQQWDPLIYSSIFECKPQRVHKLIHNSHDPSYFACLIKE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 DAVHRQSICYVFKADDQTKVPEIISSIRQAGKIARQEELHCPSEFDDTFSKKFEVLFCGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DAVHRQSICYVFKADDQTKVPEIISSIRQAGKIARQEELHCPSEFDDTFSKKFEVLFCGR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 VTVAHKKAPPALIDECIEKFNHVSGSRGSESPRPNPPHAAPTGSQEPGRRPMRKSFSQPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS33 VTVAHKKAPPALIDECIEKFNHVSGSRGSESPRPNPPHAAPTGSQEPVRRPMRKSFSQPG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 LRSLAFRKELQDGGLRSSGFFSSFEESDIENHLISGHNIVQPTDIEENRTMLFTIGQSEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LRSLAFRKELQDGGLRSSGFFSSFEESDIENHLISGHNIVQPTDIEENRTMLFTIGQSEV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 YLISPDTKKIALEKNFKEISFCSQGIRHVDHFGFICRESSGGGGFHFVCYVFQCTNEALV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YLISPDTKKIALEKNFKEISFCSQGIRHVDHFGFICRESSGGGGFHFVCYVFQCTNEALV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 DEIMMTLKQAFTVAAVQQTAKAPAQLCEGCPLQSLHKLCERIEGMNSSKTKLELQKHLTT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DEIMMTLKQAFTVAAVQQTAKAPAQLCEGCPLQSLHKLCERIEGMNSSKTKLELQKHLTT
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE1 LTNQEQATIFEEVQKLRPRNEQRENELIISFLRCLYEEKQKEHIHIGEMKQTSQMAAENI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LTNQEQATIFEEVQKLRPRNEQRENELIISFLRCLYEEKQKEHIHIGEMKQTSQMAAENI
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE1 GSELPPSATRFRLDMLKNKAKRSLTESLESILSRGNKARGLQEHSISVDLDSSLSSTLSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GSELPPSATRFRLDMLKNKAKRSLTESLESILSRGNKARGLQEHSISVDLDSSLSSTLSN
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE1 TSKEPSVCEKEALPISESSFKLLGSSEDLSSDSESHLPEEPAPLSPQQAFRRRANTLSHF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TSKEPSVCEKEALPISESSFKLLGSSEDLSSDSESHLPEEPAPLSPQQAFRRRANTLSHF
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE1 PIECQEPPQPARGSPGVSQRKLMRYHSVSTETPHERKDFESKANHLGDSGGTPVKTRRHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PIECQEPPQPARGSPGVSQRKLMRYHSVSTETPHERKDFESKANHLGDSGGTPVKTRRHS
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE1 WRQQIFLRVATPQKACDSSSRYEDYSELGELPPRSPLEPVCEDGPFGPPPEEKKRTSREL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 WRQQIFLRVATPQKACDSSSRYEDYSELGELPPRSPLEPVCEDGPFGPPPEEKKRTSREL
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE1 RELWQKAILQQILLLRMEKENQKLQASENDLLNKRLKLDYEEITPCLKEVTTVWEKMLST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RELWQKAILQQILLLRMEKENQKLQASENDLLNKRLKLDYEEITPCLKEVTTVWEKMLST
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE1 PGRSKIKFDMEKMHSAVGQGVPRHHRGEIWKFLAEQFHLKHQFPSKQQPKDVPYKELLKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PGRSKIKFDMEKMHSAVGQGVPRHHRGEIWKFLAEQFHLKHQFPSKQQPKDVPYKELLKQ
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE1 LTSQQHAILIDLGRTFPTHPYFSAQLGAGQLSLYNILKAYSLLDQEVGYCQGLSFVAGIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LTSQQHAILIDLGRTFPTHPYFSAQLGAGQLSLYNILKAYSLLDQEVGYCQGLSFVAGIL
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE1 LLHMSEEEAFKMLKFLMFDMGLRKQYRPDMIILQIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHLEEHEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LLHMSEEEAFKMLKFLMFDMGLRKQYRPDMIILQIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHLEEHEI
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE1 GPSLYAAPWFLTMFASQFPLGFVARVFDMIFLQGTEVIFKVALSLLGSHKPLILQHENLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GPSLYAAPWFLTMFASQFPLGFVARVFDMIFLQGTEVIFKVALSLLGSHKPLILQHENLE
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE1 TIVDFIKSTLPNLGLVQMEKTINQVFEMDIAKQLQAYEVEYHVLQEELIDSSPLSDNQRM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TIVDFIKSTLPNLGLVQMEKTINQVFEMDIAKQLQAYEVEYHVLQEELIDSSPLSDNQRM
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE1 DKLEKTNSSLRKQNLDLLEQLQVANGRIQSLEATIEKLLSSESKLKQAMLTLELERSALL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DKLEKTNSSLRKQNLDLLEQLQVANGRIQSLEATIEKLLSSESKLKQAMLTLELERSALL
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160        
pF1KE1 QTVEELRRRSAEPSDREPECTQPEPTGD
       ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QTVEELRRRSAEPSDREPECTQPEPTGD
             1150      1160        

>>CCDS58897.1 TBC1D1 gene_id:23216|Hs108|chr4             (1159 aa)
 initn: 6242 init1: 4238 opt: 4238  Z-score: 3549.5  bits: 668.7 E(32554): 2.2e-191
Smith-Waterman score: 6655; 84.2% identity (84.3% similar) in 1262 aa overlap (1-1168:1-1159)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MEPITFTARKHLLSNEVSVDFGLQLVGSLPVHSLTTMPMLPWVVAEVRRLSRQSTRKEPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MEPITFTARKHLLSNEVSVDFGLQLVGSLPVHSLTTMPMLPWVVAEVRRLSRQSTRKEPV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 TKQVRLCVSPSGLRCEPEPGRSQQWDPLIYSSIFECKPQRVHKLIHNSHDPSYFACLIKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TKQVRLCVSPSGLRCEPEPGRSQQWDPLIYSSIFECKPQRVHKLIHNSHDPSYFACLIKE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 DAVHRQSICYVFKADDQTKVPEIISSIRQAGKIARQEELHCPSEFDDTFSKKFEVLFCGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DAVHRQSICYVFKADDQTKVPEIISSIRQAGKIARQEELHCPSEFDDTFSKKFEVLFCGR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 VTVAHKKAPPALIDECIEKFNHVSGSRGSESPRPNPPHAAPTGSQEPGRRPMRKSFSQPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS58 VTVAHKKAPPALIDECIEKFNHVSGSRGSESPRPNPPHAAPTGSQEPVRRPMRKSFSQPG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 LRSLAFRKELQDGGLRSSGFFSSFEESDIENHLISGHNIVQPTDIEENRTMLFTIGQSEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LRSLAFRKELQDGGLRSSGFFSSFEESDIENHLISGHNIVQPTDIEENRTMLFTIGQSEV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 YLISPDTKKIALEKNFKEISFCSQGIRHVDHFGFICRESSGGGGFHFVCYVFQCTNEALV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YLISPDTKKIALEKNFKEISFCSQGIRHVDHFGFICRESSGGGGFHFVCYVFQCTNEALV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 DEIMMTLKQAFTVAAVQQTAKAPAQLCEGCPLQSLHKLCERIEGMNSSKTKLELQKHLTT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DEIMMTLKQAFTVAAVQQTAKAPAQLCEGCPLQSLHKLCERIEGMNSSKTKLELQKHLTT
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE1 LTNQEQATIFEEVQKLRPRNEQRENELIISFLRCLYEEKQKEHIHIGEMKQTSQMAAENI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LTNQEQATIFEEVQKLRPRNEQRENELIISFLRCLYEEKQKEHIHIGEMKQTSQMAAENI
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE1 GSELPPSATRFRLDMLKNKAKRSLTESLESILSRGNKARGLQEHSISVDLDSSLSSTLSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GSELPPSATRFRLDMLKNKAKRSLTESLESILSRGNKARGLQEHSISVDLDSSLSSTLSN
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE1 TSKEPSVCEKEALPISESSFKLLGSSEDLSSDSESHLPEEPAPLSPQQAFRRRANTLSHF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TSKEPSVCEKEALPISESSFKLLGSSEDLSSDSESHLPEEPAPLSPQQAFRRRANTLSHF
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630                              
pF1KE1 PIECQEPPQPARGSPGVSQRKLMRYHSVSTETPHER------------------------
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::                        
CCDS58 PIECQEPPQPARGSPGVSQRKLMRYHSVSTETPHERNVDPSPVGESKHRPGQSSAPAPPP
              610       620       630       640       650       660

                                                                   
pF1KE1 ------------------------------------------------------------
                                                                   
CCDS58 RLNPSASSPNFFKYLKHNSSGEQSGNAVPKSISYRNALRKKLHSSSSVPNFLKFLAPVDE
              670       680       690       700       710       720

                  640       650       660       670       680      
pF1KE1 ----------KDFESKANHLGDSGGTPVKTRRHSWRQQIFLRVATPQKACDSSSRYEDYS
                 .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NNTSDFMNTKRDFESKANHLGDSGGTPVKTRRHSWRQQIFLRVATPQKACDSSSRYEDYS
              730       740       750       760       770       780

        690       700       710       720       730       740      
pF1KE1 ELGELPPRSPLEPVCEDGPFGPPPEEKKRTSRELRELWQKAILQQILLLRMEKENQKLQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ELGELPPRSPLEPVCEDGPFGPPPEEKKRTSRELRELWQKAILQQILLLRMEKENQKLQA
              790       800       810       820       830       840

        750       760       770       780       790       800      
pF1KE1 SENDLLNKRLKLDYEEITPCLKEVTTVWEKMLSTPGRSKIKFDMEKMHSAVGQGVPRHHR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SENDLLNKRLKLDYEEITPCLKEVTTVWEKMLSTPGRSKIKFDMEKMHSAVGQGVPRHHR
              850       860       870       880       890       900

        810       820       830       840       850       860      
pF1KE1 GEIWKFLAEQFHLKHQFPSKQQPKDVPYKELLKQLTSQQHAILIDLGRTFPTHPYFSAQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GEIWKFLAEQFHLKHQFPSKQQPKDVPYKELLKQLTSQQHAILIDLGRTFPTHPYFSAQL
              910       920       930       940       950       960

        870       880       890       900       910       920      
pF1KE1 GAGQLSLYNILKAYSLLDQEVGYCQGLSFVAGILLLHMSEEEAFKMLKFLMFDMGLRKQY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GAGQLSLYNILKAYSLLDQEVGYCQGLSFVAGILLLHMSEEEAFKMLKFLMFDMGLRKQY
              970       980       990      1000      1010      1020

        930       940       950       960       970       980      
pF1KE1 RPDMIILQIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHLEEHEIGPSLYAAPWFLTMFASQFPLGFVARV
       ::::::::                                                    
CCDS58 RPDMIILQ----------------------------------------------------
                                                                   

        990      1000      1010      1020      1030      1040      
pF1KE1 FDMIFLQGTEVIFKVALSLLGSHKPLILQHENLETIVDFIKSTLPNLGLVQMEKTINQVF
                                                          :::::::::
CCDS58 ---------------------------------------------------MEKTINQVF
                                                        1030       

       1050      1060      1070      1080      1090      1100      
pF1KE1 EMDIAKQLQAYEVEYHVLQEELIDSSPLSDNQRMDKLEKTNSSLRKQNLDLLEQLQVANG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EMDIAKQLQAYEVEYHVLQEELIDSSPLSDNQRMDKLEKTNSSLRKQNLDLLEQLQVANG
      1040      1050      1060      1070      1080      1090       

       1110      1120      1130      1140      1150      1160      
pF1KE1 RIQSLEATIEKLLSSESKLKQAMLTLELERSALLQTVEELRRRSAEPSDREPECTQPEPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RIQSLEATIEKLLSSESKLKQAMLTLELERSALLQTVEELRRRSAEPSDREPECTQPEPT
      1100      1110      1120      1130      1140      1150       

         
pF1KE1 GD
       ::
CCDS58 GD
         

>>CCDS66563.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13             (1235 aa)
 initn: 3397 init1: 1520 opt: 2315  Z-score: 1939.4  bits: 370.9 E(32554): 1.1e-101
Smith-Waterman score: 3657; 51.3% identity (72.9% similar) in 1208 aa overlap (21-1160:36-1214)

                         10        20        30        40        50
pF1KE1           MEPITFTARKHLLSNEVSVDFGLQLVGSLPVHSLTTMPMLPWVVAEVRRL
                                     : :  ::.  .   ::.:::::..::.:: 
CCDS66 CIQDEPFPHPLEPEPGVSAQPGPGKPSDKRFRLWYVGGSCLDHRTTLPMLPWLMAEIRRR
          10        20        30        40        50        60     

                  60        70        80                 90        
pF1KE1 SRQSTRK---EPVTKQVRLCVSPSGLRCEPEPG---------RSQQWDPLIYSSIFECKP
       :..        :....: : .:   ::: : ::          . : .: ..  ::: : 
CCDS66 SQKPEAGGCGAPAAREVILVLSAPFLRCVPAPGAGASGGTSPSATQPNPAVF--IFEHKA
          70        80        90       100       110         120   

      100       110       120         130       140       150      
pF1KE1 QRVHKLIHNSHDPSYFACLIKE--DAVHRQSICYVFKADDQTKVPEIISSIRQAGKIARQ
       :.. ..:::::: .::: :::   :  . :  :.::.: : ..::..:::::: .: : .
CCDS66 QHISRFIHNSHDLTYFAYLIKAQPDDPESQMACHVFRATDPSQVPDVISSIRQLSKAAMK
           130       140       150       160       170       180   

        160         170       180       190       200              
pF1KE1 EELHCPSEFDDTF--SKKFEVLFCGRVTVAHKKAPPALIDECIEKFN-H------VSG-S
       :. .  .. .:.:  :.:::::.::.:::.::::: .:::.:.:::. :      ..: .
CCDS66 EDAKPSKDNEDAFYNSQKFEVLYCGKVTVTHKKAPSSLIDDCMEKFSLHEQQRLKIQGEQ
           190       200       210       220       230       240   

        210                     220                230       240   
pF1KE1 RGSE--------------SPRPNPPHAA---------PTGSQEPGRRPMRKSFSQPGLRS
       :: .              ::    :. :         :.:...:.    :  : .  :..
CCDS66 RGPDPGEDLADLEVVVPGSPGDCLPEEADGTDTHLGLPAGASQPALTSSRVCFPERILED
           250       260       270       280       290       300   

             250       260           270       280       290       
pF1KE1 LAF--RKELQDGGLRSSGFFSSFEE----SDIENHLISGHNIVQPTDIEENRTMLFTIGQ
        .:  ..:...     .:     .:    :. . .  :. . :::.: :.:::::: .:.
CCDS66 SGFDEQQEFRSRCSSVTGVQRRVHEGSQKSQPRRRHASAPSHVQPSDSEKNRTMLFQVGR
           310       320       330       340       350       360   

       300       310       320       330       340       350       
pF1KE1 SEVYLISPDTKKIALEKNFKEISFCSQGIRHVDHFGFICRESSGGGGFHFVCYVFQCTNE
        :. :::::::...::::::.:: :::::.::::::::::::   :  ...::::::..:
CCDS66 FEINLISPDTKSVVLEKNFKDISSCSQGIKHVDHFGFICRESPEPGLSQYICYVFQCASE
           370       380       390       400       410       420   

       360       370       380       390       400       410       
pF1KE1 ALVDEIMMTLKQAFTVAAVQQTAKAPAQLCEGCPLQSLHKLCERIEGMNSSKTKLELQKH
       .::::.:.::::::..::. :.::.  .:::.::..:::::::::::.   ..:: .:.:
CCDS66 SLVDEVMLTLKQAFSTAAALQSAKTQIKLCEACPMHSLHKLCERIEGLYPPRAKLVIQRH
           430       440       450       460       470       480   

       420       430       440       450       460       470       
pF1KE1 LTTLTNQEQATIFEEVQKLRPRNEQRENELIISFLRCLYEEKQKEHIHIGEMKQTSQMAA
       :..::..::: :::.:::..: ..:.::::.:  :: : : ::: :.::::  .: .   
CCDS66 LSSLTDNEQADIFERVQKMKPVSDQEENELVILHLRQLCEAKQKTHVHIGEGPSTIS---
           490       500       510       520       530       540   

       480          490       500       510        520       530   
pF1KE1 ENIGSELPPSAT---RFRLDMLKNKAKRSLTESLESILSRG-NKARGLQEHSISVDLDSS
          .: .: .::   ::.::.:::::::::: :::.:.::: :. ::      : . ..:
CCDS66 ---NSTIPENATSSGRFKLDILKNKAKRSLTSSLENIFSRGANRMRGRLGSVDSFERSNS
                 550       560       570       580       590       

           540       550       560       570       580       590   
pF1KE1 LSSTLSNTSKEPSVCEKEALPISESSFKLLGSSEDLSSDSESHLPEEPAPLSPQQAFRRR
       :.:            ::.  : ..:      .:    :.. . .::: .  :::  ::::
CCDS66 LAS------------EKDYSP-GDSPPGTPPASP--PSSAWQTFPEEDSD-SPQ--FRRR
       600                    610         620       630            

           600       610       620       630        640        650 
pF1KE1 ANTLSHFPIECQEPPQPARGSPGVSQRKLMRYHSVSTETPHE-RKDFESKANHLGDS-GG
       :.:.:: :   ..  .   :     .  :.:  :    .  : ::   :  .. . : ::
CCDS66 AHTFSHPPSSTKRKLNLQDGRAQGVRSPLLRQSSSEQCSDGEGRKRTSSTCSNESLSVGG
     640       650       660       670       680       690         

             660       670       680       690       700           
pF1KE1 TPVKTRRHSWRQQIFLRVATPQKACDSSSRYEDYSELGELPPRSPLEPVCEDGPF-----
       : :  :: ::::.::::::.:..   :. . .:  . .:: : ::: :. :. :.     
CCDS66 TSVTPRRISWRQRIFLRVASPMNKSPSAMQQQDGLDRNELLPLSPLSPTMEEEPLVVFLS
     700       710       720       730       740       750         

           710       720       730       740       750       760   
pF1KE1 ---GPPPEEKKRTSRELRELWQKAILQQILLLRMEKENQKLQASENDLLNKRLKLDYEEI
           :   :... :.::: ::.::: :::::::::::::::.::...: ....::::::.
CCDS66 GEDDPEKIEERKKSKELRSLWRKAIHQQILLLRMEKENQKLEASRDELQSRKVKLDYEEV
     760       770       780       790       800       810         

           770       780       790       800       810       820   
pF1KE1 TPCLKEVTTVWEKMLSTPGRSKIKFDMEKMHSAVGQGVPRHHRGEIWKFLAEQFHLKHQF
         : :::  .:.: : .  :.::. ::: .:. . .:::. .:::::.::: :..:.:..
CCDS66 GACQKEVLITWDKKLLN-CRAKIRCDMEDIHTLLKEGVPKSRRGEIWQFLALQYRLRHRL
     820       830        840       850       860       870        

           830       840       850       860       870       880   
pF1KE1 PSKQQPKDVPYKELLKQLTSQQHAILIDLGRTFPTHPYFSAQLGAGQLSLYNILKAYSLL
       :.:::: :. :::::::::.::::::.:::::::::::::.::: :::::.:.:::::::
CCDS66 PNKQQPPDISYKELLKQLTAQQHAILVDLGRTFPTHPYFSVQLGPGQLSLFNLLKAYSLL
      880       890       900       910       920       930        

           890       900       910       920       930       940   
pF1KE1 DQEVGYCQGLSFVAGILLLHMSEEEAFKMLKFLMFDMGLRKQYRPDMIILQIQMYQLSRL
       :.:::::::.:::::.::::::::.::.::::::.:.:.::::::::. :::::::::::
CCDS66 DKEVGYCQGISFVAGVLLLHMSEEQAFEMLKFLMYDLGFRKQYRPDMMSLQIQMYQLSRL
      940       950       960       970       980       990        

           950       960       970       980       990      1000   
pF1KE1 LHDYHRDLYNHLEEHEIGPSLYAAPWFLTMFASQFPLGFVARVFDMIFLQGTEVIFKVAL
       ::::::::::::::.::.:::::::::::.::::: :::::::::.::::::::::::::
CCDS66 LHDYHRDLYNHLEENEISPSLYAAPWFLTLFASQFSLGFVARVFDIIFLQGTEVIFKVAL
     1000      1010      1020      1030      1040      1050        

          1010      1020      1030      1040      1050      1060   
pF1KE1 SLLGSHKPLILQHENLETIVDFIKSTLPNLGLVQMEKTINQVFEMDIAKQLQAYEVEYHV
       :::.:.. ::.. :..:.::.:.:.:::...  .::: :.:::::::.:::.::::::::
CCDS66 SLLSSQETLIMECESFENIVEFLKNTLPDMNTSEMEKIITQVFEMDISKQLHAYEVEYHV
     1060      1070      1080      1090      1100      1110        

          1070       1080      1090      1100      1110      1120  
pF1KE1 LQEELIDSS-PLSDNQRMDKLEKTNSSLRKQNLDLLEQLQVANGRIQSLEATIEKLLSSE
       ::.:: .::    :.. ..:::..::.:..::.::::.::::. .::.::...:.::. :
CCDS66 LQDELQESSYSCEDSETLEKLERANSQLKRQNMDLLEKLQVAHTKIQALESNLENLLTRE
     1120      1130      1140      1150      1160      1170        

           1130      1140      1150      1160                     
pF1KE1 SKLKQAMLTLELERSALLQTVEELRRRSAEPSDREPECTQPEPTGD             
       .:.:. . ::: :. :  .:::.::.    :.:   .:                     
CCDS66 TKMKSLIRTLEQEKMAYQKTVEQLRK--LLPADALVNCDLLLRDLNCNPNNKAKIGNKP
     1180      1190      1200        1210      1220      1230     

>>CCDS41901.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13             (1298 aa)
 initn: 3397 init1: 1520 opt: 2179  Z-score: 1825.2  bits: 349.8 E(32554): 2.4e-95
Smith-Waterman score: 3466; 49.9% identity (71.3% similar) in 1200 aa overlap (73-1160:91-1277)

             50        60        70        80                 90   
pF1KE1 VVAEVRRLSRQSTRKEPVTKQVRLCVSPSGLRCEPEPG---------RSQQWDPLIYSSI
                                     ::: : ::          . : .: ..  :
CCDS41 EIRRRSQKPEAGGCGAPAAREVILVLSAPFLRCVPAPGAGASGGTSPSATQPNPAVF--I
               70        80        90       100       110          

           100       110       120         130       140       150 
pF1KE1 FECKPQRVHKLIHNSHDPSYFACLIKE--DAVHRQSICYVFKADDQTKVPEIISSIRQAG
       :: : :.. ..:::::: .::: :::   :  . :  :.::.: : ..::..:::::: .
CCDS41 FEHKAQHISRFIHNSHDLTYFAYLIKAQPDDPESQMACHVFRATDPSQVPDVISSIRQLS
      120       130       140       150       160       170        

             160         170       180       190       200         
pF1KE1 KIARQEELHCPSEFDDTF--SKKFEVLFCGRVTVAHKKAPPALIDECIEKFN-H------
       : : .:. .  .. .:.:  :.:::::.::.:::.::::: .:::.:.:::. :      
CCDS41 KAAMKEDAKPSKDNEDAFYNSQKFEVLYCGKVTVTHKKAPSSLIDDCMEKFSLHEQQRLK
      180       190       200       210       220       230        

             210                     220                230        
pF1KE1 VSG-SRGSE--------------SPRPNPPHAA---------PTGSQEPGRRPMRKSFSQ
       ..: .:: .              ::    :. :         :.:...:.    :  : .
CCDS41 IQGEQRGPDPGEDLADLEVVVPGSPGDCLPEEADGTDTHLGLPAGASQPALTSSRVCFPE
      240       250       260       270       280       290        

      240         250       260           270       280       290  
pF1KE1 PGLRSLAF--RKELQDGGLRSSGFFSSFEE----SDIENHLISGHNIVQPTDIEENRTML
         :.. .:  ..:...     .:     .:    :. . .  :. . :::.: :.:::::
CCDS41 RILEDSGFDEQQEFRSRCSSVTGVQRRVHEGSQKSQPRRRHASAPSHVQPSDSEKNRTML
      300       310       320       330       340       350        

            300       310       320       330       340       350  
pF1KE1 FTIGQSEVYLISPDTKKIALEKNFKEISFCSQGIRHVDHFGFICRESSGGGGFHFVCYVF
       : .:. :. :::::::...::::::.:: :::::.::::::::::::   :  ...::::
CCDS41 FQVGRFEINLISPDTKSVVLEKNFKDISSCSQGIKHVDHFGFICRESPEPGLSQYICYVF
      360       370       380       390       400       410        

            360       370       380       390       400       410  
pF1KE1 QCTNEALVDEIMMTLKQAFTVAAVQQTAKAPAQLCEGCPLQSLHKLCERIEGMNSSKTKL
       ::..:.::::.:.::::::..::. :.::.  .:::.::..:::::::::::.   ..::
CCDS41 QCASESLVDEVMLTLKQAFSTAAALQSAKTQIKLCEACPMHSLHKLCERIEGLYPPRAKL
      420       430       440       450       460       470        

            420       430       440       450       460       470  
pF1KE1 ELQKHLTTLTNQEQATIFEEVQKLRPRNEQRENELIISFLRCLYEEKQKEHIHIGEMKQT
        .:.::..::..::: :::.:::..: ..:.::::.:  :: : : ::: :.::::  .:
CCDS41 VIQRHLSSLTDNEQADIFERVQKMKPVSDQEENELVILHLRQLCEAKQKTHVHIGEGPST
      480       490       500       510       520       530        

            480          490       500       510        520        
pF1KE1 SQMAAENIGSELPPSAT---RFRLDMLKNKAKRSLTESLESILSRG-NKARGLQEHSISV
        .      .: .: .::   ::.::.:::::::::: :::.:.::: :. ::      : 
CCDS41 IS------NSTIPENATSSGRFKLDILKNKAKRSLTSSLENIFSRGANRMRGRLGSVDSF
      540             550       560       570       580       590  

      530       540       550       560       570              580 
pF1KE1 DLDSSLSSTLSNTSKEPSVCEKEALPISESSFKLLGSSEDLSSD-------SESHLPEEP
       . ..::.:  . .  .       : : : :... .   :: .:        . :: :   
CCDS41 ERSNSLASEKDYSPGDSPPGTPPASPPS-SAWQTF-PEEDSDSPQFRRRAHTFSHPPSST
            600       610       620         630       640       650

                                     590          600       610    
pF1KE1 ---------------APL----SPQQ-----AFRR---RANTLSHFPIECQEPPQPARGS
                      .::    : .:     . ::   ..:. : .:        :.  .
CCDS41 KRKLNLQDGRAQGVRSPLLRQSSSEQCSNLSSVRRMYKESNSSSSLPSLHTSFSAPSFTA
              660       670       680       690       700       710

                 620        630       640              650         
pF1KE1 PGV-------SQRKLMRYHS-VSTETPHERKDFESK-------ANHLGDSGGTPVKTRRH
       :.        : :   .:.. .  .:  : .: :..       .:.  . ::: :  :: 
CCDS41 PSFLKSFYQNSGRLSPQYENEIRQDTASESSDGEGRKRTSSTCSNESLSVGGTSVTPRRI
              720       730       740       750       760       770

     660       670       680       690       700               710 
pF1KE1 SWRQQIFLRVATPQKACDSSSRYEDYSELGELPPRSPLEPVCEDGPF--------GPPPE
       ::::.::::::.:..   :. . .:  . .:: : ::: :. :. :.         :   
CCDS41 SWRQRIFLRVASPMNKSPSAMQQQDGLDRNELLPLSPLSPTMEEEPLVVFLSGEDDPEKI
              780       790       800       810       820       830

             720       730       740       750       760       770 
pF1KE1 EKKRTSRELRELWQKAILQQILLLRMEKENQKLQASENDLLNKRLKLDYEEITPCLKEVT
       :... :.::: ::.::: :::::::::::::::.::...: ....::::::.  : ::: 
CCDS41 EERKKSKELRSLWRKAIHQQILLLRMEKENQKLEASRDELQSRKVKLDYEEVGACQKEVL
              840       850       860       870       880       890

             780       790       800       810       820       830 
pF1KE1 TVWEKMLSTPGRSKIKFDMEKMHSAVGQGVPRHHRGEIWKFLAEQFHLKHQFPSKQQPKD
        .:.: :    :.::. ::: .:. . .:::. .:::::.::: :..:.:..:.:::: :
CCDS41 ITWDKKL-LNCRAKIRCDMEDIHTLLKEGVPKSRRGEIWQFLALQYRLRHRLPNKQQPPD
               900       910       920       930       940         

             840       850       860       870       880       890 
pF1KE1 VPYKELLKQLTSQQHAILIDLGRTFPTHPYFSAQLGAGQLSLYNILKAYSLLDQEVGYCQ
       . :::::::::.::::::.:::::::::::::.::: :::::.:.::::::::.::::::
CCDS41 ISYKELLKQLTAQQHAILVDLGRTFPTHPYFSVQLGPGQLSLFNLLKAYSLLDKEVGYCQ
     950       960       970       980       990      1000         

             900       910       920       930       940       950 
pF1KE1 GLSFVAGILLLHMSEEEAFKMLKFLMFDMGLRKQYRPDMIILQIQMYQLSRLLHDYHRDL
       :.:::::.::::::::.::.::::::.:.:.::::::::. :::::::::::::::::::
CCDS41 GISFVAGVLLLHMSEEQAFEMLKFLMYDLGFRKQYRPDMMSLQIQMYQLSRLLHDYHRDL
    1010      1020      1030      1040      1050      1060         

             960       970       980       990      1000      1010 
pF1KE1 YNHLEEHEIGPSLYAAPWFLTMFASQFPLGFVARVFDMIFLQGTEVIFKVALSLLGSHKP
       ::::::.::.:::::::::::.::::: :::::::::.:::::::::::::::::.:.. 
CCDS41 YNHLEENEISPSLYAAPWFLTLFASQFSLGFVARVFDIIFLQGTEVIFKVALSLLSSQET
    1070      1080      1090      1100      1110      1120         

            1020      1030      1040      1050      1060      1070 
pF1KE1 LILQHENLETIVDFIKSTLPNLGLVQMEKTINQVFEMDIAKQLQAYEVEYHVLQEELIDS
       ::.. :..:.::.:.:.:::...  .::: :.:::::::.:::.::::::::::.:: .:
CCDS41 LIMECESFENIVEFLKNTLPDMNTSEMEKIITQVFEMDISKQLHAYEVEYHVLQDELQES
    1130      1140      1150      1160      1170      1180         

             1080      1090      1100      1110      1120      1130
pF1KE1 S-PLSDNQRMDKLEKTNSSLRKQNLDLLEQLQVANGRIQSLEATIEKLLSSESKLKQAML
       :    :.. ..:::..::.:..::.::::.::::. .::.::...:.::. :.:.:. . 
CCDS41 SYSCEDSETLEKLERANSQLKRQNMDLLEKLQVAHTKIQALESNLENLLTRETKMKSLIR
    1190      1200      1210      1220      1230      1240         

             1140      1150      1160                     
pF1KE1 TLELERSALLQTVEELRRRSAEPSDREPECTQPEPTGD             
       ::: :. :  .:::.::.    :.:   .:                     
CCDS41 TLEQEKMAYQKTVEQLRK--LLPADALVNCDLLLRDLNCNPNNKAKIGNKP
    1250      1260        1270      1280      1290        

>>CCDS66564.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13             (1290 aa)
 initn: 3397 init1: 1520 opt: 2175  Z-score: 1821.9  bits: 349.2 E(32554): 3.7e-95
Smith-Waterman score: 3486; 49.5% identity (70.9% similar) in 1219 aa overlap (62-1160:80-1269)

              40        50        60        70        80           
pF1KE1 HSLTTMPMLPWVVAEVRRLSRQSTRKEPVTKQVRLCVSPSGLRCEPEPG---------RS
                                     ..: : .:   ::: : ::          .
CCDS66 TTLPMLPWLMAEIRRRSQKPEAGGCGAPAAREVILVLSAPFLRCVPAPGAGASGGTSPSA
      50        60        70        80        90       100         

             90       100       110       120         130       140
pF1KE1 QQWDPLIYSSIFECKPQRVHKLIHNSHDPSYFACLIKE--DAVHRQSICYVFKADDQTKV
        : .: ..  ::: : :.. ..:::::: .::: :::   :  . :  :.::.: : ..:
CCDS66 TQPNPAVF--IFEHKAQHISRFIHNSHDLTYFAYLIKAQPDDPESQMACHVFRATDPSQV
     110         120       130       140       150       160       

              150       160         170       180       190        
pF1KE1 PEIISSIRQAGKIARQEELHCPSEFDDTF--SKKFEVLFCGRVTVAHKKAPPALIDECIE
       :..:::::: .: : .:. .  .. .:.:  :.:::::.::.:::.::::: .:::.:.:
CCDS66 PDVISSIRQLSKAAMKEDAKPSKDNEDAFYNSQKFEVLYCGKVTVTHKKAPSSLIDDCME
       170       180       190       200       210       220       

      200               210                     220                
pF1KE1 KFN-H------VSG-SRGSE--------------SPRPNPPHAA---------PTGSQEP
       ::. :      ..: .:: .              ::    :. :         :.:...:
CCDS66 KFSLHEQQRLKIQGEQRGPDPGEDLADLEVVVPGSPGDCLPEEADGTDTHLGLPAGASQP
       230       240       250       260       270       280       

       230       240         250       260           270       280 
pF1KE1 GRRPMRKSFSQPGLRSLAF--RKELQDGGLRSSGFFSSFEE----SDIENHLISGHNIVQ
       .    :  : .  :.. .:  ..:...     .:     .:    :. . .  :. . ::
CCDS66 ALTSSRVCFPERILEDSGFDEQQEFRSRCSSVTGVQRRVHEGSQKSQPRRRHASAPSHVQ
       290       300       310       320       330       340       

             290       300       310       320       330       340 
pF1KE1 PTDIEENRTMLFTIGQSEVYLISPDTKKIALEKNFKEISFCSQGIRHVDHFGFICRESSG
       :.: :.:::::: .:. :. :::::::...::::::.:: :::::.::::::::::::  
CCDS66 PSDSEKNRTMLFQVGRFEINLISPDTKSVVLEKNFKDISSCSQGIKHVDHFGFICRESPE
       350       360       370       380       390       400       

             350       360       370       380       390       400 
pF1KE1 GGGFHFVCYVFQCTNEALVDEIMMTLKQAFTVAAVQQTAKAPAQLCEGCPLQSLHKLCER
        :  ...::::::..:.::::.:.::::::..::. :.::.  .:::.::..::::::::
CCDS66 PGLSQYICYVFQCASESLVDEVMLTLKQAFSTAAALQSAKTQIKLCEACPMHSLHKLCER
       410       420       430       440       450       460       

             410       420       430       440       450       460 
pF1KE1 IEGMNSSKTKLELQKHLTTLTNQEQATIFEEVQKLRPRNEQRENELIISFLRCLYEEKQK
       :::.   ..:: .:.::..::..::: :::.:::..: ..:.::::.:  :: : : :::
CCDS66 IEGLYPPRAKLVIQRHLSSLTDNEQADIFERVQKMKPVSDQEENELVILHLRQLCEAKQK
       470       480       490       500       510       520       

             470       480          490       500       510        
pF1KE1 EHIHIGEMKQTSQMAAENIGSELPPSAT---RFRLDMLKNKAKRSLTESLESILSRG-NK
        :.::::  .: .      .: .: .::   ::.::.:::::::::: :::.:.::: :.
CCDS66 THVHIGEGPSTIS------NSTIPENATSSGRFKLDILKNKAKRSLTSSLENIFSRGANR
       530       540             550       560       570       580 

       520       530       540       550       560       570       
pF1KE1 ARGLQEHSISVDLDSSLSSTLSNTSKEPSVCEKEALPISESSFKLLGSSEDLSSDSESHL
        ::      : . ..::.:            ::.  : ..:      .:    :.. . .
CCDS66 MRGRLGSVDSFERSNSLAS------------EKDYSP-GDSPPGTPPASP--PSSAWQTF
             590       600                    610         620      

       580       590       600             610                     
pF1KE1 PEEPAPLSPQQAFRRRANTLSHFP------IECQEPPQPARGSPGVSQ------------
       ::: .  :::  :::::.:.:: :      .. :.    .  :: . :            
CCDS66 PEEDSD-SPQ--FRRRAHTFSHPPSSTKRKLNLQDGRAQGVRSPLLRQSSSEQCSNLSSV
        630          640       650       660       670       680   

     620       630       640                                       
pF1KE1 RKLMRYHSVSTETPHERKDFESKA----------------------NHLGDS--------
       :....  . :.  :  . .: . .                      :...:.        
CCDS66 RRMYKESNSSSSLPSLHTSFSAPSFTAPSFLKSFYQNSGRLSPQYENEISDGEGRKRTSS
           690       700       710       720       730       740   

              650       660       670       680       690       700
pF1KE1 ---------GGTPVKTRRHSWRQQIFLRVATPQKACDSSSRYEDYSELGELPPRSPLEPV
                ::: :  :: ::::.::::::.:..   :. . .:  . .:: : ::: :.
CCDS66 TCSNESLSVGGTSVTPRRISWRQRIFLRVASPMNKSPSAMQQQDGLDRNELLPLSPLSPT
           750       760       770       780       790       800   

                      710       720       730       740       750  
pF1KE1 CEDGPF--------GPPPEEKKRTSRELRELWQKAILQQILLLRMEKENQKLQASENDLL
        :. :.         :   :... :.::: ::.::: :::::::::::::::.::...: 
CCDS66 MEEEPLVVFLSGEDDPEKIEERKKSKELRSLWRKAIHQQILLLRMEKENQKLEASRDELQ
           810       820       830       840       850       860   

            760       770       780       790       800       810  
pF1KE1 NKRLKLDYEEITPCLKEVTTVWEKMLSTPGRSKIKFDMEKMHSAVGQGVPRHHRGEIWKF
       ....::::::.  : :::  .:.: :    :.::. ::: .:. . .:::. .:::::.:
CCDS66 SRKVKLDYEEVGACQKEVLITWDKKL-LNCRAKIRCDMEDIHTLLKEGVPKSRRGEIWQF
           870       880        890       900       910       920  

            820       830       840       850       860       870  
pF1KE1 LAEQFHLKHQFPSKQQPKDVPYKELLKQLTSQQHAILIDLGRTFPTHPYFSAQLGAGQLS
       :: :..:.:..:.:::: :. :::::::::.::::::.:::::::::::::.::: ::::
CCDS66 LALQYRLRHRLPNKQQPPDISYKELLKQLTAQQHAILVDLGRTFPTHPYFSVQLGPGQLS
            930       940       950       960       970       980  

            880       890       900       910       920       930  
pF1KE1 LYNILKAYSLLDQEVGYCQGLSFVAGILLLHMSEEEAFKMLKFLMFDMGLRKQYRPDMII
       :.:.::::::::.:::::::.:::::.::::::::.::.::::::.:.:.::::::::. 
CCDS66 LFNLLKAYSLLDKEVGYCQGISFVAGVLLLHMSEEQAFEMLKFLMYDLGFRKQYRPDMMS
            990      1000      1010      1020      1030      1040  

            940       950       960       970       980       990  
pF1KE1 LQIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHLEEHEIGPSLYAAPWFLTMFASQFPLGFVARVFDMIFL
       :::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::.::::: :::::::::.:::
CCDS66 LQIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHLEENEISPSLYAAPWFLTLFASQFSLGFVARVFDIIFL
           1050      1060      1070      1080      1090      1100  

           1000      1010      1020      1030      1040      1050  
pF1KE1 QGTEVIFKVALSLLGSHKPLILQHENLETIVDFIKSTLPNLGLVQMEKTINQVFEMDIAK
       ::::::::::::::.:.. ::.. :..:.::.:.:.:::...  .::: :.:::::::.:
CCDS66 QGTEVIFKVALSLLSSQETLIMECESFENIVEFLKNTLPDMNTSEMEKIITQVFEMDISK
           1110      1120      1130      1140      1150      1160  

           1060      1070       1080      1090      1100      1110 
pF1KE1 QLQAYEVEYHVLQEELIDSS-PLSDNQRMDKLEKTNSSLRKQNLDLLEQLQVANGRIQSL
       ::.::::::::::.:: .::    :.. ..:::..::.:..::.::::.::::. .::.:
CCDS66 QLHAYEVEYHVLQDELQESSYSCEDSETLEKLERANSQLKRQNMDLLEKLQVAHTKIQAL
           1170      1180      1190      1200      1210      1220  

            1120      1130      1140      1150      1160           
pF1KE1 EATIEKLLSSESKLKQAMLTLELERSALLQTVEELRRRSAEPSDREPECTQPEPTGD   
       :...:.::. :.:.:. . ::: :. :  .:::.::.    :.:   .:           
CCDS66 ESNLENLLTRETKMKSLIRTLEQEKMAYQKTVEQLRK--LLPADALVNCDLLLRDLNCNP
           1230      1240      1250        1260      1270      1280

CCDS66 NNKAKIGNKP
             1290

>>CCDS6848.2 RABGAP1 gene_id:23637|Hs108|chr9             (1069 aa)
 initn: 642 init1: 542 opt: 732  Z-score: 615.3  bits: 125.7 E(32554): 5.9e-28
Smith-Waterman score: 742; 32.7% identity (63.5% similar) in 455 aa overlap (711-1160:484-916)

              690       700       710       720       730       740
pF1KE1 RYEDYSELGELPPRSPLEPVCEDGPFGPPPEEKKRTSRELRELWQKAILQQILLLRMEKE
                                     :..: :.    .: :..  .:  ..    :
CCDS68 LKLKQIKQRERKNNTDTLYEVVCLESESERERRKTTASPSVRLPQSG--SQSSVIPSPPE
           460       470       480       490       500         510 

              750       760       770       780       790       800
pF1KE1 NQKLQASENDLLNKRLKLDYEEITPCLKEVTTVWEKMLSTPGRSKIKFDMEKMHSAVGQG
       ... . ... ::.    .. :    : ...  .: ..::   . ...   ... : : .:
CCDS68 DDEEEDNDEPLLSGSGDVSKE----CAEKILETWGELLSK-WHLNLNVRPKQLSSLVRNG
             520       530           540        550       560      

              810       820       830       840       850       860
pF1KE1 VPRHHRGEIWKFLAEQFHLKHQFPSKQQPKDVPYKELLKQLTSQQHAILIDLGRTFPTHP
       ::.  :::.:..::   : . ..  :       :. :. . . :. ::  :..::::.: 
CCDS68 VPEALRGEVWQLLA-GCHNNDHLVEK-------YRILITKESPQDSAITRDINRTFPAHD
        570       580        590              600       610        

              870       880       890       900       910       920
pF1KE1 YFSAQLGAGQLSLYNILKAYSLLDQEVGYCQGLSFVAGILLLHMSEEEAFKMLKFLMFDM
       ::.   : :: :::.: ::::. :.:.::::: ::.:..::::: ::.::..:  .:::.
CCDS68 YFKDTGGDGQDSLYKICKAYSVYDEEIGYCQGQSFLAAVLLLHMPEEQAFSVLVKIMFDY
      620       630       640       650       660       670        

              930       940       950       960       970       980
pF1KE1 GLRKQYRPDMIILQIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHLEEHEIGPSLYAAPWFLTMFASQFPL
       :::. .. ..  :. ..::: ::...:  :::::. .  .   .::. ::::.:...:::
CCDS68 GLRELFKQNFEDLHCKFYQLERLMQEYIPDLYNHFLDISLEAHMYASQWFLTLFTAKFPL
      680       690       700       710       720       730        

              990      1000      1010      1020      1030          
pF1KE1 GFVARVFDMIFLQGTEVIFKVALSLLGSHKPLILQHENLETIVDFIKSTLPNLGLVQ--M
        .: ...:... .:  :::.:::.:: . :  .:   ..:  . :..  ::.    .   
CCDS68 YMVFHIIDLLLCEGISVIFNVALGLLKTSKDDLLL-TDFEGALKFFRVQLPKRYRSEENA
      740       750       760       770        780       790       

     1040      1050       1060      1070       1080       1090     
pF1KE1 EKTINQVFEMDIA-KQLQAYEVEYHVLQEELIDS-SPLSDNQRMDK-LEKTNSSLRKQNL
       .: .. . .: :. :.:. :: :::...:.  .. .:.   .: .. :...:  :...: 
CCDS68 KKLMELACNMKISQKKLKKYEKEYHTMREQQAQQEDPIERFERENRRLQEANMRLEQEND
       800       810       820       830       840       850       

        1100      1110      1120      1130      1140      1150     
pF1KE1 DLLEQLQVANGRIQSLEATIEKLLSSESKLKQAMLTLELERSALLQTVEELRRRSAEPSD
       :: ..:      . :  :  . : ..: :       : . .. :... :: ::   : ..
CCDS68 DLAHEL------VTSKIALRKDLDNAEEKADALNKELLMTKQKLIDAEEEKRRLEEESAQ
       860             870       880       890       900       910 

        1160                                                       
pF1KE1 REPECTQPEPTGD                                               
        .  :                                                       
CCDS68 LKEMCRRELDKAESEIKKNSSIIGDYKQICSQLSERLEKQQTANKVEIEKIRQKVDDCER
             920       930       940       950       960       970 

>>CCDS1314.1 RABGAP1L gene_id:9910|Hs108|chr1             (815 aa)
 initn: 567 init1: 524 opt: 629  Z-score: 531.0  bits: 109.7 E(32554): 3e-23
Smith-Waterman score: 640; 34.8% identity (69.0% similar) in 313 aa overlap (766-1074:505-807)

         740       750       760       770       780       790     
pF1KE1 RMEKENQKLQASENDLLNKRLKLDYEEITPCLKEVTTVWEKMLSTPGRSKIKFDMEKMHS
                                     : ...   : ..:.   .:..    . . .
CCDS13 GGGPMSPQDDEAEEESDNELSSGTGDVSKDCPEKILYSWGELLGK-WHSNLGARPKGLST
          480       490       500       510        520       530   

         800       810       820       830       840       850     
pF1KE1 AVGQGVPRHHRGEIWKFLAEQFHLKHQFPSKQQPKDVPYKELLKQLTSQQHAILIDLGRT
        : .:::.  :.:.:..::   : .. . ..       :. :. . ..:. .:  :. ::
CCDS13 LVKSGVPEALRAEVWQLLA-GCHDNQAMLDR-------YRILITKDSAQESVITRDIHRT
           540       550        560              570       580     

         860       870       880       890       900       910     
pF1KE1 FPTHPYFSAQLGAGQLSLYNILKAYSLLDQEVGYCQGLSFVAGILLLHMSEEEAFKMLKF
       ::.: ::.   : :: :::.: ::::. :...::::: ::.:..::::: ::.:: .:  
CCDS13 FPAHDYFKDTGGDGQESLYKICKAYSVYDEDIGYCQGQSFLAAVLLLHMPEEQAFCVLVK
         590       600       610       620       630       640     

         920       930       940       950       960       970     
pF1KE1 LMFDMGLRKQYRPDMIILQIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHLEEHEIGPSLYAAPWFLTMFA
       .:.:.:::  :: ..  :. ..::: ::...   ::..:. . ..   .::. ::::.:.
CCDS13 IMYDYGLRDLYRNNFEDLHCKFYQLERLMQEQLPDLHSHFSDLNLEAHMYASQWFLTLFT
         650       660       670       680       690       700     

         980       990      1000      1010      1020      1030     
pF1KE1 SQFPLGFVARVFDMIFLQGTEVIFKVALSLLGSHKPLILQHENLETIVDFIKSTLPNLGL
       ..::: .: ...:... .: ..::.:::.:: . :  .::  ..:  . :..  ::.   
CCDS13 AKFPLCMVFHIIDLLLCEGLNIIFHVALALLKTSKEDLLQ-ADFEGALKFFRVQLPKRYR
         710       720       730       740        750       760    

          1040      1050       1060       1070      1080      1090 
pF1KE1 VQ--MEKTINQVFEMDI-AKQLQAYEVEYHVLQE-ELIDSSPLSDNQRMDKLEKTNSSLR
       ..   .. ..:. .. . .:.:. :: ::....: .: . .:.                 
CCDS13 AEENARRLMEQACNIKVPTKKLKKYEKEYQTMRESQLQQEDPMDRYKFVYL         
          770       780       790       800       810              

            1100      1110      1120      1130      1140      1150 
pF1KE1 KQNLDLLEQLQVANGRIQSLEATIEKLLSSESKLKQAMLTLELERSALLQTVEELRRRSA

>>CCDS12188.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19            (794 aa)
 initn: 523 init1: 523 opt: 584  Z-score: 493.5  bits: 102.7 E(32554): 3.6e-21
Smith-Waterman score: 626; 31.1% identity (66.7% similar) in 351 aa overlap (797-1145:112-446)

        770       780       790       800       810       820      
pF1KE1 LKEVTTVWEKMLSTPGRSKIKFDMEKMHSAVGQGVPRHHRGEIWKFLAEQFHLKHQFPSK
                                     . .:.:.: :. .:..:     .    : :
CCDS12 LEEDTWILWGRIANEWEEWRRRKEKLLKELIRKGIPHHFRAIVWQLLCSATDM----PVK
              90       100       110       120       130           

        830       840       850       860       870       880      
pF1KE1 QQPKDVPYKELLKQLTSQQHAILIDLGRTFPTHPYFSAQLGAGQLSLYNILKAYSLLDQE
       .:     :.::::. .  .. :  :..::.: : .:..: . ::  :.:..:::::.:.:
CCDS12 NQ-----YSELLKMSSPCEKLIRRDIARTYPEHEFFKGQDSLGQEVLFNVMKAYSLVDRE
            140       150       160       170       180       190  

        890       900       910       920       930       940      
pF1KE1 VGYCQGLSFVAGILLLHMSEEEAFKMLKFLMFDMGLRKQYRPDMIILQIQMYQLSRLLHD
       :::::: .:..:.::..: ::::: ..  :: .. ::. ..:.:  : . .::.  .:..
CCDS12 VGYCQGSAFIVGLLLMQMPEEEAFCVFVRLMQEYRLRELFKPSMAELGLCIYQFEYMLQE
            200       210       220       230       240       250  

        950       960       970       980       990      1000      
pF1KE1 YHRDLYNHLEEHEIGPSLYAAPWFLTMFASQFPLGFVARVFDMIFLQGTEVIFKVALSLL
          :: .:.. . .  :.::. ::::.: . :::  ..::::... .: :..:.:.:.::
CCDS12 QLPDLNTHFRSQSFHTSMYASSWFLTLFLTTFPLPVATRVFDIFMYEGLEIVFRVGLALL
            260       270       280       290       300       310  

       1010      1020      1030      1040      1050       1060     
pF1KE1 GSHKPLILQHENLETIVDFIKSTLPNLGLVQMEKTINQVFEMDIA-KQLQAYEVEYHVLQ
         ..  ..: . .: . .... ..:.      .: . .....    :...  : :: ...
CCDS12 QVNQAELMQLD-MEGMSQYFQRVIPHQFDSCPDKLVLKAYQVKYNPKKMKRLEKEYAAMK
            320        330       340       350       360       370 

        1070      1080      1090      1100      1110      1120     
pF1KE1 EELIDSSPLSDNQRMDKLEKTNSSLRKQNLDLLEQLQVANGRIQSLEATIEKLLSS-ESK
            :. . .. .. .: .:.. : :: .. ::. ::. ..    . .:.. :.  ...
CCDS12 -----SKEMEEQIEIKRL-RTENRLLKQRIETLEKGQVTRAQEAEENYVIKRELAVVRQQ
                  380        390       400       410       420     

         1130      1140      1150      1160                        
pF1KE1 LKQAMLTLELERSALLQTVEELRRRSAEPSDREPECTQPEPTGD                
        ..:   :.  .:.. :  :.                                       
CCDS12 CSSAAEDLQKAQSTIRQLQEQQENPRLTEDFVSHLETELEQSRLRETETLGALREMQDKV
         430       440       450       460       470       480     

>>CCDS30774.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1                (810 aa)
 initn: 521 init1: 521 opt: 583  Z-score: 492.5  bits: 102.6 E(32554): 4.1e-21
Smith-Waterman score: 628; 27.4% identity (62.5% similar) in 493 aa overlap (664-1155:44-500)

           640       650       660       670       680       690   
pF1KE1 HERKDFESKANHLGDSGGTPVKTRRHSWRQQIFLRVATPQKACDSSSRYEDYSELGELPP
                                     :.  .::.:. .  ..:     :    : :
CCDS30 SGKQVATDKVAEKLSSTLSWVKNTVSHTVSQMASQVASPSTSLHTTSSSTTLST-PALSP
            20        30        40        50        60         70  

           700       710       720       730       740       750   
pF1KE1 RSPLEPVCEDGPFGPPPEEKKRTSRELRELWQKAILQQILLLRMEKENQKLQASENDLLN
        :: .   .:  .    ::..:    : :  .:. :...   : .. .. ...:     .
CCDS30 SSPSQLSPDDLELLAKLEEQNR----LLETDSKS-LRSVNGSRRNSGSSLVSSSSA---S
             80        90           100        110       120       

           760       770       780       790       800       810   
pF1KE1 KRLKLDYEEITPCLKEVTTVWEKMLSTPGRSKIKFDMEKMHSAVGQGVPRHHRGEIWKFL
       . :.   :.      .... :: .     :.: . .....   : .:.:.: :. .:..:
CCDS30 SNLSHLEEDSWILWGRIVNEWEDV-----RKKKEKQVKEL---VHKGIPHHFRAIVWQLL
          130       140            150          160       170      

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pF1KE1 AEQFHLKHQFPSKQQPKDVPYKELLKQLTSQQHAILIDLGRTFPTHPYFSAQLGAGQLSL
              ...: :.:     :.::::. .  .. :  :..::.: : .:. . . ::  :
CCDS30 CSA----QSMPIKDQ-----YSELLKMTSPCEKLIRRDIARTYPEHNFFKEKDSLGQEVL
            180            190       200       210       220       

           880       890       900       910       920       930   
pF1KE1 YNILKAYSLLDQEVGYCQGLSFVAGILLLHMSEEEAFKMLKFLMFDMGLRKQYRPDMIIL
       .:..:::::.:.::::::: .:..:.::..: ::::: ..  :: :. ::. ..:.:  :
CCDS30 FNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQMPEEEAFCVFVKLMQDYRLRELFKPSMAEL
       230       240       250       260       270       280       

           940       950       960       970       980       990   
pF1KE1 QIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHLEEHEIGPSLYAAPWFLTMFASQFPLGFVARVFDMIFLQ
        . :::.  .....  .:. :.. . .  :.::. ::::.: . ::: ...:.::... .
CCDS30 GLCMYQFECMIQEHLPELFVHFQSQSFHTSMYASSWFLTIFLTTFPLPIATRIFDIFMSE
       290       300       310       320       330       340       

          1000      1010      1020      1030      1040      1050   
pF1KE1 GTEVIFKVALSLLGSHKPLILQHENLETIVDFIKSTLPNLGLVQMEKTINQVFEMDI-AK
       : :..:.:.:.::  ..  ..: . .: ... .....:.      .: :. ....   .:
CCDS30 GLEIVFRVGLALLQMNQAELMQLD-MEGMLQHFQKVIPHQFDGVPDKLIQAAYQVKYNSK
       350       360       370        380       390       400      

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pF1KE1 QLQAYEVEYHVLQEELIDSSPLSDNQRMDKLEKTNSSLRKQNLDLLEQLQVANGRIQSLE
       ...  : :: .     : .. . .. .. .: .:.. : :: .. ::. . ...  ... 
CCDS30 KMKKLEKEYTT-----IKTKEMEEQVEIKRL-RTENRLLKQRIETLEKHKCSSNYNEDFV
        410            420       430        440       450       460

           1120      1130      1140      1150      1160            
pF1KE1 ATIEKLLSSESKLKQAMLTLELERSALLQTVEELRRRSAEPSDREPECTQPEPTGD    
         .:: :  ...:..:     :..  . . : ....:.    :                 
CCDS30 LQLEKELV-QARLSEAESQCALKE--MQDKVLDIEKRNNSLPDENNIARLQEELIAVKLR
               470       480         490       500       510       

CCDS30 EAEAIMGLKELRQQVKDLEEHWQRHLARTTGRWKDPPKKNAMNELQDELMTIRLREAETQ
       520       530       540       550       560       570       

>>CCDS76179.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1                (821 aa)
 initn: 552 init1: 521 opt: 580  Z-score: 489.9  bits: 102.1 E(32554): 5.7e-21
Smith-Waterman score: 627; 28.1% identity (62.0% similar) in 502 aa overlap (664-1155:44-511)

           640       650       660       670       680       690   
pF1KE1 HERKDFESKANHLGDSGGTPVKTRRHSWRQQIFLRVATPQKACDSSSRYEDYSELGELPP
                                     :.  .::.:. .  ..:     :    : :
CCDS76 SGKQVATDKVAEKLSSTLSWVKNTVSHTVSQMASQVASPSTSLHTTSSSTTLST-PALSP
            20        30        40        50        60         70  

           700       710       720       730       740       750   
pF1KE1 RSPLEPVCEDGPFGPPPEEKKRTSRELRELWQKAILQQILLLRMEKENQKLQASENDLLN
        :: .   .:  .    ::..:    : :  .:. :...   : .. .. ...:     .
CCDS76 SSPSQLSPDDLELLAKLEEQNR----LLETDSKS-LRSVNGSRRNSGSSLVSSSSA---S
             80        90           100        110       120       

           760       770       780       790       800       810   
pF1KE1 KRLKLDYEEITPCLKEVTTVWEKMLSTPGRSKIKFDMEKMHSAVGQGVPRHHRGEIWKFL
       . :.   :.      .... :: .     :.: . .....   : .:.:.: :. .:..:
CCDS76 SNLSHLEEDSWILWGRIVNEWEDV-----RKKKEKQVKEL---VHKGIPHHFRAIVWQLL
          130       140            150          160       170      

           820       830       840       850       860       870   
pF1KE1 AEQFHLKHQFPSKQQPKDVPYKELLKQLTSQQHAILIDLGRTFPTHPYFSAQLGAGQLSL
              ...: :.:     :.::::. .  .. :  :..::.: : .:. . . ::  :
CCDS76 CSA----QSMPIKDQ-----YSELLKMTSPCEKLIRRDIARTYPEHNFFKEKDSLGQEVL
            180            190       200       210       220       

           880       890       900       910       920       930   
pF1KE1 YNILKAYSLLDQEVGYCQGLSFVAGILLLHMSEEEAFKMLKFLMFDMGLRKQYRPDMIIL
       .:..:::::.:.::::::: .:..:.::..: ::::: ..  :: :. ::. ..:.:  :
CCDS76 FNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQMPEEEAFCVFVKLMQDYRLRELFKPSMAEL
       230       240       250       260       270       280       

           940       950       960       970       980       990   
pF1KE1 QIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHLEEHEIGPSLYAAPWFLTMFASQFPLGFVARVFDMIFLQ
        . :::.  .....  .:. :.. . .  :.::. ::::.: . ::: ...:.::... .
CCDS76 GLCMYQFECMIQEHLPELFVHFQSQSFHTSMYASSWFLTIFLTTFPLPIATRIFDIFMSE
       290       300       310       320       330       340       

          1000      1010      1020      1030      1040      1050   
pF1KE1 GTEVIFKVALSLLGSHKPLILQHENLETIVDFIKSTLPNLGLVQMEKTINQVFEMDI-AK
       : :..:.:.:.::  ..  ..: . .: ... .....:.      .: :. ....   .:
CCDS76 GLEIVFRVGLALLQMNQAELMQLD-MEGMLQHFQKVIPHQFDGVPDKLIQAAYQVKYNSK
       350       360       370        380       390       400      

           1060          1070           1080      1090      1100   
pF1KE1 QLQAYEVEYHVLQ----EELIDSSPL-SDN----QRMDKLEKTNSSLRKQNLDLLEQLQV
       ...  : :: ...    :: .. . : ..:    ::.. ::: ..::     : : : . 
CCDS76 KMKKLEKEYTTIKTKEMEEQVEIKRLRTENRLLKQRIETLEKESASLA----DRLIQHKC
        410       420       430       440       450           460  

          1110      1120      1130      1140      1150      1160   
pF1KE1 ANGRIQSLEATIEKLLSSESKLKQAMLTLELERSALLQTVEELRRRSAEPSDREPECTQP
       ...  ...   .:: :  ...:..:     :..  . . : ....:.    :        
CCDS76 SSNYNEDFVLQLEKELV-QARLSEAESQCALKE--MQDKVLDIEKRNNSLPDENNIARLQ
            470        480       490         500       510         

                                                                   
pF1KE1 EPTGD                                                       
                                                                   
CCDS76 EELIAVKLREAEAIMGLKELRQQVKDLEEHWQRHLARTTGRWKDPPKKNAMNELQDELMT
     520       530       540       550       560       570         




1168 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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