Result of FASTA (ccds) for
pF1KB0098
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB0098, 999 aa
1>>>pF1KB0098 999 - 999 aa - 999 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.8264+/-0.00156; mu= -10.9223+/- 0.088
mean_var=495.9108+/-115.902, 0's: 0 Z-trim(107.3): 372 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.057593
statistics sampled from 9131 (9494) to 9131 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.637), E-opt: 0.2 (0.292), width: 16
Scan time: 4.550
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2094.1 MERTK gene_id:10461|Hs108|chr2 ( 999) 6679 571.6 2.7e-162
CCDS12575.1 AXL gene_id:558|Hs108|chr19 ( 894) 2191 198.7 4.6e-50
CCDS12574.1 AXL gene_id:558|Hs108|chr19 ( 885) 2129 193.5 1.6e-48
CCDS62677.1 AXL gene_id:558|Hs108|chr19 ( 626) 1754 162.2 3.1e-39
CCDS81866.1 TYRO3 gene_id:7301|Hs108|chr15 ( 845) 1631 152.1 4.5e-36
CCDS10080.1 TYRO3 gene_id:7301|Hs108|chr15 ( 890) 1631 152.1 4.6e-36
CCDS43636.1 MET gene_id:4233|Hs108|chr7 (1390) 847 87.2 2.6e-16
CCDS47689.1 MET gene_id:4233|Hs108|chr7 (1408) 847 87.2 2.6e-16
CCDS5116.1 ROS1 gene_id:6098|Hs108|chr6 (2347) 781 81.9 1.6e-14
CCDS82777.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3 (1294) 770 80.8 2.1e-14
CCDS58833.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3 (1351) 770 80.8 2.1e-14
CCDS2807.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3 (1400) 770 80.8 2.2e-14
CCDS42487.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1370) 761 80.0 3.6e-14
CCDS12176.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1382) 761 80.0 3.6e-14
CCDS73785.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1366) 759 79.9 4e-14
CCDS10378.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1367) 759 79.9 4e-14
CCDS77820.1 RYK gene_id:6259|Hs108|chr3 ( 607) 735 77.5 9.2e-14
CCDS75016.1 RYK gene_id:6259|Hs108|chr3 ( 610) 735 77.5 9.3e-14
CCDS482.1 TIE1 gene_id:7075|Hs108|chr1 (1138) 718 76.4 3.8e-13
CCDS78389.1 TEK gene_id:7010|Hs108|chr9 ( 976) 705 75.2 7.2e-13
CCDS33172.1 ALK gene_id:238|Hs108|chr2 (1620) 710 75.9 7.6e-13
CCDS75825.1 TEK gene_id:7010|Hs108|chr9 (1081) 705 75.3 7.7e-13
CCDS6519.1 TEK gene_id:7010|Hs108|chr9 (1124) 705 75.3 7.9e-13
CCDS10078.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15 ( 803) 694 74.2 1.2e-12
CCDS10077.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15 ( 864) 694 74.3 1.2e-12
CCDS1160.1 INSRR gene_id:3645|Hs108|chr1 (1297) 691 74.2 2e-12
CCDS45237.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15 ( 734) 641 69.8 2.4e-11
CCDS46921.1 EPHB1 gene_id:2047|Hs108|chr3 ( 984) 644 70.2 2.4e-11
CCDS35050.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 822) 636 69.4 3.4e-11
CCDS6671.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 838) 636 69.4 3.4e-11
CCDS81514.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 593) 626 68.4 4.8e-11
CCDS44485.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 704) 626 68.5 5.4e-11
CCDS44487.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 705) 626 68.5 5.4e-11
CCDS44486.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 709) 626 68.5 5.5e-11
CCDS73210.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 732) 626 68.5 5.6e-11
CCDS78096.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 734) 626 68.5 5.6e-11
CCDS44488.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 680) 625 68.4 5.6e-11
CCDS4411.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 762) 626 68.5 5.7e-11
CCDS53584.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 707) 625 68.4 5.8e-11
CCDS4410.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 802) 626 68.6 5.9e-11
CCDS81515.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 819) 626 68.6 6e-11
CCDS31298.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 821) 626 68.6 6e-11
CCDS7620.2 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 822) 626 68.6 6e-11
CCDS44489.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 769) 625 68.5 6.1e-11
CCDS43731.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 731) 622 68.2 7e-11
CCDS43730.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 733) 622 68.2 7e-11
CCDS55221.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 812) 622 68.2 7.5e-11
CCDS55222.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 622 68.3 7.6e-11
CCDS43732.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 622 68.3 7.6e-11
CCDS6107.2 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 822) 622 68.3 7.6e-11
>>CCDS2094.1 MERTK gene_id:10461|Hs108|chr2 (999 aa)
initn: 6679 init1: 6679 opt: 6679 Z-score: 3027.1 bits: 571.6 E(32554): 2.7e-162
Smith-Waterman score: 6679; 99.8% identity (100.0% similar) in 999 aa overlap (1-999:1-999)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MGPAPLPLLLGLFLPALWRRAITEAREEAKPYPLFPGPFPGSLQTDHTPLLSLPHASGYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 MGPAPLPLLLGLFLPALWRRAITEAREEAKPYPLFPGPFPGSLQTDHTPLLSLPHASGYQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 PALMFSPTQPGRPHTGNVAIPQVTSVESKPLPPLAFKHTVGHIILSEHKGVKFNCSISVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 PALMFSPTQPGRPHTGNVAIPQVTSVESKPLPPLAFKHTVGHIILSEHKGVKFNCSISVP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 NIYQDTTISWWKDGKELLGAHHAITQFYPDDEVTAIIASFSITSVQRSDNGSYICKMKIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 NIYQDTTISWWKDGKELLGAHHAITQFYPDDEVTAIIASFSITSVQRSDNGSYICKMKIN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 NEEIVSDPIYIEVQGLPHFTKQPESMNVTRNTAFNLTCQAVGPPEPVNIFWVQNSSRVNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 NEEIVSDPIYIEVQGLPHFTKQPESMNVTRNTAFNLTCQAVGPPEPVNIFWVQNSSRVNE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 QPEKSPSVLTVPGLTEMAVFSCEAHNDKGLTVSKGVQINIKAIPSPPTEVSIRNSTAHSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 QPEKSPSVLTVPGLTEMAVFSCEAHNDKGLTVSKGVQINIKAIPSPPTEVSIRNSTAHSI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 LISWVPGFDGYSPFRNCSIQVKEADPLSNGSVMIFNTSALPHLYQIKQLQALANYSIGVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 LISWVPGFDGYSPFRNCSIQVKEADPLSNGSVMIFNTSALPHLYQIKQLQALANYSIGVS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 CMNEIGWSAVSPWILASTTEGAPSVAPLNVTVFLNESSDNVDIRWMKPPTKQQDGELVGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 CMNEIGWSAVSPWILASTTEGAPSVAPLNVTVFLNESSDNVDIRWMKPPTKQQDGELVGY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 RISHVWQSAGISKELLEEVGQNGSRARISVQVHNATCTVRIAAVTKGGVGPFSDPVKIFI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS20 RISHVWQSAGISKELLEEVGQNGSRARISVQVHNATCTVRIAAVTRGGVGPFSDPVKIFI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB0 PAHGWVDYAPSSTPAPGNADPVLIIFGCFCGFILIGLVLYISLAIRKRVQETKFGNAFTE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS20 PAHGWVDYAPSSTPAPGNADPVLIIFGCFCGFILIGLILYISLAIRKRVQETKFGNAFTE
490 500 510 520 530 540
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pF1KB0 EDSELVVNYIAKKSFCRRAIELTLHSLGVSEELQNKLEDVVIDRNLLILGKILGEGEFGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 EDSELVVNYIAKKSFCRRAIELTLHSLGVSEELQNKLEDVVIDRNLLILGKILGEGEFGS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB0 VMEGNLKQEDGTSLKVAVKTMKLDNSSQREIEEFLSEAACMKDFSHPNVIRLLGVCIEMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 VMEGNLKQEDGTSLKVAVKTMKLDNSSQREIEEFLSEAACMKDFSHPNVIRLLGVCIEMS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB0 SQGIPKPMVILPFMKYGDLHTYLLYSRLETGPKHIPLQTLLKFMVDIALGMEYLSNRNFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 SQGIPKPMVILPFMKYGDLHTYLLYSRLETGPKHIPLQTLLKFMVDIALGMEYLSNRNFL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB0 HRDLAARNCMLRDDMTVCVADFGLSKKIYSGDYYRQGRIAKMPVKWIAIESLADRVYTSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 HRDLAARNCMLRDDMTVCVADFGLSKKIYSGDYYRQGRIAKMPVKWIAIESLADRVYTSK
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB0 SDVWAFGVTMWEIATRGMTPYPGVQNHEMYDYLLHGHRLKQPEDCLDELYEIMYSCWRTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 SDVWAFGVTMWEIATRGMTPYPGVQNHEMYDYLLHGHRLKQPEDCLDELYEIMYSCWRTD
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB0 PLDRPTFSVLRLQLEKLLESLPDVRNQADVIYVNTQLLESSEGLAQGSTLAPLDLNIDPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 PLDRPTFSVLRLQLEKLLESLPDVRNQADVIYVNTQLLESSEGLAQGSTLAPLDLNIDPD
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB0 SIIASCTPRAAISVVTAEVHDSKPHEGRYILNGGSEEWEDLTSAPSAAVTAEKNSVLPGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 SIIASCTPRAAISVVTAEVHDSKPHEGRYILNGGSEEWEDLTSAPSAAVTAEKNSVLPGE
910 920 930 940 950 960
970 980 990
pF1KB0 RLVRNGVSWSHSSMLPLGSSLPDELLFADDSSEGSEVLM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 RLVRNGVSWSHSSMLPLGSSLPDELLFADDSSEGSEVLM
970 980 990
>>CCDS12575.1 AXL gene_id:558|Hs108|chr19 (894 aa)
initn: 1669 init1: 1263 opt: 2191 Z-score: 1012.3 bits: 198.7 E(32554): 4.6e-50
Smith-Waterman score: 2247; 42.5% identity (69.0% similar) in 910 aa overlap (81-960:27-890)
60 70 80 90 100 110
pF1KB0 LSLPHASGYQPALMFSPTQPGRPHTGNVAIPQVTSVESKPLPPLAFKHTVGHIILSEHKG
:. :..: .: : . :.: ..
CCDS12 MAWRCPRMGRVPLAWCLALCGWACMAPRGTQAEESP-----FVGNPGNITGARGLT
10 20 30 40 50
120 130 140 150 160
pF1KB0 VKFNCSISVPNIYQDTTISWWKDGKELLGAHHAITQF-YPDDEVT--AIIASFSITSVQR
. :...: . . . : .::. : : . :: .:: ..... :::.:
CCDS12 GTLRCQLQVQG--EPPEVHWLRDGQILELADSTQTQVPLGEDEQDDWIVVSQLRITSLQL
60 70 80 90 100
170 180 190 200 210 220
pF1KB0 SDNGSYICKMKINNEEIVSDPIYIEVQGLPHFTKQPESMNVTRNTAFNLTCQAVGPPEPV
::.:.: : . .... .::.: :. ..:::.: ..::. .:. :: :::.::: ::::::
CCDS12 SDTGQYQCLVFLGHQTFVSQPGYVGLEGLPYFLEEPEDRTVAANTPFNLSCQAQGPPEPV
110 120 130 140 150 160
230 240 250 260 270 280
pF1KB0 NIFWVQNSSRVNEQPEKSPS-VLTVPGLTEMAVFSCEAHNDKGLTVSKGVQINIKAIPSP
...:.:.. . : ..:. : ::::.. . ::::::: ::.:.:. . :.. .:.
CCDS12 DLLWLQDAVPLATAPGHGPQRSLHVPGLNKTSSFSCEAHNAKGVTTSRTATITV--LPQQ
170 180 190 200 210 220
290 300 310 320 330
pF1KB0 PTEVSIRNSTAHSILISWVPGFDGYSPFRNCSIQ---------VKEADPLSNGSVMIFNT
: .. . . . ..:.::..: :. .:..: .. ..: . ..
CCDS12 PRNLHLVSRQPTELEVAWTPGLSGIYPLTHCTLQAVLSDDGMGIQAGEPDPPEEPLTSQA
230 240 250 260 270 280
340 350 360 370 380 390
pF1KB0 SALPHLYQIKQLQALANYSIGVSCMNEIGWSAVSPWILASTTEGAPSVAPLNVTVFLNES
:. :: .. .:. . : : :.: . : :. . :. . : ::.: : :... : :
CCDS12 SVPPHQLRLGSLHPHTPYHIRVACTSSQGPSSWTHWLPVETPEGVPLGPPENISATRNGS
290 300 310 320 330 340
400 410 420 430 440 450
pF1KB0 SDNVDIRWMKPPTKQQDGELVGYRISHVWQSAGISKELLEEVGQNGSRARISVQVHN---
.. ..:..: . : : :.:::... :. . :.: ..: : ........
CCDS12 --QAFVHWQEPRAPLQ-GTLLGYRLAYQGQD---TPEVLMDIGL---RQEVTLELQGDGS
350 360 370 380 390
460 470 480 490 500
pF1KB0 -ATCTVRIAAVTKGGVGPFSDPVKIFI-------PAHGWVDYAPSSTPAPGNADPV-LII
.. :: .:: : .: ::.: :: . :.: : ::. :. . : ..
CCDS12 VSNLTVCVAAYTAAGDGPWSLPVPLEAWRPGQAQPVHQLVK-EPST---PAFSWPWWYVL
400 410 420 430 440 450
510 520 530 540 550 560
pF1KB0 FGCFCGFILIGLVLYISLAIRKRVQETKFGNAF--TEEDSELVVNYIAKKSFCRRAIELT
.: . . :.: . : ...: .::..:..: : : .:::: : ..::. ::. : :
CCDS12 LGAVVAAACV-LILALFL-VHRRKKETRYGEVFEPTVERGELVVRYRVRKSYSRRTTEAT
460 470 480 490 500 510
570 580 590 600 610 620
pF1KB0 LHSLGVSEELQNKLEDVVIDRNLLILGKILGEGEFGSVMEGNLKQEDGTSLKVAVKTMKL
:.:::.::::..::.::..::. . ::: :::::::.::::.:.:.:. :::::::::.
CCDS12 LNSLGISEELKEKLRDVMVDRHKVALGKTLGEGEFGAVMEGQLNQDDSI-LKVAVKTMKI
520 530 540 550 560 570
630 640 650 660 670 680
pF1KB0 DNSSQREIEEFLSEAACMKDFSHPNVIRLLGVCIEMSS-QGIPKPMVILPFMKYGDLHTY
.. :.:.:::::.:::.:.::::.::.:::.. : ...: :.:::::::.::::..
CCDS12 AICTRSELEDFLSEAVCMKEFDHPNVMRLIGVCFQGSERESFPAPVVILPFMKHGDLHSF
580 590 600 610 620 630
690 700 710 720 730 740
pF1KB0 LLYSRLETGPKHIPLQTLLKFMVDIALGMEYLSNRNFLHRDLAARNCMLRDDMTVCVADF
:::::: : ..: : :.:::.::: ::::::.. :.::::::::::: ..:.::::::
CCDS12 LLYSRLGDQPVYLPTQMLVKFMADIASGMEYLSTKRFIHRDLAARNCMLNENMSVCVADF
640 650 660 670 680 690
750 760 770 780 790 800
pF1KB0 GLSKKIYSGDYYRQGRIAKMPVKWIAIESLADRVYTSKSDVWAFGVTMWEIATRGMTPYP
:::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::.::::
CCDS12 GLSKKIYNGDYYRQGRIAKMPVKWIAIESLADRVYTSKSDVWSFGVTMWEIATRGQTPYP
700 710 720 730 740 750
810 820 830 840 850 860
pF1KB0 GVQNHEMYDYLLHGHRLKQPEDCLDELYEIMYSCWRTDPLDRPTFSVLRLQLEKLLESLP
::.: :.:::: .:.::::: :::: :: .: ::. .: :::.:. :: .::. :..::
CCDS12 GVENSEIYDYLRQGNRLKQPADCLDGLYALMSRCWELNPQDRPSFTELREDLENTLKALP
760 770 780 790 800 810
870 880 890 900 910 920
pF1KB0 DVRNQADVIYVNTQLLESSEGLAQGSTLAPLDLNIDPDSIIASCTPRAAISVVTA-EVHD
... ...::: .. . : . : . :: . . :. . : .:: :::
CCDS12 PAQEPDEILYVN---MDEGGGYPEPPGAAG---GADPPT---QPDPKDSCSCLTAAEVHP
820 830 840 850 860
930 940 950 960 970 980
pF1KB0 SKPHEGRYILNGGSEEWEDLTSAPSAAVTAEKNS-VLPGERLVRNGVSWSHSSMLPLGSS
. :::.: ...:: : :...: . ::.
CCDS12 A----GRYVLCP--------STTPSPAQPADRGSPAAPGQEDGA
870 880 890
990
pF1KB0 LPDELLFADDSSEGSEVLM
>>CCDS12574.1 AXL gene_id:558|Hs108|chr19 (885 aa)
initn: 1688 init1: 1263 opt: 2129 Z-score: 984.5 bits: 193.5 E(32554): 1.6e-48
Smith-Waterman score: 2265; 42.8% identity (69.3% similar) in 902 aa overlap (81-960:27-881)
60 70 80 90 100 110
pF1KB0 LSLPHASGYQPALMFSPTQPGRPHTGNVAIPQVTSVESKPLPPLAFKHTVGHIILSEHKG
:. :..: .: : . :.: ..
CCDS12 MAWRCPRMGRVPLAWCLALCGWACMAPRGTQAEESP-----FVGNPGNITGARGLT
10 20 30 40 50
120 130 140 150 160
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. :...: . . . : .::. : : . :: .:: ..... :::.:
CCDS12 GTLRCQLQVQG--EPPEVHWLRDGQILELADSTQTQVPLGEDEQDDWIVVSQLRITSLQL
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pF1KB0 SDNGSYICKMKINNEEIVSDPIYIEVQGLPHFTKQPESMNVTRNTAFNLTCQAVGPPEPV
::.:.: : . .... .::.: :. ..:::.: ..::. .:. :: :::.::: ::::::
CCDS12 SDTGQYQCLVFLGHQTFVSQPGYVGLEGLPYFLEEPEDRTVAANTPFNLSCQAQGPPEPV
110 120 130 140 150 160
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pF1KB0 NIFWVQNSSRVNEQPEKSPS-VLTVPGLTEMAVFSCEAHNDKGLTVSKGVQINIKAIPSP
...:.:.. . : ..:. : ::::.. . ::::::: ::.:.:. . :.. .:.
CCDS12 DLLWLQDAVPLATAPGHGPQRSLHVPGLNKTSSFSCEAHNAKGVTTSRTATITV--LPQQ
170 180 190 200 210 220
290 300 310 320 330
pF1KB0 PTEVSIRNSTAHSILISWVPGFDGYSPFRNCSIQ---------VKEADPLSNGSVMIFNT
: .. . . . ..:.::..: :. .:..: .. ..: . ..
CCDS12 PRNLHLVSRQPTELEVAWTPGLSGIYPLTHCTLQAVLSDDGMGIQAGEPDPPEEPLTSQA
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pF1KB0 SALPHLYQIKQLQALANYSIGVSCMNEIGWSAVSPWILASTTEGAPSVAPLNVTVFLNES
:. :: .. .:. . : : :.: . : :. . :. . : ::.: : :... : :
CCDS12 SVPPHQLRLGSLHPHTPYHIRVACTSSQGPSSWTHWLPVETPEGVPLGPPENISATRNGS
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.. ..:..: . : : :.:::... :. . :.: ..: : ........
CCDS12 --QAFVHWQEPRAPLQ-GTLLGYRLAYQGQD---TPEVLMDIGL---RQEVTLELQGDGS
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pF1KB0 -ATCTVRIAAVTKGGVGPFSDPVKIFIPAHGWVDYAPSSTPAPGNADPVLIIFGCFCGFI
.. :: .:: : .: ::.: :: : ..: :::: . ...: .
CCDS12 VSNLTVCVAAYTAAGDGPWSLPV----PLEAWRPVKEPSTPAF-SWPWWYVLLGAVVAAA
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. :.: . : ...: .::..:..: : : .:::: : ..::. ::. : ::.:::.::
CCDS12 CV-LILALFL-VHRRKKETRYGEVFEPTVERGELVVRYRVRKSYSRRTTEATLNSLGISE
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pF1KB0 ELQNKLEDVVIDRNLLILGKILGEGEFGSVMEGNLKQEDGTSLKVAVKTMKLDNSSQREI
::..::.::..::. . ::: :::::::.::::.:.:.:. :::::::::. .. :.
CCDS12 ELKEKLRDVMVDRHKVALGKTLGEGEFGAVMEGQLNQDDSI-LKVAVKTMKIAICTRSEL
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pF1KB0 EEFLSEAACMKDFSHPNVIRLLGVCIEMSS-QGIPKPMVILPFMKYGDLHTYLLYSRLET
:.:::::.:::.:.::::.::.:::.. : ...: :.:::::::.::::..::::::
CCDS12 EDFLSEAVCMKEFDHPNVMRLIGVCFQGSERESFPAPVVILPFMKHGDLHSFLLYSRLGD
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: ..: : :.:::.::: ::::::.. :.::::::::::: ..:.:::::::::::::.
CCDS12 QPVYLPTQMLVKFMADIASGMEYLSTKRFIHRDLAARNCMLNENMSVCVADFGLSKKIYN
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pF1KB0 GDYYRQGRIAKMPVKWIAIESLADRVYTSKSDVWAFGVTMWEIATRGMTPYPGVQNHEMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::.::::::.: :.:
CCDS12 GDYYRQGRIAKMPVKWIAIESLADRVYTSKSDVWSFGVTMWEIATRGQTPYPGVENSEIY
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::: .:.::::: :::: :: .: ::. .: :::.:. :: .::. :..:: ... ..
CCDS12 DYLRQGNRLKQPADCLDGLYALMSRCWELNPQDRPSFTELREDLENTLKALPPAQEPDEI
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.::: .. . : . : . :: . . :. . : .:: ::: . :::
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CCDS12 VLCP--------STTPSPAQPADRGSPAAPGQEDGA
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CCDS62 LHPHTPYHIRVACTSSQGPSSWTHWLPVETPEGVPLGPPENISATRNGSQ--AFVHWQEP
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CCDS62 YRQGRIAKMPVKWIAIESLADRVYTSKSDVWSFGVTMWEIATRGQTPYPGVENSEIYDYL
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CCDS62 RQGNRLKQPADCLDGLYALMSRCWELNPQDRPSFTELREDLENTLKALPPAQEPDEILYV
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CCDS62 N---MDEGGGYPEPPGAAG---GADPPT---QPDPKDSCSCLTAAEVHPA----GRYVLC
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CCDS62 P--------STTPSPAQPADRGSPAAPGQEDGA
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. :: : :.:: .. . ::. . . : ::.:.: . . .: : : .
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: .:: :. :: :: :::.:.::..:::::.: .. . ::..::.:::::: :..:
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CCDS81 FGVTMWEIMTRGQTPYAGIENAEIYNYLIGGNRLKQPPECMEDVYDLMYQCWSADPKQRP
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.:. ::..::..: .: . . : .:.: . : : : :: : .: : ..
CCDS81 SFTCLRMELENILGQLSVLSASQDPLYINIERAE--EPTAGGSLELPG--RDQPYSGAGD
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CCDS81 GSGMGAVG--------GTPSDCRYILTPGG-----LAEQPGQAEHQPESPLNETQRLLLL
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pF1KB0 RNGVSWSHSSMLPLGSSLPDELLFADDSSEGSEVLM
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CCDS81 QQGL-LPHSSC
840
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CCDS10 RLGLLLAALASLLLPESAAAGLKLMGAPVKLTVSQGQPVKLNCSV---EGMEEPDIQWVK
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pF1KB0 DGKELLGAHHAITQFYPDDEVTAIIASFSITSVQRSDNGSYICKMKINNEEIVSDPIYIE
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CCDS10 DGAVV----QNLDQLYIPVSEQHWIGFLSLKSVERSDAGRYWCQVEDGGETEISQPVWLT
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CCDS10 VEGVPFFTVEPKDLAVPPNAPFQLSCEAVGPPEPVTIVWWRGTTKIG-GPAPSPSVLNVT
140 150 160 170 180 190
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CCDS10 GVTQSTMFSCEAHNLKGLASSRTATVHLQALPAAPFNITVTKLSSSNASVAWMPGADGRA
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CCDS10 LLQSCTVQVTQA-P-GGWEVLAVVVPVPPFTCLLRDLVPATNYSLRVRCANALGPSPYAD
260 270 280 290 300 310
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pF1KB0 WILASTTEGAPSVAPLNVTVFLNESSDNVDIRWMKP-PTKQQDGELVGYRISHVWQSAGI
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CCDS10 WVPFQTKGLAPASAPQNLHAIRTDSG--LILEWEEVIPEAPLEGPLGPYKLSWV-QDNGT
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. :: : :.:: .. . ::. . . : ::.:.: . . .: : : .
CCDS10 QDELTVE----GTRANLTGWDPQKDLIVRVCVSNAVGCGPWSQP--LVVSSH---DRAGQ
370 380 390 400 410
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pF1KB0 STPAPGNADPVLIIFGCFCGFILIGLVLYISLAIRKRVQETKFGNAFTE--EDSELVVNY
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CCDS10 QGPPHSRTSWVPVVLGVLTALVTAAALALILL--RKRRKETRFGQAFDSVMARGEPAVHF
420 430 440 450 460 470
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pF1KB0 IAKKSFCRRA---IELTLHSLGVSEELQNKLEDVVIDRNLLILGKILGEGEFGSVMEGNL
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CCDS10 RAARSFNRERPERIEATLDSLGISDELKEKLEDVLIPEQQFTLGRMLGKGEFGSVREAQL
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CCDS10 KQEDGSFVKVAVKMLKADIIASSDIEEFLREAACMKEFDHPHVAKLVGVSLRSRAKGRLP
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CCDS10 IPMVILPFMKHGDLHAFLLASRIGENPFNLPLQTLIRFMVDIACGMEYLSSRNFIHRDLA
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CCDS10 ARNCMLAEDMTVCVADFGLSRKIYSGDYYRQGCASKLPVKWLALESLADNLYTVQSDVWA
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CCDS10 FGVTMWEIMTRGQTPYAGIENAEIYNYLIGGNRLKQPPECMEDVYDLMYQCWSADPKQRP
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CCDS10 SFTCLRMELENILGQLSVLSASQDPLYINIERAE--EPTAGGSLELPG--RDQPYSGAGD
780 790 800 810 820 830
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pF1KB0 CTPRAAISVVTAEVHDSKPHEGRYILNGGSEEWEDLTSAPSAAVTAEKNSVLPGERLV--
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CCDS10 GSGMGAVG--------GTPSDCRYILTPGG-----LAEQPGQAEHQPESPLNETQRLLLL
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..:. :::
CCDS10 QQGL-LPHSSC
890
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CCDS43 SKKFVHRDLAARNCMLDEKFTVKVADFGLARDMYDKEYYSVHNKTGAKLPVKWMALESLQ
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CCDS43 LKCWHPKAEMRPSFSELVSRISAIFSTFIGEHYVHVNATYVNVKCVAPYPSLLSSEDNAD
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CCDS43 DEVDTRPASFWETS
1380 1390
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CCDS47 LTDMSPILTSGDSDISSPLLQNTVHIDLSALNPELVQAVQHVVIGPSSLIVHFNEVIGRG
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CCDS47 HFGCVYHGTLLDNDGKKIHCAVKSLN-RITDIGEVSQFLTEGIIMKDFSHPNVLSLLGIC
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CCDS47 LR--SEG--SPLVVLPYMKHGDLRNFI---RNET---HNPTVKDLIGFGLQVAKGMKYLA
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CCDS47 SKKFVHRDLAARNCMLDEKFTVKVADFGLARDMYDKEYYSVHNKTGAKLPVKWMALESLQ
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CCDS47 TQKFTTKSDVWSFGVLLWELMTRGAPPYPDVNTFDITVYLLQGRRLLQPEYCPDPLYEVM
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CCDS47 LKCWHPKAEMRPSFSELVSRISAIFSTFIGEHYVHVNATYVNVKCVAPYPSLLSSEDNAD
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CCDS47 DEVDTRPASFWETS
1400
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CCDS51 RFWVELQKWKYNEFYHVKTSCSQGPAYVCNITNLQPYTSYNVRVVVVYKTGENSTSLPES
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CCDS51 FKTKAGVPN-KP-GIPKLL-EGSKN-SIQWEKA---EDNGCRITYYILEIRKST--SNNL
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CCDS51 QN---QN-LRWKMTF---NGSCSSVCTWKSKNLKGIFQFRV-VAANNLGFGEYSGISENI
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CCDS51 ILVGDDFWIPETSFILTIIVGIFLVVTIPLTFVWHRRLKNQKSAKEGVTVLINEDKELAE
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CCDS51 LRGLAAGVGLANACYAIHTLPTQEEIEN-LP--AFPREKLTLRLLLGSGAFGEVYEGTAV
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. :.. .::::::.: ...:..:: ::.:: :. :.:::... ::::. :
CCDS51 DILGVGSGEIKVAVKTLKKGSTDQEKIE-FLKEAHLMSKFNHPNILKQLGVCLLNEPQ--
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CCDS51 ---YIILELMEGGDLLTYLRKARMATFYGPL-LTLVDLVDLCVDISKGCVYLERMHFIHR
2030 2040 2050 2060 2070
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CCDS51 DLAARNCLVSVKDYTSPRIVKIGDFGLARDIYKNDYYRKRGEGLLPVRWMAPESLMDGIF
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CCDS51 TTQSDVWSFGILIWEILTLGHQPYPAHSNLDVLNYVQTGGRLEPPRNCPDDLWNLMTQCW
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CCDS51 AQEPDQRPTFHRIQDQLQLFRNFFLNSIYKSRDEANNSGVINESFEGEDGDVICLNSDDI
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CCDS51 MPVALMETKNREGLNYMVLATECGQGEEKSEGPLGSQESESCGLRKEEKEPHADKDFCQE
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CCDS82 PLPILYSGSDYRSGLALPAIDGLDSTTCVHGASFSDSEDESCVPLLRKESIQLRDLDSAL
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CCDS82 LA---------EVKDVLIPHERVVTHSDRVIGKGHFGVVYHGEYIDQAQNRIQCAIKSLS
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CCDS82 -RITEMQQVEAFLREGLLMRGLNHPNVLALIG--IMLPPEGLPH--VLLPYMCHGDL---
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CCDS82 LQFIR---SPQRNPTVKDLISFGLQVARGMEYLAEQKFVHRDLAARNCMLDESFTVKVAD
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CCDS82 FGLARDILDREYYSVQQHRHARLPVKWMALESLQTYRFTTKSDVWSFGVLLWELLTRGAP
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CCDS82 PYRHIDPFDLTHFLAQGRRLPQPEYCPDSLYQVMQQCWEADPAVRPTFRVLVGEVEQIVS
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CCDS82 ALLGDHYVQLPATYMNLGPSTSHEMNVRPEQPQFSPMPGNVRRPRPLSEPPRPT
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999 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]