Result of FASTA (ccds) for pF1KB8733
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8733, 488 aa
  1>>>pF1KB8733 488 - 488 aa - 488 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.6741+/-0.00126; mu= -2.0123+/- 0.075
 mean_var=270.6709+/-57.008, 0's: 0 Z-trim(109.9): 150  B-trim: 76 in 1/51
 Lambda= 0.077957
 statistics sampled from 11075 (11225) to 11075 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.708), E-opt: 0.2 (0.345), width:  16
 Scan time:  3.480

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS34378.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6        ( 488) 3292 384.0  2e-106
CCDS78121.1 RPP21 gene_id:202658|Hs108|chr6        ( 503) 2448 289.1 7.7e-78
CCDS34377.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6        ( 518) 1786 214.6   2e-55
CCDS3808.1 TRIM60 gene_id:166655|Hs108|chr4        ( 471) 1325 162.7 7.7e-40
CCDS44525.1 TRIM21 gene_id:6737|Hs108|chr11        ( 475) 1225 151.5 1.9e-36
CCDS1636.1 TRIM58 gene_id:25893|Hs108|chr1         ( 486) 1165 144.7 2.1e-34
CCDS31048.1 TRIM11 gene_id:81559|Hs108|chr1        ( 468) 1156 143.7   4e-34
CCDS31356.1 TRIM68 gene_id:55128|Hs108|chr11       ( 485) 1133 141.1 2.5e-33
CCDS1571.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1         ( 477) 1086 135.9 9.6e-32
CCDS4568.1 TRIM38 gene_id:10475|Hs108|chr6         ( 465) 1021 128.5 1.5e-29
CCDS32220.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15      ( 500)  934 118.8 1.4e-26
CCDS4466.1 TRIM41 gene_id:90933|Hs108|chr5         ( 630)  869 111.5 2.6e-24
CCDS376.1 TRIM62 gene_id:55223|Hs108|chr1          ( 475)  862 110.7 3.7e-24
CCDS34654.1 TRIM50 gene_id:135892|Hs108|chr7       ( 487)  812 105.0 1.8e-22
CCDS4465.1 TRIM41 gene_id:90933|Hs108|chr5         ( 518)  788 102.4 1.3e-21
CCDS31389.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11       ( 516)  769 100.2 5.5e-21
CCDS3851.1 TRIML1 gene_id:339976|Hs108|chr4        ( 468)  768 100.1 5.5e-21
CCDS31390.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11       ( 488)  760 99.2 1.1e-20
CCDS55762.1 TRIM49B gene_id:283116|Hs108|chr11     ( 452)  706 93.1 6.8e-19
CCDS4676.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6         ( 395)  704 92.8 7.2e-19
CCDS34375.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6        ( 481)  704 92.9 8.3e-19
CCDS60930.1 TRIM49D1 gene_id:399939|Hs108|chr11    ( 452)  700 92.4 1.1e-18
CCDS53693.1 TRIM64B gene_id:642446|Hs108|chr11     ( 449)  694 91.7 1.7e-18
CCDS41612.1 TRIM22 gene_id:10346|Hs108|chr11       ( 498)  690 91.3 2.5e-18
CCDS8287.1 TRIM49 gene_id:57093|Hs108|chr11        ( 452)  689 91.2 2.6e-18
CCDS53694.1 TRIM49C gene_id:642612|Hs108|chr11     ( 452)  689 91.2 2.6e-18
CCDS73363.1 TRIM64 gene_id:120146|Hs108|chr11      ( 449)  685 90.7 3.5e-18
CCDS31391.1 TRIM34 gene_id:53840|Hs108|chr11       ( 488)  684 90.6   4e-18
CCDS6056.2 TRIM35 gene_id:23087|Hs108|chr8         ( 493)  670 89.1 1.2e-17
CCDS5678.1 TRIM4 gene_id:89122|Hs108|chr7          ( 474)  667 88.7 1.5e-17
CCDS10114.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15      ( 341)  663 88.2 1.6e-17
CCDS10498.1 MEFV gene_id:4210|Hs108|chr16          ( 781)  666 88.8 2.3e-17
CCDS44327.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1        ( 343)  658 87.6 2.3e-17
CCDS32437.1 TRIM72 gene_id:493829|Hs108|chr16      ( 477)  661 88.1 2.4e-17
CCDS31393.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11        ( 493)  656 87.5 3.6e-17
CCDS475.1 ERMAP gene_id:114625|Hs108|chr1          ( 475)  651 86.9 5.1e-17
CCDS73719.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15      ( 296)  645 86.1 5.7e-17
CCDS4654.1 TRIM27 gene_id:5987|Hs108|chr6          ( 513)  646 86.4   8e-17
CCDS73287.1 TRIM64C gene_id:646754|Hs108|chr11     ( 450)  643 86.0 9.2e-17
CCDS76746.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15      ( 279)  609 82.0 9.1e-16
CCDS4614.1 BTN1A1 gene_id:696|Hs108|chr6           ( 526)  615 82.9 9.2e-16
CCDS47388.1 BTN3A1 gene_id:11119|Hs108|chr6        ( 461)  596 80.7 3.6e-15
CCDS4608.1 BTN3A1 gene_id:11119|Hs108|chr6         ( 513)  596 80.8   4e-15
CCDS4612.2 BTN3A3 gene_id:10384|Hs108|chr6         ( 535)  596 80.8 4.1e-15
CCDS4611.1 BTN3A3 gene_id:10384|Hs108|chr6         ( 584)  596 80.8 4.4e-15
CCDS81297.1 TRIM62 gene_id:55223|Hs108|chr1        ( 354)  588 79.7 5.6e-15
CCDS60929.1 TRIM77 gene_id:390231|Hs108|chr11      ( 450)  580 78.9 1.2e-14
CCDS76745.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15      ( 263)  574 78.1 1.3e-14
CCDS34374.1 TRIM31 gene_id:11074|Hs108|chr6        ( 425)  577 78.6 1.5e-14
CCDS56403.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6        ( 313)  570 77.7 2.1e-14


>>CCDS34378.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6             (488 aa)
 initn: 3292 init1: 3292 opt: 3292  Z-score: 2024.1  bits: 384.0 E(32554): 2e-106
Smith-Waterman score: 3292; 100.0% identity (100.0% similar) in 488 aa overlap (1-488:1-488)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 ERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHHEALSLFCYE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHHEALSLFCYE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 DQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEEKKPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEEKKPG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 ELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGDKRRDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGDKRRDL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 AHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQYFALRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQYFALRK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 ILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLATEGFTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLATEGFTS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB8 GRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRKGELTPLPETGYWRVRLWNGDKYAATTTPFTPLH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRKGELTPLPETGYWRVRLWNGDKYAATTTPFTPLH
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB8 IKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHIYTFTDTFTEKLWPLFYPGIRAGRKNAAPLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHIYTFTDTFTEKLWPLFYPGIRAGRKNAAPLT
              430       440       450       460       470       480

               
pF1KB8 IRPPTDWE
       ::::::::
CCDS34 IRPPTDWE
               

>>CCDS78121.1 RPP21 gene_id:202658|Hs108|chr6             (503 aa)
 initn: 2448 init1: 2448 opt: 2448  Z-score: 1510.9  bits: 289.1 E(32554): 7.7e-78
Smith-Waterman score: 2448; 100.0% identity (100.0% similar) in 368 aa overlap (1-368:1-368)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 ERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHHEALSLFCYE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 ERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHHEALSLFCYE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 DQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEEKKPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 DQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEEKKPG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 ELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGDKRRDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 ELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGDKRRDL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 AHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQYFALRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 AHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQYFALRK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 ILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLATEGFTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 ILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLATEGFTS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB8 GRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRKGELTPLPETGYWRVRLWNGDKYAATTTPFTPLH
       ::::::::                                                    
CCDS78 GRHYWEVEAAHCVLAQDPENQALARFYCYTERTIAKRLVLRRDPSVKRTLCRGCSSLLVP
              370       380       390       400       410       420

>>CCDS34377.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6             (518 aa)
 initn: 1786 init1: 1786 opt: 1786  Z-score: 1108.4  bits: 214.6 E(32554): 2e-55
Smith-Waterman score: 3222; 94.2% identity (94.2% similar) in 518 aa overlap (1-488:1-518)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 ERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHHEALSLFCYE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHHEALSLFCYE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 DQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEEKKPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEEKKPG
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pF1KB8 ELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGDKRRDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGDKRRDL
              190       200       210       220       230       240

              250       260                                     270
pF1KB8 AHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEK------------------------------CE
       ::::::::::::::::::::::::::::                              ::
CCDS34 AHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKNIPRKFGGSLSTICPRDHKALLGLVKEINRCE
              250       260       270       280       290       300

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pF1KB8 KVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQYFALRKILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQYFALRKILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVK
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pF1KB8 FVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLATEGFTSGRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRKGEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLATEGFTSGRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRKGEL
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pF1KB8 TPLPETGYWRVRLWNGDKYAATTTPFTPLHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TPLPETGYWRVRLWNGDKYAATTTPFTPLHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHI
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pF1KB8 YTFTDTFTEKLWPLFYPGIRAGRKNAAPLTIRPPTDWE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YTFTDTFTEKLWPLFYPGIRAGRKNAAPLTIRPPTDWE
              490       500       510        

>>CCDS3808.1 TRIM60 gene_id:166655|Hs108|chr4             (471 aa)
 initn: 1171 init1: 651 opt: 1325  Z-score: 828.7  bits: 162.7 E(32554): 7.7e-40
Smith-Waterman score: 1325; 43.1% identity (70.6% similar) in 473 aa overlap (19-488:6-470)

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pF1KB8 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL
                         :: ::: :.:: .::::::.:: :.::::::..:..  :.::
CCDS38              MEFVTALVNLQEESSCPICLEYLKDPVTINCGHNFCRSCLSVSWKDL
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pF1KB8 ERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQ---AVKRKIRDESLCPQHHEALSLF
       .  :::::::    :.:.: : :: ...:::::::   . ... .....: .:.. :.::
CCDS38 DDTFPCPVCRFCFPYKSFRRNPQLRNLTEIAKQLQIRRSKRKRQKENAMCEKHNQFLTLF
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pF1KB8 CYEDQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEEK
       : .: : .:  :..:  :. : . :.  :.. ..: :.  ::::....... .    . .
CCDS38 CVKDLEILCTQCSFSTKHQKHYICPIKKAASYHREILEGSLEPLRNNIERVEKVIILQGS
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pF1KB8 KPGELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGDKR
       :  :::. :: .:..:  :::...  :..::...: ....::..:: .: :: ..:.:  
CCDS38 KSVELKKKVEYKREEINSEFEQIRLFLQNEQEMILRQIQDEEMNILAKLNENLVELSDYV
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pF1KB8 RDLAHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQYFA
         : ::  ::::: .::..:.: ..::  .: ...:  :.   :..: :   ..: :: .
CCDS38 STLKHLLREVEGKSVQSNLELLTQAKSMHHKYQNLKCPEL--FSFRLTKYGFSLPPQYSG
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pF1KB8 LRKILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLATEG
       : .:.: . .:: :: .::::.:..:::::.:.. : . :..   ::::   : ::... 
CCDS38 LDRIIKPFQVDVILDLNTAHPQLLVSEDRKAVRY-ERKKRNICYDPRRFYVCPAVLGSQR
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pF1KB8 FTSGRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRKGELTPLPETGYWRVRLWNGDKYAATTTPFT
       :.:::::::::::.: .: .:::.: . :. .  :    :.: .  .  . :.:.    :
CCDS38 FSSGRHYWEVEVGNKPKWILGVCQDCLLRNWQDQPSVLGGFWAIGRYMKSGYVASGPKTT
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pF1KB8 PLHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHIYTFTDTFTEKLWPLFYPGIRAGRKNAA
        :   :::...::::::: : :::::..::: .:::.: ::: .:: :: :      .. 
CCDS38 QLLPVVKPSKIGIFLDYELGDLSFYNMNDRSILYTFNDCFTEAVWPYFYTG-----TDSE
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       480         
pF1KB8 PLTIRPPTDWE 
       :: :   .: : 
CCDS38 PLKICSVSDSER
     460       470 

>>CCDS44525.1 TRIM21 gene_id:6737|Hs108|chr11             (475 aa)
 initn: 1218 init1: 470 opt: 1225  Z-score: 767.9  bits: 151.5 E(32554): 1.9e-36
Smith-Waterman score: 1225; 41.8% identity (69.9% similar) in 471 aa overlap (15-483:2-464)

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pF1KB8 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL
                     ..:: :  .  :..: .::. . ::: :::::.::. ::..  .  
CCDS44              MASAARLTMMWEEVTCPICLDPFVEPVSIECGHSFCQECISQVGKG-
                            10        20        30        40       

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pF1KB8 ERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHHEALSLFCYE
            :::::.    ..:::::::..::.  :...   :.  .   :  : : : ::: .
CCDS44 -GGSVCPVCRQRFLLKNLRPNRQLANMVNNLKEISQEAREGTQGERCAVHGERLHLFCEK
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pF1KB8 DQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEEKKPG
       : .:.: .:: :. :: :..:::..:.:::.::::  :  :..: .   . .     : .
CCDS44 DGKALCWVCAQSRKHRDHAMVPLEEAAQEYQEKLQVALGELRRKQELAEKLEVEIAIKRA
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pF1KB8 ELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGDKRRDL
       . :. ::.....:  :: . .  : ::.:  :..::..:.. :. : :. :.:... . :
CCDS44 DWKKTVETQKSRIHAEFVQQKNFLVEEEQRQLQELEKDEREQLRILGEKEAKLAQQSQAL
         170       180       190       200       210       220     

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pF1KB8 AHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQYFALRK
        .: .:.. .: .:..:.:..:  .::. :. .  ..  .: :: ..  . :    .:.:
CCDS44 QELISELDRRCHSSALELLQEVIIVLERSESWNLKDLDITSPEL-RSVCHVP----GLKK
         230       240       250       260        270           280

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 ILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLATEGFTS
       .:.   . .::::.::.: :.:::::..:.. .:. ...: . .::  :: ::... : :
CCDS44 MLRTCAVHITLDPDTANPWLILSEDRRQVRLGDTQ-QSIPGNEERFDSYPMVLGAQHFHS
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pF1KB8 GRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRKGELTPLPETGYWRVRLWNGDKYAATTTPFTPLH
       :.:::::.:  :  : .::::::: :::..    ..:.: . ::: .:: : : : ::::
CCDS44 GKHYWEVDVTGKEAWDLGVCRDSVRRKGHFLLSSKSGFWTIWLWNKQKYEAGTYPQTPLH
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pF1KB8 IKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDR-SHIYTFTD-TFTEKLWPLFYPGIRAGRKNAAP
       ..: : .:::::::::: .::::.::. : ::.:.. .::  : :.: ::.  : ::.::
CCDS44 LQVPPCQVGIFLDYEAGMVSFYNITDHGSLIYSFSECAFTGPLRPFFSPGFNDGGKNTAP
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      480              
pF1KB8 LTIRPPTDWE      
       ::. :           
CCDS44 LTLCPLNIGSQGSTDY
     460       470     

>>CCDS1636.1 TRIM58 gene_id:25893|Hs108|chr1              (486 aa)
 initn: 1137 init1: 486 opt: 1165  Z-score: 731.3  bits: 144.7 E(32554): 2.1e-34
Smith-Waterman score: 1165; 40.3% identity (67.6% similar) in 469 aa overlap (21-485:8-461)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL
                           : :. .: : :::..:.::: ..:::.::  ::... :  
CCDS16              MAWAPPGERLREDARCPVCLDFLQEPVSVDCGHSFCLRCISEFCEKS
                            10        20        30        40       

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pF1KB8 ERD----FPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHHEALSL
       .      . :: ::   :  ..::::::...:: ...:            : .: : :: 
CCDS16 DGAQGGVYACPQCRGPFRPSGFRPNRQLAGLVESVRRLGLGAGP--GARRCARHGEDLSR
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pF1KB8 FCYEDQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEE
       :: ::. :.: .:  .  ::.: ..::..:.  :. :::  :: ....:..    ...  
CCDS16 FCEEDEAALCWVCDAGPEHRTHRTAPLQEAAGSYQVKLQMALELMRKELEDALTQEANVG
         110       120       130       140       150       160     

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pF1KB8 KKPGELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGDK
       ::    :. :: .::..  :::. .  : .:.:  : ::: ::.  ::::::. ..: ..
CCDS16 KKTVIWKEKVEMQRQRFRLEFEKHRGFLAQEEQRQLRRLEAEERATLQRLRESKSRLVQQ
         170       180       190       200       210       220     

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB8 RRDLAHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQYF
        . : .:: :.. .: . .. .:. :...: . . :  .:. .. .:: :.   .: .  
CCDS16 SKALKELADELQERCQRPALGLLEGVRGVLSRSKAVTRLEAENIPMEL-KTACCIPGR--
         230       240       250       260       270        280    

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pF1KB8 ALRKILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLATE
         :..:... .:: ::: ::::.:.:. : .::.  :   ::.:..:.::  .::.:. .
CCDS16 --RELLRKFQVDVKLDPATAHPSLLLTADLRSVQDGEP-WRDVPNNPERFDTWPCILGLQ
              290       300       310        320       330         

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pF1KB8 GFTSGRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRKGELTPLPETGYWRVRLWNGDKYAATTTPF
       .:.:::::::: ::. ..:..:::.:.. :::: :: ::.: : . : .:..: . ..: 
CCDS16 SFSSGRHYWEVLVGEGAEWGLGVCQDTLPRKGETTPSPENGVWALWLLKGNEYMVLASPS
     340       350       360       370       380       390         

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pF1KB8 TPLHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHIYTFTDTFTEKLWPLFYPGIRAGRKNA
       .::    .:. .::::::::: .::::::: :.::::.. :.  : : :.        .:
CCDS16 VPLLQLESPRCIGIFLDYEAGEISFYNVTDGSYIYTFNQLFSGLLRPYFFIC------DA
     400       410       420       430       440       450         

        480                              
pF1KB8 APLTIRPPTDWE                      
       .:: : :::                         
CCDS16 TPL-ILPPTTIAGSGNWASRDHLDPASDVRDDHL
            460       470       480      

>>CCDS31048.1 TRIM11 gene_id:81559|Hs108|chr1             (468 aa)
 initn: 1242 init1: 484 opt: 1156  Z-score: 726.0  bits: 143.7 E(32554): 4e-34
Smith-Waterman score: 1308; 45.1% identity (71.2% similar) in 466 aa overlap (22-483:9-457)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL
                            ::: ::.:..::.:. .::. .::::::. :: : : . 
CCDS31              MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCWGQP
                            10        20        30        40       

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 ERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHHEALSLFCYE
       :  . :: ::. :  :.::::: :..:.:.:..:.  .     ...:: :.: :. :: .
CCDS31 EGPYACPECRELSPQRNLRPNRPLAKMAEMARRLHPPSP--VPQGVCPAHREPLAAFCGD
        50        60        70        80          90       100     

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 DQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEEKKPG
       . . .:  :  :  : :: : ::.::... : ::.: :: :....:.    ... ..   
CCDS31 ELRLLCAACERSGEHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCV
         110       120       130       140       150       160     

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 ELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGDKRRDL
         ...:::.::..: :::.:.: : ::.: ::.:::::: ..: ::::.:::::..   :
CCDS31 LWQKMVESQRQNVLGEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHL
         170       180       190       200       210       220     

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 AHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQYFALRK
       :.: ::.::.:   .. .:.:.:..:.. . :: .    : .:: ..    :    .: .
CCDS31 AELIAELEGRCQLPALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMEL-RTVCRVP----GLVE
         230       240       250       260        270           280

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 ILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLATEGFTS
        :... .::::::.::.:.:.:::::.::.  . : . :::.:.::   ::::. : :::
CCDS31 TLRRFRGDVTLDPDTANPELILSEDRRSVQRGDLR-QALPDSPERFDPGPCVLGQERFTS
              290       300       310        320       330         

              370       380         390       400       410        
pF1KB8 GRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRK--GELTPLPETGYWRVRLWNGDKYAATTTPFTP
       :::::::::::.: ::.::::..:.::  :::.    .:.: . .. :. : ..   ..:
CCDS31 GRHYWEVEVGDRTSWALGVCRENVNRKEKGELSA--GNGFW-ILVFLGSYYNSSERALAP
     340       350       360       370          380       390      

      420       430       440       450        460       470       
pF1KB8 LHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHIYTFTDT-FTEKLWPLFYPGIRAGRKNAA
       :  .  :.::::::::::: ::::..:: : .. : .  :.  : ::: :      .. .
CCDS31 L--RDPPRRVGIFLDYEAGHLSFYSATDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPL----SSSPT
          400       410       420       430       440           450

       480               
pF1KB8 PLTI-RPPTDWE      
       :.:: ::           
CCDS31 PMTICRPKGGSGDTLAPQ
              460        

>>CCDS31356.1 TRIM68 gene_id:55128|Hs108|chr11            (485 aa)
 initn: 889 init1: 402 opt: 1133  Z-score: 711.8  bits: 141.1 E(32554): 2.5e-33
Smith-Waterman score: 1133; 38.1% identity (66.7% similar) in 480 aa overlap (18-481:5-478)

               10        20        30        40        50          
pF1KB8 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWE--
                        : .: .  :..: .:. .:.::. :.:::.::..:..  ::  
CCDS31              MDPTALVEAIVEEVACPICMTFLREPMSIDCGHSFCHSCLSGLWEIP
                            10        20        30        40       

         60        70        80        90       100       110      
pF1KB8 --DLERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHHEALSL
         . .  . ::.::   . :.:::: ::...:: .. :.         .:: .: : :..
CCDS31 GESQNWGYTCPLCRAPVQPRNLRPNWQLANVVEKVRLLRLHPGMGLKGDLCERHGEKLKM
        50        60        70        80        90       100       

        120       130       140       150       160       170      
pF1KB8 FCYEDQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEE
       :: ::   .:  :. :  :.::.:::..:.. ::: .:.. :: :... .:  . . .:.
CCDS31 FCKEDVLIMCEACSQSPEHEAHSVVPMEDVAWEYKWELHEALEHLKKEQEEAWKLEVGER
       110       120       130       140       150       160       

        180       190       200                 210       220      
pF1KB8 KKPGELKRLVESRRQQILREFEEL----------HRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRL
       :. .  :  ::.:.:.:. :::.           ::.:  :  . :. :..:  . .:.:
CCDS31 KRTATWKIQVETRKQSIVWEFEKYQRLLEKKQPPHRQLGAEVAAALASLQREAAETMQKL
       170       180       190       200       210       220       

        230       240       250       260       270       280      
pF1KB8 RENAAHLGDKRRDLAHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEK
       . : ..: .. . : .. ::.. .  .    ::.:.. .:.. .. . ..   .:.::. 
CCDS31 ELNHSELIQQSQVLWRMIAELKERSQRPVRWMLQDIQEVLNRSKSWSLQQPEPISLELKT
       230       240       250       260       270       280       

        290       300       310       320       330       340      
pF1KB8 NFSNFPRQYFALRKILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRF
       .      . ..::.:::   ::: :::.::.  :..::::: :.. .:  . :::.:.::
CCDS31 DC-----RVLGLREILKTYAADVRLDPDTAYSRLIVSEDRKRVHYGDTNQK-LPDNPERF
            290       300       310       320       330        340 

        350       360       370       380       390       400      
pF1KB8 TFYPCVLATEGFTSGRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRKGELTPLPETGYWRVRLWNG
         :  ::... ..::::::::::::...:..:::...:.::  .   :. :.: .:: .:
CCDS31 YRYNIVLGSQCISSGRHYWEVEVGDRSEWGLGVCKQNVDRKEVVYLSPHYGFWVIRLRKG
             350       360       370       380       390       400 

        410       420       430       440        450        460    
pF1KB8 DKYAATTTPFTPLHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTD-RSHIYTFTD-TFTEKLWPL
       ..: : :  .  : . : :.:::::.::::  .:::::::  :::.::    :  .: : 
CCDS31 NEYRAGTDEYPILSLPVPPRRVGIFVDYEAHDISFYNVTDCGSHIFTFPRYPFPGRLLPY
             410       420       430       440       450       460 

          470       480        
pF1KB8 FYPGIRAGRKNAAPLTIRPPTDWE
       : :    : .:.:::.:       
CCDS31 FSPCYSIGTNNTAPLAICSLDGED
             470       480     

>>CCDS1571.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1              (477 aa)
 initn: 1113 init1: 417 opt: 1086  Z-score: 683.4  bits: 135.9 E(32554): 9.6e-32
Smith-Waterman score: 1086; 37.8% identity (66.6% similar) in 473 aa overlap (23-481:10-473)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL
                             :: ::.::.::.:. .::.  ::::::.:::   ::  
CCDS15              MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKA
                            10        20        30        40       

                        70        80        90       100       110 
pF1KB8 -------ER--DFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHH
              .:  .:::: ::. :  :.: ::: : ...:.:.:  .....    .:: .::
CCDS15 RGKKGRRKRKGSFPCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQHPGLQKQ----DLCQEHH
        50        60        70        80        90           100   

             120       130       140       150       160       170 
pF1KB8 EALSLFCYEDQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRC
       : :.::: .::  .:..:  :. :: : :.: ..:.: :: ::.. .: :.... .    
CCDS15 EPLKLFCQKDQSPICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNL
           110       120       130       140       150       160   

             180       190       200       210       220       230 
pF1KB8 KSSEEKKPGELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAA
       .. ::.. .: .  :. ::..:. :::...  : ::.: ::. :: ::..  .::::..:
CCDS15 QAREEQSLAEWQGKVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVA
           170       180       190       200       210       220   

             240       250       260       270       280       290 
pF1KB8 HLGDKRRDLAHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNF
        :  . ..:  :  ..: .  :. ..::.:.:  : . ..:...    .     ..    
CCDS15 CLDRQGHSLELLLLQLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPTRPRTVCRV
           230       240       250       260       270       280   

             300       310       320       330       340       350 
pF1KB8 PRQYFALRKILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPC
       : :  .:: .:.... :.:    .:.: :.: :.:.   .  .   .   .  ::. :::
CCDS15 PGQIEVLRGFLEDVVPDAT----SAYPYLLLYESRQRRYLGSSPEGSGFCSKDRFVAYPC
           290       300           310       320       330         

             360          370       380       390       400        
pF1KB8 VLATEGFTSGRHYWEVEV---GDKTHWAVGVCRDSVSRKGELTPLPETGYWRVRLWNGDK
       ...  .:.:::::::: .   ::   ::.:::::.:::: ..   ::.:.: :.: .: :
CCDS15 AVGQTAFSSGRHYWEVGMNITGDAL-WALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTK
     340       350       360        370       380       390        

      410       420       430       440       450        460       
pF1KB8 YAATTTPFTPLHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHIYTFTD-TFTEKLWPLFYP
       : .: . .::. .   :...:::::.::: .:::.:.: ::..:... ::   : :.:  
CCDS15 YLSTFSALTPVMLMEPPSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFFCL
      400       410       420       430       440       450        

        470       480        
pF1KB8 GI-RAGRKNAAPLTIRPPTDWE
       :  ..:.   . .:.       
CCDS15 GAPKSGQMVISTVTMWVKG   
      460       470          

>>CCDS4568.1 TRIM38 gene_id:10475|Hs108|chr6              (465 aa)
 initn: 1127 init1: 400 opt: 1021  Z-score: 644.0  bits: 128.5 E(32554): 1.5e-29
Smith-Waterman score: 1116; 40.0% identity (65.6% similar) in 483 aa overlap (11-486:2-465)

               10        20        30        40        50          
pF1KB8 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWED-
                 ::..::   .:    ::.::.::  . .:: :.:::..:. ::: .... 
CCDS45          MASTTSTKKMME----EATCSICLSLMTNPVSINCGHSYCHLCITDFFKNP
                        10            20        30        40       

          60         70        80        90       100       110    
pF1KB8 ----LERD-FPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHHEAL
           :... : :: ::   .. :::::.::::..:  :. .       .:  : .: : .
CCDS45 SQKQLRQETFCCPQCRAPFHMDSLRPNKQLGSLIEALKETD-------QEMSCEEHGEQF
        50        60        70        80               90       100

          120       130       140       150       160       170    
pF1KB8 SLFCYEDQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSS
        ::: .. . .:  :  .  :..::.. ..:. : ::::::: .  :.:  .. :. : :
CCDS45 HLFCEDEGQLICWRCERAPQHKGHTTALVEDVCQGYKEKLQKAVTKLKQLEDRCTEQKLS
              110       120       130       140       150       160

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pF1KB8 EEKKPGELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLG
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