Result of FASTA (ccds) for pF1KB7295
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7295, 889 aa
  1>>>pF1KB7295 889 - 889 aa - 889 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.2949+/-0.00131; mu= -13.6885+/- 0.080
 mean_var=770.9960+/-156.539, 0's: 0 Z-trim(117.0): 35  B-trim: 58 in 1/55
 Lambda= 0.046190
 statistics sampled from 17702 (17734) to 17702 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.784), E-opt: 0.2 (0.545), width:  16
 Scan time:  5.510

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS12035.1 HCN2 gene_id:610|Hs108|chr19           ( 889) 6142 425.0 2.9e-118
CCDS10248.1 HCN4 gene_id:10021|Hs108|chr15         (1203) 3530 251.1 8.8e-66
CCDS3952.1 HCN1 gene_id:348980|Hs108|chr5          ( 890) 3344 238.6 3.9e-62
CCDS1108.1 HCN3 gene_id:57657|Hs108|chr1           ( 774) 3083 221.1 6.1e-57


>>CCDS12035.1 HCN2 gene_id:610|Hs108|chr19                (889 aa)
 initn: 6142 init1: 6142 opt: 6142  Z-score: 2236.7  bits: 425.0 E(32554): 2.9e-118
Smith-Waterman score: 6142; 100.0% identity (100.0% similar) in 889 aa overlap (1-889:1-889)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MDARGGGGRPGESPGATPAPGPPPPPPPAPPQQQPPPPPPPAPPPGPGPAPPQHPPRAEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MDARGGGGRPGESPGATPAPGPPPPPPPAPPQQQPPPPPPPAPPPGPGPAPPQHPPRAEA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 LPPEAADEGGPRGRLRSRDSSCGRPGTPGAASTAKGSPNGECGRGEPQCSPAGPEGPARG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LPPEAADEGGPRGRLRSRDSSCGRPGTPGAASTAKGSPNGECGRGEPQCSPAGPEGPARG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 PKVSFSCRGAASGPAPGPGPAEEAGSEEAGPAGEPRGSQASFMQRQFGALLQPGVNKFSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PKVSFSCRGAASGPAPGPGPAEEAGSEEAGPAGEPRGSQASFMQRQFGALLQPGVNKFSL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 RMFGSQKAVEREQERVKSAGAWIIHPYSDFRFYWDFTMLLFMVGNLIIIPVGITFFKDET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RMFGSQKAVEREQERVKSAGAWIIHPYSDFRFYWDFTMLLFMVGNLIIIPVGITFFKDET
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 TAPWIVFNVVSDTFFLMDLVLNFRTGIVIEDNTEIILDPEKIKKKYLRTWFVVDFVSSIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TAPWIVFNVVSDTFFLMDLVLNFRTGIVIEDNTEIILDPEKIKKKYLRTWFVVDFVSSIP
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 VDYIFLIVEKGIDSEVYKTARALRIVRFTKILSLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTYDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VDYIFLIVEKGIDSEVYKTARALRIVRFTKILSLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTYDL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 ASAVMRICNLISMMLLLCHWDGCLQFLVPMLQDFPRNCWVSINGMVNHSWSELYSFALFK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ASAVMRICNLISMMLLLCHWDGCLQFLVPMLQDFPRNCWVSINGMVNHSWSELYSFALFK
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB7 AMSHMLCIGYGRQAPESMTDIWLTMLSMIVGATCYAMFIGHATALIQSLDSSRRQYQEKY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AMSHMLCIGYGRQAPESMTDIWLTMLSMIVGATCYAMFIGHATALIQSLDSSRRQYQEKY
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB7 KQVEQYMSFHKLPADFRQKIHDYYEHRYQGKMFDEDSILGELNGPLREEIVNFNCRKLVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KQVEQYMSFHKLPADFRQKIHDYYEHRYQGKMFDEDSILGELNGPLREEIVNFNCRKLVA
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB7 SMPLFANADPNFVTAMLTKLKFEVFQPGDYIIREGTIGKKMYFIQHGVVSVLTKGNKEMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SMPLFANADPNFVTAMLTKLKFEVFQPGDYIIREGTIGKKMYFIQHGVVSVLTKGNKEMK
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB7 LSDGSYFGEICLLTRGRRTASVRADTYCRLYSLSVDNFNEVLEEYPMMRRAFETVAIDRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LSDGSYFGEICLLTRGRRTASVRADTYCRLYSLSVDNFNEVLEEYPMMRRAFETVAIDRL
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB7 DRIGKKNSILLHKVQHDLNSGVFNNQENAIIQEIVKYDREMVQQAELGQRVGLFPPPPPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DRIGKKNSILLHKVQHDLNSGVFNNQENAIIQEIVKYDREMVQQAELGQRVGLFPPPPPP
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB7 PQVTSAIATLQQAAAMSFCPQVARPLVGPLALGSPRLVRRPPPGPAPAAASPGPPPPASP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PQVTSAIATLQQAAAMSFCPQVARPLVGPLALGSPRLVRRPPPGPAPAAASPGPPPPASP
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB7 PGAPASPRAPRTSPYGGLPAAPLAGPALPARRLSRASRPLSASQPSLPHGAPGPAASTRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PGAPASPRAPRTSPYGGLPAAPLAGPALPARRLSRASRPLSASQPSLPHGAPGPAASTRP
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880         
pF1KB7 ASSSTPRLGPTPAARAAAPSPDRRDSASPGAAGGLDPQDSARSRLSSNL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ASSSTPRLGPTPAARAAAPSPDRRDSASPGAAGGLDPQDSARSRLSSNL
              850       860       870       880         

>>CCDS10248.1 HCN4 gene_id:10021|Hs108|chr15              (1203 aa)
 initn: 3567 init1: 3404 opt: 3530  Z-score: 1294.5  bits: 251.1 E(32554): 8.8e-66
Smith-Waterman score: 3604; 65.7% identity (75.5% similar) in 935 aa overlap (41-887:52-971)

               20        30        40        50        60        70
pF1KB7 GESPGATPAPGPPPPPPPAPPQQQPPPPPPPAPPPGPGPAPPQHPPRAEALPPEAADEGG
                                     : : :.:. :      :. ::   :::  :
CCDS10 KAWIMDEEEDAEEEGAGGRQDPSRRSIRLRPLPSPSPSAAAGGTESRSSALG--AADSEG
              30        40        50        60        70           

                           80        90       100               110
pF1KB7 P-RG-----------RLRSRDSSCGRPGTPGAASTAKGSPNG------ECGR--GEPQCS
       : ::           :.:.  .: :  :  :...:..:: .:      :  :  .: . :
CCDS10 PARGAGKSSTNGDCRRFRGSLASLGSRGG-GSGGTGSGSSHGHLHDSAEERRLIAEGDAS
      80        90       100        110       120       130        

                 120        130         140                    150 
pF1KB7 PA---GPEGPARGP-KVSFSCRGAASGPAPG--PGPAEEA-------------GSEEAG-
       :.    : : :  : . . : . ::: : :   : ::  .             :.  :: 
CCDS10 PGEDRTPPGLAAEPERPGASAQPAASPPPPQQPPQPASASCEQPSVDTAIKVEGGAAAGD
      140       150       160       170       180       190        

                 160       170       180       190       200       
pF1KB7 ---PAGEPRGSQASFMQRQFGALLQPGVNKFSLRMFGSQKAVEREQERVKSAGAWIIHPY
          : .: : .::.::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
CCDS10 QILPEAEVRLGQAGFMQRQFGAMLQPGVNKFSLRMFGSQKAVEREQERVKSAGFWIIHPY
      200       210       220       230       240       250        

       210       220       230       240       250       260       
pF1KB7 SDFRFYWDFTMLLFMVGNLIIIPVGITFFKDETTAPWIVFNVVSDTFFLMDLVLNFRTGI
       ::::::::.::::.::::::::::::::::::.:.::::::::::::::.::::::::::
CCDS10 SDFRFYWDLTMLLLMVGNLIIIPVGITFFKDENTTPWIVFNVVSDTFFLIDLVLNFRTGI
      260       270       280       290       300       310        

       270       280       290       300       310       320       
pF1KB7 VIEDNTEIILDPEKIKKKYLRTWFVVDFVSSIPVDYIFLIVEKGIDSEVYKTARALRIVR
       :.::::::::::..:: :::..::.:::.:::::::::::::  ::::::::::::::::
CCDS10 VVEDNTEIILDPQRIKMKYLKSWFMVDFISSIPVDYIFLIVETRIDSEVYKTARALRIVR
      320       330       340       350       360       370        

       330       340       350       360       370       380       
pF1KB7 FTKILSLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTYDLASAVMRICNLISMMLLLCHWDGCLQFL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: :::.:::::::::::::::
CCDS10 FTKILSLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTYDLASAVVRIVNLIGMMLLLCHWDGCLQFL
      380       390       400       410       420       430        

       390       400       410       420       430       440       
pF1KB7 VPMLQDFPRNCWVSINGMVNHSWSELYSFALFKAMSHMLCIGYGRQAPESMTDIWLTMLS
       :::::::: .::::::.:::.::.. ::.::::::::::::::::::: .:.:.::::::
CCDS10 VPMLQDFPDDCWVSINNMVNNSWGKQYSYALFKAMSHMLCIGYGRQAPVGMSDVWLTMLS
      440       450       460       470       480       490        

       450       460       470       480       490       500       
pF1KB7 MIVGATCYAMFIGHATALIQSLDSSRRQYQEKYKQVEQYMSFHKLPADFRQKIHDYYEHR
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: : ::.::::::::
CCDS10 MIVGATCYAMFIGHATALIQSLDSSRRQYQEKYKQVEQYMSFHKLPPDTRQRIHDYYEHR
      500       510       520       530       540       550        

       510       520       530       540       550       560       
pF1KB7 YQGKMFDEDSILGELNGPLREEIVNFNCRKLVASMPLFANADPNFVTAMLTKLKFEVFQP
       ::::::::.::::::. ::::::.:::::::::::::::::::::::.:::::.::::::
CCDS10 YQGKMFDEESILGELSEPLREEIINFNCRKLVASMPLFANADPNFVTSMLTKLRFEVFQP
      560       570       580       590       600       610        

       570       580       590       600       610       620       
pF1KB7 GDYIIREGTIGKKMYFIQHGVVSVLTKGNKEMKLSDGSYFGEICLLTRGRRTASVRADTY
       ::::::::::::::::::::::::::::::: ::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GDYIIREGTIGKKMYFIQHGVVSVLTKGNKETKLADGSYFGEICLLTRGRRTASVRADTY
      620       630       640       650       660       670        

       630       640       650       660       670       680       
pF1KB7 CRLYSLSVDNFNEVLEEYPMMRRAFETVAIDRLDRIGKKNSILLHKVQHDLNSGVFNNQE
       :::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS10 CRLYSLSVDNFNEVLEEYPMMRRAFETVALDRLDRIGKKNSILLHKVQHDLNSGVFNYQE
      680       690       700       710       720       730        

       690       700       710       720        730       740      
pF1KB7 NAIIQEIVKYDREMVQQAELGQRVGLFPPPPPPPQVTSAI-ATLQQAAAMSFCPQVARPL
       : :::.::..::::.. :.  : ..   : : :   :  : : :: ::: .   .::  :
CCDS10 NEIIQQIVQHDREMAHCAHRVQAAASATPTPTPVIWTPLIQAPLQAAAATT---SVAIAL
      740       750       760       770       780          790     

        750       760       770                      780       790 
pF1KB7 VGPLALGSPRLVRRPPPGPAPAAASPGPPP----------P-----ASPPGAPASPRAPR
       .    :  :  . ::::: . .  . :  :          :     ::: ..:..  .: 
CCDS10 THHPRL--PAAIFRPPPGSGLGNLGAGQTPRHLKRLQSLIPSALGSASPASSPSQVDTPS
         800         810       820       830       840       850   

                  800       810       820       830       840      
pF1KB7 TSPY-----GGLPAAPLAGPALPARRLSRASRPLSASQPSLPHGAPGPAASTRP------
       .: .     .:. :    .: ::.   : .  : . ..:: :  . : ::.:        
CCDS10 SSSFHIQQLAGFSAPAGLSPLLPSS--SSSPPPGACGSPSAPTPSAGVAATTIAGFGHFH
           860       870         880       890       900       910 

                     850           860       870              880  
pF1KB7 -------ASSSTPRLGPT-PAAR---AAAPSPDRRDSASPGAAGGLD-------PQDSAR
              .::..: : :  :.::   :: :::     : ::: :::        :  :.:
CCDS10 KALGGSLSSSDSPLLTPLQPGARSPQAAQPSP-----APPGARGGLGLPEHFLPPPPSSR
             920       930       940            950       960      

                                                                   
pF1KB7 SRLSSNL                                                     
       :  ::                                                       
CCDS10 SPSSSPGQLGQPPGELSLGLATGPLSTPETPPRQPEPPSLVAGASGGASPVGFTPRGGLS
        970       980       990      1000      1010      1020      

>>CCDS3952.1 HCN1 gene_id:348980|Hs108|chr5               (890 aa)
 initn: 3294 init1: 3208 opt: 3344  Z-score: 1229.0  bits: 238.6 E(32554): 3.9e-62
Smith-Waterman score: 3392; 65.4% identity (78.3% similar) in 835 aa overlap (68-859:2-823)

        40        50        60        70          80        90     
pF1KB7 PPPPAPPPGPGPAPPQHPPRAEALPPEAADEGG--PRGRLRSRDSSCGRPGTPGAASTAK
                                     :::  : .   :::.  :    :. ::.. 
CCDS39                              MEGGGKPNSSSNSRDD--GNSVFPAKASATG
                                            10          20         

         100        110         120       130       140       150  
pF1KB7 GSPNGECGR-GEPQCSPAGPEGPAR--GPKVSFSCRGAASGPAPGPGPAEEAGSEEAGPA
       ..: .   : : :   :.:  . :.  : .: :.  :...: . : :  : ::. :   :
CCDS39 AGPAAAEKRLGTP---PGGGGAGAKEHGNSVCFKVDGGGGGGGGGGGGEEPAGGFE--DA
      30        40           50        60        70        80      

            160       170       180       190       200       210  
pF1KB7 GEPRGSQASFMQRQFGALLQPGVNKFSLRMFGSQKAVEREQERVKSAGAWIIHPYSDFRF
         ::  : .:::::: ..::::::::::::::::::::.::::::.:: :::::::::::
CCDS39 EGPR-RQYGFMQRQFTSMLQPGVNKFSLRMFGSQKAVEKEQERVKTAGFWIIHPYSDFRF
            90       100       110       120       130       140   

            220       230       240       250       260       270  
pF1KB7 YWDFTMLLFMVGNLIIIPVGITFFKDETTAPWIVFNVVSDTFFLMDLVLNFRTGIVIEDN
       :::. ::..:::::.::::::::: ..::.:::.:::.::: ::.::..::::: : ::.
CCDS39 YWDLIMLIMMVGNLVIIPVGITFFTEQTTTPWIIFNVASDTVFLLDLIMNFRTGTVNEDS
           150       160       170       180       190       200   

            280       290       300       310       320       330  
pF1KB7 TEIILDPEKIKKKYLRTWFVVDFVSSIPVDYIFLIVEKGIDSEVYKTARALRIVRFTKIL
       .::::::. :: .::..::::::.:::::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS39 SEIILDPKVIKMNYLKSWFVVDFISSIPVDYIFLIVEKGMDSEVYKTARALRIVRFTKIL
           210       220       230       240       250       260   

            340       350       360       370       380       390  
pF1KB7 SLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTYDLASAVMRICNLISMMLLLCHWDGCLQFLVPMLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::.:: :::.:::::::::::::::::.::
CCDS39 SLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTYDLASAVVRIFNLIGMMLLLCHWDGCLQFLVPLLQ
           270       280       290       300       310       320   

            400       410       420       430       440       450  
pF1KB7 DFPRNCWVSINGMVNHSWSELYSFALFKAMSHMLCIGYGRQAPESMTDIWLTMLSMIVGA
       ::: .::::.: ::: ::.. ::.::::::::::::::: ::: ::.:.:.:::::::::
CCDS39 DFPPDCWVSLNEMVNDSWGKQYSYALFKAMSHMLCIGYGAQAPVSMSDLWITMLSMIVGA
           330       340       350       360       370       380   

            460       470       480       490       500       510  
pF1KB7 TCYAMFIGHATALIQSLDSSRRQYQEKYKQVEQYMSFHKLPADFRQKIHDYYEHRYQGKM
       ::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::.
CCDS39 TCYAMFVGHATALIQSLDSSRRQYQEKYKQVEQYMSFHKLPADMRQKIHDYYEHRYQGKI
           390       400       410       420       430       440   

            520       530       540       550       560       570  
pF1KB7 FDEDSILGELNGPLREEIVNFNCRKLVASMPLFANADPNFVTAMLTKLKFEVFQPGDYII
       :::..::.::: ::::::::::::::::.::::::::::::::::.::.:::::::::::
CCDS39 FDEENILNELNDPLREEIVNFNCRKLVATMPLFANADPNFVTAMLSKLRFEVFQPGDYII
           450       460       470       480       490       500   

            580       590       600       610       620       630  
pF1KB7 REGTIGKKMYFIQHGVVSVLTKGNKEMKLSDGSYFGEICLLTRGRRTASVRADTYCRLYS
       :::..:::::::::::..:.::..:::::.::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS39 REGAVGKKMYFIQHGVAGVITKSSKEMKLTDGSYFGEICLLTKGRRTASVRADTYCRLYS
           510       520       530       540       550       560   

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pF1KB7 LSVDNFNEVLEEYPMMRRAFETVAIDRLDRIGKKNSILLHKVQHDLNSGVFNNQENAIIQ
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.: :.:::.:::::::: :..
CCDS39 LSVDNFNEVLEEYPMMRRAFETVAIDRLDRIGKKNSILLQKFQKDLNTGVFNNQENEILK
           570       580       590       600       610       620   

            700                710              720                
pF1KB7 EIVKYDREMVQ---------QAELGQRVGLFPPP-------PPPPQVTS-----------
       .:::.::::::         .. :..  .   :        ::   .::           
CCDS39 QIVKHDREMVQAIAPINYPQMTTLNSTSSTTTPTSRMRTQSPPVYTATSLSHSNLHSPSP
           630       640       650       660       670       680   

         730               740        750       760       770      
pF1KB7 AIATLQQAAAMSFC--------PQVARPLVG-PLALGSPRLVRRPPPGPAPAAASPGPPP
       .  : : .: .: :        : :  ::..  .  .::   .       :        :
CCDS39 STQTPQPSAILSPCSYTTAVCSPPVQSPLAARTFHYASPTASQLSLMQQQPQQQVQQSQP
           690       700       710       720       730       740   

        780       790       800         810       820       830    
pF1KB7 PASPPGAPASPRAPRTSPYGGLPAAPL--AGPALPARRLSRASRPLSASQPSLPHGAPGP
       : . :  : ::. :.: : .. :   .  .  ::    :.:  :::::::::::: .   
CCDS39 PQTQPQQP-SPQ-PQT-PGSSTPKNEVHKSTQALHNTNLTREVRPLSASQPSLPHEVS--
           750          760       770       780       790          

          840       850       860       870       880              
pF1KB7 AASTRPASSSTPRLGPTPAARAAAPSPDRRDSASPGAAGGLDPQDSARSRLSSNL     
       .  .::  .    :.  :   .:.:                                   
CCDS39 TLISRPHPTVGESLASIPQPVTAVPGTGLQAGGRSTVPQRVTLFRQMSSGAIPPNRGVPP
      800       810       820       830       840       850        

>>CCDS1108.1 HCN3 gene_id:57657|Hs108|chr1                (774 aa)
 initn: 2350 init1: 2127 opt: 3083  Z-score: 1135.7  bits: 221.1 E(32554): 6.1e-57
Smith-Waterman score: 3098; 64.7% identity (79.9% similar) in 771 aa overlap (129-869:10-765)

      100       110       120       130           140       150    
pF1KB7 NGECGRGEPQCSPAGPEGPARGPKVSFSCRGAASGPAPG----PGPAEEAGSEEAGPAGE
                                     ::. : .::    :  :   ..  .::   
CCDS11                      MEAEQRPAAGASEGATPGLEAVPPVAPPPATAASGPI--
                                    10        20        30         

          160       170       180       190       200       210    
pF1KB7 PRGSQASFMQRQFGALLQPGVNKFSLRMFGSQKAVEREQERVKSAGAWIIHPYSDFRFYW
       :. :     .:..:.:::: :::::::.:::.:::: :::::::::::::::::::::::
CCDS11 PK-SGPEPKRRHLGTLLQPTVNKFSLRVFGSHKAVEIEQERVKSAGAWIIHPYSDFRFYW
         40        50        60        70        80        90      

          220       230       240       250       260       270    
pF1KB7 DFTMLLFMVGNLIIIPVGITFFKDETTAPWIVFNVVSDTFFLMDLVLNFRTGIVIEDNTE
       :. :::.::::::..::::::::.:.. :::::::.::::::.:::::::::::.:...:
CCDS11 DLIMLLLMVGNLIVLPVGITFFKEENSPPWIVFNVLSDTFFLLDLVLNFRTGIVVEEGAE
        100       110       120       130       140       150      

          280       290       300         310       320       330  
pF1KB7 IILDPEKIKKKYLRTWFVVDFVSSIPVDYIFLIVE--KGIDSEVYKTARALRIVRFTKIL
       :.: :. :. .::::::.::..::::::::::.::    .:.::::::::::::::::::
CCDS11 ILLAPRAIRTRYLRTWFLVDLISSIPVDYIFLVVELEPRLDAEVYKTARALRIVRFTKIL
        160       170       180       190       200       210      

            340       350       360       370       380       390  
pF1KB7 SLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTYDLASAVMRICNLISMMLLLCHWDGCLQFLVPMLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::.:: :::.::::::::::::::::::::
CCDS11 SLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTYDLASAVVRIFNLIGMMLLLCHWDGCLQFLVPMLQ
        220       230       240       250       260       270      

            400       410       420       430       440       450  
pF1KB7 DFPRNCWVSINGMVNHSWSELYSFALFKAMSHMLCIGYGRQAPESMTDIWLTMLSMIVGA
       ::: .:::::: ::::::.. :: :::::::::::::::.::: .: :.:::::::::::
CCDS11 DFPPDCWVSINHMVNHSWGRQYSHALFKAMSHMLCIGYGQQAPVGMPDVWLTMLSMIVGA
        280       290       300       310       320       330      

            460       470       480       490       500       510  
pF1KB7 TCYAMFIGHATALIQSLDSSRRQYQEKYKQVEQYMSFHKLPADFRQKIHDYYEHRYQGKM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::.::.::::::::::
CCDS11 TCYAMFIGHATALIQSLDSSRRQYQEKYKQVEQYMSFHKLPADTRQRIHEYYEHRYQGKM
        340       350       360       370       380       390      

            520       530       540       550       560       570  
pF1KB7 FDEDSILGELNGPLREEIVNFNCRKLVASMPLFANADPNFVTAMLTKLKFEVFQPGDYII
       :::.::::::. ::::::.::.:: ::: :::::.:::.::::.::::.:::::::: ..
CCDS11 FDEESILGELSEPLREEIINFTCRGLVAHMPLFAHADPSFVTAVLTKLRFEVFQPGDLVV
        400       410       420       430       440       450      

            580       590       600       610       620       630  
pF1KB7 REGTIGKKMYFIQHGVVSVLTKGNKEMKLSDGSYFGEICLLTRGRRTASVRADTYCRLYS
       :::..:.::::::::..:::..: .. .:.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 REGSVGRKMYFIQHGLLSVLARGARDTRLTDGSYFGEICLLTRGRRTASVRADTYCRLYS
        460       470       480       490       500       510      

            640       650       660       670       680       690  
pF1KB7 LSVDNFNEVLEEYPMMRRAFETVAIDRLDRIGKKNSILLHKVQHDLNSGVFNNQENAIIQ
       ::::.:: ::::.:::::::::::.::: ::::::::: .: . . . :   .. . . :
CCDS11 LSVDHFNAVLEEFPMMRRAFETVAMDRLLRIGKKNSILQRK-RSEPSPG---SSGGIMEQ
        520       530       540       550        560          570  

            700                710       720       730       740   
pF1KB7 EIVKYDREMVQQ---------AELGQRVGLFPPPPPPPQVTSAIATLQQAAAMSFCPQVA
       ..:..::.:..          :.:. .  :. :    :  ..:...    .:...  : .
CCDS11 HLVQHDRDMARGVRGRAPSTGAQLSGKPVLWEPLVHAPLQAAAVTS---NVAIALTHQRG
            580       590       600       610          620         

           750        760       770           780        790       
pF1KB7 RPLVGPLALGSP-RLVRRPPPGPAPAAASPGPP----PPASPPGAPASP-RAPRTS-PYG
        ::  ::.  ::  :. :     : . :::  :    : ::    :: : :. ..:   .
CCDS11 -PL--PLSPDSPATLLARSAWRSAGSPASPLVPVRAGPWASTSRLPAPPARTLHASLSRA
      630         640       650       660       670       680      

        800       810          820       830       840       850   
pF1KB7 GLPAAPLAGPALPA---RRLSRASRPLSASQPSLPHGAPGPAASTRPASSSTPRLGPT--
       :   . : ::  :.   :::.  .:::::::::::. : : ..  : .:.:  :: :.  
CCDS11 GRSQVSLLGPP-PGGGGRRLGPRGRPLSASQPSLPQRATGDGSPGRKGSGSE-RLPPSGL
        690        700       710       720       730        740    

                860       870       880         
pF1KB7 ---PAARAAAPSPDRRDSASPGAAGGLDPQDSARSRLSSNL
          :   :  : :   . :.:                    
CCDS11 LAKPPRTAQPPRPPVPEPATPRGLQLSANM           
          750       760       770               




889 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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