seq1 = pF1KE3541.tfa, 885 bp seq2 = pF1KE3541/gi568815597r_37661370.tfa (gi568815597r:37661370_37865066), 203697 bp >pF1KE3541 885 >gi568815597r:37661370_37865066 (Chr1) (complement) 1-106 (100001-100106) 100% -> 107-171 (102218-102282) 100% -> 172-885 (102984-103697) 99% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGAGACCTGCGCCGGTCCACACCCGCTGCGCCTCTTCCTCTGCCGGAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGGAGACCTGCGCCGGTCCACACCCGCTGCGCCTCTTCCTCTGCCGGAT 50 . : . : . : . : . : 51 GCAGCTCTGTCTCGCGCTGCTTTTGGGACCCTGGCGGCCTGGGACCGCCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 GCAGCTCTGTCTCGCGCTGCTTTTGGGACCCTGGCGGCCTGGGACCGCCG 100 . : . : . : . : . : 101 AGGAAG TTATCCTCCTGGATTCCAAAGCCTCCCAGGCCGAG ||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100101 AGGAAGGTG...TAGTTATCCTCCTGGATTCCAAAGCCTCCCAGGCCGAG 150 . : . : . : . : . : 142 CTGGGCTGGACTGCACTGCCAAGTAATGGG TGGGAGGAGAT ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||| 102253 CTGGGCTGGACTGCACTGCCAAGTAATGGGGTA...CAGTGGGAGGAGAT 200 . : . : . : . : . : 183 CAGCGGCGTGGATGAACACGACCGTCCCATCCGCACGTACCAAGTGTGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 102995 CAGCGGCGTGGATGAACACGACCGTCCCATCCGCACGTACCAAGTGTGCA 250 . : . : . : . : . : 233 ATGTGCTGGAGCCCAACCAGGACAACTGGCTGCAGACTGGCTGGATAAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103045 ATGTGCTGGAGCCCAACCAGGACAACTGGCTGCAGACTGGCTGGATAAGC 300 . : . : . : . : . : 283 CGTGGCCGCGGGCAGCGCATCTTCGTGGAACTGCAGTTCACACTCCGTGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103095 CGTGGCCGCGGGCAGCGCATCTTCGTGGAACTGCAGTTCACACTCCGTGA 350 . : . : . : . : . : 333 CTGCAGCAGCATCCCTGGCGCCGCGGGTACCTGCAAGGAGACCTTCAACG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103145 CTGCAGCAGCATCCCTGGCGCCGCGGGTACCTGCAAGGAGACCTTCAACG 400 . : . : . : . : . : 383 TCTACTACCTGGAAACTGAGGCCGACCTGGGCCGTGGGCGTCCCCGCCTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103195 TCTACTACCTGGAAACTGAGGCCGACCTGGGCCGTGGGCGTCCCCGCCTA 450 . : . : . : . : . : 433 GGCGGCAGCCGGCCCCGCAAAATCGACACGATCGCGGCGGACGAGAGCTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103245 GGCGGCAGCCGGCCCCGCAAAATCGACACGATCGCGGCGGACGAGAGCTT 500 . : . : . : . : . : 483 CACGCAGGGCGACCTGGGTGAGCGCAAGATGAAGCTGAACACAGAGGTGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103295 CACGCAGGGCGACCTGGGTGAGCGCAAGATGAAGCTGAACACAGAGGTGC 550 . : . : . : . : . : 533 GCGAGATCGGACCGCTCAGCCGGCGGGGTTTCCACCTGGCCTTTCAGGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103345 GCGAGATCGGACCGCTCAGCCGGCGGGGTTTCCACCTGGCCTTTCAGGAC 600 . : . : . : . : . : 583 GTGGGCGCATGCGTGGCGCTTGTCTCGGTGCGCGTCTACTACAAGCAGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103395 GTGGGCGCATGCGTGGCGCTTGTCTCGGTGCGCGTCTACTACAAGCAGTG 650 . : . : . : . : . : 633 CCGCGCCACCGTGCGGGGCCTGGCCACGTTCCCAGCCACCGCAGCCGAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103445 CCGCGCCACCGTGCGGGGCCTGGCCACGTTCCCAGCCACCGCAGCCGAGA 700 . : . : . : . : . : 683 GCGCCTTCTCCACACTGGTGGAAGTGGCCGGAACGTGCGTGGCGCACTCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103495 GCGCCTTCTCCACACTGGTGGAAGTGGCCGGAACGTGCGTGGCGCACTCG 750 . : . : . : . : . : 733 GAAGGGGAGCCTGGCAGCCCCCCACGCATGCACTGCGGCGCCGACGGCGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103545 GAAGGGGAGCCTGGCAGCCCCCCACGCATGCACTGCGGCGCCGACGGCGA 800 . : . : . : . : . : 783 GTGGCTGGTGCCTGTGGGCCGCTGCAGCTGCAGCGCGGGATTCCAGGAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103595 GTGGCTGGTGCCTGTGGGCCGCTGCAGCTGCAGCGCGGGATTCCAGGAGC 850 . : . : . : . : . : 833 GTGGTGACATCTGCGAAGGTATCCAGTTGGCTGGGGGCCGTGGGGTGGGA |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103645 GTGGTGACTTCTGCGAAGGTATCCAGTTGGCTGGGGGCCGTGGGGTGGGA 900 883 GTG ||| 103695 GTG