Result of FASTA (omim) for pF1KE4265
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE4265, 1062 aa
  1>>>pF1KE4265     1062 - 1062 aa - 1062 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  64369986 residues in 92320 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.8775+/-0.00045; mu= -3.5040+/- 0.028
 mean_var=333.1147+/-70.449, 0's: 0 Z-trim(119.2): 380  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.070271
 statistics sampled from 33986 (34393) to 33986 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.693), E-opt: 0.2 (0.373), width:  16
 Scan time:  7.650

The best scores are:                                      opt bits E(92320)
NP_001333130 (OMIM: 188470,606523) SLIT-ROBO Rho G (1062) 7046 729.4 2.9e-209
NP_001164108 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-a (1070) 4813 503.0 4.1e-141
XP_005277568 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-a (1070) 4813 503.0 4.1e-141
NP_001028289 (OMIM: 606525) SLIT-ROBO Rho GTPase-a (1075) 4812 502.9 4.4e-141
XP_016863064 (OMIM: 606525) SLIT-ROBO Rho GTPase-a (1093) 4703 491.8 9.4e-138
XP_005277567 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-a (1071) 4238 444.7 1.4e-123
NP_056141 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-acti (1071) 4238 444.7 1.4e-123
XP_011507657 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-a (1083) 4171 437.9 1.6e-121
XP_016856330 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 840) 4119 432.5 5.1e-120
NP_001287881 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 789) 4068 427.3 1.8e-118
XP_005277572 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 789) 4068 427.3 1.8e-118
XP_011536883 (OMIM: 188470,606523) SLIT-ROBO Rho G (1045) 3888 409.2 6.8e-113
XP_011536882 (OMIM: 188470,606523) SLIT-ROBO Rho G (1045) 3888 409.2 6.8e-113
NP_065813 (OMIM: 188470,606523) SLIT-ROBO Rho GTPa (1085) 3888 409.2  7e-113
XP_024301784 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 973) 3786 398.8 8.3e-110
XP_016863069 (OMIM: 606525) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 709) 3661 386.0 4.3e-106
XP_011507656 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-a (1084) 3596 379.6 5.7e-104
XP_011507658 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 986) 3566 376.5 4.4e-103
XP_011507661 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 841) 3544 374.2 1.8e-102
XP_005277571 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 790) 3493 369.1 6.2e-101
XP_024301782 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-a (1053) 3432 363.0 5.6e-99
XP_024301783 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-a (1053) 3432 363.0 5.6e-99
XP_016856327 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 931) 3180 337.4 2.5e-91
XP_016856329 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 931) 3180 337.4 2.5e-91
XP_024304865 (OMIM: 188470,606523) SLIT-ROBO Rho G ( 491) 3160 335.1 6.3e-91
XP_024304864 (OMIM: 188470,606523) SLIT-ROBO Rho G ( 545) 3076 326.7 2.5e-88
XP_011532597 (OMIM: 606525) SLIT-ROBO Rho GTPase-a (1104) 2433 261.7 1.8e-68
NP_055665 (OMIM: 606525) SLIT-ROBO Rho GTPase-acti (1099) 2423 260.7 3.6e-68
XP_011532605 (OMIM: 606525) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 591) 2364 254.5 1.4e-66
XP_011532598 (OMIM: 606525) SLIT-ROBO Rho GTPase-a (1085) 2328 251.1 2.8e-65
XP_016863068 (OMIM: 606525) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 876) 2314 249.6 6.4e-65
XP_016863063 (OMIM: 606525) SLIT-ROBO Rho GTPase-a (1117) 2314 249.6 7.7e-65
XP_024309611 (OMIM: 606525) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 984) 1818 199.3 9.6e-50
XP_024309612 (OMIM: 606525) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 984) 1818 199.3 9.6e-50
XP_016863065 (OMIM: 606525) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 979) 1808 198.3 1.9e-49
XP_024309610 (OMIM: 606525) SLIT-ROBO Rho GTPase-a (1083) 1651 182.4 1.3e-44
XP_011532603 (OMIM: 606525) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 941) 1621 179.3 9.6e-44
NP_001657 (OMIM: 300023) rho GTPase-activating pro ( 946) 1449 161.9 1.7e-38
NP_001317613 (OMIM: 614703) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 305) 1346 151.1   1e-35
XP_024304895 (OMIM: 614703) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 305) 1346 151.1   1e-35
XP_016857580 (OMIM: 614703) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 305) 1346 151.1   1e-35
XP_016857581 (OMIM: 614703) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 305) 1346 151.1   1e-35
XP_024304892 (OMIM: 614703) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 458) 1346 151.2 1.4e-35
NP_001353209 (OMIM: 614703) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 458) 1346 151.2 1.4e-35
NP_001355253 (OMIM: 614703) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 306) 1334 149.9 2.3e-35
XP_005277479 (OMIM: 614703) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 306) 1334 149.9 2.3e-35
XP_016857578 (OMIM: 614703) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 306) 1334 149.9 2.3e-35
XP_005277478 (OMIM: 614703) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 306) 1334 149.9 2.3e-35
NP_001258799 (OMIM: 614703) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 459) 1334 150.0 3.2e-35
NP_001258801 (OMIM: 614704) SLIT-ROBO Rho GTPase-a ( 458) 1320 148.6 8.5e-35


>>NP_001333130 (OMIM: 188470,606523) SLIT-ROBO Rho GTPas  (1062 aa)
 initn: 7046 init1: 7046 opt: 7046  Z-score: 3878.6  bits: 729.4 E(92320): 2.9e-209
Smith-Waterman score: 7046; 100.0% identity (100.0% similar) in 1062 aa overlap (1-1062:1-1062)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MSTPSRFKKDKEIIAEYESQVKEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSTPSRFKKDKEIIAEYESQVKEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 TEYSRNLEKLAERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TEYSRNLEKLAERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 YLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAES
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE4 KLKEAEKQEEKQIGRSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKSIKAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KLKEAEKQEEKQIGRSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKSIKAR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE4 NEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEYNLETSRHEGLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEYNLETSRHEGLD
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE4 IIENAVDNLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQPVQAELMLRYQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IIENAVDNLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQPVQAELMLRYQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE4 QLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTESVKSTVSETYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTESVKSTVSETYL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE4 SKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGEGHRAEYMTTSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGEGHRAEYMTTSR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE4 GRRNSHTRHQDSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVNDIKNSFERGENP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GRRNSHTRHQDSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVNDIKNSFERGENP
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE4 LADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFNDLISCIRIDNLYERALHIRKLLLTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFNDLISCIRIDNLYERALHIRKLLLTL
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE4 PRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMPVPEIQDQVSCQAHVNEII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMPVPEIQDQVSCQAHVNEII
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE4 KTIIIHHETIFPDAKELDGPVYEKCMAGDDYCDSPYSEHGTLEEVDQDAGTEPHTSEDEC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KTIIIHHETIFPDAKELDGPVYEKCMAGDDYCDSPYSEHGTLEEVDQDAGTEPHTSEDEC
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE4 EPIEAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGLVPHQYIVVQDMD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EPIEAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGLVPHQYIVVQDMD
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE4 DTFSDTLSQKADSEASSGPVTEDKSSSKDMNSPTDRHPDGYLARQRKRGEPPPPVRRPGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DTFSDTLSQKADSEASSGPVTEDKSSSKDMNSPTDRHPDGYLARQRKRGEPPPPVRRPGR
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE4 TSDGHCPLHPPHALSNSSVDLGSPSLASHPRGLLQNRGLNNDSPERRRRPGHGSLTNISR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TSDGHCPLHPPHALSNSSVDLGSPSLASHPRGLLQNRGLNNDSPERRRRPGHGSLTNISR
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE4 HDSLKKIDSPPIRRSTSSGQYTGFNDHKPLDPETIAQDIEETMNTALNELRELERQSTAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HDSLKKIDSPPIRRSTSSGQYTGFNDHKPLDPETIAQDIEETMNTALNELRELERQSTAK
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE4 HAPDVVLDTLEQVKNSPTPATSTESLSPLHNVALRSSEPQIRRSTSSSSDTMSTFKPMVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HAPDVVLDTLEQVKNSPTPATSTESLSPLHNVALRSSEPQIRRSTSSSSDTMSTFKPMVA
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060  
pF1KE4 PRMGVQLKPPALRPKPAVLPKTNPTIGPAPPPQGPTDKSCTM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PRMGVQLKPPALRPKPAVLPKTNPTIGPAPPPQGPTDKSCTM
             1030      1040      1050      1060  

>>NP_001164108 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-activ  (1070 aa)
 initn: 4186 init1: 1639 opt: 4813  Z-score: 2655.1  bits: 503.0 E(92320): 4.1e-141
Smith-Waterman score: 4813; 68.2% identity (86.2% similar) in 1084 aa overlap (1-1062:1-1070)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MSTPSRFKKDKEIIAEYESQVKEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
       :..:..:::::::::::..:::::::::.::.:::.:: :.:::::::::::::::::::
NP_001 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 TEYSRNLEKLAERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDI
        .::::::::::::.:::::::: ::.:::::.::::::: ::::::.:::.::.:::::
NP_001 MDYSRNLEKLAERFLAKTRSTKD-QQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTLSDI
               70        80         90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 YLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAES
       ::::.: ::.:.:::: :.::::::.. ::..::::::::::.::::::::.:.::::.:
NP_001 YLNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQS
     120       130       140       150       160       170         

              190                  200       210       220         
pF1KE4 KLKEAEKQEEKQIG-----------RSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
       ::::::::::::::           :: : . ..:.::.: :::::::::::::::::::
NP_001 KLKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
     180       190       200       210       220       230         

     230       240       250       260       270       280         
pF1KE4 SENKLKSIKARNEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEY
       .:::::.:::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::: 
NP_001 TENKLKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTFLSAEL
     240       250       260       270       280       290         

     290       300       310       320       330       340         
pF1KE4 NLETSRHEGLDIIENAVDNLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQ
       ::: :.::::: :::::.::.  :::::.::::  .:::::::::: :::: . :. :::
NP_001 NLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQQ
     300       310       320       330       340       350         

     350       360       370       380       390       400         
pF1KE4 PVQAELMLRYQQLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTE
       :::.::. : :::::::.:::::::::::: :::::::::.::.::.:::.:::.: : :
NP_001 PVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSME
     360       370       380       390       400       410         

     410       420       430       440       450       460         
pF1KE4 SVKSTVSETYLSKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGE
       :::::::::..:::::::::::::::::::: :..::::: ::::::::::::::.::::
NP_001 SVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQKTLGE
     420       430       440       450       460       470         

     470       480       490       500       510       520         
pF1KE4 GHRAEYMTTSRGRRNSHTRHQDSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVND
       ..:..    : .::.: .:.:::.:.:::.::::::::. .::::.::::::::::::::
NP_001 SQRTD---CSLARRSSTVRKQDSSQAIPLVVESCIRFISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVND
     480          490       500       510       520       530      

     530       540       550       560       570       580         
pF1KE4 IKNSFERGENPLADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFNDLISCIRIDNLYER
       :::.:::::.::: ::..::..:.::::::::::::.:::::. :.::..:. .::: ::
NP_001 IKNAFERGEDPLAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFRGLEHPLFPKDIFHDLMACVTMDNLQER
        540       550       560       570       580       590      

     590       600       610       620       630       640         
pF1KE4 ALHIRKLLLTLPRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMPVPEIQDQ
       ::::::.::.::...::.:::::::::::::.:.:::::::::::::::.:: ::: .::
NP_001 ALHIRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNHLSQFSEENMMDPYNLAICFGPSLMSVPEGHDQ
        600       610       620       630       640       650      

     650       660       670       680       690       700         
pF1KE4 VSCQAHVNEIIKTIIIHHETIFPDAKELDGPVYEKCMAGDDYCDSPYSEHGTLEEVDQDA
       :::::::::.::::::.::.:::. .::.:::: .  . .::::::..:  ..:.  ::.
NP_001 VSCQAHVNELIKTIIIQHENIFPSPRELEGPVYSRGGSMEDYCDSPHGETTSVEDSTQDV
        660       670       680       690       700       710      

     710       720       730       740       750       760         
pF1KE4 GTEPHTSEDECEPIEAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGLV
        .: :::.:::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::.:::::::::::::.
NP_001 TAEHHTSDDECEPIEAIAKFDYVGRTARELSFKKGASLLLYQRASDDWWEGRHNGIDGLI
        720       730       740       750       760       770      

     770       780       790       800       810        820        
pF1KE4 PHQYIVVQDMDDTFSDTLSQKADSEASSGPVTEDKSSSKDMNSPTDRH-PDGYLA---RQ
       ::::::::: .:   .  : :.. :. : :  :  ..    . :.  :  : :::   .:
NP_001 PHQYIVVQDTEDGVVERSSPKSEIEVISEPPEEKVTARAGASCPSGGHVADIYLANINKQ
        780       790       800       810       820       830      

         830       840       850       860       870          880  
pF1KE4 RKRGEPPPPVRRPGRTSDGHCPLHPPHALSNSSVDLGSPSLASHPRGLLQ---NRGLNND
       ::: :    .:.  : ::.:       .::.: .: .::....  :   :   ...: ..
NP_001 RKRPESGS-IRKTFR-SDSH-------GLSSSLTDSSSPGVGASCRPSSQPIMSQSLPKE
        840        850               860       870       880       

            890       900        910       920       930       940 
pF1KE4 SPERRRRPGHGSLTNISRHDSLK-KIDSPPIRRSTSSGQYTGFNDHKPLDPETIAQDIEE
       .:..    :::::..::::.::: ..::: ::.....:.  .::.:.:.:::.:::::: 
NP_001 GPDKCSISGHGSLNSISRHSSLKNRLDSPQIRKTATAGRSKSFNNHRPMDPEVIAQDIEA
       890       900       910       920       930       940       

             950       960       970       980       990      1000 
pF1KE4 TMNTALNELRELERQSTAKHAPDVVLDTLEQVKNSPTPATSTESLSPLHNVALRSSEPQI
       :::.::::::::::::..::.::::::::: .:.::. : ..:  ::::.  :.. :: .
NP_001 TMNSALNELRELERQSSVKHTPDVVLDTLEPLKTSPVVAPTSEPSSPLHTQLLKDPEPAF
       950       960       970       980       990      1000       

            1010      1020      1030      1040         1050        
pF1KE4 RRSTSSSSDTMSTFKPMVAPRMGVQLKPPALRPKPAVLPKTN---PTIGPAPPPQGPTDK
       .::.:...:   .:.:. . .:.. .:::: ::::.:.::::   : .. .  ::. :::
NP_001 QRSASTAGDIACAFRPVKSVKMAAPVKPPATRPKPTVFPKTNATSPGVNSSTSPQS-TDK
      1010      1020      1030      1040      1050      1060       

     1060  
pF1KE4 SCTM
       :::.
NP_001 SCTV
       1070

>>XP_005277568 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-activ  (1070 aa)
 initn: 4186 init1: 1639 opt: 4813  Z-score: 2655.1  bits: 503.0 E(92320): 4.1e-141
Smith-Waterman score: 4813; 68.2% identity (86.2% similar) in 1084 aa overlap (1-1062:1-1070)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MSTPSRFKKDKEIIAEYESQVKEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
       :..:..:::::::::::..:::::::::.::.:::.:: :.:::::::::::::::::::
XP_005 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 TEYSRNLEKLAERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDI
        .::::::::::::.:::::::: ::.:::::.::::::: ::::::.:::.::.:::::
XP_005 MDYSRNLEKLAERFLAKTRSTKD-QQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTLSDI
               70        80         90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 YLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAES
       ::::.: ::.:.:::: :.::::::.. ::..::::::::::.::::::::.:.::::.:
XP_005 YLNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQS
     120       130       140       150       160       170         

              190                  200       210       220         
pF1KE4 KLKEAEKQEEKQIG-----------RSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
       ::::::::::::::           :: : . ..:.::.: :::::::::::::::::::
XP_005 KLKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
     180       190       200       210       220       230         

     230       240       250       260       270       280         
pF1KE4 SENKLKSIKARNEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEY
       .:::::.:::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::: 
XP_005 TENKLKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTFLSAEL
     240       250       260       270       280       290         

     290       300       310       320       330       340         
pF1KE4 NLETSRHEGLDIIENAVDNLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQ
       ::: :.::::: :::::.::.  :::::.::::  .:::::::::: :::: . :. :::
XP_005 NLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQQ
     300       310       320       330       340       350         

     350       360       370       380       390       400         
pF1KE4 PVQAELMLRYQQLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTE
       :::.::. : :::::::.:::::::::::: :::::::::.::.::.:::.:::.: : :
XP_005 PVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSME
     360       370       380       390       400       410         

     410       420       430       440       450       460         
pF1KE4 SVKSTVSETYLSKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGE
       :::::::::..:::::::::::::::::::: :..::::: ::::::::::::::.::::
XP_005 SVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQKTLGE
     420       430       440       450       460       470         

     470       480       490       500       510       520         
pF1KE4 GHRAEYMTTSRGRRNSHTRHQDSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVND
       ..:..    : .::.: .:.:::.:.:::.::::::::. .::::.::::::::::::::
XP_005 SQRTD---CSLARRSSTVRKQDSSQAIPLVVESCIRFISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVND
     480          490       500       510       520       530      

     530       540       550       560       570       580         
pF1KE4 IKNSFERGENPLADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFNDLISCIRIDNLYER
       :::.:::::.::: ::..::..:.::::::::::::.:::::. :.::..:. .::: ::
XP_005 IKNAFERGEDPLAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFRGLEHPLFPKDIFHDLMACVTMDNLQER
        540       550       560       570       580       590      

     590       600       610       620       630       640         
pF1KE4 ALHIRKLLLTLPRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMPVPEIQDQ
       ::::::.::.::...::.:::::::::::::.:.:::::::::::::::.:: ::: .::
XP_005 ALHIRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNHLSQFSEENMMDPYNLAICFGPSLMSVPEGHDQ
        600       610       620       630       640       650      

     650       660       670       680       690       700         
pF1KE4 VSCQAHVNEIIKTIIIHHETIFPDAKELDGPVYEKCMAGDDYCDSPYSEHGTLEEVDQDA
       :::::::::.::::::.::.:::. .::.:::: .  . .::::::..:  ..:.  ::.
XP_005 VSCQAHVNELIKTIIIQHENIFPSPRELEGPVYSRGGSMEDYCDSPHGETTSVEDSTQDV
        660       670       680       690       700       710      

     710       720       730       740       750       760         
pF1KE4 GTEPHTSEDECEPIEAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGLV
        .: :::.:::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::.:::::::::::::.
XP_005 TAEHHTSDDECEPIEAIAKFDYVGRTARELSFKKGASLLLYQRASDDWWEGRHNGIDGLI
        720       730       740       750       760       770      

     770       780       790       800       810        820        
pF1KE4 PHQYIVVQDMDDTFSDTLSQKADSEASSGPVTEDKSSSKDMNSPTDRH-PDGYLA---RQ
       ::::::::: .:   .  : :.. :. : :  :  ..    . :.  :  : :::   .:
XP_005 PHQYIVVQDTEDGVVERSSPKSEIEVISEPPEEKVTARAGASCPSGGHVADIYLANINKQ
        780       790       800       810       820       830      

         830       840       850       860       870          880  
pF1KE4 RKRGEPPPPVRRPGRTSDGHCPLHPPHALSNSSVDLGSPSLASHPRGLLQ---NRGLNND
       ::: :    .:.  : ::.:       .::.: .: .::....  :   :   ...: ..
XP_005 RKRPESGS-IRKTFR-SDSH-------GLSSSLTDSSSPGVGASCRPSSQPIMSQSLPKE
        840        850               860       870       880       

            890       900        910       920       930       940 
pF1KE4 SPERRRRPGHGSLTNISRHDSLK-KIDSPPIRRSTSSGQYTGFNDHKPLDPETIAQDIEE
       .:..    :::::..::::.::: ..::: ::.....:.  .::.:.:.:::.:::::: 
XP_005 GPDKCSISGHGSLNSISRHSSLKNRLDSPQIRKTATAGRSKSFNNHRPMDPEVIAQDIEA
       890       900       910       920       930       940       

             950       960       970       980       990      1000 
pF1KE4 TMNTALNELRELERQSTAKHAPDVVLDTLEQVKNSPTPATSTESLSPLHNVALRSSEPQI
       :::.::::::::::::..::.::::::::: .:.::. : ..:  ::::.  :.. :: .
XP_005 TMNSALNELRELERQSSVKHTPDVVLDTLEPLKTSPVVAPTSEPSSPLHTQLLKDPEPAF
       950       960       970       980       990      1000       

            1010      1020      1030      1040         1050        
pF1KE4 RRSTSSSSDTMSTFKPMVAPRMGVQLKPPALRPKPAVLPKTN---PTIGPAPPPQGPTDK
       .::.:...:   .:.:. . .:.. .:::: ::::.:.::::   : .. .  ::. :::
XP_005 QRSASTAGDIACAFRPVKSVKMAAPVKPPATRPKPTVFPKTNATSPGVNSSTSPQS-TDK
      1010      1020      1030      1040      1050      1060       

     1060  
pF1KE4 SCTM
       :::.
XP_005 SCTV
       1070

>>NP_001028289 (OMIM: 606525) SLIT-ROBO Rho GTPase-activ  (1075 aa)
 initn: 3768 init1: 2247 opt: 4812  Z-score: 2654.5  bits: 502.9 E(92320): 4.4e-141
Smith-Waterman score: 4812; 68.9% identity (87.2% similar) in 1072 aa overlap (1-1058:1-1062)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MSTPSRFKKDKEIIAEYESQVKEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
       ::. ..::::::::::::.:.::::.::::: ::::::.: :.:::::::.:::.:::::
NP_001 MSSQTKFKKDKEIIAEYEAQIKEIRTQLVEQFKCLEQQSESRLQLLQDLQEFFRRKAEIE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 TEYSRNLEKLAERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDI
        ::::.:::::::: .: ::...:: .:::: ::::::::::.:.:.::::.:::::.::
NP_001 LEYSRSLEKLAERFSSKIRSSREHQ-FKKDQYLLSPVNCWYLVLHQTRRESRDHATLNDI
               70        80         90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 YLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAES
       ..::::.:. :::::  :.:::::::..:.::.:.:: ::::::::::::::::::::::
NP_001 FMNNVIVRLSQISEDVIRLFKKSKEIGLQMHEELLKVTNELYTVMKTYHMYHAESISAES
     120       130       140       150       160       170         

              190       200        210       220       230         
pF1KE4 KLKEAEKQEEKQIGRSGDPVFHI-RLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKSIKA
       ::::::::::::...:::  ... : :.: ::::::::::::::::::::::::::  ::
NP_001 KLKEAEKQEEKQFNKSGDLSMNLLRHEDRPQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYSENKLKCTKA
     180       190       200       210       220       230         

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE4 RNEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEYNLETSRHEGL
       ::.:::.: ::::.. ::::::.::::::::::.:::: :..::::::::::::::::::
NP_001 RNDYLLNLAATNAAISKYYIHDVSDLIDCCDLGFHASLARTFRTYLSAEYNLETSRHEGL
     240       250       260       270       280       290         

     300       310       320       330       340       350         
pF1KE4 DIIENAVDNLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQPVQAELMLRY
       :.::::::::. ::::.  :.:   .::::.::::: ::::::::::::::::.::..::
NP_001 DVIENAVDNLDSRSDKHTVMDMCNQVFCPPLKFEFQPHMGDEVCQVSAQQPVQTELLMRY
     300       310       320       330       340       350         

     360       370       380       390       400       410         
pF1KE4 QQLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTESVKSTVSETY
       .::::::::::::::::.:: .::.::.:::.:.::.:::. ::::::::::::..::::
NP_001 HQLQSRLATLKIENEEVRKTLDATMQTLQDMLTVEDFDVSDAFQHSRSTESVKSAASETY
     360       370       380       390       400       410         

     420       430       440       450       460       470         
pF1KE4 LSKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGEGHRAEYMTTS
       .:: .::::::::::::.::: :..::..:::::::::::::::..:::::.:::  :: 
NP_001 MSKINIAKRRANQQETEMFYFTKFKEYVNGSNLITKLQAKHDLLKQTLGEGERAECGTT-
     420       430       440       450       460       470         

     480       490       500       510       520       530         
pF1KE4 RGRRNSHTRHQDSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVNDIKNSFERGEN
       :::::..::.:::::.:::.::::::.:::::::.:::::: :::::::::::::::::.
NP_001 RGRRNARTRNQDSGQAIPLVVESCIRYINLYGLQQQGIFRVPGSQVEVNDIKNSFERGED
      480       490       500       510       520       530        

     540       550       560       570       580       590         
pF1KE4 PLADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFNDLISCIRIDNLYERALHIRKLLLT
       ::.:::...::::::::::::::::::::::::::.:::: :...:  ::. .:...:.:
NP_001 PLVDDQNERDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFQDLISTIKLENPAERVHQIQQILVT
      540       550       560       570       580       590        

     600       610       620       630       640       650         
pF1KE4 LPRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMPVPEIQDQVSCQAHVNEI
       ::: :..::::::::::::::::::::::::::::::::::: .:. :: ::::::.::.
NP_001 LPRVVIVVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMHIPDGQDPVSCQAHINEV
      600       610       620       630       640       650        

     660       670       680        690       700       710        
pF1KE4 IKTIIIHHETIFPDAKELDGPVYEKCMAG-DDYCDSPYSEHGTLEEVDQDAGTEPHTSED
       :::::::::.:::. .::.:::::::::: ..:::::.:: :...:::.: :::::::..
NP_001 IKTIIIHHEAIFPSPRELEGPVYEKCMAGGEEYCDSPHSEPGAIDEVDHDNGTEPHTSDE
      660       670       680       690       700       710        

      720       730       740       750       760       770        
pF1KE4 ECEPIEAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGLVPHQYIVVQD
       : : :::::::::.::: ::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::::::
NP_001 EVEQIEAIAKFDYMGRSPRELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGVDGLIPHQYIVVQD
      720       730       740       750       760       770        

      780       790       800        810           820       830   
pF1KE4 MDDTFSDTLSQKADSEASSGPVTEDKSSSK-DMNSPTDRHPD----GYLARQRKRGEPPP
       :::.:::.:::::::::::::. .::.::: :..:::..  :    : ..: : :..   
NP_001 MDDAFSDSLSQKADSEASSGPLLDDKASSKNDLQSPTEHISDYGFGGVMGRVRLRSDGAA
      780       790       800       810       820       830        

            840       850       860         870       880       890
pF1KE4 -PVRRPGRTSDGHCPLHPPHALSNSSVDLGSPSLA--SHPRGLLQNRGLNNDSPERRRRP
        : :: :  .: : :   :..:.  :.:    . :  : :. .  .::   .:::.::  
NP_001 IPRRRSG--GDTHSP---PRGLG-PSIDTPPRAAACPSSPHKIPLTRG-RIESPEKRRMA
      840         850           860       870       880        890 

              900       910       920       930       940       950
pF1KE4 GHGSLTNISRHDSLKKIDSPPIRRSTSSGQYTGFNDHKPLDPETIAQDIEETMNTALNEL
         ::  .:.  :.    ..  .: . .: ......::: :. :..:.:::.::.:::.::
NP_001 TFGSAGSINYPDKKALSEGHSMRSTCGSTRHSSLGDHKSLEAEALAEDIEKTMSTALHEL
             900       910       920       930       940       950 

              960       970       980       990      1000      1010
pF1KE4 RELERQSTAKHAPDVVLDTLEQVKNSPTPATSTESLSPLHNVALRSSEPQIRRSTSSSSD
       ::::::.:.:.:::::::::: .:: : :..: :  ::::....:. .  .:::.:::..
NP_001 RELERQNTVKQAPDVVLDTLEPLKNPPGPVSS-EPASPLHTIVIRDPDAAMRRSSSSSTE
             960       970       980        990      1000      1010

             1020       1030       1040        1050      1060      
pF1KE4 TMSTFKPMVAPRM-GVQLKPPALRP-KPAVLPKTNPTI--GPAPPPQGPTDKSCTM    
        :.:::: .. :. :.::.:: .:: .:.:  ... .   : . :   ::.:        
NP_001 MMTTFKPALSARLAGAQLRPPPMRPVRPVVQHRSSSSSSSGVGSPAVTPTEKMFPNSSAD
             1020      1030      1040      1050      1060      1070

NP_001 KSGTM
            

>>XP_016863064 (OMIM: 606525) SLIT-ROBO Rho GTPase-activ  (1093 aa)
 initn: 3657 init1: 2136 opt: 4703  Z-score: 2594.7  bits: 491.8 E(92320): 9.4e-138
Smith-Waterman score: 4703; 68.8% identity (87.1% similar) in 1051 aa overlap (22-1058:40-1080)

                        10        20        30        40        50 
pF1KE4          MSTPSRFKKDKEIIAEYESQVKEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQD
                                     .:::.::::: ::::::.: :.:::::::.
XP_016 AGGAGGCLLMPCSTQDLQWELGSALGAAFRQEIRTQLVEQFKCLEQQSESRLQLLQDLQE
      10        20        30        40        50        60         

              60        70        80        90       100       110 
pF1KE4 FFRKKAEIETEYSRNLEKLAERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRES
       :::.::::: ::::.:::::::: .: ::...:: .:::: ::::::::::.:.:.::::
XP_016 FFRRKAEIELEYSRSLEKLAERFSSKIRSSREHQ-FKKDQYLLSPVNCWYLVLHQTRRES
      70        80        90       100        110       120        

             120       130       140       150       160       170 
pF1KE4 KDHATLSDIYLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMY
       .:::::.::..::::.:. :::::  :.:::::::..:.::.:.:: :::::::::::::
XP_016 RDHATLNDIFMNNVIVRLSQISEDVIRLFKKSKEIGLQMHEELLKVTNELYTVMKTYHMY
      130       140       150       160       170       180        

             180       190       200        210       220       230
pF1KE4 HAESISAESKLKEAEKQEEKQIGRSGDPVFHI-RLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYS
       :::::::::::::::::::::...:::  ... : :.: :::::::::::::::::::::
XP_016 HAESISAESKLKEAEKQEEKQFNKSGDLSMNLLRHEDRPQRRSSVKKIEKMKEKRQAKYS
      190       200       210       220       230       240        

              240       250       260       270       280       290
pF1KE4 ENKLKSIKARNEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEYN
       :::::  ::::.:::.: ::::.. ::::::.::::::::::.:::: :..:::::::::
XP_016 ENKLKCTKARNDYLLNLAATNAAISKYYIHDVSDLIDCCDLGFHASLARTFRTYLSAEYN
      250       260       270       280       290       300        

              300       310       320       330       340       350
pF1KE4 LETSRHEGLDIIENAVDNLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQP
       ::::::::::.::::::::. ::::.  :.:   .::::.::::: ::::::::::::::
XP_016 LETSRHEGLDVIENAVDNLDSRSDKHTVMDMCNQVFCPPLKFEFQPHMGDEVCQVSAQQP
      310       320       330       340       350       360        

              360       370       380       390       400       410
pF1KE4 VQAELMLRYQQLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTES
       ::.::..::.::::::::::::::::.:: .::.::.:::.:.::.:::. :::::::::
XP_016 VQTELLMRYHQLQSRLATLKIENEEVRKTLDATMQTLQDMLTVEDFDVSDAFQHSRSTES
      370       380       390       400       410       420        

              420       430       440       450       460       470
pF1KE4 VKSTVSETYLSKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGEG
       :::..::::.:: .::::::::::::.::: :..::..:::::::::::::::..:::::
XP_016 VKSAASETYMSKINIAKRRANQQETEMFYFTKFKEYVNGSNLITKLQAKHDLLKQTLGEG
      430       440       450       460       470       480        

              480       490       500       510       520       530
pF1KE4 HRAEYMTTSRGRRNSHTRHQDSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVNDI
       .:::  :: :::::..::.:::::.:::.::::::.:::::::.:::::: :::::::::
XP_016 ERAECGTT-RGRRNARTRNQDSGQAIPLVVESCIRYINLYGLQQQGIFRVPGSQVEVNDI
      490        500       510       520       530       540       

              540       550       560       570       580       590
pF1KE4 KNSFERGENPLADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFNDLISCIRIDNLYERA
       ::::::::.::.:::...::::::::::::::::::::::::::.:::: :...:  ::.
XP_016 KNSFERGEDPLVDDQNERDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFQDLISTIKLENPAERV
       550       560       570       580       590       600       

              600       610       620       630       640       650
pF1KE4 LHIRKLLLTLPRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMPVPEIQDQV
        .:...:.:::: :..::::::::::::::::::::::::::::::::::: .:. :: :
XP_016 HQIQQILVTLPRVVIVVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMHIPDGQDPV
       610       620       630       640       650       660       

              660       670       680        690       700         
pF1KE4 SCQAHVNEIIKTIIIHHETIFPDAKELDGPVYEKCMAG-DDYCDSPYSEHGTLEEVDQDA
       :::::.::.:::::::::.:::. .::.:::::::::: ..:::::.:: :...:::.: 
XP_016 SCQAHINEVIKTIIIHHEAIFPSPRELEGPVYEKCMAGGEEYCDSPHSEPGAIDEVDHDN
       670       680       690       700       710       720       

     710       720       730       740       750       760         
pF1KE4 GTEPHTSEDECEPIEAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGLV
       :::::::..: : :::::::::.::: ::::::::::::::::::::::::::::.:::.
XP_016 GTEPHTSDEEVEQIEAIAKFDYMGRSPRELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGVDGLI
       730       740       750       760       770       780       

     770       780       790       800        810           820    
pF1KE4 PHQYIVVQDMDDTFSDTLSQKADSEASSGPVTEDKSSSK-DMNSPTDRHPD----GYLAR
       ::::::::::::.:::.:::::::::::::. .::.::: :..:::..  :    : ..:
XP_016 PHQYIVVQDMDDAFSDSLSQKADSEASSGPLLDDKASSKNDLQSPTEHISDYGFGGVMGR
       790       800       810       820       830       840       

          830        840       850       860         870       880 
pF1KE4 QRKRGEPPP-PVRRPGRTSDGHCPLHPPHALSNSSVDLGSPSLA--SHPRGLLQNRGLNN
        : :..    : :: :  .: : :   :..:.  :.:    . :  : :. .  .::   
XP_016 VRLRSDGAAIPRRRSG--GDTHSP---PRGLG-PSIDTPPRAAACPSSPHKIPLTRG-RI
       850       860            870        880       890        900

             890       900       910       920       930       940 
pF1KE4 DSPERRRRPGHGSLTNISRHDSLKKIDSPPIRRSTSSGQYTGFNDHKPLDPETIAQDIEE
       .:::.::    ::  .:.  :.    ..  .: . .: ......::: :. :..:.:::.
XP_016 ESPEKRRMATFGSAGSINYPDKKALSEGHSMRSTCGSTRHSSLGDHKSLEAEALAEDIEK
              910       920       930       940       950       960

             950       960       970       980       990      1000 
pF1KE4 TMNTALNELRELERQSTAKHAPDVVLDTLEQVKNSPTPATSTESLSPLHNVALRSSEPQI
       ::.:::.::::::::.:.:.:::::::::: .:: : :..: :  ::::....:. .  .
XP_016 TMSTALHELRELERQNTVKQAPDVVLDTLEPLKNPPGPVSS-EPASPLHTIVIRDPDAAM
              970       980       990      1000       1010         

            1010      1020       1030       1040        1050       
pF1KE4 RRSTSSSSDTMSTFKPMVAPRM-GVQLKPPALRP-KPAVLPKTNPTI--GPAPPPQGPTD
       :::.:::.. :.:::: .. :. :.::.:: .:: .:.:  ... .   : . :   ::.
XP_016 RRSSSSSTEMMTTFKPALSARLAGAQLRPPPMRPVRPVVQHRSSSSSSSGVGSPAVTPTE
    1020      1030      1040      1050      1060      1070         

      1060           
pF1KE4 KSCTM         
       :             
XP_016 KMFPNSSADKSGTM
    1080      1090   

>>XP_005277567 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-activ  (1071 aa)
 initn: 3905 init1: 1639 opt: 4238  Z-score: 2340.1  bits: 444.7 E(92320): 1.4e-123
Smith-Waterman score: 4801; 68.1% identity (86.1% similar) in 1085 aa overlap (1-1062:1-1071)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MSTPSRFKKDKEIIAEYESQVKEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
       :..:..:::::::::::..:::::::::.::.:::.:: :.:::::::::::::::::::
XP_005 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 TEYSRNLEKLAERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDI
        .::::::::::::.:::::::: ::.:::::.::::::: ::::::.:::.::.:::::
XP_005 MDYSRNLEKLAERFLAKTRSTKD-QQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTLSDI
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              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 YLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAES
       ::::.: ::.:.:::: :.::::::.. ::..::::::::::.::::::::.:.::::.:
XP_005 YLNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQS
     120       130       140       150       160       170         

              190                  200       210       220         
pF1KE4 KLKEAEKQEEKQIG-----------RSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
       ::::::::::::::           :: : . ..:.::.: :::::::::::::::::::
XP_005 KLKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
     180       190       200       210       220       230         

     230       240       250       260        270       280        
pF1KE4 SENKLKSIKARNEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLID-CCDLGYHASLNRALRTYLSAE
       .:::::.:::::::::.::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::.::::
XP_005 TENKLKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDQCCDLGYHASLNRALRTFLSAE
     240       250       260       270       280       290         

      290       300       310       320       330       340        
pF1KE4 YNLETSRHEGLDIIENAVDNLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQ
        ::: :.::::: :::::.::.  :::::.::::  .:::::::::: :::: . :. ::
XP_005 LNLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQ
     300       310       320       330       340       350         

      350       360       370       380       390       400        
pF1KE4 QPVQAELMLRYQQLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRST
       ::::.::. : :::::::.:::::::::::: :::::::::.::.::.:::.:::.: : 
XP_005 QPVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSM
     360       370       380       390       400       410         

      410       420       430       440       450       460        
pF1KE4 ESVKSTVSETYLSKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLG
       ::::::::::..:::::::::::::::::::: :..::::: ::::::::::::::.:::
XP_005 ESVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQKTLG
     420       430       440       450       460       470         

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pF1KE4 EGHRAEYMTTSRGRRNSHTRHQDSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVN
       :..:..    : .::.: .:.:::.:.:::.::::::::. .::::.:::::::::::::
XP_005 ESQRTD---CSLARRSSTVRKQDSSQAIPLVVESCIRFISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVN
     480          490       500       510       520       530      

      530       540       550       560       570       580        
pF1KE4 DIKNSFERGENPLADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFNDLISCIRIDNLYE
       ::::.:::::.::: ::..::..:.::::::::::::.:::::. :.::..:. .::: :
XP_005 DIKNAFERGEDPLAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFRGLEHPLFPKDIFHDLMACVTMDNLQE
        540       550       560       570       580       590      

      590       600       610       620       630       640        
pF1KE4 RALHIRKLLLTLPRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMPVPEIQD
       :::::::.::.::...::.:::::::::::::.:.:::::::::::::::.:: ::: .:
XP_005 RALHIRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNHLSQFSEENMMDPYNLAICFGPSLMSVPEGHD
        600       610       620       630       640       650      

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pF1KE4 QVSCQAHVNEIIKTIIIHHETIFPDAKELDGPVYEKCMAGDDYCDSPYSEHGTLEEVDQD
       ::::::::::.::::::.::.:::. .::.:::: .  . .::::::..:  ..:.  ::
XP_005 QVSCQAHVNELIKTIIIQHENIFPSPRELEGPVYSRGGSMEDYCDSPHGETTSVEDSTQD
        660       670       680       690       700       710      

      710       720       730       740       750       760        
pF1KE4 AGTEPHTSEDECEPIEAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGL
       . .: :::.:::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::.:::::::::::::
XP_005 VTAEHHTSDDECEPIEAIAKFDYVGRTARELSFKKGASLLLYQRASDDWWEGRHNGIDGL
        720       730       740       750       760       770      

      770       780       790       800       810        820       
pF1KE4 VPHQYIVVQDMDDTFSDTLSQKADSEASSGPVTEDKSSSKDMNSPTDRH-PDGYLA---R
       .::::::::: .:   .  : :.. :. : :  :  ..    . :.  :  : :::   .
XP_005 IPHQYIVVQDTEDGVVERSSPKSEIEVISEPPEEKVTARAGASCPSGGHVADIYLANINK
        780       790       800       810       820       830      

          830       840       850       860       870          880 
pF1KE4 QRKRGEPPPPVRRPGRTSDGHCPLHPPHALSNSSVDLGSPSLASHPRGLLQ---NRGLNN
       :::: :    .:.  : ::.:       .::.: .: .::....  :   :   ...: .
XP_005 QRKRPESGS-IRKTFR-SDSH-------GLSSSLTDSSSPGVGASCRPSSQPIMSQSLPK
        840        850               860       870       880       

             890       900        910       920       930       940
pF1KE4 DSPERRRRPGHGSLTNISRHDSLK-KIDSPPIRRSTSSGQYTGFNDHKPLDPETIAQDIE
       ..:..    :::::..::::.::: ..::: ::.....:.  .::.:.:.:::.::::::
XP_005 EGPDKCSISGHGSLNSISRHSSLKNRLDSPQIRKTATAGRSKSFNNHRPMDPEVIAQDIE
       890       900       910       920       930       940       

              950       960       970       980       990      1000
pF1KE4 ETMNTALNELRELERQSTAKHAPDVVLDTLEQVKNSPTPATSTESLSPLHNVALRSSEPQ
        :::.::::::::::::..::.::::::::: .:.::. : ..:  ::::.  :.. :: 
XP_005 ATMNSALNELRELERQSSVKHTPDVVLDTLEPLKTSPVVAPTSEPSSPLHTQLLKDPEPA
       950       960       970       980       990      1000       

             1010      1020      1030      1040         1050       
pF1KE4 IRRSTSSSSDTMSTFKPMVAPRMGVQLKPPALRPKPAVLPKTN---PTIGPAPPPQGPTD
       ..::.:...:   .:.:. . .:.. .:::: ::::.:.::::   : .. .  ::. ::
XP_005 FQRSASTAGDIACAFRPVKSVKMAAPVKPPATRPKPTVFPKTNATSPGVNSSTSPQS-TD
      1010      1020      1030      1040      1050      1060       

      1060  
pF1KE4 KSCTM
       ::::.
XP_005 KSCTV
       1070 

>>NP_056141 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-activati  (1071 aa)
 initn: 3905 init1: 1639 opt: 4238  Z-score: 2340.1  bits: 444.7 E(92320): 1.4e-123
Smith-Waterman score: 4801; 68.1% identity (86.1% similar) in 1085 aa overlap (1-1062:1-1071)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MSTPSRFKKDKEIIAEYESQVKEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
       :..:..:::::::::::..:::::::::.::.:::.:: :.:::::::::::::::::::
NP_056 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 TEYSRNLEKLAERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDI
        .::::::::::::.:::::::: ::.:::::.::::::: ::::::.:::.::.:::::
NP_056 MDYSRNLEKLAERFLAKTRSTKD-QQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTLSDI
               70        80         90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 YLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAES
       ::::.: ::.:.:::: :.::::::.. ::..::::::::::.::::::::.:.::::.:
NP_056 YLNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQS
     120       130       140       150       160       170         

              190                  200       210       220         
pF1KE4 KLKEAEKQEEKQIG-----------RSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
       ::::::::::::::           :: : . ..:.::.: :::::::::::::::::::
NP_056 KLKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
     180       190       200       210       220       230         

     230       240       250       260        270       280        
pF1KE4 SENKLKSIKARNEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLID-CCDLGYHASLNRALRTYLSAE
       .:::::.:::::::::.::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::.::::
NP_056 TENKLKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDQCCDLGYHASLNRALRTFLSAE
     240       250       260       270       280       290         

      290       300       310       320       330       340        
pF1KE4 YNLETSRHEGLDIIENAVDNLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQ
        ::: :.::::: :::::.::.  :::::.::::  .:::::::::: :::: . :. ::
NP_056 LNLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQ
     300       310       320       330       340       350         

      350       360       370       380       390       400        
pF1KE4 QPVQAELMLRYQQLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRST
       ::::.::. : :::::::.:::::::::::: :::::::::.::.::.:::.:::.: : 
NP_056 QPVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSM
     360       370       380       390       400       410         

      410       420       430       440       450       460        
pF1KE4 ESVKSTVSETYLSKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLG
       ::::::::::..:::::::::::::::::::: :..::::: ::::::::::::::.:::
NP_056 ESVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQKTLG
     420       430       440       450       460       470         

      470       480       490       500       510       520        
pF1KE4 EGHRAEYMTTSRGRRNSHTRHQDSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVN
       :..:..    : .::.: .:.:::.:.:::.::::::::. .::::.:::::::::::::
NP_056 ESQRTD---CSLARRSSTVRKQDSSQAIPLVVESCIRFISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVN
     480          490       500       510       520       530      

      530       540       550       560       570       580        
pF1KE4 DIKNSFERGENPLADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFNDLISCIRIDNLYE
       ::::.:::::.::: ::..::..:.::::::::::::.:::::. :.::..:. .::: :
NP_056 DIKNAFERGEDPLAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFRGLEHPLFPKDIFHDLMACVTMDNLQE
        540       550       560       570       580       590      

      590       600       610       620       630       640        
pF1KE4 RALHIRKLLLTLPRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMPVPEIQD
       :::::::.::.::...::.:::::::::::::.:.:::::::::::::::.:: ::: .:
NP_056 RALHIRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNHLSQFSEENMMDPYNLAICFGPSLMSVPEGHD
        600       610       620       630       640       650      

      650       660       670       680       690       700        
pF1KE4 QVSCQAHVNEIIKTIIIHHETIFPDAKELDGPVYEKCMAGDDYCDSPYSEHGTLEEVDQD
       ::::::::::.::::::.::.:::. .::.:::: .  . .::::::..:  ..:.  ::
NP_056 QVSCQAHVNELIKTIIIQHENIFPSPRELEGPVYSRGGSMEDYCDSPHGETTSVEDSTQD
        660       670       680       690       700       710      

      710       720       730       740       750       760        
pF1KE4 AGTEPHTSEDECEPIEAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGL
       . .: :::.:::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::.:::::::::::::
NP_056 VTAEHHTSDDECEPIEAIAKFDYVGRTARELSFKKGASLLLYQRASDDWWEGRHNGIDGL
        720       730       740       750       760       770      

      770       780       790       800       810        820       
pF1KE4 VPHQYIVVQDMDDTFSDTLSQKADSEASSGPVTEDKSSSKDMNSPTDRH-PDGYLA---R
       .::::::::: .:   .  : :.. :. : :  :  ..    . :.  :  : :::   .
NP_056 IPHQYIVVQDTEDGVVERSSPKSEIEVISEPPEEKVTARAGASCPSGGHVADIYLANINK
        780       790       800       810       820       830      

          830       840       850       860       870          880 
pF1KE4 QRKRGEPPPPVRRPGRTSDGHCPLHPPHALSNSSVDLGSPSLASHPRGLLQ---NRGLNN
       :::: :    .:.  : ::.:       .::.: .: .::....  :   :   ...: .
NP_056 QRKRPESGS-IRKTFR-SDSH-------GLSSSLTDSSSPGVGASCRPSSQPIMSQSLPK
        840        850               860       870       880       

             890       900        910       920       930       940
pF1KE4 DSPERRRRPGHGSLTNISRHDSLK-KIDSPPIRRSTSSGQYTGFNDHKPLDPETIAQDIE
       ..:..    :::::..::::.::: ..::: ::.....:.  .::.:.:.:::.::::::
NP_056 EGPDKCSISGHGSLNSISRHSSLKNRLDSPQIRKTATAGRSKSFNNHRPMDPEVIAQDIE
       890       900       910       920       930       940       

              950       960       970       980       990      1000
pF1KE4 ETMNTALNELRELERQSTAKHAPDVVLDTLEQVKNSPTPATSTESLSPLHNVALRSSEPQ
        :::.::::::::::::..::.::::::::: .:.::. : ..:  ::::.  :.. :: 
NP_056 ATMNSALNELRELERQSSVKHTPDVVLDTLEPLKTSPVVAPTSEPSSPLHTQLLKDPEPA
       950       960       970       980       990      1000       

             1010      1020      1030      1040         1050       
pF1KE4 IRRSTSSSSDTMSTFKPMVAPRMGVQLKPPALRPKPAVLPKTN---PTIGPAPPPQGPTD
       ..::.:...:   .:.:. . .:.. .:::: ::::.:.::::   : .. .  ::. ::
NP_056 FQRSASTAGDIACAFRPVKSVKMAAPVKPPATRPKPTVFPKTNATSPGVNSSTSPQS-TD
      1010      1020      1030      1040      1050      1060       

      1060  
pF1KE4 KSCTM
       ::::.
NP_056 KSCTV
       1070 

>>XP_011507657 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-activ  (1083 aa)
 initn: 4186 init1: 1639 opt: 4171  Z-score: 2303.3  bits: 437.9 E(92320): 1.6e-121
Smith-Waterman score: 4789; 67.6% identity (85.6% similar) in 1088 aa overlap (1-1062:1-1083)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MSTPSRFKKDKEIIAEYESQVKEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
       :..:..:::::::::::..:::::::::.::.:::.:: :.:::::::::::::::::::
XP_011 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 TEYSRNLEKLAERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDI
        .::::::::::::.:::::::: ::.:::::.::::::: ::::::.:::.::.:::::
XP_011 MDYSRNLEKLAERFLAKTRSTKD-QQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTLSDI
               70        80         90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 YLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAES
       ::::.: ::.:.:::: :.::::::.. ::..::::::::::.::::::::.:.::::.:
XP_011 YLNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQS
     120       130       140       150       160       170         

              190                  200       210       220         
pF1KE4 KLKEAEKQEEKQIG-----------RSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
       ::::::::::::::           :: : . ..:.::.: :::::::::::::::::::
XP_011 KLKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
     180       190       200       210       220       230         

     230       240       250       260       270       280         
pF1KE4 SENKLKSIKARNEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEY
       .:::::.:::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::: 
XP_011 TENKLKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTFLSAEL
     240       250       260       270       280       290         

     290       300       310       320       330       340         
pF1KE4 NLETSRHEGLDIIENAVDNLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQ
       ::: :.::::: :::::.::.  :::::.::::  .:::::::::: :::: . :. :::
XP_011 NLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQQ
     300       310       320       330       340       350         

     350       360       370       380       390       400         
pF1KE4 PVQAELMLRYQQLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTE
       :::.::. : :::::::.:::::::::::: :::::::::.::.::.:::.:::.: : :
XP_011 PVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSME
     360       370       380       390       400       410         

     410       420       430       440       450       460         
pF1KE4 SVKSTVSETYLSKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGE
       :::::::::..:::::::::::::::::::: :..::::: ::::::::::::::.::::
XP_011 SVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQKTLGE
     420       430       440       450       460       470         

     470       480       490       500       510       520         
pF1KE4 GHRAEYMTTSRGRRNSHTRHQDSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVND
       ..:..    : .::.: .:.:::.:.:::.::::::::. .::::.::::::::::::::
XP_011 SQRTD---CSLARRSSTVRKQDSSQAIPLVVESCIRFISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVND
     480          490       500       510       520       530      

     530       540       550       560       570       580         
pF1KE4 IKNSFERGENPLADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFNDLISCIRIDNLYER
       :::.:::::.::: ::..::..:.::::::::::::.:::::. :.::..:. .::: ::
XP_011 IKNAFERGEDPLAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFRGLEHPLFPKDIFHDLMACVTMDNLQER
        540       550       560       570       580       590      

     590       600       610       620       630       640         
pF1KE4 ALHIRKLLLTLPRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMPVPEIQDQ
       ::::::.::.::...::.:::::::::::::.:.:::::::::::::::.:: ::: .::
XP_011 ALHIRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNHLSQFSEENMMDPYNLAICFGPSLMSVPEGHDQ
        600       610       620       630       640       650      

     650       660       670       680       690       700         
pF1KE4 VSCQAHVNEIIKTIIIHHETIFPDAKELDGPVYEKCMAGDDYCDSPYSEHGTLEEVDQDA
       :::::::::.::::::.::.:::. .::.:::: .  . .::::::..:  ..:.  ::.
XP_011 VSCQAHVNELIKTIIIQHENIFPSPRELEGPVYSRGGSMEDYCDSPHGETTSVEDSTQDV
        660       670       680       690       700       710      

     710       720       730       740       750       760         
pF1KE4 GTEPHTSEDECEPIEAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGLV
        .: :::.:::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::.:::::::::::::.
XP_011 TAEHHTSDDECEPIEAIAKFDYVGRTARELSFKKGASLLLYQRASDDWWEGRHNGIDGLI
        720       730       740       750       760       770      

     770       780       790       800       810        820        
pF1KE4 PHQYIVVQDMDDTFSDTLSQKADSEASSGPVTEDKSSSKDMNSPTDRH-PDGYLARQRK-
       ::::::::: .:   .  : :.. :. : :  :  ..    . :.  :  : :::   . 
XP_011 PHQYIVVQDTEDGVVERSSPKSEIEVISEPPEEKVTARAGASCPSGGHVADIYLANINNN
        780       790       800       810       820       830      

        830            840       850       860       870           
pF1KE4 -RGEPPPPV-----RRPGRTSDGHCPLHPPHALSNSSVDLGSPSLASHPRGLLQ---NRG
        . .   ::     .::   :  .      :.::.: .: .::....  :   :   ...
XP_011 LHLDNTKPVTTKQRKRPESGSIRKTFRSDSHGLSSSLTDSSSPGVGASCRPSSQPIMSQS
        840       850       860       870       880       890      

      880       890       900        910       920       930       
pF1KE4 LNNDSPERRRRPGHGSLTNISRHDSLK-KIDSPPIRRSTSSGQYTGFNDHKPLDPETIAQ
       : ...:..    :::::..::::.::: ..::: ::.....:.  .::.:.:.:::.:::
XP_011 LPKEGPDKCSISGHGSLNSISRHSSLKNRLDSPQIRKTATAGRSKSFNNHRPMDPEVIAQ
        900       910       920       930       940       950      

       940       950       960       970       980       990       
pF1KE4 DIEETMNTALNELRELERQSTAKHAPDVVLDTLEQVKNSPTPATSTESLSPLHNVALRSS
       ::: :::.::::::::::::..::.::::::::: .:.::. : ..:  ::::.  :.. 
XP_011 DIEATMNSALNELRELERQSSVKHTPDVVLDTLEPLKTSPVVAPTSEPSSPLHTQLLKDP
        960       970       980       990      1000      1010      

      1000      1010      1020      1030      1040         1050    
pF1KE4 EPQIRRSTSSSSDTMSTFKPMVAPRMGVQLKPPALRPKPAVLPKTN---PTIGPAPPPQG
       :: ..::.:...:   .:.:. . .:.. .:::: ::::.:.::::   : .. .  ::.
XP_011 EPAFQRSASTAGDIACAFRPVKSVKMAAPVKPPATRPKPTVFPKTNATSPGVNSSTSPQS
       1020      1030      1040      1050      1060      1070      

         1060  
pF1KE4 PTDKSCTM
        ::::::.
XP_011 -TDKSCTV
        1080   

>>XP_016856330 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-activ  (840 aa)
 initn: 3685 init1: 1604 opt: 4119  Z-score: 2276.3  bits: 432.5 E(92320): 5.1e-120
Smith-Waterman score: 4119; 74.4% identity (89.5% similar) in 835 aa overlap (1-823:1-831)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MSTPSRFKKDKEIIAEYESQVKEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
       :..:..:::::::::::..:::::::::.::.:::.:: :.:::::::::::::::::::
XP_016 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 TEYSRNLEKLAERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDI
        .::::::::::::.:::::::: ::.:::::.::::::: ::::::.:::.::.:::::
XP_016 MDYSRNLEKLAERFLAKTRSTKD-QQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTLSDI
               70        80         90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 YLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAES
       ::::.: ::.:.:::: :.::::::.. ::..::::::::::.::::::::.:.::::.:
XP_016 YLNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQS
     120       130       140       150       160       170         

              190                  200       210       220         
pF1KE4 KLKEAEKQEEKQIG-----------RSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
       ::::::::::::::           :: : . ..:.::.: :::::::::::::::::::
XP_016 KLKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
     180       190       200       210       220       230         

     230       240       250       260       270       280         
pF1KE4 SENKLKSIKARNEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEY
       .:::::.:::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::: 
XP_016 TENKLKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTFLSAEL
     240       250       260       270       280       290         

     290       300       310       320       330       340         
pF1KE4 NLETSRHEGLDIIENAVDNLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQ
       ::: :.::::: :::::.::.  :::::.::::  .:::::::::: :::: . :. :::
XP_016 NLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQQ
     300       310       320       330       340       350         

     350       360       370       380       390       400         
pF1KE4 PVQAELMLRYQQLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTE
       :::.::. : :::::::.:::::::::::: :::::::::.::.::.:::.:::.: : :
XP_016 PVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSME
     360       370       380       390       400       410         

     410       420       430       440       450       460         
pF1KE4 SVKSTVSETYLSKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGE
       :::::::::..:::::::::::::::::::: :..::::: ::::::::::::::.::::
XP_016 SVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQKTLGE
     420       430       440       450       460       470         

     470       480       490       500       510       520         
pF1KE4 GHRAEYMTTSRGRRNSHTRHQDSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVND
       ..:..    : .::.: .:.:::.:.:::.::::::::. .::::.::::::::::::::
XP_016 SQRTD---CSLARRSSTVRKQDSSQAIPLVVESCIRFISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVND
     480          490       500       510       520       530      

     530       540       550       560       570       580         
pF1KE4 IKNSFERGENPLADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFNDLISCIRIDNLYER
       :::.:::::.::: ::..::..:.::::::::::::.:::::. :.::..:. .::: ::
XP_016 IKNAFERGEDPLAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFRGLEHPLFPKDIFHDLMACVTMDNLQER
        540       550       560       570       580       590      

     590       600       610       620       630       640         
pF1KE4 ALHIRKLLLTLPRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMPVPEIQDQ
       ::::::.::.::...::.:::::::::::::.:.:::::::::::::::.:: ::: .::
XP_016 ALHIRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNHLSQFSEENMMDPYNLAICFGPSLMSVPEGHDQ
        600       610       620       630       640       650      

     650       660       670       680       690       700         
pF1KE4 VSCQAHVNEIIKTIIIHHETIFPDAKELDGPVYEKCMAGDDYCDSPYSEHGTLEEVDQDA
       :::::::::.::::::.::.:::. .::.:::: .  . .::::::..:  ..:.  ::.
XP_016 VSCQAHVNELIKTIIIQHENIFPSPRELEGPVYSRGGSMEDYCDSPHGETTSVEDSTQDV
        660       670       680       690       700       710      

     710       720       730       740       750       760         
pF1KE4 GTEPHTSEDECEPIEAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGLV
        .: :::.:::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::.:::::::::::::.
XP_016 TAEHHTSDDECEPIEAIAKFDYVGRTARELSFKKGASLLLYQRASDDWWEGRHNGIDGLI
        720       730       740       750       760       770      

     770       780       790       800       810        820        
pF1KE4 PHQYIVVQDMDDTFSDTLSQKADSEASSGPVTEDKSSSKDMNSPTDRH-PDGYLARQRKR
       ::::::::: .:   .  : :.. :. : :  :  ..    . :.  :  : :::     
XP_016 PHQYIVVQDTEDGVVERSSPKSEIEVISEPPEEKVTARAGASCPSGGHVADIYLANINNF
        780       790       800       810       820       830      

      830       840       850       860       870       880        
pF1KE4 GEPPPPVRRPGRTSDGHCPLHPPHALSNSSVDLGSPSLASHPRGLLQNRGLNNDSPERRR
                                                                   
XP_016 HCGC                                                        
        840                                                        

>>NP_001287881 (OMIM: 606524) SLIT-ROBO Rho GTPase-activ  (789 aa)
 initn: 3678 init1: 1597 opt: 4068  Z-score: 2248.7  bits: 427.3 E(92320): 1.8e-118
Smith-Waterman score: 4068; 77.1% identity (91.9% similar) in 789 aa overlap (1-778:1-785)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MSTPSRFKKDKEIIAEYESQVKEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
       :..:..:::::::::::..:::::::::.::.:::.:: :.:::::::::::::::::::
NP_001 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 TEYSRNLEKLAERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDI
        .::::::::::::.:::::::: ::.:::::.::::::: ::::::.:::.::.:::::
NP_001 MDYSRNLEKLAERFLAKTRSTKD-QQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTLSDI
               70        80         90       100       110         

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pF1KE4 YLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAES
       ::::.: ::.:.:::: :.::::::.. ::..::::::::::.::::::::.:.::::.:
NP_001 YLNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQS
     120       130       140       150       160       170         

              190                  200       210       220         
pF1KE4 KLKEAEKQEEKQIG-----------RSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
       ::::::::::::::           :: : . ..:.::.: :::::::::::::::::::
NP_001 KLKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
     180       190       200       210       220       230         

     230       240       250       260       270       280         
pF1KE4 SENKLKSIKARNEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTYLSAEY
       .:::::.:::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::: 
NP_001 TENKLKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDCCDLGYHASLNRALRTFLSAEL
     240       250       260       270       280       290         

     290       300       310       320       330       340         
pF1KE4 NLETSRHEGLDIIENAVDNLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQQ
       ::: :.::::: :::::.::.  :::::.::::  .:::::::::: :::: . :. :::
NP_001 NLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQQ
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pF1KE4 PVQAELMLRYQQLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRSTE
       :::.::. : :::::::.:::::::::::: :::::::::.::.::.:::.:::.: : :
NP_001 PVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSME
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     410       420       430       440       450       460         
pF1KE4 SVKSTVSETYLSKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLGE
       :::::::::..:::::::::::::::::::: :..::::: ::::::::::::::.::::
NP_001 SVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQKTLGE
     420       430       440       450       460       470         

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pF1KE4 GHRAEYMTTSRGRRNSHTRHQDSGQVIPLIVESCIRFINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVND
       ..:..    : .::.: .:.:::.:.:::.::::::::. .::::.::::::::::::::
NP_001 SQRTD---CSLARRSSTVRKQDSSQAIPLVVESCIRFISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVND
     480          490       500       510       520       530      

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pF1KE4 IKNSFERGENPLADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFNDLISCIRIDNLYER
       :::.:::::.::: ::..::..:.::::::::::::.:::::. :.::..:. .::: ::
NP_001 IKNAFERGEDPLAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFRGLEHPLFPKDIFHDLMACVTMDNLQER
        540       550       560       570       580       590      

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pF1KE4 ALHIRKLLLTLPRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMPVPEIQDQ
       ::::::.::.::...::.:::::::::::::.:.:::::::::::::::.:: ::: .::
NP_001 ALHIRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNHLSQFSEENMMDPYNLAICFGPSLMSVPEGHDQ
        600       610       620       630       640       650      

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pF1KE4 VSCQAHVNEIIKTIIIHHETIFPDAKELDGPVYEKCMAGDDYCDSPYSEHGTLEEVDQDA
       :::::::::.::::::.::.:::. .::.:::: .  . .::::::..:  ..:.  ::.
NP_001 VSCQAHVNELIKTIIIQHENIFPSPRELEGPVYSRGGSMEDYCDSPHGETTSVEDSTQDV
        660       670       680       690       700       710      

     710       720       730       740       750       760         
pF1KE4 GTEPHTSEDECEPIEAIAKFDYVGRSARELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGLV
        .: :::.:::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::.:::::::::::::.
NP_001 TAEHHTSDDECEPIEAIAKFDYVGRTARELSFKKGASLLLYQRASDDWWEGRHNGIDGLI
        720       730       740       750       760       770      

     770       780       790       800       810       820         
pF1KE4 PHQYIVVQDMDDTFSDTLSQKADSEASSGPVTEDKSSSKDMNSPTDRHPDGYLARQRKRG
       :::::::::                                                   
NP_001 PHQYIVVQDTLIS                                               
        780                                                        




1062 residues in 1 query   sequences
64369986 residues in 92320 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Oct 24 21:29:33 2019 done: Thu Oct 24 21:29:34 2019
 Total Scan time:  7.650 Total Display time:  0.290

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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