Result of FASTA (ccds) for pF1KE1022
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE1022, 730 aa
  1>>>pF1KE1022 730 - 730 aa - 730 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3866+/-0.000904; mu= 3.4313+/- 0.055
 mean_var=220.2393+/-44.501, 0's: 0 Z-trim(114.5): 15  B-trim: 736 in 1/52
 Lambda= 0.086422
 statistics sampled from 15087 (15100) to 15087 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.768), E-opt: 0.2 (0.464), width:  16
 Scan time:  5.000

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS3397.1 AFAP1 gene_id:60312|Hs108|chr4          ( 730) 4815 613.2 4.6e-175
CCDS47010.1 AFAP1 gene_id:60312|Hs108|chr4         ( 814) 3425 439.9 7.4e-123
CCDS34274.1 AFAP1L1 gene_id:134265|Hs108|chr5      ( 768) 1460 194.9   4e-49
CCDS54932.1 AFAP1L1 gene_id:134265|Hs108|chr5      ( 725) 1459 194.7 4.1e-49
CCDS31287.1 AFAP1L2 gene_id:84632|Hs108|chr10      ( 814)  667 96.0 2.4e-19
CCDS31286.1 AFAP1L2 gene_id:84632|Hs108|chr10      ( 818)  667 96.0 2.4e-19


>>CCDS3397.1 AFAP1 gene_id:60312|Hs108|chr4               (730 aa)
 initn: 4815 init1: 4815 opt: 4815  Z-score: 3256.5  bits: 613.2 E(32554): 4.6e-175
Smith-Waterman score: 4815; 99.9% identity (100.0% similar) in 730 aa overlap (1-730:1-730)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MEELIVELRLFLELLDHEYLTSTVREKKAVITNILLRIQSSKGFDVKDHAQKQETANSLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MEELIVELRLFLELLDHEYLTSTVREKKAVITNILLRIQSSKGFDVKDHAQKQETANSLP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 APPQMPLPEIPQPWLPPDSGPPPLPTSSLPEGYYEEAVPLSPGKAPEYITSNYDSDAMSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 APPQMPLPEIPQPWLPPDSGPPPLPTSSLPEGYYEEAVPLSPGKAPEYITSNYDSDAMSS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 SYESYDEEEEDGKGKKTRHQWPSEEASMDLVKDAKICAFLLRKKRFGQWTKLLCVIKDTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SYESYDEEEEDGKGKKTRHQWPSEEASMDLVKDAKICAFLLRKKRFGQWTKLLCVIKDTK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 LLCYKSSKDQQPQMELPLQGCNITYIPKDSKKKKHELKITQQGTDPLVLAVQSKEQAEQW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LLCYKSSKDQQPQMELPLQGCNITYIPKDSKKKKHELKITQQGTDPLVLAVQSKEQAEQW
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 LKVIKEAYSGCSGPVDSECPPPPSSPVHKAELEKKLSSERPSSDGEGVVENGITTCNGKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LKVIKEAYSGCSGPVDSECPPPPSSPVHKAELEKKLSSERPSSDGEGVVENGITTCNGKE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 QVKRKKSSKSEAKGTVSKVTGKKITKIISLGKKKPSTDEQTSSAEEDVPTCGYLNVLSNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QVKRKKSSKSEAKGTVSKVTGKKITKIISLGKKKPSTDEQTSSAEEDVPTCGYLNVLSNS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 RWRERWCRVKDNKLIFHKDRTDLKTHIVSIPLRGCEVIPGLDSKHPLTFRLLRNGQEVAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RWRERWCRVKDNKLIFHKDRTDLKTHIVSIPLRGCEVIPGLDSKHPLTFRLLRNGQEVAV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE1 LEASSSEDMGRWIGILLAETGSSTDPEALHYDYIDVEMSASVIQTAKQTFCFMNRRVISA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LEASSSEDMGRWIGILLAETGSSTDPEALHYDYIDVEMSASVIQTAKQTFCFMNRRVISA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE1 NPYLGGTSNGYAHPSGTALHYDDVPCINGSLKGKKPPMASNGVTGKGKTLSSQPKKADPA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS33 NPYLGGTSNGYAHPSGTALHYDDVPCINGSLKGKKPPVASNGVTGKGKTLSSQPKKADPA
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE1 AVVKRTGSNAAQYKYGKNRVEADAKRLQTKEEELLKRKEALRNRLAQLRKERKDLRAAIE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AVVKRTGSNAAQYKYGKNRVEADAKRLQTKEEELLKRKEALRNRLAQLRKERKDLRAAIE
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE1 VNAGRKPQAILEEKLKQLEEECRQKEAERVSLELELTEVKESLKKALAGGVTLGLAIEPK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VNAGRKPQAILEEKLKQLEEECRQKEAERVSLELELTEVKESLKKALAGGVTLGLAIEPK
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE1 SGTSSPQSPVFRHRTLENSPISSCDTSDTEGPVPVNSAAVLKKSQAAPGSSPCRGHVLRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SGTSSPQSPVFRHRTLENSPISSCDTSDTEGPVPVNSAAVLKKSQAAPGSSPCRGHVLRK
              670       680       690       700       710       720

              730
pF1KE1 AKEWELKNGT
       ::::::::::
CCDS33 AKEWELKNGT
              730

>>CCDS47010.1 AFAP1 gene_id:60312|Hs108|chr4              (814 aa)
 initn: 3423 init1: 3423 opt: 3425  Z-score: 2319.2  bits: 439.9 E(32554): 7.4e-123
Smith-Waterman score: 4285; 88.8% identity (89.0% similar) in 762 aa overlap (1-678:1-762)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MEELIVELRLFLELLDHEYLTSTVREKKAVITNILLRIQSSKGFDVKDHAQKQETANSLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MEELIVELRLFLELLDHEYLTSTVREKKAVITNILLRIQSSKGFDVKDHAQKQETANSLP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 APPQMPLPEIPQPWLPPDSGPPPLPTSSLPEGYYEEAVPLSPGKAPEYITSNYDSDAMSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 APPQMPLPEIPQPWLPPDSGPPPLPTSSLPEGYYEEAVPLSPGKAPEYITSNYDSDAMSS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 SYESYDEEEEDGKGKKTRHQWPSEEASMDLVKDAKICAFLLRKKRFGQWTKLLCVIKDTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SYESYDEEEEDGKGKKTRHQWPSEEASMDLVKDAKICAFLLRKKRFGQWTKLLCVIKDTK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 LLCYKSSKDQQPQMELPLQGCNITYIPKDSKKKKHELKITQQGTDPLVLAVQSKEQAEQW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LLCYKSSKDQQPQMELPLQGCNITYIPKDSKKKKHELKITQQGTDPLVLAVQSKEQAEQW
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 LKVIKEAYSGCSGPVDSECPPPPSSPVHKAELEKKLSSERPSSDGEGVVENGITTCNGKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LKVIKEAYSGCSGPVDSECPPPPSSPVHKAELEKKLSSERPSSDGEGVVENGITTCNGKE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 QVKRKKSSKSEAKGTVSKVTGKKITKIISLGKKKPSTDEQTSSAEEDVPTCGYLNVLSNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QVKRKKSSKSEAKGTVSKVTGKKITKIISLGKKKPSTDEQTSSAEEDVPTCGYLNVLSNS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 RWRERWCRVKDNKLIFHKDRTDLKTHIVSIPLRGCEVIPGLDSKHPLTFRLLRNGQEVAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RWRERWCRVKDNKLIFHKDRTDLKTHIVSIPLRGCEVIPGLDSKHPLTFRLLRNGQEVAV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE1 LEASSSEDMGRWIGILLAETGSSTDPEALHYDYIDVEMSASVIQTAKQTFCFMNRRVISA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LEASSSEDMGRWIGILLAETGSSTDPEALHYDYIDVEMSASVIQTAKQTFCFMNRRVISA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510                              
pF1KE1 NPYLGGTSNGYAHPSGTALHYDDVPCINGS------------------------------
       ::::::::::::::::::::::::::::::                              
CCDS47 NPYLGGTSNGYAHPSGTALHYDDVPCINGSWEPEDGFPASCSRGLGEEVLYDNAGLYDNL
              490       500       510       520       530       540

                                                                   
pF1KE1 ------------------------------------------------------LKGKKP
                                                             ::::::
CCDS47 PPPHIFARYSPADRKASRLSADKLSSNHYKYPASAQSVTNTSSVGRASLGLNSQLKGKKP
              550       560       570       580       590       600

        520       530       540       550       560       570      
pF1KE1 PMASNGVTGKGKTLSSQPKKADPAAVVKRTGSNAAQYKYGKNRVEADAKRLQTKEEELLK
       :.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PVASNGVTGKGKTLSSQPKKADPAAVVKRTGSNAAQYKYGKNRVEADAKRLQTKEEELLK
              610       620       630       640       650       660

        580       590       600       610       620       630      
pF1KE1 RKEALRNRLAQLRKERKDLRAAIEVNAGRKPQAILEEKLKQLEEECRQKEAERVSLELEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RKEALRNRLAQLRKERKDLRAAIEVNAGRKPQAILEEKLKQLEEECRQKEAERVSLELEL
              670       680       690       700       710       720

        640       650       660       670       680       690      
pF1KE1 TEVKESLKKALAGGVTLGLAIEPKSGTSSPQSPVFRHRTLENSPISSCDTSDTEGPVPVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::                  
CCDS47 TEVKESLKKALAGGVTLGLAIEPKSGTSSPQSPVFRHRTLENSPISSCDTSDTEGPVPVN
              730       740       750       760       770       780

        700       710       720       730
pF1KE1 SAAVLKKSQAAPGSSPCRGHVLRKAKEWELKNGT
                                         
CCDS47 SAAVLKKSQAAPGSSPCRGHVLRKAKEWELKNGT
              790       800       810    

>>CCDS34274.1 AFAP1L1 gene_id:134265|Hs108|chr5           (768 aa)
 initn: 1785 init1: 679 opt: 1460  Z-score: 995.5  bits: 194.9 E(32554): 4e-49
Smith-Waterman score: 1953; 46.9% identity (71.0% similar) in 710 aa overlap (62-727:93-766)

              40        50        60        70         80          
pF1KE1 TNILLRIQSSKGFDVKDHAQKQETANSLPAPPQMPLPEIPQ-PWLPPDSG-PPPLPTSSL
                                     : .   ::. . : :   .  :::::..  
CCDS34 HSGPSFVESLFEEFDCDLSDLRDMPEDDGEPSKGASPELAKSPRLRNAADLPPPLPNKPP
             70        80        90       100       110       120  

      90       100       110                                       
pF1KE1 PEGYYEEAVPLSPGKAPEYITSNY----------------------------------DS
       :: :::::.::.:::.::::.:.                                   ::
CCDS34 PEDYYEEALPLGPGKSPEYISSHNGCSPSHSIVDGYYEDADSSYPATRVNGELKSSYNDS
            130       140       150       160       170       180  

         120       130       140       150       160       170     
pF1KE1 DAMSSSYESYDEEEEDGKGKKTRHQWPSEEASMDLVKDAKICAFLLRKKRFGQWTKLLCV
       :::::::::::::::.::. . ::::::::::: ::.. .::::::::::::::.: : :
CCDS34 DAMSSSYESYDEEEEEGKSPQPRHQWPSEEASMHLVRECRICAFLLRKKRFGQWAKQLTV
            190       200       210       220       230       240  

         180       190       200       210       220       230     
pF1KE1 IKDTKLLCYKSSKDQQPQMELPLQGCNITYIPKDSKKKKHELKITQQGTDPLVLAVQSKE
       :.. .:::::::::.::...: :. :.: :.::::..:.:::..:: .:. ::::.::.:
CCDS34 IREDQLLCYKSSKDRQPHLRLALDTCSIIYVPKDSRHKRHELRFTQGATEVLVLALQSRE
            250       260       270       280       290       300  

         240       250       260       270       280        290    
pF1KE1 QAEQWLKVIKEAYSGCSGPVDSECPPPPSSPVHKAELEKKLSSERPSSDGEGV-VENGIT
       :::.:::::.:. .  .:    : :  :   . : .:.:.::.:. .::...: : .. .
CCDS34 QAEEWLKVIREVSKPVGGAEGVEVPRSPVL-LCKLDLDKRLSQEKQTSDSDSVGVGDNCS
            310       320       330        340       350       360 

          300          310       320       330        340       350
pF1KE1 TCNGKEQV---KRKKSSKSEAKGTVSKVTGKKITKIISLGKKKPSTDE-QTSSAEEDVPT
       : . .:     : :::: .: ::..:...:.:::.::...:::  .:. ::::.::.:: 
CCDS34 TLGRRETCDHGKGKKSSLAELKGSMSRAAGRKITRIIGFSKKKTLADDLQTSSTEEEVPC
             370       380       390       400       410       420 

              360       370       380       390       400       410
pF1KE1 CGYLNVLSNSRWRERWCRVKDNKLIFHKDRTDLKTHIVSIPLRGCEVIPGLDSKHPLTFR
       ::::::: :. :.:::::.: : : ::::. ::.::. .: :.:::: ::.  .::..::
CCDS34 CGYLNVLVNQGWKERWCRLKCNTLYFHKDHMDLRTHVNAIALQGCEVAPGFGPRHPFAFR
             430       440       450       460       470       480 

              420       430       440       450       460       470
pF1KE1 LLRNGQEVAVLEASSSEDMGRWIGILLAETGSSTDPEALHYDYIDVEMSASVIQTAKQTF
       .::: ::::.:::: :::::::.:.::.: :: . ::::::::.:::  .:........:
CCDS34 ILRNRQEVAILEASCSEDMGRWLGLLLVEMGSRVTPEALHYDYVDVETLTSIVSAGRNSF
             490       500       510       520       530       540 

              480       490       500       510       520          
pF1KE1 CFMNRRVISANPYLGGTSNGYAHPSGTALHYDDVPCINGSLKGKKPPMASNG-VTGKGKT
                   :  . .: . .:      :::::    ... ..:   ... :  ....
CCDS34 L-----------YARSCQNQWPEPRV----YDDVP--YEKMQDEEPERPTGAQVKRHASS
                        550           560         570       580    

     530       540       550       560       570       580         
pF1KE1 LSSQPKKADPAAVVKRTGSNAAQYKYGKNRVEADAKRLQTKEEELLKRKEALRNRLAQLR
        : . ...:: . ::: .:.: ::::::::.: ::.:  ...:.: :.::..:..:  ::
CCDS34 CSEKSHRVDPQVKVKRHASSANQYKYGKNRAEEDARRYLVEKEKLEKEKETIRTELIALR
          590       600       610       620       630       640    

     590       600       610       620       630       640         
pF1KE1 KERKDLRAAIEVNAGRKPQAILEEKLKQLEEECRQKEAERVSLELELTEVKESLKKALAG
       .:...:. ::. . : : .: ::: .  :: .:: :: .:..:::.:. ::: :...:::
CCDS34 QEKRELKEAIRSSPGAKLKA-LEEAVATLEAQCRAKEERRIDLELKLVAVKERLQQSLAG
          650       660        670       680       690       700   

     650         660       670       680       690       700       
pF1KE1 GVTLGLAI--EPKSGTSSPQSPVFRHRTLENSPISSCDTSDTEGPVPVNSAAVLKKSQAA
       : .:::..  .:::: ..            :.: .:      : :.::: .. :.: . .
CCDS34 GPALGLSVSSKPKSGETA------------NKPQNSVP----EQPLPVNCVSELRKRSPS
           710       720                       730       740       

       710       720       730
pF1KE1 PGSSPCRGHVLRKAKEWELKNGT
         .:  .:.::.::::::.:   
CCDS34 IVASN-QGRVLQKAKEWEMKKT 
       750        760         

>>CCDS54932.1 AFAP1L1 gene_id:134265|Hs108|chr5           (725 aa)
 initn: 1735 init1: 679 opt: 1459  Z-score: 995.1  bits: 194.7 E(32554): 4.1e-49
Smith-Waterman score: 1880; 48.4% identity (72.6% similar) in 645 aa overlap (62-662:93-718)

              40        50        60        70         80          
pF1KE1 TNILLRIQSSKGFDVKDHAQKQETANSLPAPPQMPLPEIPQ-PWLPPDSG-PPPLPTSSL
                                     : .   ::. . : :   .  :::::..  
CCDS54 HSGPSFVESLFEEFDCDLSDLRDMPEDDGEPSKGASPELAKSPRLRNAADLPPPLPNKPP
             70        80        90       100       110       120  

      90       100       110                                       
pF1KE1 PEGYYEEAVPLSPGKAPEYITSNY----------------------------------DS
       :: :::::.::.:::.::::.:.                                   ::
CCDS54 PEDYYEEALPLGPGKSPEYISSHNGCSPSHSIVDGYYEDADSSYPATRVNGELKSSYNDS
            130       140       150       160       170       180  

         120       130       140       150       160       170     
pF1KE1 DAMSSSYESYDEEEEDGKGKKTRHQWPSEEASMDLVKDAKICAFLLRKKRFGQWTKLLCV
       :::::::::::::::.::. . ::::::::::: ::.. .::::::::::::::.: : :
CCDS54 DAMSSSYESYDEEEEEGKSPQPRHQWPSEEASMHLVRECRICAFLLRKKRFGQWAKQLTV
            190       200       210       220       230       240  

         180       190       200       210       220       230     
pF1KE1 IKDTKLLCYKSSKDQQPQMELPLQGCNITYIPKDSKKKKHELKITQQGTDPLVLAVQSKE
       :.. .:::::::::.::...: :. :.: :.::::..:.:::..:: .:. ::::.::.:
CCDS54 IREDQLLCYKSSKDRQPHLRLALDTCSIIYVPKDSRHKRHELRFTQGATEVLVLALQSRE
            250       260       270       280       290       300  

         240       250       260       270       280        290    
pF1KE1 QAEQWLKVIKEAYSGCSGPVDSECPPPPSSPVHKAELEKKLSSERPSSDGEGV-VENGIT
       :::.:::::.:. .  .:    : :  :   . : .:.:.::.:. .::...: : .. .
CCDS54 QAEEWLKVIREVSKPVGGAEGVEVPRSPVL-LCKLDLDKRLSQEKQTSDSDSVGVGDNCS
            310       320       330        340       350       360 

          300          310       320       330        340       350
pF1KE1 TCNGKEQV---KRKKSSKSEAKGTVSKVTGKKITKIISLGKKKPSTDE-QTSSAEEDVPT
       : . .:     : :::: .: ::..:...:.:::.::...:::  .:. ::::.::.:: 
CCDS54 TLGRRETCDHGKGKKSSLAELKGSMSRAAGRKITRIIGFSKKKTLADDLQTSSTEEEVPC
             370       380       390       400       410       420 

              360       370       380       390       400       410
pF1KE1 CGYLNVLSNSRWRERWCRVKDNKLIFHKDRTDLKTHIVSIPLRGCEVIPGLDSKHPLTFR
       ::::::: :. :.:::::.: : : ::::. ::.::. .: :.:::: ::.  .::..::
CCDS54 CGYLNVLVNQGWKERWCRLKCNTLYFHKDHMDLRTHVNAIALQGCEVAPGFGPRHPFAFR
             430       440       450       460       470       480 

              420       430       440       450       460       470
pF1KE1 LLRNGQEVAVLEASSSEDMGRWIGILLAETGSSTDPEALHYDYIDVEMSASVIQTAKQTF
       .::: ::::.:::: :::::::.:.::.: :: . ::::::::.:::  .:........:
CCDS54 ILRNRQEVAILEASCSEDMGRWLGLLLVEMGSRVTPEALHYDYVDVETLTSIVSAGRNSF
             490       500       510       520       530       540 

              480       490       500       510       520          
pF1KE1 CFMNRRVISANPYLGGTSNGYAHPSGTALHYDDVPCINGSLKGKKPPMASNG-VTGKGKT
                   :  . .: . .:      :::::    ... ..:   ... :  ....
CCDS54 L-----------YARSCQNQWPEPRV----YDDVP--YEKMQDEEPERPTGAQVKRHASS
                        550           560         570       580    

     530       540       550       560       570       580         
pF1KE1 LSSQPKKADPAAVVKRTGSNAAQYKYGKNRVEADAKRLQTKEEELLKRKEALRNRLAQLR
        : . ...:: . ::: .:.: ::::::::.: ::.:  ...:.: :.::..:..:  ::
CCDS54 CSEKSHRVDPQVKVKRHASSANQYKYGKNRAEEDARRYLVEKEKLEKEKETIRTELIALR
          590       600       610       620       630       640    

     590       600       610       620       630       640         
pF1KE1 KERKDLRAAIEVNAGRKPQAILEEKLKQLEEECRQKEAERVSLELELTEVKESLKKALAG
       .:...:. ::. . : : .: ::: .  :: .:: :: .:..:::.:. ::: :...:::
CCDS54 QEKRELKEAIRSSPGAKLKA-LEEAVATLEAQCRAKEERRIDLELKLVAVKERLQQSLAG
          650       660        670       680       690       700   

     650         660       670       680       690       700       
pF1KE1 GVTLGLAI--EPKSGTSSPQSPVFRHRTLENSPISSCDTSDTEGPVPVNSAAVLKKSQAA
       : .:::..  .::::                                             
CCDS54 GPALGLSVSSKPKSGEWEMKKT                                      
           710       720                                           

>>CCDS31287.1 AFAP1L2 gene_id:84632|Hs108|chr10           (814 aa)
 initn: 1529 init1: 509 opt: 667  Z-score: 460.7  bits: 96.0 E(32554): 2.4e-19
Smith-Waterman score: 1363; 36.3% identity (61.4% similar) in 801 aa overlap (1-670:7-780)

                     10        20        30         40             
pF1KE1       MEELIVELRLFLELLDHEYLTSTVREKKAVITNIL-LRIQSSKG-----FDVKD
             .:.:..::  ::..::.: :.::.  ::. ....: :  .::..     .  : 
CCDS31 MERYKALEQLLTELDDFLKILDQENLSSTALVKKSCLAELLRLYTKSSSSDEEYIYMNKV
               10        20        30        40        50        60

       50                  60                70        80        90
pF1KE1 HAQKQETANS----------LP--------APPQMPLPEIPQPWLPPDSGPPPLPTSSLP
         .::..:.:          ::        . ::  ::..: : . :.     .: .  :
CCDS31 TINKQQNAESQGKAPEEQGLLPNGEPSQHSSAPQKSLPDLPPPKMIPERKQLAIPKTESP
               70        80        90       100       110       120

              100       110        120       130        140        
pF1KE1 EGYYEEAVPLSPGKAPEYITS-NYDSDAMSSSYESYDEEEEDG-KGKKTRHQWPSEEASM
       ::::::: :        : :: : :..:.::::::::::  :: :::.. .:::: ::..
CCDS31 EGYYEEAEP--------YDTSLNEDGEAVSSSYESYDEE--DGSKGKSAPYQWPSPEAGI
                      130       140       150         160       170

      150       160       170       180       190       200        
pF1KE1 DLVKDAKICAFLLRKKRFGQWTKLLCVIKDTKLLCYKSSKDQQPQMELPLQGCNITYIPK
       .:..::.::::: ::: .:::.: ::::::..:::::::::..::... : : .. .  :
CCDS31 ELMRDARICAFLWRKKWLGQWAKQLCVIKDNRLLCYKSSKDHSPQLDVNLLGSSVIHKEK
              180       190       200       210       220       230

      210       220       230       240       250       260        
pF1KE1 DSKKKKHELKITQQGTDPLVLAVQSKEQAEQWLKVIKEAYSGCSGPVDSECPPPPSSP-V
       . .::.:.:::: ...: .::..:::.::::::.::.:. ::   : ..       .: .
CCDS31 QVRKKEHKLKITPMNADVIVLGLQSKDQAEQWLRVIQEV-SGL--PSEGASEGNQYTPDA
              240       250       260        270         280       

       270       280       290       300       310       320       
pF1KE1 HKAELEKKLSSERPSSDGEGVVENGITTCNGKEQVKRKKSSKSEAKGTVSKVTGKKITKI
       .. . .:   .:.  :    . : : .. .:. .: . :. :.. ..      : :....
CCDS31 QRFNCQKPDIAEKYLS----ASEYG-SSVDGHPEVPETKDVKKKCSA------GLKLSNL
       290       300            310       320             330      

       330       340       350       360       370       380       
pF1KE1 ISLGKKKPSTDEQTSSAEEDVPTCGYLNVLSNSRWRERWCRVKDNKLIFHKDRTDLKTHI
       ..::.:: .. : .   :... : .::::: ::.:. ::: :.::.: :..::.  :.  
CCDS31 MNLGRKKSTSLEPV---ERSLETSSYLNVLVNSQWKSRWCSVRDNHLHFYQDRNRSKVAQ
        340       350          360       370       380       390   

       390       400       410       420       430       440       
pF1KE1 VSIPLRGCEVIPGLDSKHPLTFRLLRNGQEVAVLEASSSEDMGRWIGILLAETGSSTDPE
         . : ::::.:  .  :  .::.:..:.:.: :::.:::.::.:.:.::.:.::.::::
CCDS31 QPLSLVGCEVVPDPSPDHLYSFRILHKGEELAKLEAKSSEEMGHWLGLLLSESGSKTDPE
           400       410       420       430       440       450   

       450       460       470       480                           
pF1KE1 ALHYDYIDVEMSASVIQTAKQTFCFMNRRVISANPYLGGTSN------------------
        . :::.:..  . ....::... .:.:.    : :. :  .                  
CCDS31 EFTYDYVDADRVSCIVSAAKNSLLLMQRKFSEPNTYIDGLPSQDRQEELYDDVDLSELTA
           460       470       480       490       500       510   

                                    490                         500
pF1KE1 -------------------------------GYAH-PSGT-----------------ALH
                                      .. : ::..                 :: 
CCDS31 AVEPTEEATPVADDPNERESDRVYLDLTPVKSFLHGPSSAQAQASSPTLSCLDNATEALP
           520       530       540       550       560       570   

                               510         520       530           
pF1KE1 YD-------DVPCIN-----G-----SLKGKKPPM--ASNGVTGKGKTLSSQPKKAD---
        :       : :::.     :     ::. . : .  ..  .  . . .:  :.  :   
CCDS31 ADSGPGPTPDEPCIKCPENLGEQQLESLEPEDPSLRITTVKIQTEQQRISFPPSCPDAVV
           580       590       600       610       620       630   

         540          550       560       570       580       590  
pF1KE1 ---PAA---VVKRTGSNAAQYKYGKNRVEADAKRLQTKEEELLKRKEALRNRLAQLRKER
          :.:   :  :   ..:. : ::::.::..::   ..:.: :.:: .:..:::::::.
CCDS31 ATPPGASPPVKDRLRVTSAEIKLGKNRTEAEVKRYTEEKERLEKKKEEIRGHLAQLRKEK
           640       650       660       670       680       690   

            600       610       620       630       640       650  
pF1KE1 KDLRAAIEVNAGRKPQAILEEKLKQLEEECRQKEAERVSLELELTEVKESLKKALAGGVT
       ..:. ..   . ..  : ::.:::...:::: .:..::.::: . :::..:::: :: ::
CCDS31 RELKETLLKCTDKEVLASLEQKLKEIDEECRGEESRRVDLELSIMEVKDNLKKAEAGPVT
           700       710       720       730       740       750   

                  660          670       680       690       700   
pF1KE1 LGLAIE------PKSGT--SSPQ-SPVFRHRTLENSPISSCDTSDTEGPVPVNSAAVLKK
       :: ...      ::. :  :.:. .::                                 
CCDS31 LGTTVDTTHLENPKAVTPASAPDCTPVNSATTLKNRPLSVVVTGKGTVLQKAKEWEKKGA
           760       770       780       790       800       810   

>>CCDS31286.1 AFAP1L2 gene_id:84632|Hs108|chr10           (818 aa)
 initn: 1557 init1: 509 opt: 667  Z-score: 460.7  bits: 96.0 E(32554): 2.4e-19
Smith-Waterman score: 1360; 36.4% identity (61.7% similar) in 780 aa overlap (1-658:7-759)

                     10        20        30         40             
pF1KE1       MEELIVELRLFLELLDHEYLTSTVREKKAVITNIL-LRIQSSKG-----FDVKD
             .:.:..::  ::..::.: :.::.  ::. ....: :  .::..     .  : 
CCDS31 MERYKALEQLLTELDDFLKILDQENLSSTALVKKSCLAELLRLYTKSSSSDEEYIYMNKV
               10        20        30        40        50        60

       50                  60                70        80        90
pF1KE1 HAQKQETANS----------LP--------APPQMPLPEIPQPWLPPDSGPPPLPTSSLP
         .::..:.:          ::        . ::  ::..: : . :.     .: .  :
CCDS31 TINKQQNAESQGKAPEEQGLLPNGEPSQHSSAPQKSLPDLPPPKMIPERKQLAIPKTESP
               70        80        90       100       110       120

              100       110        120       130        140        
pF1KE1 EGYYEEAVPLSPGKAPEYITS-NYDSDAMSSSYESYDEEEEDG-KGKKTRHQWPSEEASM
       ::::::: :        : :: : :..:.::::::::::  :: :::.. .:::: ::..
CCDS31 EGYYEEAEP--------YDTSLNEDGEAVSSSYESYDEE--DGSKGKSAPYQWPSPEAGI
                      130       140       150         160       170

      150       160       170       180       190       200        
pF1KE1 DLVKDAKICAFLLRKKRFGQWTKLLCVIKDTKLLCYKSSKDQQPQMELPLQGCNITYIPK
       .:..::.::::: ::: .:::.: ::::::..:::::::::..::... : : .. .  :
CCDS31 ELMRDARICAFLWRKKWLGQWAKQLCVIKDNRLLCYKSSKDHSPQLDVNLLGSSVIHKEK
              180       190       200       210       220       230

      210       220       230       240       250       260        
pF1KE1 DSKKKKHELKITQQGTDPLVLAVQSKEQAEQWLKVIKEAYSGCSGPVDSECPPPPSSP-V
       . .::.:.:::: ...: .::..:::.::::::.::.:. ::   : ..       .: .
CCDS31 QVRKKEHKLKITPMNADVIVLGLQSKDQAEQWLRVIQEV-SGL--PSEGASEGNQYTPDA
              240       250       260        270         280       

       270       280       290       300       310       320       
pF1KE1 HKAELEKKLSSERPSSDGEGVVENGITTCNGKEQVKRKKSSKSEAKGTVSKVTGKKITKI
       .. . .:   .:.  :    . : : .. .:. .: . :. :.. ..      : :....
CCDS31 QRFNCQKPDIAEKYLS----ASEYG-SSVDGHPEVPETKDVKKKCSA------GLKLSNL
       290       300            310       320             330      

       330       340       350       360       370       380       
pF1KE1 ISLGKKKPSTDEQTSSAEEDVPTCGYLNVLSNSRWRERWCRVKDNKLIFHKDRTDLKTHI
       ..::.:: .. : .   :... : .::::: ::.:. ::: :.::.: :..::.  :.  
CCDS31 MNLGRKKSTSLEPV---ERSLETSSYLNVLVNSQWKSRWCSVRDNHLHFYQDRNRSKVAQ
        340       350          360       370       380       390   

       390       400       410       420       430       440       
pF1KE1 VSIPLRGCEVIPGLDSKHPLTFRLLRNGQEVAVLEASSSEDMGRWIGILLAETGSSTDPE
         . : ::::.:  .  :  .::.:..:.:.: :::.:::.::.:.:.::.:.::.::::
CCDS31 QPLSLVGCEVVPDPSPDHLYSFRILHKGEELAKLEAKSSEEMGHWLGLLLSESGSKTDPE
           400       410       420       430       440       450   

       450       460       470       480                           
pF1KE1 ALHYDYIDVEMSASVIQTAKQTFCFMNRRVISANPYLGGTSN------------------
        . :::.:..  . ....::... .:.:.    : :. :  .                  
CCDS31 EFTYDYVDADRVSCIVSAAKNSLLLMQRKFSEPNTYIDGLPSQDRQEELYDDVDLSELTA
           460       470       480       490       500       510   

                                    490                         500
pF1KE1 -------------------------------GYAH-PSGT-----------------ALH
                                      .. : ::..                 :: 
CCDS31 AVEPTEEATPVADDPNERESDRVYLDLTPVKSFLHGPSSAQAQASSPTLSCLDNATEALP
           520       530       540       550       560       570   

                               510         520       530           
pF1KE1 YD-------DVPCIN-----G-----SLKGKKPPM--ASNGVTGKGKTLSSQPKKAD---
        :       : :::.     :     ::. . : .  ..  .  . . .:  :.  :   
CCDS31 ADSGPGPTPDEPCIKCPENLGEQQLESLEPEDPSLRITTVKIQTEQQRISFPPSCPDAVV
           580       590       600       610       620       630   

         540          550       560       570       580       590  
pF1KE1 ---PAA---VVKRTGSNAAQYKYGKNRVEADAKRLQTKEEELLKRKEALRNRLAQLRKER
          :.:   :  :   ..:. : ::::.::..::   ..:.: :.:: .:..:::::::.
CCDS31 ATPPGASPPVKDRLRVTSAEIKLGKNRTEAEVKRYTEEKERLEKKKEEIRGHLAQLRKEK
           640       650       660       670       680       690   

            600       610       620       630       640       650  
pF1KE1 KDLRAAIEVNAGRKPQAILEEKLKQLEEECRQKEAERVSLELELTEVKESLKKALAGGVT
       ..:. ..   . ..  : ::.:::...:::: .:..::.::: . :::..:::: :: ::
CCDS31 RELKETLLKCTDKEVLASLEQKLKEIDEECRGEESRRVDLELSIMEVKDNLKKAEAGPVT
           700       710       720       730       740       750   

            660       670       680       690       700       710  
pF1KE1 LGLAIEPKSGTSSPQSPVFRHRTLENSPISSCDTSDTEGPVPVNSAAVLKKSQAAPGSSP
       :: ...                                                      
CCDS31 LGTTVDTTHLENVSPRPKAVTPASAPDCTPVNSATTLKNRPLSVVVTGKGTVLQKAKEWE
           760       770       780       790       800       810   




730 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sat Nov  5 07:25:57 2016 done: Sat Nov  5 07:25:58 2016
 Total Scan time:  5.000 Total Display time:  0.130

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com