seq1 = pF1KB5606.tfa, 1836 bp seq2 = pF1KB5606/gi568815595f_188306121.tfa (gi568815595f:188306121_188974476), 668356 bp >pF1KB5606 1836 >gi568815595f:188306121_188974476 (Chr3) 1-193 (100001-100193) 100% -> 194-306 (178472-178584) 100% -> 307-429 (218545-218667) 100% -> 430-1113 (303041-303724) 100% -> 1114-1240 (402147-402273) 100% -> 1241-1410 (453993-454162) 100% -> 1411-1589 (560080-560258) 100% -> 1590-1710 (566523-566643) 99% -> 1711-1836 (568231-568356) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGTCTCACCCATCTTGGCTGCCACCCAAAAGCACTGGTGAGCCCCTCGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGTCTCACCCATCTTGGCTGCCACCCAAAAGCACTGGTGAGCCCCTCGG 50 . : . : . : . : . : 51 CCATGTGCCTGCACGGATGGAGACCACCCATTCCTTTGGGAACCCCAGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 CCATGTGCCTGCACGGATGGAGACCACCCATTCCTTTGGGAACCCCAGCA 100 . : . : . : . : . : 101 TTTCAGTGTCTACACAACAGCCACCCAAAAAGTTTGCCCCGGTAGTTGCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100101 TTTCAGTGTCTACACAACAGCCACCCAAAAAGTTTGCCCCGGTAGTTGCT 150 . : . : . : . : . : 151 CCAAAACCTAAGTACAACCCATACAAACAACCTGGAGGTGAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...> 100151 CCAAAACCTAAGTACAACCCATACAAACAACCTGGAGGTGAGGGTA...T 200 . : . : . : . : . : 194 GTGATTTTCTTCCACCCCCACCTCCACCTCTAGATGATTCCAGTGCCC >>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 178470 AGGTGATTTTCTTCCACCCCCACCTCCACCTCTAGATGATTCCAGTGCCC 250 . : . : . : . : . : 242 TTCCATCTATCTCTGGAAACTTTCCTCCTCCACCACCTCTTGATGAAGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 178520 TTCCATCTATCTCTGGAAACTTTCCTCCTCCACCACCTCTTGATGAAGAG 300 . : . : . : . : . : 292 GCTTTCAAAGTACAG GGGAATCCCGGAGGCAAGACACTTGA |||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||| 178570 GCTTTCAAAGTACAGGTA...CAGGGGAATCCCGGAGGCAAGACACTTGA 350 . : . : . : . : . : 333 GGAGAGGCGCTCCAGCCTGGACGCTGAGATTGACTCCTTGACCAGCATCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 218571 GGAGAGGCGCTCCAGCCTGGACGCTGAGATTGACTCCTTGACCAGCATCT 400 . : . : . : . : . : 383 TGGCTGACCTTGAGTGCAGCTCCCCCTATAAGCCTCGGCCTCCACAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>> 218621 TGGCTGACCTTGAGTGCAGCTCCCCCTATAAGCCTCGGCCTCCACAGGTT 450 . : . : . : . : . : 430 AGCTCCACTGGTTCAACAGCCTCTCCTCCAGTTTCGACCCCAGT ...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 218671 ...TAGAGCTCCACTGGTTCAACAGCCTCTCCTCCAGTTTCGACCCCAGT 500 . : . : . : . : . : 474 CACAGGACACAAGAGAATGGTCATCCCGAACCAACCCCCTCTAACAGCAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 303085 CACAGGACACAAGAGAATGGTCATCCCGAACCAACCCCCTCTAACAGCAA 550 . : . : . : . : . : 524 CCAAGAAGTCTACATTGAAACCACAGCCTGCACCCCAGGCTGGACCCATC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 303135 CCAAGAAGTCTACATTGAAACCACAGCCTGCACCCCAGGCTGGACCCATC 600 . : . : . : . : . : 574 CCTGTGGCTCCAATCGGAACACTCAAACCCCAGCCTCAGCCAGTCCCAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 303185 CCTGTGGCTCCAATCGGAACACTCAAACCCCAGCCTCAGCCAGTCCCAGC 650 . : . : . : . : . : 624 CTCCTACACCACGGCCTCCACTTCTTCAAGGCCTACCTTTAATGTGCAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 303235 CTCCTACACCACGGCCTCCACTTCTTCAAGGCCTACCTTTAATGTGCAGG 700 . : . : . : . : . : 674 TGAAGTCAGCCCAGCCCAGCCCTCATTATATGGCTGCCCCTTCATCAGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 303285 TGAAGTCAGCCCAGCCCAGCCCTCATTATATGGCTGCCCCTTCATCAGGA 750 . : . : . : . : . : 724 CAAATTTATGGCTCAGGGCCCCAGGGCTATAACACTCAGCCAGTTCCTGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 303335 CAAATTTATGGCTCAGGGCCCCAGGGCTATAACACTCAGCCAGTTCCTGT 800 . : . : . : . : . : 774 CTCTGGGCAGTGTCCACCTCCTTCAACACGGGGAGGCATGGATTATGCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 303385 CTCTGGGCAGTGTCCACCTCCTTCAACACGGGGAGGCATGGATTATGCCT 850 . : . : . : . : . : 824 ACATTCCACCACCAGGACTTCAGCCGGAGCCTGGGTATGGGTATGCCCCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 303435 ACATTCCACCACCAGGACTTCAGCCGGAGCCTGGGTATGGGTATGCCCCC 900 . : . : . : . : . : 874 AACCAGGGACGCTATTATGAAGGCTACTATGCAGCAGGGCCAGGCTATGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 303485 AACCAGGGACGCTATTATGAAGGCTACTATGCAGCAGGGCCAGGCTATGG 950 . : . : . : . : . : 924 GGGCAGAAATGACTCTGACCCTACCTATGGTCAACAAGGTCACCCAAATA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 303535 GGGCAGAAATGACTCTGACCCTACCTATGGTCAACAAGGTCACCCAAATA 1000 . : . : . : . : . : 974 CCTGGAAACGGGAACCAGGGTACACTCCTCCTGGAGCAGGGAACCAGAAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 303585 CCTGGAAACGGGAACCAGGGTACACTCCTCCTGGAGCAGGGAACCAGAAC 1050 . : . : . : . : . : 1024 CCTCCTGGGATGTATCCAGTCACTGGTCCCAAGAAGACCTATATCACAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 303635 CCTCCTGGGATGTATCCAGTCACTGGTCCCAAGAAGACCTATATCACAGA 1100 . : . : . : . : . : 1074 TCCTGTTTCAGCCCCCTGTGCGCCACCATTGCAGCCAAAG G ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>| 303685 TCCTGTTTCAGCCCCCTGTGCGCCACCATTGCAGCCAAAGGTA...CAGG 1150 . : . : . : . : . : 1115 GTGGCCATTCAGGGCAACTGGGGCCTTCGTCAGTTGCCCCTTCATTCCGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 402148 GTGGCCATTCAGGGCAACTGGGGCCTTCGTCAGTTGCCCCTTCATTCCGC 1200 . : . : . : . : . : 1165 CCAGAGGATGAGCTTGAGCACCTGACCAAAAAGATGCTGTATGACATGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 402198 CCAGAGGATGAGCTTGAGCACCTGACCAAAAAGATGCTGTATGACATGGA 1250 . : . : . : . : . : 1215 AAATCCACCTGCTGACGAATACTTTG GCCGCTGTGCTCGCT ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||| 402248 AAATCCACCTGCTGACGAATACTTTGGTG...CAGGCCGCTGTGCTCGCT 1300 . : . : . : . : . : 1256 GTGGAGAAAACGTAGTTGGGGAAGGTACAGGATGCACTGCCATGGATCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 454008 GTGGAGAAAACGTAGTTGGGGAAGGTACAGGATGCACTGCCATGGATCAG 1350 . : . : . : . : . : 1306 GTCTTCCACGTGGATTGTTTTACCTGCATCATCTGCAACAACAAGCTCCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 454058 GTCTTCCACGTGGATTGTTTTACCTGCATCATCTGCAACAACAAGCTCCG 1400 . : . : . : . : . : 1356 AGGGCAGCCATTCTATGCTGTGGAAAAGAAAGCATACTGCGAGCCCTGCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 454108 AGGGCAGCCATTCTATGCTGTGGAAAAGAAAGCATACTGCGAGCCCTGCT 1450 . : . : . : . : . : 1406 ACATT AATACTCTGGAGCAGTGCAATGTGTGTTCCAAGCCC |||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 454158 ACATTGTA...CAGAATACTCTGGAGCAGTGCAATGTGTGTTCCAAGCCC 1500 . : . : . : . : . : 1447 ATCATGGAGCGGATTCTCCGAGCCACCGGGAAGGCCTATCATCCTCACTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 560116 ATCATGGAGCGGATTCTCCGAGCCACCGGGAAGGCCTATCATCCTCACTG 1550 . : . : . : . : . : 1497 TTTCACCTGCGTGATGTGCCACCGCAGCCTGGATGGGATCCCATTCACTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 560166 TTTCACCTGCGTGATGTGCCACCGCAGCCTGGATGGGATCCCATTCACTG 1600 . : . : . : . : . : 1547 TGGATGCTGGCGGGCTCATTCACTGCATTGAGGACTTCCACAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...> 560216 TGGATGCTGGCGGGCTCATTCACTGCATTGAGGACTTCCACAAGTA...C 1650 . : . : . : . : . : 1590 GAAATTTGCCCCGCGGTGTTCTGTGTGCAAGGAGCCTATTATGCCAGC >>||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| 566521 AGGAAATTTGCCCCGCGATGTTCTGTGTGCAAGGAGCCTATTATGCCAGC 1700 . : . : . : . : . : 1638 CCCGGGCCAGGAGGAGACTGTCCGTATTGTGGCTTTGGATCGAGATTTCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 566571 CCCGGGCCAGGAGGAGACTGTCCGTATTGTGGCTTTGGATCGAGATTTCC 1750 . : . : . : . : . : 1688 ATGTTCACTGCTACCGATGCGAG GATTGCGGTGGTCTCCTG |||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||| 566621 ATGTTCACTGCTACCGATGCGAGGTC...TAGGATTGCGGTGGTCTCCTG 1800 . : . : . : . : . : 1729 TCTGAAGGAGATAACCAAGGCTGCTACCCCTTGGATGGGCACATCCTCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 568249 TCTGAAGGAGATAACCAAGGCTGCTACCCCTTGGATGGGCACATCCTCTG 1850 . : . : . : . : . : 1779 CAAGACCTGCAACTCTGCCCGCATCAGGGTGTTGACCGCCAAGGCGAGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 568299 CAAGACCTGCAACTCTGCCCGCATCAGGGTGTTGACCGCCAAGGCGAGCA 1900 . 1829 CTGACCTT |||||||| 568349 CTGACCTT