Result of FASTA (omim) for pF1KB5565
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5565, 737 aa
  1>>>pF1KB5565 737 - 737 aa - 737 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.6036+/-0.000448; mu= 23.4253+/- 0.028
 mean_var=56.8636+/-12.084, 0's: 0 Z-trim(107.9): 26  B-trim: 692 in 1/52
 Lambda= 0.170082
 statistics sampled from 15922 (15941) to 15922 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.539), E-opt: 0.2 (0.187), width:  16
 Scan time: 10.570

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_000926 (OMIM: 601865,609220) procollagen-lysine ( 737) 5083 1256.3       0
NP_891988 (OMIM: 601865,609220) procollagen-lysine ( 758) 3408 845.3       0
NP_001075 (OMIM: 603066,612394) procollagen-lysine ( 738) 3173 787.7       0
NP_000293 (OMIM: 153454,225400) procollagen-lysine ( 727) 3165 785.7       0
NP_001303249 (OMIM: 153454,225400) procollagen-lys ( 774) 3155 783.3       0
XP_005247592 (OMIM: 601865,609220) PREDICTED: proc ( 666) 2779 691.0 4.2e-198
XP_016862114 (OMIM: 601865,609220) PREDICTED: proc ( 666) 2779 691.0 4.2e-198
XP_011517065 (OMIM: 616626) PREDICTED: probable in ( 517)  226 64.4 1.3e-09
NP_001273689 (OMIM: 616626) probable inactive glyc ( 517)  226 64.4 1.3e-09
XP_011517064 (OMIM: 616626) PREDICTED: probable in ( 595)  226 64.5 1.4e-09
NP_057258 (OMIM: 616626) probable inactive glycosy ( 595)  226 64.5 1.4e-09
XP_016870283 (OMIM: 616626) PREDICTED: probable in ( 595)  226 64.5 1.4e-09
XP_005252092 (OMIM: 616626) PREDICTED: probable in ( 595)  226 64.5 1.4e-09


>>NP_000926 (OMIM: 601865,609220) procollagen-lysine,2-o  (737 aa)
 initn: 5083 init1: 5083 opt: 5083  Z-score: 6732.4  bits: 1256.3 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 5083; 100.0% identity (100.0% similar) in 737 aa overlap (1-737:1-737)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MGGCTVKPQLLLLALVLHPWNPCLGADSEKPSSIPTDKLLVITVATKESDGFHRFMQSAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MGGCTVKPQLLLLALVLHPWNPCLGADSEKPSSIPTDKLLVITVATKESDGFHRFMQSAK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 YFNYTVKVLGQGEEWRGGDGINSIGGGQKVRLMKEVMEHYADQDDLVVMFTECFDVIFAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YFNYTVKVLGQGEEWRGGDGINSIGGGQKVRLMKEVMEHYADQDDLVVMFTECFDVIFAG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 GPEEVLKKFQKANHKVVFAADGILWPDKRLADKYPVVHIGKRYLNSGGFIGYAPYVNRIV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GPEEVLKKFQKANHKVVFAADGILWPDKRLADKYPVVHIGKRYLNSGGFIGYAPYVNRIV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 QQWNLQDNDDDQLFYTKVYIDPLKREAINITLDHKCKIFQTLNGAVDEVVLKFENGKARA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 QQWNLQDNDDDQLFYTKVYIDPLKREAINITLDHKCKIFQTLNGAVDEVVLKFENGKARA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 KNTFYETLPVAINGNGPTKILLNYFGNYVPNSWTQDNGCTLCEFDTVDLSAVDVHPNVSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KNTFYETLPVAINGNGPTKILLNYFGNYVPNSWTQDNGCTLCEFDTVDLSAVDVHPNVSI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 GVFIEQPTPFLPRFLDILLTLDYPKEALKLFIHNKEVYHEKDIKVFFDKAKHEIKTIKIV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GVFIEQPTPFLPRFLDILLTLDYPKEALKLFIHNKEVYHEKDIKVFFDKAKHEIKTIKIV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 GPEENLSQAEARNMGMDFCRQDEKCDYYFSVDADVVLTNPRTLKILIEQNRKIIAPLVTR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GPEENLSQAEARNMGMDFCRQDEKCDYYFSVDADVVLTNPRTLKILIEQNRKIIAPLVTR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 HGKLWSNFWGALSPDGYYARSEDYVDIVQGNRVGVWNVPYMANVYLIKGKTLRSEMNERN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 HGKLWSNFWGALSPDGYYARSEDYVDIVQGNRVGVWNVPYMANVYLIKGKTLRSEMNERN
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 YFVRDKLDPDMALCRNAREMGVFMYISNRHEFGRLLSTANYNTSHYNNDLWQIFENPVDW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YFVRDKLDPDMALCRNAREMGVFMYISNRHEFGRLLSTANYNTSHYNNDLWQIFENPVDW
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 KEKYINRDYSKIFTENIVEQPCPDVFWFPIFSEKACDELVEEMEHYGKWSGGKHHDSRIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KEKYINRDYSKIFTENIVEQPCPDVFWFPIFSEKACDELVEEMEHYGKWSGGKHHDSRIS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB5 GGYENVPTDDIHMKQVDLENVWLHFIREFIAPVTLKVFAGYYTKGFALLNFVVKYSPERQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GGYENVPTDDIHMKQVDLENVWLHFIREFIAPVTLKVFAGYYTKGFALLNFVVKYSPERQ
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB5 RSLRPHHDASTFTINIALNNVGEDFQGGGCKFLRYNCSIESPRKGWSFMHPGRLTHLHEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 RSLRPHHDASTFTINIALNNVGEDFQGGGCKFLRYNCSIESPRKGWSFMHPGRLTHLHEG
              670       680       690       700       710       720

              730       
pF1KB5 LPVKNGTRYIAVSFIDP
       :::::::::::::::::
NP_000 LPVKNGTRYIAVSFIDP
              730       

>>NP_891988 (OMIM: 601865,609220) procollagen-lysine,2-o  (758 aa)
 initn: 5069 init1: 3408 opt: 3408  Z-score: 4511.0  bits: 845.3 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 5031; 97.2% identity (97.2% similar) in 758 aa overlap (1-737:1-758)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MGGCTVKPQLLLLALVLHPWNPCLGADSEKPSSIPTDKLLVITVATKESDGFHRFMQSAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 MGGCTVKPQLLLLALVLHPWNPCLGADSEKPSSIPTDKLLVITVATKESDGFHRFMQSAK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 YFNYTVKVLGQGEEWRGGDGINSIGGGQKVRLMKEVMEHYADQDDLVVMFTECFDVIFAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 YFNYTVKVLGQGEEWRGGDGINSIGGGQKVRLMKEVMEHYADQDDLVVMFTECFDVIFAG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 GPEEVLKKFQKANHKVVFAADGILWPDKRLADKYPVVHIGKRYLNSGGFIGYAPYVNRIV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 GPEEVLKKFQKANHKVVFAADGILWPDKRLADKYPVVHIGKRYLNSGGFIGYAPYVNRIV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 QQWNLQDNDDDQLFYTKVYIDPLKREAINITLDHKCKIFQTLNGAVDEVVLKFENGKARA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 QQWNLQDNDDDQLFYTKVYIDPLKREAINITLDHKCKIFQTLNGAVDEVVLKFENGKARA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 KNTFYETLPVAINGNGPTKILLNYFGNYVPNSWTQDNGCTLCEFDTVDLSAVDVHPNVSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 KNTFYETLPVAINGNGPTKILLNYFGNYVPNSWTQDNGCTLCEFDTVDLSAVDVHPNVSI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 GVFIEQPTPFLPRFLDILLTLDYPKEALKLFIHNKEVYHEKDIKVFFDKAKHEIKTIKIV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 GVFIEQPTPFLPRFLDILLTLDYPKEALKLFIHNKEVYHEKDIKVFFDKAKHEIKTIKIV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 GPEENLSQAEARNMGMDFCRQDEKCDYYFSVDADVVLTNPRTLKILIEQNRKIIAPLVTR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 GPEENLSQAEARNMGMDFCRQDEKCDYYFSVDADVVLTNPRTLKILIEQNRKIIAPLVTR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 HGKLWSNFWGALSPDGYYARSEDYVDIVQGNRVGVWNVPYMANVYLIKGKTLRSEMNERN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 HGKLWSNFWGALSPDGYYARSEDYVDIVQGNRVGVWNVPYMANVYLIKGKTLRSEMNERN
              430       440       450       460       470       480

              490       500                            510         
pF1KB5 YFVRDKLDPDMALCRNAREM---------------------GVFMYISNRHEFGRLLSTA
       ::::::::::::::::::::                     :::::::::::::::::::
NP_891 YFVRDKLDPDMALCRNAREMTLQREKDSPTPETFQMLSPPKGVFMYISNRHEFGRLLSTA
              490       500       510       520       530       540

     520       530       540       550       560       570         
pF1KB5 NYNTSHYNNDLWQIFENPVDWKEKYINRDYSKIFTENIVEQPCPDVFWFPIFSEKACDEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 NYNTSHYNNDLWQIFENPVDWKEKYINRDYSKIFTENIVEQPCPDVFWFPIFSEKACDEL
              550       560       570       580       590       600

     580       590       600       610       620       630         
pF1KB5 VEEMEHYGKWSGGKHHDSRISGGYENVPTDDIHMKQVDLENVWLHFIREFIAPVTLKVFA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 VEEMEHYGKWSGGKHHDSRISGGYENVPTDDIHMKQVDLENVWLHFIREFIAPVTLKVFA
              610       620       630       640       650       660

     640       650       660       670       680       690         
pF1KB5 GYYTKGFALLNFVVKYSPERQRSLRPHHDASTFTINIALNNVGEDFQGGGCKFLRYNCSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 GYYTKGFALLNFVVKYSPERQRSLRPHHDASTFTINIALNNVGEDFQGGGCKFLRYNCSI
              670       680       690       700       710       720

     700       710       720       730       
pF1KB5 ESPRKGWSFMHPGRLTHLHEGLPVKNGTRYIAVSFIDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 ESPRKGWSFMHPGRLTHLHEGLPVKNGTRYIAVSFIDP
              730       740       750        

>>NP_001075 (OMIM: 603066,612394) procollagen-lysine,2-o  (738 aa)
 initn: 3163 init1: 2219 opt: 3173  Z-score: 4199.5  bits: 787.7 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 3173; 58.6% identity (84.9% similar) in 734 aa overlap (8-737:8-738)

               10        20        30           40        50       
pF1KB5 MGGCTVKPQLLLLALVLHPWNPCLGADSEKPSS---IPTDKLLVITVATKESDGFHRFMQ
              :..:::  .: :  :  .: :..: .   .  .::::::::: :..:. ::..
NP_001 MTSSGPGPRFLLLLPLLLP--PAASA-SDRPRGRDPVNPEKLLVITVATAETEGYLRFLR
               10          20         30        40        50       

        60        70        80        90       100       110       
pF1KB5 SAKYFNYTVKVLGQGEEWRGGDGINSIGGGQKVRLMKEVMEHYADQDDLVVMFTECFDVI
       ::..:::::..:: ::::::::   ..::::::: .:. ::.:::..:...::.. .:::
NP_001 SAEFFNYTVRTLGLGEEWRGGDVARTVGGGQKVRWLKKEMEKYADREDMIIMFVDSYDVI
        60        70        80        90       100       110       

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB5 FAGGPEEVLKKFQKANHKVVFAADGILWPDKRLADKYPVVHIGKRYLNSGGFIGYAPYVN
       .::.: :.:::: ... ...:.:... ::.  ::..:: :  :::.::::::::.:  ..
NP_001 LAGSPTELLKKFVQSGSRLLFSAESFCWPEWGLAEQYPEVGTGKRFLNSGGFIGFATTIH
       120       130       140       150       160       170       

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pF1KB5 RIVQQWNLQDNDDDQLFYTKVYIDPLKREAINITLDHKCKIFQTLNGAVDEVVLKFENGK
       .::.::. .:.::::::::..:.::  :: ....:::: .:::.::::.:::::::. ..
NP_001 QIVRQWKYKDDDDDQLFYTRLYLDPGLREKLSLNLDHKSRIFQNLNGALDEVVLKFDRNR
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pF1KB5 ARAKNTFYETLPVAINGNGPTKILLNYFGNYVPNSWTQDNGCTLCEFDTVDLSAVDVHPN
       .: .:. :.:::....::::::. :::.::::::.:: ..:: .:. :   : . .  : 
NP_001 VRIRNVAYDTLPIVVHGNGPTKLQLNYLGNYVPNGWTPEGGCGFCNQDRRTLPGGQPPPR
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pF1KB5 VSIGVFIEQPTPFLPRFLDILLTLDYPKEALKLFIHNKEVYHEKDIKVFFDKAKHEIKTI
       : ..::.:::::::::::. :: :::: . . ::.::.::.::  :   . . . .....
NP_001 VFLAVFVEQPTPFLPRFLQRLLLLDYPPDRVTLFLHNNEVFHEPHIADSWPQLQDHFSAV
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pF1KB5 KIVGPEENLSQAEARNMGMDFCRQDEKCDYYFSVDADVVLTNPRTLKILIEQNRKIIAPL
       :.::::: :: .:::.:.::.:::: .:..:::.:::.:::: .::.::::.:::.:::.
NP_001 KLVGPEEALSPGEARDMAMDLCRQDPECEFYFSLDADAVLTNLQTLRILIEENRKVIAPM
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pF1KB5 VTRHGKLWSNFWGALSPDGYYARSEDYVDIVQGNRVGVWNVPYMANVYLIKGKTLRSEMN
       ..:::::::::::::::: :::::::::..:: .:::::::::....:.:.: ::: :. 
NP_001 LSRHGKLWSNFWGALSPDEYYARSEDYVELVQRKRVGVWNVPYISQAYVIRGDTLRMELP
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pF1KB5 ERNYFVRDKLDPDMALCRNAREMGVFMYISNRHEFGRLLSTANYNTSHYNNDLWQIFENP
       .:. :  .  :::::.:.. :. :.:...::.:::::::.:. :.: : . ::::::.::
NP_001 QRDVFSGSDTDPDMAFCKSFRDKGIFLHLSNQHEFGRLLATSRYDTEHLHPDLWQIFDNP
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pF1KB5 VDWKEKYINRDYSKIFT-ENIVEQPCPDVFWFPIFSEKACDELVEEMEHYGKWSGGKHHD
       :::::.::...::. .  :.:::::::::.:::..::. ::::: ::::::.::::.:.:
NP_001 VDWKEQYIHENYSRALEGEGIVEQPCPDVYWFPLLSEQMCDELVAEMEHYGQWSGGRHED
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pF1KB5 SRISGGYENVPTDDIHMKQVDLENVWLHFIREFIAPVTLKVFAGYYTKGFALLNFVVKYS
       ::..:::::::: :::::::  :. ::...: ...:.: ..: ::.::. :..::::.: 
NP_001 SRLAGGYENVPTVDIHMKQVGYEDQWLQLLRTYVGPMTESLFPGYHTKARAVMNFVVRYR
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pF1KB5 PERQRSLRPHHDASTFTINIALNNVGEDFQGGGCKFLRYNCSIESPRKGWSFMHPGRLTH
       :..: :::::::.::::.:.:::. : :..::::.::::.: : ::::::...:::::::
NP_001 PDEQPSLRPHHDSSTFTLNVALNHKGLDYEGGGCRFLRYDCVISSPRKGWALLHPGRLTH
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pF1KB5 LHEGLPVKNGTRYIAVSFIDP
        :::::.  ::::: :::.::
NP_001 YHEGLPTTWGTRYIMVSFVDP
       720       730        

>>NP_000293 (OMIM: 153454,225400) procollagen-lysine,2-o  (727 aa)
 initn: 3159 init1: 2076 opt: 3165  Z-score: 4189.0  bits: 785.7 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 3165; 59.8% identity (85.1% similar) in 734 aa overlap (6-737:1-727)

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pF1KB5 MGGCTVKPQLLLLALVLHPWNPCLGADSEKPSSIPTDKLLVITVATKESDGFHRFMQSAK
            ..: ::::::.   :   : :.. : .. : :.:::.::::::..::.:: .::.
NP_000      MRP-LLLLALL--GW--LLLAEA-KGDAKPEDNLLVLTVATKETEGFRRFKRSAQ
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pF1KB5 YFNYTVKVLGQGEEWRGGDGINSIGGGQKVRLMKEVMEHYADQDDLVVMFTECFDVIFAG
       .::: ...:: ::.:    : .: ::::::::.:...:..::..:::..:.. .::.::.
NP_000 FFNYKIQALGLGEDWNVEKG-TSAGGGQKVRLLKKALEKHADKEDLVILFADSYDVLFAS
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pF1KB5 GPEEVLKKFQKANHKVVFAADGILWPDKRLADKYPVVHIGKRYLNSGGFIGYAPYVNRIV
       ::.:.::::..:  .:::.:. ...::.::  :::::  :::.:.::::::::: ....:
NP_000 GPRELLKKFRQARSQVVFSAEELIYPDRRLETKYPVVSDGKRFLGSGGFIGYAPNLSKLV
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pF1KB5 QQWNLQDNDDDQLFYTKVYIDPLKREAINITLDHKCKIFQTLNGAVDEVVLKFENGKARA
        .:. ::.:.:::::::...:: ::: :::::::.:.:::.:.::.:::::::: :..::
NP_000 AEWEGQDSDSDQLFYTKIFLDPEKREQINITLDHRCRIFQNLDGALDEVVLKFEMGHVRA
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pF1KB5 KNTFYETLPVAINGNGPTKILLNYFGNYVPNSWTQDNGCTLCEFDTVDLSAV--DVHPNV
       .:  :.:::: :.::::::. :::.:::.:  :: ..:::.:.    .:...  .. :.:
NP_000 RNLAYDTLPVLIHGNGPTKLQLNYLGNYIPRFWTFETGCTVCDEGLRSLKGIGDEALPTV
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pF1KB5 SIGVFIEQPTPFLPRFLDILLTLDYPKEALKLFIHNKEVYHEKDIKVFFDKAKHEIKTIK
        .::::::::::.  :.. :: : ::.. ..:::::.: .:. ... :. .   : ...:
NP_000 LVGVFIEQPTPFVSLFFQRLLRLHYPQKHMRLFIHNHEQHHKAQVEEFLAQHGSEYQSVK
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pF1KB5 IVGPEENLSQAEARNMGMDFCRQDEKCDYYFSVDADVVLTNPRTLKILIEQNRKIIAPLV
       .::::  ...:.::::: :.::::..: :::::::::.::.: .:..::.::...::::.
NP_000 LVGPEVRMANADARNMGADLCRQDRSCTYYFSVDADVALTEPNSLRLLIQQNKNVIAPLM
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pF1KB5 TRHGKLWSNFWGALSPDGYYARSEDYVDIVQGNRVGVWNVPYMANVYLIKGKTLRSEMNE
       ::::.:::::::::: :::::::::::::::: :::::::::..:.:::::..::.:.. 
NP_000 TRHGRLWSNFWGALSADGYYARSEDYVDIVQGRRVGVWNVPYISNIYLIKGSALRGELQS
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pF1KB5 RNYFVRDKLDPDMALCRNAREMGVFMYISNRHEFGRLLSTANYNTSHYNNDLWQIFENPV
        . : ..:::::::.: : :.. :::...::: .:.:::  .: :.: .::::..: :: 
NP_000 SDLFHHSKLDPDMAFCANIRQQDVFMFLTNRHTLGHLLSLDSYRTTHLHNDLWEVFSNPE
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pF1KB5 DWKEKYINRDYSKIFTENIVEQPCPDVFWFPIFSEKACDELVEEMEHYGKWSGGKHHDSR
       :::::::...:.: .. ..:: :::::.:::::.: :::::::::::.:.:: :...:.:
NP_000 DWKEKYIHQNYTKALAGKLVETPCPDVYWFPIFTEVACDELVEEMEHFGQWSLGNNKDNR
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pF1KB5 ISGGYENVPTDDIHMKQVDLENVWLHFIREFIAPVTLKVFAGYYTKGFALLNFVVKYSPE
       :.:::::::: ::::.:. .:  : .:. :.:::.: :.. ::::..   : :::.:.:.
NP_000 IQGGYENVPTIDIHMNQIGFEREWHKFLLEYIAPMTEKLYPGYYTRAQFDLAFVVRYKPD
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pF1KB5 RQRSLRPHHDASTFTINIALNNVGEDFQGGGCKFLRYNCSIESPRKGWSFMHPGRLTHLH
       .: :: ::::::::::::::: :: :..::::.::::::::..:::::..:::::::: :
NP_000 EQPSLMPHHDASTFTINIALNRVGVDYEGGGCRFLRYNCSIRAPRKGWTLMHPGRLTHYH
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      720       730       
pF1KB5 EGLPVKNGTRYIAVSFIDP
       ::::.  :::::::::.::
NP_000 EGLPTTRGTRYIAVSFVDP
      710       720       

>>NP_001303249 (OMIM: 153454,225400) procollagen-lysine,  (774 aa)
 initn: 3150 init1: 2076 opt: 3155  Z-score: 4175.3  bits: 783.3 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 3155; 60.1% identity (85.3% similar) in 721 aa overlap (25-737:55-774)

                     10        20        30              40        
pF1KB5       MGGCTVKPQLLLLALVLHPWNPCLGADSEKPSSIP------TDKLLVITVATKE
                                     :. : . ::::      .:.:::.::::::
NP_001 EAPCCQEGLRAGGSGSLHLGRDFTVLAGARGSPSPSVSSIPRFWIPGSDNLLVLTVATKE
           30        40        50        60        70        80    

       50        60        70        80        90       100        
pF1KB5 SDGFHRFMQSAKYFNYTVKVLGQGEEWRGGDGINSIGGGQKVRLMKEVMEHYADQDDLVV
       ..::.:: .::..::: ...:: ::.:    : .: ::::::::.:...:..::..:::.
NP_001 TEGFRRFKRSAQFFNYKIQALGLGEDWNVEKG-TSAGGGQKVRLLKKALEKHADKEDLVI
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pF1KB5 MFTECFDVIFAGGPEEVLKKFQKANHKVVFAADGILWPDKRLADKYPVVHIGKRYLNSGG
       .:.. .::.::.::.:.::::..:  .:::.:. ...::.::  :::::  :::.:.:::
NP_001 LFADSYDVLFASGPRELLKKFRQARSQVVFSAEELIYPDRRLETKYPVVSDGKRFLGSGG
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pF1KB5 FIGYAPYVNRIVQQWNLQDNDDDQLFYTKVYIDPLKREAINITLDHKCKIFQTLNGAVDE
       :::::: ....: .:. ::.:.:::::::...:: ::: :::::::.:.:::.:.::.::
NP_001 FIGYAPNLSKLVAEWEGQDSDSDQLFYTKIFLDPEKREQINITLDHRCRIFQNLDGALDE
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pF1KB5 VVLKFENGKARAKNTFYETLPVAINGNGPTKILLNYFGNYVPNSWTQDNGCTLCEFDTVD
       :::::: :..::.:  :.:::: :.::::::. :::.:::.:  :: ..:::.:.    .
NP_001 VVLKFEMGHVRARNLAYDTLPVLIHGNGPTKLQLNYLGNYIPRFWTFETGCTVCDEGLRS
           270       280       290       300       310       320   

      290         300       310       320       330       340      
pF1KB5 LSAV--DVHPNVSIGVFIEQPTPFLPRFLDILLTLDYPKEALKLFIHNKEVYHEKDIKVF
       :...  .. :.: .::::::::::.  :.. :: : ::.. ..:::::.: .:. ... :
NP_001 LKGIGDEALPTVLVGVFIEQPTPFVSLFFQRLLRLHYPQKHMRLFIHNHEQHHKAQVEEF
           330       340       350       360       370       380   

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pF1KB5 FDKAKHEIKTIKIVGPEENLSQAEARNMGMDFCRQDEKCDYYFSVDADVVLTNPRTLKIL
       . .   : ...:.::::  ...:.::::: :.::::..: :::::::::.::.: .:..:
NP_001 LAQHGSEYQSVKLVGPEVRMANADARNMGADLCRQDRSCTYYFSVDADVALTEPNSLRLL
           390       400       410       420       430       440   

        410       420       430       440       450       460      
pF1KB5 IEQNRKIIAPLVTRHGKLWSNFWGALSPDGYYARSEDYVDIVQGNRVGVWNVPYMANVYL
       :.::...::::.::::.:::::::::: :::::::::::::::: :::::::::..:.::
NP_001 IQQNKNVIAPLMTRHGRLWSNFWGALSADGYYARSEDYVDIVQGRRVGVWNVPYISNIYL
           450       460       470       480       490       500   

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pF1KB5 IKGKTLRSEMNERNYFVRDKLDPDMALCRNAREMGVFMYISNRHEFGRLLSTANYNTSHY
       :::..::.:..  . : ..:::::::.: : :.. :::...::: .:.:::  .: :.: 
NP_001 IKGSALRGELQSSDLFHHSKLDPDMAFCANIRQQDVFMFLTNRHTLGHLLSLDSYRTTHL
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pF1KB5 NNDLWQIFENPVDWKEKYINRDYSKIFTENIVEQPCPDVFWFPIFSEKACDELVEEMEHY
       .::::..: :: :::::::...:.: .. ..:: :::::.:::::.: :::::::::::.
NP_001 HNDLWEVFSNPEDWKEKYIHQNYTKALAGKLVETPCPDVYWFPIFTEVACDELVEEMEHF
           570       580       590       600       610       620   

        590       600       610       620       630       640      
pF1KB5 GKWSGGKHHDSRISGGYENVPTDDIHMKQVDLENVWLHFIREFIAPVTLKVFAGYYTKGF
       :.:: :...:.::.:::::::: ::::.:. .:  : .:. :.:::.: :.. ::::.. 
NP_001 GQWSLGNNKDNRIQGGYENVPTIDIHMNQIGFEREWHKFLLEYIAPMTEKLYPGYYTRAQ
           630       640       650       660       670       680   

        650       660       670       680       690       700      
pF1KB5 ALLNFVVKYSPERQRSLRPHHDASTFTINIALNNVGEDFQGGGCKFLRYNCSIESPRKGW
         : :::.:.:..: :: ::::::::::::::: :: :..::::.::::::::..:::::
NP_001 FDLAFVVRYKPDEQPSLMPHHDASTFTINIALNRVGVDYEGGGCRFLRYNCSIRAPRKGW
           690       700       710       720       730       740   

        710       720       730       
pF1KB5 SFMHPGRLTHLHEGLPVKNGTRYIAVSFIDP
       ..:::::::: :::::.  :::::::::.::
NP_001 TLMHPGRLTHYHEGLPTTRGTRYIAVSFVDP
           750       760       770    

>>XP_005247592 (OMIM: 601865,609220) PREDICTED: procolla  (666 aa)
 initn: 4440 init1: 2779 opt: 2779  Z-score: 3677.6  bits: 691.0 E(85289): 4.2e-198
Smith-Waterman score: 4402; 96.8% identity (96.8% similar) in 666 aa overlap (93-737:1-666)

             70        80        90       100       110       120  
pF1KB5 NYTVKVLGQGEEWRGGDGINSIGGGQKVRLMKEVMEHYADQDDLVVMFTECFDVIFAGGP
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005                               MKEVMEHYADQDDLVVMFTECFDVIFAGGP
                                             10        20        30

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pF1KB5 EEVLKKFQKANHKVVFAADGILWPDKRLADKYPVVHIGKRYLNSGGFIGYAPYVNRIVQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EEVLKKFQKANHKVVFAADGILWPDKRLADKYPVVHIGKRYLNSGGFIGYAPYVNRIVQQ
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pF1KB5 WNLQDNDDDQLFYTKVYIDPLKREAINITLDHKCKIFQTLNGAVDEVVLKFENGKARAKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 WNLQDNDDDQLFYTKVYIDPLKREAINITLDHKCKIFQTLNGAVDEVVLKFENGKARAKN
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pF1KB5 TFYETLPVAINGNGPTKILLNYFGNYVPNSWTQDNGCTLCEFDTVDLSAVDVHPNVSIGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TFYETLPVAINGNGPTKILLNYFGNYVPNSWTQDNGCTLCEFDTVDLSAVDVHPNVSIGV
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pF1KB5 FIEQPTPFLPRFLDILLTLDYPKEALKLFIHNKEVYHEKDIKVFFDKAKHEIKTIKIVGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FIEQPTPFLPRFLDILLTLDYPKEALKLFIHNKEVYHEKDIKVFFDKAKHEIKTIKIVGP
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pF1KB5 EENLSQAEARNMGMDFCRQDEKCDYYFSVDADVVLTNPRTLKILIEQNRKIIAPLVTRHG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EENLSQAEARNMGMDFCRQDEKCDYYFSVDADVVLTNPRTLKILIEQNRKIIAPLVTRHG
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pF1KB5 KLWSNFWGALSPDGYYARSEDYVDIVQGNRVGVWNVPYMANVYLIKGKTLRSEMNERNYF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KLWSNFWGALSPDGYYARSEDYVDIVQGNRVGVWNVPYMANVYLIKGKTLRSEMNERNYF
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pF1KB5 VRDKLDPDMALCRNAREM---------------------GVFMYISNRHEFGRLLSTANY
       ::::::::::::::::::                     :::::::::::::::::::::
XP_005 VRDKLDPDMALCRNAREMTLQREKDSPTPETFQMLSPPKGVFMYISNRHEFGRLLSTANY
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pF1KB5 NTSHYNNDLWQIFENPVDWKEKYINRDYSKIFTENIVEQPCPDVFWFPIFSEKACDELVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NTSHYNNDLWQIFENPVDWKEKYINRDYSKIFTENIVEQPCPDVFWFPIFSEKACDELVE
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pF1KB5 EMEHYGKWSGGKHHDSRISGGYENVPTDDIHMKQVDLENVWLHFIREFIAPVTLKVFAGY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EMEHYGKWSGGKHHDSRISGGYENVPTDDIHMKQVDLENVWLHFIREFIAPVTLKVFAGY
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pF1KB5 YTKGFALLNFVVKYSPERQRSLRPHHDASTFTINIALNNVGEDFQGGGCKFLRYNCSIES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YTKGFALLNFVVKYSPERQRSLRPHHDASTFTINIALNNVGEDFQGGGCKFLRYNCSIES
              580       590       600       610       620       630

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pF1KB5 PRKGWSFMHPGRLTHLHEGLPVKNGTRYIAVSFIDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PRKGWSFMHPGRLTHLHEGLPVKNGTRYIAVSFIDP
              640       650       660      

>>XP_016862114 (OMIM: 601865,609220) PREDICTED: procolla  (666 aa)
 initn: 4440 init1: 2779 opt: 2779  Z-score: 3677.6  bits: 691.0 E(85289): 4.2e-198
Smith-Waterman score: 4402; 96.8% identity (96.8% similar) in 666 aa overlap (93-737:1-666)

             70        80        90       100       110       120  
pF1KB5 NYTVKVLGQGEEWRGGDGINSIGGGQKVRLMKEVMEHYADQDDLVVMFTECFDVIFAGGP
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016                               MKEVMEHYADQDDLVVMFTECFDVIFAGGP
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pF1KB5 EEVLKKFQKANHKVVFAADGILWPDKRLADKYPVVHIGKRYLNSGGFIGYAPYVNRIVQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EEVLKKFQKANHKVVFAADGILWPDKRLADKYPVVHIGKRYLNSGGFIGYAPYVNRIVQQ
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pF1KB5 WNLQDNDDDQLFYTKVYIDPLKREAINITLDHKCKIFQTLNGAVDEVVLKFENGKARAKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WNLQDNDDDQLFYTKVYIDPLKREAINITLDHKCKIFQTLNGAVDEVVLKFENGKARAKN
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pF1KB5 TFYETLPVAINGNGPTKILLNYFGNYVPNSWTQDNGCTLCEFDTVDLSAVDVHPNVSIGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TFYETLPVAINGNGPTKILLNYFGNYVPNSWTQDNGCTLCEFDTVDLSAVDVHPNVSIGV
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pF1KB5 FIEQPTPFLPRFLDILLTLDYPKEALKLFIHNKEVYHEKDIKVFFDKAKHEIKTIKIVGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FIEQPTPFLPRFLDILLTLDYPKEALKLFIHNKEVYHEKDIKVFFDKAKHEIKTIKIVGP
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pF1KB5 EENLSQAEARNMGMDFCRQDEKCDYYFSVDADVVLTNPRTLKILIEQNRKIIAPLVTRHG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EENLSQAEARNMGMDFCRQDEKCDYYFSVDADVVLTNPRTLKILIEQNRKIIAPLVTRHG
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pF1KB5 KLWSNFWGALSPDGYYARSEDYVDIVQGNRVGVWNVPYMANVYLIKGKTLRSEMNERNYF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KLWSNFWGALSPDGYYARSEDYVDIVQGNRVGVWNVPYMANVYLIKGKTLRSEMNERNYF
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pF1KB5 VRDKLDPDMALCRNAREM---------------------GVFMYISNRHEFGRLLSTANY
       ::::::::::::::::::                     :::::::::::::::::::::
XP_016 VRDKLDPDMALCRNAREMTLQREKDSPTPETFQMLSPPKGVFMYISNRHEFGRLLSTANY
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pF1KB5 NTSHYNNDLWQIFENPVDWKEKYINRDYSKIFTENIVEQPCPDVFWFPIFSEKACDELVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NTSHYNNDLWQIFENPVDWKEKYINRDYSKIFTENIVEQPCPDVFWFPIFSEKACDELVE
              460       470       480       490       500       510

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pF1KB5 EMEHYGKWSGGKHHDSRISGGYENVPTDDIHMKQVDLENVWLHFIREFIAPVTLKVFAGY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EMEHYGKWSGGKHHDSRISGGYENVPTDDIHMKQVDLENVWLHFIREFIAPVTLKVFAGY
              520       530       540       550       560       570

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pF1KB5 YTKGFALLNFVVKYSPERQRSLRPHHDASTFTINIALNNVGEDFQGGGCKFLRYNCSIES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YTKGFALLNFVVKYSPERQRSLRPHHDASTFTINIALNNVGEDFQGGGCKFLRYNCSIES
              580       590       600       610       620       630

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pF1KB5 PRKGWSFMHPGRLTHLHEGLPVKNGTRYIAVSFIDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PRKGWSFMHPGRLTHLHEGLPVKNGTRYIAVSFIDP
              640       650       660      

>>XP_011517065 (OMIM: 616626) PREDICTED: probable inacti  (517 aa)
 initn: 195 init1: 114 opt: 226  Z-score: 293.6  bits: 64.4 E(85289): 1.3e-09
Smith-Waterman score: 226; 27.0% identity (60.5% similar) in 152 aa overlap (370-515:46-192)

     340       350       360       370       380       390         
pF1KB5 EKDIKVFFDKAKHEIKTIKIVGPEENLSQAEARNMGMDFCRQDEKCDYYFSVDADVVLTN
                                     : .. .. : : .   :: . .:.: .:::
XP_011 VVWRPEGEPRFYPDEEGPKHWTKERHQFLMELKQEALTFAR-NWGADYILFADTDNILTN
          20        30        40        50         60        70    

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pF1KB5 PRTLKILIEQNRKIIAPLVTRHGKLWSNFWGALSPDGYYARSEDYVDIVQGNRVGVWNVP
        .::..:. :.  ..::..  .   .:::: ...:.::: :. .:    . .: : . ::
XP_011 NQTLRLLMGQGLPVVAPMLDSQ-TYYSNFWCGITPQGYYRRTAEYFPTKNRQRRGCFRVP
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pF1KB5 YMANVYLIKGKTLRSEMNERNYFVRDK------LDPDMALCRNAREMGVFMYISNRHEFG
       .. ...:    .::.:  ..  :   .      .:  ...    .  :: ... :.:..:
XP_011 MVHSTFL---ASLRAEGADQLAFYPPHPNYTWPFDDIIVFAYACQAAGVSVHVCNEHRYG
           140          150       160       170       180       190

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pF1KB5 RLLSTANYNTSHYNNDLWQIFENPVDWKEKYINRDYSKIFTENIVEQPCPDVFWFPIFSE
        .                                                          
XP_011 YMNVPVKSHQGLEDERVNFIHLILEALVDGPRMQASAHVTRPSKRPSKIGFDEVFVISLA
              200       210       220       230       240       250

>>NP_001273689 (OMIM: 616626) probable inactive glycosyl  (517 aa)
 initn: 195 init1: 114 opt: 226  Z-score: 293.6  bits: 64.4 E(85289): 1.3e-09
Smith-Waterman score: 226; 27.0% identity (60.5% similar) in 152 aa overlap (370-515:46-192)

     340       350       360       370       380       390         
pF1KB5 EKDIKVFFDKAKHEIKTIKIVGPEENLSQAEARNMGMDFCRQDEKCDYYFSVDADVVLTN
                                     : .. .. : : .   :: . .:.: .:::
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