Result of FASTA (ccds) for pF1KB3701
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3701, 1178 aa
  1>>>pF1KB3701 1178 - 1178 aa - 1178 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0051+/-0.00116; mu= 14.4198+/- 0.070
 mean_var=104.4140+/-20.472, 0's: 0 Z-trim(105.2): 32  B-trim: 42 in 1/49
 Lambda= 0.125515
 statistics sampled from 8263 (8284) to 8263 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.594), E-opt: 0.2 (0.254), width:  16
 Scan time:  4.610

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS8152.1 PC gene_id:5091|Hs108|chr11             (1178) 7786 1421.5       0
CCDS3241.1 MCCC1 gene_id:56922|Hs108|chr3          ( 725) 1297 246.4 1.9e-64
CCDS45065.1 PCCA gene_id:5095|Hs108|chr13          ( 702) 1288 244.8 5.6e-64
CCDS53878.1 PCCA gene_id:5095|Hs108|chr13          ( 681) 1287 244.6 6.2e-64
CCDS9496.2 PCCA gene_id:5095|Hs108|chr13           ( 728) 1287 244.6 6.5e-64
CCDS42303.1 ACACA gene_id:31|Hs108|chr17           (2268)  519 105.7 1.3e-21
CCDS11318.1 ACACA gene_id:31|Hs108|chr17           (2288)  519 105.7 1.3e-21
CCDS11317.1 ACACA gene_id:31|Hs108|chr17           (2346)  519 105.7 1.3e-21
CCDS42302.1 ACACA gene_id:31|Hs108|chr17           (2383)  519 105.7 1.4e-21
CCDS31898.1 ACACB gene_id:32|Hs108|chr12           (2458)  504 103.0 9.2e-21


>>CCDS8152.1 PC gene_id:5091|Hs108|chr11                  (1178 aa)
 initn: 7786 init1: 7786 opt: 7786  Z-score: 7617.7  bits: 1421.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 7786; 100.0% identity (100.0% similar) in 1178 aa overlap (1-1178:1-1178)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MLKFRTVHGGLRLLGIRRTSTAPAASPNVRRLEYKPIKKVMVANRGEIAIRVFRACTELG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MLKFRTVHGGLRLLGIRRTSTAPAASPNVRRLEYKPIKKVMVANRGEIAIRVFRACTELG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 IRTVAIYSEQDTGQMHRQKADEAYLIGRGLAPVQAYLHIPDIIKVAKENNVDAVHPGYGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 IRTVAIYSEQDTGQMHRQKADEAYLIGRGLAPVQAYLHIPDIIKVAKENNVDAVHPGYGF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 LSERADFAQACQDAGVRFIGPSPEVVRKMGDKVEARAIAIAAGVPVVPGTDAPITSLHEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LSERADFAQACQDAGVRFIGPSPEVVRKMGDKVEARAIAIAAGVPVVPGTDAPITSLHEA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 HEFSNTYGFPIIFKAAYGGGGRGMRVVHSYEELEENYTRAYSEALAAFGNGALFVEKFIE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 HEFSNTYGFPIIFKAAYGGGGRGMRVVHSYEELEENYTRAYSEALAAFGNGALFVEKFIE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 KPRHIEVQILGDQYGNILHLYERDCSIQRRHQKVVEIAPAAHLDPQLRTRLTSDSVKLAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 KPRHIEVQILGDQYGNILHLYERDCSIQRRHQKVVEIAPAAHLDPQLRTRLTSDSVKLAK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 QVGYENAGTVEFLVDRHGKHYFIEVNSRLQVEHTVTEEITDVDLVHAQIHVAEGRSLPDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QVGYENAGTVEFLVDRHGKHYFIEVNSRLQVEHTVTEEITDVDLVHAQIHVAEGRSLPDL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 GLRQENIRINGCAIQCRVTTEDPARSFQPDTGRIEVFRSGEGMGIRLDNASAFQGAVISP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GLRQENIRINGCAIQCRVTTEDPARSFQPDTGRIEVFRSGEGMGIRLDNASAFQGAVISP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 HYDSLLVKVIAHGKDHPTAATKMSRALAEFRVRGVKTNIAFLQNVLNNQQFLAGTVDTQF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 HYDSLLVKVIAHGKDHPTAATKMSRALAEFRVRGVKTNIAFLQNVLNNQQFLAGTVDTQF
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 IDENPELFQLRPAQNRAQKLLHYLGHVMVNGPTTPIPVKASPSPTDPVVPAVPIGPPPAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 IDENPELFQLRPAQNRAQKLLHYLGHVMVNGPTTPIPVKASPSPTDPVVPAVPIGPPPAG
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 FRDILLREGPEGFARAVRNHPGLLLMDTTFRDAHQSLLATRVRTHDLKKIAPYVAHNFSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 FRDILLREGPEGFARAVRNHPGLLLMDTTFRDAHQSLLATRVRTHDLKKIAPYVAHNFSK
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 LFSMENWGGATFDVAMRFLYECPWRRLQELRELIPNIPFQMLLRGANAVGYTNYPDNVVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LFSMENWGGATFDVAMRFLYECPWRRLQELRELIPNIPFQMLLRGANAVGYTNYPDNVVF
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB3 KFCEVAKENGMDVFRVFDSLNYLPNMLLGMEAAGSAGGVVEAAISYTGDVADPSRTKYSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 KFCEVAKENGMDVFRVFDSLNYLPNMLLGMEAAGSAGGVVEAAISYTGDVADPSRTKYSL
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB3 QYYMGLAEELVRAGTHILCIKDMAGLLKPTACTMLVSSLRDRFPDLPLHIHTHDTSGAGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QYYMGLAEELVRAGTHILCIKDMAGLLKPTACTMLVSSLRDRFPDLPLHIHTHDTSGAGV
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB3 AAMLACAQAGADVVDVAADSMSGMTSQPSMGALVACTRGTPLDTEVPMERVFDYSEYWEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 AAMLACAQAGADVVDVAADSMSGMTSQPSMGALVACTRGTPLDTEVPMERVFDYSEYWEG
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB3 ARGLYAAFDCTATMKSGNSDVYENEIPGGQYTNLHFQAHSMGLGSKFKEVKKAYVEANQM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ARGLYAAFDCTATMKSGNSDVYENEIPGGQYTNLHFQAHSMGLGSKFKEVKKAYVEANQM
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB3 LGDLIKVTPSSKIVGDLAQFMVQNGLSRAEAEAQAEELSFPRSVVEFLQGYIGVPHGGFP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LGDLIKVTPSSKIVGDLAQFMVQNGLSRAEAEAQAEELSFPRSVVEFLQGYIGVPHGGFP
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB3 EPFRSKVLKDLPRVEGRPGASLPPLDLQALEKELVDRHGEEVTPEDVLSAAMYPDVFAHF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EPFRSKVLKDLPRVEGRPGASLPPLDLQALEKELVDRHGEEVTPEDVLSAAMYPDVFAHF
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB3 KDFTATFGPLDSLNTRLFLQGPKIAEEFEVELERGKTLHIKALAVSDLNRAGQRQVFFEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 KDFTATFGPLDSLNTRLFLQGPKIAEEFEVELERGKTLHIKALAVSDLNRAGQRQVFFEL
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KB3 NGQLRSILVKDTQAMKEMHFHPKALKDVKGQIGAPMPGKVIDIKVVAGAKVAKGQPLCVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 NGQLRSILVKDTQAMKEMHFHPKALKDVKGQIGAPMPGKVIDIKVVAGAKVAKGQPLCVL
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170        
pF1KB3 SAMKMETVVTSPMEGTVRKVHVTKDMTLEGDDLILEIE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SAMKMETVVTSPMEGTVRKVHVTKDMTLEGDDLILEIE
             1150      1160      1170        

>>CCDS3241.1 MCCC1 gene_id:56922|Hs108|chr3               (725 aa)
 initn: 1403 init1: 872 opt: 1297  Z-score: 1270.7  bits: 246.4 E(32554): 1.9e-64
Smith-Waterman score: 1297; 39.9% identity (68.6% similar) in 544 aa overlap (35-571:47-584)

           10        20        30        40        50        60    
pF1KB3 RTVHGGLRLLGIRRTSTAPAASPNVRRLEYKPIKKVMVANRGEIAIRVFRACTELGIRTV
                                     . : ::..::::::: ::.:.  .::..::
CCDS32 NRWHRLPSLLLPPRTWVWRQRTMKYTTATGRNITKVLIANRGEIACRVMRTAKKLGVQTV
         20        30        40        50        60        70      

           70        80        90        100       110       120   
pF1KB3 AIYSEQDTGQMHRQKADEAYLIGRGLAPVQ-AYLHIPDIIKVAKENNVDAVHPGYGFLSE
       :.::: : ..:: . ::::: ::   :: : .:: .  ::.::: . ..:.::: :::::
CCDS32 AVYSEADRNSMHVDMADEAYSIGP--APSQQSYLSMEKIIQVAKTSAAQAIHPGCGFLSE
         80        90       100         110       120       130    

           130       140       150       160       170       180   
pF1KB3 RADFAQACQDAGVRFIGPSPEVVRKMGDKVEARAIAIAAGVPVVPGTDAPITSLHEAHEF
         .::. :.. :. :::: : ..: :: :  ...:  ::::::: :  .   : .  .: 
CCDS32 NMEFAELCKQEGIIFIGPPPSAIRDMGIKSTSKSIMAAAGVPVVEGYHGEDQSDQCLKEH
          140       150       160       170       180       190    

           190       200       210       220       230       240   
pF1KB3 SNTYGFPIIFKAAYGGGGRGMRVVHSYEELEENYTRAYSEALAAFGNGALFVEKFIEKPR
       .   :.:...::. ::::.:::.:.: .:..:.   :  ::  .:.. :...:::.. ::
CCDS32 ARRIGYPVMIKAVRGGGGKGMRIVRSEQEFQEQLESARREAKKSFNDDAMLIEKFVDTPR
          200       210       220       230       240       250    

           250       260       270       280       290       300   
pF1KB3 HIEVQILGDQYGNILHLYERDCSIQRRHQKVVEIAPAAHLDPQLRTRLTSDSVKLAKQVG
       :.:::..::..:: ..:.:::::.::::::..: :::  .  ..: .:   .:. :: :.
CCDS32 HVEVQVFGDHHGNAVYLFERDCSVQRRHQKIIEEAPAPGIKSEVRKKLGEAAVRAAKAVN
          260       270       280       290       300       310    

           310       320       330       340       350       360   
pF1KB3 YENAGTVEFLVDRHGKHYFIEVNSRLQVEHTVTEEITDVDLVHAQIHVAEGRSLPDLGLR
       : .::::::..: . .  :.:.:.:::::: ::: :: .:::. :...: :...:   : 
CCDS32 YVGAGTVEFIMDSKHNFCFMEMNTRLQVEHPVTEMITGTDLVEWQLRIAAGEKIP---LS
          320       330       340       350       360          370 

           370       380       390       400        410       420  
pF1KB3 QENIRINGCAIQCRVTTEDPARSFQPDTGRIEVFRSGEG-MGIRLDNASAFQGAVISPHY
       ::.: ..: :.. :. .:::. .:.: .: .  . . ..  . :.... . ::  .: ::
CCDS32 QEEITLQGHAFEARIYAEDPSNNFMPVAGPLVHLSTPRADPSTRIETG-VRQGDEVSVHY
             380       390       400       410        420       430

            430       440       450       460       470       480  
pF1KB3 DSLLVKVIAHGKDHPTAATKMSRALAEFRVRGVKTNIAFLQNVLNNQQFLAGTVDTQFID
       : ...:... . :. .: ::.  .: .. . :..::: :: :. .. .: ::.: :.:: 
CCDS32 DPMIAKLVVWAADRQAALTKLRYSLRQYNIVGLHTNIDFLLNLSGHPEFEAGNVHTDFIP
              440       450       460       470       480       490

             490       500       510       520       530       540 
pF1KB3 EN-PELFQLRPAQNRAQKLLHYLGHVMVNGPTTPIPVKASPSPTDPVVPAVPIGPPPAGF
       ..  .:.  : :  . .     :: .. .   :   .  . .  .:   .       .  
CCDS32 QHHKQLLLSRKAAAKESLCQAALGLILKEKAMTDTFTLQAHDQFSPFSSSSGRRLNISYT
              500       510       520       530       540       550

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pF1KB3 RDILLREGPEGFARAVR-NHPG---LLLMDTTFRDAHQSLLATRVRTHDLKKIAPYVAHN
       :.. :..: .. : ::  :: :   . . : ::.                          
CCDS32 RNMTLKDGKNNVAIAVTYNHDGSYSMQIEDKTFQVLGNLYSEGDCTYLKCSVNGVASKAK
              560       570       580       590       600       610

       600       610       620       630       640       650       
pF1KB3 FSKLFSMENWGGATFDVAMRFLYECPWRRLQELRELIPNIPFQMLLRGANAVGYTNYPDN
                                                                   
CCDS32 LIILENTIYLFSKEGSIEIDIPVPKYLSSVSSQETQGGPLAPMTGTIEKVFVKAGDKVKA
              620       630       640       650       660       670

>>CCDS45065.1 PCCA gene_id:5095|Hs108|chr13               (702 aa)
 initn: 1427 init1: 830 opt: 1288  Z-score: 1262.1  bits: 244.8 E(32554): 5.6e-64
Smith-Waterman score: 1288; 44.8% identity (73.8% similar) in 469 aa overlap (26-489:28-487)

                 10        20        30        40        50        
pF1KB3   MLKFRTVHGGLRLLGIRRTSTAPAASPNVRRLEYKPIKKVMVANRGEIAIRVFRACTE
                                  :  .: :  : . :..:::::::: ::.:.: .
CCDS45 MAGFWVGTAPLVAAGRRGRWPPQQLMLSAALRTL--KTFDKILVANRGEIACRVIRTCKK
               10        20        30          40        50        

       60        70        80        90        100       110       
pF1KB3 LGIRTVAIYSEQDTGQMHRQKADEAYLIGRGLAPV-QAYLHIPDIIKVAKENNVDAVHPG
       .::.::::.:. :....: . ::::  .:   ::. ..::..  :... :.. ..:::::
CCDS45 MGIKTVAIHSDVDASSVHVKMADEAVCVGP--APTSKSYLNMDAIMEAIKKTRAQAVHPG
       60        70        80          90       100       110      

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB3 YGFLSERADFAQACQDAGVRFIGPSPEVVRKMGDKVEARAIAIAAGVPVVPGTDAPITSL
       ::::::  .::.      : ::::. .... ::::.:.. .:  : : ..:: :. . . 
CCDS45 YGFLSENKEFARCLAAEDVVFIGPDTHAIQAMGDKIESKLLAKKAEVNTIPGFDGVVKDA
        120       130       140       150       160       170      

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pF1KB3 HEAHEFSNTYGFPIIFKAAYGGGGRGMRVVHSYEELEENYTRAYSEALAAFGNGALFVEK
       .:: ...   :.:...::. ::::.:::.. . :: ....  . .:: ..::.  :..::
CCDS45 EEAVRIAREIGYPVMIKASAGGGGKGMRIAWDDEETRDGFRLSSQEAASSFGDDRLLIEK
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       240       250       260       270       280       290       
pF1KB3 FIEKPRHIEVQILGDQYGNILHLYERDCSIQRRHQKVVEIAPAAHLDPQLRTRLTSDSVK
       ::..:::::.:.:::..:: : : ::.::::::.::::: ::.  :: . :  .  ..: 
CCDS45 FIDNPRHIEIQVLGDKHGNALWLNERECSIQRRNQKVVEEAPSIFLDAETRRAMGEQAVA
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pF1KB3 LAKQVGYENAGTVEFLVDRHGKHYFIEVNSRLQVEHTVTEEITDVDLVHAQIHVAEGRSL
       ::. : : .::::::::: . . ::.:.:.:::::: ::: :: .:::. .:.::.:  :
CCDS45 LARAVKYSSAGTVEFLVDSKKNFYFLEMNTRLQVEHPVTECITGLDLVQEMIRVAKGYPL
        300       310       320       330       340       350      

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pF1KB3 PDLGLRQENIRINGCAIQCRVTTEDPARSFQ-PDTGRIEVFRSGEGM-GIRLDNASAFQ-
            .: .::::: :..::: .::: .::  :. ::.  ..    . :.:.:  :..: 
CCDS45 RH---KQADIRINGWAVECRVYAEDPYKSFGLPSIGRLSQYQEPLHLPGVRVD--SGIQP
           360       370       380       390       400         410 

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pF1KB3 GAVISPHYDSLLVKVIAHGKDHPTAATKMSRALAEFRVRGVKTNIAFLQNVLNNQQFLAG
       :. :: .:: .. :.:..:.:.  :  .:. :: .. .:::  :::.:..:. :..:. :
CCDS45 GSDISIYYDPMISKLITYGSDRTEALKRMADALDNYVIRGVTHNIALLREVIINSRFVKG
             420       430       440       450       460       470 

          480        490       500       510       520       530   
pF1KB3 TVDTQFI-DENPELFQLRPAQNRAQKLLHYLGHVMVNGPTTPIPVKASPSPTDPVVPAVP
        ..:.:. :  :. :.                                            
CCDS45 DISTKFLSDVYPDGFKGHMLTKSEKNQLLAIASSLFVAFQLRAQHFQENSRMPVIKPDIA
             480       490       500       510       520       530 

>>CCDS53878.1 PCCA gene_id:5095|Hs108|chr13               (681 aa)
 initn: 1378 init1: 830 opt: 1287  Z-score: 1261.3  bits: 244.6 E(32554): 6.2e-64
Smith-Waterman score: 1287; 45.0% identity (74.3% similar) in 460 aa overlap (35-489:61-513)

           10        20        30        40        50        60    
pF1KB3 RTVHGGLRLLGIRRTSTAPAASPNVRRLEYKPIKKVMVANRGEIAIRVFRACTELGIRTV
                                     : . :..:::::::: ::.:.: ..::.::
CCDS53 LRTLKHVLYYSRQCLMVSRNLGSVGYDPNEKTFDKILVANRGEIACRVIRTCKKMGIKTV
               40        50        60        70        80        90

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pF1KB3 AIYSEQDTGQMHRQKADEAYLIGRGLAPV-QAYLHIPDIIKVAKENNVDAVHPGYGFLSE
       ::.:. :....: . ::::  .:   ::. ..::..  :... :.. ..:::::::::::
CCDS53 AIHSDVDASSVHVKMADEAVCVGP--APTSKSYLNMDAIMEAIKKTRAQAVHPGYGFLSE
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           130       140       150       160       170       180   
pF1KB3 RADFAQACQDAGVRFIGPSPEVVRKMGDKVEARAIAIAAGVPVVPGTDAPITSLHEAHEF
         .::.      : ::::. .... ::::.:.. .:  : : ..:: :. . . .:: ..
CCDS53 NKEFARCLAAEDVVFIGPDTHAIQAMGDKIESKLLAKKAEVNTIPGFDGVVKDAEEAVRI
      150       160       170       180       190       200        

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pF1KB3 SNTYGFPIIFKAAYGGGGRGMRVVHSYEELEENYTRAYSEALAAFGNGALFVEKFIEKPR
       .   :.:...::. ::::.:::.. . :: ....  . .:: ..::.  :..::::..::
CCDS53 AREIGYPVMIKASAGGGGKGMRIAWDDEETRDGFRLSSQEAASSFGDDRLLIEKFIDNPR
      210       220       230       240       250       260        

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pF1KB3 HIEVQILGDQYGNILHLYERDCSIQRRHQKVVEIAPAAHLDPQLRTRLTSDSVKLAKQVG
       :::.:.:::..:: : : ::.::::::.::::: ::.  :: . :  .  ..: ::. : 
CCDS53 HIEIQVLGDKHGNALWLNERECSIQRRNQKVVEEAPSIFLDAETRRAMGEQAVALARAVK
      270       280       290       300       310       320        

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pF1KB3 YENAGTVEFLVDRHGKHYFIEVNSRLQVEHTVTEEITDVDLVHAQIHVAEGRSLPDLGLR
       : .::::::::: . . ::.:.:.:::::: ::: :: .:::. .:.::.:  :     .
CCDS53 YSSAGTVEFLVDSKKNFYFLEMNTRLQVEHPVTECITGLDLVQEMIRVAKGYPLRH---K
      330       340       350       360       370       380        

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pF1KB3 QENIRINGCAIQCRVTTEDPARSFQ-PDTGRIEVFRSGEGM-GIRLDNASAFQ-GAVISP
       : .::::: :..::: .::: .::  :. ::.  ..    . :.:.:  :..: :. :: 
CCDS53 QADIRINGWAVECRVYAEDPYKSFGLPSIGRLSQYQEPLHLPGVRVD--SGIQPGSDISI
         390       400       410       420       430         440   

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pF1KB3 HYDSLLVKVIAHGKDHPTAATKMSRALAEFRVRGVKTNIAFLQNVLNNQQFLAGTVDTQF
       .:: .. :.:..:.:.  :  .:. :: .. .:::  :::.:..:. :..:. : ..:.:
CCDS53 YYDPMISKLITYGSDRTEALKRMADALDNYVIRGVTHNIALLREVIINSRFVKGDISTKF
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pF1KB3 I-DENPELFQLRPAQNRAQKLLHYLGHVMVNGPTTPIPVKASPSPTDPVVPAVPIGPPPA
       . :  :. :.                                                  
CCDS53 LSDVYPDGFKGHMLTKSEKNQLLAIASSLFVAFQLRAQHFQENSRMPVIKPDIANWELSV
           510       520       530       540       550       560   

>>CCDS9496.2 PCCA gene_id:5095|Hs108|chr13                (728 aa)
 initn: 1427 init1: 830 opt: 1287  Z-score: 1260.9  bits: 244.6 E(32554): 6.5e-64
Smith-Waterman score: 1287; 45.0% identity (74.3% similar) in 460 aa overlap (35-489:61-513)

           10        20        30        40        50        60    
pF1KB3 RTVHGGLRLLGIRRTSTAPAASPNVRRLEYKPIKKVMVANRGEIAIRVFRACTELGIRTV
                                     : . :..:::::::: ::.:.: ..::.::
CCDS94 LRTLKHVLYYSRQCLMVSRNLGSVGYDPNEKTFDKILVANRGEIACRVIRTCKKMGIKTV
               40        50        60        70        80        90

           70        80        90        100       110       120   
pF1KB3 AIYSEQDTGQMHRQKADEAYLIGRGLAPV-QAYLHIPDIIKVAKENNVDAVHPGYGFLSE
       ::.:. :....: . ::::  .:   ::. ..::..  :... :.. ..:::::::::::
CCDS94 AIHSDVDASSVHVKMADEAVCVGP--APTSKSYLNMDAIMEAIKKTRAQAVHPGYGFLSE
              100       110         120       130       140        

           130       140       150       160       170       180   
pF1KB3 RADFAQACQDAGVRFIGPSPEVVRKMGDKVEARAIAIAAGVPVVPGTDAPITSLHEAHEF
         .::.      : ::::. .... ::::.:.. .:  : : ..:: :. . . .:: ..
CCDS94 NKEFARCLAAEDVVFIGPDTHAIQAMGDKIESKLLAKKAEVNTIPGFDGVVKDAEEAVRI
      150       160       170       180       190       200        

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pF1KB3 SNTYGFPIIFKAAYGGGGRGMRVVHSYEELEENYTRAYSEALAAFGNGALFVEKFIEKPR
       .   :.:...::. ::::.:::.. . :: ....  . .:: ..::.  :..::::..::
CCDS94 AREIGYPVMIKASAGGGGKGMRIAWDDEETRDGFRLSSQEAASSFGDDRLLIEKFIDNPR
      210       220       230       240       250       260        

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pF1KB3 HIEVQILGDQYGNILHLYERDCSIQRRHQKVVEIAPAAHLDPQLRTRLTSDSVKLAKQVG
       :::.:.:::..:: : : ::.::::::.::::: ::.  :: . :  .  ..: ::. : 
CCDS94 HIEIQVLGDKHGNALWLNERECSIQRRNQKVVEEAPSIFLDAETRRAMGEQAVALARAVK
      270       280       290       300       310       320        

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pF1KB3 YENAGTVEFLVDRHGKHYFIEVNSRLQVEHTVTEEITDVDLVHAQIHVAEGRSLPDLGLR
       : .::::::::: . . ::.:.:.:::::: ::: :: .:::. .:.::.:  :     .
CCDS94 YSSAGTVEFLVDSKKNFYFLEMNTRLQVEHPVTECITGLDLVQEMIRVAKGYPLRH---K
      330       340       350       360       370       380        

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pF1KB3 QENIRINGCAIQCRVTTEDPARSFQ-PDTGRIEVFRSGEGM-GIRLDNASAFQ-GAVISP
       : .::::: :..::: .::: .::  :. ::.  ..    . :.:.:  :..: :. :: 
CCDS94 QADIRINGWAVECRVYAEDPYKSFGLPSIGRLSQYQEPLHLPGVRVD--SGIQPGSDISI
         390       400       410       420       430         440   

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pF1KB3 HYDSLLVKVIAHGKDHPTAATKMSRALAEFRVRGVKTNIAFLQNVLNNQQFLAGTVDTQF
       .:: .. :.:..:.:.  :  .:. :: .. .:::  :::.:..:. :..:. : ..:.:
CCDS94 YYDPMISKLITYGSDRTEALKRMADALDNYVIRGVTHNIALLREVIINSRFVKGDISTKF
           450       460       470       480       490       500   

               490       500       510       520       530         
pF1KB3 I-DENPELFQLRPAQNRAQKLLHYLGHVMVNGPTTPIPVKASPSPTDPVVPAVPIGPPPA
       . :  :. :.                                                  
CCDS94 LSDVYPDGFKGHMLTKSEKNQLLAIASSLFVAFQLRAQHFQENSRMPVIKPDIANWELSV
           510       520       530       540       550       560   

>>CCDS42303.1 ACACA gene_id:31|Hs108|chr17                (2268 aa)
 initn: 701 init1: 435 opt: 519  Z-score: 501.5  bits: 105.7 E(32554): 1.3e-21
Smith-Waterman score: 762; 30.0% identity (59.5% similar) in 506 aa overlap (35-482:38-536)

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>>CCDS11318.1 ACACA gene_id:31|Hs108|chr17                (2288 aa)
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Smith-Waterman score: 762; 30.0% identity (59.5% similar) in 506 aa overlap (35-482:58-556)

           10        20        30        40        50              
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>>CCDS11317.1 ACACA gene_id:31|Hs108|chr17                (2346 aa)
 initn: 701 init1: 435 opt: 519  Z-score: 501.3  bits: 105.7 E(32554): 1.3e-21
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pF1KB3 RTVHGGLRLLGIRRTSTAPAASPNVRRLEYKPIKKVMVANRGEIAIRVFRAC--------
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CCDS11 RRHQKIIEEAPATIATPAVFEHMEQCAVKLAKMVGYVSAGTVEYLYSQDGSFYFLELNPR
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>>CCDS42302.1 ACACA gene_id:31|Hs108|chr17                (2383 aa)
 initn: 701 init1: 435 opt: 519  Z-score: 501.2  bits: 105.7 E(32554): 1.4e-21
Smith-Waterman score: 762; 30.0% identity (59.5% similar) in 506 aa overlap (35-482:153-651)

           10        20        30        40        50              
pF1KB3 RTVHGGLRLLGIRRTSTAPAASPNVRRLEYKPIKKVMVANRGEIAIRVFRAC--------
                                     : :.::..:: :  :.. .:.         
CCDS42 KQGRDRKKIDSQRDFTVASPAEFVTRFGGNKVIEKVLIANNGIAAVKCMRSIRRWSYEMF
            130       140       150       160       170       180  

          60        70         80        90       100       110    
pF1KB3 -TELGIRTVAIYSEQDT-GQMHRQKADEAYLIGRGLAPVQAYLHIPDIIKVAKENNVDAV
        .: .:: :.. . .:  .. .  :  . :.   :    . : ..  :. .::.  :.::
CCDS42 RNERAIRFVVMVTPEDLKANAEYIKMADHYVPVPGGPNNNNYANVELILDIAKRIPVQAV
            190       200       210       220       230       240  

          120       130       140       150       160       170    
pF1KB3 HPGYGFLSERADFAQACQDAGVRFIGPSPEVVRKMGDKVEARAIAIAAGVPVVPGTDAPI
         :.:  ::   . .     :. :.::  ...  .:::. .  .: .::.:..: . . .
CCDS42 WAGWGHASENPKLPELLLKNGIAFMGPPSQAMWALGDKIASSIVAQTAGIPTLPWSGSGL
            250       260       270       280       290       300  

          180                                 190       200        
pF1KB3 TSLHEAHEFSNTY--------------------------GFPIIFKAAYGGGGRGMRVVH
           . ..::.                            :.:...::. ::::.:.: :.
CCDS42 RVDWQENDFSKRILNVPQELYEKGYVKDVDDGLQAAEEVGYPVMIKASEGGGGKGIRKVN
            310       320       330       340       350       360  

      210       220       230       240       250       260        
pF1KB3 SYEELEENYTRAYSEALAAFGNGALFVEKFIEKPRHIEVQILGDQYGNILHLYERDCSIQ
       .     ...   . .. :   .. .:: .. .. ::.:::::.::::: . :. ::::.:
CCDS42 N----ADDFPNLFRQVQAEVPGSPIFVMRLAKQSRHLEVQILADQYGNAISLFGRDCSVQ
                370       380       390       400       410        

      270       280       290       300       310       320        
pF1KB3 RRHQKVVEIAPAAHLDPQLRTRLTSDSVKLAKQVGYENAGTVEFLVDRHGKHYFIEVNSR
       :::::..: :::.   : .  .. . .:::::.::: .:::::.: .. :. ::.:.: :
CCDS42 RRHQKIIEEAPATIATPAVFEHMEQCAVKLAKMVGYVSAGTVEYLYSQDGSFYFLELNPR
      420       430       440       450       460       470        

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pF1KB3 LQVEHTVTEEITDVDLVHAQIHVAEGRSL---PDLGLR-------------QENIRI---
       :::::  :: ..::.:  ::...: :  :    :. .              ... ..   
CCDS42 LQVEHPCTEMVADVNLPAAQLQIAMGIPLYRIKDIRMMYGVSPWGDSPIDFEDSAHVPCP
      480       490       500       510       520       530        

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pF1KB3 NGCAIQCRVTTEDPARSFQPDTGRIEV--FRSGEGMGIRLDNASAFQGAVISPHYDSLLV
        : .:  :.:.:.: ..:.:..: ..   :::....   .. :.:  :. .    :: . 
CCDS42 RGHVIAARITSENPDEGFKPSSGTVQELNFRSNKNVWGYFSVAAA--GG-LHEFADSQFG
      540       550       560       570       580          590     

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pF1KB3 KVIAHGKDHPTAATKMSRALAEFRVRG-VKTNIAFLQNVLNNQQFLAGTVDTQFIDENPE
       . .. :...  : ..:  :: :. .::  .:.. .: ..:....:  . .:: ..:    
CCDS42 HCFSWGENREEAISNMVVALKELSIRGDFRTTVEYLIKLLETESFQMNRIDTGWLDRLIA
         600       610       620       630       640       650     

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pF1KB3 LFQLRPAQNRAQKLLHYLGHVMVNGPTTPIPVKASPSPTDPVVPAVPIGPPPAGFRDILL
                                                                   
CCDS42 EKVQAERPDTMLGVVCGALHVADVSLRNSVSNFLHSLERGQVLPAHTLLNTVDVELIYEG
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>>CCDS31898.1 ACACB gene_id:32|Hs108|chr12                (2458 aa)
 initn: 585 init1: 410 opt: 504  Z-score: 486.3  bits: 103.0 E(32554): 9.2e-21
Smith-Waterman score: 735; 30.6% identity (59.2% similar) in 530 aa overlap (14-482:236-757)

                                10        20        30         40  
pF1KB3                  MLKFRTVHGGLRLLGIRRTSTAPAASPNVRRLEY-KPIKKVMV
                                     : ..:  :. . .  : :.   . :.::..
CCDS31 TTGEAETRVPTMRPSMSGLHLVKRGREHKKLDLHRDFTVASPAEFVTRFGGDRVIEKVLI
         210       220       230       240       250       260     

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pF1KB3 ANRGEIAIRVFRAC---------TELGIRTVAIYSEQDT-GQMHRQKADEAYLIGRGLAP
       :: :  :.. .:.          .: .:: :.. . .:  .. .  :  . :.   :   
CCDS31 ANNGIAAVKCMRSIRRWAYEMFRNERAIRFVVMVTPEDLKANAEYIKMADHYVPVPGGPN
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pF1KB3 VQAYLHIPDIIKVAKENNVDAVHPGYGFLSERADFAQA-CQDAGVRFIGPSPEVVRKMGD
        . : ..  :. .::.  :.::  :.:  ::   . .  :.. :: :.::  :..  .::
CCDS31 NNNYANVELIVDIAKRIPVQAVWAGWGHASENPKLPELLCKN-GVAFLGPPSEAMWALGD
         330       340       350       360        370       380    

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pF1KB3 KVEARAIAIAAGVPVVPGTDAPIT---------------------------SLHEAHEFS
       :. . ..: .  ::..: . . .:                           .. :. : .
CCDS31 KIASTVVAQTLQVPTLPWSGSGLTVEWTEDDLQQGKRISVPEDVYDKGCVKDVDEGLEAA
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pF1KB3 NTYGFPIIFKAAYGGGGRGMRVVHSYEELEENYTRAYSEALAAFGNGALFVEKFIEKPRH
       .  :::...::. ::::.:.: ..: :..   . .. ::    . .. .:. :. .. ::
CCDS31 ERIGFPLMIKASEGGGGKGIRKAESAEDFPILFRQVQSE----IPGSPIFLMKLAQHARH
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pF1KB3 IEVQILGDQYGNILHLYERDCSIQRRHQKVVEIAPAAHLDPQLRTRLTSDSVKLAKQVGY
       .:::::.::::: . :. :::::::::::.:: :::.     .   . . ...::: :::
CCDS31 LEVQILADQYGNAVSLFGRDCSIQRRHQKIVEEAPATIAPLAIFEFMEQCAIRLAKTVGY
              510       520       530       540       550       560

          310       320       330       340       350          360 
pF1KB3 ENAGTVEFLVDRHGKHYFIEVNSRLQVEHTVTEEITDVDLVHAQIHVAEG---RSLPDL-
        .:::::.: .. :. .:.:.: ::::::  :: :.::.:  ::...: :   . : :. 
CCDS31 VSAGTVEYLYSQDGSFHFLELNPRLQVEHPCTEMIADVNLPAAQLQIAMGVPLHRLKDIR
              570       580       590       600       610       620

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pF1KB3 --------GLRQENIRI-------NGCAIQCRVTTEDPARSFQPDTGRIEV--FRSGEGM
               :.   ...         : .:  :.:.:.: ..:.:..: ..   :::....
CCDS31 LLYGESPWGVTPISFETPSNPPLARGHVIAARITSENPDEGFKPSSGTVQELNFRSSKNV
              630       640       650       660       670       680

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pF1KB3 GIRLDNASAFQGAVISPHYDSLLVKVIAHGKDHPTAATKMSRALAEFRVRG-VKTNIAFL
          . ...:  :  .    :: . . .. :...  : ..:  :: :. .::  .:.. .:
CCDS31 WGYF-SVAATGG--LHEFADSQFGHCFSWGENREEAISNMVVALKELSIRGDFRTTVEYL
               690         700       710       720       730       

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pF1KB3 QNVLNNQQFLAGTVDTQFIDENPELFQLRPAQNRAQKLLHYLGHVMVNGPTTPIPVKASP
        :.:....:  . .:: ..:                                        
CCDS31 INLLETESFQNNDIDTGWLDYLIAEKVQAEKPDIMLGVVCGALNVADAMFRTCMTDFLHS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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