Result of FASTA (ccds) for pF1KB4983
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4983, 509 aa
  1>>>pF1KB4983 509 - 509 aa - 509 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9258+/-0.00108; mu= 13.9286+/- 0.064
 mean_var=61.2009+/-12.337, 0's: 0 Z-trim(101.6): 41  B-trim: 337 in 1/47
 Lambda= 0.163944
 statistics sampled from 6561 (6591) to 6561 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.562), E-opt: 0.2 (0.202), width:  16
 Scan time:  2.910

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS5749.1 DLD gene_id:1738|Hs108|chr7             ( 509) 3324 795.3       0
CCDS78269.1 DLD gene_id:1738|Hs108|chr7            ( 486) 2725 653.6 1.4e-187
CCDS78268.1 DLD gene_id:1738|Hs108|chr7            ( 461) 2052 494.4 1.1e-139
CCDS34877.1 GSR gene_id:2936|Hs108|chr8            ( 522)  644 161.4 2.2e-39
CCDS58274.1 TXNRD1 gene_id:7296|Hs108|chr12        ( 461)  601 151.2 2.3e-36
CCDS53823.1 TXNRD1 gene_id:7296|Hs108|chr12        ( 499)  601 151.2 2.5e-36
CCDS53821.1 TXNRD1 gene_id:7296|Hs108|chr12        ( 551)  601 151.2 2.7e-36
CCDS53820.1 TXNRD1 gene_id:7296|Hs108|chr12        ( 649)  601 151.2 3.2e-36
CCDS42981.1 TXNRD2 gene_id:10587|Hs108|chr22       ( 524)  569 143.7 4.9e-34
CCDS77811.1 TXNRD3 gene_id:114112|Hs108|chr3       ( 643)  563 142.3 1.6e-33
CCDS56531.1 GSR gene_id:2936|Hs108|chr8            ( 493)  356 93.3 6.7e-19
CCDS63402.1 TXNRD2 gene_id:10587|Hs108|chr22       ( 338)  326 86.2 6.4e-17
CCDS56530.1 GSR gene_id:2936|Hs108|chr8            ( 440)  311 82.6 9.7e-16
CCDS56532.1 GSR gene_id:2936|Hs108|chr8            ( 469)  307 81.7   2e-15


>>CCDS5749.1 DLD gene_id:1738|Hs108|chr7                  (509 aa)
 initn: 3324 init1: 3324 opt: 3324  Z-score: 4246.4  bits: 795.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3324; 99.8% identity (100.0% similar) in 509 aa overlap (1-509:1-509)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MQSWSRVYCSLAKRGHFNRISHGLQGLSAVPLRTYADQPIDADVTVIGSGPGGYVAAIKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 MQSWSRVYCSLAKRGHFNRISHGLQGLSAVPLRTYADQPIDADVTVIGSGPGGYVAAIKA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 AQLGFKTVCIEKNETLGGTCLNVGCIPSKALLNNSHYYHMAHGKDFASRGIEMSEVRLNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 AQLGFKTVCIEKNETLGGTCLNVGCIPSKALLNNSHYYHMAHGKDFASRGIEMSEVRLNL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 DKMMEQKSTAVKALTGGIAHLFKQNKVVHVNGYGKITGKNQVTATKADGGTQVIDTKNIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 DKMMEQKSTAVKALTGGIAHLFKQNKVVHVNGYGKITGKNQVTATKADGGTQVIDTKNIL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 IATGSEVTPFPGITIDEDTIVSSTGALSFKKVPEKMVVIGAGVIGVELGSVWQRLGADVT
       ::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 IATGSEVTPFPGITIDEDTIVSSTGALSLKKVPEKMVVIGAGVIGVELGSVWQRLGADVT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 AVEFLGHVGGVGIDMEISKNFQRILQKQGFKFKLNTKVTGATKKSDGKIDVSIEAASGGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 AVEFLGHVGGVGIDMEISKNFQRILQKQGFKFKLNTKVTGATKKSDGKIDVSIEAASGGK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 AEVITCDVLLVCIGRRPFTKNLGLEELGIELDPRGRIPVNTRFQTKIPNIYAIGDVVAGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 AEVITCDVLLVCIGRRPFTKNLGLEELGIELDPRGRIPVNTRFQTKIPNIYAIGDVVAGP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 MLAHKAEDEGIICVEGMAGGAVHIDYNCVPSVIYTHPEVAWVGKSEEQLKEEGIEYKVGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 MLAHKAEDEGIICVEGMAGGAVHIDYNCVPSVIYTHPEVAWVGKSEEQLKEEGIEYKVGK
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB4 FPFAANSRAKTNADTDGMVKILGQKSTDRVLGAHILGPGAGEMVNEAALALEYGASCEDI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 FPFAANSRAKTNADTDGMVKILGQKSTDRVLGAHILGPGAGEMVNEAALALEYGASCEDI
              430       440       450       460       470       480

              490       500         
pF1KB4 ARVCHAHPTLSEAFREANLAASFGKSINF
       :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 ARVCHAHPTLSEAFREANLAASFGKSINF
              490       500         

>>CCDS78269.1 DLD gene_id:1738|Hs108|chr7                 (486 aa)
 initn: 2725 init1: 2725 opt: 2725  Z-score: 3481.1  bits: 653.6 E(32554): 1.4e-187
Smith-Waterman score: 3107; 95.3% identity (95.5% similar) in 509 aa overlap (1-509:1-486)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MQSWSRVYCSLAKRGHFNRISHGLQGLSAVPLRTYADQPIDADVTVIGSGPGGYVAAIKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MQSWSRVYCSLAKRGHFNRISHGLQGLSAVPLRTYADQPIDADVTVIGSGPGGYVAAIKA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 AQLGFKTVCIEKNETLGGTCLNVGCIPSKALLNNSHYYHMAHGKDFASRGIEMSEVRLNL
       ::::::                       :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 AQLGFK-----------------------ALLNNSHYYHMAHGKDFASRGIEMSEVRLNL
                                      70        80        90       

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 DKMMEQKSTAVKALTGGIAHLFKQNKVVHVNGYGKITGKNQVTATKADGGTQVIDTKNIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 DKMMEQKSTAVKALTGGIAHLFKQNKVVHVNGYGKITGKNQVTATKADGGTQVIDTKNIL
       100       110       120       130       140       150       

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 IATGSEVTPFPGITIDEDTIVSSTGALSFKKVPEKMVVIGAGVIGVELGSVWQRLGADVT
       ::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 IATGSEVTPFPGITIDEDTIVSSTGALSLKKVPEKMVVIGAGVIGVELGSVWQRLGADVT
       160       170       180       190       200       210       

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 AVEFLGHVGGVGIDMEISKNFQRILQKQGFKFKLNTKVTGATKKSDGKIDVSIEAASGGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 AVEFLGHVGGVGIDMEISKNFQRILQKQGFKFKLNTKVTGATKKSDGKIDVSIEAASGGK
       220       230       240       250       260       270       

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 AEVITCDVLLVCIGRRPFTKNLGLEELGIELDPRGRIPVNTRFQTKIPNIYAIGDVVAGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 AEVITCDVLLVCIGRRPFTKNLGLEELGIELDPRGRIPVNTRFQTKIPNIYAIGDVVAGP
       280       290       300       310       320       330       

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 MLAHKAEDEGIICVEGMAGGAVHIDYNCVPSVIYTHPEVAWVGKSEEQLKEEGIEYKVGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MLAHKAEDEGIICVEGMAGGAVHIDYNCVPSVIYTHPEVAWVGKSEEQLKEEGIEYKVGK
       340       350       360       370       380       390       

              430       440       450       460       470       480
pF1KB4 FPFAANSRAKTNADTDGMVKILGQKSTDRVLGAHILGPGAGEMVNEAALALEYGASCEDI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 FPFAANSRAKTNADTDGMVKILGQKSTDRVLGAHILGPGAGEMVNEAALALEYGASCEDI
       400       410       420       430       440       450       

              490       500         
pF1KB4 ARVCHAHPTLSEAFREANLAASFGKSINF
       :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 ARVCHAHPTLSEAFREANLAASFGKSINF
       460       470       480      

>>CCDS78268.1 DLD gene_id:1738|Hs108|chr7                 (461 aa)
 initn: 2052 init1: 2052 opt: 2052  Z-score: 2621.2  bits: 494.4 E(32554): 1.1e-139
Smith-Waterman score: 2915; 90.4% identity (90.6% similar) in 509 aa overlap (1-509:1-461)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MQSWSRVYCSLAKRGHFNRISHGLQGLSAVPLRTYADQPIDADVTVIGSGPGGYVAAIKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MQSWSRVYCSLAKRGHFNRISHGLQGLSAVPLRTYADQPIDADVTVIGSGPGGYVAAIKA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 AQLGFKTVCIEKNETLGGTCLNVGCIPSKALLNNSHYYHMAHGKDFASRGIEMSEVRLNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 AQLGFKTVCIEKNETLGGTCLNVGCIPSKALLNNSHYYHMAHGKDFASRGIEMSEVRLNL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 DKMMEQKSTAVKALTGGIAHLFKQNKVVHVNGYGKITGKNQVTATKADGGTQVIDTKNIL
       ::::::::::::::::::::::::::                                  
CCDS78 DKMMEQKSTAVKALTGGIAHLFKQNK----------------------------------
              130       140                                        

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 IATGSEVTPFPGITIDEDTIVSSTGALSFKKVPEKMVVIGAGVIGVELGSVWQRLGADVT
                     ::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 --------------IDEDTIVSSTGALSLKKVPEKMVVIGAGVIGVELGSVWQRLGADVT
                      150       160       170       180       190  

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 AVEFLGHVGGVGIDMEISKNFQRILQKQGFKFKLNTKVTGATKKSDGKIDVSIEAASGGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 AVEFLGHVGGVGIDMEISKNFQRILQKQGFKFKLNTKVTGATKKSDGKIDVSIEAASGGK
            200       210       220       230       240       250  

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 AEVITCDVLLVCIGRRPFTKNLGLEELGIELDPRGRIPVNTRFQTKIPNIYAIGDVVAGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 AEVITCDVLLVCIGRRPFTKNLGLEELGIELDPRGRIPVNTRFQTKIPNIYAIGDVVAGP
            260       270       280       290       300       310  

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 MLAHKAEDEGIICVEGMAGGAVHIDYNCVPSVIYTHPEVAWVGKSEEQLKEEGIEYKVGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MLAHKAEDEGIICVEGMAGGAVHIDYNCVPSVIYTHPEVAWVGKSEEQLKEEGIEYKVGK
            320       330       340       350       360       370  

              430       440       450       460       470       480
pF1KB4 FPFAANSRAKTNADTDGMVKILGQKSTDRVLGAHILGPGAGEMVNEAALALEYGASCEDI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 FPFAANSRAKTNADTDGMVKILGQKSTDRVLGAHILGPGAGEMVNEAALALEYGASCEDI
            380       390       400       410       420       430  

              490       500         
pF1KB4 ARVCHAHPTLSEAFREANLAASFGKSINF
       :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 ARVCHAHPTLSEAFREANLAASFGKSINF
            440       450       460 

>>CCDS34877.1 GSR gene_id:2936|Hs108|chr8                 (522 aa)
 initn: 519 init1: 146 opt: 644  Z-score: 820.5  bits: 161.4 E(32554): 2.2e-39
Smith-Waterman score: 644; 30.5% identity (63.3% similar) in 463 aa overlap (43-492:66-516)

             20        30        40        50        60        70  
pF1KB4 KRGHFNRISHGLQGLSAVPLRTYADQPIDADVTVIGSGPGGYVAAIKAAQLGFKTVCIEK
                                     :  :::.: :: ..: .::.:: ... .:.
CCDS34 LTRALSRAMACRQEPQPQGPPPAAGAVASYDYLVIGGGSGGLASARRAAELGARAAVVES
          40        50        60        70        80        90     

             80        90       100       110       120       130  
pF1KB4 NETLGGTCLNVGCIPSKALLNNSHYYHMAHGKDFASRGIEMSEVRLNLDKMMEQKSTAVK
       .. :::::.::::.:.:.. :.. . .. :  : :. :.   : ..:   . :.... :.
CCDS34 HK-LGGTCVNVGCVPKKVMWNTAVHSEFMH--DHADYGFPSCEGKFNWRVIKEKRDAYVS
          100       110       120         130       140       150  

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pF1KB4 ALTGGIAHLFKQNKVVHVNGYGKITGKNQVTATKADGGTQVIDTKNILIATGS-EVTP--
        :..   . . ....  . :.. .:.  . :  ...:  .   . .::::::.   ::  
CCDS34 RLNAIYQNNLTKSHIEIIRGHAAFTSDPKPTI-EVSG--KKYTAPHILIATGGMPSTPHE
            160       170       180          190       200         

       190       200       210       220       230       240       
pF1KB4 --FPGITIDEDTIVSSTGALSFKKVPEKMVVIGAGVIGVELGSVWQRLGADVTAVEFLGH
         .:: ..     ..: : ......: . :..::: :.::.... . ::. .. .    .
CCDS34 SQIPGASLG----ITSDGFFQLEELPGRSVIVGAGYIAVEMAGILSALGSKTSLMIRHDK
     210           220       230       240       250       260     

       250       260       270       280       290       300       
pF1KB4 VGGVGIDMEISKNFQRILQKQGFKFKLNTKVTGATKKSDGKIDVSIEAASGGKAEVIT--
       :   ..:  :: :  . :.. : .  :. . .  .::. . ..::. .:  :.  :.:  
CCDS34 VLR-SFDSMISTNCTEELENAGVEV-LKFSQVKEVKKTLSGLEVSMVTAVPGRLPVMTMI
          270       280        290       300       310       320   

           310       320       330       340       350       360   
pF1KB4 --CDVLLVCIGRRPFTKNLGLEELGIELDPRGRIPVNTRFQTKIPNIYAIGDVVAGPMLA
          : ::  ::: : ::.:.:..:::. : .:.: :.   .:.. .:::.::: .  .:.
CCDS34 PDVDCLLWAIGRVPNTKDLSLNKLGIQTDDKGHIIVDEFQNTNVKGIYAVGDVCGKALLT
           330       340       350       360       370       380   

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pF1KB4 HKAEDEGIICVEGM--AGGAVHIDYNCVPSVIYTHPEVAWVGKSE-EQLKEEGIE-YKVG
         :   :   .. .       ..::: .:.:...:: .. :: .: : ... :::  :. 
CCDS34 PVAIAAGRKLAHRLFEYKEDSKLDYNNIPTVVFSHPPIGTVGLTEDEAIHKYGIENVKTY
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pF1KB4 KFPFAANSRAKTNADTDGMVKILGQKSTDRVLGAHILGPGAGEMVNEAALALEYGASCED
       .  :.   .: :.  :  ..:..  .. ..:.: :. : :  ::..  :.:...::.  :
CCDS34 STSFTPMYHAVTKRKTKCVMKMVCANKEEKVVGIHMQGLGCDEMLQGFAVAVKMGATKAD
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     480       490       500         
pF1KB4 IARVCHAHPTLSEAFREANLAASFGKSINF
       .  .   ::: ::                 
CCDS34 FDNTVAIHPTSSEELVTLR           
           510       520             

>>CCDS58274.1 TXNRD1 gene_id:7296|Hs108|chr12             (461 aa)
 initn: 515 init1: 133 opt: 601  Z-score: 766.4  bits: 151.2 E(32554): 2.3e-36
Smith-Waterman score: 628; 30.3% identity (63.5% similar) in 446 aa overlap (76-507:17-454)

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pF1KB4 VIGSGPGGYVAAIKAAQLGFKTVCIEKNETLGGTCLNVGCIPSKALLNNSHYYHMAHGKD
                                     :::::.::::::.: :....    .:  .:
CCDS58               MVLDFVTPTPLGTRWGLGGTCVNVGCIPKK-LMHQAALLGQAL-QD
                             10        20        30         40     

         110        120       130       140       150       160    
pF1KB4 FASRGIEMSE-VRLNLDKMMEQKSTAVKALTGGIAHLFKQNKVVHVNGYGKITGKNQVTA
         . : .. : :. . :.:.:  .. . .:. :    ....:::. :.::.. : ... :
CCDS58 SRNYGWKVEETVKHDWDRMIEAVQNHIGSLNWGYRVALREKKVVYENAYGQFIGPHRIKA
           50        60        70        80        90       100    

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pF1KB4 TKADGGTQVIDTKNILIATGSEVTPFPGITIDEDTIVSSTGALSFKKVPEKMVVIGAGVI
       :.  :  .. ... .::::: :   . ::  :..  .::   .:.   : : .:.::. .
CCDS58 TNNKGKEKIYSAERFLIATG-ERPRYLGIPGDKEYCISSDDLFSLPYCPGKTLVVGASYV
          110       120        130       140       150       160   

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pF1KB4 GVELGSVWQRLGADVTAVEFLGHVGGVGIDMEISKNFQRILQKQGFKFK---LNTKVTGA
       ..: ..    .: :::..  .  .   :.:....... . ....:.::    .  ::   
CCDS58 ALECAGFLAGIGLDVTVM--VRSILLRGFDQDMANKIGEHMEEHGIKFIRQFVPIKVEQI
           170       180         190       200       210       220 

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pF1KB4 TKKSDGKIDVSIEAASGGKAEVITCD--VLLVCIGRRPFTKNLGLEELGIELDPR-GRIP
          . :.. :   : : .. :.:  .  .... :::   :...::: .:.... . :.::
CCDS58 EAGTPGRLRVV--AQSTNSEEIIEGEYNTVMLAIGRDACTRKIGLETVGVKINEKTGKIP
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      340       350       360        370        380       390      
pF1KB4 VNTRFQTKIPNIYAIGDVVAGPM-LAHKAEDEGIICVEGM-AGGAVHIDYNCVPSVIYTH
       :. . ::..: ::::::..   . :.  : . : . .. . ::..:. ::. ::....: 
CCDS58 VTDEEQTNVPYIYAIGDILEDKVELTPVAIQAGRLLAQRLYAGSTVKCDYENVPTTVFTP
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        400           410        420       430       440       450 
pF1KB4 PEVAWVGKSEEQ----LKEEGIE-YKVGKFPFAANSRAKTNADTDGMVKILGQKSTDRVL
        : .  : :::.    . ::.:: :.   .:.  .  .. :    . . : . :...::.
CCDS58 LEYGACGLSEEKAVEKFGEENIEVYHSYFWPLEWTIPSRDNNKCYAKI-ICNTKDNERVV
     340       350       360       370       380        390        

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pF1KB4 GAHILGPGAGEMVNEAALALEYGASCEDIARVCHAHPTLSEAFREANLAASFGKSINF  
       : :.:::.:::...  : ::. : . ...  .   ::. .:.:   ...   : ::    
CCDS58 GFHVLGPNAGEVTQGFAAALKCGLTKKQLDSTIGIHPVCAEVFTTLSVTKRSGASILQAG
      400       410       420       430       440       450        

CCDS58 CCG
      460 

>>CCDS53823.1 TXNRD1 gene_id:7296|Hs108|chr12             (499 aa)
 initn: 574 init1: 133 opt: 601  Z-score: 765.8  bits: 151.2 E(32554): 2.5e-36
Smith-Waterman score: 687; 30.5% identity (62.2% similar) in 495 aa overlap (37-507:6-492)

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pF1KB4 VYCSLAKRGHFNRISHGLQGLSAVPLRTYADQP--IDADVTVIGSGPGGYVAAIKAAQLG
                                     : :   : :. .::.: :: .:: .::: :
CCDS53                          MNGPEDLPKSYDYDLIIIGGGSGGLAAAKEAAQYG
                                        10        20        30     

           70                80        90       100       110      
pF1KB4 FKTVCIE--------KNETLGGTCLNVGCIPSKALLNNSHYYHMAHGKDFASRGIEMSE-
        :.. ..            :::::.::::::.: :....    .:  .:  . : .. : 
CCDS53 KKVMVLDFVTPTPLGTRWGLGGTCVNVGCIPKK-LMHQAALLGQAL-QDSRNYGWKVEET
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pF1KB4 VRLNLDKMMEQKSTAVKALTGGIAHLFKQNKVVHVNGYGKITGKNQVTATKADGGTQVID
       :. . :.:.:  .. . .:. :    ....:::. :.::.. : ... ::.  :  .. .
CCDS53 VKHDWDRMIEAVQNHIGSLNWGYRVALREKKVVYENAYGQFIGPHRIKATNNKGKEKIYS
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pF1KB4 TKNILIATGSEVTPFPGITIDEDTIVSSTGALSFKKVPEKMVVIGAGVIGVELGSVWQRL
       .. .::::: :   . ::  :..  .::   .:.   : : .:.::. ...: ..    .
CCDS53 AERFLIATG-ERPRYLGIPGDKEYCISSDDLFSLPYCPGKTLVVGASYVALECAGFLAGI
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         240       250       260       270          280       290  
pF1KB4 GADVTAVEFLGHVGGVGIDMEISKNFQRILQKQGFKFK---LNTKVTGATKKSDGKIDVS
       : :::..  .  .   :.:....... . ....:.::    .  ::      . :.. : 
CCDS53 GLDVTVM--VRSILLRGFDQDMANKIGEHMEEHGIKFIRQFVPIKVEQIEAGTPGRLRVV
              220       230       240       250       260       270

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pF1KB4 IEAASGGKAEVITCD--VLLVCIGRRPFTKNLGLEELGIELDPR-GRIPVNTRFQTKIPN
         : : .. :.:  .  .... :::   :...::: .:.... . :.:::. . ::..: 
CCDS53 --AQSTNSEEIIEGEYNTVMLAIGRDACTRKIGLETVGVKINEKTGKIPVTDEEQTNVPY
                280       290       300       310       320        

     350       360        370        380       390       400       
pF1KB4 IYAIGDVVAGPM-LAHKAEDEGIICVEGM-AGGAVHIDYNCVPSVIYTHPEVAWVGKSEE
       ::::::..   . :.  : . : . .. . ::..:. ::. ::....:  : .  : :::
CCDS53 IYAIGDILEDKVELTPVAIQAGRLLAQRLYAGSTVKCDYENVPTTVFTPLEYGACGLSEE
      330       340       350       360       370       380        

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pF1KB4 Q----LKEEGIE-YKVGKFPFAANSRAKTNADTDGMVKILGQKSTDRVLGAHILGPGAGE
       .    . ::.:: :.   .:.  .  .. :    . . : . :...::.: :.:::.:::
CCDS53 KAVEKFGEENIEVYHSYFWPLEWTIPSRDNNKCYAKI-ICNTKDNERVVGFHVLGPNAGE
      390       400       410       420        430       440       

            470       480       490       500              
pF1KB4 MVNEAALALEYGASCEDIARVCHAHPTLSEAFREANLAASFGKSINF     
       ...  : ::. : . ...  .   ::. .:.:   ...   : ::       
CCDS53 VTQGFAAALKCGLTKKQLDSTIGIHPVCAEVFTTLSVTKRSGASILQAGCCG
       450       460       470       480       490         

>>CCDS53821.1 TXNRD1 gene_id:7296|Hs108|chr12             (551 aa)
 initn: 592 init1: 133 opt: 601  Z-score: 765.1  bits: 151.2 E(32554): 2.7e-36
Smith-Waterman score: 687; 30.5% identity (62.2% similar) in 495 aa overlap (37-507:58-544)

         10        20        30          40        50        60    
pF1KB4 VYCSLAKRGHFNRISHGLQGLSAVPLRTYADQP--IDADVTVIGSGPGGYVAAIKAAQLG
                                     : :   : :. .::.: :: .:: .::: :
CCDS53 KQRKIGGHGPTLKAYQEGRLQKLLKMNGPEDLPKSYDYDLIIIGGGSGGLAAAKEAAQYG
        30        40        50        60        70        80       

           70                80        90       100       110      
pF1KB4 FKTVCIE--------KNETLGGTCLNVGCIPSKALLNNSHYYHMAHGKDFASRGIEMSE-
        :.. ..            :::::.::::::.: :....    .:  .:  . : .. : 
CCDS53 KKVMVLDFVTPTPLGTRWGLGGTCVNVGCIPKK-LMHQAALLGQAL-QDSRNYGWKVEET
        90       100       110       120        130        140     

         120       130       140       150       160       170     
pF1KB4 VRLNLDKMMEQKSTAVKALTGGIAHLFKQNKVVHVNGYGKITGKNQVTATKADGGTQVID
       :. . :.:.:  .. . .:. :    ....:::. :.::.. : ... ::.  :  .. .
CCDS53 VKHDWDRMIEAVQNHIGSLNWGYRVALREKKVVYENAYGQFIGPHRIKATNNKGKEKIYS
         150       160       170       180       190       200     

         180       190       200       210       220       230     
pF1KB4 TKNILIATGSEVTPFPGITIDEDTIVSSTGALSFKKVPEKMVVIGAGVIGVELGSVWQRL
       .. .::::: :   . ::  :..  .::   .:.   : : .:.::. ...: ..    .
CCDS53 AERFLIATG-ERPRYLGIPGDKEYCISSDDLFSLPYCPGKTLVVGASYVALECAGFLAGI
         210        220       230       240       250       260    

         240       250       260       270          280       290  
pF1KB4 GADVTAVEFLGHVGGVGIDMEISKNFQRILQKQGFKFK---LNTKVTGATKKSDGKIDVS
       : :::..  .  .   :.:....... . ....:.::    .  ::      . :.. : 
CCDS53 GLDVTVM--VRSILLRGFDQDMANKIGEHMEEHGIKFIRQFVPIKVEQIEAGTPGRLRVV
          270         280       290       300       310       320  

            300         310       320       330        340         
pF1KB4 IEAASGGKAEVITCD--VLLVCIGRRPFTKNLGLEELGIELDPR-GRIPVNTRFQTKIPN
         : : .. :.:  .  .... :::   :...::: .:.... . :.:::. . ::..: 
CCDS53 --AQSTNSEEIIEGEYNTVMLAIGRDACTRKIGLETVGVKINEKTGKIPVTDEEQTNVPY
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       ::::::..   . :.  : . : . .. . ::..:. ::. ::....:  : .  : :::
CCDS53 IYAIGDILEDKVELTPVAIQAGRLLAQRLYAGSTVKCDYENVPTTVFTPLEYGACGLSEE
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       .    . ::.:: :.   .:.  .  .. :    . . : . :...::.: :.:::.:::
CCDS53 KAVEKFGEENIEVYHSYFWPLEWTIPSRDNNKCYAKI-ICNTKDNERVVGFHVLGPNAGE
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       ...  : ::. : . ...  .   ::. .:.:   ...   : ::       
CCDS53 VTQGFAAALKCGLTKKQLDSTIGIHPVCAEVFTTLSVTKRSGASILQAGCCG
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>>CCDS53820.1 TXNRD1 gene_id:7296|Hs108|chr12             (649 aa)
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CCDS53 KQRKIGGHGPTLKAYQEGRLQKLLKMNGPEDLPKSYDYDLIIIGGGSGGLAAAKEAAQYG
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CCDS53 KKVMVLDFVTPTPLGTRWGLGGTCVNVGCIPKK-LMHQAALLGQAL-QDSRNYGWKVEET
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pF1KB4 VRLNLDKMMEQKSTAVKALTGGIAHLFKQNKVVHVNGYGKITGKNQVTATKADGGTQVID
       :. . :.:.:  .. . .:. :    ....:::. :.::.. : ... ::.  :  .. .
CCDS53 VKHDWDRMIEAVQNHIGSLNWGYRVALREKKVVYENAYGQFIGPHRIKATNNKGKEKIYS
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       .. .::::: :   . ::  :..  .::   .:.   : : .:.::. ...: ..    .
CCDS53 AERFLIATG-ERPRYLGIPGDKEYCISSDDLFSLPYCPGKTLVVGASYVALECAGFLAGI
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pF1KB4 GADVTAVEFLGHVGGVGIDMEISKNFQRILQKQGFKFK---LNTKVTGATKKSDGKIDVS
       : :::..  .  .   :.:....... . ....:.::    .  ::      . :.. : 
CCDS53 GLDVTVM--VRSILLRGFDQDMANKIGEHMEEHGIKFIRQFVPIKVEQIEAGTPGRLRVV
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pF1KB4 IEAASGGKAEVITCD--VLLVCIGRRPFTKNLGLEELGIELDPR-GRIPVNTRFQTKIPN
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CCDS53 --AQSTNSEEIIEGEYNTVMLAIGRDACTRKIGLETVGVKINEKTGKIPVTDEEQTNVPY
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pF1KB4 IYAIGDVVAGPM-LAHKAEDEGIICVEGM-AGGAVHIDYNCVPSVIYTHPEVAWVGKSEE
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CCDS53 IYAIGDILEDKVELTPVAIQAGRLLAQRLYAGSTVKCDYENVPTTVFTPLEYGACGLSEE
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pF1KB4 Q----LKEEGIE-YKVGKFPFAANSRAKTNADTDGMVKILGQKSTDRVLGAHILGPGAGE
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CCDS53 KAVEKFGEENIEVYHSYFWPLEWTIPSRDNNKCYAKI-ICNTKDNERVVGFHVLGPNAGE
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pF1KB4 MVNEAALALEYGASCEDIARVCHAHPTLSEAFREANLAASFGKSINF     
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CCDS53 VTQGFAAALKCGLTKKQLDSTIGIHPVCAEVFTTLSVTKRSGASILQAGCCG
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CCDS42   MAAMAVALRGLGGRFRWRTQAVAGGVRGAARGAAAGQRDYDLLVVGGGSGGLACAKEA
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pF1KB4 AQLGFKTVCIEKNET--------LGGTCLNVGCIPSKALLNNSHYYHMAHG--KDFASRG
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CCDS42 AQLGRKVAVVDYVEPSPQGTRWGLGGTCVNVGCIPKKLM----HQAALLGGLIQDAPNYG
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pF1KB4 IEMSE-VRLNLDKMMEQKSTAVKALTGGIAHLFKQNKVVHVNGYGKITGKNQVTATKADG
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CCDS42 WEVAQPVPHDWRKMAEAVQNHVKSLNWGHRVQLQDRKVKYFNIKASFVDEHTVCGV-AKG
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pF1KB4 GTQVI-DTKNILIATGSEVTPFPGITIDEDTIVSSTGALSFKKVPEKMVVIGAGVIGVEL
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CCDS42 GKEILLSADHIIIATGGRPRYPTHIEGALEYGITSDDIFWLKESPGKTLVVGASYVALEC
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pF1KB4 GSVWQRLGADVTAVEFLGHVGGVGIDMEISKNFQRILQKQGFKFKLNTKVTGATKKSDGK
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CCDS42 AGFLTGIGLDTTIM--MRSIPLRGFDQQMSSMVIEHMASHGTRFLRGCAPSRVRRLPDGQ
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pF1KB4 IDVSIEAASGGKAEVITCDVLLVCIGRRPFTKNLGLEELGIELDP-RGRIPVNTRFQTKI
       ..:. : .. :: .. : :..:  ::: : :..:.::. :.. .:   .: :..:  :..
CCDS42 LQVTWEDSTTGKEDTGTFDTVLWAIGRVPDTRSLNLEKAGVDTSPDTQKILVDSREATSV
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pF1KB4 PNIYAIGDVVAG-PMLAHKAEDEGIICVEGMAGGAVHI-DYNCVPSVIYTHPEVAWVGKS
       :.:::::::: : : :.  :   : . :. . ::.  . ::. ::....:  : . :: :
CCDS42 PHIYAIGDVVEGRPELTPIAIMAGRLLVQRLFGGSSDLMDYDNVPTTVFTPLEYGCVGLS
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pF1KB4 EEQL----KEEGIEYKVGKFPFAANSRAKTNADTDGMVKILGQKSTDR-VLGAHILGPGA
       ::.      .: .:   ...     . :  .: .. .::..  .   . ::: :.:::.:
CCDS42 EEEAVARHGQEHVEVYHAHYKPLEFTVAGRDA-SQCYVKMVCLREPPQLVLGLHFLGPNA
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pF1KB4 GEMVNEAALALEYGASCEDIARVCHAHPTLSEAFREANLAASFGKSINF     
       ::...  ::... :::  .. :.   ::: ::                      
CCDS42 GEVTQGFALGIKCGASYAQVMRTVGIHPTCSEEVVKLRISKRSGLDPTVTGCCG
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>>CCDS77811.1 TXNRD3 gene_id:114112|Hs108|chr3            (643 aa)
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CCDS77 NIFVNKVHVGGCDQTFQAYQSGLLQKLLQEDLAYDYDLIIIGGGSGGLSCAKEAAILGKK
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pF1KB4 TVCIE--------KNETLGGTCLNVGCIPSKALLNNSHYYHMAHGKDFASRGIEMSE-VR
       .. ..         .  :::::.::::::.: :....    .:   :  . : :... ::
CCDS77 VMVLDFVVPSPQGTSWGLGGTCVNVGCIPKK-LMHQAALLGQALC-DSRKFGWEYNQQVR
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pF1KB4 LNLDKMMEQKSTAVKALTGGIAHLFKQNKVVHVNGYGKITGKNQVTATKADGGTQVIDTK
        : . : .  .. ...:. :    .... :..::.::... .... ::.  :      . 
CCDS77 HNWETMTKAIQNHISSLNWGYRLSLREKAVAYVNSYGEFVEHHKIKATNKKGQETYYTAA
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pF1KB4 NILIATGSEVTPFPGITIDEDTIVSSTGALSFKKVPEKMVVIGAGVIGVELGSVWQRLGA
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CCDS77 QFVIATG-ERPRYLGIQGDKEYCITSDDLFSLPYCPGKTLVVGASYVALECAGFLAGFGL
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pF1KB4 DVTAVEFLGHVGGVGIDMEISKNFQRILQKQGFKFK---LNTKVTGATKKSDGKIDVSIE
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CCDS77 DVTVM--VRSILLRGFDQEMAEKVGSYMEQHGVKFLRKFIPVMVQQLEKGSPGKLKVLAK
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pF1KB4 AASGGKAEVITCDVLLVCIGRRPFTKNLGLEELGIELDPR-GRIPVNTRFQTKIPNIYAI
       .. : ..   . ...:. :::   :...:::..:.... . :.::::   ::..: .::.
CCDS77 STEGTETIEGVYNTVLLAIGRDSCTRKIGLEKIGVKINEKSGKIPVNDVEQTNVPYVYAV
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pF1KB4 GDVVAG-PMLAHKAEDEGIICVEGMAGGAVH-IDYNCVPSVIYTHPEVAWVGKSEEQ---
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CCDS77 GDILEDKPELTPVAIQSGKLLAQRLFGASLEKCDYINVPTTVFTPLEYGCCGLSEEKAIE
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pF1KB4 -LKEEGIE-YKVGKFPFAANSRAKTNADTDGMVKILGQK-STDRVLGAHILGPGAGEMVN
         :.:..: :..  .:.  .  .. :     ..::. .: . :::.: :::::.:::...
CCDS77 VYKKENLEIYHTLFWPLEWTVAGRENNTC--YAKIICNKFDHDRVIGFHILGPNAGEVTQ
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pF1KB4 EAALALEYGASCEDIARVCHAHPTLSEAFREANLAASFGKSINF     
         : :.. : . . .  .   ::: .:.:   ... : : .:       
CCDS77 GFAAAMKCGLTKQLLDDTIGIHPTCGEVFTTLEITKSSGLDITQKGCCG
          600       610       620       630       640   




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 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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