Result of FASTA (ccds) for pF1KB4120
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4120, 451 aa
  1>>>pF1KB4120 451 - 451 aa - 451 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.4760+/-0.00112; mu= -12.2748+/- 0.068
 mean_var=453.9034+/-94.471, 0's: 0 Z-trim(115.6): 39  B-trim: 463 in 1/54
 Lambda= 0.060199
 statistics sampled from 16179 (16213) to 16179 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.769), E-opt: 0.2 (0.498), width:  16
 Scan time:  3.120

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS53499.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10         ( 451) 3053 279.1 6.5e-75
CCDS31170.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10         ( 452) 3041 278.0 1.3e-74
CCDS53498.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10         ( 446) 2996 274.1   2e-73
CCDS53500.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10         ( 480) 2255 209.8   5e-54
CCDS31171.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10         ( 481) 2232 207.8   2e-53
CCDS31169.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10         ( 476) 2220 206.7 4.1e-53
CCDS73078.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10         ( 422) 1831 172.9 5.5e-43
CCDS7150.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10          ( 508) 1819 171.9 1.3e-42
CCDS73077.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10         ( 393) 1793 169.6 5.1e-42
CCDS2358.1 ABI2 gene_id:10152|Hs108|chr2           ( 475) 1616 154.3 2.5e-37
CCDS53501.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10         ( 496) 1598 152.7 7.7e-37
CCDS74634.1 ABI2 gene_id:10152|Hs108|chr2          ( 390) 1590 152.0   1e-36
CCDS63094.1 ABI2 gene_id:10152|Hs108|chr2          ( 507) 1428 138.0 2.2e-32
CCDS63093.1 ABI2 gene_id:10152|Hs108|chr2          ( 513) 1370 132.9 7.2e-31
CCDS53497.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10         ( 329)  943 95.7 7.5e-20
CCDS11546.1 ABI3 gene_id:51225|Hs108|chr17         ( 366)  602 66.1 6.7e-11


>>CCDS53499.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10              (451 aa)
 initn: 3053 init1: 3053 opt: 3053  Z-score: 1458.4  bits: 279.1 E(32554): 6.5e-75
Smith-Waterman score: 3053; 100.0% identity (100.0% similar) in 451 aa overlap (1-451:1-451)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLAS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKWLKAKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKWLKAKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 PPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 GSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPAPGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPAPGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSST
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 SSGGYRRTPSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSIADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SSGGYRRTPSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSIADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 PVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIK
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450 
pF1KB4 KNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD
       :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD
              430       440       450 

>>CCDS31170.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10              (452 aa)
 initn: 1907 init1: 1907 opt: 3041  Z-score: 1452.8  bits: 278.0 E(32554): 1.3e-74
Smith-Waterman score: 3041; 99.8% identity (99.8% similar) in 452 aa overlap (1-451:1-452)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLAS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKWLKAKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKWLKAKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 PPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270        280       290         
pF1KB4 GSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPA-PGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPAAPGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSS
              250       260       270       280       290       300

     300       310       320       330       340       350         
pF1KB4 TSSGGYRRTPSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSIADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TSSGGYRRTPSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSIADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPP
              310       320       330       340       350       360

     360       370       380       390       400       410         
pF1KB4 PPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVI
              370       380       390       400       410       420

     420       430       440       450 
pF1KB4 KKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD
              430       440       450  

>>CCDS53498.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10              (446 aa)
 initn: 2060 init1: 2060 opt: 2996  Z-score: 1431.7  bits: 274.1 E(32554): 2e-73
Smith-Waterman score: 2996; 98.9% identity (98.9% similar) in 451 aa overlap (1-451:1-446)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLAS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKWLKAKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::     :::::::::::::::::::::
CCDS53 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVK-----HGNNQPARTGTLSRTNPPTQK
              130       140       150            160       170     

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 PPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHS
         180       190       200       210       220       230     

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 GSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPAPGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPAPGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSST
         240       250       260       270       280       290     

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 SSGGYRRTPSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSIADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SSGGYRRTPSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSIADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPP
         300       310       320       330       340       350     

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 PVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIK
         360       370       380       390       400       410     

              430       440       450 
pF1KB4 KNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD
       :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD
         420       430       440      

>>CCDS53500.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10              (480 aa)
 initn: 2295 init1: 2222 opt: 2255  Z-score: 1083.5  bits: 209.8 E(32554): 5e-54
Smith-Waterman score: 2985; 94.0% identity (94.0% similar) in 480 aa overlap (1-451:1-480)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLAS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKWLKAKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKWLKAKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 PPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 GSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPAPGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPAPGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSST
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330                              
pF1KB4 SSGGYRRTPSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSI----------------------------
       ::::::::::::::::::::::::::::::::                            
CCDS53 SSGGYRRTPSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSISIAPPPPPMPQLTPQIPLTGFVARVQEN
              310       320       330       340       350       360

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pF1KB4 -ADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYI
        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYI
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             400       410       420       430       440       450 
pF1KB4 EKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD
              430       440       450       460       470       480

>>CCDS31171.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10              (481 aa)
 initn: 2245 init1: 1825 opt: 2232  Z-score: 1072.7  bits: 207.8 E(32554): 2e-53
Smith-Waterman score: 2973; 93.8% identity (93.8% similar) in 481 aa overlap (1-451:1-481)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLAS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
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pF1KB4 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKWLKAKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKWLKAKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQK
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pF1KB4 PPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHS
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pF1KB4 GSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPA-PGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPAAPGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSS
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pF1KB4 TSSGGYRRTPSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSI---------------------------
       :::::::::::::::::::::::::::::::::                           
CCDS31 TSSGGYRRTPSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSISIAPPPPPMPQLTPQIPLTGFVARVQE
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pF1KB4 --ADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNY
         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NIADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNY
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pF1KB4 IEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYT
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pF1KB4 D
       :
CCDS31 D
        

>>CCDS31169.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10              (476 aa)
 initn: 2219 init1: 981 opt: 2220  Z-score: 1067.1  bits: 206.7 E(32554): 4.1e-53
Smith-Waterman score: 2916; 92.7% identity (92.7% similar) in 481 aa overlap (1-451:1-476)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLAS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
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pF1KB4 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKWLKAKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::     :::::::::::::::::::::
CCDS31 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVK-----HGNNQPARTGTLSRTNPPTQK
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pF1KB4 PPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHS
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pF1KB4 GSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPA-PGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPAAPGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSS
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     300       310       320       330                             
pF1KB4 TSSGGYRRTPSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSI---------------------------
       :::::::::::::::::::::::::::::::::                           
CCDS31 TSSGGYRRTPSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSISIAPPPPPMPQLTPQIPLTGFVARVQE
         300       310       320       330       340       350     

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pF1KB4 --ADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNY
         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NIADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNY
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              400       410       420       430       440       450
pF1KB4 IEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYT
         420       430       440       450       460       470     

        
pF1KB4 D
       :
CCDS31 D
        

>>CCDS73078.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10              (422 aa)
 initn: 2678 init1: 1804 opt: 1831  Z-score: 885.2  bits: 172.9 E(32554): 5.5e-43
Smith-Waterman score: 2626; 88.5% identity (90.2% similar) in 451 aa overlap (1-451:1-422)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLAS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKWLKAKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKWLKAKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQK
              130       140       150       160       170       180

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pF1KB4 PPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 PPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 GSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPAPGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSST
       :::::::::::::::::::::::::::::::::.  . :                     
CCDS73 GSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPVSIAPP---------------------
              250       260       270                              

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pF1KB4 SSGGYRRTPSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSIADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPP
               :    :.. :  ..:     :..:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 --------PPPMPQLTPQIPLTGFVARVQENIADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPP
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pF1KB4 PVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 PVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIK
             340       350       360       370       380       390 

              430       440       450 
pF1KB4 KNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD
       :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 KNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD
             400       410       420  

>>CCDS7150.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10               (508 aa)
 initn: 2663 init1: 1789 opt: 1819  Z-score: 878.5  bits: 171.9 E(32554): 1.3e-42
Smith-Waterman score: 2742; 88.2% identity (88.2% similar) in 483 aa overlap (1-426:1-483)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLAS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
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pF1KB4 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKWLKAKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKWLKAKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQK
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pF1KB4 PPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 PPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270                              
pF1KB4 GSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGP---------------------------
       :::::::::::::::::::::::::::::::::                           
CCDS71 GSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPENISVPPPSGAPPAPPLAPLLPVSTVI
              250       260       270       280       290       300

            280       290       300       310       320       330  
pF1KB4 -APGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSSTSSGGYRRTPSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSI
        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 AAPGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSSTSSGGYRRTPSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSI
              310       320       330       340       350       360

                                         340       350       360   
pF1KB4 -----------------------------ADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVD
                                    :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 SIAPPPPPMPQLTPQIPLTGFVARVQENIADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVD
              370       380       390       400       410       420

           370       380       390       400       410       420   
pF1KB4 YEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKND
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 YEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKND
              430       440       450       460       470       480

           430       440       450 
pF1KB4 DGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD
       :::                         
CCDS71 DGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD
              490       500        

>>CCDS73077.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10              (393 aa)
 initn: 1907 init1: 1792 opt: 1793  Z-score: 867.8  bits: 169.6 E(32554): 5.1e-42
Smith-Waterman score: 2542; 86.9% identity (87.1% similar) in 451 aa overlap (1-451:1-393)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLAS
               10        20        30        40        50        60

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pF1KB4 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKWLKAKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQK
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pF1KB4 PPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 PPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHS
              190       200       210       220       230       240

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pF1KB4 GSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPAPGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSST
       :::::::::::::::::::::::::::::::::                           
CCDS73 GSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGP---------------------------
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pF1KB4 SSGGYRRTPSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSIADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPP
                                      .::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 -------------------------------VADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPP
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pF1KB4 PVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 PVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIK
            310       320       330       340       350       360  

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pF1KB4 KNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD
       :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 KNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD
            370       380       390   

>>CCDS2358.1 ABI2 gene_id:10152|Hs108|chr2                (475 aa)
 initn: 2172 init1: 915 opt: 1616  Z-score: 783.6  bits: 154.3 E(32554): 2.5e-37
Smith-Waterman score: 2148; 69.2% identity (82.1% similar) in 487 aa overlap (1-451:1-475)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLAS
       :::::::::::::.:.:::..:: :: ::::::::::::..::..:::::::::::::::
CCDS23 MAELQMLLEEEIPGGRRALFDSYTNLERVADYCENNYIQSADKQRALEETKAYTTQSLAS
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pF1KB4 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
       ::: ::.:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 VAYLINTLANNVLQMLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
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pF1KB4 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKWLKAKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQK
       :::::::::.::::::::::::::.:::.:::::       ..:  . : : ::.:::::
CCDS23 THKIIAPANLERPVRYIRKPIDYTILDDIGHGVKV------STQNMKMGGLPRTTPPTQK
              130       140       150             160       170    

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pF1KB4 PPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPAR--LGSQHSPGRTASLNQRPRT
       ::::::::.:::::..::.:::::.::.:::::. ::.:    ::.:: ::::.::: ::
CCDS23 PPSPPMSGKGTLGRHSPYRTLEPVRPPVVPNDYVPSPTRNMAPSQQSPVRTASVNQRNRT
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      240               250       260       270       280       290
pF1KB4 HS--GSSGGS------GSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPAPGSAPGSQYGTMTRQI
       .:  ::::::      .:::::::.:.:.::::::::::.. :.    :  :. .:.:  
CCDS23 YSSSGSSGGSHPSSRSSSRENSGSGSVGVPIAVPTPSPPSVFPG---HP-VQFYSMNRPA
          240       250       260       270          280        290

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pF1KB4 SRHNSTTSSTSSGGYRRTPSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSIADSPTPP-----------
       :::.  : . .:  ::: ::.:.: : : ..::::.:::: .. .: ::           
CCDS23 SRHTPPTIG-GSLPYRRPPSITSQTSLQNQMNGGPFYSQNPVSLAPPPPSILQVTPQLPL
               300       310       320       330       340         

                    340       350       360       370       380    
pF1KB4 ---------------PPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPA
                      ::::: . :.::.::::::::  :::.::::::.:.::::. :: 
CCDS23 MGFVARVQENISDTPPPPPPVEEPVFDESPPPPPPPE-DYEEEEAAVVEYSDPYAEEDPP
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          390       400       410       420       430       440    
pF1KB4 WAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVE
       :::..:.:::::::::::::.:::::.::::::::::::::::::: : :::::::::::
CCDS23 WAPRSYLEKVVAIYDYTKDKEDELSFQEGAIIYVIKKNDDGWYEGVMNGVTGLFPGNYVE
      410       420       430       440       450       460        

          450 
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       :::::..
CCDS23 SIMHYSE
      470     




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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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