Result of FASTA (ccds) for pF1KB3614
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3614, 418 aa
  1>>>pF1KB3614 418 - 418 aa - 418 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8066+/-0.00097; mu= 14.1399+/- 0.058
 mean_var=65.9858+/-13.804, 0's: 0 Z-trim(103.3): 32  B-trim: 67 in 1/50
 Lambda= 0.157888
 statistics sampled from 7337 (7354) to 7337 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.598), E-opt: 0.2 (0.226), width:  16
 Scan time:  2.520

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS7342.1 AP3M1 gene_id:26985|Hs108|chr10         ( 418) 2760 637.9 5.4e-183
CCDS6125.1 AP3M2 gene_id:10947|Hs108|chr8          ( 418) 2448 566.8 1.3e-161
CCDS77234.1 AP1M2 gene_id:10053|Hs108|chr19        ( 425)  527 129.2 7.2e-30
CCDS45964.1 AP1M2 gene_id:10053|Hs108|chr19        ( 423)  513 126.0 6.6e-29
CCDS12342.1 AP1M1 gene_id:8907|Hs108|chr19         ( 423)  482 119.0 8.8e-27
CCDS43177.1 AP2M1 gene_id:1173|Hs108|chr3          ( 435)  383 96.4 5.5e-20
CCDS43178.1 AP2M1 gene_id:1173|Hs108|chr3          ( 433)  376 94.8 1.7e-19
CCDS82880.1 AP2M1 gene_id:1173|Hs108|chr3          ( 460)  345 87.8 2.3e-17
CCDS46008.1 AP1M1 gene_id:8907|Hs108|chr19         ( 435)  273 71.4 1.9e-12
CCDS5685.1 AP4M1 gene_id:9179|Hs108|chr7           ( 453)  271 70.9 2.7e-12


>>CCDS7342.1 AP3M1 gene_id:26985|Hs108|chr10              (418 aa)
 initn: 2760 init1: 2760 opt: 2760  Z-score: 3398.7  bits: 637.9 E(32554): 5.4e-183
Smith-Waterman score: 2760; 100.0% identity (100.0% similar) in 418 aa overlap (1-418:1-418)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MIHSLFLINCSGDIFLEKHWKSVVSQSVCDYFFEAQEKAADVENVPPVISTPHHYLISIY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MIHSLFLINCSGDIFLEKHWKSVVSQSVCDYFFEAQEKAADVENVPPVISTPHHYLISIY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 RDKLFFVSVIQTEVPPLFVIEFLHRVADTFQDYFGECSEAAIKDNVVIVYELLEEMLDNG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RDKLFFVSVIQTEVPPLFVIEFLHRVADTFQDYFGECSEAAIKDNVVIVYELLEEMLDNG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 FPLATESNILKELIKPPTILRSVVNSITGSSNVGDTLPTGQLSNIPWRRAGVKYTNNEAY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 FPLATESNILKELIKPPTILRSVVNSITGSSNVGDTLPTGQLSNIPWRRAGVKYTNNEAY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 FDVVEEIDAIIDKSGSTVFAEIQGVIDACIKLSGMPDLSLSFMNPRLLDDVSFHPCIRFK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 FDVVEEIDAIIDKSGSTVFAEIQGVIDACIKLSGMPDLSLSFMNPRLLDDVSFHPCIRFK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 RWESERVLSFIPPDGNFRLISYRVSSQNLVAIPVYVKHSISFKENSSCGRFDITIGPKQN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RWESERVLSFIPPDGNFRLISYRVSSQNLVAIPVYVKHSISFKENSSCGRFDITIGPKQN
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 MGKTIEGITVTVHMPKVVLNMNLTPTQGSYTFDPVTKVLTWDVGKITPQKLPSLKGLVNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MGKTIEGITVTVHMPKVVLNMNLTPTQGSYTFDPVTKVLTWDVGKITPQKLPSLKGLVNL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410        
pF1KB3 QSGAPKPEENPSLNIQFKIQQLAISGLKVNRLDMYGEKYKPFKGVKYVTKAGKFQVRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 QSGAPKPEENPSLNIQFKIQQLAISGLKVNRLDMYGEKYKPFKGVKYVTKAGKFQVRT
              370       380       390       400       410        

>>CCDS6125.1 AP3M2 gene_id:10947|Hs108|chr8               (418 aa)
 initn: 2448 init1: 2448 opt: 2448  Z-score: 3014.7  bits: 566.8 E(32554): 1.3e-161
Smith-Waterman score: 2448; 84.2% identity (96.9% similar) in 418 aa overlap (1-418:1-418)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MIHSLFLINCSGDIFLEKHWKSVVSQSVCDYFFEAQEKAADVENVPPVISTPHHYLISIY
       ::::::::: :::::::::::::::.:::::::::::.:...::::::: ::::::.:.:
CCDS61 MIHSLFLINSSGDIFLEKHWKSVVSRSVCDYFFEAQERATEAENVPPVIPTPHHYLLSVY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 RDKLFFVSVIQTEVPPLFVIEFLHRVADTFQDYFGECSEAAIKDNVVIVYELLEEMLDNG
       : :.:::.::::::::::::::::::.:::::::: ::: .::::::.:::.::::::::
CCDS61 RHKIFFVAVIQTEVPPLFVIEFLHRVVDTFQDYFGVCSEPVIKDNVVVVYEVLEEMLDNG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 FPLATESNILKELIKPPTILRSVVNSITGSSNVGDTLPTGQLSNIPWRRAGVKYTNNEAY
       :::::::::::::::::::::.:::.::::.:::: ::::::: .::::.::::::::::
CCDS61 FPLATESNILKELIKPPTILRTVVNTITGSTNVGDQLPTGQLSVVPWRRTGVKYTNNEAY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 FDVVEEIDAIIDKSGSTVFAEIQGVIDACIKLSGMPDLSLSFMNPRLLDDVSFHPCIRFK
       :::.:::::::::::::. ::::::::::.::.:::::.:::::::::::::::::.:::
CCDS61 FDVIEEIDAIIDKSGSTITAEIQGVIDACVKLTGMPDLTLSFMNPRLLDDVSFHPCVRFK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 RWESERVLSFIPPDGNFRLISYRVSSQNLVAIPVYVKHSISFKENSSCGRFDITIGPKQN
       ::::::.::::::::::::.::.::.::::::::::::.:::...:: :::.::.::::.
CCDS61 RWESERILSFIPPDGNFRLLSYHVSAQNLVAIPVYVKHNISFRDSSSLGRFEITVGPKQT
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 MGKTIEGITVTVHMPKVVLNMNLTPTQGSYTFDPVTKVLTWDVGKITPQKLPSLKGLVNL
       :::::::.::: .::: ::::.:::.::..:::::::.:.::::::.::::::::: ..:
CCDS61 MGKTIEGVTVTSQMPKGVLNMSLTPSQGTHTFDPVTKMLSWDVGKINPQKLPSLKGTMSL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410        
pF1KB3 QSGAPKPEENPSLNIQFKIQQLAISGLKVNRLDMYGEKYKPFKGVKYVTKAGKFQVRT
       :.:: ::.:::..:.:::::::::::::::::::::::::::::.::.::::::::::
CCDS61 QAGASKPDENPTINLQFKIQQLAISGLKVNRLDMYGEKYKPFKGIKYMTKAGKFQVRT
              370       380       390       400       410        

>>CCDS77234.1 AP1M2 gene_id:10053|Hs108|chr19             (425 aa)
 initn: 522 init1: 190 opt: 527  Z-score: 649.7  bits: 129.2 E(32554): 7.2e-30
Smith-Waterman score: 699; 29.7% identity (64.1% similar) in 437 aa overlap (4-418:5-424)

                10        20        30        40        50         
pF1KB3  MIHSLFLINCSGDIFLEKHWKSVVSQSVCDYFFEAQEKAADVENVPPVISTPHHYLISI
           ..:... .:  .. ...:. :..:  ..:.    .  .   . :..:  . ... :
CCDS77 MSASAVFILDVKGKPLISRNYKGDVAMSKIEHFMPLLVQREEEGALAPLLSHGQVHFLWI
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB3 YRDKLFFVSVIQTEVPPLFVIEFLHRVADTFQDYFGECSEAAIKDNVVIVYELLEEMLDN
        ...:..:.. . ..   .:  ::... ..: .:: :  : .:.:: :::::::.:..: 
CCDS77 KHSNLYLVATTSKNANASLVYSFLYKTIEVFCEYFKELEEESIRDNFVIVYELLDELMDF
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140        150       160       170        
pF1KB3 GFPLATESNILKELIKPPTILRSVVNSI-TGSSNVGDTLPTGQLSNIPWRRAGVKYTNNE
       ::: .:.:.::.: :   .      :.. ::.: :    :    . . ::  :.:: .::
CCDS77 GFPQTTDSKILQEYITQQS------NKLETGKSRV----PPTVTNAVSWRSEGIKYKKNE
              130             140           150       160       170

      180       190       200       210       220                  
pF1KB3 AYFDVVEEIDAIIDKSGSTVFAEIQGVIDACIKLSGMPDLSLSFMNPRLL----------
       ...::.: .. ... .::....:: :.:   . :::::.: :. .: :.:          
CCDS77 VFIDVIESVNLLVNANGSVLLSEIVGTIKLKVFLSGMPELRLG-LNDRVLFELTGLSGSK
              180       190       200       210        220         

            230       240       250       260       270       280  
pF1KB3 ------DDVSFHPCIRFKRWESERVLSFIPPDGNFRLISYRVSSQNLVAIPVYVKHSISF
             .::.:: :.:..:....:..:::::::.:.:.:::.:.:  :   ....  :  
CCDS77 NKSVELEDVKFHQCVRLSRFDNDRTISFIPPDGDFELMSYRLSTQ--VKPLIWIESVI--
     230       240       250       260       270         280       

            290       300         310       320       330       340
pF1KB3 KENSSCGRFDITIGPKQNMGK--TIEGITVTVHMPKVVLNMNLTPTQGSYTFDPVTKVLT
        :. : .: .: .  : .. :  . .:. ..: .:. . .  .  . ::  . :  .:. 
CCDS77 -EKFSHSRVEIMVKAKGQFKKQSVANGVEISVPVPSDADSPRFKTSVGSAKYVPERNVVI
          290       300       310       320       330       340    

              350       360       370        380       390         
pF1KB3 WDVGKITPQKLPSLKGLVNLQSGAPKPEEN-PSLNIQFKIQQLAISGLKVNRLDMYGEK-
       :.. ..   :   ...  .: :   .  :. : ....:.:  ...::..:  . .  :: 
CCDS77 WSIKSFPGGKEYLMRAHFGLPSVEKEEVEGRPPIGVKFEIPYFTVSGIQVRYMKII-EKS
          350       360       370       380       390       400    

       400       410         
pF1KB3 -YKPFKGVKYVTKAGKFQVRT 
        :. .  :.:.:..: .:.:: 
CCDS77 GYQALPWVRYITQSGDYQLRTS
           410       420     

>>CCDS45964.1 AP1M2 gene_id:10053|Hs108|chr19             (423 aa)
 initn: 362 init1: 190 opt: 513  Z-score: 632.5  bits: 126.0 E(32554): 6.6e-29
Smith-Waterman score: 703; 29.9% identity (64.4% similar) in 435 aa overlap (4-418:5-422)

                10        20        30        40        50         
pF1KB3  MIHSLFLINCSGDIFLEKHWKSVVSQSVCDYFFEAQEKAADVENVPPVISTPHHYLISI
           ..:... .:  .. ...:. :..:  ..:.    .  .   . :..:  . ... :
CCDS45 MSASAVFILDVKGKPLISRNYKGDVAMSKIEHFMPLLVQREEEGALAPLLSHGQVHFLWI
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB3 YRDKLFFVSVIQTEVPPLFVIEFLHRVADTFQDYFGECSEAAIKDNVVIVYELLEEMLDN
        ...:..:.. . ..   .:  ::... ..: .:: :  : .:.:: :::::::.:..: 
CCDS45 KHSNLYLVATTSKNANASLVYSFLYKTIEVFCEYFKELEEESIRDNFVIVYELLDELMDF
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140        150       160       170        
pF1KB3 GFPLATESNILKELIKPPTILRSVVNSI-TGSSNVGDTLPTGQLSNIPWRRAGVKYTNNE
       ::: .:.:.::.: :   .      :.. ::.: :    :    . . ::  :.:: .::
CCDS45 GFPQTTDSKILQEYITQQS------NKLETGKSRV----PPTVTNAVSWRSEGIKYKKNE
              130             140           150       160       170

      180       190       200       210       220                  
pF1KB3 AYFDVVEEIDAIIDKSGSTVFAEIQGVIDACIKLSGMPDLSLSFMNPRLL----------
       ...::.: .. ... .::....:: :.:   . :::::.: :. .: :.:          
CCDS45 VFIDVIESVNLLVNANGSVLLSEIVGTIKLKVFLSGMPELRLG-LNDRVLFELTGRSKNK
              180       190       200       210        220         

          230       240       250       260       270       280    
pF1KB3 ----DDVSFHPCIRFKRWESERVLSFIPPDGNFRLISYRVSSQNLVAIPVYVKHSISFKE
           .::.:: :.:..:....:..:::::::.:.:.:::.:.:  :   ....  :   :
CCDS45 SVELEDVKFHQCVRLSRFDNDRTISFIPPDGDFELMSYRLSTQ--VKPLIWIESVI---E
     230       240       250       260       270         280       

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pF1KB3 NSSCGRFDITIGPKQNMGK--TIEGITVTVHMPKVVLNMNLTPTQGSYTFDPVTKVLTWD
       . : .: .: .  : .. :  . .:. ..: .:. . .  .  . ::  . :  .:. :.
CCDS45 KFSHSRVEIMVKAKGQFKKQSVANGVEISVPVPSDADSPRFKTSVGSAKYVPERNVVIWS
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pF1KB3 VGKITPQKLPSLKGLVNLQSGAPKPEEN-PSLNIQFKIQQLAISGLKVNRLDMYGEK--Y
       . ..   :   ...  .: :   .  :. : ....:.:  ...::..:  . .  ::  :
CCDS45 IKSFPGGKEYLMRAHFGLPSVEKEEVEGRPPIGVKFEIPYFTVSGIQVRYMKII-EKSGY
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pF1KB3 KPFKGVKYVTKAGKFQVRT 
       . .  :.:.:..: .:.:: 
CCDS45 QALPWVRYITQSGDYQLRTS
           410       420   

>>CCDS12342.1 AP1M1 gene_id:8907|Hs108|chr19              (423 aa)
 initn: 361 init1: 193 opt: 482  Z-score: 594.3  bits: 119.0 E(32554): 8.8e-27
Smith-Waterman score: 655; 28.6% identity (63.4% similar) in 437 aa overlap (4-418:5-422)

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           ...... .: ... ..... :..:  ..:.    .  .   . :...     .. :
CCDS12 MSASAVYVLDLKGKVLICRNYRGDVDMSEVEHFMPILMEKEEEGMLSPILAHGGVRFMWI
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pF1KB3 YRDKLFFVSVIQTEVPPLFVIEFLHRVADTFQDYFGECSEAAIKDNVVIVYELLEEMLDN
        ...:..:.. . ..   .:. ::..:...:..:: :  : .:.:: ::.::::.:..: 
CCDS12 KHNNLYLVATSKKNACVSLVFSFLYKVVQVFSEYFKELEEESIRDNFVIIYELLDELMDF
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pF1KB3 GFPLATESNILKELIKPPTILRSVVNSITGSS-NVGDTLPTGQLSN-IPWRRAGVKYTNN
       :.: .:.:.::.: :           .  : . ..:   : . ..: . ::  :.:: .:
CCDS12 GYPQTTDSKILQEYI-----------TQEGHKLETGAPRPPATVTNAVSWRSEGIKYRKN
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pF1KB3 EAYFDVVEEIDAIIDKSGSTVFAEIQGVIDACIKLSGMPDLSLSFMNPRLLD--------
       :...::.: .. ... .:... .:: : :   . :::::.: :.. .  :.:        
CCDS12 EVFLDVIESVNLLVSANGNVLRSEIVGSIKMRVFLSGMPELRLGLNDKVLFDNTGRGKSK
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pF1KB3 -----DVSFHPCIRFKRWESERVLSFIPPDGNFRLISYRVSSQNLVAIPVYVKHSISFKE
            ::.:: :.:..:.:..:..:::::::.:.:.:::....  :   ....  :   :
CCDS12 SVELEDVKFHQCVRLSRFENDRTISFIPPDGEFELMSYRLNTH--VKPLIWIESVI---E
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pF1KB3 NSSCGRFDITIGPKQNMGKTIEGITVTVHMPKVVLNMNLTP----TQGSYTFDPVTKVLT
       . : .:..  :  :... .   . .: .:.:  : :   .:    : ::  . : .. ..
CCDS12 KHSHSRIEYMIKAKSQFKRRSTANNVEIHIP--VPNDADSPKFKTTVGSVKWVPENSEIV
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pF1KB3 WDVGKITPQKLPSLKGLVNLQS-GAPKPEENPSLNIQFKIQQLAISGLKVNRLDMYGEK-
       :.. ..   :   ...  .: :  :   : .: ....:.:  .. ::..:  : .  :: 
CCDS12 WSIKSFPGGKEYLMRAHFGLPSVEAEDKEGKPPISVKFEIPYFTTSGIQVRYLKII-EKS
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pF1KB3 -YKPFKGVKYVTKAGKFQVRT 
        :. .  :.:.:. : .:.:: 
CCDS12 GYQALPWVRYITQNGDYQLRTQ
             410       420   

>>CCDS43177.1 AP2M1 gene_id:1173|Hs108|chr3               (435 aa)
 initn: 490 init1: 178 opt: 383  Z-score: 472.3  bits: 96.4 E(32554): 5.5e-20
Smith-Waterman score: 591; 26.2% identity (61.7% similar) in 447 aa overlap (1-417:1-434)

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pF1KB3 MIHSLFLINCSGDIFLEKHWKSVVSQSVCDYFFEAQEKAADVENVPPVISTPHHYLISIY
       :: .::. : .:.... . ... ..... : : ...   :  .   :: .  .  .. . 
CCDS43 MIGGLFIYNHKGEVLISRVYRDDIGRNAVDAF-RVNVIHARQQVRSPVTNIARTSFFHVK
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pF1KB3 RDKLFFVSVIQTEVPPLFVIEFLHRVADTFQDYFGECSEAAIKDNVVIVYELLEEMLDNG
       :.......: . .:   .:.:::... :..  :::. ::  ::.: :..::::.:.:: :
CCDS43 RSNIWLAAVTKQNVNAAMVFEFLYKMCDVMAAYFGKISEENIKNNFVLIYELLDEILDFG
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pF1KB3 FPLATESNILKELIKPPTILRSVVNSITGSSNVGDTLPTGQLSNIPWRRAGVKYTNNEAY
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CCDS43 YPQNSETGALKTFITQQGI-KSQHQTKEEQSQITSQV-TGQ---IGWRREGIKYRRNELF
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pF1KB3 FDVVEEIDAIIDKSGSTVFAEIQGVIDACIKLSGMPDLSLSFMNPRL-------------
       .::.: .. ... .:... :...: .     :::::. ... :: ..             
CCDS43 LDVLESVNLLMSPQGQVLSAHVSGRVVMKSYLSGMPECKFG-MNDKIVIEKQGKGTADET
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CCDS43 SKSGKQSIAIDDCTFHQCVRLSKFDSERSISFIPPDGEFELMRYRTTKD--IILPFRV--
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pF1KB3 SISFKENSSCGRFDITIGPKQNMGKTI--EGITVTVHMPKVVLNMNLTPTQGSYTFDPVT
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CCDS43 -IPLVREVGRTKLEVKVVIKSNFKPSLLAQKIEVRIPTPLNTSGVQVICMKGKAKYKASE
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pF1KB3 KVLTWDVGKITPQKLPSLKGLVNL-QSGAPKPEENPSLNIQFKIQQLAISGLKVNRLDMY
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CCDS43 NAIVWKIKRMAGMKESQISAEIELLPTNDKKKWARPPISMNFEVP-FAPSGLKVRYLKVF
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pF1KB3 GEK-----YKPFKGVKYVTKAGKFQVRT
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CCDS43 EPKLNYSDHDVIKWVRYIGRSGIYETRC
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>>CCDS43178.1 AP2M1 gene_id:1173|Hs108|chr3               (433 aa)
 initn: 495 init1: 183 opt: 376  Z-score: 463.7  bits: 94.8 E(32554): 1.7e-19
Smith-Waterman score: 584; 26.2% identity (61.7% similar) in 447 aa overlap (1-417:1-432)

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pF1KB3 MIHSLFLINCSGDIFLEKHWKSVVSQSVCDYFFEAQEKAADVENVPPVISTPHHYLISIY
       :: .::. : .:.... . ... ..... : : ...   :  .   :: .  .  .. . 
CCDS43 MIGGLFIYNHKGEVLISRVYRDDIGRNAVDAF-RVNVIHARQQVRSPVTNIARTSFFHVK
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pF1KB3 RDKLFFVSVIQTEVPPLFVIEFLHRVADTFQDYFGECSEAAIKDNVVIVYELLEEMLDNG
       :.......: . .:   .:.:::... :..  :::. ::  ::.: :..::::.:.:: :
CCDS43 RSNIWLAAVTKQNVNAAMVFEFLYKMCDVMAAYFGKISEENIKNNFVLIYELLDEILDFG
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pF1KB3 FPLATESNILKELIKPPTILRSVVNSITGSSNVGDTLPTGQLSNIPWRRAGVKYTNNEAY
       .:  .:.. :: .:    : .:  ..   .:.. . . :::   : ::: :.::  :: .
CCDS43 YPQNSETGALKTFITQQGI-KS--QTKEEQSQITSQV-TGQ---IGWRREGIKYRRNELF
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pF1KB3 FDVVEEIDAIIDKSGSTVFAEIQGVIDACIKLSGMPDLSLSFMNPRL-------------
       .::.: .. ... .:... :...: .     :::::. ... :: ..             
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CCDS43 SKSGKQSIAIDDCTFHQCVRLSKFDSERSISFIPPDGEFELMRYRTTKD--IILPFRV--
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pF1KB3 SISFKENSSCGRFDITIGPKQNMGKTI--EGITVTVHMPKVVLNMNLTPTQGSYTFDPVT
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CCDS43 -IPLVREVGRTKLEVKVVIKSNFKPSLLAQKIEVRIPTPLNTSGVQVICMKGKAKYKASE
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pF1KB3 KVLTWDVGKITPQKLPSLKGLVNL-QSGAPKPEENPSLNIQFKIQQLAISGLKVNRLDMY
       ....: . ... .:  .... ..:  ..  :    : ....:..  .: :::::  : ..
CCDS43 NAIVWKIKRMAGMKESQISAEIELLPTNDKKKWARPPISMNFEVP-FAPSGLKVRYLKVF
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pF1KB3 GEK-----YKPFKGVKYVTKAGKFQVRT
         :     .  .: :.:. ..: ...: 
CCDS43 EPKLNYSDHDVIKWVRYIGRSGIYETRC
         410       420       430   

>>CCDS82880.1 AP2M1 gene_id:1173|Hs108|chr3               (460 aa)
 initn: 490 init1: 178 opt: 345  Z-score: 425.1  bits: 87.8 E(32554): 2.3e-17
Smith-Waterman score: 553; 26.9% identity (61.6% similar) in 401 aa overlap (47-417:71-459)

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pF1KB3 EKHWKSVVSQSVCDYFFEAQEKAADVENVPPVISTPHHYLISIYRDKLFFVSVIQTEVPP
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CCDS82 FPGEWLEANRRNAVDAFRVNVIHARQQVRSPVTNIARTSFFHVKRSNIWLAAVTKQNVNA
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pF1KB3 LFVIEFLHRVADTFQDYFGECSEAAIKDNVVIVYELLEEMLDNGFPLATESNILKELIKP
        .:.:::... :..  :::. ::  ::.: :..::::.:.:: :.:  .:.. :: .:  
CCDS82 AMVFEFLYKMCDVMAAYFGKISEENIKNNFVLIYELLDEILDFGYPQNSETGALKTFITQ
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pF1KB3 PTILRSVVNSITGSSNVGDTLPTGQLSNIPWRRAGVKYTNNEAYFDVVEEIDAIIDKSGS
         : .:  ..   .:.. . . :::   : ::: :.::  :: ..::.: .. ... .:.
CCDS82 QGI-KSQHQTKEEQSQITSQV-TGQ---IGWRREGIKYRRNELFLDVLESVNLLMSPQGQ
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pF1KB3 TVFAEIQGVIDACIKLSGMPDLSLSFMNPRL----------------------LDDVSFH
       .. :...: .     :::::. ... :: ..                      .:: .::
CCDS82 VLSAHVSGRVVMKSYLSGMPECKFG-MNDKIVIEKQGKGTADETSKSGKQSIAIDDCTFH
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pF1KB3 PCIRFKRWESERVLSFIPPDGNFRLISYRVSSQNLVAIPVYVKHSISFKENSSCGRFDIT
        :.:.....::: .:::::::.:.:. ::....  . .:  :   : . .. .  .... 
CCDS82 QCVRLSKFDSERSISFIPPDGEFELMRYRTTKD--IILPFRV---IPLVREVGRTKLEVK
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pF1KB3 IGPKQNMGKTI--EGITVTVHMPKVVLNMNLTPTQGSYTFDPVTKVLTWDVGKITPQKLP
       .  :.:.  ..  . : : .  :  . ....   .:.  .    ....: . ... .:  
CCDS82 VVIKSNFKPSLLAQKIEVRIPTPLNTSGVQVICMKGKAKYKASENAIVWKIKRMAGMKES
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pF1KB3 SLKGLVNL-QSGAPKPEENPSLNIQFKIQQLAISGLKVNRLDMYGEK-----YKPFKGVK
       .... ..:  ..  :    : ....:..  .: :::::  : ..  :     .  .: :.
CCDS82 QISAEIELLPTNDKKKWARPPISMNFEVP-FAPSGLKVRYLKVFEPKLNYSDHDVIKWVR
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        410        
pF1KB3 YVTKAGKFQVRT
       :. ..: ...: 
CCDS82 YIGRSGIYETRC
      450       460

>>CCDS46008.1 AP1M1 gene_id:8907|Hs108|chr19              (435 aa)
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pF1KB3  MIHSLFLINCSGDIFLEKHWKSVVSQSVCDYFFEAQEKAADVENVPPVISTPHHYLISI
           ...... .: ... ..... :..:  ..:.    .  .   . :...     .. :
CCDS46 MSASAVYVLDLKGKVLICRNYRGDVDMSEVEHFMPILMEKEEEGMLSPILAHGGVRFMWI
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      60        70        80        90       100       110         
pF1KB3 YRDKLFFVSVIQTEVPPLFVIEFLHRVADTFQDYFGECSEAAIKDNVVIVYELLEEMLDN
        ...:..:.. . ..   .:. ::..:...:..:: :  : .:.:: ::.::::.:..: 
CCDS46 KHNNLYLVATSKKNACVSLVFSFLYKVVQVFSEYFKELEEESIRDNFVIIYELLDELMDF
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pF1KB3 GFPLATESNILKELIKPPTILRSVVNSITGSS-NVGDTLPTGQLSN-IPWRRAGVKYTNN
       :.: .:.:.::.: :           .  : . ..:   : . ..: . ::  :.:: .:
CCDS46 GYPQTTDSKILQEYI-----------TQEGHKLETGAPRPPATVTNAVSWRSEGIKYRKN
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pF1KB3 EAYFDVVEEIDAI------------IDKSGSTVFAEIQGVIDACIKLSGMPDLSLSFMNP
       :...::.: .. .            .. .:... .:: : :   . :::::.: :.. . 
CCDS46 EVFLDVIESVNLLGKYPGVGWLGHTVSANGNVLRSEIVGSIKMRVFLSGMPELRLGLNDK
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pF1KB3 RLLD-------------DVSFHPCIRFKRWESERVLSFIPPDGNFRLISYRVSSQNLVAI
        :.:             ::.:: :.:..:.:..:..:::::::.:.:.:::....  :  
CCDS46 VLFDNTGRGKSKSVELEDVKFHQCVRLSRFENDRTISFIPPDGEFELMSYRLNTH--VKP
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pF1KB3 PVYVKHSISFKENSSCGRFDITIGPKQNMGKTIEGITVTVHMPKVVLNMNLTP----TQG
        ....  :   :. : .:..  :  :... .   . .: .:.:  : :   .:    : :
CCDS46 LIWIESVI---EKHSHSRIEYMIKAKSQFKRRSTANNVEIHIP--VPNDADSPKFKTTVG
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pF1KB3 SYTFDPVTKVLTWDVGKITPQKLPSLKGLVNLQS-GAPKPEENPSLNIQFKIQQLAISGL
       :  . : .. ..:.. ..   :   ...  .: :  :   : .: ....:.:  .. ::.
CCDS46 SVKWVPENSEIVWSIKSFPGGKEYLMRAHFGLPSVEAEDKEGKPPISVKFEIPYFTTSGI
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pF1KB3 KVNRLDMYGEK--YKPFKGVKYVTKAGKFQVRT 
       .:  : .  ::  :. .  :.:.:. : .:.:: 
CCDS46 QVRYLKII-EKSGYQALPWVRYITQNGDYQLRTQ
            410        420       430     

>>CCDS5685.1 AP4M1 gene_id:9179|Hs108|chr7                (453 aa)
 initn: 350 init1: 181 opt: 271  Z-score: 334.1  bits: 70.9 E(32554): 2.7e-12
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pF1KB3 MIHSLFLINCSGDIFLEKHWKSVVS-QSVCDYFFEAQEKAADVENVPPVISTPH-HYLIS
       :: ..:... .:: .. : ...  . ..: . :..        :.  ::.   : ...: 
CCDS56 MISQFFILSSKGDPLIYKDFRGDSGGRDVAELFYRKLTGLPGDES--PVVMHHHGRHFIH
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pF1KB3 IYRDKLFFVSVIQTEVPPLFVIEFLHRVADTFQDYFGECSEAAIKDNVVIVYELLEEMLD
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CCDS56 IRHSGLYLVVTTSENVSPFSLLELLSRLATLLGDYCGSLGEGTISRNVALVYELLDEVLD
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pF1KB3 NGFPLATESNILKELIKPPTILRSVVNSITGSSNVGDTLPTGQLSNIPWRRAGVKYT---
        :.  .: ...:...:.  ... .   :.   :.::      : :..    :. . .   
CCDS56 YGYVQTTSTEMLRNFIQTEAVVSKPF-SLFDLSSVGLFGAETQQSKVAPSSAASRPVLSS
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pF1KB3 ------NNEAYFDVVEEIDAIIDKSGSTVFAEIQGVIDACIKLSGMPDLSLSF-------
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CCDS56 RSDQSQKNEVFLDVVERLSVLIASNGSLLKVDVQGEIRLKSFLPSGSEMRIGLTEEFCVG
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pF1KB3 ------MNPRL-LDDVSFHPCIRFKRWESERVLSFIPPDGNFRLISYRVSSQNLVAIPVY
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CCDS56 KSELRGYGPGIRVDEVSFHSSVNLDEFESHRILRLQPPQGELTVMRYQLSDDLPSPLPFR
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pF1KB3 VKHSISFKENSSCGRFDITIGPKQNMGKTIEGITVTVHMP--KVVLNMNLTPTQGSYTFD
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CCDS56 LFPSVQWDRGS--GRLQVYLKLRCDLLSKSQALNVRLHLPLPRGVVSLSQELSSPEQKAE
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pF1KB3 PVTKVLTWDVGKITPQKLPSLKGLVNLQSGAPKPEENPSLNIQFKIQQLAISGLKVNRLD
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CCDS56 LAEGALRWDLPRV--QGGSQLSGL--FQMDVPGPPGPPSHGLSTSASPLGLGPASLSFEL
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pF1KB3 MYGEKYKPFKGVKYVTKAGKFQVRT                 
                                                 
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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