Result of FASTA (omim) for pF1KB3292
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3292, 559 aa
  1>>>pF1KB3292 559 - 559 aa - 559 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6673+/-0.000433; mu= 16.5229+/- 0.027
 mean_var=73.1307+/-14.590, 0's: 0 Z-trim(110.6): 111  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.149977
 statistics sampled from 18878 (18989) to 18878 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.584), E-opt: 0.2 (0.223), width:  16
 Scan time:  9.610

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_065207 (OMIM: 602273) polypeptide N-acetylgalac ( 559) 3856 844.2       0
XP_016881181 (OMIM: 602273) PREDICTED: polypeptide ( 559) 3856 844.2       0
XP_005258296 (OMIM: 602273) PREDICTED: polypeptide ( 559) 3856 844.2       0
NP_443149 (OMIM: 608369) polypeptide N-acetylgalac ( 556) 3334 731.3 1.9e-210
XP_016858750 (OMIM: 608369) PREDICTED: polypeptide ( 556) 3334 731.3 1.9e-210
XP_011508839 (OMIM: 608369) PREDICTED: polypeptide ( 571) 3225 707.7 2.5e-203
XP_016858748 (OMIM: 608369) PREDICTED: polypeptide ( 571) 3225 707.7 2.5e-203
XP_016858747 (OMIM: 608369) PREDICTED: polypeptide ( 571) 3225 707.7 2.5e-203
XP_016858749 (OMIM: 608369) PREDICTED: polypeptide ( 561) 3102 681.1 2.5e-195
NP_001288556 (OMIM: 608369) polypeptide N-acetylga ( 561) 3102 681.1 2.5e-195
XP_016858752 (OMIM: 608369) PREDICTED: polypeptide ( 375) 2387 526.3 6.6e-149
XP_011508840 (OMIM: 608369) PREDICTED: polypeptide ( 390) 2278 502.7 8.5e-142
XP_016858751 (OMIM: 608369) PREDICTED: polypeptide ( 380) 2155 476.1 8.6e-134
NP_001278795 (OMIM: 602274) polypeptide N-acetylga ( 533) 1554 346.2 1.6e-94
NP_004472 (OMIM: 602274) polypeptide N-acetylgalac ( 571) 1554 346.2 1.7e-94
XP_016874234 (OMIM: 605148) PREDICTED: polypeptide ( 622) 1501 334.7 5.2e-91
XP_016874233 (OMIM: 605148) PREDICTED: polypeptide ( 622) 1501 334.7 5.2e-91
XP_005268664 (OMIM: 605148) PREDICTED: polypeptide ( 622) 1501 334.7 5.2e-91
NP_009141 (OMIM: 605148) polypeptide N-acetylgalac ( 622) 1501 334.7 5.2e-91
XP_011536124 (OMIM: 605148) PREDICTED: polypeptide ( 622) 1501 334.7 5.2e-91
XP_011536121 (OMIM: 605148) PREDICTED: polypeptide ( 622) 1501 334.7 5.2e-91
XP_006719277 (OMIM: 605148) PREDICTED: polypeptide ( 622) 1501 334.7 5.2e-91
NP_003765 (OMIM: 603565) polypeptide N-acetylgalac ( 578) 1491 332.5 2.2e-90
NP_078918 (OMIM: 608812,610290) polypeptide N-acet ( 581) 1446 322.8 1.9e-87
XP_011509231 (OMIM: 601756) PREDICTED: polypeptide ( 633) 1440 321.5 4.9e-87
XP_016859259 (OMIM: 601756) PREDICTED: polypeptide ( 633) 1440 321.5 4.9e-87
NP_004473 (OMIM: 601756) polypeptide N-acetylgalac ( 633) 1440 321.5 4.9e-87
XP_005246506 (OMIM: 601756) PREDICTED: polypeptide ( 633) 1440 321.5 4.9e-87
XP_016856454 (OMIM: 602274) PREDICTED: polypeptide ( 598) 1424 318.0 5.2e-86
XP_016856453 (OMIM: 602274) PREDICTED: polypeptide ( 605) 1424 318.1 5.2e-86
XP_016856452 (OMIM: 602274) PREDICTED: polypeptide ( 636) 1424 318.1 5.4e-86
XP_016856455 (OMIM: 602274) PREDICTED: polypeptide ( 569) 1418 316.7 1.2e-85
NP_055383 (OMIM: 615129) polypeptide N-acetylgalac ( 940) 1397 312.3 4.4e-84
XP_016870622 (OMIM: 608812,610290) PREDICTED: poly ( 497) 1386 309.8 1.3e-83
XP_011517320 (OMIM: 608812,610290) PREDICTED: poly ( 507) 1386 309.8 1.3e-83
XP_016858726 (OMIM: 615129) PREDICTED: polypeptide ( 956) 1389 310.6 1.5e-83
NP_001316024 (OMIM: 608225) polypeptide N-acetylga ( 517) 1361 304.4 5.8e-82
NP_001316025 (OMIM: 608225) polypeptide N-acetylga ( 532) 1361 304.4 5.9e-82
NP_001240756 (OMIM: 608225) polypeptide N-acetylga ( 532) 1361 304.4 5.9e-82
NP_078848 (OMIM: 608225) polypeptide N-acetylgalac ( 552) 1361 304.4 6.1e-82
XP_016860395 (OMIM: 608225) PREDICTED: polypeptide ( 563) 1361 304.4 6.2e-82
XP_006716147 (OMIM: 615130) PREDICTED: polypeptide ( 608) 1345 301.0 7.3e-81
XP_006716146 (OMIM: 615130) PREDICTED: polypeptide ( 608) 1345 301.0 7.3e-81
XP_006716145 (OMIM: 615130) PREDICTED: polypeptide ( 608) 1345 301.0 7.3e-81
NP_071370 (OMIM: 615130) polypeptide N-acetylgalac ( 608) 1345 301.0 7.3e-81
NP_001291443 (OMIM: 615130) polypeptide N-acetylga ( 527) 1332 298.1 4.6e-80
NP_938080 (OMIM: 608043) polypeptide N-acetylgalac ( 603) 1323 296.2   2e-79
NP_001240755 (OMIM: 608225) polypeptide N-acetylga ( 557) 1297 290.6 9.1e-78
NP_001030017 (OMIM: 615138) polypeptide N-acetylga ( 601) 1289 288.8 3.2e-77
XP_016863733 (OMIM: 615138) PREDICTED: polypeptide ( 609) 1289 288.8 3.3e-77


>>NP_065207 (OMIM: 602273) polypeptide N-acetylgalactosa  (559 aa)
 initn: 3856 init1: 3856 opt: 3856  Z-score: 4509.5  bits: 844.2 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 3856; 100.0% identity (100.0% similar) in 559 aa overlap (1-559:1-559)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MRKFAYCKVVLATSLIWVLLDMFLLLYFSECNKCDEKKERGLPAGDVLEPVQKPHEGPGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 MRKFAYCKVVLATSLIWVLLDMFLLLYFSECNKCDEKKERGLPAGDVLEPVQKPHEGPGE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 MGKPVVIPKEDQEKMKEMFKINQFNLMASEMIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDNLPTTSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 MGKPVVIPKEDQEKMKEMFKINQFNLMASEMIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDNLPTTSV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 VIVFHNEAWSTLLRTVHSVINRSPRHMIEEIVLVDDASERDFLKRPLESYVKKLKVPVHV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 VIVFHNEAWSTLLRTVHSVINRSPRHMIEEIVLVDDASERDFLKRPLESYVKKLKVPVHV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 IRMEQRSGLIRARLKGAAVSKGQVITFLDAHCECTVGWLEPLLARIKHDRRTVVCPIIDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 IRMEQRSGLIRARLKGAAVSKGQVITFLDAHCECTVGWLEPLLARIKHDRRTVVCPIIDV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 ISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSIDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 ISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSIDR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 DYFQEIGTYDAGMDIWGGENLEISFRIWQCGGTLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 DYFQEIGTYDAGMDIWGGENLEISFRIWQCGGTLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTGQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 IINKNNRRLAEVWMDEFKNFFYIISPGVTKVDYGDISSRVGLRHKLQCKPFSWYLENIYP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 IINKNNRRLAEVWMDEFKNFFYIISPGVTKVDYGDISSRVGLRHKLQCKPFSWYLENIYP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 DSQIPRHYFSLGEIRNVETNQCLDNMARKENEKVGIFNCHGMGGNQVFSYTANKEIRTDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 DSQIPRHYFSLGEIRNVETNQCLDNMARKENEKVGIFNCHGMGGNQVFSYTANKEIRTDD
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 LCLDVSKLNGPVTMLKCHHLKGNQLWEYDPVKLTLQHVNSNQCLDKATEEDSQVPSIRDC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 LCLDVSKLNGPVTMLKCHHLKGNQLWEYDPVKLTLQHVNSNQCLDKATEEDSQVPSIRDC
              490       500       510       520       530       540

              550         
pF1KB3 NGSRSQQWLLRNVTLPEIF
       :::::::::::::::::::
NP_065 NGSRSQQWLLRNVTLPEIF
              550         

>>XP_016881181 (OMIM: 602273) PREDICTED: polypeptide N-a  (559 aa)
 initn: 3856 init1: 3856 opt: 3856  Z-score: 4509.5  bits: 844.2 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 3856; 100.0% identity (100.0% similar) in 559 aa overlap (1-559:1-559)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MRKFAYCKVVLATSLIWVLLDMFLLLYFSECNKCDEKKERGLPAGDVLEPVQKPHEGPGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MRKFAYCKVVLATSLIWVLLDMFLLLYFSECNKCDEKKERGLPAGDVLEPVQKPHEGPGE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 MGKPVVIPKEDQEKMKEMFKINQFNLMASEMIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDNLPTTSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MGKPVVIPKEDQEKMKEMFKINQFNLMASEMIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDNLPTTSV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 VIVFHNEAWSTLLRTVHSVINRSPRHMIEEIVLVDDASERDFLKRPLESYVKKLKVPVHV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VIVFHNEAWSTLLRTVHSVINRSPRHMIEEIVLVDDASERDFLKRPLESYVKKLKVPVHV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 IRMEQRSGLIRARLKGAAVSKGQVITFLDAHCECTVGWLEPLLARIKHDRRTVVCPIIDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IRMEQRSGLIRARLKGAAVSKGQVITFLDAHCECTVGWLEPLLARIKHDRRTVVCPIIDV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 ISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSIDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSIDR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 DYFQEIGTYDAGMDIWGGENLEISFRIWQCGGTLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DYFQEIGTYDAGMDIWGGENLEISFRIWQCGGTLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTGQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 IINKNNRRLAEVWMDEFKNFFYIISPGVTKVDYGDISSRVGLRHKLQCKPFSWYLENIYP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IINKNNRRLAEVWMDEFKNFFYIISPGVTKVDYGDISSRVGLRHKLQCKPFSWYLENIYP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 DSQIPRHYFSLGEIRNVETNQCLDNMARKENEKVGIFNCHGMGGNQVFSYTANKEIRTDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DSQIPRHYFSLGEIRNVETNQCLDNMARKENEKVGIFNCHGMGGNQVFSYTANKEIRTDD
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 LCLDVSKLNGPVTMLKCHHLKGNQLWEYDPVKLTLQHVNSNQCLDKATEEDSQVPSIRDC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LCLDVSKLNGPVTMLKCHHLKGNQLWEYDPVKLTLQHVNSNQCLDKATEEDSQVPSIRDC
              490       500       510       520       530       540

              550         
pF1KB3 NGSRSQQWLLRNVTLPEIF
       :::::::::::::::::::
XP_016 NGSRSQQWLLRNVTLPEIF
              550         

>>XP_005258296 (OMIM: 602273) PREDICTED: polypeptide N-a  (559 aa)
 initn: 3856 init1: 3856 opt: 3856  Z-score: 4509.5  bits: 844.2 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 3856; 100.0% identity (100.0% similar) in 559 aa overlap (1-559:1-559)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MRKFAYCKVVLATSLIWVLLDMFLLLYFSECNKCDEKKERGLPAGDVLEPVQKPHEGPGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MRKFAYCKVVLATSLIWVLLDMFLLLYFSECNKCDEKKERGLPAGDVLEPVQKPHEGPGE
               10        20        30        40        50        60

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pF1KB3 MGKPVVIPKEDQEKMKEMFKINQFNLMASEMIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDNLPTTSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MGKPVVIPKEDQEKMKEMFKINQFNLMASEMIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDNLPTTSV
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VIVFHNEAWSTLLRTVHSVINRSPRHMIEEIVLVDDASERDFLKRPLESYVKKLKVPVHV
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IINKNNRRLAEVWMDEFKNFFYIISPGVTKVDYGDISSRVGLRHKLQCKPFSWYLENIYP
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pF1KB3 DSQIPRHYFSLGEIRNVETNQCLDNMARKENEKVGIFNCHGMGGNQVFSYTANKEIRTDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DSQIPRHYFSLGEIRNVETNQCLDNMARKENEKVGIFNCHGMGGNQVFSYTANKEIRTDD
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pF1KB3 LCLDVSKLNGPVTMLKCHHLKGNQLWEYDPVKLTLQHVNSNQCLDKATEEDSQVPSIRDC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LCLDVSKLNGPVTMLKCHHLKGNQLWEYDPVKLTLQHVNSNQCLDKATEEDSQVPSIRDC
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              550         
pF1KB3 NGSRSQQWLLRNVTLPEIF
       :::::::::::::::::::
XP_005 NGSRSQQWLLRNVTLPEIF
              550         

>>NP_443149 (OMIM: 608369) polypeptide N-acetylgalactosa  (556 aa)
 initn: 3336 init1: 3097 opt: 3334  Z-score: 3899.2  bits: 731.3 E(85289): 1.9e-210
Smith-Waterman score: 3334; 84.7% identity (96.9% similar) in 556 aa overlap (1-555:1-554)

               10        20        30        40         50         
pF1KB3 MRKFAYCKVVLATSLIWVLLDMFLLLYFSECNKCDEKKERGL-PAGDVLEPVQKPHEGPG
       ::.:.::::::::::.:::.:.:::::::::::::.::::.: ::  ..  ... .::::
NP_443 MRRFVYCKVVLATSLMWVLVDVFLLLYFSECNKCDDKKERSLLPALRAV--ISRNQEGPG
               10        20        30        40          50        

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB3 EMGKPVVIPKEDQEKMKEMFKINQFNLMASEMIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDNLPTTS
       :::: :.:::.:::::::.:::::::::::..::::::::::::::::::::::.::.::
NP_443 EMGKAVLIPKDDQEKMKELFKINQFNLMASDLIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDELPNTS
       60        70        80        90       100       110        

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB3 VVIVFHNEAWSTLLRTVHSVINRSPRHMIEEIVLVDDASERDFLKRPLESYVKKLKVPVH
       :::::::::::::::::.:::::::.... :..::::::::::::  ::.:::.:.:::.
NP_443 VVIVFHNEAWSTLLRTVYSVINRSPHYLLSEVILVDDASERDFLKLTLENYVKNLEVPVK
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pF1KB3 VIRMEQRSGLIRARLKGAAVSKGQVITFLDAHCECTVGWLEPLLARIKHDRRTVVCPIID
       .::::.:::::::::.:::.::::::::::::::::.:::::::::::.::.::::::::
NP_443 IIRMEERSGLIRARLRGAAASKGQVITFLDAHCECTLGWLEPLLARIKEDRKTVVCPIID
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pF1KB3 VISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 VISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSID
      240       250       260       270       280       290        

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pF1KB3 RDYFQEIGTYDAGMDIWGGENLEISFRIWQCGGTLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTG
       :.::.::::::::::::::::::.:::::::::.::::::::::::::::::::::::::
NP_443 RNYFEEIGTYDAGMDIWGGENLEMSFRIWQCGGSLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTG
      300       310       320       330       340       350        

     360       370       380       390       400       410         
pF1KB3 QIINKNNRRLAEVWMDEFKNFFYIISPGVTKVDYGDISSRVGLRHKLQCKPFSWYLENIY
       ..:::::::::::::::::.:::::::::.::::::.: :  ::..:.::::::::::::
NP_443 HVINKNNRRLAEVWMDEFKDFFYIISPGVVKVDYGDVSVRKTLRENLKCKPFSWYLENIY
      360       370       380       390       400       410        

     420       430       440       450       460       470         
pF1KB3 PDSQIPRHYFSLGEIRNVETNQCLDNMARKENEKVGIFNCHGMGGNQVFSYTANKEIRTD
       :::::::.:.:::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.::::::
NP_443 PDSQIPRRYYSLGEIRNVETNQCLDNMGRKENEKVGIFNCHGMGGNQVFSYTADKEIRTD
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pF1KB3 DLCLDVSKLNGPVTMLKCHHLKGNQLWEYDPVKLTLQHVNSNQCLDKATEEDSQVPSIRD
       :::::::.::::: ::::::..::::::::  .:::.:::::::::. .:::..::...:
NP_443 DLCLDVSRLNGPVIMLKCHHMRGNQLWEYDAERLTLRHVNSNQCLDEPSEEDKMVPTMQD
      480       490       500       510       520       530        

     540       550         
pF1KB3 CNGSRSQQWLLRNVTLPEIF
       :.:::::::::::.::    
NP_443 CSGSRSQQWLLRNMTLGT  
      540       550        

>>XP_016858750 (OMIM: 608369) PREDICTED: polypeptide N-a  (556 aa)
 initn: 3336 init1: 3097 opt: 3334  Z-score: 3899.2  bits: 731.3 E(85289): 1.9e-210
Smith-Waterman score: 3334; 84.7% identity (96.9% similar) in 556 aa overlap (1-555:1-554)

               10        20        30        40         50         
pF1KB3 MRKFAYCKVVLATSLIWVLLDMFLLLYFSECNKCDEKKERGL-PAGDVLEPVQKPHEGPG
       ::.:.::::::::::.:::.:.:::::::::::::.::::.: ::  ..  ... .::::
XP_016 MRRFVYCKVVLATSLMWVLVDVFLLLYFSECNKCDDKKERSLLPALRAV--ISRNQEGPG
               10        20        30        40          50        

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB3 EMGKPVVIPKEDQEKMKEMFKINQFNLMASEMIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDNLPTTS
       :::: :.:::.:::::::.:::::::::::..::::::::::::::::::::::.::.::
XP_016 EMGKAVLIPKDDQEKMKELFKINQFNLMASDLIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDELPNTS
       60        70        80        90       100       110        

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB3 VVIVFHNEAWSTLLRTVHSVINRSPRHMIEEIVLVDDASERDFLKRPLESYVKKLKVPVH
       :::::::::::::::::.:::::::.... :..::::::::::::  ::.:::.:.:::.
XP_016 VVIVFHNEAWSTLLRTVYSVINRSPHYLLSEVILVDDASERDFLKLTLENYVKNLEVPVK
      120       130       140       150       160       170        

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB3 VIRMEQRSGLIRARLKGAAVSKGQVITFLDAHCECTVGWLEPLLARIKHDRRTVVCPIID
       .::::.:::::::::.:::.::::::::::::::::.:::::::::::.::.::::::::
XP_016 IIRMEERSGLIRARLRGAAASKGQVITFLDAHCECTLGWLEPLLARIKEDRKTVVCPIID
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     240       250       260       270       280       290         
pF1KB3 VISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSID
      240       250       260       270       280       290        

     300       310       320       330       340       350         
pF1KB3 RDYFQEIGTYDAGMDIWGGENLEISFRIWQCGGTLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTG
       :.::.::::::::::::::::::.:::::::::.::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RNYFEEIGTYDAGMDIWGGENLEMSFRIWQCGGSLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTG
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     360       370       380       390       400       410         
pF1KB3 QIINKNNRRLAEVWMDEFKNFFYIISPGVTKVDYGDISSRVGLRHKLQCKPFSWYLENIY
       ..:::::::::::::::::.:::::::::.::::::.: :  ::..:.::::::::::::
XP_016 HVINKNNRRLAEVWMDEFKDFFYIISPGVVKVDYGDVSVRKTLRENLKCKPFSWYLENIY
      360       370       380       390       400       410        

     420       430       440       450       460       470         
pF1KB3 PDSQIPRHYFSLGEIRNVETNQCLDNMARKENEKVGIFNCHGMGGNQVFSYTANKEIRTD
       :::::::.:.:::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.::::::
XP_016 PDSQIPRRYYSLGEIRNVETNQCLDNMGRKENEKVGIFNCHGMGGNQVFSYTADKEIRTD
      420       430       440       450       460       470        

     480       490       500       510       520       530         
pF1KB3 DLCLDVSKLNGPVTMLKCHHLKGNQLWEYDPVKLTLQHVNSNQCLDKATEEDSQVPSIRD
       :::::::.::::: ::::::..::::::::  .:::.:::::::::. .:::..::...:
XP_016 DLCLDVSRLNGPVIMLKCHHMRGNQLWEYDAERLTLRHVNSNQCLDEPSEEDKMVPTMQD
      480       490       500       510       520       530        

     540       550         
pF1KB3 CNGSRSQQWLLRNVTLPEIF
       :.:::::::::::.::    
XP_016 CSGSRSQQWLLRNMTLGT  
      540       550        

>>XP_011508839 (OMIM: 608369) PREDICTED: polypeptide N-a  (571 aa)
 initn: 3227 init1: 2893 opt: 3225  Z-score: 3771.5  bits: 707.7 E(85289): 2.5e-203
Smith-Waterman score: 3225; 82.2% identity (93.9% similar) in 561 aa overlap (1-559:1-559)

               10        20        30        40         50         
pF1KB3 MRKFAYCKVVLATSLIWVLLDMFLLLYFSECNKCDEKKERGL-PAGDVLEPVQKPHEGPG
       ::.:.::::::::::.:::.:.:::::::::::::.::::.: ::  ..  ... .::::
XP_011 MRRFVYCKVVLATSLMWVLVDVFLLLYFSECNKCDDKKERSLLPALRAV--ISRNQEGPG
               10        20        30        40          50        

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB3 EMGKPVVIPKEDQEKMKEMFKINQFNLMASEMIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDNLPTTS
       :::: :.:::.:::::::.:::::::::::..::::::::::::::::::::::.::.::
XP_011 EMGKAVLIPKDDQEKMKELFKINQFNLMASDLIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDELPNTS
       60        70        80        90       100       110        

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB3 VVIVFHNEAWSTLLRTVHSVINRSPRHMIEEIVLVDDASERDFLKRPLESYVKKLKVPVH
       :::::::::::::::::.:::::::.... :..::::::::::::  ::.:::.:.:::.
XP_011 VVIVFHNEAWSTLLRTVYSVINRSPHYLLSEVILVDDASERDFLKLTLENYVKNLEVPVK
      120       130       140       150       160       170        

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB3 VIRMEQRSGLIRARLKGAAVSKGQVITFLDAHCECTVGWLEPLLARIKHDRRTVVCPIID
       .::::.:::::::::.:::.::::::::::::::::.:::::::::::.::.::::::::
XP_011 IIRMEERSGLIRARLRGAAASKGQVITFLDAHCECTLGWLEPLLARIKEDRKTVVCPIID
      180       190       200       210       220       230        

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB3 VISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSID
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       ..:::::::::::::::::.:::::::::.::::::.: :  ::..:.::::::::::::
XP_011 HVINKNNRRLAEVWMDEFKDFFYIISPGVVKVDYGDVSVRKTLRENLKCKPFSWYLENIY
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pF1KB3 PDSQIPRHYFSLGEIRNVETNQCLDNMARKENEKVGIFNCHGMGGNQVFSYTANKEIRTD
       :::::::.:.:::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.::::::
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       :::::::.::::: ::::::..::::::::    :: :. ...::.     : :: :...
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        :: :  :.::::: :  :::            
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       ::.:.::::::::::.:::.:.:::::::::::::.::::.: ::  ..  ... .::::
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       :::: :.:::.:::::::.:::::::::::..::::::::::::::::::::::.::.::
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       :::::::::::::::::.:::::::.... :..::::::::::::  ::.:::.:.:::.
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pF1KB3 VIRMEQRSGLIRARLKGAAVSKGQVITFLDAHCECTVGWLEPLLARIKHDRRTVVCPIID
       .::::.:::::::::.:::.::::::::::::::::.:::::::::::.::.::::::::
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pF1KB3 VISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSID
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       :.::.::::::::::::::::::.:::::::::.::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB3 QIINKNNRRLAEVWMDEFKNFFYIISPGVTKVDYGDISSRVGLRHKLQCKPFSWYLENIY
       ..:::::::::::::::::.:::::::::.::::::.: :  ::..:.::::::::::::
XP_016 HVINKNNRRLAEVWMDEFKDFFYIISPGVVKVDYGDVSVRKTLRENLKCKPFSWYLENIY
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pF1KB3 PDSQIPRHYFSLGEIRNVETNQCLDNMARKENEKVGIFNCHGMGGNQVFSYTANKEIRTD
       :::::::.:.:::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.::::::
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pF1KB3 DLCLDVSKLNGPVTMLKCHHLKGNQLWEYDPVKLTLQHVNSNQCLDKATEED-SQVPSIR
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pF1KB3 DCNGSRSQQWLLRNVTLPEIF            
        :: :  :.::::: :  :::            
XP_016 TCNDSTLQKWLLRNYTRMEIFRNIFGNSTDYIL
      540       550       560       570 

>>XP_016858747 (OMIM: 608369) PREDICTED: polypeptide N-a  (571 aa)
 initn: 3227 init1: 2893 opt: 3225  Z-score: 3771.5  bits: 707.7 E(85289): 2.5e-203
Smith-Waterman score: 3225; 82.2% identity (93.9% similar) in 561 aa overlap (1-559:1-559)

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pF1KB3 MRKFAYCKVVLATSLIWVLLDMFLLLYFSECNKCDEKKERGL-PAGDVLEPVQKPHEGPG
       ::.:.::::::::::.:::.:.:::::::::::::.::::.: ::  ..  ... .::::
XP_016 MRRFVYCKVVLATSLMWVLVDVFLLLYFSECNKCDDKKERSLLPALRAV--ISRNQEGPG
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       :::: :.:::.:::::::.:::::::::::..::::::::::::::::::::::.::.::
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       :::::::::::::::::.:::::::.... :..::::::::::::  ::.:::.:.:::.
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       .::::.:::::::::.:::.::::::::::::::::.:::::::::::.::.::::::::
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pF1KB3 VISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSID
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pF1KB3 QIINKNNRRLAEVWMDEFKNFFYIISPGVTKVDYGDISSRVGLRHKLQCKPFSWYLENIY
       ..:::::::::::::::::.:::::::::.::::::.: :  ::..:.::::::::::::
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pF1KB3 PDSQIPRHYFSLGEIRNVETNQCLDNMARKENEKVGIFNCHGMGGNQVFSYTANKEIRTD
       :::::::.:.:::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.::::::
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pF1KB3 DLCLDVSKLNGPVTMLKCHHLKGNQLWEYDPVKLTLQHVNSNQCLDKATEED-SQVPSIR
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pF1KB3 DCNGSRSQQWLLRNVTLPEIF            
        :: :  :.::::: :  :::            
XP_016 TCNDSTLQKWLLRNYTRMEIFRNIFGNSTDYIL
      540       550       560       570 

>>XP_016858749 (OMIM: 608369) PREDICTED: polypeptide N-a  (561 aa)
 initn: 3196 init1: 2862 opt: 3102  Z-score: 3627.8  bits: 681.1 E(85289): 2.5e-195
Smith-Waterman score: 3183; 81.6% identity (93.2% similar) in 561 aa overlap (1-559:1-549)

               10        20        30        40         50         
pF1KB3 MRKFAYCKVVLATSLIWVLLDMFLLLYFSECNKCDEKKERGL-PAGDVLEPVQKPHEGPG
       ::.:.::::::::::.:::.:.:::::::::::::.::::.: ::  ..  ... .::::
XP_016 MRRFVYCKVVLATSLMWVLVDVFLLLYFSECNKCDDKKERSLLPALRAV--ISRNQEGPG
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pF1KB3 EMGKPVVIPKEDQEKMKEMFKINQFNLMASEMIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDNLPTTS
       :::: :.:::.:::::::.:::::::::::..::::::::::::::::::::::.::.::
XP_016 EMGKAVLIPKDDQEKMKELFKINQFNLMASDLIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDELPNTS
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pF1KB3 VVIVFHNEAWSTLLRTVHSVINRSPRHMIEEIVLVDDASERDFLKRPLESYVKKLKVPVH
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pF1KB3 VIRMEQRSGLIRARLKGAAVSKGQVITFLDAHCECTVGWLEPLLARIKHDRRTVVCPIID
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XP_016 IIRMEERSGLIRARLRGAAASKGQVITFLDAHCECTLGWLEPLLARIKEDRKTVVCPIID
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pF1KB3 VISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSID
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pF1KB3 RDYFQEIGTYDAGMDIWGGENLEISFRIWQCGGTLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTG
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pF1KB3 QIINKNNRRLAEVWMDEFKNFFYIISPGVTKVDYGDISSRVGLRHKLQCKPFSWYLENIY
       ..:::::::::::::::::.:::::::::.::::::.: :  ::..:.::::::::::::
XP_016 HVINKNNRRLAEVWMDEFKDFFYIISPGVVKVDYGDVSVRKTLRENLKCKPFSWYLENIY
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pF1KB3 PDSQIPRHYFSLGEIRNVETNQCLDNMARKENEKVGIFNCHGMGGNQVFSYTANKEIRTD
       :::::::.:.:::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.::::::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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