Result of SIM4 for pF1KE0936

seq1 = pF1KE0936.tfa, 1254 bp
seq2 = pF1KE0936/gi568815584f_99984685.tfa (gi568815584f:99984685_100241793), 257109 bp

>pF1KE0936 1254
>gi568815584f:99984685_100241793 (Chr14)

10-180  (100001-100171)   100% ->
181-358  (112797-112974)   100% ->
359-422  (138855-138918)   100% ->
423-487  (142023-142087)   100% ->
488-717  (143835-144064)   100% ->
718-839  (144879-145000)   100% ->
840-900  (148035-148095)   100% ->
901-964  (151221-151284)   100% ->
965-1031  (152894-152960)   100% ->
1032-1094  (153056-153118)   100% ->
1095-1161  (156496-156562)   100% ->
1162-1219  (157052-157109)   100% ->
1220-1254  (159017-159051)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     10 AGTGAACAGAGTATCTGCCAAGCCCGGGCTTCCGTGATGGTCTACGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 AGTGAACAGAGTATCTGCCAAGCCCGGGCTTCCGTGATGGTCTACGATGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     60 CACCAGTAAGAAATGGGTACCAATCAAACCTGGCCAGCAGGGATTCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACCAGTAAGAAATGGGTACCAATCAAACCTGGCCAGCAGGGATTCAGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    110 GGATCAACATCTACCACAACACTGCCAGCAACACCTTCAGAGTCGTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGATCAACATCTACCACAACACTGCCAGCAACACCTTCAGAGTCGTTGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    160 GTCAAGTTGCAGGATCAGCAG         GTTGTGATCAATTATTCAAT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100151 GTCAAGTTGCAGGATCAGCAGGTC...CAGGTTGTGATCAATTATTCAAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGTGAAAGGGCTGAAGTACAATCAGGCCACGCCAACCTTCCACCAGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112817 CGTGAAAGGGCTGAAGTACAATCAGGCCACGCCAACCTTCCACCAGTGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GAGATGCCCGCCAGGTCTACGGCTTAAACTTTGCAAGTAAAGAAGAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112867 GAGATGCCCGCCAGGTCTACGGCTTAAACTTTGCAAGTAAAGAAGAGGCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACCACGTTCTCCAATGCAATGCTGTTTGCCCTGAACATCATGAATTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112917 ACCACGTTCTCCAATGCAATGCTGTTTGCCCTGAACATCATGAATTCCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGAAGGAG         GCCCCTCCAGCCAGCGTCAGGTGCAGAATGGCC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 112967 AGAAGGAGGTA...CAGGCCCCTCCAGCCAGCGTCAGGTGCAGAATGGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CCTCTCCTGATGAGATGGACATCCAGAGAAG         ACAAGTGATG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 138888 CCTCTCCTGATGAGATGGACATCCAGAGAAGGTA...CAGACAAGTGATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GAGCAGCACCAGCAGCAGCGTCAGGAATCTCTAGAAAGAAGAACCTCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142033 GAGCAGCACCAGCAGCAGCGTCAGGAATCTCTAGAAAGAAGAACCTCGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CACAG         GGCCCATCCTCCCACCAGGACATCCTTCATCTGCAG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142083 CACAGGTG...CAGGGCCCATCCTCCCACCAGGACATCCTTCATCTGCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CCAGCGCCCCCGTCTCATGTAGTGGGCCTCCACCGCCCCCCCCACCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143871 CCAGCGCCCCCGTCTCATGTAGTGGGCCTCCACCGCCCCCCCCACCCCCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GTCCCACCTCCACCCACTGGGGCTACCCCACCTCCCCCACCCCCACTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143921 GTCCCACCTCCACCCACTGGGGCTACCCCACCTCCCCCACCCCCACTGCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 AGCCGGAGGAGCCCAGGGGTCCAGCCACGACGAGAGCTCCATGTCAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143971 AGCCGGAGGAGCCCAGGGGTCCAGCCACGACGAGAGCTCCATGTCAGGAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TGGCCGCTGCCATAGCTGGGGCCAAGCTGAGAAGAGTCCAACGG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 144021 TGGCCGCTGCCATAGCTGGGGCCAAGCTGAGAAGAGTCCAACGGGTA...

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    718    CCAGAAGACGCATCTGGAGGCTCCAGTCCCAGTGGGACCTCAAAGTC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144876 CAGCCAGAAGACGCATCTGGAGGCTCCAGTCCCAGTGGGACCTCAAAGTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CGATGCCAACCGGGCAAGCAGCGGGGGTGGCGGAGGAGGCCTCATGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144926 CGATGCCAACCGGGCAAGCAGCGGGGGTGGCGGAGGAGGCCTCATGGAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 AAATGAACAAACTGCTGGCCAAGAG         GAGAAAAGCAGCCTCC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 144976 AAATGAACAAACTGCTGGCCAAGAGGTG...TAGGAGAAAAGCAGCCTCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CAGTCAGACAAGCCAGCCGAGAAGAAGGAAGATGAAAGCCAAATG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 148051 CAGTCAGACAAGCCAGCCGAGAAGAAGGAAGATGAAAGCCAAATGGTG..

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901     GAAGATCCTAGTACCTCCCCCTCTCCGGGGACCCGAGCAGCCAGCC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148101 .TAGGAAGATCCTAGTACCTCCCCCTCTCCGGGGACCCGAGCAGCCAGCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 AGCCACCTAACTCCTCAG         AGGCTGGCCGGAAGCCCTGGGAG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 151267 AGCCACCTAACTCCTCAGGTG...CAGAGGCTGGCCGGAAGCCCTGGGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CGGAGCAACTCGGTGGAGAAGCCTGTGTCCTCGATTCTGTCCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 152917 CGGAGCAACTCGGTGGAGAAGCCTGTGTCCTCGATTCTGTCCAGGTG...

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1032    AACCCCGTCTGTGGCAAAGAGCCCCGAAGCTAAGAGCCCCCTTCAGT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153053 TAGAACCCCGTCTGTGGCAAAGAGCCCCGAAGCTAAGAGCCCCCTTCAGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 CGCAGCCTCACTCTAG         GATGAAGCCTGCTGGGAGCGTGAAT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 153103 CGCAGCCTCACTCTAGGTA...CAGGATGAAGCCTGCTGGGAGCGTGAAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 GACATGGCCCTGGATGCCTTCGACTTGGACCGGATGAAGCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 156521 GACATGGCCCTGGATGCCTTCGACTTGGACCGGATGAAGCAGGTG...CA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1162  GAGATCCTAGAGGAGGTGGTGAGAGAGCTCCACAAGGTGAAGGAGGAGA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157051 GGAGATCCTAGAGGAGGTGGTGAGAGAGCTCCACAAGGTGAAGGAGGAGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 TCATCGACG         CCATCAGGCAGGAGCTGAGTGGGATCAGCACC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 157101 TCATCGACGGTG...CAGCCATCAGGCAGGAGCTGAGTGGGATCAGCACC

   1350 
   1252 ACG
        |||
 159049 ACG

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